PROSITE entry PS50194
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | FILAMIN_REPEAT |
Accession [info] | PS50194 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-DEC-2001 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC50194 |
Associated ProRule [info] | PRU00087 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Filamin/ABP280 repeat profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=95; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=90; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.8348000; R2=0.0205485; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4094.8825684; R2=6.1862440; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=374; H_SCORE=6409; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=276; H_SCORE=5802; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MM=1; M0=-1; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='S'; M= -2, -7,-19, -8, -3,-19, -7,-14,-14, -2,-14, -9, -4,-11, -6, -5, 1, -1, -8,-27,-16, -5; /M: SY='P'; M= -2, -4,-26, 0, 6,-24,-11, -9,-18, -6,-17,-12, -5, 12, 1,-10, -1, -6,-18,-28,-19, 2; /M: SY='A'; M= 6, -8,-18, -9, -8,-17, -9,-17, -7,-12,-10, -8, -8, -6,-10,-16, 2, 0, -2,-27,-16,-10; /M: M= -1,-12, -7,-13,-15,-10, -5,-11,-11,-17,-11, -9, -9,-16,-16,-17, 0, -4, -4,-27,-11,-16; /M: SY='D'; M=-14, 34,-27, 45, 14,-31, -8, 4,-33, -2,-26,-23, 19,-12, 0, -8, 2, -8,-27,-36,-17, 7; /M: SY='P'; M= 19,-13,-19,-16, -7,-21,-11,-19,-11,-11,-14,-11,-12, 20, -9,-19, 2, -1, -9,-25,-21,-10; /M: SY='S'; M= 3, 4,-18, 5, 5,-24, -4, -6,-23, -3,-26,-17, 8, -7, 4, -4, 20, 8,-16,-34,-18, 4; /M: SY='K'; M= -8, -2,-27, -3, 5,-24,-17, -2,-24, 28,-21, -8, 1,-14, 8, 24, -7, -9,-18,-22,-10, 6; /M: SY='V'; M= 4,-25, -6,-27,-24, -5,-25,-27, 19,-20, 4, 4,-23,-23,-24,-20, -5, 0, 32,-30,-12,-24; /M: SY='K'; M= -8, -6,-24, -8, -1,-16,-21,-10,-14, 14,-13, -5, -4,-15, 1, 14, -4, 1, -8,-21, -5, -2; /M: SY='V'; M= 16,-21, -3,-26,-21, -9,-19,-25, 11,-18, 0, 0,-19,-21,-20,-21, -1, -1, 23,-27,-14,-21; /M: SY='Y'; M= -9, -6,-24, -8, -6, -4,-15, -3,-16, -3,-15,-11, -3,-18, -4, -1, -2, 2,-14, -3, 10, -6; /M: SY='G'; M= 0, -7,-29, -6,-16,-29, 59,-18,-38,-18,-28,-20, 1,-19,-17,-19, 1,-17,-28,-22,-28,-16; /M: SY='P'; M= -3,-11,-30, -6, 2,-22,-18,-14,-14, -8,-13,-12,-13, 33, -6,-13, -8, -8,-18,-27,-20, -5; /M: SY='G'; M= 0, -4,-28, -4,-12,-30, 49,-16,-35,-15,-28,-19, 3,-15,-12,-16, 2,-15,-28,-23,-27,-12; /M: SY='L'; M= -9,-21,-20,-22,-15, 2,-27,-17, 13,-21, 28, 12,-20,-26,-15,-14,-20, -8, 8,-23, -4,-15; /M: SY='E'; M= -5, 1,-24, 4, 16,-25,-14, -3,-20, 4,-19,-11, 0, -9, 11, 2, 4, -3,-16,-29,-15, 13; /M: SY='R'; M= -5, -7,-26, -7, 0,-24, -4, -9,-23, 9,-22,-12, -2, -6, 0, 12, -1, -6,-16,-25,-16, -2; /M: SY='A'; M= 9, -4,-20, -7, -5,-21, 7,-15,-18, -8,-15,-11, -2,-12, -8,-12, 5, 0,-12,-25,-19, -7; /I: I=-5; MI=0; MD=-15; IM=0; /M: SY='R'; M= -9,-12,-22,-14, -7, -4,-20,-10, -6, 0, -8, -3, -7,-11, -6, 3, -7, -4, -4,-19, -4, -8; D=-3; /I: DM=-15; /M: SY='V'; M= 3,-22,-13,-25,-21, -4,-25,-25, 16,-17, 8, 5,-21,-24,-21,-16, -8, 1, 26,-25,-10,-21; /M: SY='G'; M= -6, 3,-25, 0, -9,-22, 27, -9,-30, -7,-25,-17, 12,-19,-11, -7, 0,-12,-25,-25,-20,-10; /M: SY='E'; M= -6, -1,-25, 1, 14,-24,-18, -2,-20, 12,-19,-10, -1, -7, 12, 6, -1, -5,-17,-26,-12, 13; /M: SY='P'; M= -4, -8,-27, -5, 2,-23,-18,-12,-15, -4,-20,-13, -8, 23, -4,-10, 0, 1,-14,-29,-18, -3; /M: SY='A'; M= 16, -6,-10,-13, -9,-18, -9,-15,-10, -8,-13, -9, -3,-14, -5, -9, 10, 9, -2,-27,-16, -7; /M: SY='E'; M= -7, 5,-24, 9, 19,-21,-15, 0,-22, 2,-18,-14, 1,-10, 7, -3, 4, -1,-19,-26, -8, 12; /M: SY='F'; M=-17,-28,-20,-36,-27, 57,-30,-18, 6,-28, 14, 4,-21,-29,-32,-19,-19, -9, 4, 2, 22,-27; /M: SY='T'; M= -4, -4,-18, -8, -8,-11,-19,-12, -4, -8, -6, -4, -3,-15, -7, -9, 3, 10, 0,-27, -8, -8; /M: SY='V'; M= -6,-30,-15,-34,-29, 4,-33,-28, 33,-25, 18, 14,-26,-27,-26,-24,-16, -5, 35,-24, -4,-29; /M: SY='D'; M=-14, 21,-28, 29, 12,-25,-13, 2,-28, 1,-21,-18, 10,-13, 2, -3, -3, -9,-23,-27,-11, 6; /M: SY='A'; M= 11,-12, -4,-19,-14,-13,-12,-21, -6,-15, -6, -7,-10,-15,-13,-17, 4, 10, 1,-26,-14,-14; /I: I=-5; MI=0; MD=-16; IM=0; /M: SY='R'; M= -3, -3,-19, -5, -2,-18, -8,-10,-18, 5,-18,-11, 1,-11, -1, 7, 3, 2,-12,-24,-13, -3; D=-3; /I: DM=-16; /M: SY='N'; M= 0, 4,-23, 3, 4,-24, -1, -8,-22, 2,-21,-14, 5,-10, -1, -2, 3, -3,-17,-27,-18, 1; D=-3; /I: DM=-16; /M: SY='A'; M= 25, -4,-16, -9, -6,-21, 2,-16,-14, -9,-14,-12, -3,-12, -8,-16, 8, 0, -7,-23,-18, -7; /M: SY='G'; M= -1, -4,-28, -2,-11,-28, 43,-17,-33,-13,-26,-18, 0,-17,-14,-16, 0,-14,-24,-23,-25,-12; /M: M= -1, -5,-21, -6, 0,-18, -7,-10,-15, -2,-14, -9, -4,-11, -2, -6, -1, -4,-12,-25,-13, -1; /M: SY='G'; M= 2, 2,-25, 2, -8,-28, 35,-14,-32,-12,-28,-20, 7,-15,-11,-14, 6, -9,-24,-26,-25,-10; /M: SY='D'; M= -6, 2,-27, 4, 4,-26, -5, -6,-22, 2,-19,-10, 1, -2, 3, -3, -2, -7,-20,-27,-17, 3; /M: SY='L'; M= -8,-29,-20,-31,-23, 13,-30,-22, 21,-27, 31, 16,-27,-25,-23,-21,-23, -8, 16,-19, 0,-23; /M: SY='E'; M= -5, 1,-22, 1, 7,-21,-11, -9,-20, 3,-16,-12, 0,-12, 3, 2, 4, 4,-14,-27,-13, 4; /M: SY='V'; M= 9,-23,-11,-28,-23, -4,-22,-26, 18,-20, 7, 6,-22,-23,-22,-21, -7, -1, 27,-25,-10,-23; /M: SY='S'; M= -1, -4,-21, -6, 1,-19,-10, -6,-16, 0,-16, -9, -2,-14, 2, 0, 5, 3,-10,-25,-10, 0; /M: SY='V'; M= -2,-28,-15,-33,-28, 1,-32,-28, 32,-24, 13, 12,-25,-26,-25,-23,-13, -4, 36,-25, -6,-28; /M: SY='E'; M= -7, -5,-17, -5, 5,-18,-19, -3,-15, 2,-12, -7, -4,-13, 3, 4, -1, 0,-10,-27,-11, 3; D=-2; /M: SY='G'; M= -2, 4,-23, 7, -5,-27, 23,-11,-29,-12,-25,-19, 4,-12,-10,-14, 6, -6,-21,-29,-23, -7; D=-2; /M: SY='P'; M= -5,-15,-35, -7, -1,-27,-14,-18,-19,-10,-25,-18,-15, 64, -9,-19, -6, -9,-26,-29,-27, -9; D=-2; /M: SY='S'; M= 1, 8,-16, 9, 5,-23, -8, -6,-22, 0,-23,-15, 7,-11, 2, -3, 14, 6,-15,-32,-16, 3; D=-2; /M: SY='G'; M= -3, -7,-28, -7, -7,-27, 27,-15,-29, -5,-25,-15, -1,-10, -8, -6, -1,-12,-23,-22,-22, -8; D=-2; /M: SY='A'; M= 2, -5,-18, -7, -4,-19, -9,-11,-14, -1,-16,-10, -2, -7, -5, -2, 1, -3, -8,-27,-16, -5; D=-2; /I: I=-4; MI=-15; MD=-20; IM=-15; DM=-20; /M: SY='P'; M= -6, -5,-12, -3, 2,-15,-13,-11, -9, -4,-10, -7, -7, 4, -4, -8, -5, -4, -7,-22,-13, -2; D=-2; /I: DM=-20; /M: SY='V'; M= -1, -9,-16,-11, -1, -9,-18, -9, 0, -8, -3, -2, -8,-12, -7, -9, -4, -3, 3,-21, -8, -5; D=-2; /I: DM=-20; /M: SY='E'; M=-12, 6,-28, 14, 17,-28,-15, -2,-27, 4,-23,-17, 0, 10, 2, -3, -5, -9,-25,-29,-17, 8; /M: SY='V'; M= 0,-21, -3,-26,-22, -6,-25,-22, 11,-19, 2, 3,-19,-16,-20,-20, -8, -1, 17,-28,-11,-22; /M: SY='E'; M= -7, 4,-20, 5, 6,-19,-15, -2,-19, 2,-16,-10, 3,-15, 3, 0, -1, -4,-15,-26, -9, 4; /M: SY='V'; M= -5,-24, -5,-28,-22, -5,-29,-23, 17,-19, 8, 10,-21,-21,-17,-18,-13, -5, 19,-26, -9,-21; /M: SY='E'; M= -8, -7,-24, -7, 3,-17,-22, -9, -6, 3, -9, -2, -8,-13, 3, -2, -5, -3, -4,-24, -8, 2; /M: SY='D'; M=-13, 21,-28, 30, 16,-31,-13, 3,-30, 6,-23,-18, 8, -9, 4, 3, -2, -9,-24,-32,-15, 9; /M: SY='N'; M=-10, 1,-21, -5, -5,-12,-14, 2, -9, -5, -6, -2, 9,-21, -3, 0, -5, -5,-11,-28, -9, -5; /M: SY='G'; M= -5, 0,-29, 2, 1,-28, 14, -6,-29, -3,-26,-15, 3, -3, -2, -6, -1,-11,-25,-26,-20, -2; /M: SY='D'; M=-13, 32,-27, 40, 15,-33, -8, 3,-32, 1,-28,-23, 21, -7, 4, -6, 3, -7,-28,-36,-19, 9; /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; /M: SY='G'; M= -3, 0,-27, -1,-10,-26, 36, -7,-32,-12,-26,-17, 6,-18,-10,-10, 1,-12,-25,-24,-21,-11; D=-6; /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='T'; M= -3, -5,-14, -9, -5,-14,-17, -9,-11, -3,-11, -6, -3,-13, -3, -3, 8, 19, -4,-27, -9, -5; D=-6; /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='Y'; M=-16,-19,-10,-22,-21, 21,-28, 4, -3,-16, -2, -2,-17,-28,-16,-14,-15, -8, -6, 6, 39,-20; /M: SY='S'; M= -3, 0,-18, -2, -3,-19, -8, -9,-18, -3,-15,-10, 1,-16, -3, -1, 3, 3,-12,-26,-14, -4; /M: SY='V'; M= 3,-26, -4,-30,-27, -2,-27,-27, 22,-21, 7, 8,-24,-26,-25,-22,-10, -3, 32,-27,-10,-26; /M: SY='S'; M= -1, -4,-16, -6, 2,-16,-14,-11,-17, 2,-18,-12, -1,-13, -1, 5, 9, 9, -9,-27,-13, 0; /M: SY='Y'; M=-19,-24,-22,-27,-24, 43,-30, 3, -1,-17, 2, -1,-21,-30,-21,-14,-20,-11, -7, 24, 57,-24; /M: SY='T'; M= -4,-12,-17,-16,-12, -7,-24,-18, 2, -9, -2, -2,-10,-18,-12, -8, 0, 12, 8,-22, -5,-13; /M: SY='P'; M= -6,-20,-36,-13, -4,-24,-20,-20,-14,-12,-23,-14,-20, 70,-11,-20,-10, -9,-22,-28,-25,-12; /M: SY='K'; M= -4, -6,-23, -7, 0,-15,-20, -7,-12, 4,-10, -4, -6,-12, 2, 3, -4, -1, -9,-21, -5, 0; /M: SY='E'; M= -6, 0,-21, 4, 23,-25,-18, -2,-20, 4,-16,-11, -4,-10, 11, -1, -1, -5,-16,-28,-15, 17; /M: SY='P'; M= -1, -8,-25, -7, 0,-21,-16,-15,-12, -5,-16,-10, -9, 15, -6,-10, -3, -1,-10,-28,-19, -5; /M: SY='G'; M= -1,-11,-29,-11,-19,-28, 59,-20,-34,-18,-27,-17, -2,-20,-19,-18, -1,-18,-24,-20,-27,-19; /M: SY='D'; M=-10, 6,-26, 9, 7,-23,-18,-10,-17, 1,-17,-13, 1, 3, -2, -4, -2, 0,-15,-30,-16, 1; /M: SY='H'; M=-19,-11,-30,-11,-10, 6,-25, 52,-14,-10, -9, 0, -6,-24, -1, -6,-15,-14,-18, 2, 47,-10; /M: SY='T'; M= -2, -5,-18, -8, -2,-14,-16,-12, -9, -6, -9, -7, -3,-15, -4, -6, 6, 12, -3,-29,-12, -3; /M: SY='I'; M= -5,-28,-20,-32,-27, 1,-33,-28, 34,-25, 18, 14,-25,-25,-23,-24,-16, -5, 33,-22, -4,-27; /M: SY='N'; M= -7, 6,-20, 5, 2,-17,-10, -1,-17, -5,-16,-10, 7,-15, -2, -7, 4, 1,-14,-29,-10, -1; /M: SY='V'; M= -3,-29,-15,-32,-29, -1,-32,-29, 33,-23, 13, 13,-26,-26,-25,-23,-13, -3, 39,-27, -7,-29; /M: SY='K'; M= -9, -7,-23,-10, -4, -9,-21,-12,-12, 7, -8, -5, -6,-16, -3, 6, -4, 5, -8,-18, -3, -4; /M: SY='Y'; M=-16,-27,-24,-30,-24, 29,-28,-11, 2,-18, 5, 0,-24,-29,-22,-16,-22,-11, -1, 24, 33,-23; /M: SY='N'; M= -2, 15,-24, 13, -2,-27, 15, -5,-28, -6,-25,-19, 18,-16, -5, -8, 4, -8,-24,-30,-21, -4; /M: SY='G'; M= -5, 3,-29, 7, -7,-30, 42,-12,-37,-12,-29,-21, 5,-17,-12,-14, 0,-16,-29,-24,-23,-10; /I: MD=-35; /M: SY='E'; M= -8, 1,-24, 3, 14,-21,-17, -3,-15, 1,-14, -8, 0,-10, 8, -2, -2, -6,-12,-28,-13, 10; D=-5; /I: I=-10; MI=-10; IM=-10; DM=-27; /M: SY='H'; M=-10, -2,-30, 0, 5,-25,-17, 24,-23, -5,-23,-11, 1, 16, 5, -7, -3, -9,-25,-30, -9, 2; /M: SY='I'; M= -6,-28,-19,-33,-27, -1,-33,-26, 33,-24, 14, 13,-23,-25,-22,-23,-15, -5, 32,-22, -4,-27; /M: SY='P'; M= -5,-12,-32, -7, 1,-27,-14,-14,-21, -2,-25,-16,-11, 41, -4, -9, -5, -7,-24,-24,-22, -4; /M: SY='G'; M= -2, 1,-25, -1, -5,-24, 20, -9,-28, -5,-23,-15, 6,-17, -6, -5, 1,-10,-22,-25,-20, -6; /M: SY='S'; M= 10, -4,-10, -6, -5,-14, -1,-12,-17,-11,-24,-16, 4,-13, -5,-11, 28, 13, -9,-33,-15, -5; /M: SY='P'; M=-10,-20,-39,-10, 0,-29,-20,-20,-20, -9,-29,-19,-20, 86,-10,-19,-10,-10,-29,-30,-29,-10; /M: SY='F'; M=-15,-25,-20,-32,-24, 48,-28,-14, 2,-22, 7, 2,-18,-27,-26,-16,-16, -8, 0, 2, 25,-23; /M: SY='R'; M= -6, -5,-24, -6, 3,-20,-19, -9,-14, 8,-14, -6, -4, -9, 5, 9, -1, 2,-11,-24,-11, 3; /M: SY='V'; M= 1,-25, -3,-28,-25, -1,-27,-27, 18,-21, 7, 5,-23,-27,-24,-21, -8, 0, 30,-28, -9,-25; /M: SY='K'; M= -8, -5,-22, -6, -1,-16,-18, 1,-15, 5,-13, -4, -2,-12, 1, 4, -5, -4,-11,-24, -5, -1; /M: SY='V'; M= 3,-27,-11,-31,-27, -4,-26,-28, 25,-22, 10, 9,-24,-25,-24,-23,-11, -4, 33,-26,-10,-27; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 234 in 46 different sequences |
Number of true positive hits | 232 in 44 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 2 in 2 different sequences |
Number of false negative sequences | 0 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 99.15 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
Maximum number of repetitions [info] | 24 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | K_Hofmann |
Feature key [info] | REPEAT |
Feature description [info] | Filamin |
Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
44 sequences
AREL1_HUMAN (O15033), AREL1_MOUSE (Q8CHG5), DYHA_CHLRE (Q39610), FLNA_DROME (Q9VEN1), FLNA_HUMAN (P21333), FLNA_MOUSE (Q8BTM8), FLNB_HUMAN (O75369), FLNB_MOUSE (Q80X90), FLNB_RABIT (Q9MZD2), FLNC_HUMAN (Q14315), FLNC_MOUSE (Q8VHX6), FLNC_RAT(D3ZHA0), GELA_DICDI (P13466), GEX2_ARATH (F4K4R6), HIW_DROME (Q9NB71), LIN41_BOVIN (E1BJS7), LIN41_CAEEL (Q9U489), LIN41_CHICK (Q1PRL4), LIN41_DANRE (E7FAM5), LIN41_HUMAN (Q2Q1W2), LIN41_MOUSE (Q1PSW8), LIN41_RAT (D3ZVM4), LIN41_XENTR (F6QEU4), MYCB2_DANRE (F1RD40), MYCB2_HUMAN (O75592), MYCB2_MOUSE (Q7TPH6), PLGT2_DANRE (Q7ZVE6), PLGT2_HUMAN (Q6UW63), PLGT2_MOUSE (Q9JHP7), PLGT3_HUMAN (Q7Z4H8), PLGT3_MOUSE (G5E897), PLGT3_RAT (Q566E5), TRI45_BOVIN (Q5BIM1), TRI45_HUMAN (Q9H8W5), TRI45_MOUSE (Q6PFY8), TRIM2_AILME (D2GXS7), TRIM2_BOVIN (A4IF63), TRIM2_CALJA (F7H9X2), TRIM2_HUMAN (Q9C040), TRIM2_MOUSE (Q9ESN6), TRIM2_RAT (D3ZQG6), TRIM3_HUMAN (O75382), TRIM3_MOUSE (Q9R1R2), TRIM3_RAT (O70277)» more
|
UniProtKB/Swiss-Prot False positive sequences |
2 sequences
SOD5_CANAL (Q5AD07), Y9956_DICDI (Q55EI8) |
PDB [Detailed view] |
65 PDB
1KSR; 1QFH; 1V05; 1WLH; 2AAV; 2BP3; 2BRQ; 2D7M; 2D7N; 2D7O; 2D7P; 2D7Q; 2DI7; 2DI8; 2DI9; 2DIA; 2DIB; 2DIC; 2DJ4; 2DLG; 2DMB; 2DMC; 2DS4; 2E9I; 2E9J; 2EE6; 2EE9; 2EEA; 2EEB; 2EEC; 2EED; 2J3S; 2JF1; 2K3T; 2K7P; 2K7Q; 2K9U; 2MTP; 2N62; 2NQC; 2W0P; 3CNK; 3ISW; 3RGH; 3V8O; 4B7L; 4M9P; 4MGX; 4P3W; 4UMG; 5DCP; 5XR1; 6EW1; 6FPT; 6FQ3; 6FQL; 6G4A; 7O0B; 7OUU; 7OUV; 7P0E; 7SC4; 7SFT; 7Z20; 7ZP8 » more |