Entry: PS50180

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] GAE
Accession [info] PS50180
Entry type [info] MATRIX
Date [info] MAY-2003 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50180
Associated ProRule [info] PRU00093

Name and characterization of the entry

Description [info] Gamma-adaptin ear (GAE) domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=116;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=111;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8907; R2=0.02608901; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7407.15399; R2=29.53677; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=311; N_SCORE=10.0; H_SCORE=15471; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=176; N_SCORE=6.5; H_SCORE=12635; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='A'; M= 16, -8,-18,-12, -5,-21,-11,-18,-15, -3,-18,-13, -7, 11, -7,-11,  9, 10, -9,-26,-19, -7;
/M: SY='T'; M=  5, -6,-16,-10, -7,-18, -8,-16,-12,-10,-16,-10, -4, -5, -4,-12, 14, 18, -4,-29,-16, -6;
/M: SY='Y'; M= -4,-17,-25,-21,-19,  0, -5, -9, -2,-17, -1, -2,-13,-22,-15,-17, -9, -4, -4, -5, 15,-19;
/M: SY='P'; M= -3,-11,-33, -6,  9,-30,-18,-13,-21,  1,-25,-16,-12, 46,  3, -9, -5, -9,-25,-27,-23,  3;
/M: SY='P'; M= -6, -6,-29,  0,  4,-28,-14,-10,-23, -3,-28,-17, -4, 32,  4, -4,  6, -2,-23,-31,-22,  1;
/M: SY='I'; M= -4,-22,-23,-26,-18, -4,-27, -9, 15,-17, 14, 10,-17,-22,-13,-10,-16, -9, 11,-22, -3,-18;
/M: SY='V'; M= -6,-17,-20,-23,-18, -8,-28,-22, 13, -9,  1,  4,-13,-19,-13, -6, -5,  9, 16,-25, -7,-18;
/M: SY='V'; M= 19,-19,-10,-24,-20, -9,-17,-25, 10,-15,  0,  0,-19,-20,-20,-19,  1,  6, 25,-26,-14,-20;
/M: SY='F'; M=-16,-27,-24,-31,-24, 34,-31,-10, 12,-25, 22,  9,-23,-29,-23,-18,-23,-10,  4,  2, 30,-24;
/M: SY='D'; M=-10, 23,-23, 30, 14,-27,-13, -5,-23, -2,-21,-19, 12,-12, -1, -8,  5,  1,-16,-36,-18,  6;
/M: SY='K'; M=-11,  9,-27,  9,  7,-27,-14, -5,-29, 29,-28,-15, 11,-13,  7, 24, -1, -6,-21,-27,-13,  6;
/M: SY='H'; M=-11, 17,-26, 19,  9,-29, -3, 21,-29, -3,-26,-15, 17,-14,  9, -4,  3, -9,-28,-33,-11,  8;
/M: SY='G'; M= -2,  6,-26, 10, -7,-30, 36,-13,-36,-13,-30,-22,  7,-16,-11,-16,  9, -9,-26,-29,-26, -9;
/M: SY='L'; M= -9,-28,-22,-30,-21,  7,-29,-21, 18,-23, 23, 16,-26,-13,-20,-20,-21, -8, 14,-20, -3,-21;
/M: SY='Q'; M= -9,  2,-24, -1,  8,-22,-19, -5,-18,  9,-14, -7,  4,-13, 12,  9,  0,  4,-17,-26,-11, 10;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-22,-34,-26,  4,-34,-26, 33,-28, 31, 18,-26,-26,-22,-24,-22, -8, 26,-22, -2,-26;
