PROSITE entry PS50229
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | WH1 |
Accession [info] | PS50229 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-MAR-2005 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC50229 |
Associated ProRule [info] | PRU00410 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | WH1 domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=114; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=109; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4736438; R2=0.0174257; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7780.8222656; R2=5.0197740; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=387; H_SCORE=9723; N_SCORE=9.2; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=232; H_SCORE=8945; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='M'; M=-10,-19,-26,-21,-17, -8, -4, -5, -2,-15, 8, 10,-13,-23,-11, -6,-16,-13, -5,-21, -6,-15; /M: SY='P'; M= -7,-13,-30,-10, -2,-23, -2,-16,-17, -8,-21,-13, -8, 17, -7, -6, -2, -8,-18,-27,-21, -7; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='K'; M= -7, 6,-22, 7, 6,-25,-14, -6,-24, 17,-23,-12, 4,-10, 9, 13, 4, 3,-16,-25,-12, 7; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='A'; M= 15, 1,-20, 0, 3,-26, 2,-13,-24, 3,-22,-15, -1,-10, -2, -6, 6, -4,-15,-25,-19, 0; /M: SY='S'; M= -8, -3, 5, -3, -5,-22,-16, 0,-25, -8,-23,-16, 0, -9, -5, -3, 6, 3,-17,-36,-15, -7; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='D'; M=-11, 22,-21, 26, 12,-20,-10, 0,-19, -3,-12,-14, 16,-11, 0, -6, -2, -6,-19,-28,-13, 6; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='K'; M= -8, -5,-24, -3, 1,-19,-20,-11,-11, 9, -7, -3, -7,-17, 4, 3, -8, -6, -8,-25,-10, 2; /M: SY='I'; M= -4,-15,-23,-19,-14, -8,-23,-18, 9,-17, -6, -2, -9, -2,-11,-18, 3, 9, 3,-23, -3,-16; /M: SY='I'; M= -8,-24,-24,-30,-22, 3,-30,-17, 26,-23, 19, 17,-18,-22,-14,-21,-15, -6, 14,-18, 5,-21; /M: SY='A'; M= 10, -8,-15,-12,-12, 6,-12,-16, -9,-15,-10,-10, -7,-17,-16,-17, 6, 1, -1,-20, -6,-13; /M: SY='S'; M= 3, -7,-16,-10, -5,-17,-11,-11,-16, 2,-18,-12, -1,-15, -2, 13, 14, 9, -5,-29,-15, -5; /M: SY='A'; M= 14,-14,-14,-19,-16,-11, -5,-22, -3,-16, -1, -4,-13,-18,-16,-18, 2, 8, 7,-24,-15,-16; /M: SY='V'; M= -9,-24,-24,-25,-19, -6,-27,-21, 7, -3, -3, 1,-20,-24,-14, 4,-15, -8, 14, -2, -3,-18; /M: SY='A'; M= 26,-18, 8,-24,-19,-14,-13,-24, 0,-16, -5, -5,-18,-20,-19,-21, 1, -1, 14,-27,-18,-19; /M: SY='Q'; M=-10, -5,-26, -4, 10,-25,-22, 10,-15, 8,-15, -3, -4,-15, 20, 10, -5, -9,-13,-25, -7, 14; /M: SY='L'; M= -5,-30,-15,-30,-25, 5,-30,-25, 25,-25, 32, 15,-30,-30,-25,-20,-21, -5, 28,-25, -5,-25; /M: SY='Y'; M=-17,-24,-24,-28,-23, 35,-28, 0, 7,-18, 13, 14,-21,-28,-17,-14,-21,-10, -1, 8, 41,-21; /M: SY='M'; M= -4,-14,-20,-20,-13, 0,-23, -3, 1,-15, 1, 2,-11,-19, -7,-13, -5, 2, 2,-20, 0,-10; /M: SY='A'; M= 17,-14,-16,-19,-12,-15,-13,-17, -2, -6, -8, -5, -9,-16, -9, -3, 4, 0, 5,-24,-14,-12; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='D'; M=-10, 9,-19, 15, 0, -8,-13, 1,-14, -6, -9,-10, 1,-14, -4, -9, -2, -4,-12,-13, 8, -3; D=-5; /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='P'; M= -2, -1,-25, 6, 3,-23,-11,-11,-18, -6,-20,-16, -6, 37, -6,-13, -3, -6,-19,-23,-20, -4; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='D'; M= 2, 13,-18, 19, 5,-25, -5, -8,-22, -5,-23,-19, 6, 1, -2,-11, 13, 2,-16,-31,-18, 1; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='S'; M= -4, -4,-25, -3, 3,-24, 4,-12,-27, 1,-25,-17, 0, -1, -2, 0, 7, 1,-20,-28,-20, 0; /M: SY='N'; M= 5, 14,-21, 3, -5,-23, 11, -5,-23, 1,-26,-16, 25,-16, -5, -4, 5, -5,-22,-29,-21, -5; /M: SY='G'; M= -7, -6,-15, -5, 1,-28, 20,-13,-35, -1,-26,-18, -2,-17, -6, 0, -3,-15,-26,-25,-23, -3; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='H'; M=-11, -5,-24,-10,-10, -6,-14, 15,-13, -9,-12, -2, 0,-17, -3, -7, -9, -6,-16, 14, 7, -7; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='W'; M=-18,-27,-45,-29,-21, 1,-18,-21,-20,-15,-21,-18,-25,-27, -9,-15,-30,-25,-30,111, 20,-12; /M: SY='Y'; M=-11,-15,-24,-19,-11, 4,-25, -5, -1, -8, -1, 0,-11,-21, -2, -1, -7, -1, -5, -9, 15, -9; /M: SY='P'; M= -8, -9,-28,-10, 0,-24,-23,-13,-10, 4,-17, -6, -7, 11, 8, -3, -3, 3,-13,-24,-13, 2; /M: SY='A'; M= 1,-12,-25,-11, -3,-22, 0,-16,-15, -6,-13, -8,-11, -2, -4,-10, -5,-10,-11,-24,-18, -4; /I: I=-4; MD=-19; /M: SY='H'; M= -7, -3, -3, -6, -4,-10, -7, 2,-11,-11, -2, -4, 1,-17, -6, -9, -7, -8,-11,-22, -9, -6; D=-4; /I: I=-4; MD=-19; /M: SY='G'; M= 0, -7, 13, -9,-13,-18, 17,-15,-23,-15,-20,-15, -2,-17,-13,-15, 6, -5,-14,-25,-20,-13; D=-4; /I: I=-4; MD=-19; /M: SY='G'; M= 0, -7,-22, -7,-15,-22, 52,-15,-30,-15,-22,-15, 0,-15,-15,-15, 0,-15,-22,-15,-22,-15; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='G'; M= -5, 5,-15, 6, -3,-15, 7, 7,-18, -6,-14, -9, 4, -9, -4, -6, 1, -1,-14,-17, -7, -4; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='A'; M= 10,-12,-10,-16,-10, -3,-11,-13, 7,-12, 10, 4,-11,-11, -9,-13, -6, -3, 5,-12, -5,-10; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='A'; M= 13,-14,-16,-17,-12,-15,-14,-20, -5, -9,-11, -8,-12, -3,-12, -9, 5, 6, 5,-27,-17,-13; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='V'; M= 8,-25,-15,-29,-23, -3,-24,-25, 21,-21, 15, 9,-24,-24,-22,-21,-11, -3, 27,-24, -9,-23; /M: SY='C'; M= 3,-13, 12,-19,-17,-12,-11,-22, -9,-19, -6, -8,-11,-22,-17,-18, 4, 9, 1,-32,-17,-17; /M: SY='F'; M=-12,-27, -1,-31,-26, 23,-30,-18, 8,-25, 18, 6,-25,-31,-27,-20,-20, -8, 10,-12, 12,-26; /M: SY='V'; M= -4,-23, -3,-26,-22, 6,-25,-23, 11,-23, 6, 2,-18,-25,-22,-20, -5, -1, 17,-26, -6,-22; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='K'; M=-13, 0,-30, 3, 7,-18,-13, 1,-23, 14,-20,-10, -3,-15, 9, 6, -8,-11,-22,-11, 8, 6; /M: SY='D'; M=-17, 43,-29, 56, 14,-36, -1, -1,-37, -2,-30,-28, 24,-12, -2,-10, 1,-10,-30,-38,-21, 6; /M: SY='S'; M= 6, 7,-14, -1, -5,-16, -5, -8,-13, -9,-17,-13, 17,-15, -5, -9, 18, 12,-11,-34,-17, -5; /M: SY='P'; M= -3,-12,-24,-12,-11,-19, -4,-21,-15,-13,-18,-13,-10, 19,-14,-16, 3, 12,-10,-28,-20,-14; /M: SY='E'; M= -3, -3,-28, -1, 15,-29, 0, -4,-28, 6,-21,-13, -1,-12, 14, 11, -1,-11,-24,-23,-18, 13; /M: SY='R'; M=-10, 4, -4, -3, -3,-21,-15, -6,-25, 12,-24,-15, 12,-19, 0, 17, 2, 1,-18,-31,-16, -3; /M: SY='S'; M= -4,-13, -4,-15,-11, -9,-14,-14, -5,-15,-10, -7,-10,-20,-12,-16, 2, 2, 0,-24, -3,-13; /M: SY='F'; M=-19,-24, -9,-30,-25, 46,-30, -3, -3,-21, 2, -2,-20,-31,-25,-16,-19,-10, -6, 13, 46,-25; /M: SY='F'; M=-18,-22,-27,-25,-16, 19,-25, 0,-10,-10, 2, -1,-15,-26,-14, 7,-20,-14,-11, 7, 12,-15; /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-37,-28, 11,-36,-27, 36,-29, 24, 17,-23,-24,-23,-26,-21, -9, 24,-18, 2,-28; /M: SY='R'; M=-13,-10,-27,-14, -7,-16,-25, 6, -6, 5,-10, 0, -3,-17, -1, 11, -9, -4, -6,-23, -2, -7; /M: SY='L'; M= 4,-20,-19,-22,-18, -8, -4,-21, 4,-22, 8, 2,-15,-22,-17,-20, -6, -5, 6,-24,-12,-18; /I: I=-6; MD=-29; /M: SY='Y'; M= -8,-12,-17,-11, -3, 9,-20, -4, 1, -8, -1, -2,-13,-16, -9, -9, -9, -5, 3, -4, 15, -6; D=-6; /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='D'; M=-11, 18,-21, 22, 4,-22, 0, -1,-25, 4,-20,-16, 14,-11, 0, 8, -1, -7,-20,-24,-14, 1; D=-6; /I: I=-6; DM=-29; /M: SY='I'; M= -6,-22,-22,-27,-18, -4,-27,-18, 22,-20, 14, 17,-17,-21, -8,-18,-11, -5, 15,-24, -5,-15; /I: I=-6; MD=-29; /M: SY='E'; M= -7, 0,-21, -1, 6,-20, -3, -5,-16, 5,-16, -8, 3,-12, 6, 6, -2, -7,-13,-21,-13, 6; D=-6; /I: I=-6; MD=-29; /M: SY='P'; M= -4, 1,-17, 0, 1,-16, 1, -4,-14, 3,-16, -8, 4, 6, 3, -1, -1, -5,-15,-15,-11, 1; D=-6; /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='D'; M= -3, 13,-22, 16, -2,-25, 0, 2,-22, -9,-22,-16, 10,-16, -6,-11, 5, -5,-14,-33,-16, -5; /M: SY='A'; M= 8, 1,-22, 1, -2,-26, 7,-12,-27, 5,-24,-16, 1,-13, -4, 1, 4, -6,-17,-25,-19, -3; /M: SY='K'; M= -9, 1,-27, 3, -1,-25, 0,-12,-27, 13,-20,-12, 0,-15, -3, 9, -5, -6,-19,-24,-15, -2; /M: SY='I'; M= 1,-26,-21,-28,-21, -5,-27,-25, 21,-22, 12, 8,-24, -9,-20,-22,-14, -6, 20,-24,-10,-23; /M: SY='I'; M= -9,-19,-23,-20,-20, -2,-31,-23, 24,-24, 21, 11,-20,-24,-19,-22,-19, -8, 19,-25, -5,-21; /M: SY='W'; M=-17,-25,-39,-24,-22, 2,-23,-24, -6,-21, -3, -8,-28,-26,-17,-20,-30,-21,-14, 71, 14,-17; /M: SY='E'; M=-11, 17,-26, 24, 32,-27,-16, -3,-23, 3,-20,-18, 8, -9, 7, -5, 0, -7,-20,-33,-19, 19; /M: SY='Q'; M= -9, -8, 0, -8, 3,-30,-19, -6,-23, 0,-23,-10, -5, -3, 19, 3, 1, -6,-22,-30,-18, 9; /M: SY='E'; M= -7, -5,-21, -3, 15,-11,-23, -9,-10, -5, -4, -7, -9,-12, -1, -8, -1, 7, -7,-23, -4, 6; /M: SY='L'; M= -5,-30,-15,-30,-25, 5,-30,-25, 25,-25, 30, 15,-30,-30,-25,-20,-20, -5, 30,-25, -5,-25; /M: SY='Y'; M=-15,-10,-27,-11, -4, -3,-24, 8,-12, 3,-10, -3, -8,-20, 12, 11, -8, -2,-16, -1, 27, 1; /M: SY='P'; M= -9, -9,-26,-10, -4,-10,-18,-11,-14, -1,-18,-10, -4, 9, -3, 0, -3, -5,-14,-23,-12, -4; /M: SY='B'; M=-12, 33,-26, 31, 6,-30, 4, 3,-29, -2,-29,-21, 33,-16, 3, -5, 4, -7,-30,-36,-20, 4; /M: SY='F'; M=-12,-24,-19,-31,-22, 29,-26,-15, 9,-23, 21, 19,-20,-25,-21,-16,-18, -2, 5,-11, 9,-20; /M: SY='V'; M= -7,-10,-18, -8, -7,-10,-24,-17, 1, -8, 1, -1,-13,-21,-12, -4, -7, 2, 12,-28,-11,-10; /M: SY='Y'; M=-17,-24,-29,-28,-24, 29,-33, 1, 13,-18, 7, 5,-20,-27,-17,-17,-20,-10, 2, 14, 52,-24; /M: SY='N'; M= -8, 2,-22, -4, -7,-14, -4, -4,-21, 1,-20,-13, 11,-18, -3, 11, 6, 7,-17,-23, -6, -7; /M: SY='Q'; M= -8, 7,-26, 9, 12,-32,-17, -3,-25, 18,-25,-10, 4,-10, 23, 10, 3, -1,-22,-26,-12, 17; /M: SY='P'; M= 3, 2,-23, 5, -1,-24,-14,-15,-17, -1,-19,-14, -5, 8, -7,-10, 1, 1,-10,-29,-18, -5; /M: SY='R'; M= -6, 1,-20, -3, -1,-19,-13, -7,-23, 12,-23,-14, 8,-14, 3, 22, 11, 10,-14,-29,-14, -1; /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='P'; M= 1, -7,-26, -6, 5,-26, -8,-13,-20, -6,-20,-14, -7, 19, 2,-11, 3, 3,-19,-26,-20, 2; /M: SY='F'; M=-14,-15, -4,-22,-16, 17,-25,-13,-14, -5, -8, -7,-11,-23,-17, 0, -8, 1, -8,-11, 9,-16; /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29, 70,-30,-20, 3,-30, 15, 3,-21,-30,-37,-20,-21,-10, 1, 6, 26,-29; /M: SY='H'; M=-13, -9,-26, -9, -9,-15,-11, 51,-17,-15, -8, 1, -2,-23, -3, -8,-11,-16,-14,-27, 7, -9; /M: SY='H'; M= -7, -7,-19,-10, -7,-10,-20, 12,-10, -9,-11, -4, -4,-17, 1, -7, 5, 11, -5,-22, 6, -4; /M: SY='W'; M=-20,-35,-34,-40,-30, 48,-25,-25, -9,-25, -4, -9,-29,-30,-31,-20,-29,-19,-14, 73, 30,-25; /M: SY='E'; M= 9, -1,-23, 0, 20,-26,-13, -9,-23, 14,-19,-14, -3, -7, 7, 7, 0, -7,-17,-24,-17, 13; /M: M= -2, -1,-23, 0,-10,-18, -1,-15, -8,-14, -4, -2, -6,-18,-12,-17, -7,-10, -4,-26,-15,-12; /M: SY='D'; M=-10, 19,-29, 31, 21,-33, -5, -6,-32, -2,-28,-24, 7, 4, 2,-10, 4, -7,-27,-34,-22, 10; /M: SY='D'; M= -9, 10,-23, 11, 8,-22,-13, -4,-21, 7,-19, -8, 8,-13, 4, 7, 3, 1,-17,-30,-14, 5; /M: SY='C'; M= -3,-12, 37,-19,-14,-20,-21,-19,-25, -3,-18,-14,-10,-25,-12, 3, -3, -1,-11,-34,-20,-14; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='Y'; M=-10,-13,-23,-16, -8, -1,-25, -8, -5, 0, -3, 0,-12,-20, 1, -2, -9, -1, -3,-13, 8, -4; /M: SY='F'; M= 5,-24,-22,-30,-22, 14,-21,-18, 4,-19, 0, -2,-20,-22,-20,-20,-12, -8, 4, 13, 13,-21; /M: SY='G'; M= 5,-10,-28,-11,-19,-29, 63,-20,-37,-19,-28,-19, -1,-19,-19,-20, 1,-18,-27,-20,-29,-19; /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21, 18,-30,-20, 18,-30, 45, 18,-29,-30,-22,-20,-29,-10, 9,-17, 3,-21; /M: SY='N'; M= -5, 14,-18, 3, -7,-16, 2, -5,-17, -9,-18,-14, 26,-18, -7, -8, 10, 8,-18,-33,-17, -7; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='A'; M= 17,-10,-17,-16, -8,-14,-14,-10, -6, -7, -8, -5,-10,-15, 1,-12, 3, 3, -2,-16, -2, -4; /M: SY='D'; M= -4, 25,-19, 28, 7,-27, -3, -2,-27, -5,-30,-23, 24,-12, 0, -8, 20, 6,-21,-40,-20, 3; /M: SY='P'; M= -7, -5,-30, 1, 23,-26,-19,-11,-17, -3,-20,-16, -7, 25, 4,-11, 0, -6,-21,-30,-21, 11; /M: SY='Q'; M= 2, 4,-23, 1, 5,-23,-16, -9,-12, 2,-15, -9, 4,-11, 6, -4, 1, 0,-12,-26,-14, 5; /M: SY='D'; M=-16, 26,-30, 39, 35,-33,-16, 13,-34, 3,-24,-22, 10, -7, 10, -4, -1,-11,-30,-34,-15, 22; /M: SY='A'; M= 34,-14, 6,-23,-14,-16, -8,-21, -9,-15, -3, -7,-14,-17,-14,-21, 2, -3, 0,-24,-19,-14; /M: SY='R'; M= -9, -1,-25, 0, 13,-27,-18, -4,-24, 18,-22,-10, 1,-11, 18, 20, 3, 1,-20,-25,-12, 15; /M: SY='Q'; M= 6, 3,-23, -3, 5,-27,-12, 7,-20, 9,-21, -8, 6,-12, 16, 3, 1, -7,-19,-24,-11, 10; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='R'; M=-10, 0,-26, 2, -2,-15,-18, 11,-21, 3,-11, -8, -2,-19, 0, 15, -9,-10,-16,-20, 2, -4; /M: SY='K'; M= -6, 5,-27, 4, 18,-26,-15, -4,-27, 23,-24,-14, 7,-11, 9, 21, -3, -8,-22,-25,-15, 13; /M: SY='K'; M= 0, -9, -5,-12, -8,-22, 0,-15,-24, 2,-18,-12, -5,-19, -7, 2, -1, -7,-14,-27,-18, -8; /M: SY='V'; M= -5,-29, 4,-32,-30, 8,-31,-29, 20,-24, 7, 6,-26,-30,-30,-22,-12, -4, 34,-26, -6,-30; /M: SY='Q'; M= -8, -8, -4,-10, -1,-22,-20, -6,-18, -1,-12, -6, -5,-18, 14, 8, 1, 0,-15,-28,-13, 6; /M: SY='E'; M=-13, 9,-31, 17, 21,-31,-18, -6,-31, 21,-27,-18, 2, 4, 8, 12, -6,-10,-26,-28,-17, 13; /M: SY='R'; M= 3,-11,-20,-13, -6,-16,-16,-13,-12, 9,-10, -6, -8,-17, -3, 13, -2, -3, -3,-24,-12, -6; /M: SY='I'; M=-10,-16,-28,-19, -6, -5,-18,-15, 2, -9, 0, 2,-11,-18, -4,-10,-13,-11, -4,-17, -4, -6; /M: SY='E'; M= -9, -1,-10, 0, 16,-26,-12, -8,-27, 7,-21,-14, -2,-12, 8, 5, -1, -3,-21,-28,-17, 11; /M: SY='R'; M=-10, 0,-26, 1, -3, -7,-18, 7,-22, 5,-16,-10, -1,-18, -3, 11, -8,-10,-17,-16, 5, -4; /M: SY='A'; M= 7,-12,-19,-14, -6,-15,-12,-13,-12, -6, -8, -8, -8, -4, -5, 0, 4, 0, -8,-26,-15, -7; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 45 in 45 different sequences |
Number of true positive hits | 45 in 45 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 12 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 78.95 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | PS_Langendijk_Genevaux |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | WH1 |
Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
45 sequences
ENAH_HUMAN (Q8N8S7), ENAH_MOUSE (Q03173), ENA_DROME (Q8T4F7), EVL_HUMAN (Q9UI08), EVL_MOUSE (P70429), EVL_PONAB (Q5R896), EVL_RAT (O08719), EVL_XENLA (Q64GL0), HOME1_BOVIN (Q2KJ56), HOME1_HUMAN (Q86YM7), HOME1_MOUSE (Q9Z2Y3), HOME1_RAT (Q9Z214), HOME2_HUMAN (Q9NSB8), HOME2_MOUSE (Q9QWW1), HOME2_RAT (O88801), HOME3_HUMAN (Q9NSC5), HOME3_MOUSE (Q99JP6), HOME3_RAT (Q9Z2X5), LAS17_YEAST (Q12446), RANG_DICDI (Q54KD9), SIF1_DROME (P91621), SPRE1_HUMAN (Q7Z699), SPRE1_MOUSE (Q924S8), SPRE1_XENTR (Q66JG9), SPRE2_DANRE (Q6NYK3), SPRE2_HUMAN (Q7Z698), SPRE2_MOUSE (Q924S7), SPRE2_PONAB (Q5RDN2), SPRE2_RAT (Q3C2P8), SPRE2_XENTR (Q5Y171), SPRE3_HUMAN (Q2MJR0), SPRE3_MOUSE (Q6P6N5), VASP_BOVIN (Q2TA49), VASP_CANLF (P50551), VASP_DICDI (Q5TJ65), VASP_HUMAN (P50552), VASP_MOUSE (P70460), WASL_BOVIN (Q95107), WASL_HUMAN (O00401), WASL_MOUSE (Q91YD9), WASL_RAT(O08816), WASP_HUMAN (P42768), WASP_MOUSE (P70315), WSP1_SCHPO (O36027), YKC2_CAEEL (P41993)» more
|
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
12 sequences
P4R3A_HUMAN (Q6IN85), P4R3A_MOUSE (Q6P2K6), P4R3A_XENLA (Q7ZX60), P4R3B_HUMAN (Q5MIZ7), P4R3B_MOUSE (Q922R5), P4R3B_XENLA (Q801Q7), PP4R3_DANRE (Q5SP90), PP4R3_DROME (Q9VFS5), PP4R3_TETNG (Q4S6U8), PP4R3_XENLA (Q6INN7), PP4R3_XENTR (Q6DFT3), SMEK_DICDI (Q54I18)» more |
PDB [Detailed view] |
46 PDB
1DDV; 1DDW; 1EGX; 1EVH; 1I2H; 1I7A; 1MKE; 1QC6; 1TJ6; 1XOD; 2IFS; 2IYB; 2JP2; 2P8V; 2XQN; 3SYX; 4MY6; 4WSF; 5N91; 5N9C; 5N9P; 5NAJ; 5NBF; 5NBX; 5NC2; 5NC7; 5NCF; 5NCG; 5NCP; 5ND0; 5NDU; 5NEG; 5ZZ9; 6R8I; 6RCF; 6RCJ; 6RD2; 6UHC; 6V65; 6V6F; 6XVT; 6XXR; 7A5M; 7AKI; 7LXE; 9C66 » more |