Entry: PS50228

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] SUEL_LECTIN
Accession [info] PS50228
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2001 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50228
Associated ProRule [info] PRU00260

Name and characterization of the entry

Description [info] SUEL-type lectin domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=86;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=81;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7934; R2=.00744374; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1297.09843; R2=23.09843; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=900; N_SCORE=8.5; H_SCORE=19014; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=632; N_SCORE=6.5; H_SCORE=15895; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='A'; M= 14, -9,-18,-16,-11,-15,-14,-16, -1, -3, -8, -4, -4,-16, -9, -5, -1, -3,  4,-24,-14,-11;
/M: SY='C'; M=-14,-16, 33,-18,-15,-17,-25,  0,-25,-14,-20,-14,-13, -7,-13,-10,-11,-11,-18,-32,-10,-17;
/M: SY='D'; M=-11, 10,-26, 18, 16,-22,-10, -8,-21, -6, -8,-14,  0,-12, -1,-10, -4, -4,-18,-30,-16,  7;
/M: SY='H'; M=-14,  1,-30,  4, -3,-26,  7, 20,-34,  1,-24,-13,  5,-19,  0, 15, -6,-15,-27,-25,-10, -4;
/M: SY='P'; M= -7,  0,-30,  5, 17,-27,-14, -8,-23, -3,-27,-20,  2, 33,  2,-10,  3, -4,-27,-33,-24,  7;
/M: SY='K'; M=  1, -6,-22, -8,  0,-22,-15,-12,-19, 22,-21, -9, -3,-14,  1, 17,  0, -3, -8,-24,-13,  0;
/M: SY='V'; M= 13,-23,-16,-28,-20, -4,-21,-24, 16,-21, 15,  7,-22,-22,-19,-21,-10, -4, 19,-22, -9,-20;
/M: SY='H'; M= -8,  3,-22,  3, 14,-20,-18, 23,-23, -4,-18,-11,  4,-10,  6, -4,  7,  8,-19,-31, -5,  9;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,  9,-31,-21, 24,-30, 46, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 13,-20,  0,-21;
/M: SY='S'; M=  4,  0,-16,  0,  4,-24, -6, -8,-22,  5,-29,-16,  7,-10,  9,  1, 25, 10,-14,-34,-17,  6;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P'; M= -7,  6,-32, 12,  2,-30, -5,-11,-26, -7,-28,-22,  2, 34, -7,-15, -3, -9,-28,-32,-26, -5;
/M: SY='P'; M= -4, -4,-29, -5,  5,-23,-17,-11,-16,  6,-20,-12, -1, 13,  0,  3, -5, -8,-18,-26,-18,  0;
/M: SY='G'; M= -6,  7,-27,  8, -7,-28, 31,-10,-34, -7,-29,-20, 12,-17, -9, -4,  4,-11,-27,-28,-24, -8;
/I:         I=-8; MI=-8; IM=-8; DM=-15; MD=-15;
/M: SY='K'; M= -6, -9,-24, -8,  2,-20,-23,-16,-11, 12,-16, -7,-10, -2, -4,  2, -5,  0, -2,-26,-14, -2;
/M: SY='I'; M= -8,-23,-27,-29,-22, -9,-21,-21, 26,-21,  8, 15,-16,-20,-10,-21,-14,-10, 16,-21, -6,-19;
/M: SY='S'; M= -1,-14,-18,-19,-15, -2,-19,-19,  8,-19, -6, -3, -5,-16,-12,-18, 11,  9,  6,-27, -7,-15;
/M: SY='S'; M=  8, -5,-15, -7, -3,-19,-10,-15,-14,  3,-21,-12, -1,-12, -3, -3, 16, 11, -3,-31,-15, -3;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-23,-37,-30,  0,-37,-30, 43,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 37,-23, -3,-30;
/M: SY='K'; M= -8, -6,-24, -8,  0,-17,-22, -8,-15, 20,-17, -5, -6,-15,  6, 10, -5,  1, -8,-17,  1,  2;
/M: SY='F'; M=-16,-15,-22,-19,-19, 38,-26,-11, -4,-21,  6, -2,-14,-25,-24,-16,-14, -3, -4, -1, 23,-20;
/M: SY='A'; M= 38,-10,-15,-18,-12,-22, 17,-20,-17,-12,-15,-12, -8,-12,-12,-20,  8, -5, -7,-20,-22,-12;
/M: SY='S'; M= -3,  5,-18,  4, -4, -8,-10,-10,-12,-12,-19,-14, 10,-15, -7,-12, 15,  5,-10,-31,-11, -6;
/M: SY='Y'; M=-20,-25,-25,-30,-25, 54,-30,  1,  0,-20,  5,  0,-20,-30,-24,-15,-20,-10, -5, 20, 56,-25;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='R'; M=-10,  1,-22, -5,  0,-20,-18, -4,-20,  9,-18,-10,  7,-15, 10, 24,  5, 12,-16,-26,-11,  3;
/I:         I=-5; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15;
/M: SY='P'; M= -6,-10,-29, -4,  7,-26,-14,-12,-22, -3,-28,-19, -7, 38, -1, -4,  5, -2,-23,-32,-24,  0;
/M: SY='S'; M= -4,  2,-21,  0,  5,-22, -5, -9,-18,  0,-19,-12,  5,-13,  2, -4,  7,  5,-12,-29,-17,  4;
/M: SY='G'; M=  3, -6,-28, -6, -4,-30, 40,-14,-33,-11,-25,-16, -1,-15, -4,-14,  1,-15,-26,-21,-25, -4;
/M: SY='T'; M= -1,-13,-14,-16,-12,-10,-21,-18,  4,-13, -1,  0,-12,-19, -7,-12,  5, 14, 12,-29,-10,-10;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='G'; M= -4,-15,-31,-12,-15,-25, 36,-20,-28,-19,-20,-15, -8,  6,-18,-20, -6,-16,-25,-22,-26,-18;
/M: SY='S'; M= -1, -3,-24, -2, -1,-25,  0,-12,-24, -1,-30,-18,  4, 12, -3, -6, 13,  1,-21,-32,-22, -3;
/M: SY='F'; M=-18,-16,-23,-19,-16, 38,-26,-10, -5,-20,  5, -1,-14,-25,-18,-14,-16,-10, -7, -1, 20,-15;
/M: SY='A'; M=  5, -2,-19, -9, -4,-10,-12,-10,-17,  4,-17,-10,  3,-15, -1,  3,  4,  2,-12,-21,-10, -2;
/I:         I=-4; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15;
/M: SY='Q'; M= -4, 12,-23, 10, 10,-28,-10,  1,-23,  5,-23,-14, 15,-13, 16,  8,  6, -3,-23,-29,-16, 13;
/M: SY='G'; M= -3,-12,-29,-12,-14,-25, 31,-18,-25,-13,-24,-15, -3, -7,-13,-10,  0,-12,-20,-23,-24,-16;
/M: SY='N'; M= -3,  7,-17,  1, -2,-17, -9,  2,-16, -3,-18,-12, 16,-16, -1, -3, 13,  8,-14,-34,-12, -2;
/M: SY='C'; M= -8,-18,106,-27,-27,-20,-27,-28,-29,-28,-21,-20,-17,-37,-27,-28, -5, -7,-10,-49,-29,-27;
/M: SY='H'; M=-13,  6,-28,  6,  6,-25, -4, 22,-25, -1,-19, -5,  8,-16,  9,  4, -5,-13,-25,-27, -8,  6;
/M: SY='A'; M= 10, -6,-18,-11, -8,-19, -3,-13, -7,-11,-14, -7,  0,-16, -2,-13,  8, -1, -4,-27,-16, -5;
/M: SY='H'; M= -1, -4,-24, -5, -4,-22,  1, 32,-26,-12,-23,-10,  3, -7, -1,-10,  5, -8,-22,-29, -6, -5;
/M: SY='R'; M=-13,  8,-28,  3,  5,-25,-15, 20,-26, 18,-25, -9, 17,-16, 13, 21, -4, -9,-26,-27, -7,  7;
/I:         I=-4; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15;
/M: SY='T'; M= 14, -1,-11, -7, -1,-17, -9,-15,-15, -9,-18,-14,  1, -9, -4,-11, 23, 24, -6,-31,-16, -3;
/M: SY='Y'; M=-12,-15, -9,-16,-10, -8,-26,  4, -6, -8,  1,  2,-14,-24,  0, -7,-14,-10, -6,-18,  7, -6;
/M: SY='D'; M= -6, 17,-21, 19, 10,-27, -9, -4,-25,  3,-26,-18, 15,-11,  7, -2, 14,  6,-20,-35,-17,  9;
/M: SY='V'; M= -1,-22,-23,-27,-20, -8,-21,-21, 14,-13,  5,  6,-16,-21,-15, -6,-12, -7, 15,-22, -9,-20;
/M: SY='V'; M= -7,-29,-18,-33,-27, 12,-31,-24, 27,-24, 19, 18,-26,-27,-24,-21,-18, -6, 28,-20,  0,-26;
/M: SY='E'; M=  2,  2,-20,  1, 12,-24,-10, -6,-20,  7,-22,-10,  5, -9,  9,  1, 11,  1,-16,-30,-16, 11;
/M: SY='K'; M=-10,  6,-29,  6, 21,-31,-18, -2,-27, 30,-26,-11,  6, -9, 20, 18, -4, -9,-25,-24,-13, 20;
/M: SY='R'; M= -5, -4,-23, -6,  2,-15,-17, -9,-13,  6, -5, -5,  0,-17, -1,  7, -6, -5,-12,-25,-11,  0;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='B'; M= -9,  4,-21,  4, -4,-14,-20,-12,  0,-11, -3, -5,  2,-20,-11,-13, -6, -5,  3,-32,-13, -8;
/M: SY='G'; M= -4, -7,-28, -8,-10,-26, 30,-16,-33,  1,-26,-16,  0,-17, -9,  2, -1, -9,-23,-21,-21,-10;
/M: SY='R'; M=-14, -1,-29,  1,  7,-26,-20, -4,-26, 28,-19, -8,  0,-15, 13, 32, -9,-10,-20,-22,-10,  9;
/M: SY='R'; M= -8,  0,-22,  0, 12,-18,-16, -5,-20,  5,-15,-12,  3,-13,  5, 14,  5,  3,-16,-29,-14,  7;
/M: SY='K'; M= -7, -3,-24, -6,  0,-15,-14, -7,-18, 11,-21, -6,  2,-15,  6,  5,  1, -3,-16,-13, -7,  4;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='T'; M= -2, -2,-15, -8, -8,-10,-17,-12,-10, -3,-15, -9,  1,-15, -7, -5, 12, 21, -2,-26, -4, -8;
/M: SY='V'; M= -4,-29,-13,-31,-28,  9,-29,-25, 25,-21, 16, 15,-28,-29,-27,-19,-14, -3, 36,-24, -4,-27;
/M: SY='V'; M= -6, -9,-17,-14,-11,  1,-22,-15,  3,-13,  0, -1, -5,-22,-13,-12, -4,  5,  8,-25, -6,-11;
/M: SY='V'; M= 11,-26,-10,-28,-26, -4,-24,-28, 21,-18,  6,  6,-26,-26,-26,-20, -6,  0, 39,-28,-12,-26;
/M: SY='D'; M=  2,  9,-22, 14,  1,-28,  2,-12,-26, -8,-26,-21,  5,  1, -6,-14, 12,  2,-19,-33,-22, -3;
/M: SY='S'; M= -2,  6,-21,  8,  3,-25, -9,-10,-23, -2,-28,-20,  8,  9, -2, -7, 16,  8,-19,-35,-20, -1;
/M: SY='E'; M=-11, 15,-26, 15, 16,-27,-13,  8,-28, 13,-26,-16, 16,-12,  8, 10,  2, -6,-25,-31,-13, 11;
/M: SY='T'; M=  2,-11,-16,-18,-15, -9,-21,-19,  6, -8, -3,  3, -8,-17,-13,-12,  0, 12, 12,-27,-10,-15;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='G'; M= -3, -6,-29, -4, -1,-28, 33,-16,-33,-12,-26,-19, -2, -2,-10,-15,  1,-10,-27,-24,-26, -6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0;
/M: SY='D'; M= -7, 10,-22, 14,  6,-22,  8, -6,-23, -4,-20,-16,  7,  3, -3, -8,  0, -8,-21,-22,-17,  0; D=-6;
/I:         DM=-29;
/M: SY='D'; M=-15, 33,-27, 48, 17,-32,-11, -3,-31, -3,-22,-23, 12,-11,  0,-10,  2, -6,-24,-37,-18,  8;
/M: SY='P'; M=-12,-11,-38, -1,  2,-30,-19, -3,-23, -9,-29,-18,-12, 67, -7,-17, -9,-11,-30,-31,-23, -7;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P'; M=-10,-15,-36, -9, -1,-29,-11,-16,-25,  2,-29,-17,-13, 51, -6, -1, -9,-11,-27,-26,-25, -7;
/M: SY='G'; M= -4,  9,-24,  5,-10,-25, 29,-11,-30,-12,-26,-19, 16,-17,-12,-13,  6, -1,-24,-28,-23,-11;
/M: SY='T'; M=  7, -8,-10,-15,-13,-10,-18,-21, -3,-12, -8, -7, -7,-14,-13,-13, 14, 30, 10,-30,-12,-13;
/M: SY='M'; M= -1,-18,-21,-18,-12, -6,-18,-11,  0,-15,  0,  4,-16,  0,-10,-16, -5, -2, -2,-21, -3,-13;
/M: SY='K'; M=-11, -1,-30, -1,  9,-29,-20, -9,-30, 47,-29,-10,  0,-11, 10, 35,-10,-10,-20,-20,-10,  9;
/M: SY='Y'; M=-12,-11,-26,-11, -8,  3,-21,  6,-13,  6,-14, -7, -8,-21, -2,  6, -5, -4,-13,  1, 33, -8;
/M: SY='L'; M=-11,-27,-21,-27,-17,  6,-29,-17, 14,-22, 41, 16,-26,-29,-16, -9,-27,-10,  6,-20, -1,-17;
/M: SY='E'; M=  7, -6,-22, -8,  8,-10,-15, -4,-15, -4,-12, -9, -7,-12,  8, -8,  1, -5,-14,-14, -1,  8;
/M: SY='V'; M= -2,-28,-12,-30,-28,  0,-28,-23, 28,-18, 12, 21,-28,-28,-23,-18,-12, -2, 41,-28, -8,-26;
/M: SY='E'; M=  5,  2,-23,  3, 26,-27,-16, -6,-22,  8,-18,-13, -2, -6, 14, -1,  3, -1,-19,-25,-17, 20;
/M: SY='Y'; M=  4,-18,-21,-21,-18, 11,-21,  2,  0,-11, -2, -2,-18,-24,-12,-14, -9, -6,  0,  8, 39,-18;
/M: SY='N'; M= -7,  0,-26, -1, -5,-19,  0,-14, -6,-14,-13, -9,  2,-16,-10,-16, -1, -8, -6,-28,-16, -9;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='V'; M=  0,-14,-19,-16, -8,-11,-20,-19, 10,-16, -6, -2, -7,-15, -9,-17,  8,  4, 11,-31,-12,-10;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 66 in 59 different sequences
Number of true positive hits 66 in 59 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 2
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] SUEL-type lectin
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
59 sequences

BGA10_ORYSJ (Q67VU7), BGA11_ARATH (Q9SCV1), BGA11_ORYSJ (Q6ZJJ0), 
BGA12_ORYSJ (Q0IZZ8), BGA13_ARATH (Q9SCU9), BGA13_ORYSJ (Q7G3T8), 
BGA14_ARATH (Q9SCU8), BGA14_ORYSJ (Q7XFK2), BGA15_ARATH (Q9C6W4), 
BGA15_ORYSJ (Q0INM3), BGA16_ARATH (Q8GX69), BGAL1_ARATH (Q9SCW1), 
BGAL1_ORYSJ (Q8RUV9), BGAL2_ORYSJ (Q8W0A1), BGAL3_ARATH (Q9SCV9), 
BGAL3_ORYSJ (Q5N8X6), BGAL5_ORYSJ (Q10RB4), BGAL6_ORYSJ (Q10NX8), 
BGAL7_ARATH (Q9SCV5), BGAL7_ORYSJ (Q75HQ3), BGAL8_ARATH (Q9SCV4), 
BGAL9_ARATH (Q9SCV3), BGAL_ASPOF  (P45582), BGAL_BRAOL  (P49676), 
BGAL_SOLLC  (P48980), CSL1_ONCKE  (P86177), CSL2_ONCKE  (P86178), 
CSL3_ONCKE  (P86179), EVA1C_HUMAN (P58658), EVA1C_MOUSE (P58659), 
EVA1C_PANTR (Q68US5), EVA1_CAEEL  (Q9XU98), LEG_HELCR   (P22031), 
LPHN1_BOVIN (O97831), LPHN1_HUMAN (O94910), LPHN1_MOUSE (Q80TR1), 
LPHN1_RAT   (O88917), LPHN2_BOVIN (O97817), LPHN2_HUMAN (O95490), 
LPHN2_RAT   (O88923), LPHN3_BOVIN (O97827), LPHN3_HUMAN (Q9HAR2), 
LPHN3_MOUSE (Q80TS3), LPHN3_RAT   (Q9Z173), LPHN_DROAN  (B3MFV7), 
LPHN_DROER  (B3N8M1), LPHN_DROGR  (B4J780), LPHN_DROME  (A1Z7G7), 
LPHN_DROMO  (B4KMZ1), LPHN_DROPE  (B4GD14), LPHN_DROPS  (Q292N4), 
LPHN_DROSE  (B4HS00), LPHN_DROVI  (B4LNA8), LPHN_DROYA  (B4P3A0), 
LPLT1_CAEEL (G5EDW2), LPLT2_CAEEL (G5ECX0), PK1L2_HUMAN (Q7Z442), 
PK1L2_MOUSE (Q7TN88), SAL_SILAS   (Q9PVW8)
» More

PDB
[Detailed view]
7 PDB

2JX9; 2JXA; 2ZX0; 2ZX1; 2ZX2; 2ZX3; 2ZX4

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission