PROSITE entry PS50268
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | CADHERIN_2 |
Accession [info] | PS50268 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-DEC-2001 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC00205 |
Associated ProRule [info] | PRU00043 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Cadherins domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=106; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=101; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.8381; R2=0.02192269; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=350; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=259; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-60; B1=-60; E0=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='T'; M= -7, -6,-23, -6, -2, -8,-19,-12,-10, -8, -9, -8, -6, -7, -6, -7, -2, 2, -8,-21, -7, -4; /M: SY='P'; M= -4, -8,-27, -7, 2,-21,-18, -7,-15, -3,-17, -9, -8, 5, 5, -6, -4, -6,-17,-14,-12, 3; /M: SY='S'; M= -3, -6,-23, -6, -1,-16,-14,-11,-12, -5,-14, -9, -4, -3, -3, -7, 1, 0,-11,-23,-12, -2; /M: SY='P'; M= -4,-11,-24,-12, -6,-13,-19,-16, -5, -9,-11, -7, -9, 8, -9,-12, -2, 1, -5,-26,-13, -9; /M: SY='Y'; M=-13,-14,-26,-16, -9, 6,-23, 0, -8, -2, -7, -3,-12,-15, -4, 0,-12, -7,-11, -1, 24, -9; /M: SY='E'; M= -7, -4,-23, -4, 3,-14,-18, -5,-13, -4,-13, -9, -3, -5, -1, -3, 0, 1,-11,-24, -7, 0; /M: SY='V'; M= 1,-20,-15,-25,-20, 1,-13,-21, 4,-19, -1, 0,-15,-20,-20,-19, -7, -5, 8,-20, -7,-20; /M: SY='S'; M= -3, -4,-20, -5, 4,-14,-16, -7,-14, -1,-15,-10, -1,-13, 1, 0, 6, 5, -9,-26,-10, 2; /M: SY='V'; M= -5,-27,-19,-31,-25, 3,-31,-25, 29,-23, 16, 13,-23,-25,-22,-21,-14, -4, 30,-24, -4,-25; /M: SY='P'; M= -6,-10, 2,-10, -3,-21,-17,-14,-19, -8,-19,-12, -9, 4, -5,-11, -1, -4,-16,-32,-19, -5; /M: SY='E'; M=-10, 10,-29, 18, 49,-29,-18, -1,-29, 9,-21,-19, 2, -2, 17, 0, 1, -9,-28,-29,-19, 33; /M: SY='N'; M= -8, 20,-22, 15, 3,-22, -1, 0,-24, -2,-24,-17, 25,-15, 0, -2, 6, -2,-24,-33,-17, 1; /M: SY='A'; M= 7, -5,-16, -9, -3,-17,-11,-12,-10, -7,-12, -9, -1,-10, -4, -9, 7, 4, -6,-28,-15, -4; /M: SY='P'; M= -3,-10,-27, -9, -1,-21,-13,-12,-14, -1,-15, -8, -9, 10, -3, -4, -5, -7,-13,-26,-17, -4; /M: SY='P'; M= -3,-11,-24,-11, -7,-17,-14,-15, -5,-10,-11, -6, -9, 3, -9,-13, -4, -4, -3,-27,-16,-10; /M: SY='G'; M= -4, -4,-27, -4,-10,-23, 25,-12,-27,-11,-25,-16, 3, -7,-12,-12, 0,-11,-22,-25,-21,-12; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='T'; M= -1, -4,-16, -8, -2, -9,-16,-10,-11, -6,-12, -9, -2, -9, -2, -7, 8, 14, -7,-22, -8, -2; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: M= -6,-14,-22,-14, -6, -8,-19,-14, -1, -9, -4, -2,-12, -2, -8,-10, -5, -3, -1,-21, -7, -8; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='V'; M= -4,-21,-14,-23,-19, 1,-23,-18, 21,-16, 12, 9,-18,-20,-16,-15,-11, -4, 23,-18, -3,-19; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='M'; M= -1,-12,-16,-15,-12, -9, -6,-10, -1,-13, 2, 5,-10,-17, -6,-12, -6, -4, 0,-19, -8, -9; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='R'; M= -6, -6,-21, -9, -5,-16,-14, -8,-10, -2,-12, -6, -2,-14, 1, 2, 0, 2, -7,-24,-10, -3; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='I'; M= -7,-26,-20,-29,-24, 5,-30,-21, 24,-21, 18, 13,-23,-25,-20,-18,-17, -6, 22,-20, 1,-23; /M: SY='T'; M= -3, -4,-18, -8, -4,-15,-15, -9,-12, -1,-13, -7, 0,-14, -1, -1, 5, 9, -8,-27,-10, -3; /M: SY='A'; M= 29,-13,-14,-20,-12,-16,-10,-17, -2,-10, -7, -5,-12,-13,-10,-16, 4, -1, 5,-22,-15,-11; /M: SY='T'; M= -4, -8,-18,-12, -8,-10,-21,-12, -2, -9, -6, -3, -6,-16, -6, -7, 3, 12, 2,-26, -7, -8; /M: SY='D'; M=-19, 43,-28, 60, 19,-37,-11, 2,-37, 0,-29,-27, 18,-10, 2, -9, 0,-10,-29,-38,-18, 10; /M: SY='P'; M= 4,-10,-25, -9, 0,-21,-14,-11,-16, 2,-15, -9, -9, 9, -1, -2, -3, -6,-14,-23,-15, -2; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='D'; M=-18, 45,-28, 62, 20,-37,-10, 0,-37, 1,-28,-28, 18, -9, 1, -8, 0, -9,-28,-37,-19, 11; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='E'; M= -5, -1,-18, 1, 4,-15,-14,-10, -8, -5, -5, -6, -4,-12, -2, -6, -2, -1, -7,-24,-11, 0; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='G'; M= 1, -5,-17, -6, -5,-15, 4,-10,-15, -7,-14,-10, -3, -1, -7, -8, 3, 1,-11,-19,-13, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='N'; M= -3, 2,-21, 0, 1,-18, -7, -3,-14, -3,-14, -8, 5, -4, 2, -3, 1, -3,-15,-24,-13, 1; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='N'; M= -4, 12,-23, 5, -3,-21, 2, 1,-21, -6,-23,-15, 21,-10, -3, -7, 5, -4,-22,-29,-16, -4; /M: SY='G'; M= 1, -7,-25, -9, -7,-19, 3, -9,-19,-10,-19,-12, -2,-11, -3,-11, 1, -6,-18, -9,-12, -5; /M: SY='K'; M= -6, -5,-25, -6, 1,-20,-13, -8,-17, 5,-17, -9, -2, -3, 2, 5, -1, -1,-14,-25,-13, 0; /M: SY='I'; M= -2,-25,-19,-30,-24, 11,-26,-22, 19,-23, 13, 8,-21,-23,-23,-21,-13, -5, 19,-17, 2,-24; /M: SY='R'; M= -6, -8,-23,-10, -5,-12,-19, -8,-12, 1,-13, -7, -4,-10, -3, 5, -1, 1, -7,-23, -7, -6; /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23, 44,-30, 8, 0,-16, 3, 0,-20,-30,-19,-13,-20,-10, -7, 24, 65,-23; /M: SY='S'; M= -2, -3,-19, -4, 2,-16,-13, -7,-17, 1,-19,-12, 2,-13, 3, 4, 11, 7,-11,-28,-11, 2; /M: SY='I'; M= -7,-27,-25,-34,-24, 4,-33,-24, 31,-24, 24, 17,-22,-23,-19,-22,-21, -9, 20,-19, 0,-24; /M: SY='T'; M= -3,-11,-20,-12, -7,-11,-18,-14, -2,-11, -1, -2,-10,-13, -8,-11, -3, 1, 0,-26,-10, -8; /M: SY='G'; M= -4, 0,-25, 0, 1,-22, 4, -8,-23, -4,-19,-13, 3, -9, -1, -4, 3, -5,-20,-26,-16, -1; /M: SY='G'; M= -6, 3,-26, 6, 1,-27, 10, -7,-27, -5,-24,-16, 4, -9, 0, -7, 3, -6,-22,-28,-19, 0; /M: SY='N'; M= -7, 7,-25, 7, 2,-23, -2, -2,-23, -7,-22,-16, 8, 0, -3, -9, 2, -5,-22,-30,-17, -2; /I: I=-3; MD=-17; /M: SY='P'; M= 2, -3,-24, 0, 3,-23, -5,-12,-17, -7,-18,-13, -5, 6, -5,-12, 0, -5,-14,-26,-18, -2; D=-3; /I: I=-3; MD=-17; /M: SY='D'; M= -3, 6,-18, 8, 4,-19, -5, -4,-17, -2,-15,-11, 4, -7, -1, -4, 3, -2,-13,-24,-13, 1; D=-3; /I: I=-3; MD=-17; /M: SY='D'; M= -4, 3,-12, 4, 3,-11, -6, -4, -8, -2, -7, -5, 1, -7, 0, -3, 0, -1, -6,-15, -7, 1; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='G'; M= -5, -1,-21, -2, -3,-19, 7, -5,-20, -1,-18,-10, 5,-10, -2, 1, -1, -7,-17,-20,-14, -3; D=-3; /I: I=-3; DM=-17; /M: SY='Y'; M=-11,-10,-26,-15,-12, -4,-20, -4, -3,-11, -4, 1, -5,-18, -7, -9,-12, -8, -8, -3, 3,-10; /M: SY='F'; M=-19,-31,-24,-38,-28, 60,-29,-22, 0,-28, 9, -1,-24,-30,-34,-20,-24,-13, -2, 26, 26,-27; /M: SY='T'; M= -2, -3,-19, -6, -2,-15,-15, -8,-14, 0,-15, -9, 0,-14, -2, 1, 7, 9, -8,-26, -9, -3; /M: SY='I'; M= -6,-28,-22,-35,-27, 0,-35,-27, 37,-26, 20, 17,-23,-23,-21,-25,-18, -7, 28,-22, -3,-27; /M: SY='D'; M=-10, 20,-24, 21, 13,-25,-11, 3,-24, 0,-22,-17, 16,-13, 4, -3, 4, -1,-21,-33,-15, 8; /M: SY='P'; M= -6, -3,-25, -1, 4,-22,-16,-10,-19, 4,-20,-13, -3, 7, 0, 2, 1, 3,-16,-27,-14, 0; /M: SY='B'; M= -8, 12,-23, 12, 5,-20,-13, -4,-16, -2,-15,-12, 10,-15, -1, -5, 0, -3,-14,-30,-13, 1; /I: I=-3; MD=-17; /M: SY='T'; M= -2, 6,-16, 2, -1,-18,-11, -9,-17, -4,-19,-14, 8, -4, -3, -6, 12, 18,-13,-30,-15, -3; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='G'; M= -1, -7,-26, -6,-13,-25, 43,-17,-29,-16,-22,-16, -1,-18,-16,-17, -1,-14,-21,-21,-24,-15; D=-3; /I: I=-3; DM=-17; /M: SY='I'; M= -7,-11,-23,-13, -9, -9,-22,-13, 5,-10, -2, 1, -9,-18, -7, -9, -7, -4, 4,-17, -5, -9; D=-3; /I: I=-3; DM=-17; /M: SY='I'; M= -5,-24,-20,-28,-21, 0,-29,-22, 24,-22, 20, 12,-20,-23,-18,-18,-15, -4, 19,-22, -3,-21; D=-3; /I: I=-3; DM=-17; /M: SY='T'; M= -4, -6,-15,-10, -5, -9,-18, -9,-11, -3,-12, -7, -2,-16, -3, -3, 5, 11, -6,-23, -4, -5; D=-3; /I: I=-3; DM=-17; /M: SY='V'; M= -2,-16,-13,-20,-17, -5,-22,-18, 6,-15, 5, 2,-14,-19,-15,-13, -3, 9, 10,-26, -7,-17; /M: SY='T'; M= 0, -8,-18,-12, -8,-12,-16,-12, -7, -3, -8, -5, -4,-16, -5, -2, 2, 7, -2,-24, -9, -7; /M: SY='K'; M= -4, -4,-25, -5, 1,-21,-11, -8,-20, 12,-17, -9, -1,-11, 1, 11, -4, -5,-15,-22,-13, 0; /M: SY='P'; M= -4, -9,-26, -8, -3,-21, -8,-12,-16, -3,-19,-11, -5, 9, -4, -4, -1, -4,-14,-26,-17, -5; /M: SY='L'; M= -9,-28,-21,-30,-21, 11,-29,-20, 19,-26, 34, 16,-26,-25,-20,-20,-24, -9, 12,-18, 1,-21; /M: SY='D'; M=-16, 34,-28, 46, 13,-33,-10, -2,-32, 0,-24,-23, 16,-11, 0, -7, 0, -7,-25,-36,-18, 6; /M: SY='R'; M=-17,-13,-27,-14, -6, -1,-22, 0,-19, 12,-11, -6, -6,-21, 0, 35,-12, -9,-15,-10, 8, -7; /M: SY='E'; M= -9, 6,-29, 14, 46,-29,-18, 0,-27, 8,-17,-16, -1, -3, 19, 0, -2,-10,-27,-28,-18, 33; /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='E'; M= -4, -1,-21, -1, 10,-20,-16, -6,-15, 6,-12, -7, -2, -9, 6, 1, -1, -1,-12,-24,-12, 8; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='K'; M= -6, -3,-20, -7, -4,-12,-16, -5, -9, 2,-11, -4, 1,-15, 0, 2, -3, -2, -8,-20, -4, -3; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='D'; M= -2, 6,-24, 7, 5,-26, -1, -6,-24, 1,-23,-16, 6, -4, 2, -2, 5, -4,-20,-28,-18, 3; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='Q'; M= -7, -7,-23, -8, 0,-12,-20, -6, -8, -3, -9, -4, -5,-16, 2, -3, -3, -2, -7,-18, -5, 0; /M: SY='Y'; M=-18,-20,-25,-21,-20, 27,-29, 17, -1,-13, 1, 1,-18,-29,-13,-11,-18,-10, -7, 17, 60,-20; /M: SY='N'; M= -6, 1,-21, -1, 2,-16,-17, -2,-12, -3,-12, -8, 4,-15, 1, -2, 2, 4,-10,-28, -9, 1; /M: SY='L'; M= -6,-29,-20,-32,-23, 10,-29,-23, 23,-27, 33, 16,-26,-27,-22,-21,-23, -8, 17,-19, 0,-23; /M: SY='T'; M= -7, -9,-23,-12, -6,-10,-21, -9, -7, -7,-10, -5, -7, -2, -5, -6, -1, 5, -6,-23, -6, -7; /M: SY='V'; M= -1,-27,-17,-32,-26, 1,-28,-26, 28,-23, 14, 12,-23,-25,-23,-23,-13, -5, 29,-23, -5,-26; /M: SY='M'; M= -7,-11,-23,-13, -2,-12,-19, -7, -6, -3, -2, 1,-10,-17, 0, -1, -7, -4, -5,-22, -6, -2; /M: SY='A'; M= 25,-18,-11,-24,-18,-11,-13,-23, 6,-16, 1, -1,-16,-18,-17,-21, 0, -1, 14,-23,-14,-18; /M: SY='T'; M= 0, -8,-18,-12, -5,-14,-17,-14, -7, -4, -9, -5, -5,-14, -3, -3, 6, 11, -1,-27,-11, -5; /M: SY='D'; M=-16, 42,-26, 52, 15,-34, -9, 0,-33, 0,-28,-26, 24,-12, 0, -8, 3, -5,-27,-39,-19, 8; /M: SY='N'; M= -2, -2,-22, -4, 0,-19, -8, -5,-16, -2,-15, -6, 1,-11, 1, 0, 1, -4,-14,-26,-13, 0; /I: I=-3; MD=-17; /M: SY='G'; M= 1, 2,-24, 2, -4,-25, 19, -6,-26, -9,-21,-14, 4,-15, -4,-10, 2,-10,-20,-24,-19, -5; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='N'; M= -3, -4,-18, -6, -6,-13, -1, -8,-10, -6,-11, -6, 1,-10, -4, -6, 1, -3, -9,-19, -9, -6; D=-3; /I: I=-3; DM=-17; /M: SY='P'; M= -7, -8,-24, -6, -1,-15,-12, -6,-15, -2,-17,-10, -6, 20, -3, -4, -4, -5,-16,-19,-10, -4; D=-3; /I: I=-3; DM=-17; /M: SY='P'; M= -3, -6,-25, -6, -5,-22, 3,-12,-19, -8,-21,-14, -2, 9, -7,-10, 1, -4,-17,-26,-19, -8; D=-3; /I: I=-3; DM=-17; /M: SY='L'; M= -6,-15,-22,-16, -7, -8,-21,-13, -4, -4, 3, 3,-13,-13, -3, -2,-12, -6, -4,-20, -7, -6; D=-3; /I: I=-3; DM=-17; /M: SY='S'; M= -1, -1,-18, -1, 6,-17,-13, -9,-17, -3,-17,-12, 0,-10, 1, -5, 13, 11,-11,-29,-13, 3; /M: SY='S'; M= 3, 0,-13, -3, -5,-20, 2,-11,-20, -8,-21,-15, 5,-13, -4,-10, 11, 3,-15,-29,-16, -5; /M: SY='T'; M= -4, -7,-20,-10, -4,-13,-21,-15, -8, -7,-10, -7, -6, -1, -6, -7, 4, 17, -4,-26,-11, -6; /M: SY='A'; M= 10,-11,-10,-16,-13,-14, -5,-17, -7,-14, -8, -6, -7,-17,-12,-16, 6, 7, 0,-27,-15,-13; /M: SY='T'; M= -6, -4,-21, -6, -2,-14,-20,-11, -9, -5,-10, -6, -4, -6, -3, -7, 3, 12, -6,-26, -9, -3; /M: SY='V'; M= -4,-28,-14,-31,-25, 6,-30,-25, 24,-25, 24, 13,-26,-27,-24,-22,-18, -6, 26,-23, -4,-25; /M: SY='T'; M= -7, -6,-21,-10, -8,-10,-19, -9, -5, -6, -7, -4, -2,-16, -6, -3, -1, 6, -3,-24, -6, -8; /M: SY='I'; M= -3,-29,-19,-34,-29, 1,-33,-29, 36,-25, 16, 14,-24,-25,-24,-25,-15, -5, 36,-24, -5,-29; /M: SY='R'; M= -8, 0,-23, -4, -1,-17,-18, -1,-14, 4,-15, -7, 4,-14, 1, 5, 1, 4,-11,-25, -7, -1; /M: SY='V'; M= -3,-29,-15,-31,-28, 1,-31,-28, 31,-23, 17, 13,-27,-28,-26,-21,-14, -3, 39,-27, -7,-28; /M: SY='C'; M= -8,-12, 5,-14, -6,-12,-25,-14, -6,-14, 0, -3,-13,-20, -8,-14, -9, -3, -5,-29,-11, -8; /M: SY='D'; M=-16, 38,-29, 53, 16,-36, -7, -2,-36, 0,-28,-26, 16, -9, 0, -8, 1, -9,-28,-37,-19, 8; /M: SY='V'; M= -4,-17, 8,-21,-15,-11,-25,-21, 4,-16, -3, -1,-17,-23,-14,-18, -7, -4, 11,-30,-13,-15; /M: SY='N'; M=-11, 34,-22, 23, 5,-23, -3, 7,-22, -1,-28,-20, 44,-17, 1, -2, 8, -2,-27,-38,-19, 3; /M: SY='D'; M=-14, 31,-28, 44, 20,-33, -8, 0,-33, 0,-25,-23, 13,-10, 2, -8, 1, -8,-26,-35,-18, 11; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='N'; M= -8, 22,-18, 11, 1,-18, -2, 13,-20, -1,-23,-14, 33,-16, 2, 0, 5, -3,-24,-31,-12, 1; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='A'; M= 7,-11,-20,-11, -5,-19, -7,-14,-14, -8,-14,-10, -9, 7, -8,-11, -1, -5,-12,-23,-17, -8; D=-4; /I: I=-4; DM=-22; /M: SY='P'; M=-10,-16,-38, -7, 2,-29,-19,-18,-21, -8,-28,-19,-17, 76, -8,-17, -9,-10,-29,-29,-28, -7; /M: SY='V'; M= -5,-12,-18,-14, -4,-11,-22,-13, -1, -4, -6, -1,-10,-17, -4, -4, -5, -1, 2,-23, -7, -5; /M: SY='F'; M=-15,-25,-21,-32,-23, 46,-26,-20, 2,-25, 7, 1,-18,-20,-29,-19,-16, -7, 1, -3, 14,-24; /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 2'381 in 342 different sequences |
Number of true positive hits | 2'379 in 340 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 2 in 2 different sequences |
Number of false negative sequences | 0 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 99.92 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Archaea, Eukaryotes |
Maximum number of repetitions [info] | 34 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | K_Hofmann, N_Hulo |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | Cadherin |
Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
340 sequences
CAD10_CHICK (P79995), CAD10_HUMAN (Q9Y6N8), CAD10_MOUSE (P70408), CAD11_CHICK (O93319), CAD11_HUMAN (P55287), CAD11_MOUSE (P55288), CAD12_HUMAN (P55289), CAD12_MOUSE (Q5RJH3), CAD13_BOVIN (Q3B7N0), CAD13_CHICK (P33150), CAD13_HUMAN (P55290), CAD13_MOUSE (Q9WTR5), CAD13_PONAB (Q5R5W6), CAD15_HUMAN (P55291), CAD15_MOUSE (P33146), CAD16_HUMAN (O75309), CAD16_MOUSE (O88338), CAD16_RABIT (Q28634), CAD17_HUMAN (Q12864), CAD17_MOUSE (Q9R100), CAD17_RAT (P55281), CAD18_BOVIN (Q08DJ5), CAD18_HUMAN (Q13634), CAD19_HUMAN (Q9H159), CAD20_CHICK (Q8QGH3), CAD20_HUMAN (Q9HBT6), CAD20_MOUSE (Q9Z0M3), CAD20_RAT (Q5DWV1), CAD20_XENLA (Q91838), CAD22_HUMAN (Q9UJ99), CAD22_MOUSE (Q9WTP5), CAD22_RAT (Q63315), CAD23_HUMAN (Q9H251), CAD23_MOUSE (Q99PF4), CAD23_RAT (P58365), CAD24_HUMAN (Q86UP0), CAD24_MOUSE (Q6PFX6), CAD26_HUMAN (Q8IXH8), CAD26_MOUSE (P59862), CAD2A_XENLA (P33147), CAD2B_XENLA (P20310), CAD86_DROME (Q9VGW1), CAD87_DROME (Q9VGG5), CAD89_DROME (Q9VEU1), CAD96_DROME (Q9VBW3), CAD99_DROME (Q9VAF5), CADE_DROME (Q24298), CADH1_ANOGA (A0A1S4GGP7), CADH1_BOVIN (Q6R8F2), CADH1_CANLF (F1PAA9), CADH1_CHICK (P08641), CADH1_DANRE (Q90Z37), CADH1_HUMAN (P12830), CADH1_MOUSE (P09803), CADH1_PONAB (Q5RAX1), CADH1_RAT (Q9R0T4), CADH1_XENLA (P30944), CADH2_BOVIN (P19534), CADH2_CALJA (B0KW95), CADH2_CHICK (P10288), CADH2_CRIGR (O55075), CADH2_DANRE (Q90275), CADH2_HUMAN (P19022), CADH2_MOUSE (P15116), CADH2_OTOGA (B4USZ0), CADH2_PONAB (Q5R9X1), CADH2_RAT (Q9Z1Y3), CADH2_RHIFE (B2KI42), CADH3_BOVIN (P19535), CADH3_CAEEL (P34616), CADH3_HUMAN (P22223), CADH3_MOUSE (P10287), CADH3_PIG (O18926), CADH4_CAEEL (Q19319), CADH4_CHICK (P24503), CADH4_HUMAN (P55283), CADH4_MOUSE (P39038), CADH4_RAT (Q63149), CADH4_XENLA (P79883), CADH5_BOVIN (Q6URK6), CADH5_CHICK (Q8AYD0), CADH5_DANRE (Q68SP4), CADH5_HUMAN (P33151), CADH5_MOUSE (P55284), CADH5_PIG (O02840), CADH6_BOVIN (Q3SWX5), CADH6_CHICK (Q90762), CADH6_HUMAN (P55285), CADH6_MOUSE (P97326), CADH6_RAT (P55280), CADH7_CHICK (Q90763), CADH7_HUMAN (Q9ULB5), CADH7_MOUSE (Q8BM92), CADH7_RAT (Q5DWV2), CADH8_HUMAN (P55286), CADH8_MOUSE (P97291), CADH8_RAT (O54800), CADH9_HUMAN (Q9ULB4), CADH9_MOUSE (P70407), CADHB_XENLA (P33152), CADHF_XENLA (P33148), CADHK_CHICK (P33145), CADN2_DROME (Q9VJB6), CADN_DROME (O15943), CASY1_CAEEL (G5ED46), CDHR1_BOVIN (Q8WN91), CDHR1_CHICK (Q8UVJ7), CDHR1_DANRE (Q6B3P0), CDHR1_HUMAN (Q96JP9), CDHR1_MOUSE (Q8VHP6), CDHR1_RAT (Q91XU7), CDHR1_XENLA (Q6B457), CDHR2_HUMAN (Q9BYE9), CDHR2_MOUSE (E9Q7P9), CDHR3_HUMAN (Q6ZTQ4), CDHR3_MOUSE (Q8BL00), CDHR4_HUMAN (A6H8M9), CDHR5_HUMAN (Q9HBB8), CDHR5_MOUSE (Q8VHF2), CDHR5_RAT (Q9JIK1), CELR1_HUMAN (Q9NYQ6), CELR1_MOUSE (O35161), CELR2_HUMAN (Q9HCU4), CELR2_MOUSE (Q9R0M0), CELR2_RAT (Q9QYP2), CELR3_HUMAN (Q9NYQ7), CELR3_MOUSE (Q91ZI0), CELR3_RAT (O88278), CELR_CAEEL (G5EDK5), CSTN1_DANRE (F1R520), CSTN1_DROME (Q9V498), CSTN1_HUMAN (O94985), CSTN1_MOUSE (Q9EPL2), CSTN1_RAT (Q6Q0N0), CSTN2_DANRE (B0S5G3), CSTN2_HUMAN (Q9H4D0), CSTN2_MOUSE (Q9ER65), CSTN2_RAT (Q8VDA1), CSTN3_BOVIN (Q0VCN6), CSTN3_DANRE (A0A8M9PFP2), CSTN3_HUMAN (Q9BQT9), CSTN3_MOUSE (Q99JH7), CSTN3_PONAB (Q5R9Q9), CSTN3_RAT (Q8R553), DSC1_BOVIN (Q01107), DSC1_HUMAN (Q08554), DSC1_MOUSE (P55849), DSC2L_DANRE (F1QSQ0), DSC2_BOVIN (P33545), DSC2_HUMAN (Q02487), DSC2_MOUSE (P55292), DSC3_BOVIN (Q28060), DSC3_HUMAN (Q14574), DSC3_MOUSE (P55850), DSG1A_MOUSE (Q61495), DSG1B_MOUSE (Q7TSF1), DSG1C_MOUSE (Q7TSF0), DSG1_BOVIN (Q03763), DSG1_CANLF (Q9GKQ8), DSG1_HUMAN (Q02413), DSG1_PIG(Q3BDI7), DSG21_DANRE (H2EQR6), DSG2L_DANRE (A0A8M2BIB6), DSG2_HUMAN (Q14126), DSG2_MOUSE (O55111), DSG3_CANLF (Q7YRU7), DSG3_HUMAN (P32926), DSG3_MOUSE (O35902), DSG4_HUMAN (Q86SJ6), DSG4_MOUSE (Q7TMD7), DSG4_RAT(Q6W3B0), DS_DROME(Q24292), FAT1_HUMAN (Q14517), FAT2_DROME (Q9VW71), FAT2_HUMAN (Q9NYQ8), FAT2_MOUSE (Q5F226), FAT2_RAT(O88277), FAT3_HUMAN (Q8TDW7), FAT3_MOUSE (Q8BNA6), FAT3_RAT(Q8R508), FAT4_HUMAN (Q6V0I7), FAT4_MOUSE (Q2PZL6), FAT_DROME (P33450), HMR1_CAEEL (Q967F4), HMU_HALWD (Q18DN4), PC11X_GORGO (Q6X862), PC11X_HUMAN (Q9BZA7), PC11X_PANPA (Q6WYY1), PC11X_PANTR (Q71M42), PC11X_PIG (Q6KEQ9), PC11X_PONPY (Q6WXV7), PC11Y_HUMAN (Q9BZA8), PCD10_HUMAN (Q9P2E7), PCD12_HUMAN (Q9NPG4), PCD12_MOUSE (O55134), PCD15_CHICK (Q0ZM14), PCD15_HUMAN (Q96QU1), PCD15_MOUSE (Q99PJ1), PCD16_HUMAN (Q96JQ0), PCD16_MOUSE (E9PVD3), PCD16_RAT (D4ACX8), PCD17_HUMAN (O14917), PCD18_BOVIN (A7MB46), PCD18_HUMAN (Q9HCL0), PCD18_MOUSE (Q8VHR0), PCD19_DANRE (F8W3X3), PCD19_HUMAN (Q8TAB3), PCD19_MOUSE (Q80TF3), PCD20_HUMAN (Q8N6Y1), PCD20_MOUSE (Q8BIZ0), PCD23_HUMAN (Q6V1P9), PCDA1_HUMAN (Q9Y5I3), PCDA1_PANTR (Q5DRF5), PCDA2_HUMAN (Q9Y5H9), PCDA2_PANTR (Q5DRF0), PCDA3_HUMAN (Q9Y5H8), PCDA3_PANTR (Q5DRE9), PCDA4_HUMAN (Q9UN74), PCDA4_MOUSE (O88689), PCDA4_PANTR (Q5DRE8), PCDA4_RAT (Q767I8), PCDA5_HUMAN (Q9Y5H7), PCDA5_PANTR (Q5DRE7), PCDA6_HUMAN (Q9UN73), PCDA6_PANTR (Q5DRE6), PCDA7_HUMAN (Q9UN72), PCDA7_MOUSE (Q91Y13), PCDA7_PANTR (Q5DRE5), PCDA8_HUMAN (Q9Y5H6), PCDA8_PANTR (Q5DRE4), PCDA9_HUMAN (Q9Y5H5), PCDA9_MOUSE (Q91Y11), PCDA9_PANTR (Q5DRE3), PCDAA_HUMAN (Q9Y5I2), PCDAA_MOUSE (Q91Y20), PCDAA_PANTR (Q5DRF4), PCDAB_HUMAN (Q9Y5I1), PCDAB_PANTR (Q5DRF3), PCDAC_HUMAN (Q9UN75), PCDAC_PANTR (Q5DRF2), PCDAD_HUMAN (Q9Y5I0), PCDAD_PANTR (Q5DRF1), PCDB1_HUMAN (Q9Y5F3), PCDB1_PANTR (Q5DRE0), PCDB2_HUMAN (Q9Y5E7), PCDB2_PANTR (Q5DRD2), PCDB3_HUMAN (Q9Y5E6), PCDB3_PANTR (Q5DRD1), PCDB4_HUMAN (Q9Y5E5), PCDB4_PANTR (Q5DRD0), PCDB5_HUMAN (Q9Y5E4), PCDB5_PANTR (Q5DRC9), PCDB6_HUMAN (Q9Y5E3), PCDB6_MOUSE (Q91XZ4), PCDB6_PANTR (Q5DRC8), PCDB7_HUMAN (Q9Y5E2), PCDB7_PANTR (Q5DRC7), PCDB8_HUMAN (Q9UN66), PCDB8_MOUSE (Q91XZ2), PCDB8_PANTR (Q5DRC6), PCDB9_HUMAN (Q9Y5E1), PCDB9_PANTR (Q5DRC4), PCDBA_HUMAN (Q9UN67), PCDBA_PANTR (Q5DRD9), PCDBB_HUMAN (Q9Y5F2), PCDBB_PANTR (Q5DRD8), PCDBC_HUMAN (Q9Y5F1), PCDBC_PANTR (Q5DRD7), PCDBD_HUMAN (Q9Y5F0), PCDBD_PANTR (Q5DRD6), PCDBE_HUMAN (Q9Y5E9), PCDBE_MOUSE (Q6PB90), PCDBE_PANTR (Q5DRD5), PCDBF_HUMAN (Q9Y5E8), PCDBF_PANTR (Q5DRD3), PCDBG_HUMAN (Q9NRJ7), PCDBH_PANTR (Q5DRC3), PCDBI_HUMAN (Q96TA0), PCDBI_MOUSE (Q91Y02), PCDBI_PANTR (Q5DRD4), PCDC1_HUMAN (Q9H158), PCDC1_PANTR (Q5DRE2), PCDC2_HUMAN (Q9Y5I4), PCDC2_PANTR (Q5DRE1), PCDG1_HUMAN (Q9Y5H4), PCDG1_PANTR (Q5DRC2), PCDG2_HUMAN (Q9Y5H1), PCDG2_PANTR (Q5DRB8), PCDG3_HUMAN (Q9Y5H0), PCDG3_PANTR (Q5DRB7), PCDG4_HUMAN (Q9Y5G9), PCDG4_MOUSE (Q91XY4), PCDG4_PANTR (Q5DRB6), PCDG5_HUMAN (Q9Y5G8), PCDG5_PANTR (Q5DRB5), PCDG6_HUMAN (Q9Y5G7), PCDG6_PANTR (Q5DRB4), PCDG7_HUMAN (Q9Y5G6), PCDG7_PANTR (Q5DRB3), PCDG8_HUMAN (Q9Y5G5), PCDG8_PANTR (Q5DRB2), PCDG9_HUMAN (Q9Y5G4), PCDG9_PANTR (Q5DRB1), PCDGA_HUMAN (Q9Y5H3), PCDGA_PANTR (Q5DRC1), PCDGB_HUMAN (Q9Y5H2), PCDGB_PANTR (Q5DRC0), PCDGC_HUMAN (O60330), PCDGC_PANTR (Q5DRB9), PCDGD_HUMAN (Q9Y5G3), PCDGD_PANTR (Q5DRB0), PCDGE_HUMAN (Q9Y5G2), PCDGE_PANTR (Q5DRA9), PCDGF_HUMAN (Q9Y5G1), PCDGG_HUMAN (Q9UN71), PCDGG_PANTR (Q5DRA8), PCDGH_HUMAN (Q9Y5G0), PCDGH_PANTR (Q5DRA7), PCDGI_HUMAN (Q9Y5F9), PCDGI_PANTR (Q5DRA6), PCDGJ_HUMAN (Q9Y5F8), PCDGJ_PANTR (Q5DRA5), PCDGK_HUMAN (Q9UN70), PCDGK_PANTR (Q5DRA4), PCDGL_HUMAN (Q9Y5F7), PCDGL_PANTR (Q5DRA3), PCDGM_HUMAN (Q9Y5F6), PCDGM_PANTR (Q5DRA2), PCDH1_HUMAN (Q08174), PCDH3_RAT (Q63418), PCDH7_HUMAN (O60245), PCDH8_HUMAN (O95206), PCDH8_MOUSE (Q7TSK3), PCDH8_RAT (D3ZE55), PCDH9_HUMAN (Q9HC56), PCDL_ACRMI (B8V7Q1), RET_HUMAN (P07949), RET_MOUSE (P35546), RET_RAT (G3V9H8), STAN_DROME (Q9V5N8)» more
|
UniProtKB/Swiss-Prot False positive sequences |
2 sequences
CHIA_PSEO7 (P32823), FREM2_LYTVA (Q9GV77) |
PDB [Detailed view] |
193 PDB
1EDH; 1FF5; 1L3W; 1NCG; 1NCH; 1NCI; 1NCJ; 1O6S; 1Q1P; 1SUH; 1WUZ; 1WYJ; 1ZVN; 1ZXK; 2A4C; 2A4E; 2A62; 2EE0; 2O72; 2OMT; 2OMU; 2OMV; 2OMW; 2OMX; 2OMY; 2OMZ; 2QVF; 2QVI; 2V37; 2WBX; 2WCP; 2WD0; 2WHV; 2X2U; 2YQG; 2YST; 3FF7; 3FF8; 3K5R; 3K5S; 3K6F; 3K6I; 3LND; 3LNE; 3LNF; 3LNG; 3LNH; 3LNI; 3MVS; 3PPE; 3Q2L; 3Q2N; 3Q2V; 3Q2W; 3QRB; 3UBF; 3UBG; 3UBH; 4APX; 4AQ8; 4AQA; 4AQE; 4AXW; 4NQQ; 4NUM; 4NUP; 4NUQ; 4OY9; 4QD2; 4UX8; 4XHZ; 4XXW; 4ZML; 4ZMN; 4ZMO; 4ZMP; 4ZMQ; 4ZMT; 4ZMV; 4ZMW; 4ZMX; 4ZMY; 4ZMZ; 4ZT1; 4ZTE; 5CO1; 5CYX; 5CZR; 5DZV; 5DZW; 5DZX; 5DZY; 5EQX; 5ERD; 5ERP; 5I8D; 5IRY; 5IU9; 5J5J; 5JYL; 5JYM; 5K8R; 5KJ4; 5SZQ; 5T4M; 5T4N; 5TFK; 5TFL; 5TFM; 5TPK; 5ULU; 5ULY; 5UN2; 5UZ8; 5VEB; 5VH2; 5VT8; 5VVM; 5W1D; 5WJ8; 5WJM; 6BWN; 6BX7; 6C10; 6C13; 6C14; 6CG6; 6CG7; 6CGB; 6CGS; 6CGU; 6CV7; 6CXY; 6E8F; 6EB5; 6EET; 6GL7; 6MEQ; 6MER; 6MFO; 6MGA; 6N22; 6N2E; 6OAE; 6PGW; 6PIM; 6PPO; 6PSF; 6Q2J; 6Q2N; 6Q2O; 6Q2R; 6Q2S; 6QNT; 6QNU; 6SIT; 6ULM; 6VEL; 6VFP; 6VFQ; 6VFR; 6VFT; 6VFU; 6VFV; 6VFW; 6VG4; 6ZTB; 6ZTR; 7A7D; 7AGF; 7AGG; 7CME; 7CMF; 7CYM; 7EV1; 7KNV; 7N86; 7SKH; 7STZ; 7SUU; 7SZ8; 7T3S; 7T80; 7U71; 7UQU; 8D40; 8EGW; 8EGX; 8H62; 8HYI; 8QJX; 8QJY; 8QK3 » more |