Entry: PS50231

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] RICIN_B_LECTIN
Accession [info] PS50231
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2001 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); SEP-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50231
Associated ProRule [info] PRU00174

Name and characterization of the entry

Description [info] Lectin domain of ricin B chain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=129;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=124;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.6; R2=0.0255; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5638.97753; R2=21.74157; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=309; N_SCORE=8.5; H_SCORE=11531; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=231; N_SCORE=6.5; H_SCORE=10661; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='R'; M= -6, -8,-21, -9, -8,-17, -8,-11,-15, -3,-15, -9, -4,-13, -7,  2, -3, -3, -9,-20,-12, -9;
/M: SY='E'; M= -2, -2,-24,  1,  8,-23,-11, -2,-20, -3,-20,-13, -2,  0,  4, -4,  6,  0,-17,-28,-13,  5;
/M: SY='P'; M= -5,-13,-27,-12,-13,-12,  1,-15,-12,-15,-16,-11, -9,  4,-16,-17, -5, -8,-11,-20,-10,-16;
/M: SY='F'; M= -8, -7,-22,-11,-10,  5,-21, -9, -5,-13, -3, -5, -6,-17,-11,-12, -6,  1, -6,-13,  5,-11;
/M: SY='I'; M= -7,-27,-19,-31,-25,  7,-32,-25, 26,-23, 20, 12,-24,-26,-23,-18,-16, -3, 26,-22, -2,-25;
/M: SY='R'; M= -9, -6,-25,-10, -1,-20,-20, -6,-17, 11,-15, -5, -3,-13, 11, 20, -2,  4,-14,-20, -7,  3;
/M: SY='I'; M= -6, -8,-20,-15,-14,  1,-17,-14,  3,-17,  0, -2,  1,-20,-13,-14, -1,  3,  0,-25, -6,-14;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='N'; M= -1, -2,-15, -6, -8,-12, -5, -3, -6, -7,-10, -5,  4,-16, -6, -6,  4,  0, -3,-25,-10, -7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='G'; M= -2, -9,-24, -9, -6,-22, 14,-15,-20, -6,-18,-12, -4,-13, -9, -6,  0, -8,-13,-25,-20, -8; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='N'; M= -7,  0,-25, -3, -7, -5, -9, -2,-16, -7,-12,-10,  3,-17, -8, -3, -6, -8,-15,-15,  1, -9;
/M: SY='S'; M= -5,  8,-20,  6,  0,-21, -5, -2,-20, -4,-21,-14, 10,-14,  1, -4, 11,  7,-16,-31,-13,  0;
/M: SY='G'; M= -7, 12,-27, 11,  2,-29, 20, -6,-31, -5,-28,-20, 16,-12, -2, -8,  3, -9,-28,-29,-23,  0;
/M: SY='M'; M= -9,-12,-23,-14, -4,-10,-22, -9, -4,  2,  4,  7, -9,-19,  0,  7,-12, -5, -5,-22, -7, -3;
/M: SY='C'; M= -8,-19, 98,-28,-28,-15,-28,-27,-24,-28,-17,-17,-18,-38,-28,-28, -9, -9, -7,-44,-24,-28;
/M: SY='L'; M= -7,-29,-19,-32,-24,  6,-30,-21, 26,-25, 31, 22,-27,-27,-20,-20,-22, -8, 22,-22, -2,-23;
/M: SY='D'; M=-13, 26,-27, 36, 17,-34,-12, -1,-31,  2,-25,-20, 11,-10, 11, -2,  3, -3,-25,-33,-17, 14;
