PROSITE entry PS50216
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | DHHC |
| Accession [info] | PS50216 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JAN-2002 CREATED;
01-MAY-2016 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50216 |
| Associated ProRule [info] | PRU00067 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | DHHC domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=.5296; R2=.01412429; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=565; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=423; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-30; E1=-30; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='N'; M=-10, 7,-25, 2, 0,-22,-15, 0,-15, 8,-21,-10, 14,-15, 4, 8, 1, -4,-15,-29,-11, 0; /M: SY='F'; M=-17,-27,-25,-32,-26, 44,-29,-11, 1,-19, 3, -1,-23,-29,-26,-15,-20,-11, 0, 24, 36,-25; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='I'; M= -6,-14,-22,-15,-10, -5,-22,-13, 3,-12, -5, -1,-11,-12, -5,-12, -2, -2, 2,-21, -2, -9; /M: SY='E'; M= -7, -1,-25, 2, 21,-22,-20,-10,-19, 11,-16,-11, -4, -4, 5, 3, -1, -1,-15,-27,-15, 13; /M: SY='C'; M= -8,-16, 95,-26,-26,-18,-28,-28,-26,-26,-18,-18,-16,-34,-26,-26, -4, 1, -8,-46,-26,-26; /M: SY='N'; M=-13, -4,-21,-10, -8, -5,-11, 0,-17, -8,-13, -8, 5,-23, -1, -1, -9,-11,-20, -7, -3, -5; /M: SY='I'; M= -8,-10,-18,-14, -8, -9,-19, -2, 2,-14, -7, -2, -4,-19, -5,-14, -3, -5, -2,-22, 1, -9; /M: SY='W'; M=-16,-25,-32,-27,-19, 2,-25,-16, -4, -6, -3, -3,-20,-25,-11, 9,-22,-14, -5, 26, 8,-16; /M: SY='K'; M=-11, -1,-30, -1, 9,-29,-20, -9,-30, 49,-29,-10, 0,-11, 10, 32,-10,-10,-20,-20,-10, 9; /M: SY='P'; M= -8,-19,-33,-14, -6,-23,-13,-16,-12,-11,-19, -4,-17, 51, -9,-18, -8, -9,-18,-28,-23,-11; /M: SY='P'; M=-11, 5,-30, 16, 11,-25,-18,-11,-20, -8,-12,-15, -6, 18, -4,-14, -8,-10,-21,-31,-19, 2; /M: SY='R'; M=-18, -6,-28, -7, 0,-20,-18, 7,-29, 23,-21,-10, 4,-19, 9, 57, -6, -8,-21,-23, -9, 0; /M: SY='S'; M= 10, -5, -5, -8, -7,-16, -7,-16,-17,-12,-22,-17, 1,-13, -6,-13, 25, 20, -8,-25,-16, -6; /M: SY='H'; M=-13, -2,-28, -2, 2,-21,-18, 42,-28, 12,-23, -6, 5,-16, 8, 13, -5,-11,-23,-25, 7, 2; /M: SY='H'; M=-20, -4,-29, -5, -4, -8,-22, 84,-25,-12,-16, 0, 5,-22, 4, -2,-12,-18,-26,-22, 26, -4; /M: SY='C'; M= -5,-15, 87,-22,-22,-20,-22,-25,-27,-25,-23,-20,-12,-32,-22,-25, 3, -2,-10,-47,-27,-22; /M: SY='S'; M= 3, -7,-20, -7, -3,-15, -6,-13,-20, -4,-25,-16, -1, 4, -5, -5, 15, 5,-14,-29,-17, -5; /M: SY='V'; M= -1,-15,-19,-19, -9, -2,-21,-17, 3,-12, 3, 2,-13,-18,-11,-10, -4, 1, 5,-23, -7,-11; /M: SY='C'; M= -8,-14, 86,-24,-24,-17,-25,-24,-24,-26,-15,-16,-12,-35,-24,-25, -6, -7,-10,-46,-26,-24; /M: SY='N'; M= -9, 19,-27, 16, 4,-28, 15, -4,-31, 2,-29,-20, 23,-15, -3, -3, 2,-10,-29,-30,-22, 0; /M: SY='R'; M= -3,-12,-23,-15, -6,-11,-19, -1,-10, 6, -7, 2, -9,-18, 0, 10, -9, -8, -5,-20, -5, -4; /M: SY='C'; M= -9,-22, 98,-30,-29,-16,-30,-29,-21,-29,-12,-14,-22,-38,-29,-28,-12, -9, -4,-46,-26,-29; /M: SY='V'; M= -4,-29, -1,-32,-30, -2,-32,-30, 29,-24, 9, 9,-26,-29,-28,-24,-12, -4, 39,-30,-10,-30; /M: SY='L'; M= -1,-15,-22,-20,-14, -4,-20, -6, 5,-18, 13, 9,-12,-13,-11,-16,-14, -8, -2,-21, -2,-14; /M: SY='R'; M=-13, -8,-26,-10, -4,-19,-16, -7,-19, 21,-17, -5, -2,-20, 1, 37, -9, -8, -9,-23,-11, -4; /M: SY='F'; M= -9,-19,-22,-26,-18, 22,-23, 1, 1,-10, 4, 16,-16,-23,-12,-10,-16,-10, -2, -3, 22,-15; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='H'; M=-20, -5,-30, -5, -5, -7,-23, 80,-22,-10,-15, 0, 2,-23, 5, -3,-13,-17,-25,-15, 35, -5; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='P'; M=-11,-23,-34,-20,-10,-11,-25,-20, -1,-16,-12, -3,-20, 47,-14,-21,-14,-10,-12,-24,-16,-16; /M: SY='W'; M=-19,-36,-46,-38,-28, 7,-23,-22,-10,-21,-14,-13,-34,-28,-18,-20,-35,-26,-21,114, 25,-20; /M: SY='I'; M= -8,-25,-23,-33,-25, 4,-34,-27, 32,-26, 17, 13,-19,-21,-20,-24,-13, 1, 23,-21, -1,-25; /M: SY='N'; M= -5, 8,-24, -2,-10,-11, 13, -2,-20, -9,-21,-12, 20,-20, -7, -9, 1, -8,-23,-22, -9, -8; /M: SY='N'; M= -2, 16,-19, 4, 1,-19, -8, 0,-14, -3,-17, -9, 25,-16, 5, -4, 7, 3,-18,-32,-16, 3; /M: SY='C'; M=-11,-10, 84,-14,-22,-21,-27,-25,-26,-24,-19,-19,-14,-34,-25,-26, -8, -9, -8,-47,-27,-24; /M: SY='V'; M= -3,-28,-16,-32,-29, -1,-32,-29, 34,-22, 12, 12,-25,-26,-26,-22,-11, 0, 41,-27, -7,-29; /M: SY='G'; M= -2, -6,-27, -8,-17,-26, 51,-12,-35,-17,-27,-18, 3,-19,-16,-17, 2,-10,-26,-23,-24,-17; /M: SY='L'; M= -6,-15,-22,-18, -9, 0,-21, -2, -9, -3, 4, 1,-11,-21, -8, 4,-12, -8, -7,-18, 0, -9; /M: SY='R'; M= -9, -3,-28, -2, -5,-25, 6, 1,-29, 7,-23,-12, 1,-18, -3, 14, -6,-13,-19,-24,-14, -5; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='H'; M=-17, -9,-29,-10, -5, -4,-24, 45,-13, -6,-10, 4, -5,-22, 12, -2,-12,-14,-20, -4, 35, 0; /M: SY='R'; M=-11, -9,-26, -9, 0,-20,-21, -9,-18, 22,-15, -6, -6,-13, 4, 27, -9, -7,-11,-22,-10, 0; /M: SY='Y'; M= -9,-14,-11,-17, -9, 4,-24, 9, -9,-14, 0, -1,-12,-23, -5,-11,-12, -8,-10,-12, 15, -8; /M: SY='F'; M=-19,-26,-21,-35,-22, 70,-29,-18, -3,-26, 7, -2,-18,-27,-35,-18,-18,-10, -3, 6, 26,-24; /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-25, 15,-32,-20, 25,-26, 27, 14,-26,-28,-23,-21,-22, -8, 18,-13, 10,-25; /M: SY='L'; M=-12,-23,-23,-26,-15, 11,-28,-13, 9,-18, 25, 14,-21,-25, -8, -9,-21,-10, 1,-15, 3,-11; /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-39,-29, 77,-30,-17, 0,-29, 9, 0,-20,-30,-38,-19,-20,-10, -1, 11, 33,-29; /M: SY='L'; M= 1,-27,-19,-30,-21, 2,-27,-23, 22,-26, 30, 14,-25,-25,-19,-22,-19, -7, 17,-21, -4,-21; /M: SY='I'; M= 0,-23,-19,-30,-23, 13,-26,-19, 15,-21, 9, 8,-19,-22,-20,-20,-11, -2, 14,-12, 7,-22; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 236 in 236 different sequences |
| Number of true positive hits | 236 in 236 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | K_Hofmann |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | DHHC |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
236 sequences
AKR1_ASPFU (Q4X251), AKR1_ASPOR (Q7Z8U2), AKR1_CANAL (Q5AL27), AKR1_CANGA (Q6FJ70), AKR1_CRYNB (P0CS67), AKR1_CRYNJ (P0CS66), AKR1_DEBHA (Q6BP80), AKR1_EMENI (Q5B0V6), AKR1_EREGS (Q755Y0), AKR1_GIBZE (Q4I8B6), AKR1_KLULA (Q875M2), AKR1_LACK1 (Q875S9), AKR1_MORAP (Q9UVH3), AKR1_NAUCC (Q876A6), AKR1_NEUCR (Q7S3M5), AKR1_SACU7 (Q876L5), AKR1_SCHPO (Q09701), AKR1_USTMA (Q4P6L3), AKR1_YARLI (Q6C520), AKR1_YEAST (P39010), AKR2_SACU7 (Q876L4), AKR2_YEAST (Q12013), APP_DROME (A2VEY9), DHC3A_DANRE (F1RE57), DHC5A_DANRE (Q2THW0), DHC5B_DANRE (E7FBS9), ERFB_ASPFU (Q4WWN2), ERFB_CANAL (Q59QL0), ERFB_CANGA (Q6FSS4), ERFB_DEBHA (Q6BHT4), ERFB_EMENI (Q5B3W7), ERFB_EREGS (Q750R7), ERFB_GIBZE (Q4I2M7), ERFB_KLULA (Q6CQB5), ERFB_NEUCR (Q7SFL7), ERFB_SCHPO (O74384), ERFB_YARLI (Q6C890), ERFB_YEAST (Q06551), HIP14_DROME (Q9VUW9), KMT2C_HUMAN (Q8NEZ4), KMT2C_MOUSE (Q8BRH4), PFA3_ASPFU (Q4WZL8), PFA3_CANAL (Q5ADN9), PFA3_CANGA (Q6FW70), PFA3_DEBHA (Q6BMV2), PFA3_EMENI (C8VCL4), PFA3_EREGS (Q75AW7), PFA3_GIBZE (Q4IA62), PFA3_KLULA (Q6CPU8), PFA3_NEUCR (Q7S7C5), PFA3_SCHPO (O14345), PFA3_YARLI (Q6C4W5), PFA3_YEAST (P42836), PFA4_ASPFU (Q4WC37), PFA4_CANAL (Q5AGV7), PFA4_CANGA (Q6FVE6), PFA4_CRYNB (P0CS69), PFA4_CRYNH (J9VJ99), PFA4_CRYNJ (P0CS68), PFA4_DEBHA (Q6BLY8), PFA4_EMENI (Q5BD15), PFA4_EREGS (Q75CB4), PFA4_GIBZE (Q4IMZ7), PFA4_KLULA (Q6CUB5), PFA4_NEUCR (Q7SCY6), PFA4_USTMA (Q4PE27), PFA4_YARLI (Q6C7Q0), PFA4_YEAST (Q12006), PFA5_ASPFU (Q4WUK1), PFA5_CANAL (Q59NR8), PFA5_CANGA (Q6FMP5), PFA5_DEBHA (Q6BP97), PFA5_EMENI (Q5B433), PFA5_EREGS (Q75D19), PFA5_GIBZE (Q4I1J3), PFA5_KLULA (Q6CRV3), PFA5_SCHPO (Q9C0W9), PFA5_YARLI (Q6C7D1), PFA5_YEAST (Q03289), SWF1_ASPFU (Q4WN54), SWF1_CANAL (Q5A861), SWF1_CANGA (Q6FXC6), SWF1_DEBHA (Q6BP23), SWF1_EMENI (Q5BC23), SWF1_EREGS (Q74ZZ2), SWF1_KLULA (Q6CJC5), SWF1_NEUCR (Q7RWM9), SWF1_SCHPO (O60069), SWF1_YARLI (Q6CG20), SWF1_YEAST (Q04629), ZCHC4_BOVIN (E1BGQ2), ZCHC4_HUMAN (Q9H5U6), ZCHC4_MOUSE (Q8BKW4), ZCHC4_RAT (D3ZV31), ZCHC4_XENLA (Q6DCD7), ZCHC4_XENTR (Q66IH9), ZD12A_DANRE (B0S5D5), ZD12B_DANRE (E7F021), ZD16A_DANRE (B8A4F0), ZD16B_DANRE (A0A0R4IF99), ZD18A_DANRE (E7FH11), ZD18B_DANRE (Q7ZVN4), ZD20A_DANRE (F1Q7H8), ZD20B_DANRE (E7F587), ZD23A_DANRE (F1QHM7), ZD23B_DANRE (F1QX91), ZDH10_ARATH (Q9M306), ZDH11_ARATH (Q7XA86), ZDH11_DANRE (E7EZI4), ZDH11_HUMAN (Q9H8X9), ZDH11_MOUSE (Q14AK4), ZDH12_ARATH (B3DN87), ZDH12_HUMAN (Q96GR4), ZDH12_MOUSE (Q8VC90), ZDH12_RAT (Q6DGF5), ZDH13_ARATH (Q9M1K5), ZDH13_DANRE (A0A0R4IQZ2), ZDH13_HUMAN (Q8IUH4), ZDH13_MACFA (Q4R690), ZDH13_MOUSE (Q9CWU2), ZDH13_PONAB (Q5NVB9), ZDH14_ARATH (Q8VYP5), ZDH14_DANRE (E9QCD3), ZDH14_HUMAN (Q8IZN3), ZDH14_MOUSE (Q8BQQ1), ZDH15_ARATH (Q5M757), ZDH15_HUMAN (Q96MV8), ZDH15_MOUSE (Q8BGJ0), ZDH15_RAT (Q2TGJ4), ZDH15_XENLA (Q5FWL7), ZDH16_ARATH (Q9M115), ZDH16_BOVIN (Q58CU4), ZDH16_HUMAN (Q969W1), ZDH16_MACFA (Q4R7E2), ZDH16_MOUSE (Q9ESG8), ZDH17_ARATH (Q8L5Y5), ZDH17_DANRE (A5WVX9), ZDH17_HUMAN (Q8IUH5), ZDH17_MOUSE (Q80TN5), ZDH17_RAT (E9PTT0), ZDH18_ARATH (Q94C49), ZDH18_HUMAN (Q9NUE0), ZDH18_MOUSE (Q5Y5T2), ZDH18_RAT (Q2TGJ1), ZDH19_ARATH (Q9SB58), ZDH19_HUMAN (Q8WVZ1), ZDH19_MOUSE (Q810M5), ZDH20_ARATH (Q500Z2), ZDH20_BOVIN (Q0VC89), ZDH20_HUMAN (Q5W0Z9), ZDH20_MOUSE (Q5Y5T1), ZDH21_ARATH (Q5PNZ1), ZDH21_BOVIN (A2VDT6), ZDH21_DANRE (B1H1H3), ZDH21_HUMAN (Q8IVQ6), ZDH21_MOUSE (Q9D270), ZDH21_PONAB (Q5RB84), ZDH22_ARATH (Q52T38), ZDH22_DANRE (X1WBB5), ZDH22_HUMAN (Q8N966), ZDH22_MOUSE (A0PK84), ZDH22_RAT (Q2TGI8), ZDH23_ARATH (Q9FLM3), ZDH23_HUMAN (Q8IYP9), ZDH23_MOUSE (Q5Y5T3), ZDH23_RAT (Q76IC6), ZDH24_ARATH (Q8VYS8), ZDH24_DANRE (F1QGD2), ZDH24_HUMAN (Q6UX98), ZDH24_MOUSE (Q6IR37), ZDH24_RAT (Q2TGI5), ZDH8B_DANRE (A2CEX1), ZDHC1_ARATH (Q9C533), ZDHC1_DANRE (E7F4Z4), ZDHC1_DICDI (Q550R7), ZDHC1_HUMAN (Q8WTX9), ZDHC1_MOUSE (Q8R0N9), ZDHC2_ARATH (Q3EC11), ZDHC2_DANRE (Q5BLG4), ZDHC2_DICDI (Q86A83), ZDHC2_HUMAN (Q9UIJ5), ZDHC2_MOUSE (P59267), ZDHC2_RAT (Q9JKR5), ZDHC3_ARATH (Q6DR03), ZDHC3_DICDI (Q557H5), ZDHC3_HUMAN (Q9NYG2), ZDHC3_MOUSE (Q8R173), ZDHC3_RAT (Q2TGK3), ZDHC4_ARATH (O80685), ZDHC4_BOVIN (Q58DT3), ZDHC4_CAEEL (Q8I0G4), ZDHC4_DANRE (F1QAM1), ZDHC4_DICDI (Q555N7), ZDHC4_HUMAN (Q9NPG8), ZDHC4_MOUSE (Q9D6H5), ZDHC4_RAT (Q5FVR1), ZDHC5_ARATH (Q3EBC2), ZDHC5_BOVIN (E1BLT8), ZDHC5_CANLF (Q2THW9), ZDHC5_DICDI (Q554E7), ZDHC5_HUMAN (Q9C0B5), ZDHC5_MOUSE (Q8VDZ4), ZDHC5_PANTR (Q2THX1), ZDHC5_PONAB (Q5R838), ZDHC5_RAT (Q2THW7), ZDHC6_ARATH (Q93VV0), ZDHC6_BOVIN (Q2HJ95), ZDHC6_DANRE (E7F6D7), ZDHC6_DICDI (Q8T2Q0), ZDHC6_HUMAN (Q9H6R6), ZDHC6_MOUSE (Q9CPV7), ZDHC6_PONAB (Q5REH2), ZDHC7_ARATH (Q9LIH7), ZDHC7_DANRE (Q6DHI1), ZDHC7_DICDI (Q552M6), ZDHC7_HUMAN (Q9NXF8), ZDHC7_MOUSE (Q91WU6), ZDHC7_RAT (Q923G5), ZDHC8_ARATH (Q9LIE4), ZDHC8_CANLF (Q2THW8), ZDHC8_DICDI (Q54VH7), ZDHC8_DROME (Q9W345), ZDHC8_HUMAN (Q9ULC8), ZDHC8_MOUSE (Q5Y5T5), ZDHC8_PANTR (Q2THX0), ZDHC9_ARATH (Q0WQK2), ZDHC9_BOVIN (Q58DA8), ZDHC9_DANRE (F1R013), ZDHC9_HUMAN (Q9Y397), ZDHC9_MOUSE (P59268), ZDHC9_ORYSJ (Q10L01), ZDHC9_PONAB (Q5R5J8), ZDHCS_CAEEL (Q5FC64), ZH11B_HUMAN (P0C7U3), ZH15A_DANRE (A0A0R4IDP3), ZH15B_DANRE (F1QXD3)» more
|
| PDB [Detailed view] |
8 PDB
6BML; 6BMM; 6BMN; 6BMS; 6UCA; 7KHM; 8HF3; 8HFC |