Entry: PS50216

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] ZF_DHHC
Accession [info] PS50216
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JAN-2002 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAR-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50216
Associated ProRule [info] PRU00067

Name and characterization of the entry

Description [info] Zinc finger DHHC-type profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=.5296; R2=.01412429; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-930.00000; R2=23.74747; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=564; N_SCORE=8.5; H_SCORE=10801; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=422; N_SCORE=6.5; H_SCORE=9115; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-30; E1=-30; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='N'; M=-10,  7,-25,  2,  0,-22,-15,  0,-15,  8,-21,-10, 14,-15,  4,  8,  1, -4,-15,-29,-11,  0;
/M: SY='F'; M=-17,-27,-25,-32,-26, 44,-29,-11,  1,-19,  3, -1,-23,-29,-26,-15,-20,-11,  0, 24, 36,-25;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='I'; M= -6,-14,-22,-15,-10, -5,-22,-13,  3,-12, -5, -1,-11,-12, -5,-12, -2, -2,  2,-21, -2, -9;
/M: SY='E'; M= -7, -1,-25,  2, 21,-22,-20,-10,-19, 11,-16,-11, -4, -4,  5,  3, -1, -1,-15,-27,-15, 13;
/M: SY='C'; M= -8,-16, 95,-26,-26,-18,-28,-28,-26,-26,-18,-18,-16,-34,-26,-26, -4,  1, -8,-46,-26,-26;
/M: SY='N'; M=-13, -4,-21,-10, -8, -5,-11,  0,-17, -8,-13, -8,  5,-23, -1, -1, -9,-11,-20, -7, -3, -5;
/M: SY='I'; M= -8,-10,-18,-14, -8, -9,-19, -2,  2,-14, -7, -2, -4,-19, -5,-14, -3, -5, -2,-22,  1, -9;
/M: SY='W'; M=-16,-25,-32,-27,-19,  2,-25,-16, -4, -6, -3, -3,-20,-25,-11,  9,-22,-14, -5, 26,  8,-16;
/M: SY='K'; M=-11, -1,-30, -1,  9,-29,-20, -9,-30, 49,-29,-10,  0,-11, 10, 32,-10,-10,-20,-20,-10,  9;
/M: SY='P'; M= -8,-19,-33,-14, -6,-23,-13,-16,-12,-11,-19, -4,-17, 51, -9,-18, -8, -9,-18,-28,-23,-11;
/M: SY='P'; M=-11,  5,-30, 16, 11,-25,-18,-11,-20, -8,-12,-15, -6, 18, -4,-14, -8,-10,-21,-31,-19,  2;
/M: SY='R'; M=-18, -6,-28, -7,  0,-20,-18,  7,-29, 23,-21,-10,  4,-19,  9, 57, -6, -8,-21,-23, -9,  0;
/M: SY='S'; M= 10, -5, -5, -8, -7,-16, -7,-16,-17,-12,-22,-17,  1,-13, -6,-13, 25, 20, -8,-25,-16, -6;
/M: SY='H'; M=-13, -2,-28, -2,  2,-21,-18, 42,-28, 12,-23, -6,  5,-16,  8, 13, -5,-11,-23,-25,  7,  2;
/M: SY='H'; M=-20, -4,-29, -5, -4, -8,-22, 84,-25,-12,-16,  0,  5,-22,  4, -2,-12,-18,-26,-22, 26, -4;
/M: SY='C'; M= -5,-15, 87,-22,-22,-20,-22,-25,-27,-25,-23,-20,-12,-32,-22,-25,  3, -2,-10,-47,-27,-22;
/M: SY='S'; M=  3, -7,-20, -7, -3,-15, -6,-13,-20, -4,-25,-16, -1,  4, -5, -5, 15,  5,-14,-29,-17, -5;
/M: SY='V'; M= -1,-15,-19,-19, -9, -2,-21,-17,  3,-12,  3,  2,-13,-18,-11,-10, -4,  1,  5,-23, -7,-11;
/M: SY='C'; M= -8,-14, 86,-24,-24,-17,-25,-24,-24,-26,-15,-16,-12,-35,-24,-25, -6, -7,-10,-46,-26,-24;
/M: SY='N'; M= -9, 19,-27, 16,  4,-28, 15, -4,-31,  2,-29,-20, 23,-15, -3, -3,  2,-10,-29,-30,-22,  0;
/M: SY='R'; M= -3,-12,-23,-15, -6,-11,-19, -1,-10,  6, -7,  2, -9,-18,  0, 10, -9, -8, -5,-20, -5, -4;
/M: SY='C'; M= -9,-22, 98,-30,-29,-16,-30,-29,-21,-29,-12,-14,-22,-38,-29,-28,-12, -9, -4,-46,-26,-29;
/M: SY='V'; M= -4,-29, -1,-32,-30, -2,-32,-30, 29,-24,  9,  9,-26,-29,-28,-24,-12, -4, 39,-30,-10,-30;
/M: SY='L'; M= -1,-15,-22,-20,-14, -4,-20, -6,  5,-18, 13,  9,-12,-13,-11,-16,-14, -8, -2,-21, -2,-14;
/M: SY='R'; M=-13, -8,-26,-10, -4,-19,-16, -7,-19, 21,-17, -5, -2,-20,  1, 37, -9, -8, -9,-23,-11, -4;
/M: SY='F'; M= -9,-19,-22,-26,-18, 22,-23,  1,  1,-10,  4, 16,-16,-23,-12,-10,-16,-10, -2, -3, 22,-15;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='H'; M=-20, -5,-30, -5, -5, -7,-23, 80,-22,-10,-15,  0,  2,-23,  5, -3,-13,-17,-25,-15, 35, -5;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P'; M=-11,-23,-34,-20,-10,-11,-25,-20, -1,-16,-12, -3,-20, 47,-14,-21,-14,-10,-12,-24,-16,-16;
/M: SY='W'; M=-19,-36,-46,-38,-28,  7,-23,-22,-10,-21,-14,-13,-34,-28,-18,-20,-35,-26,-21,114, 25,-20;
/M: SY='I'; M= -8,-25,-23,-33,-25,  4,-34,-27, 32,-26, 17, 13,-19,-21,-20,-24,-13,  1, 23,-21, -1,-25;
/M: SY='N'; M= -5,  8,-24, -2,-10,-11, 13, -2,-20, -9,-21,-12, 20,-20, -7, -9,  1, -8,-23,-22, -9, -8;
/M: SY='N'; M= -2, 16,-19,  4,  1,-19, -8,  0,-14, -3,-17, -9, 25,-16,  5, -4,  7,  3,-18,-32,-16,  3;
/M: SY='C'; M=-11,-10, 84,-14,-22,-21,-27,-25,-26,-24,-19,-19,-14,-34,-25,-26, -8, -9, -8,-47,-27,-24;
/M: SY='V'; M= -3,-28,-16,-32,-29, -1,-32,-29, 34,-22, 12, 12,-25,-26,-26,-22,-11,  0, 41,-27, -7,-29;
/M: SY='G'; M= -2, -6,-27, -8,-17,-26, 51,-12,-35,-17,-27,-18,  3,-19,-16,-17,  2,-10,-26,-23,-24,-17;
/M: SY='L'; M= -6,-15,-22,-18, -9,  0,-21, -2, -9, -3,  4,  1,-11,-21, -8,  4,-12, -8, -7,-18,  0, -9;
/M: SY='R'; M= -9, -3,-28, -2, -5,-25,  6,  1,-29,  7,-23,-12,  1,-18, -3, 14, -6,-13,-19,-24,-14, -5;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='H'; M=-17, -9,-29,-10, -5, -4,-24, 45,-13, -6,-10,  4, -5,-22, 12, -2,-12,-14,-20, -4, 35,  0;
/M: SY='R'; M=-11, -9,-26, -9,  0,-20,-21, -9,-18, 22,-15, -6, -6,-13,  4, 27, -9, -7,-11,-22,-10,  0;
/M: SY='Y'; M= -9,-14,-11,-17, -9,  4,-24,  9, -9,-14,  0, -1,-12,-23, -5,-11,-12, -8,-10,-12, 15, -8;
/M: SY='F'; M=-19,-26,-21,-35,-22, 70,-29,-18, -3,-26,  7, -2,-18,-27,-35,-18,-18,-10, -3,  6, 26,-24;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-25, 15,-32,-20, 25,-26, 27, 14,-26,-28,-23,-21,-22, -8, 18,-13, 10,-25;
/M: SY='L'; M=-12,-23,-23,-26,-15, 11,-28,-13,  9,-18, 25, 14,-21,-25, -8, -9,-21,-10,  1,-15,  3,-11;
/M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-39,-29, 77,-30,-17,  0,-29,  9,  0,-20,-30,-38,-19,-20,-10, -1, 11, 33,-29;
/M: SY='L'; M=  1,-27,-19,-30,-21,  2,-27,-23, 22,-26, 30, 14,-25,-25,-19,-22,-19, -7, 17,-21, -4,-21;
/M: SY='I'; M=  0,-23,-19,-30,-23, 13,-26,-19, 15,-21,  9,  8,-19,-22,-20,-20,-11, -2, 14,-12,  7,-22;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_04 which contains 544'996 sequence entries.


Total number of hits 199 in 199 different sequences
Number of true positive hits 199 in 199 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] ZN_FING
Feature description [info] DHHC-type
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
199 sequences

AKR1_ASHGO  (Q755Y0), AKR1_ASPFU  (Q4X251), AKR1_ASPOR  (Q7Z8U2), 
AKR1_CANAL  (Q5AL27), AKR1_CANGA  (Q6FJ70), AKR1_CRYNB  (P0CS67), 
AKR1_CRYNJ  (P0CS66), AKR1_DEBHA  (Q6BP80), AKR1_EMENI  (Q5B0V6), 
AKR1_GIBZE  (Q4I8B6), AKR1_KLULA  (Q875M2), AKR1_LACK1  (Q875S9), 
AKR1_MORAP  (Q9UVH3), AKR1_NAUCC  (Q876A6), AKR1_NEUCR  (Q7S3M5), 
AKR1_SACBA  (Q876L5), AKR1_SCHPO  (Q09701), AKR1_USTMA  (Q4P6L3), 
AKR1_YARLI  (Q6C520), AKR1_YEAST  (P39010), AKR2_SACBA  (Q876L4), 
AKR2_YEAST  (Q12013), ERFB_ASHGO  (Q750R7), ERFB_ASPFU  (Q4WWN2), 
ERFB_CANAL  (Q59QL0), ERFB_CANGA  (Q6FSS4), ERFB_DEBHA  (Q6BHT4), 
ERFB_EMENI  (Q5B3W7), ERFB_GIBZE  (Q4I2M7), ERFB_KLULA  (Q6CQB5), 
ERFB_NEUCR  (Q7SFL7), ERFB_SCHPO  (O74384), ERFB_YARLI  (Q6C890), 
ERFB_YEAST  (Q06551), KMT2C_HUMAN (Q8NEZ4), KMT2C_MOUSE (Q8BRH4), 
PFA3_ASHGO  (Q75AW7), PFA3_ASPFU  (Q4WZL8), PFA3_CANAL  (Q5ADN9), 
PFA3_CANGA  (Q6FW70), PFA3_DEBHA  (Q6BMV2), PFA3_EMENI  (C8VCL4), 
PFA3_GIBZE  (Q4IA62), PFA3_KLULA  (Q6CPU8), PFA3_NEUCR  (Q7S7C5), 
PFA3_SCHPO  (O14345), PFA3_YARLI  (Q6C4W5), PFA3_YEAST  (P42836), 
PFA4_ASHGO  (Q75CB4), PFA4_ASPFU  (Q4WC37), PFA4_CANAL  (Q5AGV7), 
PFA4_CANGA  (Q6FVE6), PFA4_CRYNB  (P0CS69), PFA4_CRYNJ  (P0CS68), 
PFA4_DEBHA  (Q6BLY8), PFA4_EMENI  (Q5BD15), PFA4_GIBZE  (Q4IMZ7), 
PFA4_KLULA  (Q6CUB5), PFA4_NEUCR  (Q7SCY6), PFA4_USTMA  (Q4PE27), 
PFA4_YARLI  (Q6C7Q0), PFA4_YEAST  (Q12006), PFA5_ASHGO  (Q75D19), 
PFA5_ASPFU  (Q4WUK1), PFA5_CANAL  (Q59NR8), PFA5_CANGA  (Q6FMP5), 
PFA5_DEBHA  (Q6BP97), PFA5_EMENI  (Q5B433), PFA5_GIBZE  (Q4I1J3), 
PFA5_KLULA  (Q6CRV3), PFA5_SCHPO  (Q9C0W9), PFA5_YARLI  (Q6C7D1), 
PFA5_YEAST  (Q03289), SWF1_ASHGO  (Q74ZZ2), SWF1_ASPFU  (Q4WN54), 
SWF1_CANAL  (Q5A861), SWF1_CANGA  (Q6FXC6), SWF1_DEBHA  (Q6BP23), 
SWF1_EMENI  (Q5BC23), SWF1_KLULA  (Q6CJC5), SWF1_NEUCR  (Q7RWM9), 
SWF1_SCHPO  (O60069), SWF1_YARLI  (Q6CG20), SWF1_YEAST  (Q04629), 
ZCHC4_BOVIN (E1BGQ2), ZCHC4_HUMAN (Q9H5U6), ZCHC4_MOUSE (Q8BKW4), 
ZCHC4_RAT   (D3ZV31), ZCHC4_XENLA (Q6DCD7), ZCHC4_XENTR (Q66IH9), 
ZDH10_ARATH (Q9M306), ZDH11_ARATH (Q7XA86), ZDH11_HUMAN (Q9H8X9), 
ZDH11_MOUSE (Q14AK4), ZDH12_ARATH (B3DN87), ZDH12_HUMAN (Q96GR4), 
ZDH12_MOUSE (Q8VC90), ZDH12_RAT   (Q6DGF5), ZDH13_ARATH (Q9M1K5), 
ZDH13_HUMAN (Q8IUH4), ZDH13_MACFA (Q4R690), ZDH13_MOUSE (Q9CWU2), 
ZDH13_PONAB (Q5NVB9), ZDH14_ARATH (Q8VYP5), ZDH14_HUMAN (Q8IZN3), 
ZDH14_MOUSE (Q8BQQ1), ZDH15_ARATH (Q5M757), ZDH15_HUMAN (Q96MV8), 
ZDH15_MOUSE (Q8BGJ0), ZDH15_RAT   (Q2TGJ4), ZDH15_XENLA (Q5FWL7), 
ZDH16_ARATH (Q9M115), ZDH16_BOVIN (Q58CU4), ZDH16_HUMAN (Q969W1), 
ZDH16_MACFA (Q4R7E2), ZDH16_MOUSE (Q9ESG8), ZDH17_ARATH (Q8L5Y5), 
ZDH17_HUMAN (Q8IUH5), ZDH17_MOUSE (Q80TN5), ZDH18_ARATH (Q94C49), 
ZDH18_HUMAN (Q9NUE0), ZDH18_MOUSE (Q5Y5T2), ZDH18_RAT   (Q2TGJ1), 
ZDH19_ARATH (Q9SB58), ZDH19_HUMAN (Q8WVZ1), ZDH19_MOUSE (Q810M5), 
ZDH20_ARATH (Q500Z2), ZDH20_BOVIN (Q0VC89), ZDH20_HUMAN (Q5W0Z9), 
ZDH20_MOUSE (Q5Y5T1), ZDH21_ARATH (Q5PNZ1), ZDH21_BOVIN (A2VDT6), 
ZDH21_HUMAN (Q8IVQ6), ZDH21_MOUSE (Q9D270), ZDH21_PONAB (Q5RB84), 
ZDH22_ARATH (Q52T38), ZDH22_HUMAN (Q8N966), ZDH22_MOUSE (A0PK84), 
ZDH22_RAT   (Q2TGI8), ZDH23_ARATH (Q9FLM3), ZDH23_HUMAN (Q8IYP9), 
ZDH23_MOUSE (Q5Y5T3), ZDH23_RAT   (Q76IC6), ZDH24_ARATH (Q8VYS8), 
ZDH24_HUMAN (Q6UX98), ZDH24_MOUSE (Q6IR37), ZDH24_RAT   (Q2TGI5), 
ZDHC1_ARATH (Q9C533), ZDHC1_DICDI (Q550R7), ZDHC1_HUMAN (Q8WTX9), 
ZDHC1_MOUSE (Q8R0N9), ZDHC2_ARATH (Q3EC11), ZDHC2_DICDI (Q86A83), 
ZDHC2_HUMAN (Q9UIJ5), ZDHC2_MOUSE (P59267), ZDHC2_RAT   (Q9JKR5), 
ZDHC3_ARATH (Q6DR03), ZDHC3_DICDI (Q557H5), ZDHC3_HUMAN (Q9NYG2), 
ZDHC3_MOUSE (Q8R173), ZDHC4_ARATH (O80685), ZDHC4_BOVIN (Q58DT3), 
ZDHC4_CAEEL (Q8I0G4), ZDHC4_DICDI (Q555N7), ZDHC4_HUMAN (Q9NPG8), 
ZDHC4_MOUSE (Q9D6H5), ZDHC4_RAT   (Q5FVR1), ZDHC5_ARATH (Q3EBC2), 
ZDHC5_BOVIN (E1BLT8), ZDHC5_CANFA (Q2THW9), ZDHC5_DICDI (Q554E7), 
ZDHC5_HUMAN (Q9C0B5), ZDHC5_MOUSE (Q8VDZ4), ZDHC5_PANTR (Q2THX1), 
ZDHC5_PONAB (Q5R838), ZDHC5_RAT   (Q2THW7), ZDHC6_ARATH (Q93VV0), 
ZDHC6_BOVIN (Q2HJ95), ZDHC6_DICDI (Q8T2Q0), ZDHC6_HUMAN (Q9H6R6), 
ZDHC6_MOUSE (Q9CPV7), ZDHC6_PONAB (Q5REH2), ZDHC7_ARATH (Q9LIH7), 
ZDHC7_DICDI (Q552M6), ZDHC7_HUMAN (Q9NXF8), ZDHC7_MOUSE (Q91WU6), 
ZDHC7_RAT   (Q923G5), ZDHC8_ARATH (Q9LIE4), ZDHC8_CANFA (Q2THW8), 
ZDHC8_DICDI (Q54VH7), ZDHC8_HUMAN (Q9ULC8), ZDHC8_MOUSE (Q5Y5T5), 
ZDHC8_PANTR (Q2THX0), ZDHC9_ARATH (Q0WQK2), ZDHC9_BOVIN (Q58DA8), 
ZDHC9_HUMAN (Q9Y397), ZDHC9_MOUSE (P59268), ZDHC9_PONAB (Q5R5J8), 
ZH11B_HUMAN (P0C7U3)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission