PROSITE

Home | Contact

	Home ScanProsite ProRule Documents Downloads Links Funding
	Entry: PS50211

General information about the entry
Entry name	DENN
Accession number	PS50211
Entry type	MATRIX
Date	DEC-2003 (CREATED); DEC-2003 (DATA UPDATE); MAR-2013 (INFO UPDATE).
PROSITE Documentation	PDOC50211
Associated ProRule	PRU00304
Name and characterization of the entry
Description	DENN domain profile.
Matrix / Profile	/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=220; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=215; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5768406; R2=0.0181153; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=327; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=217; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='Y'; M= -2,-13,-24,-16,-14, -4, -6, -7,-16, -8,-14,-11,-10,-20, -9, -5, -2, 0,-13, 8, 13,-13; /M: SY='T'; M= 13, -9,-13,-15,-11,-12,-13,-18, -3,-14, -5, -6, -5,-13,-10,-16, 13, 16, 2,-28,-13,-11; /M: SY='R'; M=-13,-13,-27, -8, -7,-14,-23,-14, -8, -5, -1, -4,-14, 2, -9, 5,-14, -9, -6,-26,-13,-10; /M: SY='Y'; M=-10, -9,-24, -9, -1, -5,-21, -3,-12, 3, -7, -6, -8,-18, -1, 6, -4, 1,-11,-13, 11, -3; /M: SY='C'; M= -2,-17, 55,-22,-22,-15,-22,-25,-13,-22,-15,-13,-15,-30,-22,-22, 3, 0, 5,-43,-23,-22; /M: SY='Y'; M=-14,-29,-29,-31,-24, 12,-31,-14, 17,-24, 20, 10,-26,-27,-17,-20,-26,-13, 5, 15, 24,-23; /M: SY='C'; M= -9,-19, 87,-28,-27, -7,-27,-26,-25,-28,-17,-17,-17,-35,-28,-26, -6, -7, -9,-41,-21,-27; /M: SY='V'; M= 1,-26,-16,-31,-25, 7,-26,-23, 21,-21, 15, 14,-24,-25,-23,-20,-13, -5, 26,-21, -3,-24; /M: SY='L'; M= -8,-30,-18,-30,-22, 8,-30,-22, 22,-28, 41, 18,-30,-30,-22,-20,-25, -8, 19,-22, -2,-22; /M: SY='S'; M= 6, -4,-13, -7, -5,-16, -8,-14, -9,-13,-20,-13, 5,-11, -4,-13, 29, 20, -3,-36,-16, -5; /M: SY='H'; M=-17, 3,-27, 4, 1,-21,-19, 34,-29, 6,-20, -9, 6,-17, 6, 23, -5, -6,-22,-28, 0, 0; /M: SY='Y'; M= 2,-17,-21,-20, -8, 10,-21, -8, -2,-15, 9, 0,-17,-21,-12,-15,-12, -7, -4, -6, 14,-11; /M: SY='P'; M= -8,-18,-38,-10, -5,-30, 2,-20,-25,-12,-30,-20,-15, 63,-12,-20, -8,-12,-30,-28,-30,-12; /M: SY='F'; M=-14,-17, -8,-24,-21, 16,-24, -4, -6,-21, -2, -4,-11,-29,-21,-16,-16,-11, -5, 0, 7,-20; /M: SY='F'; M=-19,-29,-21,-36,-28, 65,-30,-16, 3,-28, 14, 3,-21,-30,-34,-19,-21,-10, 0, 8, 31,-28; /M: SY='N'; M= -6, 16,-21, 11, 16,-23, -8, 1,-24, 4,-26,-19, 24,-12, 7, 6, 13, 1,-24,-35,-19, 11; /M: SY='L'; M= -8,-22,-18,-25,-19, 9,-27,-21, 9,-14, 17, 7,-21,-25,-20,-12,-15, 0, 13,-20, -1,-19; /M: SY='F'; M=-16,-24,-21,-31,-22, 39,-27, 0, 3,-24, 16, 13,-18,-27,-23,-16,-21,-11, -1, -7, 18,-21; /M: SY='R'; M=-12,-12,-24,-14,-10, 1,-11, -6,-19, 1,-14,-10, -4,-20, -7, 18, -2, 0,-13,-13, 3,-10; /M: SY='B'; M= 0, 9,-23, 7, 6,-26, -1, -9,-26, 7,-23,-16, 8,-11, -1, -1, 3, -1,-20,-27,-18, 3; /M: SY='I'; M= -7,-24, -5,-29,-24, 0,-30,-21, 19,-24, 9, 7,-19,-25,-19,-23,-11, -5, 16,-22, 1,-24; /M: SY='L'; M= -9,-26,-19,-27,-19, 7,-29,-20, 16,-27, 42, 16,-26,-27,-19,-19,-23, -2, 9,-21, -1,-19; /M: SY='N'; M=-13, 13,-27, 11, 5,-19, -3, 16,-26, -1,-23,-15, 17,-18, 1, 3, -2,-10,-26,-24, -3, 1; /M: SY='E'; M= -5, 8,-24, 8, 22,-26, -5, -3,-25, 0,-23,-16, 9, -9, 12, -3, 9, 2,-24,-30,-19, 17; /M: SY='I'; M= -1,-26,-19,-33,-25, 9,-28,-23, 24,-23, 16, 15,-22,-24,-22,-22,-15, -6, 22,-18, -1,-24; /M: SY='F'; M= -3,-18,-24,-21,-11, 9,-10,-19,-11, -9, -9, -8,-15,-20,-17,-12,-11,-11, -6, 4, 0,-12; /M: SY='R'; M= -5, -9,-23, -9, -8,-15,-21,-14, -5, 2, -3, -2, -9,-19, -6, 9,-10, -7, 0,-24,-10, -9; /M: SY='L'; M= -1,-12,-21,-12, 0,-10,-18, -1, -8,-10, 6, -1,-10,-18, -4, -4, -7, -6, -7,-25, -7, -3; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='I'; M= -7,-17,-20,-18, -8, -2,-20,-13, 9,-12, 8, 9,-17,-16, -8,-12,-15, -9, 5, 0, -1, -8; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='Q'; M= -5, 5,-13, 7, 5,-16, -7, 0,-14, 4,-13, -8, 4, -7, 10, 9, 4, -1,-12,-16, -8, 7; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='C'; M= -3, -1, 8, -5, -6, -6, -8, -7, -6, -9, -3, -5, 3,-13, -6, -8, 1, 0, -5,-20, -9, -6; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='E'; M= -4, -4, 5, -2, 9,-11,-13, -8, -8, -4, -7, -7, -6, -9, -2, -6, -3, -4, -3,-18,-11, 3; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='H'; M= 2, -3,-11, -4, -1,-11, -6, 10,-12, 0,-11, -5, 1, -8, 1, 6, 3, -2, -8,-14, -4, -1; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='E'; M= -7, 4,-15, 8, 10,-13,-11, -2, -9, -2, -2, -4, -2, -7, 8, -3, -4, -5,-10,-15, -6, 9; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='R'; M= -9, -9,-13,-12, -7, 6,-12, -3, -5, 2, -1, 6, -6,-12, -3, 14, -8, -5, -4, -7, 1, -5; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='L'; M= -2, -8,-11, -8, -2, -6,-10, -5, 0, -8, 6, 2, -6,-10, 3, -5, -2, -1, -3,-13, -4, 0; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='G'; M= -4, -9,-15, -9,-11, -3, 12, -5, -9,-11, -2, -3, -6,-13, -9, -9, -6, -8, -8, -4, 2,-11; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='V'; M= -4,-11,-13,-12,-11, -6, -4,-11, 2, -5, -2, 0, -7,-12, -8, 0, -6, -5, 5,-12, -6,-11; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='C'; M= -2, -1, 7, -1, 5,-13, -9, -7,-15, 2,-13, -9, -1, -8, 0, -2, 3, -1, -9,-19,-11, 3; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='C'; M= -7, -7, 7,-10, -6, -9,-12, -5, -9, 4, -6, 3, -6,-12, -2, 7, -7, -5, -5,-15, -7, -4; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='A'; M= 5, -9, -9,-10, -7, -6,-10,-11, 1, -1, 2, 1, -9,-10, -7, -4, -5, -3, 5,-12, -6, -7; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='A'; M= 7, -7,-10, -9, -8, -9, 3,-11, -2, -9, -7, -4, -3, -8, -6,-11, 4, -1, -1,-13, -9, -8; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='Y'; M= -4,-11,-12,-12, -9, 3,-13, -5, 6,-11, 6, 3, -8,-12, -7, -9, -4, -1, 2, -7, 8, -9; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='E'; M= 3, -1,-15, 2, 15,-15, -8, -5,-12, 0,-11, -9, -4, 10, 3, -5, 0, -4,-12,-15,-12, 9; D=-1; /I: I=-1; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2; /M: SY='E'; M= 4, -1,-13, -1, 6,-15, 3, -7,-14, 5,-12, -8, -1, -5, 0, -1, 0, -5,-10,-12,-10, 3; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='F'; M= -3, -2, -8, -6, -8, 5, -8, -6, -2, -8, -6, -4, 4,-12, -9, -6, 3, 1, 0,-13, -3, -8; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='P'; M= 4, -5,-15, -5, -2,-16, 5, -7,-12, -4,-12, -7, -4, 7, 2, -7, 0, -5,-12,-12,-12, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='S'; M= 0, -1, -8, -3, -1, -9, -5, -5,-11, 0,-12, -8, 3, -7, 0, 4, 13, 11, -5,-18, -8, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='V'; M= 3, -4, -9, -2, -6, -6,-10,-10, 1, -8, 3, -1, -7,-11, -8, -9, -4, -3, 5,-14, -6, -7; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='S'; M= 7, -1, -8, -4, 0,-12, -5, -5, -8, -2, -9, -5, 0, -5, 6, -4, 9, 7, -6,-15, -8, 3; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='M'; M= 3,-12,-11,-16,-11, -1,-12,-10, 11,-11, 11, 12,-11,-11, -7,-11, -8, -4, 7,-11, -3,-10; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='W'; M= 3,-10,-12,-13, -9, -1, -9,-12, -2, -9, 2, -2,-10,-11, -8, -9, -5, 2, -2, 9, 0, -8; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='C'; M= -4, -8, 9, -9, -7, -7,-11, -8, -8, -6, -3, -4, -5,-13, -6, 0, -1, -1, -4,-18, -8, -7; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='A'; M= 5, -4,-11, -5, 4,-10, -8, -8, -2, -5, -6, -4, -2, -5, -1, -8, 4, 0, -2,-15, -8, 1; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='Y'; M= -8, -9,-16, -9, -4, 5,-13, -1, -5, -5, -5, -3, -8, 3, 0, -5, -7, -5, -9, -1, 10, -2; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='T'; M= -4, 4,-11, 5, -1, -5, -8, -1, -9, -4, -9, -8, 1, -8, -3, -5, 5, 6, -7,-10, 5, -3; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='Q'; M= -3, -5,-13, -8, -5,-11, -2, -8, -2, -6, -5, -1, -3, -8, 2, -6, 0, 2, -4,-12, -6, -2; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='Y'; M= -2, -7, -9, -7, -6, 0, -8, -3, -2, -8, -1, -2, -4,-11, -4, -7, 3, 2, -2, -9, 6, -6; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='A'; M= 4, -5, -9, -8, -4, -7, -9, -9, -5, 1, -1, -2, -5, -8, -4, -2, -1, 4, -2,-12, -5, -4; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='C'; M= 4, -9, 9,-12,-11, -8, 2,-12, -9,-12, -2, -4, -8,-13,-11,-12, -4, -5, -4,-15,-11,-11; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='F'; M= 0,-11,-16,-15,-12, 3,-15,-13, 0,-13, 1, -2, -8, -2,-14,-13, -7, -4, 0,-16, -6,-13; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='E'; M= 2, -4,-16, -6, 5,-15,-14, -8, -9, 1, -4, -4, -5, -9, 5, -2, -1, 2, -8,-18, -9, 5; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='D'; M= -4, 8,-21, 9, 9,-20, -9, -4,-19, 3,-18,-14, 6, 4, 1, 4, 0, -5,-18,-23,-15, 4; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='Q'; M= -6, 1,-21, 1, -2,-19, -4, -9,-11, -1,-13, -6, 0,-10, 2, -4, -2, -3,-10,-19,-10, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='S'; M= 7, -3, 6, -9,-10,-14,-10,-14,-10,-12,-15,-11, 2,-16,-10,-13, 13, 11, -1,-32,-16,-10; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='T'; M= 1,-12,-17,-17,-10, -1,-18,-14, 1,-14, 0, 0, -8,-15, -4,-12, 1, 5, 0,-18, -4, -7; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='Q'; M= -2, -9,-21,-11, 1, -8,-17, -9, -7, -3, -9, -5, -5,-13, 3, 1, 0, -4, -7,-18, -7, 2; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='T'; M= 0,-10,-18,-13, -8,-14,-18, -4, -9, -1, -7, -4, -7,-17, -6, 2, 1, 4, -1,-26, -8, -8; /M: SY='E'; M= -6, -4,-25, -2, 22, -7,-20, 6,-17, -5, -6, -9, -6,-12, 2, -7, -7,-10,-18,-22, -5, 12; /M: SY='H'; M=-10, -5,-26, -4, 8,-21,-10, 21,-16, -5,-13, 1, -4,-15, 9, -5, -6,-13,-15,-26, -6, 7; /M: SY='T'; M= -4, -3,-20, 0, 1,-17,-17,-14,-11,-10,-11,-11, -6, 0, -7,-13, 6, 7, -6,-32,-16, -4; /M: SY='L'; M= -9,-26, -6,-25,-17, -5,-28,-22, 5,-24, 17, 4,-26, -2,-20,-21,-20, -9, 2,-27,-12,-20; /M: SY='K'; M= -2, -4,-27, -2, 12,-28,-16, -7,-24, 16,-24,-13, -3, 4, 12, 12, 0, -6,-21,-25,-16, 11; /M: SY='E'; M=-13, -3,-28, -2, 10,-16,-20, 8,-15, -4, -5, -6, -1, -4, 1, 0,-10,-10,-19,-28,-10, 4; /M: SY='I'; M= -6,-30,-18,-32,-26, 4,-32,-26, 31,-26, 28, 16,-28,-28,-24,-22,-20, -6, 30,-24, -4,-26; /M: SY='H'; M=-11, -9,-29, -8, 3,-12,-20, 9,-17, -1,-13, -7, -8,-17, 7, -2, -8,-10,-19, 2, 8, 4; /M: SY='P'; M= 6, 0,-25, 4, 10,-29,-11,-10,-21, -4,-22,-16, -4, 17, 5,-11, 4, -4,-20,-29,-21, 6; /M: SY='F'; M=-13,-28,-25,-31,-24, 19,-29, -9, 10,-25, 15, 7,-23,-28,-22,-19,-22,-12, 6, 5, 11,-22; /M: SY='P'; M= -7,-17,-27,-17, -4,-13,-24,-16, 6,-15, 0, 4,-14, 8, -7,-17, -8, -6, -3,-26,-12, -8; /M: SY='Y'; M= -1,-12,-24,-15, -7, -6,-19, 13,-10, -5, -4, -1,-10,-20, 3, -1, -9, -9,-12, -8, 17, -5; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='P'; M= -4,-15,-25,-17, -8, -6,-16,-11,-14, -2,-13, -3,-10, 6, -6, 6, -4, -5,-12,-21,-10, -9; /M: SY='V'; M= -7,-21,-23,-20,-16,-12,-13,-19, -1, -8, -3, -2,-18, -9,-15, 1,-11, -8, 7,-25,-14,-18; /M: SY='I'; M= -6,-11,-19,-18,-15, 4,-18,-12, 6,-18, 6, 6, -3,-21,-12,-15, -3, -1, 1,-24, -4,-13; /M: SY='N'; M= -1, 15,-21, 9, 14,-23, -8, 0,-22, 4,-24,-17, 22,-12, 5, 5, 9, -1,-22,-32,-19, 9; /M: SY='G'; M= 6, -6,-17, -5,-12,-19, 9,-18,-13,-14,-17,-12, -4,-18,-14,-16, 9, -1, 0,-30,-20,-13; /M: SY='P'; M= 0,-12,-27, -8, 5,-22,-16,-14,-17, -5,-16,-13,-11, 24, -3, -5, -1, -5,-18,-28,-20, -2; /M: SY='V'; M= -6,-24,-16,-25,-20, 7,-25,-20, 10,-16, 12, 5,-20,-26,-19, -7,-10, -3, 17,-23, -4,-20; /M: SY='P'; M=-11,-11,-30, -8, 3,-19,-21, 2,-17, -6,-13, -9,-10, 22, -3, -4, -7, -3,-20,-28,-13, -3; /M: SY='V'; M= 1,-14,-17,-21,-14, -8,-22,-19, 6, -8, 5, 8,-13,-17,-11,-10, -5, 8, 9,-24, -7,-13; /M: SY='P'; M=-11, 0,-33, 10, 5,-30,-15,-11,-26, -2,-29,-21, -4, 40, -4, -4, -2, -6,-26,-32,-24, -3; /M: SY='G'; M= -1, -3,-25, -7,-15,-24, 42,-13,-28,-15,-25,-11, 7,-19,-13,-15, 4,-11,-23,-25,-24,-14; /M: SY='S'; M= -4, 6,-22, 8, 7,-27,-11, -5,-26, 12,-28,-15, 7,-11, 11, 11, 13, 2,-19,-31,-15, 9; /M: SY='B'; M= 0, 5,-22, 5, -4,-22, -5,-15,-16, -4,-16,-12, 1,-13, -8,-10, 3, 5,-10,-27,-15, -7; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='Y'; M=-11,-15,-22,-20,-12, 5,-25, -9, 5, -9, 0, 3,-10,-17, -3, -3, -9, -1, 0, -9, 9,-10; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='T'; M= 3, -8,-15, -8, 0,-13,-15,-14, -6, -2, -5, -5, -7,-13, -5, -6, 2, 5, 0,-24,-11, -2; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='C'; M=-10, -2, 18, -5,-11,-14,-18,-12,-14, -9, -9,-10, -1,-24,-12, -4, -7, -6, -6,-32,-16,-12; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='S'; M= 1, -7, -2, -9, -8,-17, -2,-15,-14, -8,-19,-12, 0,-14, -7,-10, 12, 2, -7,-29,-16, -8; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='E'; M= -6, -5,-22, -5, 8,-13,-19, -7,-12, -2,-14,-10, -2,-12, 1, 0, 7, 6,-10,-23, -4, 3; /M: SY='V'; M= -3,-13,-18,-13, -9, -9,-19,-11, -2, -5, -6, -2,-11,-20, -3, -6, 1, 1, 4,-22, -1, -6; /M: SY='L'; M=-10,-26,-24,-26,-19, 7,-15,-20, 5,-26, 25, 8,-24,-14,-21,-20,-22,-11, -1,-18, -4,-20; /M: SY='P'; M=-10,-13,-33, -8, 3,-16, -9,-16,-23, -3,-24,-16,-12, 34, -8,-10, -8,-11,-25,-22,-18, -4; /M: SY='A'; M= 16,-13,-17,-17, -9,-15, -3,-15, -7,-14, 1, -3,-11,-17, -4,-15, 0, -4, -5,-22,-14, -7; /M: SY='A'; M= 10,-13,-16,-17, -7,-11,-18,-19, 3,-14, 0, -2,-12,-15,-10,-16, 2, 5, 7,-26,-12, -9; /M: SY='E'; M= -1,-11,-26,-10, 4, -9, 1,-15,-18,-12,-10,-11,-10, -4,-10,-15, -6,-11,-17,-20,-14, -3; /M: SY='N'; M= 1, 15,-20, 12, 10,-25, -8, -3,-21, -1,-22,-16, 17,-11, 7, -5, 11, 4,-20,-32,-18, 9; /M: SY='H'; M= -9, -5,-10, -4, 2,-25, -9, 17,-29, -3,-25,-13, -1, -4, -1, -6, -2,-10,-24,-31,-11, -1; /M: SY='T'; M= 0,-15,-20,-17,-10, -3,-19,-18, -6,-10, 0, -4,-13, -4,-12,-11, -4, 3, -5,-22, -8,-11; /M: SY='L'; M= -6,-18,-19,-21,-13, -3,-25,-17, 9,-20, 20, 8,-16,-21, -7,-15, -9, 3, 4,-24, -5,-11; /M: SY='T'; M= -5, 3,-17, -3, -1,-11,-15, -9, -8,-11, -3, -7, 8,-17, -6, -9, 5, 11, -9,-31,-12, -3; /M: SY='F'; M=-10,-15,-18,-23,-20, 25,-21,-13, 4,-19, 6, 7, -8,-25,-21,-15, -8, -4, 4,-15, 5,-18; /M: SY='C'; M= 12,-13, 53,-20,-11,-21,-18,-23,-23,-18,-16,-16,-14,-24,-16,-23, -1, -6, -9,-36,-25,-14; /M: SY='F'; M= -8,-16,-23,-19, -5, 10,-21,-10, -8, -5, 2, 2,-12,-20, -9, 6,-12, -9, -7,-14, 0, -7; /M: SY='P'; M=-10,-19,-36,-11, 2,-22,-21,-19,-15, -9,-23,-16,-21, 50, -9,-17,-12,-11,-20,-11,-20, -6; /M: SY='P'; M= -1, -6,-25, -1, 5,-19,-16,-13,-13,-11, -6,-10, -9, 10, -6,-15, -3, -5,-14,-29,-17, -2; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='P'; M= -6, -5,-17, 0, -4,-12,-14,-11, -4, -8, -5, -5,-10, 13, -9,-11, -7, -5, -3,-19,-11, -7; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='S'; M= -1, 2, -9, 5, 0, -9, -5, -5, -7, -7, -5, -6, 1, -8, -3, -6, 6, 3, -5,-18, -8, -1; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='F'; M= 2, -9,-20,-11, -7, 9,-19,-11, -7,-12, -5, -7,-12,-19,-15,-15, -6, -6, -2,-11, 6,-10; /M: SY='A'; M= 16, 12,-15, 4, -3,-21, -4, -9,-17, -6,-20,-16, 14,-12, -5,-12, 13, 7,-12,-31,-19, -4; /M: SY='S'; M= 0, -6, -3, -7, -8, -6,-15,-14,-16,-11,-10,-11, -5,-20,-11, -7, 3, -1, -9,-27,-11,-10; /M: SY='L'; M= -7,-30,-17,-30,-23, 7,-30,-23, 23,-27, 40, 17,-30,-30,-23,-20,-25, -7, 20,-23, -3,-23; /M: SY='P'; M= -5, 0,-26, 6, 8,-26,-14,-13,-22, -7,-26,-20, -3, 29, -3,-13, 9, 6,-21,-34,-22, 1; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='F'; M= -6,-11,-14,-15,-11, 5,-17, -1, 1,-15, 3, 1, -6,-15,-10,-11, -2, 4, 0,-16, 2,-11; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6; /M: SY='L'; M= -6,-18,-15,-16,-10, 1,-18,-12, 8,-16, 22, 8,-18, -4,-11,-12,-16, -6, 1,-14, -4,-11; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='F'; M= -7,-19,-11,-21,-16, 22,-19,-14, 9,-18, 16, 6,-16,-19,-19,-12,-14, -5, 9, -6, 6,-16; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='E'; M= -2, -6,-12, -5, 2, -8,-12, -9, -3, -1, -2, -2, -6,-10, -3, -3, -1, -1, 0,-18, -7, 0; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='C'; M= 2, -7, 4, -9, -7, -9,-10, 4, -9,-11, -4, -4, -4,-13, -6,-10, 0, -2, -5,-20, -6, -7; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='L'; M= -5,-19,-10,-20,-16, 13,-19,-15, 12,-16, 16, 7,-17,-19,-18,-12,-12, -4, 15,-11, 1,-16; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='S'; M= 1, 4,-10, 0, -4,-12, 6, -6,-14, -6,-16,-11, 10, -9, -4, -6, 14, 9,-10,-21,-12, -4; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='P'; M= -6, -4,-20, 2, 3,-16,-16,-12, -7, -6,-11, -9, -9, 14, -7,-11, -5, -5, -3,-23,-15, -3; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='D'; M=-11, 23,-20, 24, 12,-21, -7, 2,-22, 5,-20,-16, 20,-10, 4, 5, 1, -5,-21,-26,-14, 7; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='A'; M= 22, -4,-14,-13, -9,-15, -7, -1, -6,-10, -9, -6, 1,-12, -6,-14, 3, -3, -4,-21,-11, -9; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='I'; M= -6,-25, -1,-29,-24, 0,-29,-24, 22,-24, 18, 10,-22,-25,-21,-21,-16, -6, 21,-24, -6,-24; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='V'; M= 2,-19,-17,-21,-17, -8,-11,-19, 6,-12, 4, 2,-15,-20,-15, -7, -8, -6, 12,-20,-10,-17; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='S'; M= -5, -3,-19, 0, -5,-19, -5,-10,-12, -4,-14, -8, -3,-16, -1, -1, 2, -3, -3,-25,-14, -3; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='L'; M= -6,-22,-16,-25,-18, 4,-26,-20, 18,-22, 28, 12,-21,-22,-17,-17,-16, 0, 14,-20, -2,-18; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='C'; M=-10,-19, 17,-22,-13, 5,-25,-18, -3,-22, 13, 1,-19,-26,-18,-18,-17, -9, -2,-23, -6,-15; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='A'; M= 17, -3,-14, -7, 1,-19, 5,-13,-17, -7,-16,-13, -2, -9, -5,-12, 11, 5,-10,-23,-18, -2; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='A'; M= 18,-10, 6,-15,-10,-13, -8,-16,-10,-14, -7, -9, -8,-15,-10,-16, 9, 3, -2,-26,-16,-10; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='L'; M= -9,-26,-20,-29,-20, 6,-29,-20, 24,-26, 37, 18,-24,-24,-18,-20,-24, -9, 13,-18, 0,-20; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='L'; M= -8,-19,-18,-20,-12, 0,-20,-11, 6,-13, 21, 14,-16,-21, -8, -2,-15, -6, 2,-20, -4,-11; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='L'; M= -1,-15,-21,-15, -3,-13,-19, -9, -1,-11, 9, 4,-15, -5, 6, -9,-11, -8, -8,-19, -8, 1; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='E'; M= -6, 12,-21, 19, 31,-24,-13, -4,-24, 2,-19,-18, 4, -4, 9, -4, 8, 2,-20,-29,-16, 20; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='R'; M=-15, 2,-25, 1, 8,-19,-15, 14,-25, 14,-19,-10, 10,-15, 9, 33, -5, -9,-21,-23, -8, 5; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='R'; M=-11, -6,-24, -8, -3,-19, -5, -7,-25, 16,-19,-10, 0,-15, 2, 33, -3, -2,-16,-19,-12, -3; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='V'; M= -3,-26,-14,-29,-26, 0,-29,-26, 31,-20, 11, 11,-24,-24,-24,-20,-11, -3, 39,-24, -6,-26; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='I'; M= -5,-22,-14,-24,-19, 3,-24,-19, 24,-19, 20, 12,-20,-20,-17,-17,-15, -5, 22,-17, -3,-19; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='F'; M=-10,-22,-13,-26,-20, 31,-22,-16, 9,-21, 17, 6,-18,-22,-23,-15,-16, -6, 9, -5, 9,-20; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='V'; M= -4,-15,-14,-17,-12, -5,-21,-15, 12,-12, 8, 6,-13,-16, -6,-11, -6, 2, 13,-18, -5,-10; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='G'; M= 14, -5,-13, -7, -8,-17, 19,-12,-18,-10,-17,-12, 0,-10, -8,-12, 12, -1,-10,-19,-17, -8; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='R'; M= 1, 2,-16, -2, 0,-16, -7, 7,-17, 7,-17, -9, 8,-11, 2, 9, 4, -2,-13,-20, -8, 0; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='S'; M= -3, 4,-14, 5, 0,-12,-10, -4,-15, 1,-16,-11, 3, -9, -1, -2, 9, 8,-10,-18, -1, -1; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='L'; M= -9,-18,-21,-16,-10, 0,-20,-10, 3,-15, 11, 3,-18, 7,-11,-13,-16, -7, -5,-11, 2,-12; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='H'; M= -1, 3,-16, -1, 2,-17, -8, 13,-16, 1,-16, -7, 9,-11, 9, 6, 5, -3,-15,-21, -7, 4; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='H'; M= 0, -5,-14, -9, -5,-10,-11, 10, -9, -1, -6, 3, -2,-11, 0, 5, -1, 1, -6,-17, -3, -4; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='L'; M= 3,-23,-13,-24,-19, 1,-21,-20, 16,-20, 22, 10,-23,-23,-19,-17,-14, -4, 19,-20, -6,-19; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='S'; M= 10, -3,-11, -6, -3,-16, -5,-10,-16, -3,-19,-13, 3,-10, -1, 1, 20, 14, -7,-27,-15, -3; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='M'; M= 9,-13,-15,-20,-11, -9,-11, -6, 1, -3, 2, 20,-11,-14, -2, -1, -6, -5, 1,-17, -8, -7; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='C'; M= 3, 0, 28, -2, -8,-20,-10,-14,-22,-13,-20,-17, -2,-18,-10,-16, 10, 2,-10,-35,-20, -9; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='V'; M= 3,-19,-11,-20,-19, -5,-21, -7, 13,-15, 2, 5,-18,-22,-18,-14, -6, -3, 26,-25, -6,-19; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='M'; M=-10,-20,-23,-23, -9, 3,-28,-14, 12,-15, 11, 14,-18,-21, -5,-13,-15, -8, 7,-19, -1, -7; /M: SY='S'; M= 17, -1,-13, -4, 5,-20, -5,-12,-18, -7,-20,-16, 2, -8, -1,-11, 23, 14, -9,-32,-19, 2; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='M'; M=-10,-22,-19,-26,-19, 10,-24,-14, 14,-13, 14, 15,-17,-21,-14, -5,-16, -7, 11,-14, 2,-17; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='W'; M= -9,-22,-25,-24,-19, -4,-11,-19, 3,-14, 2, 1,-18,-22,-15, -8,-16,-12, 2, 7, -2,-18; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='A'; M= 8, -3,-17, -4, -5, -8,-11,-14,-13,-10,-12,-12, -6, 5,-11,-14, 2, 3, -9,-19,-11, -8; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='L'; M= 2,-18,-13,-22,-16, -1,-19,-16, 11,-16, 17, 13,-18,-19,-13,-14, -9, 2, 12,-20, -5,-15; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='I'; M= -7,-24,-20,-30,-23, 2,-29,-20, 31,-22, 21, 22,-20,-20,-15,-20,-17, -7, 22,-18, -1,-21; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='R'; M=-11, -9,-23, -9, -4, -4,-17, 3,-16, 11,-14, -7, -4,-17, 1, 19, -4, -4,-13, -6, 16, -4; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='P'; M= -7,-18,-31,-11, -4,-22,-18,-18,-11,-10,-21,-14,-18, 63,-11,-17, -9, -7,-16,-26,-23,-11; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='F'; M=-14,-25,-18,-29,-22, 43,-26,-12, 6,-23, 19, 6,-20,-26,-25,-16,-20, -9, 2, 2, 23,-22; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='E'; M= -7, -3,-18, -3, 10, -4,-16, -7,-17, 0,-13,-11, -1,-10, 0, 5, 5, 5,-12,-20, -7, 5; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='W'; M=-16,-26,-14,-27,-23, 10,-21,-11,-13,-16,-11,-11,-26,-27,-16,-16,-24,-17,-17, 67, 32,-19; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='S'; M= -5, -3,-22, 0, -1,-22,-15, -9,-10, -7,-16, -3, -5, 1, 4,-10, 5, -1, -7,-31,-16, 0; /M: SY='F'; M= -4,-14,-18,-17,-12, 8, -7,-14,-10,-16,-12, -7, -7,-20,-10,-13, 5, -1, -4,-19, -4,-10; /M: SY='P'; M= -9,-24,-30,-18,-10,-15,-24,-21, -2,-17, -2, -5,-24, 39,-16,-20,-16, -9, -7,-27,-19,-16; /M: SY='Y'; M=-13,-26,-24,-26,-20, 19,-29,-11, 8,-21, 14, 5,-24,-13,-20,-17,-20, -9, 3, -5, 20,-22; /M: SY='I'; M= -7,-28,-20,-33,-26, 3,-31,-22, 31,-24, 26, 24,-26,-26,-20,-21,-20, -7, 26,-23, -3,-24; /M: SY='P'; M= -7,-17,-36, -9, 0,-29,-17,-19,-20,-10,-30,-20,-16, 76, -9,-19, -3, -6,-27,-31,-29, -9; /M: SY='I'; M= -8,-23,-21,-23,-13, 3,-30,-16, 17,-18, 17, 8,-23,-25,-16,-17,-17, -7, 16,-17, 6,-16; /M: SY='L'; M= -9,-24,-20,-26,-16, 0,-27,-14, 16,-20, 31, 22,-24,-26, -7,-14,-22, -9, 9,-21, -3,-11; /M: SY='P'; M= -7,-13,-27,-10, -4,-10,-16, -2,-18,-13,-23,-15, -8, 31, -9,-15, 3, -3,-20,-27,-13, -9; /M: SY='E'; M= -3, -1,-25, 1, 2,-12, -4,-14,-22,-10,-18,-16, -4, 2,-10,-14, 0, -2,-18,-23,-15, -4; /M: SY='H'; M=-12, 1, -5, 4, 4,-20,-18, 6,-23, -7,-12,-11, -1,-18, -2, -2, -3, -7,-17,-33,-11, 0; /M: SY='M'; M= -8,-16,-23,-19,-13,-11,-10, 4, 1,-13, 5, 19,-13,-21, 0,-10,-13,-11, -1,-23, -5, -7; /M: SY='A'; M= 24,-19,-13,-25,-16, -8,-14,-21, 5,-18, 12, 2,-19,-19,-16,-20, -5, -3, 10,-21,-12,-16; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='Q'; M= -4, 4,-27, 7, 16,-25,-17, 4,-20, 3,-17, -9, -2,-11, 24, -2, -2, -8,-22,-17, -1, 19; /M: SY='F'; M=-13,-30,-26,-33,-26, 21,-30,-19, 15,-24, 16, 7,-27,-28,-23,-20,-24,-11, 9, 14, 19,-25; /M: SY='L'; M= -7,-25,-19,-28,-21, 4,-30,-23, 21,-26, 32, 14,-24,-26,-20,-20,-19, 0, 16,-23, -3,-21; /M: SY='D'; M=-13, 11,-29, 18, 10,-27, -5, 11,-26, -6,-15,-12, 3,-15, 6, -7, -6,-13,-25,-29,-11, 8; /M: SY='A'; M= 18,-12,-15,-16, -4, -3,-11,-16, -8,-13, -2, -7,-10,-15,-10,-16, 3, -1, -4,-20,-10, -7; /M: SY='P'; M=-10,-23,-36,-17, -7,-20,-24,-21, -4,-16,-11, -8,-22, 57,-13,-21,-14,-10,-16,-27,-21,-14; /M: SY='T'; M= -5,-12,-20,-16,-14, -4, 0,-17,-11,-14,-10, -6, -8,-19,-10,-13, 1, 6, -4,-20, -9,-11; /M: SY='P'; M= -6,-14,-31, -9, -2,-26,-17,-19,-18,-10,-27,-18,-13, 61, -9,-17, 1, 3,-23,-31,-26, -9; /M: SY='Y'; M=-13,-20,-23,-22,-20, 17,-29, 1, 6,-15, 8, 3,-20,-27,-15,-13,-14, 0, 4, 5, 42,-20; /M: SY='I'; M=-10,-29,-26,-36,-26, 3,-34,-23, 37,-27, 29, 26,-23,-23,-17,-24,-23,-10, 21,-20, 0,-24; /M: SY='M'; M= 2,-20,-20,-25,-16, -7,-23,-18, 13, -7, 8, 14,-18,-20,-12,-11,-13, -6, 14,-22, -7,-15; /M: SY='G'; M= -4,-10,-32, -8,-11,-30, 38,-18,-35, -5,-30,-18, -3, 1,-13,-11, -4,-16,-28,-22,-26,-13; /M: SY='V'; M= 6,-19,-20,-21,-14,-11,-19,-21, 6,-18, 0, -1,-16, 0,-14,-20, -2, -1, 7,-27,-14,-16; /M: SY='P'; M=-14,-16,-29,-15,-10, 4,-24, 7,-13,-13,-13, -8,-12, 16,-12,-14, -9, -3,-17,-12, 11,-14; /M: SY='A'; M= 24, -7,-14,-11, -5,-20, -4,-13,-17, -3,-19,-13, -1,-12, -3, -1, 17, 5, -7,-27,-18, -5; /M: SY='Q'; M= -5, 6,-21, 9, 12,-24,-12, -2,-17, -2,-18, -3, 3,-10, 13, -5, 10, 0,-16,-31,-15, 12; /M: SY='V'; M= -8,-21, -2,-23,-16, -3,-26,-20, -1,-16, -7, -3,-20, -6,-12,-16,-10, -7, 5,-25,-10,-14; /M: SY='Q'; M=-15, -3,-28, -3, 0,-11,-23, -5, -9, -2,-10, -3, -3,-16, 13, 3, -8,-10,-13,-18, -4, 6; /M: SY='T'; M= -4,-10,-17,-14, -7,-10,-21,-13, -3,-13, 6, 1, -9,-17, 0,-10, 2, 15, -3,-26, -8, -3; /M: SY='P'; M= -7,-13,-27,-11, -6,-15, -4, -7,-15,-11,-12, -8, -9, 1, 1,-12, -3, -7,-18,-17, -3, -4; /M: SY='N'; M=-11, 9,-25, 1, 5,-15,-15, 3,-19, 7,-21, -8, 18,-16, 18, 6, -1, -7,-24,-23, -8, 12; /M: SY='L'; M= 2,-20,-17,-24,-19, 4,-23,-14, 9,-18, 15, 5,-20,-24,-17,-17,-11, 2, 10,-14, 8,-19; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='R'; M= -5, 6,-12, 9, 3,-14, -5, -2,-15, 4,-14,-10, 5, -7, 2, 10, 5, 0,-10,-17, -9, 2; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='A'; M= 1, -4,-23, -4, -6,-18,-15,-13, -3,-12,-10, 0, -6, 1, -7,-17, 0, -3, -5,-29,-15, -8; /M: SY='P'; M= -5,-17,-26,-15,-10,-16, -3,-15,-10,-15, -7, 0,-13, 13,-10,-17, -5, -6,-13,-27,-18,-12; /M: SY='D'; M= -7, 7,-29, 14, 3,-21,-16, -4,-23, 4,-22,-16, -2, 4, -3, -6, -6, -9,-20,-19, -1, -2; /M: SY='D'; M= -8, 16,-23, 18, -1,-22, 3, -7,-22,-10,-16,-16, 14,-17, -7,-12, 4, -5,-19,-33,-18, -4; /M: SY='A'; M= 16,-18,-12,-21,-16, -8,-15,-21, 6,-17, 4, 0,-16,-20,-16,-18, 2, 2, 16,-27,-13,-16; /M: SY='L'; M=-10,-21,-23,-23,-18, 0,-25, -2, 1,-20, 10, 3,-19,-25,-15,-15,-16, -3, 1, 2, 5,-16; /M: SY='V'; M= 9,-21,-12,-23,-19, -6,-19,-23, 12,-18, 5, 3,-19,-23,-19,-18, 0, 2, 24,-29,-12,-19; /M: SY='V'; M= -2,-28,-16,-26,-24, -6,-28,-28, 21,-18, 3, 4,-28, -8,-26,-20,-10, -2, 35,-30,-14,-26; /M: SY='D'; M=-18, 25,-32, 39, 9,-25,-15, 0,-29, -4,-24,-23, 6, 4, -4,-12, -5,-10,-26,-25, -3, 1; /M: SY='L'; M=-10,-23,-24,-21,-15, -4,-26, 1, 6,-21, 16, 8,-21, -7,-14,-16,-19,-10, 3,-25, -3,-16; /M: SY='D'; M= -9, 32,-23, 45, 13,-33, -6, -4,-33, -4,-30,-26, 16,-10, 0,-10, 14, 1,-23,-40,-20, 6; /M: SY='Q'; M= -6, -6,-23,-10, -1,-20,-20,-10,-10, 7,-15, -5, -2,-13, 9, 9, 3, 5, -8,-25,-10, 2; /M: SY='N'; M=-10, 9,-24, 0, -7,-16, 3, -3,-18, -4,-13,-11, 22,-22, -5, 5, -3, -7,-21,-29,-16, -7; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
Numerical results
UniProtKB/Swiss-Prot release number: 2013_05, total number of sequence entries in that release: 540052. Total number of hits in UniProtKB/Swiss-Prot: 37 hits in 37 different sequences Number of hits on proteins that are known to belong to the set under consideration: 37 hits in 37 different sequences Number of hits on proteins that could potentially belong to the set under consideration: 0 hits in 0 different sequences Number of false hits (on unrelated proteins): 0 hits in 0 different sequences Number of known missed hits: 0 Number of partial sequences which belong to the set under consideration, but which are not hit by the pattern or profile because they are partial (fragment) sequences: 0 Precision (true hits / (true hits + false positives)): 100.00 % Recall (true hits / (true hits + false negatives)): 100.00 %
Comments
MATRIX_TYPE: protein_domain Scaling database: UniProtKB/Swiss-Prot: reversed Matrix author: CJA_Sigrist Taxonomic range: Eukaryotes Maximum known number of repetitions of the pattern in a single protein: 1 FT_KEY: DOMAIN FT_DESC: DENN VERSION: 1
Cross-references
UniProtKB/Swiss-Prot	True positive hits: DEN1A_HUMAN (Q8TEH3), DEN1A_MOUSE (Q8K382), DEN1A_XENLA (Q68F67), DEN1B_HUMAN (Q6P3S1), DEN1B_MOUSE (Q3U1T9), DEN1C_HUMAN (Q8IV53), DEN1C_MOUSE (Q8CFK6), DEN2A_HUMAN (Q9ULE3), DEN2A_MOUSE (Q8C4S8), DEN2C_HUMAN (Q68D51), DEN2C_MOUSE (Q6P9P8), DEN2D_HUMAN (Q9H6A0), DEN2D_MOUSE (Q91VV4), DEN4B_HUMAN (O75064), DEN4B_MOUSE (Q3U1Y4), DEN4C_HUMAN (Q5VZ89), DEN4C_MOUSE (A6H8H2), DEN5A_HUMAN (Q6IQ26), DEN5A_MOUSE (Q6PAL8), DEN5B_DANRE (Q6NXD8), DEN5B_HUMAN (Q6ZUT9), DEN5B_MOUSE (A2RSQ0), DEND3_HUMAN (A2RUS2), DEND3_MOUSE (A2RT67), DENN_SCHPO (Q9Y7Q7), MADD_CAEEL (O02626), MADD_DROME (Q9VXY2), MADD_HUMAN (Q8WXG6), MADD_MOUSE (Q80U28), MADD_RAT (O08873), MTMR5_HUMAN (O95248), MTMR5_MOUSE (Q6ZPE2), MTMRD_HUMAN (Q86WG5), MTMRD_XENLA (Q6NTN5), MYCPP_HUMAN (Q7Z401), ST5_HUMAN (P78524), ST5_MOUSE (Q924W7) Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
PDB [Detailed view]	3TW8;

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)

If you would like to retrieve all the Swiss-Prot entries referenced in the DR lines of this entry (with the exception of false positive hits) , you can enter a file name. These entries will then be saved to a file under this name. (Please note that this temporary file will only be kept for 1 week.)

SIB Swiss Institute of Bioinformatics | Disclaimer

Back to the Top