![]() |
|
| Entry: PS50227 |
| General information about the entry | |
|---|---|
| Entry name | G_PROTEIN_RECEP_F2_3 |
| Accession number | PS50227 |
| Entry type | MATRIX |
| Date | DEC-2001 (CREATED); DEC-2001 (DATA UPDATE); MAR-2013 (INFO UPDATE). |
| PROSITE Documentation | PDOC00559 |
| Name and characterization of the entry | |
| Description | G-protein coupled receptors family 2 profile 1. |
| Matrix / Profile | /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=81;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=76;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.0635; R2=0.01305269; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=569; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=416; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z
/I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='Q'; M= -8, -2,-21, -2, 11,-23,-19, 2,-19, 6,-12, -4, -3,-14, 16, 8, -5, -8,-19,-23, -9, 13;
/M: SY='C'; M=-10,-19,114,-28,-26,-20,-30,-29,-30,-28,-20,-20,-19,-38,-28,-29,-10,-10,-11,-49,-30,-27;
/M: SY='E'; M= -7, -5,-25, -3, 10,-14,-20, 2,-13, -3, -2, -4, -8,-16, 5, -2, -8, -8,-14,-20, -1, 7;
/M: SY='E'; M= -7, 5,-25, 6, 15,-22,-16, 1,-20, 5,-16,-10, 5,-13, 11, 4, -1, -7,-19,-27,-13, 12;
/M: SY='R'; M= -5, -5,-22, -8, 2,-12,-17, -6,-14, 1, -9, -6, -1,-12, 0, 6, -2, 1,-12,-24, -9, 0;
/I: MD=-10;
/M: SY='L'; M= 0,-21,-19,-24,-17, 3,-23,-18, 14,-22, 24, 14,-19,-21,-15,-19,-16, -6, 8,-19, -3,-17; D=-2;
/I: MD=-10;
/M: SY='Q'; M= 0, -2,-19, -3, 5,-19,-15, -4,-10, -3,-11, -5, -3, -9, 6, -6, 3, 1, -8,-24,-11, 5; D=-2;
/I: MD=-10;
/M: SY='E'; M= -1, -4,-13, -4, 7,-19,-10, -3,-16, 5,-12, -7, -3,-10, 7, 4, -3, -7,-14,-18,-11, 7; D=-2;
/I: MD=-10;
/M: SY='D'; M= -4, 1,-13, 3, 1, -8,-11, 0, -5, -5, -2, -3, -2,-11, -3, -6, -4, -5, -3,-15, -3, -1; D=-2;
/I: MD=-10;
/M: SY='P'; M= -1, -1,-13, -1, 0,-11, -8, -6, -7, -3, -7, -6, -1, 7, -2, -6, -2, -1, -9,-15, -9, -2; D=-2;
/I: I=-3; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M: M= -1, -3,-24, -2, -3,-23, -2, -8,-18, -6,-16,-10, -3, -7, -2, -8, 0, -4,-14,-26,-16, -4;
/M: M= -5,-11,-14,-12, -5, -8,-17, -7,-12,-10, -8, -6,-10, -6, -5,-11, -3, -3,-12,-22, -5, -6;
/M: SY='E'; M= -9, 1,-29, 0, 10,-24,-14, -5,-19, 3,-21,-12, 5, 8, 7, 3, -2, -6,-22,-28,-18, 6;
/M: SY='N'; M= -6, 4,-26, 4, 3,-23, -5, -6,-18, -4,-19,-14, 5, -1, -4, -8, -3, -8,-18,-29,-18, -1;
/M: SY='S'; M= -2, 2,-21, 2, 9,-22,-11,-10,-19, -1,-21,-15, 2, 0, 0, -5, 10, 8,-14,-31,-18, 4;
/M: SY='G'; M= -5, 1,-26, 5, 1,-22, 7, -6,-26, -8,-23,-17, 0, -6, -5,-10, 3, -4,-21,-25,-13, -3;
/M: SY='L'; M= -7,-14,-23,-13,-10,-11,-13,-15, -4,-12, 1, -1,-10, -8,-10, -7, -6, -3, -5,-26,-13,-12;
/M: SY='Y'; M= -4,-14,-26,-17,-15, 1, 0, -9,-15,-11,-13, -9,-10,-14,-12,-11, -7,-10,-13, -3, 8,-14;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='N'; M= -6, 8,-25, 3, 3,-19,-10, -6,-19, -2,-23,-16, 16, 9, -3, -6, 4, -2,-23,-32,-19, -1;
/M: SY='G'; M= 1,-11,-27,-11, -7,-24, 6,-15,-24, 1,-22,-13, -5, 1, -6, 5, -2, -8,-18,-23,-20, -9;
/M: SY='T'; M= 0, -5,-16, -9, 0,-12,-17,-11, -8, -6, -7, -1, -5,-12, -3, -7, 8, 17, -3,-26, -9, -2;
/M: SY='W'; M=-17,-29,-37,-32,-23, 18,-23,-23, -8,-17, -8,-10,-26,-27,-20,-17,-28,-20,-15, 74, 21,-19;
/M: SY='D'; M=-18, 40,-29, 57, 20,-37,-12, -2,-36, 3,-27,-26, 15,-10, 1, -5, -1,-10,-26,-37,-19, 10;
/I: I=-6; MI=0; MD=-33; IM=0; DM=-33;
/M: SY='N'; M= -7, 3,-26, -2, -9,-19, 10, -6,-17, -7,-18, -8, 11,-18, -7, -6, -2, -9,-17,-25,-14, -9;
/M: SY='W'; M=-10,-24,-29,-26,-22, 0, -9,-16, 3,-20, 3, 2,-19,-25,-17,-17,-17,-13, -2, 9, 8,-21;
/M: SY='V'; M= 0,-13,-16,-20,-17, -5,-21,-19, 10,-17, 6, 4, -9,-19,-14,-16, -1, 10, 12,-27, -9,-16;
/M: SY='C'; M=-10,-16, 93,-25,-25,-20,-27,-25,-28,-25,-20,-18,-15,-35,-21,-25, -8, -8,-12,-40,-25,-23;
/M: SY='W'; M=-20,-39,-48,-39,-30, 14,-21,-27,-18,-20,-18,-18,-38,-30,-20,-20,-38,-28,-28,139, 32,-20;
/M: SY='P'; M=-12, 0,-35, 9, 8,-31,-17,-11,-25, -1,-29,-20, -5, 48, -2, -9, -6,-10,-29,-31,-25, 0;
/M: SY='D'; M= -4, 2,-26, 5, 3,-22,-14, -6,-21, -1,-20,-15, 0, 4, 2, -1, 2, -2,-19,-26,-11, 0;
/M: SY='T'; M= 13, -4,-12,-11,-10,-16, -2,-19,-14,-11,-15,-12, -2,-12,-10,-14, 18, 24, -4,-28,-16,-10;
/M: SY='P'; M= 3, -8,-26, -8, -1,-25,-11,-11,-19, -1,-21,-13, -7, 18, -1, -5, -1, -3,-17,-25,-19, -3;
/M: SY='P'; M= 10,-16,-23,-17, -9,-16,-14,-19, -9, -8,-15,-10,-14, 14, -9,-12, -1, -4, -6,-19,-17,-10;
/M: SY='G'; M= -1, -2,-21, -6,-17,-28, 51,-15,-35,-17,-29,-20, 9,-21,-17,-17, 2,-16,-28,-25,-28,-17;
/I: I=-6; MD=-33;
/M: SY='E'; M= 2, -4,-19, -6, 7,-18,-16, -9,-12, 0,-10, -3, -5,-11, 6, -2, 4, 5, -8,-25,-13, 6; D=-6;
/I: I=-6; MI=-33; IM=-33; DM=-33;
/M: SY='L'; M= -6,-19,-19,-22,-16, 1,-24,-16, 6,-18, 11, 7,-18,-18,-15,-16, -9, 5, 6,-15, -2,-15;
/M: SY='V'; M= 12,-20,-11,-22,-20, -9,-17,-19, 10,-16, -2, 0,-18,-22,-19,-18, 2, 2, 26,-29,-13,-20;
/M: SY='T'; M= 0, -7,-18,-10, 0, -9,-18,-11, -7, -5, -7, -5, -5,-16, -6, -4, 0, 2, -1,-24, -9, -3;
/M: SY='M'; M= -1,-16,-21,-19, -9,-14,-22,-13, 3, -5, 1, 5,-15,-20, 3, 0, -9, -6, 5,-22, -9, -4;
/M: SY='P'; M= -5,-11,-29, -6, 2,-24,-15,-10,-19, -6,-24,-15, -9, 37, 0,-12, 2, -3,-22,-28,-18, -1;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P'; M=-11,-21,-39,-12, -2,-23,-21,-20,-19,-11,-27,-19,-20, 82,-12,-20,-11,-10,-28,-27,-26,-11;
/M: SY='D'; M=-11, 7,-30, 11, 9,-22,-16, -6,-25, 5,-20,-16, 0,-12, 0, -2, -8,-11,-22, -4, -8, 5;
/M: SY='Y'; M=-14,-19,-27,-20,-16, 16,-15, -1, -3,-15, -2, -1,-17,-20,-15,-14,-15,-11, -7, 4, 32,-18;
/M: SY='F'; M=-12,-23,-21,-28,-18, 29,-27,-18, 6,-22, 14, 5,-18,-24,-21,-16,-15, -5, 3,-10, 9,-18;
/M: SY='P'; M=-10, -7,-27, -7, -5,-10,-14, -2,-17, -2,-19,-12, -1, 3, -2, 1, -1, -4,-19,-17, 2, -6;
/I: I=-3; MD=-14;
/M: SY='W'; M=-10, -1,-25, 1, -8,-13, 3, -2,-17,-11,-13, -8, -2,-16, -8,-11,-10,-13,-17, 4, -4, -8; D=-3;
/I: I=-3; MD=-14;
/M: SY='F'; M=-10,-20,-15,-25,-20, 30,-19, -9, 3,-20, 6, 2,-14,-21,-22,-15,-13, -8, 3, -3, 14,-20; D=-3;
/I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='Y'; M= -6, -6,-15, -6, -5, -2,-11, 4, -6, -5, -6, -4, -5, -9, -3, -5, -2, 0, -7, -7, 11, -6; D=-3;
/I: I=-3; DM=-14;
/M: SY='B'; M= -6, 14,-16, 14, -1,-17, -9, -3,-11, -6,-16,-12, 13,-14, -5, -8, 6, 2, -7,-30,-13, -3; D=-3;
/I: I=-3; DM=-14;
/M: SY='H'; M= -5, -2,-22, -1, 0,-18,-16, 5,-14, -2,-13, -7, -3, 0, 1, -3, -3, -3,-12,-21, -5, -1; D=-3;
/I: I=-3; DM=-14;
/M: SY='S'; M= 0, 2,-19, -1, 2,-19, -7, -4,-17, 1,-16, -9, 3, -5, 1, -2, 4, 4,-14,-24,-13, 1; D=-3;
/I: I=-3; DM=-14;
/M: SY='G'; M= -6, -6,-29, -5, -5,-27, 33,-11,-33, -5,-25,-16, 2,-17, -4, 0, -2,-15,-27,-21,-21, -6;
/M: SY='N'; M= -7, 0,-20, -7, -9, -5,-17, -1, -8, -4, -9, -6, 8,-20, -8, -4, -3, -1, -8,-24, -3, -9;
/M: SY='V'; M= 13,-21,-14,-25,-20, -9,-16,-23, 12,-17, 4, 3,-19,-21,-17,-19, -4, -2, 21,-25,-12,-19;
/M: SY='T'; M= -6,-13,-18,-16,-13, 8,-18,-10, -6,-12, -6, -5, -8,-20,-11,-10, 3, 9, -3,-14, 9,-12;
/M: SY='R'; M=-17, -9,-30,-10, 0,-18,-20, -5,-28, 31,-22,-10, -2,-18, 7, 52,-12,-11,-20,-12, -7, 1;
/M: SY='H'; M=-10, 1,-25, -2, 1,-12,-18, 7,-14, 0,-13, -6, 5,-18, 5, 4, -4, -6,-15,-20, 1, 2;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='T'; M= -8, 5,-20, 4, -6,-14, -9,-12,-15,-10, -7,-10, 2,-17, -9, -8, 1, 11,-11,-27,-10, -8;
/I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E'; M= 2, 0,-23, 3, 19,-25,-13, -7,-19, 0,-19,-14, -1, 0, 11, -4, 8, -1,-18,-28,-18, 14; D=-6;
/I: I=-6; DM=-32;
/M: SY='D'; M=-12, 28,-23, 29, 12,-25,-11, 2,-25, -2,-22,-19, 22,-12, 1, -6, 5, 3,-23,-36,-16, 6;
/M: SY='G'; M= 2,-10,-29,-10,-19,-29, 64,-19,-38,-18,-29,-19, 0,-20,-18,-17, 0,-19,-28,-20,-29,-19;
/M: SY='W'; M=-10,-15,-30,-17,-10,-11,-16,-15,-15, -6,-15,-10,-13,-20, -1, -5,-10, -6,-15, 27, 1, -4;
/M: SY='W'; M=-10,-28,-38,-29,-22, 1,-15,-25,-19,-17,-21,-19,-26,-24,-15,-17,-18,-14,-23, 93, 15,-15;
/M: SY='E'; M= -3, -3,-23, -2, 9,-12,-12, -5,-16, -7, -9,-10, -3,-12, -2, -8, -3, -6,-14,-24,-10, 3;
/M: SY='P'; M= -6, -8,-24, -9, -6,-14,-15,-12,-13, -6,-11, -8, -5, 6, -7, -4, -2, 3,-13,-26,-14, -8;
/I: I=-4; MD=-22;
/M: SY='F'; M= -9, -6,-17, -7, 0, 4,-13, 2,-10, -3, -7, -3, -5,-12, -6, -2, -7, -8, -8,-11, 2, -2; D=-4;
/I: I=-4; MD=-22;
/M: SY='P'; M= -6, -8,-22, -3, 0,-17,-12, -7,-11, -4,-16,-10, -9, 38, -5, -9, -6, -6,-14,-18,-14, -5; D=-4;
/I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='W'; M=-12,-19,-27,-20,-15, 4, -7, -8,-13, -9,-11, -8,-17,-18,-10, -6,-18,-15,-16, 51, 15,-12; D=-4;
/I: I=-4; DM=-22;
/M: SY='P'; M= -4, -9,-24, -8, -3,-20,-17,-10,-15, -3,-18,-12, -7, 12, -5, 1, 1, 2,-11,-28,-16, -7;
/M: SY='N'; M=-15, 26,-26, 23, 1,-14,-11, 5,-20, -4,-22,-18, 27,-14, -4, -7, 0, -6,-24,-26, -3, -3;
/M: SY='Y'; M= -8,-15,-25,-16,-14, 9,-23, 7, -4,-14, -2, -2,-13,-14,-11,-13,-11, -6, -8, -3, 27,-15;
/M: SY='T'; M= 1, -4,-15, -6, -8,-10,-15,-17, -8,-13,-11,-10, -3,-15,-10,-13, 13, 18, 0,-25,-11, -9;
/M: SY='N'; M= 5, 4,-22, -1, 3,-21, -5, 1,-16, -5,-14, -8, 6,-15, 5, -8, 1, -7,-16,-25,-12, 3;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='E'; M= -7, -2,-24, -5, 1,-17, 1,-10,-19, -7,-15,-10, 1, -9, -2, -7, 1, 0,-17,-25,-15, 0;
/M: M= -4, -7,-21, -8, 0, -9,-17, -4,-10, -3,-10, -5, -5,-12, -4, -4, -1, -3, -7,-23, -4, -3;
/M: SY='N'; M=-12, 0,-26, -3, -6, -7,-18,-10, -8, -9,-13,-10, 6, -1, -9, -8, -4, -6,-13,-26,-10, -9;
/M: M=-11, -6,-27, -4, -4,-11,-17,-16, -8,-12, -2, -6,-12,-16,-10,-13,-11, -4, -8, -6, -6, -7;
/I: E1=0;
|
| Numerical results | |
|
|
| Comments | |
|
|
| Cross-references | |
| UniProtKB/Swiss-Prot | True positive hits:BAI1_HUMAN (O14514), BAI1_MOUSE (Q3UHD1), BAI2_HUMAN (O60241), BAI2_MOUSE (Q8CGM1), BAI2_PONAB (Q5R7Y0), BAI3_HUMAN (O60242), BAI3_MOUSE (Q80ZF8), CALCR_CAVPO (O08893), CALCR_HUMAN (P30988), CALCR_MOUSE (Q60755), CALCR_PIG (P25117), CALCR_RABIT (P79222), CALCR_RAT (P32214), CALRL_BOVIN (A6QP74), CALRL_DANRE (Q68EK2), CALRL_HUMAN (Q16602), CALRL_MOUSE (Q9R1W5), CALRL_ONCGO (Q8AXU4), CALRL_PAROL (Q9IB86), CALRL_PIG (Q8WN93), CALRL_RAT (Q63118), CALRL_XENLA (Q7ZXS8), CALRL_XENTR (Q0P4Y4), CELR1_HUMAN (Q9NYQ6), CELR1_MOUSE (O35161), CELR2_HUMAN (Q9HCU4), CELR2_MOUSE (Q9R0M0), CELR2_RAT (Q9QYP2), CELR3_HUMAN (Q9NYQ7), CELR3_MOUSE (Q91ZI0), CELR3_RAT (O88278), CRFR1_CHICK (Q90812), CRFR1_HUMAN (P34998), CRFR1_MACMU (Q76LL8), CRFR1_MOUSE (P35347), CRFR1_RAT (P35353), CRFR1_SHEEP (O62772), CRFR1_XENLA (O42602), CRFR2_HUMAN (Q13324), CRFR2_MOUSE (Q60748), CRFR2_RAT (P47866), CRFR2_XENLA (O42603), DIHR_ACHDO (Q16983), DIHR_MANSE (P35464), GHRHR_HUMAN (Q02643), GHRHR_MOUSE (P32082), GHRHR_PIG (P34999), GHRHR_RAT (Q02644), GIPR_HUMAN (P48546), GIPR_MESAU (P43218), GIPR_MOUSE (Q0P543), GIPR_RAT (P43219), GLP1R_HUMAN (P43220), GLP1R_MOUSE (O35659), GLP1R_RAT (P32301), GLP2R_HUMAN (O95838), GLP2R_MOUSE (Q5IXF8), GLP2R_RAT (Q9Z0W0), GLR_HUMAN (P47871), GLR_MOUSE (Q61606), GLR_RAT (P30082), GP113_HUMAN (Q8IZF5), GP113_MOUSE (Q58Y75), GP124_HUMAN (Q96PE1), GP124_MOUSE (Q91ZV8), GP125_HUMAN (Q8IWK6), GP125_MOUSE (Q7TT36), GP126_MOUSE (Q6F3F9), LPHN1_BOVIN (O97831), LPHN1_HUMAN (O94910), LPHN1_MOUSE (Q80TR1), LPHN1_RAT (O88917), LPHN2_BOVIN (O97817), LPHN2_HUMAN (O95490), LPHN2_RAT (O88923), LPHN3_BOVIN (O97827), LPHN3_HUMAN (Q9HAR2), LPHN3_MOUSE (Q80TS3), LPHN3_RAT (Q9Z173), LPLT1_CAEEL (G5EDW2), LPLT2_CAEEL (G5ECX0), PACR_BOVIN (Q29627), PACR_HUMAN (P41586), PACR_MOUSE (P70205), PACR_RAT (P32215), PDFR1_CAEEL (Q09460), PDFR_DROME (Q9W4Y2), PTH1R_BOVIN (Q1LZF7), PTH1R_CANFA (Q9TU31), PTH1R_DIDVI (P25107), PTH1R_HUMAN (Q03431), PTH1R_MOUSE (P41593), PTH1R_PIG (P50133), PTH1R_PONAB (Q5RAQ1), PTH1R_RAT (P25961), PTH2R_HUMAN (P49190), PTH2R_MOUSE (Q91V95), PTH2R_RAT (P70555), SCTR_HUMAN (P47872), SCTR_MOUSE (Q5FWI2), SCTR_RABIT (O46502), SCTR_RAT (P23811), STAN_DROME (Q9V5N8), VIPR1_HUMAN (P32241), VIPR1_MOUSE (P97751), VIPR1_PIG (Q28992), VIPR1_RAT (P30083), VIPR2_HUMAN (P41587), VIPR2_MOUSE (P41588), VIPR2_RAT (P35000), VIPR_CARAU (Q90308), VIPR_MELGA (Q91085), ZK643_CAEEL (P30650)False negative hits (sequences which belong to the set under consideration, but which have not been picked up by the pattern or profile): GCR1_ARATH (O04714), GP110_HUMAN (Q5T601), GP110_MOUSE (Q8VEC3), GP111_HUMAN (Q8IZF7), GP112_HUMAN (Q8IZF6), GP114_HUMAN (Q8IZF4), GP114_MOUSE (Q3V3Z3), GP115_HUMAN (Q8IZF3), GP115_MOUSE (Q9D2L6), GP116_HUMAN (Q8IZF2), GP116_RAT (Q9WVT0), GP126_DANRE (C6KFA3), GP126_HUMAN (Q86SQ4), GP133_BOVIN (A6QLU6), GP133_HUMAN (Q6QNK2), GP133_MOUSE (Q80T32), GP144_HUMAN (Q7Z7M1), GP157_HUMAN (Q5UAW9), GP157_MOUSE (Q8C206), GP157_RAT (Q5FVG1), GPR97_HUMAN (Q86Y34), GPR97_MOUSE (Q8R0T6), GPR98_DANRE (Q6JAN0), GPR98_HUMAN (Q8WXG9), GPR98_MOUSE (Q8VHN7), LPHN2_MOUSE (Q8JZZ7), LRLA_DICDI (Q54MC6)Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view]
[Clustal format, color]
[Clustal format, plain text]
[Fasta format]
|
| PDB [Detailed view] |
1U34; 2JNC; 2JND; 2JOD; 2L27; 2QKH; 2X57; 2XDG; 3AQF; 3C4M; 3C59; 3C5T; 3EHS; 3EHT; 3EHU; 3H3G; 3IOL; 3L2J; 3N7P; 3N7R; 3N7S; 3N93; 3N94; 3N95; 3N96; 4DLO; 4DLQ; 4ERS; |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)