To improve security and privacy, we are moving our web pages and services from HTTP to HTTPS.
To give users of web services time to transition to HTTPS, we will support separate HTTP and HTTPS services until the end of 2017.
From January 2018 most HTTP traffic will be automatically redirected to HTTPS. [more...]
View this page in https
Entry: PS50194

General information about the entry

Entry name [info] FILAMIN_REPEAT
Accession [info] PS50194
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-DEC-2001 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 22-NOV-2017 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC50194
Associated ProRule [info] PRU00087

Name and characterization of the entry

Description [info] Filamin/ABP280 repeat profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=95;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=90;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.8348000; R2=0.0205485; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4094.8825684; R2=6.1862440; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=374; H_SCORE=6409; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=276; H_SCORE=5802; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MM=1; M0=-1;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='S'; M= -2, -7,-19, -8, -3,-19, -7,-14,-14, -2,-14, -9, -4,-11, -6, -5,  1, -1, -8,-27,-16, -5;
/M: SY='P'; M= -2, -4,-26,  0,  6,-24,-11, -9,-18, -6,-17,-12, -5, 12,  1,-10, -1, -6,-18,-28,-19,  2;
/M: SY='A'; M=  6, -8,-18, -9, -8,-17, -9,-17, -7,-12,-10, -8, -8, -6,-10,-16,  2,  0, -2,-27,-16,-10;
/M:         M= -1,-12, -7,-13,-15,-10, -5,-11,-11,-17,-11, -9, -9,-16,-16,-17,  0, -4, -4,-27,-11,-16;
/M: SY='D'; M=-14, 34,-27, 45, 14,-31, -8,  4,-33, -2,-26,-23, 19,-12,  0, -8,  2, -8,-27,-36,-17,  7;
/M: SY='P'; M= 19,-13,-19,-16, -7,-21,-11,-19,-11,-11,-14,-11,-12, 20, -9,-19,  2, -1, -9,-25,-21,-10;
/M: SY='S'; M=  3,  4,-18,  5,  5,-24, -4, -6,-23, -3,-26,-17,  8, -7,  4, -4, 20,  8,-16,-34,-18,  4;
/M: SY='K'; M= -8, -2,-27, -3,  5,-24,-17, -2,-24, 28,-21, -8,  1,-14,  8, 24, -7, -9,-18,-22,-10,  6;
/M: SY='V'; M=  4,-25, -6,-27,-24, -5,-25,-27, 19,-20,  4,  4,-23,-23,-24,-20, -5,  0, 32,-30,-12,-24;
/M: SY='K'; M= -8, -6,-24, -8, -1,-16,-21,-10,-14, 14,-13, -5, -4,-15,  1, 14, -4,  1, -8,-21, -5, -2;