/M: SY='Q'; M= -6,  2,-22,  0, 12,-22,-17, -6,-17,  4,-15, -9,  3,-11, 13,  1,  6,  7,-16,-28,-13, 13;
/M: SY='L'; M=-12,-30,-21,-33,-23, 21,-31,-21, 20,-30, 39, 17,-27,-29,-23,-21,-27,-10, 11,-15,  5,-23;
/M: SY='N'; M= -5,  4,-19, -1,  1,-17,-16,  1,-10, -5,-15, -8,  8,-16,  2, -6,  6,  6, -6,-32,-11,  1;
/M: SY='F'; M=-13,-25,-22,-29,-21, 38,-25,-20, -3,-23, -3, -5,-18, -2,-29,-19,-11, -6, -2, -8,  8,-23;
/M: SY='T'; M= -2, -7,-18,-10,  0,-13,-21,-17, -1,-11, -8, -6, -5,-12, -6,-13, 10, 16,  3,-30,-12, -4;
/M: SY='R'; M= -9, -5,-26, -6,  6,-21,-20, -8,-16, 14,-17, -8, -1,-13,  9, 19,  0,  0,-13,-24,-11,  5;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='S'; M=  0,  9,-19,  9,  9,-23, -9, -5,-19, -3,-21,-15,  8, -1,  5, -7, 11,  5,-17,-29,-17,  7; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='P'; M=-10, -8,-29, -6,  3,-19,-14, -9,-21,  2,-22,-16, -4, 14,  0,  8, -5, -7,-23, -7,-13,  0; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='E'; M=  1, -1,-22,  1, 15,-23, -6,-10,-22,  2,-20,-15, -2,  5,  2, -5,  5, -1,-18,-25,-18,  8; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='N'; M= -6, 11,-22,  3, -5,-21,  9,  5,-25, -4,-26,-16, 24,-18, -4,  1,  9,  1,-23,-32,-17, -5;
/M: SY='P'; M= -9, -3,-31,  0,  8,-27,-16,  2,-23,  0,-28,-17,  1, 33,  0, -7, -1, -7,-27,-31,-19,  1;
/M: SY='E'; M= -3,  5,-22,  7, 15,-26,-14, -6,-24,  8,-22,-15,  3, -9, 10,  7,  9,  3,-18,-29,-16, 12;
/M: SY='V'; M=  8,-22,  0,-27,-23, -7,-24,-26, 13,-20,  5,  2,-21,-24,-22,-21, -5,  2, 23,-28,-12,-23;
/M: SY='V'; M= -5,-15,-18,-19,-14, -9,-23,-15,  7,-10,  1,  7,-12,-19, -6, -5, -2,  6, 10,-26, -8,-11;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='V'; M=-10,-11,-20,-10,-11,-10,-23, -3,  2, -6, -1,  1,-10,-20, -9,  4,-11, -7,  8,-24, -5,-12; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='I'; M=-10,-26,-28,-31,-18, -1,-36,-25, 35,-26, 21, 16,-20,-20,-16,-25,-20,-10, 20,-21, -2,-20;
/M: SY='T'; M= -1,-13,-17,-17,-13, -7,-22,-15, -2, -2, -3, -2,-12,-19,-11, -1, -3,  9,  6,-20, -1,-13;
/M: SY='M'; M=  5,-17,-21,-24,-15, -9,-20,-16, 12,-11,  5, 14,-13,-17, -8,-14, -6, -4,  8,-22, -8,-13;
/M: SY='T'; M= -7, -4,-17,-12, -9,  5,-18,-11,-13, -8,-11, -9,  2,-17, -7, -1,  7, 17, -9,-21, -3, -8;
/M: SY='F'; M= 10,-15,-16,-24,-15, 14,-16,-17, -6,-10, -3, -1,-12,-17,-17,-13, -4,  0, -1,-11,  0,-14;
/M: SY='T'; M= -6, -2,-18,-11, -9, -9,-19, -7, -3, -9, -8,  0,  1,-15,  0, -9,  6, 18, -5,-22,  0, -5;
/M: SY='N'; M= -6, 28,-19, 14,  1,-21, -2,  4,-21,  4,-30,-19, 44,-17,  1,  1, 14,  3,-25,-38,-19,  1;
/M: SY='N'; M= -3, -4,-20,-11,-10, -1,-16, -7, -7, -7, -2, -4,  2,-20, -9, -7, -4,  1, -8,-19,  1,-10;
/M: SY='T'; M=  8, -3,-13, -7, -5,-17,-10,-16,-15,-10,-21,-15,  1,  1, -6,-12, 24, 27, -7,-33,-17, -6;
/M: SY='P'; M= -8, -3,-27,  3,  9,-24,-14, -8,-20, -1,-22,-11, -4, 19,  1, -2,  3, -3,-20,-31,-20,  3;
/M: SY='N'; M= -1,  3,-21, -3, -1,-22, -5, -4,-17, -2,-17,-10, 10,-15,  8,  2,  7,  2,-17,-28,-15,  3;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='P'; M= -9, -3,-24,  1, -2,-20,-17,-14,-15, -4,-18,-13, -6, 21, -7, -4, -1,  4,-12,-27,-17, -7; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='I'; M= -7,-28,-19,-31,-26,  5,-32,-21, 29,-23, 20, 17,-26,-27,-21,-21,-18, -6, 28,-19,  4,-25;
/M: SY='S'; M= -4,  1,-20,  2,  3,-18,-12,-11,-22, -3,-22,-17,  2,-12, -1,  0, 14, 13,-15,-17,-12,  1;
/M: SY='B'; M=-14, 28,-27, 28, 15,-30,-11, 11,-28,  7,-27,-18, 26,-13, 10,  1,  1, -7,-29,-34,-15, 12;
/M: SY='F'; M=-16,-28,-25,-35,-27, 37,-33,-15, 18,-26, 16,  8,-21,-27,-25,-21,-21,-10,  8,  1, 28,-27;
/M: SY='M'; M= -9, -8,-21,-13,-12, -9,-21,  2,  6,-13,  4,  9, -1,-23, -3,-10,-10, -7,  2,-27, -5, -8;
/M: SY='F'; M=-17,-29, -9,-37,-28, 58,-30,-21,  2,-30, 16,  3,-22,-31,-35,-21,-21,-10,  1, -1, 19,-28;
/M: SY='Q'; M=-11, -5,-28, -3, 19,-19,-22,  1,-15,  1, -8, -2, -6,-12, 30,  1, -6,-10,-22,-19, -7, 25;
/M: SY='A'; M= 33,-16,-11,-23,-15,-12,-10,-22,  2,-14,  1, -2,-16,-16,-15,-20,  1, -1, 11,-22,-16,-15;
/M: SY='A'; M= 45, -9,-10,-18, -9,-20,  0,-19,-11,-10,-12,-11, -8,-10, -9,-19, 14,  2, -1,-22,-20, -9;
/M: SY='V'; M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='P'; M= -9,-13,-35, -8,  2,-29,-20,-16,-20, -1,-27,-16,-13, 57, -1,-10, -6, -4,-26,-28,-23, -3;
/M: SY='K'; M=-11, -1,-30, -1,  9,-29,-20, -9,-30, 48,-29,-10,  0,-11, 10, 34,-10,-10,-20,-20,-10,  9;
/M: SY='S'; M=  2, -5,-15, -8, -6, -8,-11,-15,-15,-12,-20,-15,  1,  0, -8,-12, 22, 22, -8,-31,-13, -7;
/M: SY='F'; M=-14,-20, -6,-26,-18, 16,-26, -1, -1,-19,  9, 14,-16,-26,-11,-14,-17,-11, -4,-16,  6,-13;
/M: SY='Q'; M= -8,  0,-28,  1, 17,-31,-18, -1,-25, 23,-25, -9,  1,-10, 27, 18,  1, -6,-23,-24,-12, 22;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-19,-31,-23,  7,-31,-23, 25,-28, 39, 18,-29,-29,-22,-21,-25, -8, 20,-22, -2,-23;
/M: SY='Q'; M= -6, -2,-28, -3,  9,-30,-18,  8,-24, 21,-22, -5,  0,-12, 26, 19, -4,-10,-22,-21, -8, 16;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-31,-21,  7,-29,-17, 23,-26, 41, 28,-27,-27,-16,-19,-27,-10, 12,-20,  0,-19;
/M: SY='Q'; M=-11, -3,-27,  0, 13,-24,-22, -1,-11, -3,  0,  1, -7,-15, 26, -2, -9,-10,-18,-23, -9, 19;
/M: SY='P'; M=  5,-12,-26,-11, -4,-23,-15,-19,-16,-10,-22,-16,-12, 43, -9,-17,  4,  7,-17,-29,-23, -9;
/M: SY='P'; M=  8,-17,-27,-17, -6,-21,-17,-17, -5,-12, -9, -6,-16, 24, -4,-17, -6, -7,-11,-24,-18, -7;
/M: SY='S'; M=  6, -1,-12, -2, -1,-19, -5,-10,-20, -6,-27,-18,  8,-11,  0, -1, 32, 20,-10,-37,-18, -1;
/M: SY='S'; M=  2,  8,-17,  7, -2,-23,  9,-10,-25,-10,-28,-20, 14,-13, -5,-11, 23, 11,-17,-35,-21, -3;
/M: SY='S'; M=  1, 10,-16,  4, -1,-20, -4, -6,-19, -7,-28,-19, 21, -2, -2, -8, 24, 14,-17,-38,-20, -2;
/M: SY='T'; M= -4, -5,-18,-11, -8, -6,-17,-12, -6, -6,-13, -6,  2,-16, -3, -7,  7,  9, -3,-25, -7, -5;
/M: SY='M'; M= -7,-27,-19,-31,-24,  3,-28,-17, 26,-20, 26, 31,-25,-25,-16,-18,-20, -7, 22,-23, -3,-20;
/M: SY='P'; M=-12, -8,-36, -1,  5,-26,-21, -4,-16, -9,-22,-14,-10, 45, -5,-16, -9,-11,-23,-30,-19, -4;
/M: SY='P'; M= 12,-15,-29,-13, -6,-27, -2,-20,-19,-11,-23,-17,-14, 43,-11,-20, -2, -8,-20,-25,-27,-11;
/M: SY='N'; M=-13, 11,-25,  4, -7, -8,  5,  8,-25, -8,-21,-15, 20,-21, -9, -3, -2,-10,-24,-25, -8, -8;
/M: SY='G'; M=  5, -1,-23, -3, -1,-26, 22,-12,-29, -4,-26,-18,  5,-14, -6, -9,  9, -6,-21,-26,-23, -3;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='P'; M= -8,  0,-24,  0,  4,-21, -9,  1,-21,  1,-21,-13,  3, 10, -1, -4,  0,  1,-20,-26,-14,  0; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='T'; M= -8, -5,-20, -6, -5, -1,-15,-14, -5,-14,  1, -4, -7,-15,-12,-14, -5,  3, -4,-20, -5, -8; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='P'; M= -3,-11,-18,-11, -9,-14, -7,-17, -8, -5,-12, -7,-10,  6,-11, -9, -1,  4, -2,-21,-14,-11; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='I'; M= -8,-17,-24,-23,-13, -8,-27,-15, 25,-15,  8, 12,-12,-14,  1,-15,-12, -8, 11,-16, -2, -9; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='T'; M=  0,  1,-12, -6, -8, -5,-12,-13,-13,-11,-17,-13,  8,-13, -9,-10, 21, 28, -7,-30,-10, -8;
/M: SY='Q'; M=-10, -4,-28, -6, 12,-32,-20,  8,-12,  6,-12, 12, -4,-12, 48,  6, -4,-10,-22,-20, -8, 30;
/M: SY='T'; M= -7,-11,-21,-10,  2,-13,-23,-14, -5, -5, -4, -1,-12, -5, -5, -4, -4,  5,  0,-27,-13, -3;
/M: SY='L'; M= -9,-25,-22,-30,-24,  5,-17,-18, 18,-23, 21, 21,-22,-25,-18,-20,-20,-10, 12,-19, -2,-21;
/M: SY='R'; M=-11,-10,-21,-13, -7,-11,-22,-11,-13,  6, -3, -4, -6,-18, -3, 22, -4, 10, -7,-23, -8, -7;
/M: SY='V'; M= -7,-21,-19,-25,-22, -2,-28,-21, 21,-17, 13,  9,-16,-26,-19,-10,-14, -5, 22,-26, -7,-22;
/M: SY='M'; M= -9, -8,-22, -6,  0,-12,-21,  0, -5, -7,  3,  4, -9,-18, -4, -7, -9, -7, -4,-27, -6, -3;
/M: SY='N'; M=  5, 13,-19,  1, -5,-21,  3, -4,-15, -5,-21,-13, 24,-18, -1, -7,  6, -3,-15,-31,-19, -3;
/M: SY='P'; M= -2,-15,-32,-10, -1,-27,-18,-19,-19, -4,-26,-17,-15, 58, -8,-14, -5, -3,-22,-28,-25, -8;
/M: SY='N'; M= -5,  2,-24, -1, -2,-24, -3,  0,-22, -8,-26,-16,  9,  9,  0, -9,  9,  3,-22,-32,-18, -2;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='G'; M=  2, -1,-23, -4, -4,-25, 16,-11,-27,  9,-24,-13,  5,-13, -4,  1, -1,-10,-20,-20,-18, -4; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='A'; M= 10,  3,-19, -2,  5,-24,-10, -9,-19,  7,-21,-12,  6,-10,  5, -1,  8,  4,-14,-27,-16,  5;
/M: SY='P'; M=  5,-10,-25,-10, -1,-25,-16,-14,-16, -6,-20,-12,-10, 29,  3,-12,  3,  5,-17,-26,-20, -1;
/M: SY='V'; M=  2,-24,-16,-27,-22, -2,-25,-24, 21,-22, 15,  9,-21,-24,-20,-21, -9, -2, 23,-26, -8,-22;
/M: SY='R'; M=-16, -3,-28,  0,  2,-23,-20, -5,-25, 26,-21,-10, -1,-17,  5, 42, -9, -9,-14,-23,-11,  1;
/M: SY='M'; M= -1,-24,-18,-29,-20,  1,-23,-14, 18,-19, 26, 30,-24,-24,-12,-16,-19, -8, 13,-21, -4,-16;
/M: SY='R'; M=-16,-11,-26,-12, -3,-16,-21, -6,-22, 19,-11, -6, -4,-19,  4, 47, -9, -3,-14,-21, -9, -3;
/M: SY='L'; M=-10,-20, -5,-24,-17, -1,-27,-15,  5,-14, 16, 11,-19,-25,-14,-13,-17, -4,  3,-20,  1,-16;
/M: SY='R'; M=-14,-12,-28,-13, -4,-18,-24,-10,-13, 22,-14, -4, -6,-19,  2, 36,-11, -9, -6,-21, -9, -4;
/M: SY='I'; M= -8,-26,-23,-31,-23, -1,-33,-25, 29,-18, 19, 14,-22,-23,-18,-18,-19, -8, 23,-22, -3,-23;
/M: SY='S'; M=  4, -8,-21,-12, -9,-18,  6,-16,-21,-11,-21,-15, -4,-15, -4,-12, 10,  7,-15, -6,-13, -6;
/M: SY='Y'; M=-17,-21,-26,-22,-19, 29,-29,  3,  0, -8, -1,  0,-19,-28,-16, -8,-18, -9, -3, 13, 50,-19;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='K'; M=-10, -1,-24, -3, -4,-19,-20, -9, -6,  7,-14, -4,  3,-18,  1,  7, -6, -6, -3,-27,-11, -3;
/M: SY='M'; M= -9,-11,-22,-14,-10,-11,-24,  5,  5,-13,  4,  6, -6,-22,  1,-10,-11, -8,  2,-26, -3, -6;
/M: SY='D'; M=-12, 12,-28, 15, -4,-16, 11, -5,-29, -6,-23,-18,  8,-18,-10,-10, -4,-12,-25,-20, -6, -7;
/M: SY='G'; M= -3, -1,-28,  1,-11,-29, 45, -7,-37,-16,-29,-20,  4,-18,-13,-16,  4,-14,-28,-26,-24,-13;
/M: SY='Q'; M= -6,  2,-22,  3,  4,-25,-16,  4,-17,  1,-19, -8,  2,-13, 13, -1,  6,  2,-12,-29,-10,  8;
/M: SY='N'; M= -3, 10,-25, 10, 10,-27, -9, -4,-22, -3,-26,-18, 13,  9,  5, -7,  8, -2,-24,-33,-21,  6;
/M: SY='V'; M= -6, -7,-18, -7, -7, -9,-20,-11, -3, -9, -7,  0, -8,-18, -1,-10,  1,  3,  4,-26, -8, -3;
/M: SY='Q'; M= -5,-15,-21,-15, -6,-15,-22,-14,  0,-11,  0,  1,-14, -7,  3,-10, -4,  2,  0,-26,-11, -3;
/M: SY='E'; M=-12, 14,-30, 22, 24,-31,-10, -4,-23, -1,-19,-16,  3, -9, 10, -7, -2,-11,-23,-29,-17, 17;
/M: SY='Q'; M= -2, -6,-25, -6, 12,-24,-21, -7, -9,  4, -9, -3, -8,-12, 17, -1, -5, -8,-10,-23,-12, 14;
/M: SY='G'; M=  0, -7,-21, -8,  0,-14,  6,-16,-18,-11,-15,-12, -6,-14,-10,-13,  2,  1,-11,-23,-16, -5;
/M: SY='E'; M= -9, 12,-26, 21, 31,-29,-17, -3,-24,  2,-20,-17,  2, -8, 12, -4,  4, -5,-19,-32,-18, 21;
/M: SY='V'; M= -6,-27,-20,-32,-28,  9,-30,-28, 21,-22,  7,  6,-24,-25,-25,-21,-13,  0, 26, -5,  1,-27;
/M: SY='N'; M=  8,  7,-18, -2, -7,-20,  2, -9,-15, -3,-21,-13, 17,-17, -7, -7,  8, -1,-11,-30,-19, -7;
/M: SY='N'; M= -2, 10,-23,  6,  5,-25, -4, -6,-19,  2,-21,-13, 12,-15,  3, -3,  1, -6,-16,-29,-18,  4;
/M: SY='F'; M=-16,-25,-23,-30,-20, 43,-28,-19, -2,-19,  9,  0,-20,-15,-27,-14,-20,-10, -4, -3, 13,-21;
/M: SY='P'; M= -6,-14,-32, -9, -4,-27, -7,-19,-21,-11,-28,-19,-12, 54,-10,-18,  0, -1,-24,-30,-27,-10;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_09 which contains 546'439 sequence entries.


Total number of hits 20 in 20 different sequences
Number of true positive hits 20 in 20 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 4
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 83.33 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] GAE
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
20 sequences

AP1G1_ARATH (Q84K16), AP1G1_HUMAN (O43747), AP1G1_MOUSE (P22892), 
AP1G1_PONAB (Q5R5M2), AP1G1_SCHPO (Q9UU81), AP1G1_USTMA (Q99128), 
AP1G2_ARATH (Q9ZUI6), AP1G2_HUMAN (O75843), AP1G2_MOUSE (O88512), 
AP1G_DICDI  (Q8I8U2), GGA1_HUMAN  (Q9UJY5), GGA1_MOUSE  (Q8R0H9), 
GGA1_YEAST  (Q06336), GGA2_HUMAN  (Q9UJY4), GGA2_MOUSE  (Q6P5E6), 
GGA2_YEAST  (P38817), GGA3_HUMAN  (Q9NZ52), GGA3_MOUSE  (Q8BMI3), 
YB0G_SCHPO  (P87157), YD85_SCHPO  (Q10410)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
4 sequences

AP1G1_YEAST (Q12028), AP2A1_ARATH (Q8LPL6), AP2A2_ARATH (Q8LPK4), 
AP3D_DICDI  (Q54WN0)
» More

PDB
[Detailed view]
16 PDB

1GYU; 1GYV; 1GYW; 1IU1; 1NA8; 1OM9; 1P4U; 2A7B; 2DWX; 2DWY; 2E9G; 2YMT; 3MNM; 3ZHF; 3ZY7; 4BCX
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission