PROSITE entry PS50287

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50287
Entry name [info]	SRCR_2
Accession [info]	PS50287
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2001 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00348
Associated ProRule [info]	PRU00196

Name and characterization of the entry

Description [info]

SRCR domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=101;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=96;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.7507000; R2=0.0159054; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4953.1884766; R2=8.8938360; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=412; H_SCORE=8617; N_SCORE=7.3; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=362; H_SCORE=8173; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-70; E1=-70; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='V';  M= -6,-28,-18,-31,-25, 10,-29,-24, 21,-24, 19, 12,-25,-26,-24,-20,-16, -5, 23,-18, -1,-24;
/M: SY='R';  M=-16, -8,-28, -9,  1,-21,-18, -1,-27, 23,-19, -8,  0,-18, 13, 55, -5, -7,-19,-22,-11,  3;
/M: SY='L';  M= -9,-29,-20,-31,-21, 12,-29,-20, 20,-29, 44, 20,-28,-29,-20,-20,-28,-10, 10,-19,  1,-20;
/M: SY='V';  M=  0,-18,-15,-23,-19, -3,-24,-22, 12,-13,  2,  5,-16,-21,-17,-12, -3,  7, 21,-26, -8,-19;
/M: SY='G';  M= -6,  8,-25,  7, -5,-24, 14, -3,-27, -8,-23,-16, 12,-14, -6, -8,  2, -8,-23,-28,-18, -6;
/M: SY='G';  M= -1, -5,-27, -6,-11,-27, 45,-14,-32,-15,-26,-16,  4,-18,-12,-15,  3,-13,-25,-24,-26,-11;
/I:         I=-5; MD=-26;
/M: SY='S';  M= -2,  4,-21,  4, -1,-21,  2, -6,-22, -4,-21,-15,  5, -5, -4, -5,  7,  1,-16,-27,-16, -3; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26;
/M: SY='S';  M= -3,  0,-20, -1, -2,-18, -2, -6,-19, -8,-18,-13,  4,-12, -2, -7, 10,  6,-14,-28,-12, -3; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-26;
/M: SY='R';  M= -7, -4,-26, -2,  1,-22,-15, -4,-17,  3,-18,-10, -2, -2,  1,  6, -3, -6,-13,-26,-14, -1;
/M: SY='C';  M= -9, -8, 53,-17,-19,-18,-16,-13,-25,-18,-20,-15, -3,-29,-17,-15, -3, -4,-14,-40,-20,-19;
/M: SY='E';  M=  3,  4,-22,  5, 24,-27,-12, -4,-22,  4,-21,-14,  3, -7, 16, -2, 10,  0,-20,-29,-18, 20;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 69,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-19,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='R';  M=-13,-14,-25,-16, -8, -9,-22, -7,-11,  5, -7, -3, -8,-21,  0, 25, -8, -3, -7,-15, -2, -7;
/M: SY='V';  M= -1,-29,-13,-30,-27,  1,-30,-28, 28,-22, 18, 12,-29,-29,-27,-21,-14, -3, 39,-27, -8,-27;
/M: SY='E';  M=-10,  8,-30, 16, 52,-31,-20,  1,-29, 12,-20,-17,  0, -2, 24,  4, -1,-10,-29,-28,-18, 38;
/M: SY='V';  M= -5,-29,-16,-33,-29, 11,-32,-27, 29,-23, 13, 12,-26,-27,-28,-22,-14, -3, 36,-22, -2,-29;
/M: SY='Y';  M=-14,-13,-26,-15, -8,  4,-23,  1, -9, -1, -2, -2,-10,-22, -4,  4,-13, -9,-11, -4, 17, -7;
/M: SY='Y';  M=-12,-10,-24,-14,-11,  4,-22,  8, -3,-14, -1,  1, -5,-22, -8,-11,-10, -8, -7,-12, 11,-10;
/M: SY='Q';  M= -6,  2,-27,  2,  3,-27,  6, -3,-26,  1,-23,-13,  5,-13,  7,  4,  0,-10,-23,-25,-18,  4;
/M: SY='G';  M= -1,  4,-23,  4, -5,-26, 23,-12,-29, -9,-27,-19,  8,-15, -8,-10, 10, -2,-21,-29,-22, -7;
/I:         I=-5; MD=-28;
/M: SY='Q';  M= -3, -6,-22, -7,  2,-18,-11, -8,-13, -1,-12, -6, -3,-14,  8,  3,  1, -1,-11,-23,-12,  4; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-28; IM=0; DM=-28;
/M: SY='W';  M=-18,-35,-46,-35,-26,  6,-15,-28,-19,-18,-18,-17,-35,-28,-18,-18,-34,-26,-26,121, 22,-18;
/M: SY='G';  M= -5, -7,-28, -7, -8,-23, 28, -5,-28,-10,-21,-12, -1,-18, -9, -9, -3,-14,-22,-22,-17, -9;
/M: SY='T';  M=  0, -7,-17,-13, -9,-10,-14,-17,-11,-10,-13, -9, -5,  0, -9,-10, 10, 22, -6,-27,-12,-10;
/M: SY='V';  M=  0,-27,-15,-31,-26, -1,-29,-28, 29,-22, 14, 11,-24,-25,-24,-22,-11, -2, 34,-26, -8,-26;
/M: SY='C';  M= -9,-17, 98,-26,-27,-20,-24,-25,-28,-28,-19,-18,-16,-36,-27,-27, -8, -9,-10,-47,-27,-27;
/M: SY='D';  M= -5, 21,-24, 26,  6,-27, -6, -2,-27, -1,-23,-19, 10,-13, -2, -7,  3, -5,-20,-30,-14,  1;
/M: SY='D';  M= -7, 14,-24, 19, 12,-26,-10, -3,-26,  2,-24,-17,  8,-10,  4, -1,  6, -2,-21,-28,-14,  8;
/M: SY='N';  M= -4,  3,-23,  3, -1,-23,  0,  6,-23, -6,-23,-14,  9,-10,  1, -5,  7, -3,-20,-28,-13, -1;
/M: SY='W';  M=-15,-33,-40,-35,-25, 13,-21,-24,-14,-18,-11,-11,-32,-27,-17,-17,-30,-21,-21, 96, 21,-17;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='B';  M= -5, 14,-20, 14,  1,-22, -3, -8,-23, -7,-23,-18, 12, -9, -5,-10, 12, 11,-17,-33,-16, -3;
/M:         M= -6, -9,-23,-10, -8,-11,-17,-14, -3,-11, -1,  0, -9,-10, -8,-10, -7, -2, -5,-22,-10, -9;
/M: SY='Q';  M= -4,  0,-25,  1,  5,-24,-13, -5,-19,  5,-17,-10,  0, -9,  6,  5, -2, -6,-16,-26,-13,  4;
/M: SY='D';  M= -8, 11,-25, 14,  9,-22,-15, -6,-15, -4,-12,-12,  6,-13,  1, -6, -2, -5,-15,-30,-14,  4;
/M: SY='A';  M= 26,-10,-14,-16,-10,-16,  1,-19,-13,-11,-14,-12, -7,-13,-11,-16, 10,  3, -3,-18,-17,-10;
/M: SY='N';  M= -6, 11,-23,  6,  5,-22, -8,  4,-20,  1,-21,-12, 18,-15,  6,  2,  5, -2,-20,-30,-13,  4;
/M: SY='V';  M=  0,-18,-14,-18,-16, -5,-25,-23, 12,-14,  4,  2,-19,-23,-19,-15, -5,  3, 25,-28,-10,-18;
/M: SY='V';  M=  2,-27,-15,-31,-26,  1,-29,-27, 27,-22, 14, 10,-25,-25,-25,-22,-12, -2, 34,-25, -7,-26;
/M: SY='C';  M=-10,-20,100,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='R';  M=-13, -3,-28, -4,  2,-23,-16,  5,-26, 19,-20, -9,  3,-17, 12, 37, -7,-10,-20,-22, -8,  4;
/M: SY='Q';  M= -3,  0,-25,  1, 16,-29,-16,  4,-18,  2,-15, -4,  0,-11, 28,  1,  2, -6,-21,-25,-12, 22;
/M: SY='L';  M= -7,-27,-20,-28,-18,  7,-27,-17, 16,-25, 40, 20,-26,-27,-14,-18,-25, -9,  7,-19, -1,-16;
/M: SY='G';  M= -4, -6,-29, -6, -9,-31, 44,-12,-35,-10,-28,-16,  3,-18, -3, -8,  0,-16,-29,-21,-25, -6;
/M: SY='C';  M=-12,-22, 53,-29,-26,  4,-29,-19,-13,-27, -1, -7,-21,-35,-25,-24,-15, -9, -5,-26, -1,-26;
/M: SY='G';  M= -1,-10,-28, -9,-12,-28, 38,-17,-32,-12,-27,-17, -3, -8,-11,-12,  1,-13,-24,-22,-25,-12;
/M: SY='D';  M= -4,  2,-23,  4,  0,-20, -5,-10,-22, -1,-20,-15,  2,-14, -3, -3,  4,  0,-15,-21,-13, -2;
/M: SY='A';  M= 15,-11,-20,-14, -9,-15,  5,-18,-15,-11,-14,-11, -9, -8,-12,-16,  1, -6, -8,-21,-17,-11;
/I:         MD=-16;
/M: SY='V';  M= -2,-14,-19,-17,-15, -8,-13,-17,  4,-14,  5,  2, -9,-22,-13,-11, -8, -4,  6,-25,-11,-15; D=-3;
/I:         MD=-16;
/M: SY='S';  M= -1,  2,-18,  0,  2,-18,-10, -7,-17,  3,-20,-12,  5,-12,  3,  0, 11,  5,-12,-27,-12,  2; D=-3;
/I:         MD=-16;
/M: SY='A';  M=  7,-10,-17,-14, -9, -7,-13, -6, -7, -9, -8, -6, -8,-12, -8, -9,  1,  2, -3,-11, -1,-10; D=-3;
/I:         MD=-16;
/M:         M= -6,-10,-19,-12, -8, -5,-17, -6, -2,-10, -1,  0, -7, -4, -6, -9, -5, -1, -5,-17, -3, -8; D=-3;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='G';  M= -3, -8,-22, -9, -6,-15,  4,-10,-19, -3,-16,-10, -5,-10, -3, -3, -2, -4,-16, -7, -8, -5; D=-3;
/I:         DM=-16;
/M: SY='G';  M= -3, -3,-17, -3, -5,-17,  1, -7,-19, -3,-16,-10, -1,-13, -3, -1,  1, -4,-13,-16,-11, -4; D=-3;
/I:         DM=-16;
/M: SY='A';  M=  7,-10,-16,-13, -7, -9, -9,-13,-10,-10,-12, -8, -8,  2, -9,-13,  2, -2, -7,-17,-10, -9; D=-3;
/I:         DM=-16;
/M: SY='Y';  M= -7, -7,-22, -9, -7,  0,-11,  5,-13, -6,-11, -7, -2,-12, -5, -4, -5, -7,-14,-10,  8, -7; D=-3;
/I:         DM=-16;
/M: SY='F';  M= -9,-15,-21,-16,-10, 13,-19,-11, -6,-13, -2, -5,-11, -7,-15,-10, -8, -4, -5,-13,  2,-12; D=-3;
/I:         DM=-16;
/M: SY='G';  M= -1, -7,-23, -8, -7,-19, 10, -8,-20, -7,-17,-11, -1,-11, -7, -6,  1, -7,-15,-24,-16, -8; D=-3;
/I:         DM=-16;
/M: SY='E';  M= -5, -6,-23, -5,  3,-14,-17,-10,-12, -2, -8, -7, -5, -9, -1, -1, -4, -4,-10,-25,-11,  0;
/M: SY='G';  M= -4,  1,-25,  2, -5,-25, 22, -8,-28, -9,-23,-16,  6,-15, -7, -8,  4, -8,-22,-27,-21, -7;
/M: SY='S';  M= -3, -2,-21, -4, -1,-16,-12, -8,-14, -5,-13,-10,  0, -9, -2, -7,  4,  3,-12,-26,-12, -2;
/M: SY='G';  M=  0, -9,-25,-10,-11,-19, 10,-14,-17,-11,-14,-10, -4,-11, -8, -9, -2, -7,-14,-22,-16,-11;
/M: SY='P';  M=-10, -9,-33, -4,  1,-28,-16, -9,-22, -2,-26,-15, -8, 43,  0, -5, -5, -6,-26,-28,-21, -3;
/M: SY='I';  M= -9,-18,-23,-24,-18,  4,-28,-17, 18,-19,  8,  9,-13,-19,-15,-18,-11, -4, 11,-19,  2,-18;
/M: SY='W';  M=-12,-25,-33,-27,-20,  2,-17,-15, -7,-19, -7, -6,-22,-16,-16,-18,-20,-13,-12, 40, 10,-17;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='L';  M= -3,-19,-12,-23,-15, -5,-23,-17,  5,-15, 10,  9,-18,-18,-10,-12,-11, -2,  4,-20, -7,-13; D=-5;
/I:         DM=-27;
/M: SY='D';  M=-11,  8,-28, 13,  6,-22,-12, -6,-21, -5,-19,-14,  2,  5,  0, -9, -3, -8,-22,-28,-15,  2;
/M: SY='N';  M= -6,  7,-24,  7,  5,-22, -3,  1,-23, -1,-22,-14, 10,-12,  3, -2,  4, -5,-22,-27,-12,  3;
/M: SY='V';  M= -5,-24,-19,-26,-20,  3,-24,-20, 14,-18,  7,  8,-21,-19,-18,-16,-11, -5, 18,-21, -4,-20;
/M: SY='Q';  M= -7, -1,-23, -3,  0,-15,-17,  2,-14, -2,-12, -5,  2,-16,  6,  1,  1, -2,-14,-25, -6,  2;
/M: SY='C';  M=-10,-20,100,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='S';  M= -6, -4,-21, -5,  2,-16,-15, -4,-17, -1,-15,-10,  1, -9,  1,  5,  6,  6,-13,-27,-10,  0;
/M: SY='G';  M= -1, -7,-29, -7,-11,-30, 49,-14,-36,-13,-29,-18,  1,-16,-10,-14,  2,-15,-28,-22,-26,-10;
/M: SY='B';  M= -3,  4,-21,  1, -1,-18,-13, -7,-13, -5,-10, -9,  3,-14, -2, -6,  1,  4,-10,-28,-11, -2;
/M: SY='E';  M= -7,  6,-28, 13, 41,-28,-18, -3,-25,  6,-18,-16, -1,  1, 15, -2,  1, -8,-25,-29,-18, 28;
/I:         MD=-27;
/M: SY='S';  M=  1, -2,-17, -3, -3,-15, -8,-11,-12, -6,-12,-10,  0, -5, -5, -8,  4,  4,-10,-20,-12, -4; D=-5;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='S';  M= -1, -1,-15, -4, -3,-11,-10,  2,-11, -7,-14, -8,  5,-12, -2, -5, 12,  9, -8,-25, -6, -4; D=-5;
/I:         DM=-27;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-21,-30,-21, 12,-28,-20, 19,-25, 34, 15,-25,-26,-19,-18,-25,-10, 10,-11,  3,-20; D=-5;
/I:         DM=-27;
/M: SY='W';  M=  1,-11,-23,-12, -7,-10,-11,-15,-13,-11,-12,-12,-10,-16, -6,-11, -1, -3,-13, 14, -4, -6; D=-5;
/I:         DM=-27;
/M: SY='Q';  M=-11, 12,-26, 14, 14,-26,-15,  6,-23,  3,-20,-12, 10,-13, 18,  3,  2, -6,-24,-29,-12, 15;
/M: SY='C';  M=-10,-20,100,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P';  M= -8, -4,-26, -5,  0,-13,-17, -6,-17,  0,-18,-12,  0,  5, -3, -1, -2, -3,-17,-24,-10, -3;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24;
/M: SY='H';  M= -6, -7,-16, -8, -5, -7,-13,  9, -6, -5, -5, -1, -3,-10, -3, -2, -4, -5, -6,-13,  1, -5; D=-5;
/I:         DM=-24;
/M: SY='R';  M= -8,  3,-20,  3,  2,-17,-12, -1,-16,  5,-14, -9,  4,-12,  3,  9, -1, -2,-13,-21, -9,  2; D=-5;
/I:         DM=-24;
/M: SY='P';  M= -3, -7,-22, -6, -3,-16, -2,-11,-16, -6,-14,-10, -5,  4, -4, -8, -1, -4,-14,-21,-14, -5; D=-5;
/I:         DM=-24;
/M: SY='W';  M=-11,-18,-17,-21,-16, -3,-20,-15,-10,-15,-10, -8,-15,-20,-11,-14,-14, -9,-12, 22,  4,-13;
/M: SY='G';  M= -5, -3,-26, -4, -3,-21, 10,-11,-25, -1,-20,-13,  1,-13, -4, -2, -1, -7,-20,-21,-16, -4;
/M: SY='K';  M= -6, -2,-25, -1,  4,-22,-10, -7,-20,  8,-21,-12,  0,-10,  3,  8,  0, -5,-15,-24,-12,  2;
/M: SY='H';  M=-12,  0,-27, -1,  0,-20,-13, 15,-21,  2,-18, -7,  5,-12,  6,  6, -5, -9,-20,-23, -6,  1;
/I:         I=-9; MI=-10; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='B';  M= -5,  1,-22, -1, -2,-16,-12, -5,-12, -6, -8, -5,  1,-14, -2, -6, -1,  1,-11,-26,-10, -3;
/M: SY='C';  M= -6,-19, 83,-27,-27,-17,-22,-27,-22,-26,-16,-14,-18,-35,-26,-26, -8, -8, -6,-43,-25,-27;
/M: SY='S';  M= -2,  0,-22, -2, -1,-22, -1, -5,-21, -3,-20,-12,  4, -7,  0, -3,  6,  0,-17,-28,-16, -2;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='H';  M= -9,  2,-21,  3,  2,-18,-10, 37,-20, -5,-17, -5,  6, -9,  8, -3,  0, -8,-19,-22,  2,  3; D=-5;
/I:         DM=-27;
/M: SY='E';  M= -5,  5,-19,  5,  8,-20, -4, -3,-19,  4,-18,-11,  6,-10,  5,  1,  3, -2,-16,-22,-12,  6; D=-5;
/I:         DM=-27;
/M: SY='E';  M=-10, -2,-27,  1, 15,-20,-11, -2,-19,  2,-14,-10, -4,-12,  8,  2, -7,-11,-19,-10, -9, 11; D=-5;
/I:         DM=-27;
/M: SY='D';  M= -4, 12,-23, 18,  4,-21,-11,-10,-21, -5,-18,-17,  2, -8, -6, -9,  2, -3,-13,-30,-16, -1;
/M: SY='A';  M= 21,-16,-14,-22,-15,-11,-14,-21,  3,-15,  2, -2,-15,-11,-15,-19, -1,  1,  9,-24,-15,-16;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-26,-11,-12,-16, 21,-15,-26, -8,-22,-15, -4,-18,-11, -9, -1,-10,-19, -9,-12,-11;
/M: SY='V';  M= -1,-29,-15,-31,-28,  1,-31,-28, 30,-22, 16, 13,-28,-28,-26,-21,-14, -3, 40,-27, -7,-28;
/M: SY='V';  M= -4,-18,-19,-22,-17, -4,-27,-20, 13,-15,  3,  3,-16,-20,-14,-14, -4,  6, 17,-20, -3,-17;
/M: SY='C';  M= -9,-19,100,-29,-29,-21,-23,-29,-31,-29,-21,-20,-19,-39,-29,-29, -9,-11,-11,-48,-30,-29;
/M: SY='S';  M=  1, -6,-19, -6, -2,-15, -5,-10,-15, -9,-14,-11, -3,-15, -3,-10,  9,  3,-11,-21, -8, -2;
/I:         E1=0;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_02 which contains 573'230 sequence entries.

Total number of hits	335 in 99 different sequences
Number of true positive hits	334 in 98 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	1
Number of false negative sequences	6
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	99.70 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	98.24 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	14
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	window20_shuffled
Author [info]	K_Hofmann
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	SRCR
Version [info]	6

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences	98 sequences BARK_DROME (M9NDE3), C163A_BOVIN (P85521), C163A_CANLF (Q2VLG6), » more Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences	6 sequences CORIN_HUMAN (Q9Y5Q5), HEPS_HUMAN (P05981), HEPS_MOUSE (O35453), » more
UniProtKB/Swiss-Prot False positive sequences	1 sequence PGBD1_HUMAN (Q96JS3)
PDB [Detailed view]	59 PDB 1BY2; 2JA4; 2JOP; 2JP0; 2OTT; 2OY3; 2OYA; 2XRC; 5A2E; 5HRJ; 5JFB; 5O32; » more