Due to maintenance work, this service will be unavailable from
Mon Nov 11 17:30 until
Tue Nov 12 09:00
CET.
Apologies for the inconvenience.
PROSITE entry PS50212
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | RASGEF_NTER |
Accession [info] | PS50212 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-APR-2003 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC00594 |
Associated ProRule [info] | PRU00135 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Ras guanine-nucleotide exchange factors N-terminal domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=117; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=112; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.8479941; R2=0.0229533; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=247; N_SCORE=8.5000; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=160; N_SCORE=6.5000; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-40; I=-40; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='N'; M= -8, 2,-20, 1, -1,-19, -4, -7,-20, -1,-19,-12, 6,-14, -2, -1, 1, -5,-17,-28,-15, -2; /M: SY='D'; M= -7, 0,-24, 1, 0,-19, -6,-10,-17, 0,-16,-11, 1,-14, -4, 0, -2, -6,-12,-26,-14, -3; /M: SY='G'; M= -9, -9,-28, -9, -9,-10, 1, -2,-19, -8,-17,-11, -3, -6, -9, -6, -5,-10,-19,-17, -2,-11; /M: SY='Q'; M= -3, -6,-22, -8, 0,-16,-19,-10, -8, -1,-10, -5, -4,-12, 1, 0, -1, 0, -6,-26,-11, -1; /M: SY='V'; M= -5,-25,-21,-29,-23, -2,-30,-26, 27,-22, 12, 10,-22,-20,-21,-22,-14, -5, 28,-24, -6,-24; /M: SY='K'; M= -9, -6,-26, -8, -1,-20,-18, -7,-15, 20,-14, 0, -3,-16, 4, 17, -9, -8,-10,-22, -9, 0; /I: I=-12; MD=-32; /M: SY='G'; M= 15, -7,-17,-10,-10,-18, 16,-14,-20,-11,-19,-14, -1,-14,-10,-14, 11, -1,-12,-22,-16,-10; D=-12; /I: I=-12; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='G'; M= 13,-11,-14,-14,-16,-24, 32,-20,-24,-17,-19,-13, -6,-18,-17,-20, 1,-12,-15,-23,-24,-17; /M: SY='T'; M= 0, -2,-15, -6, -6,-14,-14,-14,-14, -8,-17,-12, 1, -5, -6, -9, 19, 28, -7,-30,-11, -6; /M: SY='L'; M= -8,-21,-23,-22,-12, 1,-24,-18, 6,-15, 17, 7,-20,-15,-13,-12,-17, -7, 2,-21, -5,-13; /M: SY='D'; M= -8, 21,-26, 25, 22,-29,-13, 0,-26, 2,-23,-19, 14, -5, 6, -5, 1, -7,-24,-33,-19, 14; /M: SY='K'; M= 2, -2,-24, -4, 6,-22,-15, -8,-21, 17,-19, -9, -3,-12, 7, 12, -2, -6,-15,-21,-11, 6; /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-30,-21, 7,-30,-19, 22,-28, 42, 22,-26,-28,-18,-20,-27,-10, 12,-21, -1,-20; /M: SY='I'; M= -7,-29,-21,-33,-27, 2,-34,-27, 34,-26, 23, 16,-25,-25,-23,-24,-18, -5, 30,-23, -3,-27; /M: SY='E'; M= -8, 3,-23, 6, 18,-23,-17, -2,-18, 0,-14,-10, 0,-10, 6, -2, -2, -7,-16,-30,-15, 11; /M: SY='H'; M=-13, -8,-24,-10, -5,-11,-19, 28,-17, -1,-10, 0, -3,-20, 1, 4,-11,-10,-17,-15, 11, -5; /M: SY='L'; M= -5,-26, -8,-29,-21, 5,-27,-20, 14,-27, 33, 14,-25,-28,-20,-21,-23, -9, 9,-23, -4,-20; /M: SY='T'; M= -3,-15,-12,-20,-17, -3,-25,-19, 8,-19, 7, 2,-13,-20,-16,-17, -2, 13, 11,-26, -6,-18; /M: SY='E'; M= -7, 3,-24, 4, 10,-23,-12, 6,-23, -2,-22,-14, 5, 0, 6, -3, 2, -5,-23,-28,-11, 6; /M: SY='T'; M= -2, 3,-21, 0, 0,-20,-12, -3,-16, -4,-17,-11, 4, -6, -3, -7, 7, 8,-13,-30,-13, -2; /I: I=-7; MD=-17; /M: M=-11, -3,-23, -4, -2, -3,-19, -6,-12, -4, -8, -6, -2,-15, -6, -1, -6, -5,-10,-18, -4, -4; D=-7; /I: I=-7; MD=-17; /M: SY='D'; M= -9, 2,-22, 3, 0,-17,-12, -3,-15, -2,-13, -8, 1,-16, -1, -3, -3, -6,-12,-25, -8, -1; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: M= -6, -5,-25, -3, -3,-16,-15, -3,-13, -6, -9, -6, -6, -5, -4, -6, -5, -5,-11,-25, -9, -5; /M: SY='D'; M=-13, 28,-25, 38, 13,-29,-11, -2,-27, -3,-22,-20, 13,-12, 0, -9, 3, -3,-21,-36,-17, 7; /M: SY='D'; M= -8, 1,-25, 4, 3,-18,-16, -6,-16, -5,-16,-13, 1, 4, -4, -7, 0, -2,-16,-29,-13, -2; /M: SY='N'; M= -5, 1,-21, -2, -1, -9,-14, -6,-14, -6,-13,-10, 3,-14, -3, -6, 3, 3,-12,-24, -7, -3; /M: SY='F'; M=-16,-24,-19,-30,-23, 48,-28,-10, 1,-24, 11, 3,-19,-28,-27,-17,-19,-10, -1, 4, 29,-23; /M: SY='I'; M= -6,-15,-14,-20,-17, -4,-24,-18, 10,-16, 6, 6,-11,-20,-14,-14, -8, 0, 10,-26, -8,-17; /M: SY='N'; M= -6, 6,-23, 4, 7,-14,-12, -5,-20, 2,-20,-14, 8,-12, 0, 0, 3, -2,-17,-26,-10, 3; /M: SY='T'; M= 3, -3,-18, -6,-11,-14,-18,-17, 2,-13, -6, -3, -4,-15,-11,-16, 4, 9, 6,-29,-12,-12; /M: SY='F'; M=-18,-29,-17,-38,-29, 66,-30,-20, 3,-29, 12, 4,-21,-30,-36,-20,-20, -9, 4, 3, 23,-29; /M: SY='L'; M=-12,-30,-21,-33,-23, 20,-31,-21, 21,-30, 40, 17,-27,-29,-23,-21,-27,-10, 11,-15, 5,-23; /M: SY='L'; M= -3,-17,-16,-21,-16, -2,-20,-13, 7,-20, 18, 10,-15,-23,-13,-17,-12, -1, 4,-23, -4,-15; /M: SY='T'; M= -1, -3,-12,-12,-11, -9,-18,-16, -4,-11, -7, -1, -1,-13, -8,-11, 14, 33, 2,-30,-10,-10; /M: SY='Y'; M=-17,-16,-25,-19,-17, 23,-26, 28, -7,-14, -4, -1,-12,-27,-11,-10,-15,-11,-12, 7, 49,-17; /M: SY='R'; M=-14, -7,-25, -6, 0,-21,-19, -3,-25, 18,-19, -9, -1,-14, 8, 40, -5, -7,-18,-24,-12, 1; /M: SY='T'; M= 3, -7,-17, -9, -9,-11,-12,-15, -9,-11,-12,-10, -4,-16, -9,-11, 11, 12, -3,-18, -8, -9; /M: SY='F'; M=-19,-29,-22,-37,-29, 64,-30,-16, 4,-27, 9, 3,-21,-29,-34,-19,-20,-10, 2, 11, 31,-28; /M: SY='I'; M= 0,-16,-10,-24,-19, -4,-24,-20, 11,-18, 7, 9,-14,-18,-14,-18, -3, 11, 10,-25, -7,-17; /M: SY='T'; M= -1, -1,-17, -3, -1,-19,-13,-12,-17, -7,-21,-15, 2, 4, -3, -7, 19, 23,-11,-33,-16, -3; /M: SY='P'; M= -2, -7,-24, -5, -3,-22,-13,-16,-16,-10,-23,-16, -5, 28, -8,-15, 9, 9,-15,-33,-21, -7; /M: M= -4, -5,-19, -6, -1,-18,-15, -6,-14, -5,-13, -9, -4,-10, -1, -5, -2, -2,-12,-21,-10, -2; /M: SY='E'; M= -6, 6,-26, 9, 24,-26,-18, -4,-19, 5,-15,-10, 1, -8, 13, 0, -1, -5,-19,-27,-15, 18; /M: SY='L'; M= -8,-29,-19,-30,-22, 10,-30,-22, 22,-27, 36, 16,-28,-29,-22,-20,-24, -8, 19,-21, -1,-22; /M: SY='L'; M= -6,-26, -8,-31,-23, 11,-27,-18, 14,-25, 24, 14,-24,-27,-21,-20,-20, -9, 10,-20, -1,-22; /M: SY='D'; M= -2, 11,-24, 12, 11,-27, -3, -5,-25, 1,-24,-16, 9, -9, 5, -5, 6, -3,-22,-29,-17, 8; /M: SY='K'; M= -6,-11,-22,-12, -2,-12,-22, -9,-11, 10, -4, -1, -9,-18, -2, 6,-13, -9, -9,-20, -5, -3; /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-21, 9,-30,-20, 21,-27, 43, 20,-28,-29,-19,-19,-28,-10, 12,-20, 0,-20; /M: SY='I'; M= -4,-22,-16,-27,-20, 0,-26,-21, 17,-20, 14, 11,-19,-23,-16,-19,-13, -3, 15,-23, -5,-19; /M: SY='Q'; M= -7, -1,-20, 0, 8,-21,-17, 8,-19, 1,-16, -8, 0,-13, 10, 2, -1, -6,-18,-25, -5, 8; /M: SY='R'; M=-15,-11,-26,-12, -4,-10,-21, 5,-18, 9,-11, -5, -4,-18, 3, 30, -7, -5,-14,-18, 1, -4; /M: SY='Y'; M=-18,-23,-19,-26,-23, 34,-29, 2, -2,-17, 2, -1,-21,-28,-19,-15,-19,-10, -7, 20, 52,-22; /M: SY='H'; M=-10, -1,-25, -3, 4,-13,-18, 5,-15, -2,-14, -7, 2, -9, 5, 0, -4, -5,-16,-24, -6, 3; /M: M= -5, -7,-18,-11, -6, -9,-15,-10, -8, -7, -9, -6, -4,-17, -8, -6, -5, -3, -6,-19, -6, -8; /M: SY='P'; M= -3,-10,-23,-10, -5,-11,-17,-12,-11,-10,-10, -7,-10, 8, -6,-13, -6, -5,-13,-23,-11, -7; /M: SY='E'; M= -9, -3,-22, -2, 6,-22,-19, -6,-19, 2,-19,-12, -3, 6, 3, 0, -3, -4,-19,-27,-14, 3; /M: SY='N'; M= -7, -1,-21, 0, 1,-22, -9, 1,-23, -4,-22,-14, 2, 1, 0, -5, 1, -5,-22,-25,-12, -1; /I: I=-5; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='E'; M= -7, 0,-21, -1, 3,-14,-14, -5, -9, 0,-11, -7, 2,-13, 2, -3, -1, -3,-10,-19, -3, 2; D=-5; /I: I=-5; DM=-13; /M: M= -4, -6,-16, -7, -2,-13,-14, -6, -9, -1,-10, -4, -4,-12, 0, 0, -1, -3, -5,-22, -9, -2; D=-5; /I: I=-5; DM=-13; /M: SY='E'; M= -5, -4,-19, -5, 1,-14,-14, -6, -9, -2, -7, -4, -2,-10, 0, -2, -4, -5,-10,-22, -9, 0; D=-5; /I: I=-5; DM=-13; /M: SY='R'; M= -6, -6,-20, -7, -1,-17,-16, -8,-11, 0,-13, -7, -2, -4, -1, 3, -3, -2,-10,-25,-13, -2; D=-5; /I: I=-5; DM=-13; /M: SY='V'; M= -5,-18,-17,-23,-18, -1,-26,-19, 13,-15, 4, 5,-13,-21,-16,-13, -8, -1, 14,-23, -5,-18; D=-5; /I: I=-5; DM=-13; /M: SY='R'; M= -7, -4,-22, -7, 2,-22,-17, -3,-19, 12,-17, -6, 0,-16, 13, 16, -3, -5,-16,-23,-10, 6; /M: SY='M'; M= -6,-10,-19,-11, -3,-16,-20, -9, -6, -3, -1, 1, -9,-17, 1, 0,-10, -8, -6,-24,-10, -2; /M: SY='R'; M= -8, -4,-25, -6, 0,-22,-12, 1,-24, 16,-20, -9, 2,-16, 6, 24, -3, -6,-17,-24,-10, 1; /M: SY='V'; M= -2,-26,-14,-30,-26, 0,-30,-28, 27,-22, 12, 9,-23,-24,-24,-22,-10, 2, 32,-26, -7,-26; /M: SY='V'; M= -4,-24, 2,-29,-22, 1,-28,-24, 11,-23, 10, 4,-20,-23,-21,-20,-13, -5, 12,-25, -8,-22; /M: SY='N'; M= -8, 4,-19, 1, 3,-20,-14, 3,-18, 1,-20,-11, 10,-16, 7, 6, 5, 0,-15,-29, -9, 4; /M: SY='I'; M= -7,-29,-18,-33,-26, 20,-31,-25, 22,-26, 21, 11,-25,-27,-27,-22,-18, -6, 22,-16, 3,-26; /M: SY='L'; M= -7,-28,-16,-32,-24, 9,-29,-21, 23,-25, 26, 19,-25,-27,-21,-20,-20, -7, 20,-21, -1,-23; /M: SY='R'; M= -6, -8,-23,-10, -2,-16,-16, -4,-16, 9,-13, -4, -3,-17, 4, 16, -2, -2,-11,-22, -7, -1; /M: SY='Y'; M= -9,-10,-18,-12, -4, -7,-20, -3, -9, -4, -6, -4, -8,-18, -2, -4, -6, -1, -8,-18, 3, -4; /M: SY='W'; M=-18,-37,-44,-38,-28, 12,-21,-28,-13,-21,-10,-14,-37,-29,-20,-20,-36,-26,-23,118, 25,-20; /M: SY='I'; M= -4,-27,-15,-32,-25, 5,-30,-25, 25,-24, 18, 14,-24,-25,-22,-21,-15, -3, 25,-23, -4,-25; /M: SY='E'; M= -4, 8,-24, 11, 19,-24,-14, -6,-21, 3,-16,-11, 2, -9, 5, -3, 2, -2,-17,-29,-16, 12; /M: SY='N'; M= -7, 2,-20, -1, 1,-18,-15, -3,-15, 2,-13, -7, 4,-16, 3, 1, -1, -2,-14,-27,-11, 2; /M: SY='Y'; M=-16,-13,-19,-17,-15, 13,-26, 23, -6,-15, -3, 0, -8,-26, -9,-10,-14,-10, -9, -6, 31,-15; /M: SY='P'; M=-12,-21,-32,-20,-13, 2,-19,-12,-14,-13,-15,-11,-18, 14,-14,-13,-14,-10,-18, 8, 5,-15; /M: SY='E'; M= -7, -2,-24, -2, 5,-13,-16, -1,-15, -3,-16,-10, -2,-12, 4, -4, 1, -2,-14,-18, 0, 3; /I: I=-10; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='D'; M=-12, 28,-27, 39, 13,-30,-11, -2,-28, -2,-22,-19, 11,-12, -2,-10, -1, -9,-20,-32,-17, 5; /M: SY='F'; M=-15,-26,-15,-33,-24, 53,-26,-17, -1,-26, 8, 0,-19,-28,-31,-19,-18, -9, -2, 4, 23,-25; /M: SY='D'; M=-12, 6,-22, 7, 6,-16,-15, 3,-22, 2,-17,-12, 5,-14, 2, 4, -3, -7,-20,-24, -5, 3; /M: SY='E'; M= -7, 8,-25, 12, 14,-26, -8, -5,-23, -1,-16,-13, 2, -9, 6, -4, 0, -3,-20,-28,-16, 9; /M: SY='D'; M=-11, 18,-28, 24, 19,-29,-12, -4,-27, 2,-24,-20, 10, 1, 5, -5, 2, -5,-25,-33,-19, 11; /I: I=-10; MD=-27; /M: SY='P'; M= -4, -7,-19, -5, -2,-11,-11, -8, -8, -7, -5, -6, -8, 11, -6, -8, -5, -4, -9,-17, -9, -5; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='L'; M= -5,-13,-20,-15,-11, -4,-18,-14, 3,-18, 12, 6,-13,-19,-11,-15, -9, -2, 1,-24, -7,-11; /M: SY='M'; M= -5,-11,-18,-17,-10, -7,-20,-10, 0,-10, 0, 3, -7,-18, -7, -6, -5, 1, -1,-24, -6, -9; /M: SY='R'; M= -4, -4,-23, -3, 2,-18,-14, -6,-18, 2,-14, -9, -3,-10, 2, 4, 0, -2,-14,-22,-10, 1; /M: SY='F'; M=-11,-17,-21,-21,-15, 11,-24,-13, 1,-13, 5, 4,-12,-20,-14, -7,-13, -6, -1,-14, 1,-14; /M: SY='L'; M= -9,-27,-20,-30,-22, 7,-30,-20, 22,-25, 32, 17,-25,-26,-19,-19,-21, -5, 15,-20, 0,-21; /M: SY='E'; M= -7, -1,-24, -2, 5,-16,-15, -5,-16, 4,-13, -9, 0,-15, 2, 4, -3, -5,-13,-23, -8, 3; /I: I=-10; MD=-25; /M: SY='E'; M=-10, 7,-25, 8, 13,-16,-15, -2,-21, 4,-19,-13, 7,-13, 4, 3, 0, -4,-19,-25, -9, 8; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='F'; M=-14,-27,-22,-34,-25, 41,-30,-17, 10,-25, 18, 8,-21,-27,-27,-18,-21, -9, 5, -4, 17,-24; /M: SY='I'; M= -1,-16,-15,-20,-12, -6,-22,-15, 3,-13, 3, 0,-13,-21,-10,-10, -7, -4, 2,-18, -4,-12; /M: SY='D'; M= -6, 11,-22, 13, 10,-25,-13, 3,-23, 3,-20,-14, 8,-12, 4, -1, 0, -5,-19,-30,-14, 6; /M: M=-10, -9,-20,-11, -9, -3,-20, -7, -7, -8, -3, -3, -7,-19, -7, -5, -7, -3, -5,-19, -1, -9; /M: SY='V'; M= -2,-22,-12,-25,-20, -3,-22,-19, 12,-19, 10, 8,-19,-22,-18,-18,-10, -1, 16,-25, -7,-19; /M: SY='E'; M= -2, 2,-24, 4, 5,-23,-11, -9,-17, -1,-16,-11, 0, -5, -1, -6, 1, -2,-13,-28,-16, 1; /M: SY='Q'; M= -7, -1,-24, -2, 0,-19,-14, -3,-14, 1,-14, -6, 0,-14, 6, 4, -2, -5,-13,-24, -8, 2; /M: SY='E'; M= -7, 3,-24, 5, 8,-13,-13, -1,-19, -2,-16,-12, 2,-12, -1, -4, 1, -4,-16,-24, -6, 3; /I: I=-10; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: M= -2, -5,-21, -5, 0,-15,-13, -9, -9, -2,-10, -7, -4, -7, -2, -4, -2, -4, -7,-21, -8, -2; D=-10; /I: I=-10; DM=-25; /M: SY='Y'; M= -5,-13,-24,-15, -9, -6, -6, -3, -9,-11, -5, -1, -9,-18, -7,-10, -7, -9,-10,-16, 1, -9; /M: SY='Q'; M= -4, -3,-23, -5, 0,-18,-15, -8,-14, 0,-16, -9, 2, -2, 3, -1, 3, 0,-14,-27,-13, 0; /M: SY='E'; M= -5, 0,-26, 1, 12,-23, -9, -5,-21, 4,-18,-12, -1, -8, 5, 2, -1, -6,-19,-25,-14, 8; /M: M= -4,-15,-20,-16,-12, -8,-16,-14, -2,-11, -1, -2,-12,-18,-10,-10, -8, -6, 0,-18, -7,-12; /M: M= -4,-11,-22,-13, -6, -7,-14, 0, -9, -9, -6, -3, -7,-14, -6, -8, -5, -5, -8,-21, -3, -7; /M: SY='S'; M= -5, -2,-19, -5, -2,-18,-11, -9,-16, -1,-15,-10, 2,-13, -1, 2, 3, 3,-11,-28,-13, -2; /M: M= -8, -6,-24, -6, 0,-12,-18, -8,-10, -4, -7, -6, -4,-13, -3, 0, -3, -4, -9,-25, -9, -3; /M: SY='L'; M= -3,-24,-17,-27,-18, 2,-27,-20, 17,-23, 22, 11,-21,-24,-15,-19,-15, -6, 12,-22, -4,-17; /M: SY='Q'; M= -6,-11,-25,-12, 0,-15,-19, -9, -7, -2, -4, -2, -9,-15, 2, 1, -7, -6, -8,-20, -8, 0; /M: SY='D'; M= -9, 10,-26, 12, 11,-27,-10, -4,-24, 6,-23,-16, 10, -5, 7, 3, 2, -3,-23,-30,-17, 8; /M: SY='L'; M= -8,-21,-19,-25,-17, 3,-28,-19, 16,-21, 21, 11,-18,-24,-15,-15,-16, -5, 10,-22, -3,-17; /M: SY='L'; M= -6,-17,-22,-21,-14, -2,-23,-14, 9,-13, 10, 6,-12,-22,-11,-12,-13, -6, 5,-20, -2,-14; /M: SY='K'; M= -7, -1,-22, -1, 7,-23,-12, -6,-21, 9,-18,-10, 1,-13, 6, 7, -1, -4,-17,-26,-13, 6; /M: SY='K'; M= -6, -2,-23, -4, 4,-23,-16, -7,-17, 11,-19, -7, 2,-10, 8, 9, -1, -4,-14,-26,-14, 5; /M: SY='L'; M= -4,-13,-21,-16,-11, -7,-15,-15, -2,-11, 5, 1,-10,-16,-11,-10,-10, -6, -4,-19, -7,-12; /M: SY='R'; M= -5,-10,-24,-12, -6,-12,-13,-11,-13, 0,-14, -8, -6,-14, -3, 2, -1, -1,-10,-14, -6, -5; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 115 in 115 different sequences |
Number of true positive hits | 115 in 115 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 2 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 98.29 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | N_Hulo |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | N-terminal Ras-GEF |
Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
115 sequences
BUD5_YEAST (P25300), C3G_DROME (O77086), CDC25_CANAL (P43069), CDC25_LACKL (Q02342), CDC25_YEAST (P04821), EFC25_SCHPO (Q9USU1), GBPC_DICDI (Q8MVR1), GBPD_DICDI (Q54S40), GEFA_DICDI (Q54PQ4), GEFB_DICDI (Q8IS21), GEFC_DICDI (Q8IS20), GEFD_DICDI (Q8IS19), GEFE_DICDI (Q8IS18), GEFF_DICDI (Q54C94), GEFG_DICDI (Q8ST25), GEFH_DICDI (Q8IS16), GEFI_DICDI (Q8IS15), GEFJ_DICDI (Q8IS14), GEFK_DICDI (Q54FF3), GEFL_DICDI (B0M0P8), GEFM_DICDI (Q8SSQ3), GEFN_DICDI (Q8IS12), GEFO_DICDI (Q8IS11), GEFP_DICDI (Q54TK8), GEFQ_DICDI (Q86G47), GEFR_DICDI (Q8SSQ0), GEFS_DICDI (Q8SSW7), GEFV_DICDI (Q55FD8), GEFW_DICDI (Q55GH9), GEFX_DICDI (Q55EC7), GEFY_DICDI (Q552M5), GFLB_DICDI (Q54L90), GNDS_HUMAN (Q12967), GNDS_MOUSE (Q03385), GNDS_RAT(Q03386), GRP1_HUMAN (O95267), GRP1_MOUSE (Q9Z1S3), GRP1_RAT(Q9R1K8), GRP1_XENLA (Q6NTL4), GRP1_XENTR (A4IJ06), GRP2A_XENLA (Q32N25), GRP2B_XENLA (Q6DCK3), GRP2_BOVIN (A6N9I4), GRP2_HUMAN (Q7LDG7), GRP2_MOUSE (Q9QUG9), GRP2_RAT(P0C643), GRP3_HUMAN (Q8IV61), GRP4_BOVIN (Q1LZ97), GRP4_HUMAN (Q8TDF6), GRP4_MOUSE (Q8BTM9), GRP4_RAT(Q8R5I4), KNDC1_HUMAN (Q76NI1), KNDC1_MOUSE (Q0KK55), LTE1_CANGA (Q6FT12), LTE1_EREGS (Q75BH9), LTE1_KLULA (Q6CY10), LTE1_YEAST (P07866), RG1BA_DANRE (Q6DHR3), RG1BB_DANRE (Q6DBW1), RGF1A_HUMAN (Q8N9B8), RGF1A_XENTR (A0JM95), RGF1B_BOVIN (A4IFE4), RGF1B_HUMAN (Q0VAM2), RGF1B_MOUSE (Q8JZL7), RGF1B_PONAB (Q5RC04), RGF1B_XENTR (Q28EC1), RGF1C_HUMAN (Q8N431), RGF1C_MACFA (Q95KH6), RGF1C_MOUSE (Q9D300), RGL1_DANRE (Q6P112), RGL1_HUMAN (Q9NZL6), RGL1_MOUSE (Q60695), RGL2_CANLF (Q5TJE5), RGL2_HUMAN (O15211), RGL2_MOUSE (Q61193), RGL3_HUMAN (Q3MIN7), RGL3_MOUSE (Q3UYI5), RGRF1_HUMAN (Q13972), RGRF1_MOUSE (P27671), RGRF1_RAT (P28818), RGRF2_DANRE (A2CEA7), RGRF2_HUMAN (O14827), RGRF2_MOUSE (P70392), RGRF2_RAT (Q99JE4), RPGF1_CAEEL (P34578), RPGF1_HUMAN (Q13905), RPGF2_BOVIN (F1MSG6), RPGF2_CANLF (F1PBJ0), RPGF2_HUMAN (Q9Y4G8), RPGF2_MOUSE (Q8CHG7), RPGF2_RAT (F1M386), RPGF3_HUMAN (O95398), RPGF3_MOUSE (Q8VCC8), RPGF3_RAT (Q9Z1C8), RPGF4_HUMAN (Q8WZA2), RPGF4_MOUSE (Q9EQZ6), RPGF4_RAT (Q9Z1C7), RPGF5_HUMAN (Q92565), RPGF5_MOUSE (Q8C0Q9), RPGF5_RAT (P83900), RPGF6_HUMAN (Q8TEU7), RPGF_CAEEL (G5EDB9), SDC25_YEAS1 (B3LTF3), SDC25_YEAS6 (B5VMS9), SDC25_YEAS7 (A7A0P0), SDC25_YEAS8 (C8ZCV7), SDC25_YEASX (P0CF32), SOS1_HUMAN (Q07889), SOS1_MOUSE (Q62245), SOS2_HUMAN (Q07890), SOS2_MOUSE (Q02384), SOS_CAEEL (Q9N5D3), SOS_DROME (P26675), STE6_SCHPO (P26674), YL016_YEAST (P0CF34)» more
|
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
2 sequences
PIAA_DICDI (O77203), TSC11_YEAST (P40061) |
PDB [Detailed view] |
104 PDB
1BKD; 1NVU; 1NVV; 1NVW; 1NVX; 1XD2; 1XD4; 1XDV; 2BYV; 2II0; 3CF6; 3KSY; 4F7Z; 4JGW; 4L9M; 4MGI; 4MGK; 4MGY; 4MGZ; 4MH0; 4NYI; 4NYJ; 4NYM; 4URU; 4URV; 4URW; 4URX; 4URY; 4URZ; 4US0; 4US1; 4US2; 5CM8; 5CM9; 5OVD; 5OVE; 5OVF; 5OVG; 5OVH; 5OVI; 5WFO; 5WFP; 5WFQ; 5WFR; 6AXF; 6AXG; 6BVI; 6BVJ; 6BVK; 6BVL; 6BVM; 6CUO; 6CUP; 6CUR; 6D55; 6D56; 6D59; 6D5E; 6D5G; 6D5H; 6D5J; 6D5L; 6D5M; 6D5V; 6D5W; 6EIE; 6EPL; 6EPM; 6EPN; 6EPO; 6EPP; 6SCM; 6SFR; 6V94; 6V9F; 6V9J; 6V9L; 6V9M; 6V9N; 6V9O; 7AVI; 7AVL; 7AVS; 7AVT; 7AVU; 7AVV; 7KFZ; 7NZZ; 7UKR; 7UKS; 8BE2; 8BE4; 8BE5; 8BE6; 8BE7; 8BE8; 8BE9; 8BEA; 8T5G; 8T5M; 8T5R; 8UC9; 8UF2; 8UH0 » more |