![]() |
|
| Entry: PS50234 |
| General information about the entry | |
|---|---|
| Entry name | VWFA |
| Accession number | PS50234 |
| Entry type | MATRIX |
| Date | DEC-2001 (CREATED); DEC-2001 (DATA UPDATE); APR-2013 (INFO UPDATE). |
| PROSITE Documentation | PDOC50234 |
| Associated ProRule | PRU00219 |
| Name and characterization of the entry | |
| Description | VWFA domain profile. |
| Matrix / Profile | /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=177;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=172;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.9193; R2=0.01761053; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=430; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=316; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MM=1; M0=-8;
A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z
/I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D'; M=-14, 36,-27, 46, 15,-32,-11, 2,-31, -1,-25,-23, 19,-12, 1, -8, 2, -7,-25,-37,-18, 8;
/M: SY='I'; M= -6,-29,-19,-33,-27, 3,-33,-26, 32,-25, 22, 15,-25,-26,-23,-23,-17, -4, 31,-23, -3,-27;
/M: SY='V'; M= -1,-22,-13,-27,-23, 2,-26,-19, 17,-19, 9, 9,-20,-24,-20,-18,-10, 0, 21,-20, 0,-22;
/M: SY='F'; M=-12,-29,-21,-36,-27, 40,-31,-22, 15,-28, 20, 8,-23,-28,-30,-22,-20, -9, 12, -6, 14,-27;
/M: SY='V'; M= -2,-28,-12,-30,-24, 2,-27,-24, 21,-24, 24, 13,-27,-28,-23,-21,-17, -5, 25,-25, -7,-24;
/M: SY='I'; M= -8,-29,-20,-32,-25, 7,-32,-24, 29,-26, 27, 17,-26,-25,-22,-22,-21, -7, 23,-21, -2,-24;
/M: SY='D'; M=-19, 46,-30, 64, 21,-38,-11, 0,-38, 0,-29,-28, 18,-10, 1, -9, 0,-10,-28,-39,-19, 10;
/M: SY='G'; M= 2, -3,-15, -6, -9,-21, 12,-14,-20,-10,-20,-13, 3,-16,-10,-12, 6, -2,-13,-28,-19,-10;
/M: SY='S'; M= 9, 0,-10, 0, -1,-19, -2,-10,-20,-10,-28,-19, 9,-11, -1, -9, 37, 20,-10,-39,-19, -1;
/M: SY='G'; M= -3, 0,-26, 2, 3,-25, 10, -9,-27, -3,-23,-15, 2,-13, 0, -5, 2, -8,-22,-20,-17, 1;
/M: SY='S'; M= 3, 2,-17, 1, 0,-20, -1, -8,-21, -3,-26,-17, 9,-13, 0, -5, 22, 9,-14,-31,-16, 0;
/M: SY='M'; M= -6,-23,-21,-30,-23, -1,-25,-18, 25,-19, 16, 26,-20,-22,-14,-19,-15, -6, 20,-22, -4,-20;
/M: SY='G'; M= 2, -5,-22, -6, -6,-21, 12,-14,-23, -7,-20,-14, 0,-14, -7, -6, 7, 0,-15,-24,-17, -7;
/M: SY='E'; M= -6, 0,-26, 1, 6,-21, -6, -5,-19, -2,-17,-11, 1, -7, 2, -3, 0, -6,-18,-25,-13, 3;
/I: I=-4; MD=-23;
/M: SY='Q'; M= -1, 0,-22, -1, 2,-17,-10, -6,-16, -1,-15,-10, 0,-11, 3, -2, 1, -3,-13,-23,-10, 2; D=-4;
/I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='N'; M=-11, 6,-24, 3, 0,-18,-10, -4,-20, 3,-19,-13, 10,-15, 0, 5, -4, -6,-19,-14,-10, -1; D=-4;
/I: I=-4; DM=-23;
/M: SY='F'; M=-14,-26,-22,-32,-24, 39,-28,-16, 7,-22, 11, 6,-20,-27,-25,-16,-19, -9, 4, 1, 19,-23;
/M: SY='E'; M= -9, 8,-26, 7, 11,-24,-15, 1,-21, 5,-20,-12, 7,-10, 11, 5, 0, -3,-21,-25,-11, 10;
/M: SY='Q'; M= -4, -8,-21,-10, -2,-16,-18, -7, -9, -1, -7, -3, -6,-16, 2, 0, -3, -2, -6,-23, -8, -1;
/M: SY='V'; M= 8,-17,-16,-22,-15, -7,-19,-18, 9,-14, 2, 5,-15,-19,-11,-16, -3, 1, 13,-23, -8,-13;
/M: SY='K'; M= -8,-10,-25,-11, -2,-18,-21,-11,-13, 18,-12, -2, -7,-16, 3, 17, -9, -7, -8,-21, -8, -1;
/M: SY='E'; M= -4, 10,-25, 12, 15,-28, -9, -5,-25, 4,-23,-16, 6, -5, 6, -1, 3, -4,-21,-30,-18, 10;
/M: SY='F'; M= -3,-19,-14,-27,-19, 28,-21,-16, -3,-20, 1, -2,-13,-23,-22,-16, -7, -2, -1, -9, 7,-19;
/M: SY='I'; M= 0,-25,-18,-29,-22, 0,-27,-24, 23,-22, 18, 13,-22,-23,-20,-21,-13, -2, 23,-24, -6,-22;
/M: SY='E'; M= -2, -5,-19, -7, 2,-15,-18,-10, -7, -3, -8, -5, -4,-14, -2, -6, -1, -1, -5,-27,-11, -1;
/M: SY='K'; M= -5, 2,-24, 0, 3,-20,-10, -5,-19, 5,-17,-10, 4,-14, 3, 4, 1, -1,-16,-25,-12, 3;
/M: SY='I'; M= -8,-28,-19,-32,-25, 14,-30,-22, 23,-24, 22, 15,-24,-26,-22,-20,-18, -6, 21,-18, 1,-24;
/M: SY='I'; M= 0,-25,-16,-30,-24, 2,-25,-23, 22,-22, 16, 15,-22,-24,-20,-21,-13, -6, 21,-22, -5,-23;
/M: SY='E'; M= -7, 8,-25, 10, 13,-26, -7, -4,-25, 5,-22,-14, 7,-12, 9, 3, 4, -3,-21,-29,-16, 11;
/M: SY='R'; M= -5, 2,-24, 1, 4,-22,-12, -6,-20, 7,-19,-11, 4,-11, 6, 10, 2, -1,-16,-27,-14, 3;
/M: SY='L'; M= -8,-23,-19,-27,-20, 10,-24,-16, 11,-22, 23, 14,-20,-25,-18,-17,-19, -8, 6,-17, 1,-18;
/M: SY='D'; M= -7, 6,-24, 7, 3,-17,-12, -3,-20, -3,-19,-14, 4, -9, -1, -4, 3, 1,-17,-24, -8, 0;
/M: SY='I'; M= -6,-12,-25,-14, -8,-13,-21,-14, 5,-10, -1, 1, -9,-13, -7, -9, -8, -6, 3,-25, -9, -9;
/M: SY='G'; M= -1, -3,-21, -3, -6,-18, 5,-11,-17,-10,-16,-12, 0,-16, -7,-11, 5, -3,-13,-25,-13, -7;
/I: I=-4; MD=-20;
/M: SY='D'; M= -8, 3,-26, 6, 6,-25, -6, -6,-24, 1,-22,-15, 2, 2, 3, -1, 0, -6,-22,-26,-16, 3; D=-4;
/I: I=-4; MD=-20;
/M: SY='D'; M= -8, 8,-20, 11, 3,-19,-10, -6,-18, 3,-17,-12, 4, -6, -1, 0, -1, -3,-14,-23,-11, 0; D=-4;
/I: I=-4; MD=-20;
/M: SY='E'; M= -5, 0,-20, 0, 2,-17, -6, -3,-15, 2,-14, -8, 2, -8, 0, 2, -1, -5,-13,-20,-10, 0; D=-4;
/I: I=-4; MI=0; MD=-20; IM=0; DM=-20;
/M: SY='V'; M= 1,-10,-13,-15,-14, -7,-17,-17, 6,-13, -3, -1, -7,-11,-12,-14, 1, 8, 9,-20, -8,-14; D=-4;
/I: I=-4; DM=-20;
/M: SY='R'; M=-14, -1,-25, -4, 3,-21,-16, 15,-24, 10,-19, -7, 6,-18, 15, 25, -4, -8,-23,-23, -4, 6;
/M: SY='V'; M= -6,-28,-17,-32,-27, 12,-30,-23, 25,-23, 15, 12,-25,-28,-26,-20,-15, -5, 30,-19, 2,-27;
/M: SY='G'; M= 10, -4,-18, -8, -9,-21, 18,-14,-22,-12,-20,-13, 1,-15,-10,-14, 7, -3,-14,-24,-19,-10;
/M: SY='I'; M= -5,-28,-19,-32,-25, 5,-29,-24, 26,-25, 25, 16,-25,-26,-22,-22,-19, -6, 25,-22, -3,-25;
/M: SY='I'; M= -3,-26,-18,-30,-25, 1,-28,-23, 25,-22, 16, 13,-22,-25,-21,-20,-15, -5, 25,-21, -4,-24;
/M: SY='Q'; M= -5, -6,-22, -7, 1,-20,-17, -6,-10, -4, -9, -3, -5,-13, 12, -4, 2, 4,-10,-24,-10, 6;
/M: SY='Y'; M=-17,-22,-23,-27,-23, 43,-28, 1, 0,-18, 3, 1,-18,-29,-20,-14,-17, -9, -4, 13, 47,-22;
/M: SY='S'; M= 8, 2,-17, -2, -5,-20, 6, -7,-21, -8,-24,-16, 9,-13, -4, -9, 18, 5,-15,-31,-17, -5;
/M: SY='D'; M= -4, 6,-23, 7, 1,-22, 2, -2,-25, -5,-23,-17, 7,-12, -3, -7, 7, 0,-20,-25,-11, -1;
/M: SY='B'; M= -7, 7,-25, 7, 5,-23, -9, -4,-20, 2,-20,-12, 6,-11, 1, -1, 1, -4,-17,-26,-13, 2;
/I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='V'; M= 3,-13,-16,-15,-11,-10,-15,-15, 0,-10, -6, -3,-11, -4,-10,-12, -1, 1, 4,-21,-10,-12; D=-4;
/I: I=-4; DM=-21;
/M: SY='R'; M= -5, -3,-20, -5, 1,-17,-14, 0,-19, 8,-16, -8, 0,-11, 5, 11, 0, 1,-14,-21, -7, 2; D=-4;
/I: I=-4; DM=-21;
/M: SY='T'; M= -3, -6,-21, -7, -1,-15,-18,-14, -3, -9, -7, -5, -6, -8, -6,-11, -1, 3, -1,-24,-12, -4; D=-4;
/I: I=-4; DM=-21;
/M: SY='E'; M= -7, -7,-23, -6, 7,-15,-20, -6,-11, -2,-10, -7, -7,-11, 0, -4, -6, -6, -9,-19, -7, 3; D=-4;
/I: I=-4; DM=-21;
/M: SY='F'; M= -6,-22,-22,-26,-19, 15,-23,-16, 5,-18, 3, 1,-18,-24,-19,-16,-14, -8, 6, -2, 7,-19;
/M: SY='S'; M= -5, 2,-21, 3, 2,-18,-11, -8,-19, -2,-16,-12, 2, -9, -2, -1, 4, 1,-14,-28,-13, 0;
/M: SY='L'; M= -9,-26,-21,-28,-20, 18,-27,-17, 11,-24, 26, 10,-23,-24,-21,-17,-22, -9, 6,-12, 6,-20;
/M: SY='N'; M= -7, 5,-23, 3, -2,-17, -8, -4,-18, -2,-17,-11, 8,-12, -2, -1, 1, -1,-16,-27,-10, -3;
/M: SY='D'; M= -4, 7,-23, 10, 7,-23,-10, -7,-21, -1,-19,-14, 4, -8, 2, -4, 4, 0,-17,-29,-15, 4;
/I: I=-5; MI=0; MD=-28; IM=0; DM=-28;
/M: SY='Y'; M= -3, -9,-21,-12, -9, -3,-16, -3, -8, -9, -9, -6, -5,-15, -7, -8, 1, 1, -7,-18, 3, -9;
/M: SY='Q'; M= -6, -2,-23, -3, 2,-19,-13, -3,-19, 4,-19,-10, 1,-10, 7, 5, 2, -1,-16,-22, -7, 3;
/M: SY='N'; M= -4, 12,-19, 10, 3,-21, -8, -3,-22, -1,-24,-17, 15,-13, 2, -1, 14, 7,-17,-33,-15, 2;
/M: SY='K'; M= -6, -6,-26, -7, -1,-15,-19,-10,-14, 10,-13, -6, -4, -8, -1, 6, -8, -7,-12,-20, -8, -2;
/M: SY='E'; M= -1, 6,-23, 7, 8,-25, -7, -8,-22, 1,-21,-15, 4, -6, 2, -4, 5, -1,-18,-28,-17, 5;
/M: SY='E'; M= -3, 8,-24, 12, 14,-25,-13, -4,-22, 2,-19,-14, 3,-10, 5, -3, 3, -4,-17,-27,-15, 10;
/M: SY='L'; M= -3,-24,-20,-27,-21, 3,-25,-20, 16,-22, 19, 10,-21,-22,-19,-18,-16, -5, 14,-20, -3,-20;
/M: SY='L'; M= -5,-15,-22,-18,-10, -5,-22,-13, 1, -7, 7, 3,-11,-20, -8, -4,-11, -4, -1,-20, -4,-10;
/M: SY='E'; M= -5, 6,-24, 6, 11,-24,-13, -2,-23, 8,-22,-13, 7,-12, 11, 7, 5, -2,-20,-27,-13, 10;
/M: SY='A'; M= 7,-10,-20,-14, -7,-14,-13, -9, -7, -4, -8, -4, -7,-16, -5, -5, -2, -4, -3,-22, -9, -7;
/M: SY='I'; M= -4,-27,-19,-31,-24, 4,-30,-24, 25,-23, 20, 14,-25,-25,-22,-21,-17, -5, 24,-19, -2,-24;
/M: SY='R'; M= -7, 4,-25, 3, 5,-21,-12, 1,-23, 8,-20,-11, 6,-13, 7, 11, -1, -5,-20,-24,-11, 5;
/M: SY='N'; M= -6, 5,-24, 4, 7,-23, -8, -2,-23, 5,-22,-13, 8,-11, 7, 5, 4, -3,-21,-26,-13, 6;
/M: SY='L'; M= -5,-23,-18,-28,-20, 5,-26,-18, 17,-21, 20, 15,-20,-24,-16,-18,-16, -6, 13,-20, -1,-19;
/M: SY='R'; M= -8, -4,-27, -3, 6,-22,-16, -7,-18, 6,-16, -9, -4, -1, 6, 7, -3, -4,-17,-26,-14, 5;
/I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='Y'; M= -7, -7,-15, -7, -7, 2,-13, 2, -1, -7, -1, 0, -6,-12, -4, -6, -7, -4, -3, -4, 12, -6; D=-4;
/I: I=-4; DM=-22;
/M: SY='Y'; M= -7, -8,-22, -8, -3, -5,-15, -2,-11, -3,-10, -5, -6,-11, 0, -2, -3, -4,-11, -8, 6, -3; D=-4;
/I: I=-4; DM=-22;
/M: M= -3, -9,-19,-10, -9,-16, -4,-13,-14,-10,-11, -7, -7, -8, -8,-11, -4, -6,-12,-23,-13, -9;
/M: SY='G'; M= 0, -4,-23, -5, -7,-21, 13,-11,-22, -7,-20,-12, 1,-15, -6, -9, 4, -4,-16,-23,-16, -7;
/M: SY='G'; M= -5, -1,-24, -2, -6,-24, 21,-12,-28, -7,-24,-16, 4,-14, -8, -8, 1, -8,-22,-23,-20, -7;
/M: SY='G'; M= -4, -5,-24, -6, -7,-18, 7,-11,-21, -5,-18,-11, 0,-13, -7, -5, -2, -7,-16,-21,-14, -8;
/M: SY='T'; M= 3, -3,-13, -9, -8,-12,-17,-17, -9,-10,-10, -9, -2, -9, -9,-11, 14, 29, -1,-29,-12, -9;
/M: SY='N'; M= -9, 10,-23, 5, -2,-13,-11, 2,-17, -2,-18,-11, 16,-12, -2, -2, 1, -3,-19,-25, -7, -3;
/M: SY='T'; M= -4,-15,-17,-22,-17, -1,-25,-20, 10,-19, 12, 6,-13,-19,-15,-16, -4, 15, 9,-24, -4,-17;
/M: SY='G'; M= 3, -3,-21, -6, -8,-19, 12,-11,-21,-10,-19,-13, 2,-15, -8,-11, 3, -5,-16,-23,-17, -8;
/M: SY='E'; M= -1, -1,-19, -1, 4,-20,-11, -8,-17, 0,-13, -9, -2,-12, 0, -4, 1, -1,-13,-27,-13, 2;
/M: SY='A'; M= 27,-10,-16,-16,-13,-20, 15,-20,-16,-14,-15,-12, -7,-13,-14,-19, 7, -4, -7,-22,-21,-13;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-21,-32,-23, 7,-31,-22, 26,-28, 40, 21,-28,-28,-20,-21,-26, -9, 16,-20, 0,-22;
/M: SY='Q'; M= -6, 0,-24, -1, 6,-22,-15, -4,-17, 6,-14, -6, 0,-13, 10, 4, -2, -5,-15,-25,-12, 8;
/M: SY='Y'; M= -8,-11,-23,-14, -8, 5,-21, 4, -9, -5, -6, -2, -9,-20, -5, -4, -9, -6, -9, -8, 17, -8;
/M: SY='A'; M= 18,-16,-14,-21,-16,-11, -8,-20, 1,-15, 0, -1,-14,-18,-15,-18, 0, 0, 8,-23,-13,-16;
/M: SY='L'; M= -5,-15,-21,-17, -9, -5,-23,-11, 2,-10, 3, 2,-12,-20, -7, -5, -8, -3, 2,-21, -2, -9;
/M: SY='E'; M= -8, 3,-25, 3, 11,-20,-13, -3,-20, 5,-17,-10, 4,-13, 9, 5, 0, -5,-19,-25,-12, 10;
/I: I=-6; MD=-33;
/M: SY='H'; M= -8, -4,-22, -8, -2,-13,-18, 4, -5, -4, -5, 2, 0,-17, 3, -3, -6, -5, -8,-23, -3, -1; D=-6;
/I: I=-6; MI=-33; IM=-33; DM=-33;
/M: SY='L'; M= -6,-21,-20,-25,-19, 10,-23,-13, 11,-21, 16, 9,-17,-24,-17,-18,-13, -5, 7,-16, 5,-19;
/M: SY='F'; M= -9,-11,-21,-16,-11, 17,-20,-12, -7,-10, -3, -4, -7,-19,-14, -8, -8, -5, -7,-12, 4,-11;
/M: SY='S'; M= -2, -1,-22, -2, 1,-21,-10, -4,-18, 1,-18,-11, 2,-12, 3, 0, 4, 1,-14,-24,-12, 1;
/I: I=-5; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26;
/M: SY='K'; M= -1, -5,-20, -5, 1,-15,-10, -7,-14, 3,-13, -8, -3, -2, -1, 3, -1, -4,-11,-19,-10, -1; D=-5;
/I: I=-5; DM=-26;
/M: SY='Q'; M= -2, -2,-20, -3, 3,-18, -9, -5,-16, 3,-16, -9, 1, -8, 5, 3, 3, 0,-13,-22,-11, 3; D=-5;
/I: I=-5; DM=-26;
/M: SY='E'; M= 0, 2,-23, 0, 5,-22, -7, -2,-21, 2,-19,-12, 4,-10, 4, 1, 2, -3,-17,-26,-14, 4;
/M: SY='G'; M= -2, -5,-24, -5,-11,-24, 29,-14,-27,-12,-23,-15, 0,-15,-12,-13, 2,-10,-21,-22,-21,-12;
/M: SY='N'; M= 0, 3,-19, 0, -3,-15, -8, -5,-14, -5,-15,-10, 6,-15, -4, -6, 4, -1,-11,-26,-11, -4;
/I: MD=-13;
/M: SY='R'; M=-13, -6,-23, -6, 1,-16,-16, 2,-20, 17,-13, -6, -1,-14, 8, 40, -7, -7,-15,-17, -7, 2; D=-2;
/I: I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='E'; M= -4, -2,-19, 1, 10,-16, -9, -5,-15, 2,-13, -9, -3, 3, 3, 0, -1, -4,-14,-18,-10, 6; D=-2;
/I: DM=-13;
/M: SY='N'; M= -6, 7,-19, 6, 5,-18, -2, 2,-17, 2,-17,-10, 10, -7, 3, 2, 0, -6,-17,-21,-11, 3; D=-2;
/I: DM=-13;
/M: SY='A'; M= 8,-10,-12,-14,-10, -8,-10,-11, -1,-10, -6, -3, -8,-12, -9,-13, 2, 1, 3,-18, -6,-10; D=-2;
/I: DM=-13;
/M: SY='P'; M= -7, -8,-27, -8, 0,-21,-16,-10,-16, 4,-18,-10, -4, 6, 0, 6, -4, -4,-15,-25,-15, -2;
/M: SY='K'; M= -8, 0,-26, -2, 6,-24,-16, 2,-21, 17,-21, -7, 4,-12, 12, 14, -3, -6,-18,-25,-10, 8;
/M: SY='V'; M= -6,-24,-19,-28,-22, 4,-28,-19, 19,-19, 14, 11,-21,-24,-20,-16,-14, -4, 22,-22, -2,-22;
/M: SY='I'; M= -1,-25,-19,-30,-23, 1,-26,-24, 23,-23, 17, 12,-22,-24,-21,-22,-14, -4, 22,-22, -5,-23;
/M: SY='I'; M= -7,-28,-21,-34,-27, 4,-33,-23, 33,-24, 19, 17,-24,-25,-21,-23,-18, -7, 28,-19, 2,-27;
/M: SY='I'; M= -6,-28,-18,-31,-24, 6,-29,-20, 24,-23, 24, 17,-26,-27,-21,-20,-19, -6, 23,-21, -1,-23;
/M: SY='I'; M=-10,-29,-21,-34,-26, 22,-31,-22, 23,-26, 21, 14,-24,-27,-25,-22,-20, -8, 18,-13, 8,-26;
/M: SY='T'; M= 5, -3,-10,-10, -9,-12,-15,-19,-10,-11,-12,-10, -1,-11, -9,-11, 20, 37, 0,-31,-13, -9;
/M: SY='D'; M= -9, 33,-26, 44, 12,-34, -3, -3,-34, -3,-28,-25, 16,-11, 0,-10, 5, -6,-25,-36,-20, 6;
/M: SY='G'; M= 2, -6,-26, -7,-14,-27, 45,-17,-32,-15,-26,-18, 1,-17,-15,-16, 3,-12,-24,-23,-26,-14;
/M: SY='E'; M=-10, -2,-27, -1, 4,-17,-17, 0,-17, 4,-16,-10, 0, -8, 3, 4, -4, -6,-17,-21, -4, 2;
/M: SY='S'; M= 2, -5,-21, -5, 0,-19, -9,-10,-16, -7,-20,-13, -2, 4, -3,-11, 8, 2,-14,-28,-16, -3;
/M: SY='N'; M= -8, 9,-21, 7, 3,-19,-10, -3,-19, -3,-19,-13, 11,-11, 2, -3, 5, 3,-18,-29,-12, 2;
/I: MD=-12;
/M: SY='D'; M= -9, 10,-20, 15, 4,-18,-10, -6,-17, -4,-15,-11, 3,-10, -4, -8, 0, -5,-13,-25,-10, 0; D=-2;
/I: MD=-12;
/M: SY='G'; M= -2, -2,-18, -1, -4,-17, 11, -7,-18, -6,-15,-10, 0, -5, -5, -6, 1, -6,-15,-18,-13, -5; D=-2;
/I: I=-3; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: M= -4, -2,-17, -2, 0,-12, -2, -6,-13, -1,-10, -7, 0, -9, -2, 0, -1, -2,-11,-16, -8, -2; D=-2;
/I: DM=-12;
/M: SY='D'; M= -8, 15,-22, 17, 7,-23, -6, -1,-23, 1,-19,-15, 12,-12, 3, 0, 2, -4,-20,-27,-13, 4; D=-2;
/I: DM=-12;
/M: SY='I'; M= -3,-20,-21,-21,-14, -5,-22,-18, 7,-17, 6, 2,-18, 2,-15,-17,-11, -4, 3,-22, -8,-16; D=-2;
/I: DM=-12;
/M: SY='R'; M= -6, -7,-22, -7, 2,-13,-19, -6,-11, 2, -8, -4, -5,-15, 1, 5, -4, -3, -8,-22, -7, 1; D=-2;
/I: DM=-12;
/M: SY='E'; M= -7, 8,-27, 13, 14,-28,-14, -7,-24, 7,-21,-15, 2, -1, 6, 2, 0, -4,-20,-29,-17, 9;
/M: SY='V'; M= 6,-16,-19,-18,-10,-10,-19,-19, 5,-14, 0, -1,-15,-10,-12,-17, -5, -3, 7,-23,-10,-13;
/M: SY='A'; M= 11,-15,-17,-19,-14,-11,-14,-19, 5,-15, -3, -1,-11,-17,-11,-17, 1, 0, 9,-25,-11,-13;
/M: SY='K'; M= -7, 1,-26, 1, 8,-23,-16, -4,-19, 9,-16, -9, 2, -9, 7, 8, -4, -6,-17,-26,-13, 6;
/M: SY='R'; M= -6, 3,-24, 1, 5,-20,-14, -4,-18, 6,-16,-10, 5,-14, 3, 9, -1, -3,-15,-26,-12, 3;
/M: SY='L'; M= 3,-23,-18,-26,-18, 0,-23,-18, 14,-21, 21, 12,-21,-22,-16,-19,-15, -6, 11,-19, -2,-18;
/M: SY='R'; M=-10, -3,-27, -4, 5,-24,-18, -4,-25, 24,-22,-10, 1,-10, 8, 29, -6, -7,-19,-23,-11, 5;
/M: SY='E'; M= -2, 5,-22, 5, 8,-25,-10, -5,-23, 7,-21,-13, 5,-11, 4, 4, 3, -2,-17,-28,-15, 6;
/I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='E'; M= -1, 0,-22, 0, 5,-19, -8, -7,-19, 3,-16,-10, 1,-11, 2, 0, 1, -4,-16,-22,-12, 3; D=-3;
/I: I=-3; DM=-17;
/M: SY='G'; M= -7, 4,-27, 3, -5,-25, 17, -5,-29, -2,-25,-16, 8,-15, -4, -3, 0,-11,-24,-24,-16, -5;
/M: SY='V'; M= -5,-27,-19,-31,-26, 3,-29,-22, 27,-23, 14, 12,-23,-25,-22,-21,-14, -5, 28,-21, 0,-25;
/M: SY='E'; M= -4, -2,-23, -3, 2,-19,-15, -9,-13, 1,-15, -8, 0, -7, 1, -1, 0, 0,-11,-27,-13, 0;
/M: SY='V'; M= -6,-26,-17,-29,-23, 1,-29,-24, 21,-21, 16, 11,-23,-22,-21,-17,-15, -4, 22,-23, -6,-23;
/M: SY='F'; M= -9,-21,-21,-26,-21, 24,-27,-13, 8,-20, 6, 3,-17,-25,-21,-17,-12, -5, 7, -7, 17,-22;
/M: SY='V'; M= 7,-16,-14,-21,-17, -5,-17,-21, 3,-16, -4, -3,-13,-10,-17,-17, 0, 5, 9,-24,-10,-17;
/M: SY='I'; M= -7,-29,-19,-34,-28, 8,-33,-27, 32,-26, 19, 14,-25,-26,-25,-23,-18, -6, 30,-21, -1,-28;
/M: SY='G'; M= 8, -7,-24, -9,-15,-24, 38,-17,-27,-16,-23,-16, 0,-18,-15,-18, 3,-11,-19,-22,-23,-15;
/M: SY='V'; M= -7,-27,-18,-32,-26, 11,-31,-23, 24,-23, 14, 12,-23,-24,-24,-21,-14, -3, 25,-19, 2,-26;
/M: SY='G'; M= -1, -3,-27, -2, -9,-28, 37,-15,-33, -9,-26,-18, 2,-17,-11,-10, 2,-12,-24,-24,-24,-10;
/M: SY='N'; M= -6, 4,-26, 4, 3,-21, -8, -3,-22, -1,-22,-13, 6, -2, 1, -3, 1, -4,-21,-26,-14, 1;
/M: SY='D'; M= -2, 4,-23, 5, -1,-20,-10, 0,-16, -6,-15,-10, 3,-11, -4, -8, -1, -6,-13,-28,-12, -4;
/M: SY='V'; M= -3, -6,-20, -7, -9, -4,-17,-12, -5,-12, -6, -5, -7,-16,-13,-13, -4, -3, 1,-22, -6,-11;
/I: I=-4; MD=-19;
/M: SY='B'; M= -8, 13,-21, 13, 3,-18, -8, -1,-18, -2,-18,-14, 12,-13, -1, -5, 3, -2,-16,-27,-10, 0; D=-4;
/I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='M'; M= -6, -9,-18,-11, -5, -6,-18, -6, -3, -7, 0, 1, -9,-13, -3, -6, -7, -3, -3,-14, -1, -5; D=-4;
/I: I=-4; DM=-19;
/M: SY='E'; M= -5, 6,-25, 8, 10,-27, -9, -3,-23, 4,-22,-14, 5, -5, 6, 0, 1, -5,-20,-29,-17, 7;
/M: SY='E'; M=-11, 0,-26, 1, 14,-14,-19, -4,-17, 3,-13, -8, -2,-11, 8, 2, -5, -6,-17,-22, -8, 11;
/M: SY='L'; M= -8,-25,-18,-29,-21, 5,-27,-19, 20,-26, 34, 18,-23,-27,-18,-19,-23, -9, 11,-22, -3,-20;
/M: SY='K'; M= -9, 3,-24, 3, 9,-22,-15, -1,-21, 10,-19,-10, 5,-13, 8, 10, -1, -4,-18,-26,-11, 7;
/M: SY='E'; M= -4, -4,-23, -4, 4,-17,-17, -8,-12, 2,-11, -6, -4,-13, 2, 1, -2, -3,-10,-23,-10, 2;
/M: SY='I'; M= -8,-28,-23,-34,-24, 5,-33,-23, 32,-27, 27, 22,-23,-23,-18,-24,-22, -9, 19,-19, 0,-24;
/M: SY='A'; M= 27, -9,-13,-15, -9,-19, 1,-18,-11,-11,-12,-10, -7,-12,-10,-16, 9, 2, -2,-24,-19,-10;
/M: SY='S'; M= -1, -4,-13, -7, -8,-16, 1,-12,-19,-10,-18,-13, 2,-16, -7, -9, 7, 2,-14,-24,-15, -8;
/M: SY='E'; M= -5, 0,-12, 0, 4,-23,-11,-11,-20, -2,-19,-13, -2, -5, -1, -7, -2, -6,-17,-29,-17, 1;
/M: SY='P'; M= -3, -1,-26, -2, -3,-21, -5, -7,-20, -3,-22,-13, 2, 8, -5, -6, 1, -5,-19,-28,-17, -6;
/I: I=-3; MD=-16;
/M: SY='B'; M= -3, 3,-22, 3, -1,-20, -3, -4,-19, -4,-17,-11, 3, -5, -4, -6, 1, -2,-15,-26,-14, -3; D=-3;
/I: I=-3; MD=-16;
/M: SY='G'; M= -3, 3,-21, 2, 2,-18, 8, -7,-20, -5,-18,-13, 5, -8, -3, -7, 2, -5,-18,-20,-13, -1; D=-3;
/I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='R'; M= -7, -4, -7, -5, -3,-12,-12, -6,-12, -2,-11, -7, -2,-12, -1, 2, -1, -2, -9,-21, -9, -3; D=-3;
/I: I=-3; DM=-16;
/M: SY='H'; M=-13, -5,-23, -7, -4, -9,-19, 22,-19, -1,-14, -5, 0,-14, -1, 6, -7, -9,-18,-20, 6, -5;
/M: SY='V'; M= 0,-16,-19,-21,-18, 3,-21,-15, 8,-16, 2, 1,-11,-21,-16,-16, -5, -1, 9,-17, 3,-18;
/M: SY='F'; M=-15,-22,-23,-26,-22, 38,-27, -9, 2,-20, 6, 1,-17,-26,-24,-16,-16, -8, 1, 3, 28,-22;
/M: SY='T'; M= -4, -7,-21,-11, -6, -8,-17, -9, -6, -6, -6, -4, -3,-17, -6, -5, -1, 3, -4,-23, -6, -6;
/M: SY='V'; M= -3,-10,-19,-11,-11, -8,-20,-16, 3,-12, 2, 1,-11,-18,-12,-12, -7, -3, 7,-26, -9,-12;
/M: SY='E'; M= -2, 5,-22, 6, 7,-24,-12, -4,-21, 1,-20,-14, 4, -3, 3, -2, 4, -1,-18,-29,-16, 4;
/M: SY='D'; M=-10, 27,-25, 35, 14,-31, -9, -2,-29, 0,-26,-22, 16, -8, 3, -6, 6, -3,-24,-36,-19, 8;
/M: SY='F'; M= -7,-20,-24,-23,-16, 13,-17,-15, -4,-16, -1, -2,-17,-20,-17,-14,-12, -8, -4, 5, 7,-15;
/M: SY='D'; M= -4, 11,-23, 12, 9,-25, -7, -5,-23, -1,-22,-17, 9, -7, 2, -5, 7, 2,-19,-32,-18, 5;
/M: SY='E'; M= 0, 1,-22, 2, 7,-21,-11, -5,-17, -3,-13,-10, 0,-11, 3, -5, 3, -2,-14,-28,-14, 4;
/I: I=-5; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-22,-32,-23, 7,-31,-22, 26,-27, 35, 19,-26,-26,-20,-21,-24, -9, 17,-20, 0,-22;
/M: SY='E'; M= -4, 5,-25, 6, 10,-26, -9, -2,-24, 6,-23,-14, 5, -6, 8, 2, 4, -3,-20,-28,-15, 8;
/M: SY='E'; M= -8, 12,-26, 14, 15,-29, -8, -2,-27, 6,-24,-16, 9, -7, 10, 1, 4, -4,-24,-30,-17, 12;
/I: I=-5; MI=0; MD=-28; IM=0; DM=-28;
/M: SY='L'; M= -8,-24,-21,-29,-21, 14,-27,-18, 14,-21, 17, 11,-19,-24,-18,-16,-16, -5, 9,-15, 4,-19;
/M: SY='L'; M= -9,-18,-23,-21,-14, 5,-23,-11, 4,-14, 6, 4,-15,-21, -9, -9,-11, -5, 1,-14, 6,-12;
/M: SY='D'; M= -6, 13,-23, 16, 12,-29, -8, -2,-27, 4,-25,-17, 10, -8, 7, -2, 5, -3,-23,-31,-17, 9;
/M: SY='E'; M= -4, 0,-24, -2, 6,-19,-15, -4,-18, 6,-16, -9, 1,-10, 5, 5, -1, -2,-16,-24,-11, 5;
/M: SY='I'; M= -7,-28,-21,-32,-24, 5,-31,-23, 28,-25, 25, 18,-25,-25,-20,-22,-20, -7, 23,-20, -2,-24;
/I: E1=0;
|
| Numerical results | |
|
|
| Comments | |
|
|
| Cross-references | |
| UniProtKB/Swiss-Prot | True positive hits:ANTR1_HUMAN (Q9H6X2), ANTR1_MOUSE (Q9CZ52), ANTR1_RAT (Q0PMD2), ANTR2_HUMAN (P58335), ANTR2_MOUSE (Q6DFX2), ANTRL_HUMAN (A6NF34), ANTRL_MACFA (Q4R7B7), ANTRL_MOUSE (Q8BVM2), BCHD_CHLP8 (O50313), BCHD_CHLTE (Q93SW0), BCHD_HELMO (Q9ZGE6), BCHD_RHOCB (P26175), BCHD_RHOS4 (O34845), BON1_ARATH (Q941L3), BON2_ARATH (Q5S1W2), BON3_ARATH (Q5XQC7), CA2D1_HUMAN (P54289), CA2D1_MOUSE (O08532), CA2D1_RABIT (P13806), CA2D1_RAT (P54290), CA2D2_HUMAN (Q9NY47), CA2D2_MOUSE (Q6PHS9), CA2D2_RAT (Q8CFG6), CA2D3_HUMAN (Q8IZS8), CA2D3_MOUSE (Q9Z1L5), CA2D3_RAT (Q8CFG5), CA2D4_HUMAN (Q7Z3S7), CA2D4_MOUSE (Q5RJF7), CAHD1_DROME (Q5BI42), CAHD1_HUMAN (Q5VU97), CAHD1_MOUSE (Q6PDJ1), CFAB_BOVIN (P81187), CFAB_GORGO (Q864V9), CFAB_HUMAN (P00751), CFAB_MOUSE (P04186), CFAB_PANTR (Q864W0), CFAB_PONPY (Q864W1), CHLD_ARATH (Q9SJE1), CHLD_ORYSI (B8AMB8), CHLD_ORYSJ (Q6ATS0), CHLD_PEA (O22437), CHLD_SYNE7 (O07345), CHLD_SYNY3 (P72772), CHLD_TOBAC (O24133), CL160_CAEBR (A8XP79), CL160_CAEEL (P34393), CLCA1_HORSE (Q2TU62), CLCA1_HUMAN (A8K7I4), CLCA1_MACMU (Q6PT52), CLCA1_MOUSE (Q9D7Z6), CLCA1_PIG (Q9TUB5), CLCA2_HUMAN (Q9UQC9), CLCA2_MOUSE (Q8BG22), CLCA4_HUMAN (Q14CN2), CLCA4_MOUSE (Q6Q473), CO2_BOVIN (Q3SYW2), CO2_GORGO (Q863A0), CO2_HUMAN (P06681), CO2_MOUSE (P21180), CO2_PANTR (Q8SQ74), CO2_PONPY (Q8SQ75), CO6A1_CHICK (P20785), CO6A1_HUMAN (P12109), CO6A1_MOUSE (Q04857), CO6A1_XENLA (Q801S8), CO6A2_CHICK (P15988), CO6A2_HUMAN (P12110), CO6A2_MOUSE (Q02788), CO6A3_CHICK (P15989), CO6A3_HUMAN (P12111), CO6A4_MOUSE (A2AX52), CO6A5_HUMAN (A8TX70), CO6A5_MOUSE (A6H584), CO6A6_HUMAN (A6NMZ7), CO6A6_MOUSE (Q8C6K9), CO7A1_HUMAN (Q02388), CO7A1_MOUSE (Q63870), COBT_PSEDE (P29934), COCA1_CHICK (P13944), COCA1_HUMAN (Q99715), COCA1_MOUSE (Q60847), COCA1_NOTVI (Q91145), COCA1_RABIT (Q28902), COCH_BOVIN (Q5EA64), COCH_CHICK (O42163), COCH_HUMAN (O43405), COCH_MOUSE (Q62507), COEA1_CHICK (P32018), COEA1_HUMAN (Q05707), COEA1_MOUSE (Q80X19), COKA1_HUMAN (Q9P218), COKA1_MOUSE (Q923P0), COLA1_HUMAN (Q96P44), COLA1_XENLA (Q641F3), COMA1_HUMAN (Q8NFW1), COSA1_HUMAN (Q2UY09), COSA1_MOUSE (Q2UY11), CPAS1_DICDI (Q75J93), CPNB_DICDI (Q86K21), CPND_DICDI (Q55GG1), CPNE5_HUMAN (Q9HCH3), CPNE5_MOUSE (Q8JZW4), CPNE6_HUMAN (O95741), CPNE6_MOUSE (Q9Z140), CPNE6_PONAB (Q5R4W6), CPNE7_HUMAN (Q9UBL6), CPNE7_MOUSE (Q0VE82), CPNE8_HUMAN (Q86YQ8), CPNE8_MOUSE (Q9DC53), CPNE9_HUMAN (Q8IYJ1), CPNE9_MOUSE (Q1RLL3), CPNE9_RAT (Q5BJS7), CPNE_DICDI (Q54FY7), CPNF_DICDI (Q1ZXB3), DIG1_CAEEL (Q09165), DX26B_HUMAN (Q5JSJ4), DX26B_MOUSE (Q8BND4), ECLC_BOVIN (P54281), INT6A_XENLA (Q2TAF4), INT6B_XENLA (Q5U4W6), INT6_DANRE (Q7SYD9), INT6_DICDI (Q54Z23), INT6_HUMAN (Q9UL03), INT6_MOUSE (Q6PCM2), ITA10_HUMAN (O75578), ITA11_HUMAN (Q9UKX5), ITA11_MOUSE (P61622), ITA1_CHICK (Q90615), ITA1_HUMAN (P56199), ITA1_MOUSE (Q3V3R4), ITA1_RAT (P18614), ITA2_BOVIN (P53710), ITA2_HUMAN (P17301), ITA2_MOUSE (Q62469), ITAD_HUMAN (Q13349), ITAD_MOUSE (Q3V0T4), ITAD_RAT (Q9QYE7), ITAE_HUMAN (P38570), ITAE_MOUSE (Q60677), ITAL_BOVIN (P61625), ITAL_HUMAN (P20701), ITAL_MOUSE (P24063), ITAM_HUMAN (P11215), ITAM_MOUSE (P05555), ITAX_HUMAN (P20702), ITAX_MOUSE (Q9QXH4), ITBN_DROME (Q27591), ITIH1_BOVIN (Q0VCM5), ITIH1_HUMAN (P19827), ITIH1_MESAU (P97278), ITIH1_MOUSE (Q61702), ITIH1_PIG (Q29052), ITIH2_HUMAN (P19823), ITIH2_MESAU (P97279), ITIH2_MOUSE (Q61703), ITIH2_PIG (O02668), ITIH3_BOVIN (P56652), ITIH3_HUMAN (Q06033), ITIH3_MESAU (P97280), ITIH3_MOUSE (Q61704), ITIH3_PONAB (Q5RB37), ITIH3_RABIT (Q9GLY5), ITIH3_RAT (Q63416), ITIH4_BOVIN (Q3T052), ITIH4_HUMAN (Q14624), ITIH4_MOUSE (A6X935), ITIH4_PIG (P79263), ITIH5_BOVIN (A2VE29), ITIH5_HUMAN (Q86UX2), ITIH5_MOUSE (Q8BJD1), ITIH5_PONAB (Q5RER0), ITIH6_HUMAN (Q6UXX5), MATN1_CHICK (P05099), MATN1_HUMAN (P21941), MATN1_MOUSE (P51942), MATN2_HUMAN (O00339), MATN2_MOUSE (O08746), MATN3_CHICK (O42401), MATN3_HUMAN (O15232), MATN3_MOUSE (O35701), MATN4_HUMAN (O95460), MATN4_MOUSE (O89029), MDN1_DICDI (Q869L3), MDN1_GIAIN (Q8T5T1), MDN1_HUMAN (Q9NU22), MDN1_SCHPO (O94248), MDN1_YEAST (Q12019), MUA3_CAEEL (P34576), NORD_BRUA2 (Q2YJT9), NORD_BRUAB (Q576X0), NORD_BRUME (Q8YBA4), NORD_BRUSU (Q8FX38), NORD_PSEST (Q52528), NRA1_CAEEL (Q9XUB9), PARP4_HUMAN (Q9UKK3), PIF_PINFU (C7G0B5), PIF_PINMG (H2A0N4), PIPSL_HUMAN (A2A3N6), PSMD4_ARATH (P55034), PSMD4_BOVIN (Q58DA0), PSMD4_DICDI (Q553E0), PSMD4_HUMAN (P55036), PSMD4_MOUSE (O35226), RPN10_SCHPO (O94444), RPN10_YEAST (P38886), SIBA_DICDI (Q54KF7), SIBB_DICDI (Q54JE1), SIBC_DICDI (Q54JA5), SIBE_DICDI (Q54JA3), SSL1_YEAST (Q04673), SSP2_PLAYO (Q01443), SVEP1_HUMAN (Q4LDE5), SVEP1_MOUSE (A2AVA0), SVEP1_RAT (P0C6B8), T2H2L_HUMAN (Q6P1K8), TF2H2_BOVIN (Q2TBV5), TF2H2_CAEEL (P34567), TF2H2_DICDI (Q86KZ2), TF2H2_HUMAN (Q13888), TF2H2_MOUSE (Q9JIB4), TF2H2_RAT (A0JN27), TFH47_SCHPO (O74995), TRAP_PLAFA (P16893), UBC4_MIMIV (Q5UQ40), UNC36_CAEBR (A8XP97), UNC36_CAEEL (P34374), VITRN_BOVIN (Q95LI2), VITRN_HUMAN (Q6UXI7), VITRN_MOUSE (Q8VHI5), VMA5A_HUMAN (O00534), VMA5A_MOUSE (Q99KC8), VW5B1_HUMAN (Q5TIE3), VW5B1_MOUSE (A9Z1V5), VWA1_BOVIN (A6QLN9), VWA1_HUMAN (Q6PCB0), VWA1_MOUSE (Q8R2Z5), VWA1_RAT (Q642A6), VWA2_HUMAN (Q5GFL6), VWA2_MOUSE (Q70UZ7), VWA2_XENLA (Q6DCQ6), VWA3A_HUMAN (A6NCI4), VWA3A_MOUSE (Q3UVV9), VWA3B_HUMAN (Q502W6), VWA5A_RAT (Q75WE7), VWA8_DANRE (B0R0T1), VWA8_HUMAN (A3KMH1), VWA8_MOUSE (Q8CC88), VWF_CANFA (Q28295), VWF_HUMAN (P04275), VWF_MOUSE (Q8CIZ8), VWF_PIG (Q28833), VWF_RAT (Q62935), Y103_SYNY3 (Q55874), Y1207_MYCPA (Q740Y5), Y1481_MYCTU (P64855), Y1490_MYCUA (A0PNU3), Y1491_MYCTA (A5U2I5), Y1517_MYCBO (P64856), Y1518_MYCBT (C1ANC7), Y1543_MYCBP (A1KIS1), Y173_BORBU (O51195), Y1808_MYCLB (B8ZS82), Y1808_MYCLE (Q9CBL9), Y2016_DICDI (Q54DV3), Y2028_DICDI (Q54DU5), Y2188_DICDI (Q54DL7), Y2288_MYCMM (B2HPD3), Y2455_MYCSS (Q1B971), Y246_TREPA (O83274), Y2492_MYCSJ (A3PZE9), Y2500_MYCSK (A1UFT9), Y2740_DICDI (Q54CQ8), Y2751_MYCVP (A1T8Q8), Y2850_MYCTU (O05809), Y335_MYCAV (O07395), Y3434_MYCPA (Q73UD4), Y3435_MYCPA (Q73UD3), Y3478_NOCFA (Q5YU15), Y3659_MYCGI (A4T9I4), Y5975_DICDI (Q54MG4), Y5981_DICDI (Q54MG1), Y6969_DICDI (C7G046), Y750_TREPA (O83731), Y7758_DICDI (Q55G98), Y892_ATV (Q3V4Q4), YCBR_BACSU (P42250), YEGL_ECOLI (P76396), YFBK_ECOLI (P76481), YOJO_BACSU (O31849), YR811_MIMIV (Q5UQ35), YWMC_BACSU (P70960), YWMD_BACSU (P70961)False negative hits (sequences which belong to the set under consideration, but which have not been picked up by the pattern or profile): CPNA2_CAEEL (Q09221), CPNA5_CAEEL (Q09219), CPNA_DICDI (Q7YXU4), CPNC_DICDI (Q54P51), CPNE1_HUMAN (Q99829), CPNE1_MOUSE (Q8C166), CPNE2_HUMAN (Q96FN4), CPNE2_MOUSE (P59108), CPNE3_HUMAN (O75131), CPNE3_MOUSE (Q8BT60), CPNE3_PONAB (Q5RAE1), CPNE4_HUMAN (Q96A23), CPNE4_MOUSE (Q8BLR2), CPNE6_BOVIN (Q2KHY1), HMCN1_HUMAN (Q96RW7), HMCN2_HUMAN (Q8NDA2), HMCN2_MOUSE (A2AJ76), ITB1A_XENLA (P12606), ITB1B_XENLA (P12607), ITB1_BOVIN (P53712), ITB1_CAMBA (A5Z1X6), ITB1_CHICK (P07228), ITB1_FELCA (P53713), ITB1_HUMAN (P05556), ITB1_MOUSE (P09055), ITB1_PIG (Q9GLP0), ITB1_PONAB (Q5RCA9), ITB1_RAT (P49134), ITB1_SHEEP (B0FYY4), ITB2L_MOUSE (Q3UV74), ITB2_BOVIN (P32592), ITB2_CAPHI (Q5VI41), ITB2_HUMAN (P05107), ITB2_MOUSE (P11835), ITB2_OVICA (Q2VJ42), ITB2_PIG (P53714), ITB2_SHEEP (Q6ECI6), ITB3_HUMAN (P05106), ITB3_MOUSE (O54890), ITB4_HUMAN (P16144), ITB4_MOUSE (A2A863), ITB4_RAT (Q64632), ITB5_BOVIN (P80747), ITB5_HUMAN (P18084), ITB5_MOUSE (O70309), ITB5_PAPCY (Q07441), ITB6_BOVIN (Q8SQB8), ITB6_CAVPO (P18563), ITB6_HUMAN (P18564), ITB6_MOUSE (Q9Z0T9), ITB6_PIG (Q1RPR6), ITB6_RAT (Q6AYF4), ITB6_SHEEP (Q863C4), ITB7_HUMAN (P26010), ITB7_MOUSE (P26011), ITB8_HUMAN (P26012), ITB8_RABIT (P26013), ITBX_DROME (P11584), NRA1_CAEBR (A8WMY4), PAT3_CAEEL (Q27874), PSMD4_DROME (P55035), PSMD4_SCHMA (O17453), RGLG1_ARATH (Q9SS90), RGLG2_ARATH (Q9LY87), SIBD_DICDI (Q54JA4), VW5B2_HUMAN (Q8N398), VW5B2_MOUSE (Q3UR50), VWA3A_RAT (A1A5Q7), VWA7_BOVIN (Q0V8J4), VWA7_HUMAN (Q9Y334), VWA7_MOUSE (Q9JHA8), VWA7_RAT (Q6MG64), VWA9_BOVIN (Q5EA76), VWA9_CHICK (Q5ZK21), VWA9_HUMAN (Q96SY0), VWA9_MOUSE (Q8R3P6), VWA9_RAT (Q66H58), VWA9_XENTR (Q66KD9), VWKA_DICDI (Q6B9X6)`Potential' hits (partial sequences which belong to the set under consideration, but which are not hit by the pattern or profile because they are partial (fragment) sequences): COCH_CAVPO (P84552)Sequences which could potentially belong to the set under consideration: MED25_DANRE (Q6PEH8), MED25_XENLA (Q6GP15), MED25_XENTR (A4IHD9), Y525_PSEAE (Q51484), Y811_METJA (Q58221), YABS_BACSU (P37561)False positive hits (sequences which do not belong to the set under consideration): DER_MYCPU (Q98RC1), KU70_RHIAP (Q26228), KU80_ASPFU (Q4WI96), KU80_ASPOR (Q2MHH2), KU80_ASPSO (Q2MHH1), KU80_COCIM (Q1E6K9), KU80_EMENI (Q5B4H8), KU80_NEUCR (Q7RX73), KU80_PHANO (Q0U8L4)Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view]
[Clustal format, color]
[Clustal format, plain text]
[Fasta format]
|
| PDB [Detailed view] |
1AO3; 1AOX; 1ATZ; 1AUQ; 1BHO; 1BHQ; 1CK4; 1CQP; 1DGQ; 1DZI; 1FE8; 1FNS; 1IDN; 1IDO; 1IJ4; 1IJB; 1IJK; 1JLM; 1LFA; 1M10; 1M1U; 1MF7; 1MHP; 1MJN; 1MQ8; 1MQ9; 1MQA; 1N3Y; 1N9Z; 1NA5; 1OAK; 1PQB; 1PT6; 1Q0P; 1QC5; 1QCY; 1RD4; 1RRK; 1RS0; 1RTK; 1SHT; 1SHU; 1SQ0; 1T0P; 1T6B; 1TZN; 1U0N; 1U0O; 1UEX; 1V7P; 1XDD; 1XDG; 1XUO; 1ZON; 1ZOO; 1ZOP; 2ADF; 2B2X; 2I6Q; 2I6S; 2ICA; 2O7N; 2ODP; 2ODQ; 2OK5; 2WIN; 2X31; 2X5N; 2XWB; 2XWJ; 3BN3; 3BQM; 3BQN; 3E2M; 3EOA; 3EOB; 3F74; 3F78; 3GXB; 3HI6; 3HRZ; 3HS0; 3HXO; 3HXQ; 3K6S; 3K71; 3M6F; 3N2N; 3PPV; 3PPW; 3PPX; 3PPY; 3Q3G; 3QA3; 3TCX; 3ZQK; 4A0Q; 4B4T; 4DMU; |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)