/M: SY='V'; M= 16,-21, -3,-26,-21, -9,-19,-25, 11,-18,  0,  0,-19,-21,-20,-21, -1, -1, 23,-27,-14,-21;
/M: SY='Y'; M= -9, -6,-24, -8, -6, -4,-15, -3,-16, -3,-15,-11, -3,-18, -4, -1, -2,  2,-14, -3, 10, -6;
/M: SY='G'; M=  0, -7,-29, -6,-16,-29, 59,-18,-38,-18,-28,-20,  1,-19,-17,-19,  1,-17,-28,-22,-28,-16;
/M: SY='P'; M= -3,-11,-30, -6,  2,-22,-18,-14,-14, -8,-13,-12,-13, 33, -6,-13, -8, -8,-18,-27,-20, -5;
/M: SY='G'; M=  0, -4,-28, -4,-12,-30, 49,-16,-35,-15,-28,-19,  3,-15,-12,-16,  2,-15,-28,-23,-27,-12;
/M: SY='L'; M= -9,-21,-20,-22,-15,  2,-27,-17, 13,-21, 28, 12,-20,-26,-15,-14,-20, -8,  8,-23, -4,-15;
/M: SY='E'; M= -5,  1,-24,  4, 16,-25,-14, -3,-20,  4,-19,-11,  0, -9, 11,  2,  4, -3,-16,-29,-15, 13;
/M: SY='R'; M= -5, -7,-26, -7,  0,-24, -4, -9,-23,  9,-22,-12, -2, -6,  0, 12, -1, -6,-16,-25,-16, -2;
/M: SY='A'; M=  9, -4,-20, -7, -5,-21,  7,-15,-18, -8,-15,-11, -2,-12, -8,-12,  5,  0,-12,-25,-19, -7;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-15; IM=0;
/M: SY='R'; M= -9,-12,-22,-14, -7, -4,-20,-10, -6,  0, -8, -3, -7,-11, -6,  3, -7, -4, -4,-19, -4, -8; D=-3;
/I:         DM=-15;
/M: SY='V'; M=  3,-22,-13,-25,-21, -4,-25,-25, 16,-17,  8,  5,-21,-24,-21,-16, -8,  1, 26,-25,-10,-21;
/M: SY='G'; M= -6,  3,-25,  0, -9,-22, 27, -9,-30, -7,-25,-17, 12,-19,-11, -7,  0,-12,-25,-25,-20,-10;
/M: SY='E'; M= -6, -1,-25,  1, 14,-24,-18, -2,-20, 12,-19,-10, -1, -7, 12,  6, -1, -5,-17,-26,-12, 13;
/M: SY='P'; M= -4, -8,-27, -5,  2,-23,-18,-12,-15, -4,-20,-13, -8, 23, -4,-10,  0,  1,-14,-29,-18, -3;
/M: SY='A'; M= 16, -6,-10,-13, -9,-18, -9,-15,-10, -8,-13, -9, -3,-14, -5, -9, 10,  9, -2,-27,-16, -7;
/M: SY='E'; M= -7,  5,-24,  9, 19,-21,-15,  0,-22,  2,-18,-14,  1,-10,  7, -3,  4, -1,-19,-26, -8, 12;
/M: SY='F'; M=-17,-28,-20,-36,-27, 57,-30,-18,  6,-28, 14,  4,-21,-29,-32,-19,-19, -9,  4,  2, 22,-27;
/M: SY='T'; M= -4, -4,-18, -8, -8,-11,-19,-12, -4, -8, -6, -4, -3,-15, -7, -9,  3, 10,  0,-27, -8, -8;
/M: SY='V'; M= -6,-30,-15,-34,-29,  4,-33,-28, 33,-25, 18, 14,-26,-27,-26,-24,-16, -5, 35,-24, -4,-29;
/M: SY='D'; M=-14, 21,-28, 29, 12,-25,-13,  2,-28,  1,-21,-18, 10,-13,  2, -3, -3, -9,-23,-27,-11,  6;
/M: SY='A'; M= 11,-12, -4,-19,-14,-13,-12,-21, -6,-15, -6, -7,-10,-15,-13,-17,  4, 10,  1,-26,-14,-14;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-16; IM=0;
/M: SY='R'; M= -3, -3,-19, -5, -2,-18, -8,-10,-18,  5,-18,-11,  1,-11, -1,  7,  3,  2,-12,-24,-13, -3; D=-3;
/I:         DM=-16;
/M: SY='N'; M=  0,  4,-23,  3,  4,-24, -1, -8,-22,  2,-21,-14,  5,-10, -1, -2,  3, -3,-17,-27,-18,  1; D=-3;
/I:         DM=-16;
/M: SY='A'; M= 25, -4,-16, -9, -6,-21,  2,-16,-14, -9,-14,-12, -3,-12, -8,-16,  8,  0, -7,-23,-18, -7;
/M: SY='G'; M= -1, -4,-28, -2,-11,-28, 43,-17,-33,-13,-26,-18,  0,-17,-14,-16,  0,-14,-24,-23,-25,-12;
/M:         M= -1, -5,-21, -6,  0,-18, -7,-10,-15, -2,-14, -9, -4,-11, -2, -6, -1, -4,-12,-25,-13, -1;
/M: SY='G'; M=  2,  2,-25,  2, -8,-28, 35,-14,-32,-12,-28,-20,  7,-15,-11,-14,  6, -9,-24,-26,-25,-10;
/M: SY='D'; M= -6,  2,-27,  4,  4,-26, -5, -6,-22,  2,-19,-10,  1, -2,  3, -3, -2, -7,-20,-27,-17,  3;
/M: SY='L'; M= -8,-29,-20,-31,-23, 13,-30,-22, 21,-27, 31, 16,-27,-25,-23,-21,-23, -8, 16,-19,  0,-23;
/M: SY='E'; M= -5,  1,-22,  1,  7,-21,-11, -9,-20,  3,-16,-12,  0,-12,  3,  2,  4,  4,-14,-27,-13,  4;
/M: SY='V'; M=  9,-23,-11,-28,-23, -4,-22,-26, 18,-20,  7,  6,-22,-23,-22,-21, -7, -1, 27,-25,-10,-23;
/M: SY='S'; M= -1, -4,-21, -6,  1,-19,-10, -6,-16,  0,-16, -9, -2,-14,  2,  0,  5,  3,-10,-25,-10,  0;
/M: SY='V'; M= -2,-28,-15,-33,-28,  1,-32,-28, 32,-24, 13, 12,-25,-26,-25,-23,-13, -4, 36,-25, -6,-28;
/M: SY='E'; M= -7, -5,-17, -5,  5,-18,-19, -3,-15,  2,-12, -7, -4,-13,  3,  4, -1,  0,-10,-27,-11,  3; D=-2;
/M: SY='G'; M= -2,  4,-23,  7, -5,-27, 23,-11,-29,-12,-25,-19,  4,-12,-10,-14,  6, -6,-21,-29,-23, -7; D=-2;
/M: SY='P'; M= -5,-15,-35, -7, -1,-27,-14,-18,-19,-10,-25,-18,-15, 64, -9,-19, -6, -9,-26,-29,-27, -9; D=-2;
/M: SY='S'; M=  1,  8,-16,  9,  5,-23, -8, -6,-22,  0,-23,-15,  7,-11,  2, -3, 14,  6,-15,-32,-16,  3; D=-2;
/M: SY='G'; M= -3, -7,-28, -7, -7,-27, 27,-15,-29, -5,-25,-15, -1,-10, -8, -6, -1,-12,-23,-22,-22, -8; D=-2;
/M: SY='A'; M=  2, -5,-18, -7, -4,-19, -9,-11,-14, -1,-16,-10, -2, -7, -5, -2,  1, -3, -8,-27,-16, -5; D=-2;
/I:         I=-4; MI=-15; MD=-20; IM=-15; DM=-20;
/M: SY='P'; M= -6, -5,-12, -3,  2,-15,-13,-11, -9, -4,-10, -7, -7,  4, -4, -8, -5, -4, -7,-22,-13, -2; D=-2;
/I:         DM=-20;
/M: SY='V'; M= -1, -9,-16,-11, -1, -9,-18, -9,  0, -8, -3, -2, -8,-12, -7, -9, -4, -3,  3,-21, -8, -5; D=-2;
/I:         DM=-20;
/M: SY='E'; M=-12,  6,-28, 14, 17,-28,-15, -2,-27,  4,-23,-17,  0, 10,  2, -3, -5, -9,-25,-29,-17,  8;
/M: SY='V'; M=  0,-21, -3,-26,-22, -6,-25,-22, 11,-19,  2,  3,-19,-16,-20,-20, -8, -1, 17,-28,-11,-22;
/M: SY='E'; M= -7,  4,-20,  5,  6,-19,-15, -2,-19,  2,-16,-10,  3,-15,  3,  0, -1, -4,-15,-26, -9,  4;
/M: SY='V'; M= -5,-24, -5,-28,-22, -5,-29,-23, 17,-19,  8, 10,-21,-21,-17,-18,-13, -5, 19,-26, -9,-21;
/M: SY='E'; M= -8, -7,-24, -7,  3,-17,-22, -9, -6,  3, -9, -2, -8,-13,  3, -2, -5, -3, -4,-24, -8,  2;
/M: SY='D'; M=-13, 21,-28, 30, 16,-31,-13,  3,-30,  6,-23,-18,  8, -9,  4,  3, -2, -9,-24,-32,-15,  9;
/M: SY='N'; M=-10,  1,-21, -5, -5,-12,-14,  2, -9, -5, -6, -2,  9,-21, -3,  0, -5, -5,-11,-28, -9, -5;
/M: SY='G'; M= -5,  0,-29,  2,  1,-28, 14, -6,-29, -3,-26,-15,  3, -3, -2, -6, -1,-11,-25,-26,-20, -2;
/M: SY='D'; M=-13, 32,-27, 40, 15,-33, -8,  3,-32,  1,-28,-23, 21, -7,  4, -6,  3, -7,-28,-36,-19,  9;
/I:         I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29;
/M: SY='G'; M= -3,  0,-27, -1,-10,-26, 36, -7,-32,-12,-26,-17,  6,-18,-10,-10,  1,-12,-25,-24,-21,-11; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='T'; M= -3, -5,-14, -9, -5,-14,-17, -9,-11, -3,-11, -6, -3,-13, -3, -3,  8, 19, -4,-27, -9, -5; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='Y'; M=-16,-19,-10,-22,-21, 21,-28,  4, -3,-16, -2, -2,-17,-28,-16,-14,-15, -8, -6,  6, 39,-20;
/M: SY='S'; M= -3,  0,-18, -2, -3,-19, -8, -9,-18, -3,-15,-10,  1,-16, -3, -1,  3,  3,-12,-26,-14, -4;
/M: SY='V'; M=  3,-26, -4,-30,-27, -2,-27,-27, 22,-21,  7,  8,-24,-26,-25,-22,-10, -3, 32,-27,-10,-26;
/M: SY='S'; M= -1, -4,-16, -6,  2,-16,-14,-11,-17,  2,-18,-12, -1,-13, -1,  5,  9,  9, -9,-27,-13,  0;
/M: SY='Y'; M=-19,-24,-22,-27,-24, 43,-30,  3, -1,-17,  2, -1,-21,-30,-21,-14,-20,-11, -7, 24, 57,-24;
/M: SY='T'; M= -4,-12,-17,-16,-12, -7,-24,-18,  2, -9, -2, -2,-10,-18,-12, -8,  0, 12,  8,-22, -5,-13;
/M: SY='P'; M= -6,-20,-36,-13, -4,-24,-20,-20,-14,-12,-23,-14,-20, 70,-11,-20,-10, -9,-22,-28,-25,-12;
/M: SY='K'; M= -4, -6,-23, -7,  0,-15,-20, -7,-12,  4,-10, -4, -6,-12,  2,  3, -4, -1, -9,-21, -5,  0;
/M: SY='E'; M= -6,  0,-21,  4, 23,-25,-18, -2,-20,  4,-16,-11, -4,-10, 11, -1, -1, -5,-16,-28,-15, 17;
/M: SY='P'; M= -1, -8,-25, -7,  0,-21,-16,-15,-12, -5,-16,-10, -9, 15, -6,-10, -3, -1,-10,-28,-19, -5;
/M: SY='G'; M= -1,-11,-29,-11,-19,-28, 59,-20,-34,-18,-27,-17, -2,-20,-19,-18, -1,-18,-24,-20,-27,-19;
/M: SY='D'; M=-10,  6,-26,  9,  7,-23,-18,-10,-17,  1,-17,-13,  1,  3, -2, -4, -2,  0,-15,-30,-16,  1;
/M: SY='H'; M=-19,-11,-30,-11,-10,  6,-25, 52,-14,-10, -9,  0, -6,-24, -1, -6,-15,-14,-18,  2, 47,-10;
/M: SY='T'; M= -2, -5,-18, -8, -2,-14,-16,-12, -9, -6, -9, -7, -3,-15, -4, -6,  6, 12, -3,-29,-12, -3;
/M: SY='I'; M= -5,-28,-20,-32,-27,  1,-33,-28, 34,-25, 18, 14,-25,-25,-23,-24,-16, -5, 33,-22, -4,-27;
/M: SY='N'; M= -7,  6,-20,  5,  2,-17,-10, -1,-17, -5,-16,-10,  7,-15, -2, -7,  4,  1,-14,-29,-10, -1;
/M: SY='V'; M= -3,-29,-15,-32,-29, -1,-32,-29, 33,-23, 13, 13,-26,-26,-25,-23,-13, -3, 39,-27, -7,-29;
/M: SY='K'; M= -9, -7,-23,-10, -4, -9,-21,-12,-12,  7, -8, -5, -6,-16, -3,  6, -4,  5, -8,-18, -3, -4;
/M: SY='Y'; M=-16,-27,-24,-30,-24, 29,-28,-11,  2,-18,  5,  0,-24,-29,-22,-16,-22,-11, -1, 24, 33,-23;
/M: SY='N'; M= -2, 15,-24, 13, -2,-27, 15, -5,-28, -6,-25,-19, 18,-16, -5, -8,  4, -8,-24,-30,-21, -4;
/M: SY='G'; M= -5,  3,-29,  7, -7,-30, 42,-12,-37,-12,-29,-21,  5,-17,-12,-14,  0,-16,-29,-24,-23,-10;
/I:         MD=-35;
/M: SY='E'; M= -8,  1,-24,  3, 14,-21,-17, -3,-15,  1,-14, -8,  0,-10,  8, -2, -2, -6,-12,-28,-13, 10; D=-5;
/I:         I=-10; MI=-10; IM=-10; DM=-27;
/M: SY='H'; M=-10, -2,-30,  0,  5,-25,-17, 24,-23, -5,-23,-11,  1, 16,  5, -7, -3, -9,-25,-30, -9,  2;
/M: SY='I'; M= -6,-28,-19,-33,-27, -1,-33,-26, 33,-24, 14, 13,-23,-25,-22,-23,-15, -5, 32,-22, -4,-27;
/M: SY='P'; M= -5,-12,-32, -7,  1,-27,-14,-14,-21, -2,-25,-16,-11, 41, -4, -9, -5, -7,-24,-24,-22, -4;
/M: SY='G'; M= -2,  1,-25, -1, -5,-24, 20, -9,-28, -5,-23,-15,  6,-17, -6, -5,  1,-10,-22,-25,-20, -6;
/M: SY='S'; M= 10, -4,-10, -6, -5,-14, -1,-12,-17,-11,-24,-16,  4,-13, -5,-11, 28, 13, -9,-33,-15, -5;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-39,-10,  0,-29,-20,-20,-20, -9,-29,-19,-20, 86,-10,-19,-10,-10,-29,-30,-29,-10;
/M: SY='F'; M=-15,-25,-20,-32,-24, 48,-28,-14,  2,-22,  7,  2,-18,-27,-26,-16,-16, -8,  0,  2, 25,-23;
/M: SY='R'; M= -6, -5,-24, -6,  3,-20,-19, -9,-14,  8,-14, -6, -4, -9,  5,  9, -1,  2,-11,-24,-11,  3;
/M: SY='V'; M=  1,-25, -3,-28,-25, -1,-27,-27, 18,-21,  7,  5,-23,-27,-24,-21, -8,  0, 30,-28, -9,-25;
/M: SY='K'; M= -8, -5,-22, -6, -1,-16,-18,  1,-15,  5,-13, -4, -2,-12,  1,  4, -5, -4,-11,-24, -5, -1;
/M: SY='V'; M=  3,-27,-11,-31,-27, -4,-26,-28, 25,-22, 10,  9,-24,-25,-24,-23,-11, -4, 33,-26,-10,-27;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2017_11 which contains 556'196 sequence entries.


Total number of hits 232 in 44 different sequences
Number of true positive hits 230 in 42 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 2 in 2 different sequences
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 99.14 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 24
Feature key [info] REPEAT
Feature description [info] Filamin
Version [info] 5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
42 sequences

AREL1_HUMAN (O15033    ), AREL1_MOUSE (Q8CHG5    ), DYHA_CHLRE  (Q39610    ), 
FLNA_DROME  (Q9VEN1    ), FLNA_HUMAN  (P21333    ), FLNA_MOUSE  (Q8BTM8    ), 
FLNB_HUMAN  (O75369    ), FLNB_MOUSE  (Q80X90    ), FLNB_RABIT  (Q9MZD2    ), 
FLNC_HUMAN  (Q14315    ), FLNC_MOUSE  (Q8VHX6    ), FLNC_RAT    (D3ZHA0    ), 
GELA_DICDI  (P13466    ), GEX2_ARATH  (F4K4R6    ), HIW_DROME   (Q9NB71    ), 
KDEL1_DANRE (Q7ZVE6    ), KDEL1_HUMAN (Q6UW63    ), KDEL1_MOUSE (Q9JHP7    ), 
KDEL2_HUMAN (Q7Z4H8    ), KDEL2_RAT   (Q566E5    ), LIN41_BOVIN (E1BJS7    ), 
LIN41_CAEEL (Q9U489    ), LIN41_CHICK (Q1PRL4    ), LIN41_DANRE (E7FAM5    ), 
LIN41_HUMAN (Q2Q1W2    ), LIN41_MOUSE (Q1PSW8    ), LIN41_RAT   (D3ZVM4    ), 
LIN41_XENTR (F6QEU4    ), MYCB2_HUMAN (O75592    ), MYCB2_MOUSE (Q7TPH6    ), 
TRI45_BOVIN (Q5BIM1    ), TRI45_HUMAN (Q9H8W5    ), TRI45_MOUSE (Q6PFY8    ), 
TRIM2_AILME (D2GXS7    ), TRIM2_BOVIN (A4IF63    ), TRIM2_CALJA (F7H9X2    ), 
TRIM2_HUMAN (Q9C040    ), TRIM2_MOUSE (Q9ESN6    ), TRIM2_RAT   (D3ZQG6    ), 
TRIM3_HUMAN (O75382    ), TRIM3_MOUSE (Q9R1R2    ), TRIM3_RAT   (O70277    )
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
False positive sequences
2 sequences

SOD5_CANAL  (Q5AD07    ), Y9956_DICDI (Q55EI8    )

		
PDB
[Detailed view]
51 PDB

1KSR; 1QFH; 1V05; 1WLH; 2AAV; 2BP3; 2BRQ; 2D7M; 2D7N; 2D7O; 2D7P; 2D7Q; 2DI7; 2DI8; 2DI9; 2DIA; 2DIB; 2DIC; 2DJ4; 2DLG; 2DMB; 2DMC; 2DS4; 2E9I; 2E9J; 2EE6; 2EE9; 2EEA; 2EEB; 2EEC; 2EED; 2J3S; 2JF1; 2K3T; 2K7P; 2K7Q; 2K9U; 2MTP; 2N62; 2NQC; 2W0P; 3CNK; 3ISW; 3RGH; 3V8O; 4B7L; 4M9P; 4MGX; 4P3W; 4UMG; 5DCP
» more

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission