To improve security and privacy, we are moving our web pages and services from HTTP to HTTPS.
To give users of web services time to transition to HTTPS, we will support separate HTTP and HTTPS services until the end of 2017.
From January 2018 most HTTP traffic will be automatically redirected to HTTPS. [more...]
View this page in https
Entry: PS50296

General information about the entry

Entry name [info] SUI1
Accession [info] PS50296
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-DEC-2001 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-SEP-2017 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC00862
Associated ProRule [info] PRU00200

Name and characterization of the entry

Description [info] Translation initiation factor SUI1 family profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=71;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=66;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.2859000; R2=0.0154785; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4167.2734375; R2=3.9856045; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=467; H_SCORE=6029; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=337; H_SCORE=5510; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-60; B1=-60; E0=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='I'; M= -6,-29,-21,-35,-29,  0,-35,-29, 38,-24, 16, 15,-24,-25,-23,-23,-16, -6, 36,-24, -5,-29;
/M: SY='H'; M=-12, -2,-27, -3,  2,-21,-23, 17,-14,  3,-13, -2, -1,-15,  8,  2, -7, -7,-14,-25, -2,  3;
/M: SY='I'; M= -9,-29,-26,-38,-29,  2,-37,-28, 44,-27, 18, 21,-21,-22,-21,-27,-19, -9, 31,-21, -1,-29;
/M: SY='R'; M=-10, -9,-26,-11, -2,-13,-20, -4,-16, 15,-14, -4, -4,-17,  3, 27, -6, -4,-11,-17,  0, -3;
/M: SY='I'; M= -8,-12,-22,-17, -8,-10,-26,-17,  5, -7,  3,  2, -9,-17, -6, -4, -7,  5,  4,-24, -7, -9;
/M: SY='Q'; M=  0, -3,-23, -4, 10,-23,-18, -9, -9, -4,-11, -6, -5,-11, 11, -7,  1,  1, -9,-25,-13, 10;
/M: SY='Q'; M= -6, -4,-26, -3, 12,-27,-18, -3,-18, 12,-18, -4, -3, -7, 20, 11, -1, -4,-17,-24,-13, 16;
/M: SY='R'; M=-15,-10,-30,-10, -2,-22,-10, -4,-30, 23,-22,-11, -1,-15,  5, 52, -8,-11,-21,-20,-13, -2;
/M: SY='R'; M= -5,  5,-22, -3, -3,-19,-12, -3,-17,  7,-19,-11, 16,-17,  3, 20,  3,  1,-16,-28,-14, -2;
/M: SY='G'; M= -6, -9,-28,-10,-11,-14, 21,-13,-29,  1,-24,-13, -3,-18,-11, -4, -4,-13,-21,-14, -9,-11;
/M: SY='R'; M=-11, -1,-28, -4, -5,-24, 12, -5,-32, 11,-26,-15, 10,-19, -1, 27, -4,-12,-25,-23,-18, -5;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 49,-30,-10,  0,-10, 10, 31,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='T'; M= -6, -9,-15,-11, -6, -8,-15,-13,-12, -2,-11, -8, -7,-17, -8, -4,  1,  6, -5,-22, -4, -7;
/M: SY='V'; M= -4,-29,-16,-31,-26,  1,-30,-25, 29,-21, 19, 16,-27,-27,-24,-19,-16, -4, 35,-26, -6,-26;
/M: SY='T'; M=  0, -2, -5,-11,-11,-10,-20,-21, -9,-11,-10,-10, -2,-12,-11,-11, 18, 44,  2,-31,-11,-11;
/M: SY='V'; M= -3,-16,-17,-21,-17, -7,-25,-21,  9,-11,  3,  2,-13,-19,-14, -7, -3, 11, 14,-26, -8,-17;
/M: SY='V'; M= -3,-30,-17,-33,-30,  0,-33,-30, 37,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 43,-27, -7,-30;
/M: SY='Q'; M= -4,  1,-16,  1, 13,-27,-15, -5,-23,  5,-23,-12,  2,-10, 17,  4, 11,  5,-19,-30,-15, 14;
/M: SY='G'; M= -2, -1,-28, -5,-17,-28, 58,-15,-37,-17,-30,-20, 10,-20,-17,-17,  2,-17,-30,-23,-28,-17;
/M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-33,-24, 16,-32,-22, 24,-29, 35, 19,-26,-27,-22,-22,-25,-10, 15,-17,  3,-23;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E'; M=  7,  8,-24, 12, 18,-29,-11, -8,-24,  2,-21,-18,  0,  1,  4, -8,  4, -5,-19,-29,-20, 11;
/M: SY='Y'; M= -7,-12,-21,-13, -7, -2,-23,-12, -4, -2,  1,  0,-12,-19, -9, -4, -9,  0, -1,-16,  3, -9;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='D'; M= -8, 14,-28, 23, 16,-31,  7, -6,-32, -4,-23,-20,  5,-11,  2,-10,  1,-11,-26,-30,-21,  9;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='I'; M= -8,-23,-24,-28,-21,  9,-30,-18, 22,-22, 15, 11,-19,-23,-18,-21,-17, -8, 14,-13,  9,-21;
/M: SY='D'; M=-11, 29,-27, 40, 17,-32, -9, -4,-29,  0,-25,-23, 13,-10,  1, -9,  2, -7,-23,-35,-19,  9;
/M: SY='L'; M=-10,-23,-25,-23,-13, -1,-27,-15,  8,-18, 21, 10,-23, -7,-11,-15,-21, -8,  0,-19, -1,-13;
/M: SY='K'; M= -7,  5,-27,  6, 12,-25,-17, -6,-26, 26,-25,-13,  2,-10,  8, 13, -3, -4,-19,-22, -8,  9;
/M: SY='K'; M= -5,  3,-25,  6, 16,-26,-15, -8,-25, 19,-23,-14,  1,-10,  7, 11,  3, -4,-17,-28,-15, 11;
/M: SY='L'; M= -1,-27,-19,-31,-22, 10,-27,-22, 20,-26, 27, 14,-24,-25,-21,-21,-19, -8, 15,-18, -1,-22;
/M: SY='A'; M= 22,-14,-14,-20,-13,-13, -8,-19, -1,-15, -1, -3,-12,-16,-11,-18,  3,  0,  4,-23,-15,-12;
/M: SY='K'; M=  5, -3,-23, -6,  3,-25,-13,-11,-24, 26,-24,-11, -1,-11,  4, 19,  1, -4,-14,-23,-14,  3;
/M: SY='E'; M= -1,  0,-23,  2,  4,-15,-18,-12,-10, -4, -7, -7, -5,-12, -5, -9, -4, -3, -7,-24,-10, -1;
/M: SY='L'; M=-12,-29, -8,-32,-23, 21,-30,-21, 12,-30, 36, 13,-27,-31,-25,-21,-26,-10,  6,-17,  3,-23;
/M: SY='K'; M=  0, -3,-27, -4,  5,-29,-11,-10,-26, 30,-25,-10, -2,-11, 10, 19, -5, -9,-19,-20,-13,  7;
/M: SY='K'; M= -4,  3,-26,  2,  9,-30,-15, -5,-26, 25,-27,-11,  4,-11, 16, 16,  2, -5,-20,-25,-13, 12;
/M: SY='K'; M=-11, -3,-29, -3,  6,-21,-17, -9,-21, 23,-20, -9, -2,-14,  4, 23, -9,-10,-16,-21,-10,  3;
/M: SY='C'; M=-11,-25, 31,-34,-28, 30,-28,-24, -9,-29,  3, -5,-21,-33,-32,-24,-16, -9, -2,-17,  2,-28;
/M: SY='A'; M= 28, -8, -6,-15,-10,-23,  9,-17,-18,-12,-17,-13, -4,-14, -8,-17,  9, -3, -9,-25,-22, -9;
/M: SY='C'; M=  0,-13, 65,-22,-22,-19,-18,-26,-24,-22,-18,-17,-12,-28,-22,-23,  1,  4, -8,-40,-24,-22;
/M: SY='G'; M=  0,  3,-23, -1,-11,-26, 40,-11,-31,-14,-30,-20, 15,-18,-11,-14, 11, -7,-26,-29,-26,-11;
/M: SY='G'; M=  6, -8,-15,-11,-16,-23, 33,-20,-28,-17,-23,-17, -1,-17,-16,-18,  8,  1,-18,-25,-24,-16;
/M: SY='T'; M=  8,  0,-10, -7, -6,-15,-10,-16,-14,-10,-18,-14,  4,-10, -6,-11, 26, 33, -4,-33,-15, -6;
/M: SY='V'; M=  2,-28,-13,-30,-28, -1,-29,-29, 28,-21, 12, 10,-27,-27,-27,-21,-11, -2, 41,-27, -9,-28;
/M: SY='K'; M= -4, -7,-20,-10, -7,-16,-17,-17, -6,  5,-14, -5, -4,-16, -7, -1,  0,  4,  2,-27,-12, -7;
/M: SY='E'; M=-10, 12,-29, 15, 20,-30, -9, -4,-30, 16,-27,-17,  9, -4,  9,  6, -2, -9,-27,-28,-18, 14;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='G'; M= -4,  6,-24,  8, -3,-23, 12, -4,-24,-11,-17,-14,  5,-16, -8,-13,  0, -8,-19,-28,-17, -6; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='P'; M=  1, -7,-19, -4,  1,-17, -9, -9,-11, -3,-15, -9, -8, 30, -1, -8, -2, -4,-14,-16,-14, -2; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='E'; M= -6,  3,-15,  6, 15,-11,-11, -3,-15,  6,-11, -8,  0, -5,  6,  1,  0, -3,-13,-14, -7, 11; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='K'; M= -7, -2,-16,  0,  1, -9,-10, -1,-10,  8, -6, -2, -3,-10,  0,  3, -7, -6, -9,-10,  1,  0; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='G'; M=  0, -4, -8, -5, -7,-16, 15, -5,-20, -3,-17,-10,  0,-11, -6, -5,  0, -7,-14,-16,-13, -7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='E'; M= -4,  5,-17, 10, 18,-15,-11, -1,-15,  1, -9, -9, -1, -6,  7, -3, -1, -5,-14,-17, -7, 12; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='E'; M= -7, -7,-19, -5, 12,-20,-24,-10, -5, -3, -9, -5,-10,-14,  7, -4, -4, -6, -2,-28,-13,  8;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-24,-36,-29,  1,-36,-29, 42,-27, 20, 17,-24,-24,-23,-26,-18, -7, 34,-23, -3,-29;
/M: SY='Q'; M= -9, -2,-27,  2, 22,-27,-22, -3,-12,  2,-11, -5, -6,-11, 24, -2, -4, -9,-14,-26,-13, 23;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-23,-35,-26,  4,-35,-26, 35,-28, 30, 18,-25,-25,-22,-25,-22, -8, 25,-22, -2,-26;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='D'; M=-16, 39,-29, 50, 17,-35, -6, -1,-35, -1,-29,-27, 22, -5,  0, -9,  1, -9,-30,-38,-21,  8;
/M: SY='H'; M=-11, -9,-26,-10,  0,-18,-23, 21,-10, -2,-10,  2, -5,-18, 17,  0, -8,-11,-10,-23,  0,  7;
/M: SY='R'; M=-11,-12,-24,-15, -9,-15,-16,-10,-10,  8,-12, -2, -5,-20, -3, 25, -6, -4, -2,-24,-11, -9;
/M: SY='D'; M=-13, 13,-29, 19, 11,-27,-12,  9,-28,  8,-23,-15,  6,-13,  6,  3, -5,-11,-24,-25, -6,  8;
/M: SY='N'; M=-11,  9,-25,  8,  5,-17,-15,  2,-21,  5,-16,-11, 10,-16,  1,  6, -3, -7,-19,-28,-10,  3;
/M: SY='I'; M= -5,-30,-20,-33,-27,  2,-33,-27, 34,-26, 23, 16,-26,-26,-23,-24,-18, -6, 31,-24, -4,-27;
/M:         M= -5,-11,-11,-13, -3,-15,-17,-10,-10, -1, -9, -4, -8,-17, -6, -6, -7, -8, -7,-26,-11, -5;
/M: SY='E'; M= -9, 12,-26, 16, 18,-26,-16, -5,-26,  4,-22,-17,  4, -9,  9,  0,  3,  0,-22,-20,-13, 14;
/M: SY='F'; M=-15,-25,-23,-28,-19, 29,-29, -8,  7,-23, 17,  6,-21,-27,-22,-17,-21,-11,  2, -1, 20,-20;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22,  7,-32,-21, 27,-29, 40, 23,-27,-27,-19,-22,-27,-10, 15,-20,  0,-22;
/M: SY='L'; M= -4,-12,-20,-14, -5,-10,-23,-11,  2,-12,  3,  0,-10,-15, -8,-11, -6,  1,  3,-27, -9, -7;
/M: SY='E'; M= -6,  8,-27, 12, 29,-30,-16, -2,-27, 16,-24,-15,  4, -7, 18,  7,  2, -6,-24,-28,-16, 23;
/M: SY='K'; M= -5, -8,-24,-10,  2,-17,-21, -6,-10,  8, -6,  1, -8,-15,  5,  4, -8, -4, -9,-23, -8,  3;
/M: SY='G'; M= -8,-16,-31,-16,-20, -7, 25,-13,-23,-19,-14,-12,-11,-24,-18,-18,-12,-18,-21, 10,  3,-20;
/I:         E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2017_09 which contains 555'594 sequence entries.


Total number of hits 114 in 114 different sequences
Number of true positive hits 113 in 113 different sequences
Number of 'unknown' hits 1
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann, N_Hulo
Taxonomic range [info] Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] SUI1
Version [info] 5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
113 sequences

DENR_ASHGO  (Q75CN1    ), DENR_ASPCL  (A1C8E3    ), DENR_ASPFU  (Q4WBL6    ), 
DENR_ASPNC  (A2QHG9    ), DENR_ASPOR  (Q2TVZ2    ), DENR_BOTFB  (A6SIZ0    ), 
DENR_BOVIN  (Q2HJ47    ), DENR_CAEEL  (Q9NAH4    ), DENR_CANGA  (Q6FXQ4    ), 
DENR_CHAGB  (Q2H5Z7    ), DENR_CHICK  (Q5ZJ39    ), DENR_COCIM  (Q1E556    ), 
DENR_CRYNB  (P0CR81    ), DENR_CRYNJ  (P0CR80    ), DENR_DANRE  (Q6DH65    ), 
DENR_DEBHA  (Q6BH22    ), DENR_DICDI  (Q54WG0    ), DENR_DROME  (Q9VX98    ), 
DENR_HUMAN  (O43583    ), DENR_KLULA  (Q6CJ30    ), DENR_LODEL  (A5E3R9    ), 
DENR_MAGO7  (A4QVI3    ), DENR_MOUSE  (Q9CQJ6    ), DENR_NEOFI  (A1DAY1    ), 
DENR_NEUCR  (Q9P3T4    ), DENR_PICGU  (A5DGV3    ), DENR_PICST  (A3LSY0    ), 
DENR_PONAB  (Q5RFP5    ), DENR_SCHPO  (O42929    ), DENR_VANPO  (A7TES6    ), 
DENR_XENLA  (Q6GLZ1    ), DENR_XENTR  (Q6DFN7    ), DENR_YARLI  (Q6CA08    ), 
DENR_YEAS7  (A6ZPY2    ), DENR_YEAST  (P47089    ), EIF1B_HUMAN (O60739    ), 
EIF1B_MACFA (Q4R4X9    ), EIF1B_MOUSE (Q9CXU9    ), EIF1B_PIG   (P61220    ), 
EIF1_BOVIN  (Q5E938    ), EIF1_CHICK  (P51971    ), EIF1_HUMAN  (P41567    ), 
EIF1_MOUSE  (P48024    ), EIF1_PONAB  (Q5RFF4    ), EIF2D_BOVIN (Q58CR3    ), 
EIF2D_HUMAN (P41214    ), EIF2D_MOUSE (Q61211    ), EIF2D_PONAB (Q5RA63    ), 
EIF2D_RABIT (P0CL18    ), EIF2D_RAT   (Q5PPG7    ), ETIF1_ANOGA (P42678    ), 
ETIF1_DROME (Q9VZS3    ), SUI11_ARATH (P41568    ), SUI12_ARATH (Q94JV4    ), 
SUI1_AERPE  (Q9YBG9    ), SUI1_ARCFU  (O29348    ), SUI1_ASHGO  (Q755R1    ), 
SUI1_BRAOL  (Q9SQF4    ), SUI1_CENSY  (A0RWW9    ), SUI1_HALLT  (B9LR02    ), 
SUI1_HALMA  (Q5UZP9    ), SUI1_HALS3  (B0R868    ), SUI1_HALSA  (Q9HME3    ), 
SUI1_HYPBU  (A2BIX0    ), SUI1_IGNH4  (A8AC05    ), SUI1_MAIZE  (P56330    ), 
SUI1_METAC  (Q8TIT3    ), SUI1_METB6  (A7I9K6    ), SUI1_METBF  (Q46F27    ), 
SUI1_METBU  (Q12UF1    ), SUI1_METHJ  (Q2FTC8    ), SUI1_METJA  (Q57902    ), 
SUI1_METKA  (Q8TX33    ), SUI1_METLZ  (A2SQ91    ), SUI1_METM5  (A4FWB4    ), 
SUI1_METM6  (A9A9Q7    ), SUI1_METM7  (A6VGZ2    ), SUI1_METMA  (Q8PYK3    ), 
SUI1_METMJ  (A3CX23    ), SUI1_METMP  (Q6LXE5    ), SUI1_METPE  (B8GDE2    ), 
SUI1_METS5  (A4YIU6    ), SUI1_METST  (Q2NFW4    ), SUI1_METTH  (O26118    ), 
SUI1_METTP  (A0B635    ), SUI1_METVA  (P14021    ), SUI1_MIMIV  (Q5UQD7    ), 
SUI1_NATPD  (Q3IU96    ), SUI1_NITMS  (A9A389    ), SUI1_ORYSI  (A6MZM2    ), 
SUI1_ORYSJ  (Q0D5W6    ), SUI1_PICTO  (Q6L1B9    ), SUI1_PIMBR  (O82569    ), 
SUI1_PYRAB  (Q9V1U3    ), SUI1_PYRAE  (Q8ZTB0    ), SUI1_PYRFU  (Q8U006    ), 
SUI1_PYRHO  (P58193    ), SUI1_SALBA  (O48650    ), SUI1_SCHPO  (P79060    ), 
SUI1_SPOST  (Q9SM41    ), SUI1_SULAC  (Q4JAE7    ), SUI1_SULTO  (Q975S0    ), 
SUI1_THEGJ  (C5A278    ), SUI1_THEKO  (Q5JDH7    ), SUI1_THEON  (B6YSM1    ), 
SUI1_THEVO  (Q97BW9    ), SUI1_YEAST  (P32911    ), TMA64_YEAST (Q04600    ), 
Y1225_HAEIN (P45116    ), Y546_SYNY3  (Q55397    ), YCIH_ECOLI  (P08245    ), 
YCIH_SALTI  (P0A2G8    ), YCIH_SALTY  (P0A2G7    )
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
'Unknown' sequences
1 sequence

RM49_DROME  (Q9VYI3    )

		
PDB
[Detailed view]
10 PDB

1D1R; 2IF1; 2OGH; 2RVH; 3J80; 3J81; 3JAM; 4KZX; 4KZY; 4MO0

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission