PROSITE entry PS50212

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	RASGEF_NTER
Accession [info]	PS50212
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-APR-2003 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00594
Associated ProRule [info]	PRU00135

Name and characterization of the entry

Description [info]

Ras guanine-nucleotide exchange factors N-terminal domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=117;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=112;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.8479941; R2=0.0229533; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=247; N_SCORE=8.5000; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=160; N_SCORE=6.5000; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-40; I=-40; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='N';  M= -8,  2,-20,  1, -1,-19, -4, -7,-20, -1,-19,-12,  6,-14, -2, -1,  1, -5,-17,-28,-15, -2;
/M: SY='D';  M= -7,  0,-24,  1,  0,-19, -6,-10,-17,  0,-16,-11,  1,-14, -4,  0, -2, -6,-12,-26,-14, -3;
/M: SY='G';  M= -9, -9,-28, -9, -9,-10,  1, -2,-19, -8,-17,-11, -3, -6, -9, -6, -5,-10,-19,-17, -2,-11;
/M: SY='Q';  M= -3, -6,-22, -8,  0,-16,-19,-10, -8, -1,-10, -5, -4,-12,  1,  0, -1,  0, -6,-26,-11, -1;
/M: SY='V';  M= -5,-25,-21,-29,-23, -2,-30,-26, 27,-22, 12, 10,-22,-20,-21,-22,-14, -5, 28,-24, -6,-24;
/M: SY='K';  M= -9, -6,-26, -8, -1,-20,-18, -7,-15, 20,-14,  0, -3,-16,  4, 17, -9, -8,-10,-22, -9,  0;
/I:         I=-12; MD=-32;
/M: SY='G';  M= 15, -7,-17,-10,-10,-18, 16,-14,-20,-11,-19,-14, -1,-14,-10,-14, 11, -1,-12,-22,-16,-10; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='G';  M= 13,-11,-14,-14,-16,-24, 32,-20,-24,-17,-19,-13, -6,-18,-17,-20,  1,-12,-15,-23,-24,-17;
/M: SY='T';  M=  0, -2,-15, -6, -6,-14,-14,-14,-14, -8,-17,-12,  1, -5, -6, -9, 19, 28, -7,-30,-11, -6;
/M: SY='L';  M= -8,-21,-23,-22,-12,  1,-24,-18,  6,-15, 17,  7,-20,-15,-13,-12,-17, -7,  2,-21, -5,-13;
/M: SY='D';  M= -8, 21,-26, 25, 22,-29,-13,  0,-26,  2,-23,-19, 14, -5,  6, -5,  1, -7,-24,-33,-19, 14;
/M: SY='K';  M=  2, -2,-24, -4,  6,-22,-15, -8,-21, 17,-19, -9, -3,-12,  7, 12, -2, -6,-15,-21,-11,  6;
/M: SY='L';  M=-10,-28,-21,-30,-21,  7,-30,-19, 22,-28, 42, 22,-26,-28,-18,-20,-27,-10, 12,-21, -1,-20;
/M: SY='I';  M= -7,-29,-21,-33,-27,  2,-34,-27, 34,-26, 23, 16,-25,-25,-23,-24,-18, -5, 30,-23, -3,-27;
/M: SY='E';  M= -8,  3,-23,  6, 18,-23,-17, -2,-18,  0,-14,-10,  0,-10,  6, -2, -2, -7,-16,-30,-15, 11;
/M: SY='H';  M=-13, -8,-24,-10, -5,-11,-19, 28,-17, -1,-10,  0, -3,-20,  1,  4,-11,-10,-17,-15, 11, -5;
/M: SY='L';  M= -5,-26, -8,-29,-21,  5,-27,-20, 14,-27, 33, 14,-25,-28,-20,-21,-23, -9,  9,-23, -4,-20;
/M: SY='T';  M= -3,-15,-12,-20,-17, -3,-25,-19,  8,-19,  7,  2,-13,-20,-16,-17, -2, 13, 11,-26, -6,-18;
/M: SY='E';  M= -7,  3,-24,  4, 10,-23,-12,  6,-23, -2,-22,-14,  5,  0,  6, -3,  2, -5,-23,-28,-11,  6;
/M: SY='T';  M= -2,  3,-21,  0,  0,-20,-12, -3,-16, -4,-17,-11,  4, -6, -3, -7,  7,  8,-13,-30,-13, -2;
/I:         I=-7; MD=-17;
/M:         M=-11, -3,-23, -4, -2, -3,-19, -6,-12, -4, -8, -6, -2,-15, -6, -1, -6, -5,-10,-18, -4, -4; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-17;
/M: SY='D';  M= -9,  2,-22,  3,  0,-17,-12, -3,-15, -2,-13, -8,  1,-16, -1, -3, -3, -6,-12,-25, -8, -1; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M:         M= -6, -5,-25, -3, -3,-16,-15, -3,-13, -6, -9, -6, -6, -5, -4, -6, -5, -5,-11,-25, -9, -5;
/M: SY='D';  M=-13, 28,-25, 38, 13,-29,-11, -2,-27, -3,-22,-20, 13,-12,  0, -9,  3, -3,-21,-36,-17,  7;
/M: SY='D';  M= -8,  1,-25,  4,  3,-18,-16, -6,-16, -5,-16,-13,  1,  4, -4, -7,  0, -2,-16,-29,-13, -2;
/M: SY='N';  M= -5,  1,-21, -2, -1, -9,-14, -6,-14, -6,-13,-10,  3,-14, -3, -6,  3,  3,-12,-24, -7, -3;
/M: SY='F';  M=-16,-24,-19,-30,-23, 48,-28,-10,  1,-24, 11,  3,-19,-28,-27,-17,-19,-10, -1,  4, 29,-23;
/M: SY='I';  M= -6,-15,-14,-20,-17, -4,-24,-18, 10,-16,  6,  6,-11,-20,-14,-14, -8,  0, 10,-26, -8,-17;
/M: SY='N';  M= -6,  6,-23,  4,  7,-14,-12, -5,-20,  2,-20,-14,  8,-12,  0,  0,  3, -2,-17,-26,-10,  3;
/M: SY='T';  M=  3, -3,-18, -6,-11,-14,-18,-17,  2,-13, -6, -3, -4,-15,-11,-16,  4,  9,  6,-29,-12,-12;
/M: SY='F';  M=-18,-29,-17,-38,-29, 66,-30,-20,  3,-29, 12,  4,-21,-30,-36,-20,-20, -9,  4,  3, 23,-29;
/M: SY='L';  M=-12,-30,-21,-33,-23, 20,-31,-21, 21,-30, 40, 17,-27,-29,-23,-21,-27,-10, 11,-15,  5,-23;
/M: SY='L';  M= -3,-17,-16,-21,-16, -2,-20,-13,  7,-20, 18, 10,-15,-23,-13,-17,-12, -1,  4,-23, -4,-15;
/M: SY='T';  M= -1, -3,-12,-12,-11, -9,-18,-16, -4,-11, -7, -1, -1,-13, -8,-11, 14, 33,  2,-30,-10,-10;
/M: SY='Y';  M=-17,-16,-25,-19,-17, 23,-26, 28, -7,-14, -4, -1,-12,-27,-11,-10,-15,-11,-12,  7, 49,-17;
/M: SY='R';  M=-14, -7,-25, -6,  0,-21,-19, -3,-25, 18,-19, -9, -1,-14,  8, 40, -5, -7,-18,-24,-12,  1;
/M: SY='T';  M=  3, -7,-17, -9, -9,-11,-12,-15, -9,-11,-12,-10, -4,-16, -9,-11, 11, 12, -3,-18, -8, -9;
/M: SY='F';  M=-19,-29,-22,-37,-29, 64,-30,-16,  4,-27,  9,  3,-21,-29,-34,-19,-20,-10,  2, 11, 31,-28;
/M: SY='I';  M=  0,-16,-10,-24,-19, -4,-24,-20, 11,-18,  7,  9,-14,-18,-14,-18, -3, 11, 10,-25, -7,-17;
/M: SY='T';  M= -1, -1,-17, -3, -1,-19,-13,-12,-17, -7,-21,-15,  2,  4, -3, -7, 19, 23,-11,-33,-16, -3;
/M: SY='P';  M= -2, -7,-24, -5, -3,-22,-13,-16,-16,-10,-23,-16, -5, 28, -8,-15,  9,  9,-15,-33,-21, -7;
/M:         M= -4, -5,-19, -6, -1,-18,-15, -6,-14, -5,-13, -9, -4,-10, -1, -5, -2, -2,-12,-21,-10, -2;
/M: SY='E';  M= -6,  6,-26,  9, 24,-26,-18, -4,-19,  5,-15,-10,  1, -8, 13,  0, -1, -5,-19,-27,-15, 18;
/M: SY='L';  M= -8,-29,-19,-30,-22, 10,-30,-22, 22,-27, 36, 16,-28,-29,-22,-20,-24, -8, 19,-21, -1,-22;
/M: SY='L';  M= -6,-26, -8,-31,-23, 11,-27,-18, 14,-25, 24, 14,-24,-27,-21,-20,-20, -9, 10,-20, -1,-22;
/M: SY='D';  M= -2, 11,-24, 12, 11,-27, -3, -5,-25,  1,-24,-16,  9, -9,  5, -5,  6, -3,-22,-29,-17,  8;
/M: SY='K';  M= -6,-11,-22,-12, -2,-12,-22, -9,-11, 10, -4, -1, -9,-18, -2,  6,-13, -9, -9,-20, -5, -3;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-20,-30,-21,  9,-30,-20, 21,-27, 43, 20,-28,-29,-19,-19,-28,-10, 12,-20,  0,-20;
/M: SY='I';  M= -4,-22,-16,-27,-20,  0,-26,-21, 17,-20, 14, 11,-19,-23,-16,-19,-13, -3, 15,-23, -5,-19;
/M: SY='Q';  M= -7, -1,-20,  0,  8,-21,-17,  8,-19,  1,-16, -8,  0,-13, 10,  2, -1, -6,-18,-25, -5,  8;
/M: SY='R';  M=-15,-11,-26,-12, -4,-10,-21,  5,-18,  9,-11, -5, -4,-18,  3, 30, -7, -5,-14,-18,  1, -4;
/M: SY='Y';  M=-18,-23,-19,-26,-23, 34,-29,  2, -2,-17,  2, -1,-21,-28,-19,-15,-19,-10, -7, 20, 52,-22;
/M: SY='H';  M=-10, -1,-25, -3,  4,-13,-18,  5,-15, -2,-14, -7,  2, -9,  5,  0, -4, -5,-16,-24, -6,  3;
/M:         M= -5, -7,-18,-11, -6, -9,-15,-10, -8, -7, -9, -6, -4,-17, -8, -6, -5, -3, -6,-19, -6, -8;
/M: SY='P';  M= -3,-10,-23,-10, -5,-11,-17,-12,-11,-10,-10, -7,-10,  8, -6,-13, -6, -5,-13,-23,-11, -7;
/M: SY='E';  M= -9, -3,-22, -2,  6,-22,-19, -6,-19,  2,-19,-12, -3,  6,  3,  0, -3, -4,-19,-27,-14,  3;
/M: SY='N';  M= -7, -1,-21,  0,  1,-22, -9,  1,-23, -4,-22,-14,  2,  1,  0, -5,  1, -5,-22,-25,-12, -1;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='E';  M= -7,  0,-21, -1,  3,-14,-14, -5, -9,  0,-11, -7,  2,-13,  2, -3, -1, -3,-10,-19, -3,  2; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-13;
/M:         M= -4, -6,-16, -7, -2,-13,-14, -6, -9, -1,-10, -4, -4,-12,  0,  0, -1, -3, -5,-22, -9, -2; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-13;
/M: SY='E';  M= -5, -4,-19, -5,  1,-14,-14, -6, -9, -2, -7, -4, -2,-10,  0, -2, -4, -5,-10,-22, -9,  0; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-13;
/M: SY='R';  M= -6, -6,-20, -7, -1,-17,-16, -8,-11,  0,-13, -7, -2, -4, -1,  3, -3, -2,-10,-25,-13, -2; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-13;
/M: SY='V';  M= -5,-18,-17,-23,-18, -1,-26,-19, 13,-15,  4,  5,-13,-21,-16,-13, -8, -1, 14,-23, -5,-18; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-13;
/M: SY='R';  M= -7, -4,-22, -7,  2,-22,-17, -3,-19, 12,-17, -6,  0,-16, 13, 16, -3, -5,-16,-23,-10,  6;
/M: SY='M';  M= -6,-10,-19,-11, -3,-16,-20, -9, -6, -3, -1,  1, -9,-17,  1,  0,-10, -8, -6,-24,-10, -2;
/M: SY='R';  M= -8, -4,-25, -6,  0,-22,-12,  1,-24, 16,-20, -9,  2,-16,  6, 24, -3, -6,-17,-24,-10,  1;
/M: SY='V';  M= -2,-26,-14,-30,-26,  0,-30,-28, 27,-22, 12,  9,-23,-24,-24,-22,-10,  2, 32,-26, -7,-26;
/M: SY='V';  M= -4,-24,  2,-29,-22,  1,-28,-24, 11,-23, 10,  4,-20,-23,-21,-20,-13, -5, 12,-25, -8,-22;
/M: SY='N';  M= -8,  4,-19,  1,  3,-20,-14,  3,-18,  1,-20,-11, 10,-16,  7,  6,  5,  0,-15,-29, -9,  4;
/M: SY='I';  M= -7,-29,-18,-33,-26, 20,-31,-25, 22,-26, 21, 11,-25,-27,-27,-22,-18, -6, 22,-16,  3,-26;
/M: SY='L';  M= -7,-28,-16,-32,-24,  9,-29,-21, 23,-25, 26, 19,-25,-27,-21,-20,-20, -7, 20,-21, -1,-23;
/M: SY='R';  M= -6, -8,-23,-10, -2,-16,-16, -4,-16,  9,-13, -4, -3,-17,  4, 16, -2, -2,-11,-22, -7, -1;
/M: SY='Y';  M= -9,-10,-18,-12, -4, -7,-20, -3, -9, -4, -6, -4, -8,-18, -2, -4, -6, -1, -8,-18,  3, -4;
/M: SY='W';  M=-18,-37,-44,-38,-28, 12,-21,-28,-13,-21,-10,-14,-37,-29,-20,-20,-36,-26,-23,118, 25,-20;
/M: SY='I';  M= -4,-27,-15,-32,-25,  5,-30,-25, 25,-24, 18, 14,-24,-25,-22,-21,-15, -3, 25,-23, -4,-25;
/M: SY='E';  M= -4,  8,-24, 11, 19,-24,-14, -6,-21,  3,-16,-11,  2, -9,  5, -3,  2, -2,-17,-29,-16, 12;
/M: SY='N';  M= -7,  2,-20, -1,  1,-18,-15, -3,-15,  2,-13, -7,  4,-16,  3,  1, -1, -2,-14,-27,-11,  2;
/M: SY='Y';  M=-16,-13,-19,-17,-15, 13,-26, 23, -6,-15, -3,  0, -8,-26, -9,-10,-14,-10, -9, -6, 31,-15;
/M: SY='P';  M=-12,-21,-32,-20,-13,  2,-19,-12,-14,-13,-15,-11,-18, 14,-14,-13,-14,-10,-18,  8,  5,-15;
/M: SY='E';  M= -7, -2,-24, -2,  5,-13,-16, -1,-15, -3,-16,-10, -2,-12,  4, -4,  1, -2,-14,-18,  0,  3;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='D';  M=-12, 28,-27, 39, 13,-30,-11, -2,-28, -2,-22,-19, 11,-12, -2,-10, -1, -9,-20,-32,-17,  5;
/M: SY='F';  M=-15,-26,-15,-33,-24, 53,-26,-17, -1,-26,  8,  0,-19,-28,-31,-19,-18, -9, -2,  4, 23,-25;
/M: SY='D';  M=-12,  6,-22,  7,  6,-16,-15,  3,-22,  2,-17,-12,  5,-14,  2,  4, -3, -7,-20,-24, -5,  3;
/M: SY='E';  M= -7,  8,-25, 12, 14,-26, -8, -5,-23, -1,-16,-13,  2, -9,  6, -4,  0, -3,-20,-28,-16,  9;
/M: SY='D';  M=-11, 18,-28, 24, 19,-29,-12, -4,-27,  2,-24,-20, 10,  1,  5, -5,  2, -5,-25,-33,-19, 11;
/I:         I=-10; MD=-27;
/M: SY='P';  M= -4, -7,-19, -5, -2,-11,-11, -8, -8, -7, -5, -6, -8, 11, -6, -8, -5, -4, -9,-17, -9, -5; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='L';  M= -5,-13,-20,-15,-11, -4,-18,-14,  3,-18, 12,  6,-13,-19,-11,-15, -9, -2,  1,-24, -7,-11;
/M: SY='M';  M= -5,-11,-18,-17,-10, -7,-20,-10,  0,-10,  0,  3, -7,-18, -7, -6, -5,  1, -1,-24, -6, -9;
/M: SY='R';  M= -4, -4,-23, -3,  2,-18,-14, -6,-18,  2,-14, -9, -3,-10,  2,  4,  0, -2,-14,-22,-10,  1;
/M: SY='F';  M=-11,-17,-21,-21,-15, 11,-24,-13,  1,-13,  5,  4,-12,-20,-14, -7,-13, -6, -1,-14,  1,-14;
/M: SY='L';  M= -9,-27,-20,-30,-22,  7,-30,-20, 22,-25, 32, 17,-25,-26,-19,-19,-21, -5, 15,-20,  0,-21;
/M: SY='E';  M= -7, -1,-24, -2,  5,-16,-15, -5,-16,  4,-13, -9,  0,-15,  2,  4, -3, -5,-13,-23, -8,  3;
/I:         I=-10; MD=-25;
/M: SY='E';  M=-10,  7,-25,  8, 13,-16,-15, -2,-21,  4,-19,-13,  7,-13,  4,  3,  0, -4,-19,-25, -9,  8; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='F';  M=-14,-27,-22,-34,-25, 41,-30,-17, 10,-25, 18,  8,-21,-27,-27,-18,-21, -9,  5, -4, 17,-24;
/M: SY='I';  M= -1,-16,-15,-20,-12, -6,-22,-15,  3,-13,  3,  0,-13,-21,-10,-10, -7, -4,  2,-18, -4,-12;
/M: SY='D';  M= -6, 11,-22, 13, 10,-25,-13,  3,-23,  3,-20,-14,  8,-12,  4, -1,  0, -5,-19,-30,-14,  6;
/M:         M=-10, -9,-20,-11, -9, -3,-20, -7, -7, -8, -3, -3, -7,-19, -7, -5, -7, -3, -5,-19, -1, -9;
/M: SY='V';  M= -2,-22,-12,-25,-20, -3,-22,-19, 12,-19, 10,  8,-19,-22,-18,-18,-10, -1, 16,-25, -7,-19;
/M: SY='E';  M= -2,  2,-24,  4,  5,-23,-11, -9,-17, -1,-16,-11,  0, -5, -1, -6,  1, -2,-13,-28,-16,  1;
/M: SY='Q';  M= -7, -1,-24, -2,  0,-19,-14, -3,-14,  1,-14, -6,  0,-14,  6,  4, -2, -5,-13,-24, -8,  2;
/M: SY='E';  M= -7,  3,-24,  5,  8,-13,-13, -1,-19, -2,-16,-12,  2,-12, -1, -4,  1, -4,-16,-24, -6,  3;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M:         M= -2, -5,-21, -5,  0,-15,-13, -9, -9, -2,-10, -7, -4, -7, -2, -4, -2, -4, -7,-21, -8, -2; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-25;
/M: SY='Y';  M= -5,-13,-24,-15, -9, -6, -6, -3, -9,-11, -5, -1, -9,-18, -7,-10, -7, -9,-10,-16,  1, -9;
/M: SY='Q';  M= -4, -3,-23, -5,  0,-18,-15, -8,-14,  0,-16, -9,  2, -2,  3, -1,  3,  0,-14,-27,-13,  0;
/M: SY='E';  M= -5,  0,-26,  1, 12,-23, -9, -5,-21,  4,-18,-12, -1, -8,  5,  2, -1, -6,-19,-25,-14,  8;
/M:         M= -4,-15,-20,-16,-12, -8,-16,-14, -2,-11, -1, -2,-12,-18,-10,-10, -8, -6,  0,-18, -7,-12;
/M:         M= -4,-11,-22,-13, -6, -7,-14,  0, -9, -9, -6, -3, -7,-14, -6, -8, -5, -5, -8,-21, -3, -7;
/M: SY='S';  M= -5, -2,-19, -5, -2,-18,-11, -9,-16, -1,-15,-10,  2,-13, -1,  2,  3,  3,-11,-28,-13, -2;
/M:         M= -8, -6,-24, -6,  0,-12,-18, -8,-10, -4, -7, -6, -4,-13, -3,  0, -3, -4, -9,-25, -9, -3;
/M: SY='L';  M= -3,-24,-17,-27,-18,  2,-27,-20, 17,-23, 22, 11,-21,-24,-15,-19,-15, -6, 12,-22, -4,-17;
/M: SY='Q';  M= -6,-11,-25,-12,  0,-15,-19, -9, -7, -2, -4, -2, -9,-15,  2,  1, -7, -6, -8,-20, -8,  0;
/M: SY='D';  M= -9, 10,-26, 12, 11,-27,-10, -4,-24,  6,-23,-16, 10, -5,  7,  3,  2, -3,-23,-30,-17,  8;
/M: SY='L';  M= -8,-21,-19,-25,-17,  3,-28,-19, 16,-21, 21, 11,-18,-24,-15,-15,-16, -5, 10,-22, -3,-17;
/M: SY='L';  M= -6,-17,-22,-21,-14, -2,-23,-14,  9,-13, 10,  6,-12,-22,-11,-12,-13, -6,  5,-20, -2,-14;
/M: SY='K';  M= -7, -1,-22, -1,  7,-23,-12, -6,-21,  9,-18,-10,  1,-13,  6,  7, -1, -4,-17,-26,-13,  6;
/M: SY='K';  M= -6, -2,-23, -4,  4,-23,-16, -7,-17, 11,-19, -7,  2,-10,  8,  9, -1, -4,-14,-26,-14,  5;
/M: SY='L';  M= -4,-13,-21,-16,-11, -7,-15,-15, -2,-11,  5,  1,-10,-16,-11,-10,-10, -6, -4,-19, -7,-12;
/M: SY='R';  M= -5,-10,-24,-12, -6,-12,-13,-11,-13,  0,-14, -8, -6,-14, -3,  2, -1, -1,-10,-14, -6, -5;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_05 which contains 572'214 sequence entries.

Total number of hits	115 in 115 different sequences
Number of true positive hits	115 in 115 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	2
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	98.29 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	N_Hulo
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	N-terminal Ras-GEF
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

115 sequences

BUD5_YEAST  (P25300), C3G_DROME   (O77086), CDC25_CANAL (P43069),

CDC25_LACKL (Q02342), CDC25_YEAST (P04821), EFC25_SCHPO (Q9USU1), 
GBPC_DICDI  (Q8MVR1), GBPD_DICDI  (Q54S40), GEFA_DICDI  (Q54PQ4), 
GEFB_DICDI  (Q8IS21), GEFC_DICDI  (Q8IS20), GEFD_DICDI  (Q8IS19), 
GEFE_DICDI  (Q8IS18), GEFF_DICDI  (Q54C94), GEFG_DICDI  (Q8ST25), 
GEFH_DICDI  (Q8IS16), GEFI_DICDI  (Q8IS15), GEFJ_DICDI  (Q8IS14), 
GEFK_DICDI  (Q54FF3), GEFL_DICDI  (B0M0P8), GEFM_DICDI  (Q8SSQ3), 
GEFN_DICDI  (Q8IS12), GEFO_DICDI  (Q8IS11), GEFP_DICDI  (Q54TK8), 
GEFQ_DICDI  (Q86G47), GEFR_DICDI  (Q8SSQ0), GEFS_DICDI  (Q8SSW7), 
GEFV_DICDI  (Q55FD8), GEFW_DICDI  (Q55GH9), GEFX_DICDI  (Q55EC7), 
GEFY_DICDI  (Q552M5), GFLB_DICDI  (Q54L90), GNDS_HUMAN  (Q12967), 
GNDS_MOUSE  (Q03385), GNDS_RAT(Q03386), GRP1_HUMAN  (O95267), 
GRP1_MOUSE  (Q9Z1S3), GRP1_RAT(Q9R1K8), GRP1_XENLA  (Q6NTL4), 
GRP1_XENTR  (A4IJ06), GRP2A_XENLA (Q32N25), GRP2B_XENLA (Q6DCK3), 
GRP2_BOVIN  (A6N9I4), GRP2_HUMAN  (Q7LDG7), GRP2_MOUSE  (Q9QUG9), 
GRP2_RAT(P0C643), GRP3_HUMAN  (Q8IV61), GRP4_BOVIN  (Q1LZ97), 
GRP4_HUMAN  (Q8TDF6), GRP4_MOUSE  (Q8BTM9), GRP4_RAT(Q8R5I4), 
KNDC1_HUMAN (Q76NI1), KNDC1_MOUSE (Q0KK55), LTE1_CANGA  (Q6FT12), 
LTE1_EREGS  (Q75BH9), LTE1_KLULA  (Q6CY10), LTE1_YEAST  (P07866), 
RG1BA_DANRE (Q6DHR3), RG1BB_DANRE (Q6DBW1), RGF1A_HUMAN (Q8N9B8), 
RGF1A_XENTR (A0JM95), RGF1B_BOVIN (A4IFE4), RGF1B_HUMAN (Q0VAM2), 
RGF1B_MOUSE (Q8JZL7), RGF1B_PONAB (Q5RC04), RGF1B_XENTR (Q28EC1), 
RGF1C_HUMAN (Q8N431), RGF1C_MACFA (Q95KH6), RGF1C_MOUSE (Q9D300), 
RGL1_DANRE  (Q6P112), RGL1_HUMAN  (Q9NZL6), RGL1_MOUSE  (Q60695), 
RGL2_CANLF  (Q5TJE5), RGL2_HUMAN  (O15211), RGL2_MOUSE  (Q61193), 
RGL3_HUMAN  (Q3MIN7), RGL3_MOUSE  (Q3UYI5), RGRF1_HUMAN (Q13972), 
RGRF1_MOUSE (P27671), RGRF1_RAT   (P28818), RGRF2_DANRE (A2CEA7), 
RGRF2_HUMAN (O14827), RGRF2_MOUSE (P70392), RGRF2_RAT   (Q99JE4), 
RPGF1_CAEEL (P34578), RPGF1_HUMAN (Q13905), RPGF2_BOVIN (F1MSG6), 
RPGF2_CANLF (F1PBJ0), RPGF2_HUMAN (Q9Y4G8), RPGF2_MOUSE (Q8CHG7), 
RPGF2_RAT   (F1M386), RPGF3_HUMAN (O95398), RPGF3_MOUSE (Q8VCC8), 
RPGF3_RAT   (Q9Z1C8), RPGF4_HUMAN (Q8WZA2), RPGF4_MOUSE (Q9EQZ6), 
RPGF4_RAT   (Q9Z1C7), RPGF5_HUMAN (Q92565), RPGF5_MOUSE (Q8C0Q9), 
RPGF5_RAT   (P83900), RPGF6_HUMAN (Q8TEU7), RPGF_CAEEL  (G5EDB9), 
SDC25_YEAS1 (B3LTF3), SDC25_YEAS6 (B5VMS9), SDC25_YEAS7 (A7A0P0), 
SDC25_YEAS8 (C8ZCV7), SDC25_YEASX (P0CF32), SOS1_HUMAN  (Q07889), 
SOS1_MOUSE  (Q62245), SOS2_HUMAN  (Q07890), SOS2_MOUSE  (Q02384), 
SOS_CAEEL   (Q9N5D3), SOS_DROME   (P26675), STE6_SCHPO  (P26674), 
YL016_YEAST (P0CF34)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences

2 sequences

PIAA_DICDI  (O77203), TSC11_YEAST (P40061)

PDB
[Detailed view]

104 PDB

1BKD; 1NVU; 1NVV; 1NVW; 1NVX; 1XD2; 1XD4; 1XDV; 2BYV; 2II0; 3CF6; 3KSY; 4F7Z; 4JGW; 4L9M; 4MGI; 4MGK; 4MGY; 4MGZ; 4MH0; 4NYI; 4NYJ; 4NYM; 4URU; 4URV; 4URW; 4URX; 4URY; 4URZ; 4US0; 4US1; 4US2; 5CM8; 5CM9; 5OVD; 5OVE; 5OVF; 5OVG; 5OVH; 5OVI; 5WFO; 5WFP; 5WFQ; 5WFR; 6AXF; 6AXG; 6BVI; 6BVJ; 6BVK; 6BVL; 6BVM; 6CUO; 6CUP; 6CUR; 6D55; 6D56; 6D59; 6D5E; 6D5G; 6D5H; 6D5J; 6D5L; 6D5M; 6D5V; 6D5W; 6EIE; 6EPL; 6EPM; 6EPN; 6EPO; 6EPP; 6SCM; 6SFR; 6V94; 6V9F; 6V9J; 6V9L; 6V9M; 6V9N; 6V9O; 7AVI; 7AVL; 7AVS; 7AVT; 7AVU; 7AVV; 7KFZ; 7NZZ; 7UKR; 7UKS; 8BE2; 8BE4; 8BE5; 8BE6; 8BE7; 8BE8; 8BE9; 8BEA; 8T5G; 8T5M; 8T5R; 8UC9; 8UF2; 8UH0
» more