/M: SY='V'; M= 11,-16,-11,-20,-16,-10,-19,-21,  5,-12, -3, -2,-15,-17,-16,-16,  0,  4, 15,-25,-11,-17;
/M: SY='N'; M= -8,  0,-25, -3, -7,-12,-11, -8,-13, -7,-12, -9,  3, -7, -7, -6, -4, -4,-15,-20, -8, -8;
/M: SY='G'; M=  1,  6,-23,  7, -2,-25, 11,-10,-27, -6,-27,-19,  8,-10, -6,-10, 10, -2,-21,-27,-20, -4;
/M: SY='G'; M=  0,  5,-24,  3,  2,-26,  9, -6,-25, -5,-24,-16,  9, -9,  0, -7,  7, -5,-22,-29,-20,  1;
/M: SY='N'; M= -5,  3,-23,  1, -3,-14, -4, -4,-19, -5,-19,-13,  7,-17, -4, -6,  4, -3,-16,-21, -7, -4;
/I:         I=-5; MD=-24;
/M: SY='N'; M= -5,  5,-20,  3,  3,-14, -6, -4,-17, -2,-15,-11,  7,-11,  2, -3,  1, -2,-16,-17, -9,  2; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-24;
/M: SY='G'; M= -3,  3,-16,  3, -1,-11,  4, -5,-16, -5,-14,-11,  4, -8, -5, -7,  2, -2,-13,-17,-10, -3; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-24;
/M: SY='D'; M= -7, 12,-12, 16,  4,-18, -1, -3,-17, -2,-15,-12,  7, -5,  0, -5,  1, -4,-15,-20,-12,  2; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-24;
/M: SY='G'; M=  1, -7,-15, -8, -8,-13, 11,-12,-13, -5,-12, -8, -4, -5, -8, -7, -1, -4, -8, -9,-11, -8; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24;
/M: SY='V'; M= -5,-29,-18,-29,-24,  3,-30,-24, 24,-24, 25, 13,-28,-23,-23,-21,-19, -6, 26,-23, -4,-24;
/M: SY='Q'; M= -5,-11,-26,-14, -5,-16,-14,-11, -8, -7,-12, -4, -8,-17,  7, -7, -2, -3, -9, -5, -5,  1;
/M: SY='L'; M= -2,-21,-20,-26,-17, -1,-23,-15, 13,-20, 21, 13,-19,-22,-13,-17,-15, -5,  8,-21, -4,-16;
/M: SY='W'; M= -7,-12,-29,-14, -5, -4,-16, -8,-13, -7,-12, -9,-11,-19, -2, -8,-10, -9,-16, 18,  9, -3;
/M: SY='D'; M= -5, 12,-23, 15,  3,-25,-10, -9,-22, -4,-23,-18,  8,  0, -3, -8,  8,  5,-17,-33,-17, -1;
/M: SY='C'; M= -8,-17, 94,-27,-26,-17,-27,-25,-26,-25,-18,-17,-16,-36,-26,-26, -8, -8,-10,-44,-24,-26;
/M: SY='N'; M= -9,  9,-24,  7,  2,-20, -6, 12,-24,  0,-22,-13, 13,-16,  1,  0,  3, -4,-21,-28, -9,  0;
/M: SY='G'; M= -1, -2,-24, -2, -4,-23, 16,-13,-25,-10,-22,-16,  3,-10, -6,-12,  6, -3,-20,-27,-21, -5;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='B'; M= -2,  3,-13,  2,  0,-10, -5, -4,-10, -4, -9, -6,  3, -6,  0, -6,  2,  1,-10,-16, -7,  0; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-29;
/M: SY='G'; M= -2,  3,-24,  3,  1,-24,  8, -9,-26, -2,-24,-15,  6,-12,  0, -5,  6, -3,-21,-27,-18,  0;
/M: SY='B'; M= -3,  3,-22,  2,  3,-21, -5, -9,-21,  0,-18,-13,  3,-13, -3,  0,  1, -4,-17,-23,-16,  0;
/M: SY='N'; M= -1, 20,-20,  9,  2,-19, -5,  3,-19, -1,-23,-16, 30,-16,  1, -1,  9, -1,-22,-33,-16,  2;
/M: SY='Q'; M= -9, -2,-28, -3, 14,-33,-19,  7,-17,  7,-17,  3, -2,-11, 49,  8,  0, -8,-25,-20, -9, 32;
/M: SY='Q'; M= -6, -9,-24, -9,  2,-16,-21, -8, -8,  4, -5, -1, -9,-16,  8,  3, -7, -7, -8,-21, -6,  5;
/M: SY='W'; M=-19,-36,-40,-39,-30, 29,-23,-27,-14,-23,-11,-14,-34,-30,-25,-20,-33,-23,-20,105, 28,-23;
/M: SY='T'; M=  1, -2,-20, -7, -1,-19,-15,-12,-11,  0,-13, -8,  1,-12,  1, -2,  5,  9, -8,-26,-13, -1;
/M: SY='F'; M=-13,-28,-26,-31,-23, 22,-29,-15,  9,-23, 19,  6,-26,-26,-21,-18,-24,-11,  2, 12, 21,-22;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='T'; M= -9, -8,-18, -9, -8, -8,-22, -9, -4, -5, -5, -3, -8,-18, -8, -3, -4,  3,  0,-21,  0,-10; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='S'; M=  0,  5,-21,  5,  4,-25, -3, -9,-24,  1,-24,-16,  6, -8,  2, -3, 10,  5,-18,-30,-18,  3;
/M: SY='D'; M=-10, 22,-26, 26, 13,-28,-13, -2,-27,  7,-23,-18, 13,-12,  5,  0,  1, -4,-23,-31,-15,  9;
/M: SY='G'; M= -5, -1,-27, -2, -6,-24, 22, -1,-31, -5,-26,-15,  7,-16, -5, -3,  1,-12,-25,-24,-16, -6;
/M: SY='A'; M=  6, -3,-13, -7,  2,-20,-11,-10,-18, -1,-16,-12, -1,-13,  0,  1,  6,  6,-11,-27,-16,  1;
/M: SY='I'; M=-12,-27,-26,-31,-25, 11,-34,-13, 28,-22, 17, 14,-23,-26,-18,-21,-20, -9, 17, -6, 23,-25;
/M: SY='R'; M=-14,-12,-26,-13, -2, -8,-23, -7,-15, 13,-10, -3, -7,-19,  5, 26,-10, -8,-10,-18, -5,  0;
/M: SY='S'; M= -4,-12,-16,-16,-14, -4,-19,-10,  2,-16, -7, -3, -4,-15,-12,-15,  3,  2,  3,-26, -7,-14;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='N'; M= -2,  1,-10, -4, -4,-10, -9, -3, -7, -2, -8, -5,  6,-12, -2,  1,  2,  0, -5,-20, -8, -4; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-25;
/M: SY='I'; M= -1,-10,-16,-12, -6,-10,-16,-12,  4, -6, -2,  1, -7,-13, -2, -7, -2, -2,  4,-20, -8, -5; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-25;
/M: SY='B'; M= -1,  1,-18,  0, -2,-12, -6, -4,-12, -4, -9, -7,  1,-14, -3, -5, -1, -4,-11,-18, -5, -3; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-25;
/M: SY='S'; M= -3,  0,-21, -2, -4,-16, -6,-10,-17, -6,-16,-10,  3, -9, -5, -4,  7,  5,-13,-29,-15, -5;
/M: SY='N'; M= -7, 13,-25, 12,  1,-27, 12, -3,-29, -4,-26,-18, 16,-15, -2, -7,  6, -4,-25,-31,-19, -1;
/M: SY='R'; M= -9,-11,-21,-13, -5,-11,-16,-12,-10,  2,  1, -1, -8,-20, -3,  3,-12, -6,-10,-21, -7, -5;
/M: SY='C'; M= -8,-19, 90,-27,-26,-17,-27,-26,-23,-26,-16,-16,-18,-36,-26,-25, -7, -7, -6,-45,-24,-26;
/M: SY='L'; M= -8,-29,-19,-30,-21,  9,-29,-19, 20,-27, 40, 20,-28,-29,-20,-20,-26, -9, 14,-19,  1,-21;
/M: SY='T'; M= -4,  6,-20,  5, -4,-18, -4,-10,-20, -8,-17,-14,  4,-14, -7, -7,  8, 12,-12,-29,-14, -6;
/M: SY='A'; M=  6,-16,-19,-20,-16, -8,-13,-19, -1,-16, -3, -4,-14,-20,-14,-17, -4, -1,  4, -6, -7,-15;
/M: SY='N'; M= -5,  7,-24,  6, -1,-20, -2, -6,-19, -5,-21,-15,  9, -9, -5, -7,  3, -4,-17,-27,-12, -4;
/M: SY='G'; M= -3, -4,-25, -5, -6,-16,  6, -9,-21, -8,-21,-13,  2,-16, -5, -8,  2, -7,-17,-15,-12, -6;
/M: SY='N'; M= -5,  0,-21, -5, -7,-10,-12,  0,-12, -8,-11, -8,  6,-17, -5, -7,  2,  0,-12,-23, -5, -6;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='N'; M=  0,  0,-19, -3, -3,-16, -2, -8,-14, -5,-15,-10,  4,-14, -5, -7,  4, -1,-11,-22,-12, -4; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='T'; M= -3, -1,-19, -3, -4,-17, -7,-10,-14, -4,-16,-11,  2,  0, -3, -5,  5,  6,-12,-21,-14, -4; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='N'; M= -2, -1,-18, -4, -3,-12,  1, -7,-13, -6,-12, -9,  2,-10, -6, -7,  0,  0,-12,-13, -8, -5; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='S'; M=  0,  3,-14,  2, -1,-13, -2, -6,-12, -6,-14,-10,  5, -6, -1, -7,  8,  4, -9,-20,-10, -2; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='G'; M= -2, -5,-15, -5, -5, -9,  2, -7,-10, -6, -9, -7, -2, -4, -5, -6,  1, -1, -9,-14, -7, -5; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='V'; M= -3,-24,-19,-26,-23,  0,-26,-24, 22,-20, 13, 10,-22,-25,-22,-19,-14, -6, 25,-24, -6,-23;
/M: SY='R'; M= -7,-10,-22,-13, -5,-16,-17,-11, -7,  1, -8,  2, -7,-16,  2,  5, -3,  2, -4,-22, -9, -2;
/M: SY='I'; M= -9,-23,-23,-29,-20,  0,-28,-17, 24,-22, 22, 20,-19,-23,-15,-18,-19, -7, 15,-22, -2,-19;
/M: SY='Y'; M=-12,-13,-26,-13, -5,  1,-20, -1, -6, -7, -1,  2,-13,-21,  0, -7,-12, -9,-10, -6, 15, -3;
/M: SY='S'; M=  1,  2,-22,  0,  4,-23, -8, -7,-21,  4,-23,-14,  6, -5,  3,  1,  7,  1,-17,-27,-15,  3;
/M: SY='C'; M= -7,-16, 85,-24,-24,-18,-26,-26,-26,-25,-18,-18,-15,-34,-24,-24, -6, -6,-10,-40,-25,-24;
/M: SY='D'; M= -7, 13,-23, 16,  3,-24, -9, -6,-21, -5,-22,-17,  9, -7, -2, -8,  6,  2,-17,-30,-16,  0;
/M: SY='S'; M=  0,  0,-21, -1, -4,-21,  5, -8,-21, -7,-21,-14,  4,-13, -3, -9,  9,  2,-16,-26,-13, -4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M:         M= -2, -2,-16, -2, -5,-12, -4, -9, -8, -5,-10, -7, -1, -8, -7, -6,  0, -1, -4,-19,-10, -7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='N'; M= -3,  0,-23, -3, -5,-16, -7, -5,-18, -7,-19,-14,  5, -6, -6, -9,  5,  2,-17,-18, -9, -6;
/M: SY='D'; M= -6,  2,-25,  4,  0,-19, -9, -8,-16, -6,-13,-11,  0,-12, -4, -5, -4, -8,-13,-24,-13, -3;
/M: SY='N'; M=  8,  6,-19,  0, -2,-18, -1, -8,-18, -6,-20,-15, 11,-14, -5, -9,  9,  0,-15,-24,-14, -4;
/M: SY='Q'; M=-10, -4,-27, -6, 10,-28,-22,  6,-12,  2,-11,  2, -4,-13, 38,  2, -2, -5,-19,-21, -7, 24;
/M: SY='R'; M=-14,-12,-28,-13, -4, -8,-24, -1,-12, 13, -9,  0, -8,-19,  3, 20,-13, -9,-11,-11,  9, -3;
/M: SY='W'; M=-20,-38,-46,-39,-29, 16,-21,-27,-18,-19,-17,-18,-37,-30,-21,-18,-37,-27,-27,131, 30,-20;
/M: SY='E'; M= -7, -8,-21, -9,  2, -9,-22, -6, -6, -4, -3, -1, -7,-16, -2, -3, -4,  1, -4,-23, -4, -1;
/M: SY='F'; M=-11,-28,-20,-33,-25, 16,-30,-22, 14,-24, 14,  6,-24,-25,-22,-19,-21,-10, 10,  2,  8,-24;
/M: SY='N'; M=-11,  4,-26, -1,  0,-16,-17, -7,-11,  2,-15, -8,  8,-13,  1,  0, -5, -6,-14,-21,-10,  0;
/M: SY='P'; M= -6,  0,-26,  0,  2,-21,-11, -9,-16, -1,-20,-13,  2,  3, -2, -6,  1, -3,-17,-27,-13, -2;
/M: SY='D'; M=-11, 27,-24, 32,  5,-27, -7, -3,-23, -5,-20,-17, 17,-15, -2, -9,  0, -6,-18,-35,-17,  1;
/M: SY='G'; M=  1, -5,-24, -6,-10,-24, 31,-15,-28,-11,-25,-16,  1,-16,-10,-12,  7, -4,-20,-24,-21,-10;
/M: SY='B'; M= -7, 10,-20,  7, -4,-14,-12, -8,-14, -7,-11,-12, 10,-17, -7, -6,  4,  7,-12,-29,-10, -6;
/M: SY='I'; M= -4,-15,-24,-20,-14, -8,-19,-20, 10,-14,  3,  3,-10,-18,-13,-14, -9, -3,  7,-23, -8,-15;
/M: SY='Y'; M= -4,-19,-18,-22,-18,  2,-18,-15,  2,-16,  3,  0,-16,-23,-16,-14, -8, -3,  4,-11,  5,-18;
/M: SY='N'; M= -6,  5,-21, -2, -4,-10, -9,  2,-14, -6,-16,-11, 14,-19, -3, -2,  3, -2,-15,-25, -5, -4;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24;
/M: SY='H'; M= -5, -2,-14, -5, -5, -5, -8,  3, -4, -4, -4, -2,  3, -9, -4, -4, -4, -4, -6,-12,  1, -5; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-24;
/M: SY='P'; M= -8,-14,-25,-12, -7,-13,-21,-12, -6, -6, -8, -4,-12,  8, -8, -6, -8, -5, -6,-25,-11, -9; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-24;
/M: SY='N'; M= -8, 10,-24,  7, -1,-17, -3,  5,-23, -1,-21,-14, 13,-17, -1, -1,  1, -7,-22,-25, -7, -1;
/M: SY='S'; M=  3, -2,-17, -4, -2,-17,-10,-13,-16, -8,-20,-15,  2,  4, -5,-10, 17, 16,-11,-32,-17, -5;
/M: SY='G'; M= -5,  8,-24,  5, -3,-25, 16, -2,-30, -2,-27,-18, 14,-16, -5, -3,  6, -5,-24,-29,-19, -5;
/M: SY='L'; M=-10,-15,-24,-15, -7, -6,-23, -9, -1, -4, 14,  8,-16,-22, -5, -3,-19,-10, -4,-18,  1, -7;
/M: SY='C'; M= -4,-25, 25,-30,-27, -4,-29,-26,  8,-22,  4,  2,-24,-31,-26,-20,-12, -5, 20,-32,-12,-27;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-22, 11,-29,-18, 20,-26, 36, 23,-28,-28,-19,-19,-26,-10, 12,-14,  2,-20;
/M: SY='D'; M= -8, 21,-22, 26, 11,-28,-11, -4,-27, -1,-23,-19, 12,-10,  3, -6,  8,  7,-20,-34,-16,  7;
/M: SY='V'; M= 10,-19,-17,-22,-17, -7,-17,-19,  5,-13,  0,  0,-17,-21,-14,-15, -4, -2, 12,-15, -5,-16;
/M: SY='K'; M= -2, -4,-25, -6, -4,-15, -9, -8,-18,  4,-18,-11,  0, -5, -4,  1, -2, -5,-15,-20, -7, -5;
/M: SY='G'; M= -4,  5,-26,  5, -2,-27,  9, -5,-24, -5,-23,-14,  8,-15,  2, -4,  3, -7,-21,-27,-18, -1;
/M: SY='G'; M=  2, -3,-22, -4, -5,-20, 10,-10,-25, -9,-22,-16,  2,-11, -5, -8,  8,  0,-18,-22,-17, -5;
/M: SY='B'; M= -2,  8,-24,  8,  6,-26, -7, -3,-23, -2,-21,-15,  8, -3,  4, -4,  4, -3,-21,-30,-17,  4;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='T'; M= -5, -4,-21, -4,  2,-16,-16, -9,-11, -5,-12, -8, -4, -2, -2, -7,  2,  5, -8,-27,-12, -1; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='S'; M=  1, -2,-19, -5, -6,-15,  1, -8,-16, -6,-16,-11,  2, -9, -4, -7,  5,  0,-13,-21,-11, -5; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='N'; M= -5,  5,-18,  1, -6,-14,  0, -8,-13, -8, -8, -8,  8,-16, -7, -5, -1,  0,-12,-24,-13, -7; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M:         M= -6, -4,-14, -4, -4,-15,  0,-10,-14, -1,-12, -8, -2, -9, -4,  0, -3, -4,-10,-19,-12, -5; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='E'; M= -5, -3,-21, -1,  5,-18, -8, -2,-17,  5,-16, -9, -2,  4,  4,  1, -3, -5,-16,-14,-10,  3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='I'; M= -8,-29,-23,-33,-26,  2,-34,-26, 35,-27, 25, 17,-24,-22,-21,-24,-20, -8, 26,-21, -3,-26; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='I'; M= -5,-13,-22,-17, -9,-11,-20,-10,  4,-11, -3,  4, -8,-17,  2,-10, -2, -1,  0,-22, -5, -5;
/M: SY='L'; M= -3,-24,-18,-26,-20, -1,-25,-22, 16,-22, 21, 12,-22,-21,-17,-19,-14, -1, 16,-24, -6,-19;
/M: SY='Y'; M=-13,-12,-28,-12, -7, -1,-18, -4,-14, -5,-11, -8,-10,-21, -3, -1,-10, -9,-14,  7, 10, -5;
/M: SY='E'; M= -7,  4,-24,  6,  8,-24,-13, -5,-22,  0,-23,-15,  3,  1,  4, -4,  6,  5,-19,-26,-15,  5;
/M: SY='C'; M= -9, -2, 19, -6, -9,-14,-14,-12,-21,-14,-18,-15, -1,-19,-12,-16, -4, -6,-15,-30,-12,-11;
/M: SY='N'; M= -6, 12,-21,  8, -1,-19, -7,  7,-19, -7,-21,-14, 16,-15, -2, -6,  9,  3,-16,-32,-10, -3;
/M: SY='G'; M= -2, -7,-26, -9, -9,-20, 15, -7,-20,-10,-19,-11,  0,-12, -7,-12, -1,-10,-19,-22,-13, -9;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='B'; M=  6,  7,-20,  5, -2,-21, -1, -7,-19, -3,-17,-13,  7,-14, -2, -7,  5, -2,-15,-25,-14, -2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M:         M= -2, -5,-22, -6, -6,-11,-16,-15, -8, -9, -7, -7, -6, -4,-10,-11, -3, -1, -6,-26,-12, -9;
/M: SY='N'; M= -6, 18,-20, 10, -1,-20, -4, -2,-21, -2,-24,-17, 27,-17, -1, -1, 10,  4,-21,-28,-16, -1;
/M: SY='Q'; M= -8,  1,-28,  0, 18,-38,-15,  7,-21,  8,-21, -3,  2,-10, 51,  7,  2, -9,-29,-22,-12, 34;
/M: SY='Q'; M=-11,-11,-28,-13, -3,-15,-12, -8,-11,  3,-10, -1, -7,-17,  8,  8, -8, -9,-12,-17, -6,  1;
/M: SY='W'; M=-20,-39,-48,-40,-30, 14,-21,-29,-19,-21,-18,-19,-39,-30,-21,-20,-39,-29,-28,142, 30,-21;
/M: SY='L'; M=-10,-11,-24,-14, -8, -4,-25,-13,  0, -4,  1,  0, -9,-18, -7, -5,-10, -1, -2,-15,  1, -8;
/M: SY='L'; M= -6,-22,-21,-26,-19,  6,-23,-18,  7,-20,  9,  3,-19,-15,-19,-16,-12, -2,  7,-15, -2,-20;
/M: SY='T'; M= -7, -6,-22, -7, -2,-13,-14,-10,-10, -6, -7, -5, -5,-16, -2, -3,  0,  3, -9,-20, -7, -3;
/I:         E1=0;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_10 which contains 546'790 sequence entries.


Total number of hits 185 in 159 different sequences
Number of true positive hits 172 in 146 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits 13 in 13 different sequences
Number of false negative sequences 2
Number of 'partial' sequences 2
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 92.97 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 98.85 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 3
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Ricin B-type lectin
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
146 sequences

ABRA_ABRPR  (P11140), ABRB_ABRPR  (Q06077), ABRC_ABRPR  (P28590), 
ABRD_ABRPR  (Q06076), AGALA_ASPCL (A1CBW8), AGALA_ASPFN (B8MWJ5), 
AGALA_ASPFU (Q4WVZ3), AGALA_ASPNC (A2QL72), AGALA_ASPNG (P28351), 
AGALA_ASPOR (Q2UT06), AGALA_ASPTN (Q0CPK2), AGALA_NEOFI (A1DDD8), 
AGB34_AGAAL (A8W969), AGGL_ABRPR  (Q9M6E9), AGGL_RICCO  (P06750), 
AHV_ACTSK   (Q9KWN0), AIM1L_HUMAN (Q8N1P7), AIM1_HUMAN  (Q9Y4K1), 
CDTA_AGGAC  (O87120), CDTA_CAMJE  (Q0PC56), CDTA_CAMJJ  (A1VXG4), 
CDTA_ECOLX  (Q46668), CDTA_HAEDU  (O06522), CDTA_HELHP  (Q9RFY6), 
CDTC_ECOLX  (Q46670), CRBG3_HUMAN (Q68DQ2), CRBG3_MOUSE (Q80W49), 
CUPA_DICDI  (Q55FW5), CUPB_DICDI  (Q7Z203), CUPC_DICDI  (Q7Z202), 
CUPD_DICDI  (Q54BF5), CUPE_DICDI  (Q7Z200), CUPF_DICDI  (Q7Z1I0), 
CUPG_DICDI  (Q7Z1Z9), CUPH_DICDI  (Q54FW5), CUPI_DICDI  (Q75JP7), 
CUPJ_DICDI  (Q54Z20), E13B_ARTSW  (Q59146), E13B_CELCE  (P22222), 
EABF_STRCO  (O54161), EABF_STRLI  (P96463), FLVS_ELIME  (Q47899), 
GALT1_BOVIN (Q07537), GALT1_DROME (Q6WV20), GALT1_HUMAN (Q10472), 
GALT1_MOUSE (O08912), GALT1_PIG   (Q29121), GALT1_RAT   (Q10473), 
GALT2_DROME (Q6WV19), GALT2_HUMAN (Q10471), GALT2_MOUSE (Q6PB93), 
GALT3_CAEEL (P34678), GALT3_DROME (Q9Y117), GALT3_HUMAN (Q14435), 
GALT3_MOUSE (P70419), GALT4_CAEEL (Q8I136), GALT4_DROME (Q8IA42), 
GALT4_HUMAN (Q8N4A0), GALT4_MOUSE (O08832), GALT5_CAEEL (Q95ZJ1), 
GALT5_DROME (Q6WV17), GALT5_HUMAN (Q7Z7M9), GALT5_MOUSE (Q8C102), 
GALT5_RAT   (O88422), GALT6_BOVIN (Q5EA41), GALT6_CAEEL (O61394), 
GALT6_DROME (Q6WV16), GALT6_HUMAN (Q8NCL4), GALT6_MOUSE (Q8C7U7), 
GALT7_CAEEL (O61397), GALT7_DROME (Q8MV48), GALT7_HUMAN (Q86SF2), 
GALT7_MOUSE (Q80VA0), GALT7_PONAB (Q5RFJ6), GALT7_RAT   (Q9R0C5), 
GALT8_DROME (Q9VUT6), GALT8_HUMAN (Q9NY28), GALT9_CAEEL (Q9U2C4), 
GALT9_DROME (Q8MRC9), GALT9_HUMAN (Q9HCQ5), GALT9_MACFA (Q9GM01), 
GLT10_CAEBR (A8Y236), GLT10_CAEEL (O45947), GLT10_DROME (Q8IA43), 
GLT10_HUMAN (Q86SR1), GLT10_MOUSE (Q6P9S7), GLT10_RAT   (Q925R7), 
GLT11_CAEEL (Q7K755), GLT11_DROME (Q8IA41), GLT11_HUMAN (Q8NCW6), 
GLT11_MOUSE (Q921L8), GLT11_RAT   (Q6P6V1), GLT11_XENTR (Q6DJR8), 
GLT12_DROME (Q8IA44), GLT12_HUMAN (Q8IXK2), GLT12_MOUSE (Q8BGT9), 
GLT13_DROME (Q8MYY6), GLT13_HUMAN (Q8IUC8), GLT13_MOUSE (Q8CF93), 
GLT13_RAT   (Q6UE39), GLT14_HUMAN (Q96FL9), GLT14_MOUSE (Q8BVG5), 
GLT15_HUMAN (Q8N3T1), GLT15_MOUSE (Q9D2N8), GLT16_HUMAN (Q8N428), 
GLT16_MOUSE (Q9JJ61), GLT18_HUMAN (Q6P9A2), GLT18_MOUSE (Q8K1B9), 
GLT35_DROME (Q8MVS5), GLTL3_HUMAN (Q6IS24), GLTL3_MOUSE (Q7TT15), 
GLTL6_HUMAN (Q49A17), HA33_CLOBO  (P46084), HLY1_AERHH  (P55870), 
HLY4_AERSA  (Q08677), HLYA_VIBCH  (P09545), LY75_HUMAN  (O60449), 
LY75_MESAU  (Q920P9), LY75_MOUSE  (Q60767), ML1_VISAL   (P81446), 
ML2_VISAL   (Q6H266), ML3_VISAL   (P82683), ML4_VISAL   (Q6ITZ3), 
MRC1_HUMAN  (P22897), MRC1_MOUSE  (Q61830), MRC2_HUMAN  (Q9UBG0), 
MRC2_MOUSE  (Q64449), MRC2_RAT    (Q4TU93), NIGB_SAMNI  (P33183), 
PLA2R_BOVIN (P49259), PLA2R_HUMAN (Q13018), PLA2R_MOUSE (Q62028), 
PLA2R_PONAB (Q5R880), PLA2R_RABIT (P49260), PRSN_PIEBR  (Q9GV36), 
PRSN_PIERA  (Q9U8Q4), RICI_RICCO  (P02879), RIP1_SAMNI  (P93543), 
SP1_RARFA   (Q05308), TCT2_PHYPO  (O61064), VVHA_VIBVU  (P19247), 
XYNA_STRLI  (P26514), Y1419_MYCTO (P9WLX8), Y1419_MYCTU (P9WLX9), 
Y1454_MYCBO (P64850), YL288_MIMIV (Q5UPX2)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
2 sequences

AGGL_SCLS1  (A7EWX9), AGGL_SCLSC  (A7XUK7)

		
UniProtKB/Swiss-Prot
'Partial' sequences
2 sequences

AGI_EUPCH   (P33888), AGI_EUPMA   (P33889)

		
UniProtKB/Swiss-Prot
False positive sequences
13 sequences

DCA10_MOUSE (A2AKB9), DCDC5_HUMAN (Q6ZRR9), ENVE_SALTY  (Q56030), 
MB212_DANRE (Q8UUZ1), MB212_HUMAN (Q9Y586), MB212_MOUSE (Q8BPP1), 
PRP19_BOVIN (Q08E38), PRP19_CHICK (Q5ZMA2), PRP19_HUMAN (Q9UMS4), 
PRP19_MOUSE (Q99KP6), PRP19_RAT   (Q9JMJ4), RS17_BUCBP  (Q89A75), 
TCPR1_MOUSE (Q80VP0)
» More

PDB
[Detailed view]
65 PDB

1ABR; 1CE7; 1DQG; 1DQO; 1FWU; 1FWV; 1KNL; 1KNM; 1M2T; 1MC9; 1ONK; 1OQL; 1PC8; 1PUM; 1PUU; 1QXM; 1RZO; 1SR4; 1SZ6; 1TFM; 1XEZ; 1XHB; 1YF8; 2AAI; 2D7I; 2D7R; 2E4M; 2F2F; 2FFU; 2FFV; 2MLL; 2Q3N; 2R9K; 2RG9; 2ZR1; 3A07; 3AH1; 3AH2; 3AH4; 3AJ5; 3AJ6; 3C9Z; 3CA0; 3CA1; 3CA3; 3CA4; 3CA5; 3CA6; 3CAH; 3D7W; 3O5W; 3RTI; 3RTJ; 4D0T; 4D0Z; 4D11; 4DEN; 4EB2; 4END; 4G1R; 4G1S; 4JKX; 4OWJ; 4OWK; 4OWL
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission