PROSITE entry PS50231
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | RICIN_B_LECTIN |
| Accession [info] | PS50231 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2001 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50231 |
| Associated ProRule [info] | PRU00174 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Lectin domain of ricin B chain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=129; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=124; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.6000000; R2=0.0255000; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6188.0952148; R2=4.7309322; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=310; H_SCORE=7655; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=232; H_SCORE=7286; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='R'; M= -6, -8,-21, -9, -8,-17, -8,-11,-15, -3,-15, -9, -4,-13, -7, 2, -3, -3, -9,-20,-12, -9; /M: SY='E'; M= -2, -2,-24, 1, 8,-23,-11, -2,-20, -3,-20,-13, -2, 0, 4, -4, 6, 0,-17,-28,-13, 5; /M: SY='P'; M= -5,-13,-27,-12,-13,-12, 1,-15,-12,-15,-16,-11, -9, 4,-16,-17, -5, -8,-11,-20,-10,-16; /M: SY='F'; M= -8, -7,-22,-11,-10, 5,-21, -9, -5,-13, -3, -5, -6,-17,-11,-12, -6, 1, -6,-13, 5,-11; /M: SY='I'; M= -7,-27,-19,-31,-25, 7,-32,-25, 26,-23, 20, 12,-24,-26,-23,-18,-16, -3, 26,-22, -2,-25; /M: SY='R'; M= -9, -6,-25,-10, -1,-20,-20, -6,-17, 11,-15, -5, -3,-13, 11, 20, -2, 4,-14,-20, -7, 3; /M: SY='I'; M= -6, -8,-20,-15,-14, 1,-17,-14, 3,-17, 0, -2, 1,-20,-13,-14, -1, 3, 0,-25, -6,-14; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='N'; M= -1, -2,-15, -6, -8,-12, -5, -3, -6, -7,-10, -5, 4,-16, -6, -6, 4, 0, -3,-25,-10, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-23; /M: SY='G'; M= -2, -9,-24, -9, -6,-22, 14,-15,-20, -6,-18,-12, -4,-13, -9, -6, 0, -8,-13,-25,-20, -8; D=-4; /I: I=-4; DM=-23; /M: SY='N'; M= -7, 0,-25, -3, -7, -5, -9, -2,-16, -7,-12,-10, 3,-17, -8, -3, -6, -8,-15,-15, 1, -9; /M: SY='S'; M= -5, 8,-20, 6, 0,-21, -5, -2,-20, -4,-21,-14, 10,-14, 1, -4, 11, 7,-16,-31,-13, 0; /M: SY='G'; M= -7, 12,-27, 11, 2,-29, 20, -6,-31, -5,-28,-20, 16,-12, -2, -8, 3, -9,-28,-29,-23, 0; /M: SY='M'; M= -9,-12,-23,-14, -4,-10,-22, -9, -4, 2, 4, 7, -9,-19, 0, 7,-12, -5, -5,-22, -7, -3; /M: SY='C'; M= -8,-19, 98,-28,-28,-15,-28,-27,-24,-28,-17,-17,-18,-38,-28,-28, -9, -9, -7,-44,-24,-28; /M: SY='L'; M= -7,-29,-19,-32,-24, 6,-30,-21, 26,-25, 31, 22,-27,-27,-20,-20,-22, -8, 22,-22, -2,-23; /M: SY='D'; M=-13, 26,-27, 36, 17,-34,-12, -1,-31, 2,-25,-20, 11,-10, 11, -2, 3, -3,-25,-33,-17, 14; /M: SY='V'; M= 11,-16,-11,-20,-16,-10,-19,-21, 5,-12, -3, -2,-15,-17,-16,-16, 0, 4, 15,-25,-11,-17; /M: SY='N'; M= -8, 0,-25, -3, -7,-12,-11, -8,-13, -7,-12, -9, 3, -7, -7, -6, -4, -4,-15,-20, -8, -8; /M: SY='G'; M= 1, 6,-23, 7, -2,-25, 11,-10,-27, -6,-27,-19, 8,-10, -6,-10, 10, -2,-21,-27,-20, -4; /M: SY='G'; M= 0, 5,-24, 3, 2,-26, 9, -6,-25, -5,-24,-16, 9, -9, 0, -7, 7, -5,-22,-29,-20, 1; /M: SY='N'; M= -5, 3,-23, 1, -3,-14, -4, -4,-19, -5,-19,-13, 7,-17, -4, -6, 4, -3,-16,-21, -7, -4; /I: I=-5; MD=-24; /M: SY='N'; M= -5, 5,-20, 3, 3,-14, -6, -4,-17, -2,-15,-11, 7,-11, 2, -3, 1, -2,-16,-17, -9, 2; D=-5; /I: I=-5; MD=-24; /M: SY='G'; M= -3, 3,-16, 3, -1,-11, 4, -5,-16, -5,-14,-11, 4, -8, -5, -7, 2, -2,-13,-17,-10, -3; D=-5; /I: I=-5; MD=-24; /M: SY='D'; M= -7, 12,-12, 16, 4,-18, -1, -3,-17, -2,-15,-12, 7, -5, 0, -5, 1, -4,-15,-20,-12, 2; D=-5; /I: I=-5; MD=-24; /M: SY='G'; M= 1, -7,-15, -8, -8,-13, 11,-12,-13, -5,-12, -8, -4, -5, -8, -7, -1, -4, -8, -9,-11, -8; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24; /M: SY='V'; M= -5,-29,-18,-29,-24, 3,-30,-24, 24,-24, 25, 13,-28,-23,-23,-21,-19, -6, 26,-23, -4,-24; /M: SY='Q'; M= -5,-11,-26,-14, -5,-16,-14,-11, -8, -7,-12, -4, -8,-17, 7, -7, -2, -3, -9, -5, -5, 1; /M: SY='L'; M= -2,-21,-20,-26,-17, -1,-23,-15, 13,-20, 21, 13,-19,-22,-13,-17,-15, -5, 8,-21, -4,-16; /M: SY='W'; M= -7,-12,-29,-14, -5, -4,-16, -8,-13, -7,-12, -9,-11,-19, -2, -8,-10, -9,-16, 18, 9, -3; /M: SY='D'; M= -5, 12,-23, 15, 3,-25,-10, -9,-22, -4,-23,-18, 8, 0, -3, -8, 8, 5,-17,-33,-17, -1; /M: SY='C'; M= -8,-17, 94,-27,-26,-17,-27,-25,-26,-25,-18,-17,-16,-36,-26,-26, -8, -8,-10,-44,-24,-26; /M: SY='N'; M= -9, 9,-24, 7, 2,-20, -6, 12,-24, 0,-22,-13, 13,-16, 1, 0, 3, -4,-21,-28, -9, 0; /M: SY='G'; M= -1, -2,-24, -2, -4,-23, 16,-13,-25,-10,-22,-16, 3,-10, -6,-12, 6, -3,-20,-27,-21, -5; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='B'; M= -2, 3,-13, 2, 0,-10, -5, -4,-10, -4, -9, -6, 3, -6, 0, -6, 2, 1,-10,-16, -7, 0; D=-6; /I: I=-6; DM=-29; /M: SY='G'; M= -2, 3,-24, 3, 1,-24, 8, -9,-26, -2,-24,-15, 6,-12, 0, -5, 6, -3,-21,-27,-18, 0; /M: SY='B'; M= -3, 3,-22, 2, 3,-21, -5, -9,-21, 0,-18,-13, 3,-13, -3, 0, 1, -4,-17,-23,-16, 0; /M: SY='N'; M= -1, 20,-20, 9, 2,-19, -5, 3,-19, -1,-23,-16, 30,-16, 1, -1, 9, -1,-22,-33,-16, 2; /M: SY='Q'; M= -9, -2,-28, -3, 14,-33,-19, 7,-17, 7,-17, 3, -2,-11, 49, 8, 0, -8,-25,-20, -9, 32; /M: SY='Q'; M= -6, -9,-24, -9, 2,-16,-21, -8, -8, 4, -5, -1, -9,-16, 8, 3, -7, -7, -8,-21, -6, 5; /M: SY='W'; M=-19,-36,-40,-39,-30, 29,-23,-27,-14,-23,-11,-14,-34,-30,-25,-20,-33,-23,-20,105, 28,-23; /M: SY='T'; M= 1, -2,-20, -7, -1,-19,-15,-12,-11, 0,-13, -8, 1,-12, 1, -2, 5, 9, -8,-26,-13, -1; /M: SY='F'; M=-13,-28,-26,-31,-23, 22,-29,-15, 9,-23, 19, 6,-26,-26,-21,-18,-24,-11, 2, 12, 21,-22; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='T'; M= -9, -8,-18, -9, -8, -8,-22, -9, -4, -5, -5, -3, -8,-18, -8, -3, -4, 3, 0,-21, 0,-10; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='S'; M= 0, 5,-21, 5, 4,-25, -3, -9,-24, 1,-24,-16, 6, -8, 2, -3, 10, 5,-18,-30,-18, 3; /M: SY='D'; M=-10, 22,-26, 26, 13,-28,-13, -2,-27, 7,-23,-18, 13,-12, 5, 0, 1, -4,-23,-31,-15, 9; /M: SY='G'; M= -5, -1,-27, -2, -6,-24, 22, -1,-31, -5,-26,-15, 7,-16, -5, -3, 1,-12,-25,-24,-16, -6; /M: SY='A'; M= 6, -3,-13, -7, 2,-20,-11,-10,-18, -1,-16,-12, -1,-13, 0, 1, 6, 6,-11,-27,-16, 1; /M: SY='I'; M=-12,-27,-26,-31,-25, 11,-34,-13, 28,-22, 17, 14,-23,-26,-18,-21,-20, -9, 17, -6, 23,-25; /M: SY='R'; M=-14,-12,-26,-13, -2, -8,-23, -7,-15, 13,-10, -3, -7,-19, 5, 26,-10, -8,-10,-18, -5, 0; /M: SY='S'; M= -4,-12,-16,-16,-14, -4,-19,-10, 2,-16, -7, -3, -4,-15,-12,-15, 3, 2, 3,-26, -7,-14; /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='N'; M= -2, 1,-10, -4, -4,-10, -9, -3, -7, -2, -8, -5, 6,-12, -2, 1, 2, 0, -5,-20, -8, -4; D=-5; /I: I=-5; DM=-25; /M: SY='I'; M= -1,-10,-16,-12, -6,-10,-16,-12, 4, -6, -2, 1, -7,-13, -2, -7, -2, -2, 4,-20, -8, -5; D=-5; /I: I=-5; DM=-25; /M: SY='B'; M= -1, 1,-18, 0, -2,-12, -6, -4,-12, -4, -9, -7, 1,-14, -3, -5, -1, -4,-11,-18, -5, -3; D=-5; /I: I=-5; DM=-25; /M: SY='S'; M= -3, 0,-21, -2, -4,-16, -6,-10,-17, -6,-16,-10, 3, -9, -5, -4, 7, 5,-13,-29,-15, -5; /M: SY='N'; M= -7, 13,-25, 12, 1,-27, 12, -3,-29, -4,-26,-18, 16,-15, -2, -7, 6, -4,-25,-31,-19, -1; /M: SY='R'; M= -9,-11,-21,-13, -5,-11,-16,-12,-10, 2, 1, -1, -8,-20, -3, 3,-12, -6,-10,-21, -7, -5; /M: SY='C'; M= -8,-19, 90,-27,-26,-17,-27,-26,-23,-26,-16,-16,-18,-36,-26,-25, -7, -7, -6,-45,-24,-26; /M: SY='L'; M= -8,-29,-19,-30,-21, 9,-29,-19, 20,-27, 40, 20,-28,-29,-20,-20,-26, -9, 14,-19, 1,-21; /M: SY='T'; M= -4, 6,-20, 5, -4,-18, -4,-10,-20, -8,-17,-14, 4,-14, -7, -7, 8, 12,-12,-29,-14, -6; /M: SY='A'; M= 6,-16,-19,-20,-16, -8,-13,-19, -1,-16, -3, -4,-14,-20,-14,-17, -4, -1, 4, -6, -7,-15; /M: SY='N'; M= -5, 7,-24, 6, -1,-20, -2, -6,-19, -5,-21,-15, 9, -9, -5, -7, 3, -4,-17,-27,-12, -4; /M: SY='G'; M= -3, -4,-25, -5, -6,-16, 6, -9,-21, -8,-21,-13, 2,-16, -5, -8, 2, -7,-17,-15,-12, -6; /M: SY='N'; M= -5, 0,-21, -5, -7,-10,-12, 0,-12, -8,-11, -8, 6,-17, -5, -7, 2, 0,-12,-23, -5, -6; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='N'; M= 0, 0,-19, -3, -3,-16, -2, -8,-14, -5,-15,-10, 4,-14, -5, -7, 4, -1,-11,-22,-12, -4; D=-4; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='T'; M= -3, -1,-19, -3, -4,-17, -7,-10,-14, -4,-16,-11, 2, 0, -3, -5, 5, 6,-12,-21,-14, -4; D=-4; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='N'; M= -2, -1,-18, -4, -3,-12, 1, -7,-13, -6,-12, -9, 2,-10, -6, -7, 0, 0,-12,-13, -8, -5; D=-4; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='S'; M= 0, 3,-14, 2, -1,-13, -2, -6,-12, -6,-14,-10, 5, -6, -1, -7, 8, 4, -9,-20,-10, -2; D=-4; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='G'; M= -2, -5,-15, -5, -5, -9, 2, -7,-10, -6, -9, -7, -2, -4, -5, -6, 1, -1, -9,-14, -7, -5; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='V'; M= -3,-24,-19,-26,-23, 0,-26,-24, 22,-20, 13, 10,-22,-25,-22,-19,-14, -6, 25,-24, -6,-23; /M: SY='R'; M= -7,-10,-22,-13, -5,-16,-17,-11, -7, 1, -8, 2, -7,-16, 2, 5, -3, 2, -4,-22, -9, -2; /M: SY='I'; M= -9,-23,-23,-29,-20, 0,-28,-17, 24,-22, 22, 20,-19,-23,-15,-18,-19, -7, 15,-22, -2,-19; /M: SY='Y'; M=-12,-13,-26,-13, -5, 1,-20, -1, -6, -7, -1, 2,-13,-21, 0, -7,-12, -9,-10, -6, 15, -3; /M: SY='S'; M= 1, 2,-22, 0, 4,-23, -8, -7,-21, 4,-23,-14, 6, -5, 3, 1, 7, 1,-17,-27,-15, 3; /M: SY='C'; M= -7,-16, 85,-24,-24,-18,-26,-26,-26,-25,-18,-18,-15,-34,-24,-24, -6, -6,-10,-40,-25,-24; /M: SY='D'; M= -7, 13,-23, 16, 3,-24, -9, -6,-21, -5,-22,-17, 9, -7, -2, -8, 6, 2,-17,-30,-16, 0; /M: SY='S'; M= 0, 0,-21, -1, -4,-21, 5, -8,-21, -7,-21,-14, 4,-13, -3, -9, 9, 2,-16,-26,-13, -4; /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: M= -2, -2,-16, -2, -5,-12, -4, -9, -8, -5,-10, -7, -1, -8, -7, -6, 0, -1, -4,-19,-10, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='N'; M= -3, 0,-23, -3, -5,-16, -7, -5,-18, -7,-19,-14, 5, -6, -6, -9, 5, 2,-17,-18, -9, -6; /M: SY='D'; M= -6, 2,-25, 4, 0,-19, -9, -8,-16, -6,-13,-11, 0,-12, -4, -5, -4, -8,-13,-24,-13, -3; /M: SY='N'; M= 8, 6,-19, 0, -2,-18, -1, -8,-18, -6,-20,-15, 11,-14, -5, -9, 9, 0,-15,-24,-14, -4; /M: SY='Q'; M=-10, -4,-27, -6, 10,-28,-22, 6,-12, 2,-11, 2, -4,-13, 38, 2, -2, -5,-19,-21, -7, 24; /M: SY='R'; M=-14,-12,-28,-13, -4, -8,-24, -1,-12, 13, -9, 0, -8,-19, 3, 20,-13, -9,-11,-11, 9, -3; /M: SY='W'; M=-20,-38,-46,-39,-29, 16,-21,-27,-18,-19,-17,-18,-37,-30,-21,-18,-37,-27,-27,131, 30,-20; /M: SY='E'; M= -7, -8,-21, -9, 2, -9,-22, -6, -6, -4, -3, -1, -7,-16, -2, -3, -4, 1, -4,-23, -4, -1; /M: SY='F'; M=-11,-28,-20,-33,-25, 16,-30,-22, 14,-24, 14, 6,-24,-25,-22,-19,-21,-10, 10, 2, 8,-24; /M: SY='N'; M=-11, 4,-26, -1, 0,-16,-17, -7,-11, 2,-15, -8, 8,-13, 1, 0, -5, -6,-14,-21,-10, 0; /M: SY='P'; M= -6, 0,-26, 0, 2,-21,-11, -9,-16, -1,-20,-13, 2, 3, -2, -6, 1, -3,-17,-27,-13, -2; /M: SY='D'; M=-11, 27,-24, 32, 5,-27, -7, -3,-23, -5,-20,-17, 17,-15, -2, -9, 0, -6,-18,-35,-17, 1; /M: SY='G'; M= 1, -5,-24, -6,-10,-24, 31,-15,-28,-11,-25,-16, 1,-16,-10,-12, 7, -4,-20,-24,-21,-10; /M: SY='B'; M= -7, 10,-20, 7, -4,-14,-12, -8,-14, -7,-11,-12, 10,-17, -7, -6, 4, 7,-12,-29,-10, -6; /M: SY='I'; M= -4,-15,-24,-20,-14, -8,-19,-20, 10,-14, 3, 3,-10,-18,-13,-14, -9, -3, 7,-23, -8,-15; /M: SY='Y'; M= -4,-19,-18,-22,-18, 2,-18,-15, 2,-16, 3, 0,-16,-23,-16,-14, -8, -3, 4,-11, 5,-18; /M: SY='N'; M= -6, 5,-21, -2, -4,-10, -9, 2,-14, -6,-16,-11, 14,-19, -3, -2, 3, -2,-15,-25, -5, -4; /I: I=-5; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24; /M: SY='H'; M= -5, -2,-14, -5, -5, -5, -8, 3, -4, -4, -4, -2, 3, -9, -4, -4, -4, -4, -6,-12, 1, -5; D=-5; /I: I=-5; DM=-24; /M: SY='P'; M= -8,-14,-25,-12, -7,-13,-21,-12, -6, -6, -8, -4,-12, 8, -8, -6, -8, -5, -6,-25,-11, -9; D=-5; /I: I=-5; DM=-24; /M: SY='N'; M= -8, 10,-24, 7, -1,-17, -3, 5,-23, -1,-21,-14, 13,-17, -1, -1, 1, -7,-22,-25, -7, -1; /M: SY='S'; M= 3, -2,-17, -4, -2,-17,-10,-13,-16, -8,-20,-15, 2, 4, -5,-10, 17, 16,-11,-32,-17, -5; /M: SY='G'; M= -5, 8,-24, 5, -3,-25, 16, -2,-30, -2,-27,-18, 14,-16, -5, -3, 6, -5,-24,-29,-19, -5; /M: SY='L'; M=-10,-15,-24,-15, -7, -6,-23, -9, -1, -4, 14, 8,-16,-22, -5, -3,-19,-10, -4,-18, 1, -7; /M: SY='C'; M= -4,-25, 25,-30,-27, -4,-29,-26, 8,-22, 4, 2,-24,-31,-26,-20,-12, -5, 20,-32,-12,-27; /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-22, 11,-29,-18, 20,-26, 36, 23,-28,-28,-19,-19,-26,-10, 12,-14, 2,-20; /M: SY='D'; M= -8, 21,-22, 26, 11,-28,-11, -4,-27, -1,-23,-19, 12,-10, 3, -6, 8, 7,-20,-34,-16, 7; /M: SY='V'; M= 10,-19,-17,-22,-17, -7,-17,-19, 5,-13, 0, 0,-17,-21,-14,-15, -4, -2, 12,-15, -5,-16; /M: SY='K'; M= -2, -4,-25, -6, -4,-15, -9, -8,-18, 4,-18,-11, 0, -5, -4, 1, -2, -5,-15,-20, -7, -5; /M: SY='G'; M= -4, 5,-26, 5, -2,-27, 9, -5,-24, -5,-23,-14, 8,-15, 2, -4, 3, -7,-21,-27,-18, -1; /M: SY='G'; M= 2, -3,-22, -4, -5,-20, 10,-10,-25, -9,-22,-16, 2,-11, -5, -8, 8, 0,-18,-22,-17, -5; /M: SY='B'; M= -2, 8,-24, 8, 6,-26, -7, -3,-23, -2,-21,-15, 8, -3, 4, -4, 4, -3,-21,-30,-17, 4; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='T'; M= -5, -4,-21, -4, 2,-16,-16, -9,-11, -5,-12, -8, -4, -2, -2, -7, 2, 5, -8,-27,-12, -1; D=-4; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='S'; M= 1, -2,-19, -5, -6,-15, 1, -8,-16, -6,-16,-11, 2, -9, -4, -7, 5, 0,-13,-21,-11, -5; D=-4; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='N'; M= -5, 5,-18, 1, -6,-14, 0, -8,-13, -8, -8, -8, 8,-16, -7, -5, -1, 0,-12,-24,-13, -7; D=-4; /I: I=-4; MD=-23; /M: M= -6, -4,-14, -4, -4,-15, 0,-10,-14, -1,-12, -8, -2, -9, -4, 0, -3, -4,-10,-19,-12, -5; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='E'; M= -5, -3,-21, -1, 5,-18, -8, -2,-17, 5,-16, -9, -2, 4, 4, 1, -3, -5,-16,-14,-10, 3; D=-4; /I: I=-4; DM=-23; /M: SY='I'; M= -8,-29,-23,-33,-26, 2,-34,-26, 35,-27, 25, 17,-24,-22,-21,-24,-20, -8, 26,-21, -3,-26; D=-4; /I: I=-4; DM=-23; /M: SY='I'; M= -5,-13,-22,-17, -9,-11,-20,-10, 4,-11, -3, 4, -8,-17, 2,-10, -2, -1, 0,-22, -5, -5; /M: SY='L'; M= -3,-24,-18,-26,-20, -1,-25,-22, 16,-22, 21, 12,-22,-21,-17,-19,-14, -1, 16,-24, -6,-19; /M: SY='Y'; M=-13,-12,-28,-12, -7, -1,-18, -4,-14, -5,-11, -8,-10,-21, -3, -1,-10, -9,-14, 7, 10, -5; /M: SY='E'; M= -7, 4,-24, 6, 8,-24,-13, -5,-22, 0,-23,-15, 3, 1, 4, -4, 6, 5,-19,-26,-15, 5; /M: SY='C'; M= -9, -2, 19, -6, -9,-14,-14,-12,-21,-14,-18,-15, -1,-19,-12,-16, -4, -6,-15,-30,-12,-11; /M: SY='N'; M= -6, 12,-21, 8, -1,-19, -7, 7,-19, -7,-21,-14, 16,-15, -2, -6, 9, 3,-16,-32,-10, -3; /M: SY='G'; M= -2, -7,-26, -9, -9,-20, 15, -7,-20,-10,-19,-11, 0,-12, -7,-12, -1,-10,-19,-22,-13, -9; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='B'; M= 6, 7,-20, 5, -2,-21, -1, -7,-19, -3,-17,-13, 7,-14, -2, -7, 5, -2,-15,-25,-14, -2; D=-4; /I: I=-4; DM=-23; /M: M= -2, -5,-22, -6, -6,-11,-16,-15, -8, -9, -7, -7, -6, -4,-10,-11, -3, -1, -6,-26,-12, -9; /M: SY='N'; M= -6, 18,-20, 10, -1,-20, -4, -2,-21, -2,-24,-17, 27,-17, -1, -1, 10, 4,-21,-28,-16, -1; /M: SY='Q'; M= -8, 1,-28, 0, 18,-38,-15, 7,-21, 8,-21, -3, 2,-10, 51, 7, 2, -9,-29,-22,-12, 34; /M: SY='Q'; M=-11,-11,-28,-13, -3,-15,-12, -8,-11, 3,-10, -1, -7,-17, 8, 8, -8, -9,-12,-17, -6, 1; /M: SY='W'; M=-20,-39,-48,-40,-30, 14,-21,-29,-19,-21,-18,-19,-39,-30,-21,-20,-39,-29,-28,142, 30,-21; /M: SY='L'; M=-10,-11,-24,-14, -8, -4,-25,-13, 0, -4, 1, 0, -9,-18, -7, -5,-10, -1, -2,-15, 1, -8; /M: SY='L'; M= -6,-22,-21,-26,-19, 6,-23,-18, 7,-20, 9, 3,-19,-15,-19,-16,-12, -2, 7,-15, -2,-20; /M: SY='T'; M= -7, -6,-22, -7, -2,-13,-14,-10,-10, -6, -7, -5, -5,-16, -2, -3, 0, 3, -9,-20, -7, -3; /I: E1=0;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 211 in 175 different sequences |
| Number of true positive hits | 198 in 162 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 13 in 13 different sequences |
| Number of false negative sequences | 5 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 93.84 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 97.54 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Bacteriophages, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 3 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | K_Hofmann |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Ricin B-type lectin |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
162 sequences
ABRA_ABRPR (P11140), ABRB_ABRPR (Q06077), ABRC_ABRPR (P28590), ABRD_ABRPR (Q06076), AGALA_ASPCL (A1CBW8), AGALA_ASPFN (B8MWJ5), AGALA_ASPFU (Q4WVZ3), AGALA_ASPNC (A2QL72), AGALA_ASPNG (P28351), AGALA_ASPOR (Q2UT06), AGALA_ASPTN (Q0CPK2), AGALA_NEOFI (A1DDD8), AGB34_AGAAL (A8W969), AGGL_ABRPR (Q9M6E9), AGGL_RICCO (P06750), AHV_ACTSK (Q9KWN0), C35AB_BACTU (Q939S9), CDTA_AGGAC (O87120), CDTA_CAMJE (Q0PC56), CDTA_CAMJJ (A1VXG4), CDTA_ECOLX (Q46668), CDTA_HAEDU (O06522), CDTA_HELHP (Q9RFY6), CDTC_ECOLX (Q46670), CEL3_CUCEC (Q868M7), CFGA_TACTR (Q27082), CRBG1_HUMAN (Q9Y4K1), CRBG2_HUMAN (Q8N1P7), CRBG3_HUMAN (Q68DQ2), CRBG3_MOUSE (Q80W49), CUPA_DICDI (Q55FW5), CUPB_DICDI (Q7Z203), CUPC_DICDI (Q7Z202), CUPD_DICDI (Q54BF5), CUPE_DICDI (Q7Z200), CUPF_DICDI (Q7Z1I0), CUPG_DICDI (Q7Z1Z9), CUPH_DICDI (Q54FW5), CUPI_DICDI (Q75JP7), CUPJ_DICDI (Q54Z20), DCDC1_HUMAN (M0R2J8), E13B_ARTSW (Q59146), E13B_CELCE (P22222), EABF_STRCO (O54161), EABF_STRLI (P96463), EULS3_ARATH (Q945P1), EXGAL_BIFL2 (A0A401ETL2), FLVS_ELIME (Q47899), GALT1_BOVIN (Q07537), GALT1_DROME (Q6WV20), GALT1_HUMAN (Q10472), GALT1_MOUSE (O08912), GALT1_PIG (Q29121), GALT1_RAT (Q10473), GALT2_DROME (Q6WV19), GALT2_HUMAN (Q10471), GALT2_MOUSE (Q6PB93), GALT3_CAEEL (P34678), GALT3_DROME (Q9Y117), GALT3_HUMAN (Q14435), GALT3_MOUSE (P70419), GALT3_TAEGU (H0ZAB5), GALT4_CAEEL (Q8I136), GALT4_DROME (Q8IA42), GALT4_HUMAN (Q8N4A0), GALT4_MOUSE (O08832), GALT5_CAEEL (Q95ZJ1), GALT5_DROME (Q6WV17), GALT5_HUMAN (Q7Z7M9), GALT5_MOUSE (Q8C102), GALT5_RAT (O88422), GALT6_BOVIN (Q5EA41), GALT6_CAEEL (O61394), GALT6_DROME (Q6WV16), GALT6_HUMAN (Q8NCL4), GALT6_MOUSE (Q8C7U7), GALT7_CAEEL (O61397), GALT7_DROME (Q8MV48), GALT7_HUMAN (Q86SF2), GALT7_MOUSE (Q80VA0), GALT7_PONAB (Q5RFJ6), GALT7_RAT (Q9R0C5), GALT8_DROME (Q9VUT6), GALT8_HUMAN (Q9NY28), GALT9_CAEEL (Q9U2C4), GALT9_DROME (Q8MRC9), GALT9_HUMAN (Q9HCQ5), GALT9_MACFA (Q9GM01), GALT_BIOGL (S5S833), GLT10_CAEBR (A8Y236), GLT10_CAEEL (O45947), GLT10_DROME (Q8IA43), GLT10_HUMAN (Q86SR1), GLT10_MOUSE (Q6P9S7), GLT10_RAT (Q925R7), GLT11_CAEEL (Q7K755), GLT11_DROME (Q8IA41), GLT11_HUMAN (Q8NCW6), GLT11_MOUSE (Q921L8), GLT11_RAT (Q6P6V1), GLT11_XENTR (Q6DJR8), GLT12_DROME (Q8IA44), GLT12_HUMAN (Q8IXK2), GLT12_MOUSE (Q8BGT9), GLT13_DROME (Q8MYY6), GLT13_HUMAN (Q8IUC8), GLT13_MOUSE (Q8CF93), GLT13_RAT (Q6UE39), GLT14_HUMAN (Q96FL9), GLT14_MOUSE (Q8BVG5), GLT15_HUMAN (Q8N3T1), GLT15_MOUSE (Q9D2N8), GLT16_HUMAN (Q8N428), GLT16_MOUSE (Q9JJ61), GLT17_HUMAN (Q6IS24), GLT17_MOUSE (Q7TT15), GLT18_HUMAN (Q6P9A2), GLT18_MOUSE (Q8K1B9), GLT35_DROME (Q8MVS5), GLTL6_HUMAN (Q49A17), HA33C_CBCP (P0DPR0), HA33D_CBDP (P0DPR1), HLY1_AERHH (P55870), HLY4_AERSA (Q08677), HLYA_VIBCH (P09545), LY75_HUMAN (O60449), LY75_MESAU (Q920P9), LY75_MOUSE (Q60767), ML1_VISAL (P81446), ML2_VISAL (Q6H266), ML3_VISAL (P82683), ML4_VISAL (Q6ITZ3), MRC1_HUMAN (P22897), MRC1_MOUSE (Q61830), MRC2_HUMAN (Q9UBG0), MRC2_MOUSE (Q64449), MRC2_RAT(Q4TU93), NIGB_SAMNI (P33183), PLA2R_BOVIN (P49259), PLA2R_HUMAN (Q13018), PLA2R_MOUSE (Q62028), PLA2R_PONAB (Q5R880), PLA2R_RABIT (P49260), PRSN_PIEBR (Q9GV36), PRSN_PIERA (Q9U8Q4), RICI_RICCO (P02879), RIP1_SAMNI (P93543), RIPM_POLML (Q9M654), RIPT_POLML (Q9M653), RLT1_RHIO9 (I1C083), SGSL_TRIAN (U3KRF8), SNAIB_SAMNI (Q41358), SNAIF_SAMNI (O22415), SP1_RARFA (Q05308), TCT2_PHYPO (O61064), VOLK_ADEVO (Q70US9), VVHA_VIBVU (P19247), XYNA_STRLI (P26514), Y1419_MYCTO (P9WLX8), Y1419_MYCTU (P9WLX9), Y1454_MYCBO (P64850), YL288_MIMIV (Q5UPX2)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
5 sequences
40C1_ORYSJ (Q10M12), 40G2_ORYSJ (Q6Z4N6), 40G3_ORYSJ (Q6Z4N4), AGGL_SCLS1 (A7EWX9), AGGL_SCLSC (A7XUK7)» more |
| UniProtKB/Swiss-Prot False positive sequences |
13 sequences
DCA10_MOUSE (A2AKB9), ENVE_SALTY (Q56030), MB212_DANRE (Q8UUZ1), MB212_HUMAN (Q9Y586), MB212_MOUSE (Q8BPP1), PRP19_BOVIN (Q08E38), PRP19_CHICK (Q5ZMA2), PRP19_HUMAN (Q9UMS4), PRP19_MOUSE (Q99KP6), PRP19_RAT (Q9JMJ4), RS17_BUCBP (Q89A75), TCPR1_MOUSE (Q80VP0), VP13D_DROME (Q9VU08)» more |
| PDB [Detailed view] |
125 PDB
1ABR; 1CE7; 1DQG; 1DQO; 1FWU; 1FWV; 1KNL; 1KNM; 1M2T; 1MC9; 1ONK; 1OQL; 1PC8; 1PUM; 1PUU; 1QXM; 1RZO; 1SR4; 1SZ6; 1TFM; 1VCL; 1XEZ; 1XHB; 1YF8; 2AAI; 2D7I; 2D7R; 2E4M; 2F2F; 2FFU; 2FFV; 2MLL; 2Q3N; 2R9K; 2RG9; 2X2S; 2X2T; 2Z48; 2Z49; 2ZR1; 3A07; 3AH1; 3AH2; 3AH4; 3AJ5; 3AJ6; 3C9Z; 3CA0; 3CA1; 3CA3; 3CA4; 3CA5; 3CA6; 3CAH; 3D7W; 3O44; 3O5W; 3RTI; 3RTJ; 3W9T; 3WMY; 3WMZ; 3WN0; 3WN1; 3WN2; 4D0T; 4D0Z; 4D11; 4DEN; 4EB2; 4END; 4G1R; 4HR6; 4JKX; 4JP0; 4OWJ; 4OWK; 4OWL; 4P6A; 5AJN; 5AJO; 5AJP; 5AO5; 5AO6; 5E4K; 5E4L; 5EW6; 5FV9; 5NDF; 5NQA; 5XTS; 5XTW; 6E4Q; 6E4R; 6E7I; 6EGS; 6ELY; 6H0B; 6INN; 6INO; 6INU; 6INV; 6IOE; 6IWQ; 6IWR; 6NQT; 6PXU; 6S22; 6S24; 7JPT; 7JPU; 7KBI; 7KBK; 7KC9; 7KD0; 7KD2; 7KDM; 7KDU; 7QSR; 7YL9; 8HBC; 8K8H; 8TFH; 8TFL; 8V9Q » more |