PROSITE entry PS50296
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | SUI1 |
| Accession [info] | PS50296 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2001 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00862 |
| Associated ProRule [info] | PRU00200 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Translation initiation factor SUI1 family profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=71; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=66; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.2859000; R2=0.0154785; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4167.2734375; R2=3.9856045; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=467; H_SCORE=6029; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=337; H_SCORE=5510; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-60; B1=-60; E0=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='I'; M= -6,-29,-21,-35,-29, 0,-35,-29, 38,-24, 16, 15,-24,-25,-23,-23,-16, -6, 36,-24, -5,-29; /M: SY='H'; M=-12, -2,-27, -3, 2,-21,-23, 17,-14, 3,-13, -2, -1,-15, 8, 2, -7, -7,-14,-25, -2, 3; /M: SY='I'; M= -9,-29,-26,-38,-29, 2,-37,-28, 44,-27, 18, 21,-21,-22,-21,-27,-19, -9, 31,-21, -1,-29; /M: SY='R'; M=-10, -9,-26,-11, -2,-13,-20, -4,-16, 15,-14, -4, -4,-17, 3, 27, -6, -4,-11,-17, 0, -3; /M: SY='I'; M= -8,-12,-22,-17, -8,-10,-26,-17, 5, -7, 3, 2, -9,-17, -6, -4, -7, 5, 4,-24, -7, -9; /M: SY='Q'; M= 0, -3,-23, -4, 10,-23,-18, -9, -9, -4,-11, -6, -5,-11, 11, -7, 1, 1, -9,-25,-13, 10; /M: SY='Q'; M= -6, -4,-26, -3, 12,-27,-18, -3,-18, 12,-18, -4, -3, -7, 20, 11, -1, -4,-17,-24,-13, 16; /M: SY='R'; M=-15,-10,-30,-10, -2,-22,-10, -4,-30, 23,-22,-11, -1,-15, 5, 52, -8,-11,-21,-20,-13, -2; /M: SY='R'; M= -5, 5,-22, -3, -3,-19,-12, -3,-17, 7,-19,-11, 16,-17, 3, 20, 3, 1,-16,-28,-14, -2; /M: SY='G'; M= -6, -9,-28,-10,-11,-14, 21,-13,-29, 1,-24,-13, -3,-18,-11, -4, -4,-13,-21,-14, -9,-11; /M: SY='R'; M=-11, -1,-28, -4, -5,-24, 12, -5,-32, 11,-26,-15, 10,-19, -1, 27, -4,-12,-25,-23,-18, -5; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 49,-30,-10, 0,-10, 10, 31,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='T'; M= -6, -9,-15,-11, -6, -8,-15,-13,-12, -2,-11, -8, -7,-17, -8, -4, 1, 6, -5,-22, -4, -7; /M: SY='V'; M= -4,-29,-16,-31,-26, 1,-30,-25, 29,-21, 19, 16,-27,-27,-24,-19,-16, -4, 35,-26, -6,-26; /M: SY='T'; M= 0, -2, -5,-11,-11,-10,-20,-21, -9,-11,-10,-10, -2,-12,-11,-11, 18, 44, 2,-31,-11,-11; /M: SY='V'; M= -3,-16,-17,-21,-17, -7,-25,-21, 9,-11, 3, 2,-13,-19,-14, -7, -3, 11, 14,-26, -8,-17; /M: SY='V'; M= -3,-30,-17,-33,-30, 0,-33,-30, 37,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 43,-27, -7,-30; /M: SY='Q'; M= -4, 1,-16, 1, 13,-27,-15, -5,-23, 5,-23,-12, 2,-10, 17, 4, 11, 5,-19,-30,-15, 14; /M: SY='G'; M= -2, -1,-28, -5,-17,-28, 58,-15,-37,-17,-30,-20, 10,-20,-17,-17, 2,-17,-30,-23,-28,-17; /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-33,-24, 16,-32,-22, 24,-29, 35, 19,-26,-27,-22,-22,-25,-10, 15,-17, 3,-23; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='E'; M= 7, 8,-24, 12, 18,-29,-11, -8,-24, 2,-21,-18, 0, 1, 4, -8, 4, -5,-19,-29,-20, 11; /M: SY='Y'; M= -7,-12,-21,-13, -7, -2,-23,-12, -4, -2, 1, 0,-12,-19, -9, -4, -9, 0, -1,-16, 3, -9; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='D'; M= -8, 14,-28, 23, 16,-31, 7, -6,-32, -4,-23,-20, 5,-11, 2,-10, 1,-11,-26,-30,-21, 9; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='I'; M= -8,-23,-24,-28,-21, 9,-30,-18, 22,-22, 15, 11,-19,-23,-18,-21,-17, -8, 14,-13, 9,-21; /M: SY='D'; M=-11, 29,-27, 40, 17,-32, -9, -4,-29, 0,-25,-23, 13,-10, 1, -9, 2, -7,-23,-35,-19, 9; /M: SY='L'; M=-10,-23,-25,-23,-13, -1,-27,-15, 8,-18, 21, 10,-23, -7,-11,-15,-21, -8, 0,-19, -1,-13; /M: SY='K'; M= -7, 5,-27, 6, 12,-25,-17, -6,-26, 26,-25,-13, 2,-10, 8, 13, -3, -4,-19,-22, -8, 9; /M: SY='K'; M= -5, 3,-25, 6, 16,-26,-15, -8,-25, 19,-23,-14, 1,-10, 7, 11, 3, -4,-17,-28,-15, 11; /M: SY='L'; M= -1,-27,-19,-31,-22, 10,-27,-22, 20,-26, 27, 14,-24,-25,-21,-21,-19, -8, 15,-18, -1,-22; /M: SY='A'; M= 22,-14,-14,-20,-13,-13, -8,-19, -1,-15, -1, -3,-12,-16,-11,-18, 3, 0, 4,-23,-15,-12; /M: SY='K'; M= 5, -3,-23, -6, 3,-25,-13,-11,-24, 26,-24,-11, -1,-11, 4, 19, 1, -4,-14,-23,-14, 3; /M: SY='E'; M= -1, 0,-23, 2, 4,-15,-18,-12,-10, -4, -7, -7, -5,-12, -5, -9, -4, -3, -7,-24,-10, -1; /M: SY='L'; M=-12,-29, -8,-32,-23, 21,-30,-21, 12,-30, 36, 13,-27,-31,-25,-21,-26,-10, 6,-17, 3,-23; /M: SY='K'; M= 0, -3,-27, -4, 5,-29,-11,-10,-26, 30,-25,-10, -2,-11, 10, 19, -5, -9,-19,-20,-13, 7; /M: SY='K'; M= -4, 3,-26, 2, 9,-30,-15, -5,-26, 25,-27,-11, 4,-11, 16, 16, 2, -5,-20,-25,-13, 12; /M: SY='K'; M=-11, -3,-29, -3, 6,-21,-17, -9,-21, 23,-20, -9, -2,-14, 4, 23, -9,-10,-16,-21,-10, 3; /M: SY='C'; M=-11,-25, 31,-34,-28, 30,-28,-24, -9,-29, 3, -5,-21,-33,-32,-24,-16, -9, -2,-17, 2,-28; /M: SY='A'; M= 28, -8, -6,-15,-10,-23, 9,-17,-18,-12,-17,-13, -4,-14, -8,-17, 9, -3, -9,-25,-22, -9; /M: SY='C'; M= 0,-13, 65,-22,-22,-19,-18,-26,-24,-22,-18,-17,-12,-28,-22,-23, 1, 4, -8,-40,-24,-22; /M: SY='G'; M= 0, 3,-23, -1,-11,-26, 40,-11,-31,-14,-30,-20, 15,-18,-11,-14, 11, -7,-26,-29,-26,-11; /M: SY='G'; M= 6, -8,-15,-11,-16,-23, 33,-20,-28,-17,-23,-17, -1,-17,-16,-18, 8, 1,-18,-25,-24,-16; /M: SY='T'; M= 8, 0,-10, -7, -6,-15,-10,-16,-14,-10,-18,-14, 4,-10, -6,-11, 26, 33, -4,-33,-15, -6; /M: SY='V'; M= 2,-28,-13,-30,-28, -1,-29,-29, 28,-21, 12, 10,-27,-27,-27,-21,-11, -2, 41,-27, -9,-28; /M: SY='K'; M= -4, -7,-20,-10, -7,-16,-17,-17, -6, 5,-14, -5, -4,-16, -7, -1, 0, 4, 2,-27,-12, -7; /M: SY='E'; M=-10, 12,-29, 15, 20,-30, -9, -4,-30, 16,-27,-17, 9, -4, 9, 6, -2, -9,-27,-28,-18, 14; /I: I=-4; MD=-19; /M: SY='G'; M= -4, 6,-24, 8, -3,-23, 12, -4,-24,-11,-17,-14, 5,-16, -8,-13, 0, -8,-19,-28,-17, -6; D=-4; /I: I=-4; MD=-19; /M: SY='P'; M= 1, -7,-19, -4, 1,-17, -9, -9,-11, -3,-15, -9, -8, 30, -1, -8, -2, -4,-14,-16,-14, -2; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='E'; M= -6, 3,-15, 6, 15,-11,-11, -3,-15, 6,-11, -8, 0, -5, 6, 1, 0, -3,-13,-14, -7, 11; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='K'; M= -7, -2,-16, 0, 1, -9,-10, -1,-10, 8, -6, -2, -3,-10, 0, 3, -7, -6, -9,-10, 1, 0; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='G'; M= 0, -4, -8, -5, -7,-16, 15, -5,-20, -3,-17,-10, 0,-11, -6, -5, 0, -7,-14,-16,-13, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='E'; M= -4, 5,-17, 10, 18,-15,-11, -1,-15, 1, -9, -9, -1, -6, 7, -3, -1, -5,-14,-17, -7, 12; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='E'; M= -7, -7,-19, -5, 12,-20,-24,-10, -5, -3, -9, -5,-10,-14, 7, -4, -4, -6, -2,-28,-13, 8; /M: SY='I'; M= -7,-30,-24,-36,-29, 1,-36,-29, 42,-27, 20, 17,-24,-24,-23,-26,-18, -7, 34,-23, -3,-29; /M: SY='Q'; M= -9, -2,-27, 2, 22,-27,-22, -3,-12, 2,-11, -5, -6,-11, 24, -2, -4, -9,-14,-26,-13, 23; /M: SY='I'; M= -8,-30,-23,-35,-26, 4,-35,-26, 35,-28, 30, 18,-25,-25,-22,-25,-22, -8, 25,-22, -2,-26; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='D'; M=-16, 39,-29, 50, 17,-35, -6, -1,-35, -1,-29,-27, 22, -5, 0, -9, 1, -9,-30,-38,-21, 8; /M: SY='H'; M=-11, -9,-26,-10, 0,-18,-23, 21,-10, -2,-10, 2, -5,-18, 17, 0, -8,-11,-10,-23, 0, 7; /M: SY='R'; M=-11,-12,-24,-15, -9,-15,-16,-10,-10, 8,-12, -2, -5,-20, -3, 25, -6, -4, -2,-24,-11, -9; /M: SY='D'; M=-13, 13,-29, 19, 11,-27,-12, 9,-28, 8,-23,-15, 6,-13, 6, 3, -5,-11,-24,-25, -6, 8; /M: SY='N'; M=-11, 9,-25, 8, 5,-17,-15, 2,-21, 5,-16,-11, 10,-16, 1, 6, -3, -7,-19,-28,-10, 3; /M: SY='I'; M= -5,-30,-20,-33,-27, 2,-33,-27, 34,-26, 23, 16,-26,-26,-23,-24,-18, -6, 31,-24, -4,-27; /M: M= -5,-11,-11,-13, -3,-15,-17,-10,-10, -1, -9, -4, -8,-17, -6, -6, -7, -8, -7,-26,-11, -5; /M: SY='E'; M= -9, 12,-26, 16, 18,-26,-16, -5,-26, 4,-22,-17, 4, -9, 9, 0, 3, 0,-22,-20,-13, 14; /M: SY='F'; M=-15,-25,-23,-28,-19, 29,-29, -8, 7,-23, 17, 6,-21,-27,-22,-17,-21,-11, 2, -1, 20,-20; /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22, 7,-32,-21, 27,-29, 40, 23,-27,-27,-19,-22,-27,-10, 15,-20, 0,-22; /M: SY='L'; M= -4,-12,-20,-14, -5,-10,-23,-11, 2,-12, 3, 0,-10,-15, -8,-11, -6, 1, 3,-27, -9, -7; /M: SY='E'; M= -6, 8,-27, 12, 29,-30,-16, -2,-27, 16,-24,-15, 4, -7, 18, 7, 2, -6,-24,-28,-16, 23; /M: SY='K'; M= -5, -8,-24,-10, 2,-17,-21, -6,-10, 8, -6, 1, -8,-15, 5, 4, -8, -4, -9,-23, -8, 3; /M: SY='G'; M= -8,-16,-31,-16,-20, -7, 25,-13,-23,-19,-14,-12,-11,-24,-18,-18,-12,-18,-21, 10, 3,-20; /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 114 in 114 different sequences |
| Number of true positive hits | 113 in 113 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 1 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | K_Hofmann, N_Hulo |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | SUI1 |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
113 sequences
DENR_ASPCL (A1C8E3), DENR_ASPFU (Q4WBL6), DENR_ASPNC (A2QHG9), DENR_ASPOR (Q2TVZ2), DENR_BOTFB (A6SIZ0), DENR_BOVIN (Q2HJ47), DENR_CAEEL (Q9NAH4), DENR_CANGA (Q6FXQ4), DENR_CHAGB (Q2H5Z7), DENR_CHICK (Q5ZJ39), DENR_COCIM (Q1E556), DENR_CRYNB (P0CR81), DENR_CRYNJ (P0CR80), DENR_DANRE (Q6DH65), DENR_DEBHA (Q6BH22), DENR_DICDI (Q54WG0), DENR_DROME (Q9VX98), DENR_EREGS (Q75CN1), DENR_HUMAN (O43583), DENR_KLULA (Q6CJ30), DENR_LODEL (A5E3R9), DENR_MOUSE (Q9CQJ6), DENR_NEOFI (A1DAY1), DENR_NEUCR (Q9P3T4), DENR_PICGU (A5DGV3), DENR_PICST (A3LSY0), DENR_PONAB (Q5RFP5), DENR_PYRO7 (A4QVI3), DENR_SCHPO (O42929), DENR_VANPO (A7TES6), DENR_XENLA (Q6GLZ1), DENR_XENTR (Q6DFN7), DENR_YARLI (Q6CA08), DENR_YEAS7 (A6ZPY2), DENR_YEAST (P47089), EIF1B_HUMAN (O60739), EIF1B_MACFA (Q4R4X9), EIF1B_MOUSE (Q9CXU9), EIF1B_PIG (P61220), EIF1_BOVIN (Q5E938), EIF1_CHICK (P51971), EIF1_HUMAN (P41567), EIF1_MOUSE (P48024), EIF1_PONAB (Q5RFF4), EIF2D_BOVIN (Q58CR3), EIF2D_HUMAN (P41214), EIF2D_MOUSE (Q61211), EIF2D_PONAB (Q5RA63), EIF2D_RABIT (P0CL18), EIF2D_RAT (Q5PPG7), ETIF1_ANOGA (P42678), ETIF1_DROME (Q9VZS3), SUI11_ARATH (P41568), SUI12_ARATH (Q94JV4), SUI1_AERPE (Q9YBG9), SUI1_ARCFU (O29348), SUI1_BRAOL (Q9SQF4), SUI1_CENSY (A0RWW9), SUI1_EREGS (Q755R1), SUI1_HALLT (B9LR02), SUI1_HALMA (Q5UZP9), SUI1_HALS3 (B0R868), SUI1_HALSA (Q9HME3), SUI1_HYPBU (A2BIX0), SUI1_IGNH4 (A8AC05), SUI1_MAIZE (P56330), SUI1_METAC (Q8TIT3), SUI1_METB6 (A7I9K6), SUI1_METBF (Q46F27), SUI1_METBU (Q12UF1), SUI1_METHJ (Q2FTC8), SUI1_METJA (Q57902), SUI1_METKA (Q8TX33), SUI1_METLZ (A2SQ91), SUI1_METM5 (A4FWB4), SUI1_METM6 (A9A9Q7), SUI1_METM7 (A6VGZ2), SUI1_METMA (Q8PYK3), SUI1_METMJ (A3CX23), SUI1_METMP (Q6LXE5), SUI1_METPE (B8GDE2), SUI1_METS5 (A4YIU6), SUI1_METST (Q2NFW4), SUI1_METTH (O26118), SUI1_METTP (A0B635), SUI1_METVA (P14021), SUI1_MIMIV (Q5UQD7), SUI1_NATPD (Q3IU96), SUI1_NITMS (A9A389), SUI1_ORYSI (A6MZM2), SUI1_ORYSJ (Q0D5W6), SUI1_PICTO (Q6L1B9), SUI1_PYRAB (Q9V1U3), SUI1_PYRAE (Q8ZTB0), SUI1_PYRFU (Q8U006), SUI1_PYRHO (P58193), SUI1_SALBA (O48650), SUI1_SCHPO (P79060), SUI1_SPOST (Q9SM41), SUI1_SPUBR (O82569), SUI1_SULAC (Q4JAE7), SUI1_SULTO (Q975S0), SUI1_THEGJ (C5A278), SUI1_THEKO (Q5JDH7), SUI1_THEON (B6YSM1), SUI1_THEVO (Q97BW9), SUI1_YEAST (P32911), TMA64_YEAST (Q04600), Y1225_HAEIN (P45116), Y546_SYNY3 (Q55397), YCIH_ECOLI (P08245), YCIH_SALTI (P0A2G8), YCIH_SALTY (P0A2G7)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot 'Unknown' sequences |
1 sequence
RM49_DROME (Q9VYI3) |
| PDB [Detailed view] |
33 PDB
1D1R; 2IF1; 2OGH; 2RVH; 3J80; 3J81; 3JAM; 3JAP; 4KZX; 4KZY; 4MO0; 5JB3; 5JBH; 5OA3; 5OA9; 5VYC; 5W2F; 5ZCY; 6GSM; 6GSN; 6VPQ; 6VPR; 6YBW; 6ZCE; 6ZMW; 6ZP4; 6ZVJ; 7A09; 7QP6; 8CAH; 8PPK; 8PPL; 8XXN » more |