Entry: PS50600

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] ULP_PROTEASE
Accession [info] PS50600
Entry type [info] MATRIX
Date [info] APR-2002 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50600

Name and characterization of the entry

Description [info] Ubiquitin-like protease family profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=176;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=171;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6647; R2=0.01252843; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9194.15232; R2=19.06402; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=545; N_SCORE=8.5; H_SCORE=18078; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=385; N_SCORE=6.5; H_SCORE=16553; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-7;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='I'; M= -9,-25,-23,-30,-24,  3,-32,-17, 24,-17, 11, 12,-20,-24,-18,-13,-16, -7, 22,-18,  4,-23;
/M: SY='V'; M=  0,-12,-14,-13, -5,-15,-21,-16, -2, -6, -3, -2,-12,-15, -4,-10, -5, -3,  1,-26,-12, -5;
/M: SY='I'; M= -8,-28,-23,-34,-26,  4,-33,-24, 33,-24, 20, 19,-23,-24,-18,-22,-18, -8, 26,-21, -1,-24;
/M: SY='T'; M= -1, -6,-16, -9, -6,-16,-17,-14,-14, -2,-14,-10, -4,-12, -3,  2,  5, 10, -7,-22,-12, -6;
/M: SY='N'; M=-10,  3,-24, -2, -2,-14,-12, -3, -9, -4,-10, -5,  9,-18, -3, -5, -5, -6,-11,-27,-10, -2;
/M: SY='K'; M= -8,  2,-27,  3, 15,-26,-17, -5,-23, 17,-20,-10,  1, -7, 11, 14, -3, -6,-20,-25,-14, 12;
/M: SY='D'; M=-17, 26,-27, 35,  9,-16,-16, -6,-27, -1,-21,-20, 10,-14, -6, -8, -4, -8,-21,-29,-10,  2;
/M: SY='F'; M=-12,-18,-22,-19,-16, 15,-23,-17,  6,-20, 12,  3,-17,-24,-20,-15,-15, -8,  5,-15,  4,-18;
/M: SY='K'; M= -6, -3,-20, -2,  2,-18,-15, -6,-21,  3,-18,-12, -5,-15, -1, -1, -3, -4,-16,-12, -8,  1;
/M: SY='T'; M= -7, -9,  4,-12, -6,-16,-22, -8,-13,-13,-11, -9, -6, -9, -7,-12,  1,  6,-10,-33,-13, -8;
/M: SY='L'; M=-11,-20,-22,-20,-14,  5,-28,-18, 13,-24, 29, 12,-22,-22,-17,-19,-23,-10,  6,-21, -2,-16;
/M: SY='A'; M=  3, -4,-21, -7, -1,-15,-15,-10,-11,  2,-13, -8, -2,-15, -1,  0,  0, -3, -7,-23,-10, -2;
/M: SY='P'; M= -8,  0,-30,  3, 10,-28,-13,-11,-24, 10,-25,-16, -2, 15,  1,  2, -4, -8,-22,-27,-20,  4;
/M: SY='P'; M= -6, -6,-29, -6, -3,-25, -2, -2,-25,  2,-24,-13, -1,  9, -2,  1, -3, -8,-23,-26,-17, -4;
/M: SY='E'; M=-11,  6,-27,  6,  9,-23, -7,  4,-25,  1,-19,-13,  8,-10,  6,  5, -2, -6,-24,-26,-11,  6;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='W'; M=-18,-35,-32,-37,-28, 19,-24,-24, -9,-22, -6,-10,-33,-30,-23,-20,-32,-21,-15, 86, 26,-23;
/M: SY='L'; M= -7,-29,-18,-30,-24, 12,-29,-23, 21,-26, 30, 14,-27,-28,-24,-20,-20, -6, 20,-21, -1,-24;
/M: SY='N'; M= -7, 16,-21,  8, -1,-19,  3, -3,-19, -7,-18,-15, 26,-18, -5, -7,  6,  1,-21,-33,-18, -3;
/M: SY='D'; M=-14, 36,-26, 48, 14,-34,-10, -2,-33,  1,-28,-25, 17,-10,  2, -7,  6, -2,-25,-38,-18,  8;
/M: SY='T'; M= -4, -1,-19,  0,  1,-14,-19,-11, -9, -8, -8, -7, -5,-11, -4,-11,  4, 10, -4,-27, -9, -2;
/M: SY='H'; M= -8,-12,-24,-17,-15,-10,-25, 10,  9,-15, -1,  8, -7,-20, -8,-12, -9, -9,  7,-27,  0,-15;
/M: SY='I'; M= -9,-25,-25,-33,-24,  0,-33,-21, 33,-22, 19, 24,-19,-21,-15,-20,-17, -5, 21,-21, -1,-22;
/M: SY='D'; M= -5, 22,-18, 23, 17,-24,-11, -3,-26, -2,-22,-20, 15,-12,  1, -8,  3, -4,-23,-33,-18,  9;
/M: SY='F'; M=-10,-25,-21,-32,-24, 37,-26,-11,  5,-22,  9,  8,-20,-26,-24,-18,-18,-10,  4,  4, 20,-23;
/M: SY='Y'; M=-16,-20,-26,-21,-18, 21,-27,  3,  3,-13,  6,  8,-19,-23,-13,-10,-19, -9, -3,  6, 39,-18;
/M: SY='L'; M= -3,-17,-19,-21,-17, -4,-22,-17, 12,-18, 13, 12,-18,-22,-13,-17,-11, -1, 11,-22, -4,-16;
/M: SY='K'; M= -8,  2,-19,  1,  8,-23,-16, -7,-22, 13,-21,-11,  4, -9,  5, 10,  1, -3,-18,-29,-15,  6;
/M: SY='Y'; M=-11,-21,-23,-23,-19, 13,-28, -5, 10,-18, 17,  9,-20,-26,-16,-15,-20, -9,  5, -7, 20,-19;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-24,-31,-22,  4,-30,-19, 22,-22, 26, 19,-25,-21,-17,-17,-23,-10, 13,-13,  2,-21;
/M:         M= -4,-13,-13,-15, -8,-13,-14,-15, -9, -8,-10, -4,-11,-18, -5,-10, -3, -1, -5,-12, -8, -6;
/M: SY='H'; M=-14,  2,-23,  3,  9,-20,-16, 13,-24,  5,-17, -8,  3,-15,  8,  9, -6, -9,-22,-26, -7,  7;
/M: SY='R'; M=-12, -8,-26, -8,  2,-18,-17,  1,-18,  9, -9, -3, -4,-17,  7, 19, -8, -7,-15,-23, -8,  3;
/M: SY='L'; M= -4,-14,-20,-18,-12, -4,-20,-16,  4,-15,  5,  3,-10,-21,-11,-13, -6, -2,  4,-17, -6,-11;
/M:         M= -3,-13,-21,-15, -9, -6,-12,-15, -7, -9, -3, -4, -9,-12,-10, -8, -4, -1, -6,-22, -9,-10;
/M: SY='E'; M= -5, -5,-24, -5,  6,-18,-14,-11,-19,  4,-19,-13, -2,  1, -1,  3,  3,  2,-16,-27,-15,  1;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='D'; M= -8, 10,-22, 13,  8,-24,-13,  5,-24,  8,-21,-13,  6,-10,  6,  6,  3,  0,-18,-26,-10,  6; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='E'; M= -6, -2,-21, -1,  2,-14,-10, -6,-12, -6, -9, -5, -2, -1, -2, -7, -1, -4,-13,-23, -9, -1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='K'; M= -5, -5,-23, -6, -1,-18,-15,-10, -8,  3,-13, -4, -3,  0,  1, -1, -3, -2, -9,-22,-12, -1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='N'; M= -1, -3,-20, -7, -3,-14, -8, -9,-10, -1,-10, -7,  2, -9, -4, -3, -1, -2,-10,-21,-10, -5; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='Q'; M= -7,  0,-22,  0,  5,-15,-14,  4,-15,  1,-14, -8,  2, -8,  8,  2,  0, -4,-17,-18, -1,  5; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='R'; M=  1, -6,-18, -9, -2,-10,-11, -5,-15,  6,-11, -7, -2,-11, -1, 16, -2, -4,-10,-15, -6, -3; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='N'; M= -3,  5, -8,  3,  2,-11, -7, -1,-12,  0,-13, -9,  7, -9,  2,  0,  5,  2,-10,-16, -5,  1; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M: SY='C'; M= -3,-22, 19,-27,-25, -4,-27,-25,  7,-22, -2, -2,-19,-27,-23,-22, -5,  1, 17,-30,-10,-25;
/M: SY='H'; M= -8,-10,-25,-13,-10, -6,-20, 36,-12,-11, -9,  1, -4,-20, -3, -5, -8,-10,-12,-14, 16, -9;
/M: SY='F'; M= -2,-18,-19,-25,-20, 13,-21,-19,  8,-18,  7,  4,-12,-23,-20,-17,-11, -6,  7,-16,  0,-20;
/M: SY='F'; M=-13,-22,-17,-28,-20, 24,-27,-17,  4,-17, 11,  8,-17,-20,-22,-14,-18, -9,  3,-13,  5,-20;
/M: SY='N'; M=-12, 26,-25, 21,  3,-24, -7,  6,-25,  1,-28,-20, 31,-13,  2,  2,  4, -4,-28,-28,-15,  2;
/M: SY='T'; M= -1, -6,-14, -9, -7,-19,-11,-18,-18,-10,-21,-15, -3, 12, -9,-11, 14, 21,-12,-32,-19, -9;
/M: SY='F'; M=-15,-28,-19,-36,-27, 48,-26,-19, -3,-25,  2, -2,-21,-28,-30,-19,-19,-11, -4, 24, 23,-25;
/M: SY='F'; M=-16,-24,-22,-31,-21, 47,-28,-17, -3,-14,  8,  3,-17,-26,-26,-10,-19,-10, -2, -1, 17,-20;
/M: SY='W'; M=-10,-25,-28,-27,-22, 14,-24,-10, -2,-16, -3, -4,-24,-21,-17,-16,-18, -8, -5, 34, 29,-20;
/M: SY='S'; M= -7, -2,-23, -3, -5,-13, -8, -8,-18, -1,-19,-10,  1, -6, -7, -3,  2,  0,-13,-26,-12, -6;
/M: SY='K'; M=-11, -1,-25, -5, -1,-16,-17,  2,-19, 18,-15, -3,  4,-17,  3, 17, -7, -8,-16,-24, -7,  0;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-31,-22, 10,-30,-20, 20,-28, 41, 17,-29,-29,-20,-20,-28,-10, 11,-12,  4,-21;
/M: SY='T'; M=  3, -9,-17,-13, -7,-14,-16,-13, -5, -7, -3, -3, -6,-16, -2, -7,  4,  5, -2,-27,-11, -5;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='S'; M= -2,  1,-17, -1,  5,-15, -9, -7,-17, -3,-15,-11,  3,-11,  3, -1, 10,  7,-13,-25,-12,  4; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='R'; M= -5,  3,-12,  4,  1,-15,-11, -1,-16,  7,-11, -8,  2,-11,  0,  8, -5, -6,-11,-18, -8, -1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='F'; M= -8,-10,-17,-11, -9,  6,-14, -9,  1,-12,  2,  0,-10,-11,-10,-11, -9, -6,  0, -8,  5,-10; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='A'; M=  5, -3,-14, -5,  1,-15, -9, -5,-14,  5,-13, -8, -2, -1,  0,  3,  3,  2, -9,-17,-10,  0; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M: SY='N'; M= -3, 13, -8,  8,  1,-15, -4, -2,-15,  4,-18,-12, 17,-10,  0,  0,  6,  0,-14,-23,-12,  0; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='G'; M= -5, -6,-19, -6, -9, -5, 15,-11,-13,-12,-10, -6, -3,-13,-12,-12, -4,-10,-11,-12, -9,-10; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='K'; M= -4, -5,-14, -6, -1,-11,-10, -7, -5,  1, -6, -1, -3,-11,  1,  0, -1,  1, -2,-18, -8, -1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='A'; M=  2, -1, -9, -2, -2,-18, -4,  2,-19,  0,-15, -9,  0,-12,  0,  1,  1, -3,-13,-20,-10, -2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='A'; M=  5, -3,-17, -5, -5,-18, -8,-13,-13, -3,-10, -8, -4,-15, -7, -7, -4, -8, -9,-22,-12, -7; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='N'; M= -7,  3,-26, -1,  2,-15,  2, -1,-20, -2,-19,-13,  9,-12, -3, -4, -2, -9,-21,-21, -9, -1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='Y'; M=-15, -5,-20, -4, -8,  2,-21,  9,-13, -4,-10, -5, -4,-22, -4,  2, -9, -8,-13, -8, 21, -8; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='P'; M= -4, -5,-27, -2,  8,-26,-15,-11,-19,  8,-21,-12, -5,  9,  2,  0, -3, -7,-15,-27,-18,  4;
/M: SY='R'; M= -3, -5,-25, -7, -2,-21, -4,-11,-21,  2,-20,-11,  0,  0, -3,  5,  1, -2,-18,-26,-18, -4;
/M: SY='V'; M= -8, -6,-20, -9, -8, -5,-17,-12, -3, -6, -8, -5, -2,-22,-10, -4, -5, -5,  4,-26, -9, -9;
/M: SY='R'; M=-10,-14,-23,-16, -8, -8,-22,-10, -5,  5, -1,  5,-11,-20, -2, 10,-10, -6, -3,-20, -3, -6;
/M: SY='R'; M=-14, -4,-29, -3,  8,-25,-20,  0,-29, 33,-24,-10,  1,-14, 10, 42, -8, -8,-21,-22, -9,  7;
/M: SY='W'; M=-17,-35,-43,-36,-27, 11,-20,-26,-16,-19,-17,-17,-34,-29,-19,-19,-31,-23,-23,117, 26,-19;
/M: SY='T'; M=  1,-15,-20,-21,-16, -8,-14,-21,  1,-15, -2, -1,-11,-17,-13,-16, -1,  8,  2,-12, -7,-15;
/I:         I=-3; MD=-14;
/M: SY='R'; M=-11,  0,-26,  0,  7,-22,-18, -6,-22, 20,-17, -9,  2,-10,  6, 21, -6, -4,-18,-23,-11,  5; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-14;
/M: SY='D'; M=-13, 15,-28, 20,  5,-28, -8,  1,-28,  5,-24,-17,  9, -1, -1, -1, -3, -8,-24,-30,-15,  1; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='V'; M= -2,-24,-16,-27,-23,  5,-27,-24, 17,-17,  6,  5,-22,-21,-23,-18,-10,  0, 25,-21, -3,-24;
/M: SY='D'; M=-16, 40,-29, 55, 20,-37,-11,  3,-37,  3,-28,-26, 17,-10,  2, -7,  0,-10,-28,-37,-18, 11;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='L'; M= -8,-24,-20,-27,-20,  2,-27,-20, 20,-18, 21, 15,-22,-23,-16,-14,-18, -6, 16,-14, -1,-19; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='F'; M=-10,-19,-15,-24,-16, 33,-20,-12,  2,-16,  9,  5,-14,-19,-18,-11,-14, -7,  1, -1, 12,-15; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='D'; M= -4,  9,-12, 11,  8,-19, -9, -1,-19,  2,-15,-12,  7, -9,  1, -1,  2, -3,-15,-24,-12,  4; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='K'; M= -5, -2, -7, -2,  4,-12,-14, -9,-18, 14,-16, -8, -3,-11,  0,  5, -4, -6,-12,-17, -8,  2; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='D'; M= -8, 22,-19, 31, 11,-24, -7, -3,-24,  5,-20,-17,  9, -7,  1, -3,  2, -4,-17,-24,-13,  6; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='Y'; M=-10,-15,-19,-18,-15, 12,-22,  6,  5,-13,  3,  5,-12,-19,-10,-11,-11, -4,  1,  0, 26,-15; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-23,-35,-28,  3,-35,-26, 37,-27, 23, 17,-24,-25,-22,-25,-20, -8, 29,-20,  1,-28;
/M: SY='F'; M=-16,-26,-23,-30,-24, 40,-30, -9,  7,-22, 11,  4,-21,-26,-25,-17,-19, -8,  3,  5, 33,-24;
/M: SY='V'; M=  2,-23,-17,-29,-24,  0,-27,-25, 23,-21, 11, 11,-20,-22,-20,-21, -9,  1, 25,-23, -6,-23;
/M: SY='P'; M=-10,-21,-39,-13, -3,-27,-22,-21,-14,-12,-26,-17,-20, 80,-11,-21,-11,-10,-25,-29,-27,-12;
/M: SY='I'; M= -8,-27,-22,-34,-26,  1,-32,-21, 35,-23, 22, 29,-23,-23,-17,-22,-19, -8, 26,-22, -2,-24;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='N'; M= -7, 10,-14,  3,  0,-12, -7, 12, -7, -2,-11, -5, 18,-10,  5, -1,  1, -4,-12,-18, -5,  1; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='H'; M=-12, -1,-19, -5, -7,-13,-16,  8,-20, -8,-20,-13,  4,-21, -5, -8, -7, -7,-21,  4,  0, -6;
/M: SY='E'; M= -7,  3,-22,  4,  9,-24, -1,-10,-22, -1,-17,-13,  2,-14, -2, -7, -3,-10,-19,-28,-18,  3;
/M: SY='D'; M= -4,  8,-19, 12,  5,-27,  6,-10,-29, -8,-26,-21,  6,-10, -3,-12,  7, -4,-23,-26,-20,  1;
/M:         M= -5, -5,-15, -7, -1, -8,-18,-11, -8, -5, -7, -5, -3,-18, -7, -7, -2, -3, -5,-25, -8, -4;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='V'; M=  2,-17,  3,-21,-19,  0,-19,-20,  0,-18, -6, -5,-13,-23,-19,-17,  5,  6, 12,-28, -8,-19;
/M: SY='L'; M=  2,-20,-19,-23,-18, -4, -7,-18,  4,-21, 18, 11,-18,-23,-16,-18,-13, -6,  2,-21, -9,-17;
/M: SY='L'; M=  5,-24,-13,-28,-21, -3,-18,-22, 13,-23, 19, 10,-22,-24,-19,-21,-14, -7, 13,-23, -9,-20;
/M: SY='V'; M=  2,-21,-20,-25,-22, -8,-17,-15, 16,-20,  1,  5,-15,-21,-18,-21, -6, -5, 19,-25, -8,-22;
/M: SY='I'; M= -4,-29,-23,-36,-29, -1,-35,-29, 40,-26, 17, 15,-23,-23,-23,-26,-16, -6, 34,-23, -4,-29;
/M: SY='B'; M=-11, 15, 15, 10, -5,-23,-14, -2,-25, -9,-24,-19, 15,-22, -8,-11,  2, -3,-19,-40,-19, -7;
/M: SY='L'; M=-11,-11,-22,-16,-15,  0,-24, -5,  9,-18, 16, 10, -7,-24,-13,-14,-16, -8,  3,-25, -3,-15;
/M: SY='P'; M= -9, -6,-31, -5,  0,-25, -8,-11,-21, -2,-24,-15, -1, 26, -2, -4, -3, -8,-24,-28,-22, -3;
/M: SY='D'; M=-10,  7,-26, 11, 11,-23,-10, -7,-24,  9,-22,-15,  4,-12,  4,  7,  0, -7,-19,-27,-14,  7;
/M: SY='R'; M= -9, -9,-22,-10, -5,-19, -2,-10,-26,  8,-20,-12, -4,-19, -1, 13, -8,-10,-20, -8, -9, -4;
/M:         M=  0,-10,-20,-13, -3,-12,-18, -2, -7, -6, -2,  0, -8,-16, -2, -6, -3, -1, -5,-23, -4, -3;
/M: SY='I'; M= -9,-20,-17,-23,-22, -2,-28,-21, 19,-19,  7,  8,-18,-23,-17,-20,-14, -8, 17,-22, -2,-21;
/M: SY='E'; M= -5,  2,-25,  7, 11,-19,-15,-10,-20, -4,-18,-16, -4, -2, -2, -8,  0, -1,-16,-20,-11,  4;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M:         M= -4, -5,  0, -7, -7, -6,-12, -9, -4, -5, -7, -5, -2,-12, -7, -2,  0, -1, -1,-17, -7, -8; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='Y'; M= -6, -7,-14, -7, -8, -1, -6,  7, -3, -7, -1,  4, -5,-12, -4, -7, -6, -6, -5, -5, 10, -7; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='D'; M= -5,  6,-12, 11,  3,-12, -9, -4, -9, -4, -4, -6,  0, -8, -1, -6,  0, -1, -6,-18, -7,  1; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M: SY='I'; M= -3, -7,-12,-10, -9, -5,-14,-12, 10,-11,  1,  2, -4, -8, -7,-11,  0,  5,  7,-15, -4, -9; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='L'; M= -4,-10,-13,-11, -8,  0,-15, -7,  4, -7,  8,  4,-10,-13, -8, -7,-10, -5,  4,-12, -1, -9; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='Y'; M=-12,-19,-24,-23,-19,  8,-29,  1, 10,-15,  3,  5,-15,-23,-14,-14,-12, -2,  7, -9, 22,-19;
/M: SY='Y'; M=-14,-21,-24,-24,-19, 21,-26, -6,  4,-16, 11,  5,-17,-27,-16, -8,-18, -8, -1,  1, 25,-18;
/M: SY='D'; M=-19, 45,-30, 64, 25,-39,-11,  0,-39,  1,-29,-29, 17, -9,  3, -9,  0,-10,-30,-39,-20, 14;
/M: SY='S'; M=  8, -1,-15,  0, -1,-22,  1, -7,-22,-10,-28,-19,  7, -4, -2,-11, 29, 12,-13,-37,-20, -2;
/M: SY='L'; M= -6,-18,-15,-22,-15,  2,-24,-15,  6,-15, 18, 10,-16,-24,-11,-12,-17, -8,  3,-21, -4,-13;
/M:         M= -3,-13,-22,-16,-13,-10,-12,-15, -4, -6, -9, -4, -7,-15,-10, -2, -1, -2,  0,-23, -9,-13;
/M: SY='N'; M= -4,  0,-21, -3, -6,-18, -4, -7,-15, -7,-13,-10,  4,-14, -5, -4,  1,  0,-12,-29,-15, -7;
/M: SY='H'; M= -2, -9,-24, -9, -4,-16, -1,  1,-19,-10,-13, -9, -4, -6, -5, -8,  0, -6,-17,-25,-11, -6;
/I:         I=-2; MD=-8;
/M: SY='H'; M=-10,  4,-19,  3,  0,-14,-10, 14,-17,  3,-16, -8,  9, -3,  2,  8, -2, -4,-17,-18, -3, -1; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
/M: SY='L'; M= -6,-12,-12,-13,-10,  6,-15, -4,  7,-11, 13,  8,-12,-13, -7, -8,-11, -2,  3, -4, 11,-10; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-8;
/M: SY='I'; M= -3,-11,-11,-12, -7, -3,-15,-11,  9, -8,  6,  4, -9,-11, -7, -8, -6, -3,  9,-13, -3, -8; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-8;
/M: SY='Q'; M= -4,  1,-13,  2,  6,-14, -9,  1,-12,  4,-11, -5,  1, -7,  8,  6,  2, -2, -9,-16, -7,  7; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-8;
/M: SY='E'; M=  1, -3, -6, -4,  3, -8,-10, -6,-11,  1, -6, -6, -4, -9, -2,  2, -3, -4, -8,-14, -8,  0; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-8;
/M: SY='E'; M= -6, -4,-16, -4,  5, -6,-11, -2, -7,  1, -6, -1, -4, -9,  1,  0, -3, -2, -7,-10,  2,  2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-8;
/M: SY='C'; M=  3, -6, 12, -8, -6,-13, -8, -7,-12, -7,-13, -9, -4, -7, -6, -9,  6,  1, -5,-22,-12, -7; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-8;
/M:         M= -1, -7,-16, -7, -4,-10,-14, -9, -4,  0, -3, -2, -8, -2, -3, -4, -6, -3, -4,-13, -4, -4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-8;
/M: SY='D'; M= -9,  7,-21, 13,  9,-20,-12, -2,-17,  1,-14,-11,  2,  2,  2, -2, -2, -6,-15,-23,-12,  4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-8;
/M: SY='K'; M= -4, -7,-18, -6,  2,-10,-16, -6, -9,  9,-10, -5, -7, -8, -1,  3, -5, -4, -5,-12,  1,  0; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-8;
/M: SY='R'; M= -9, -8,-13, -9, -5, -2,-17, -5, -7, -3, -1, -3, -5,-17, -5,  4, -7, -4, -7,-13,  3, -6; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-8;
/M: SY='K'; M= -2, -5,-17, -4, -2,-16, -9,-10,-10,  5,-12, -6, -4,-12, -1,  4, -1, -3, -4,-21,-11, -2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-8;
/M: SY='K'; M= -8, -3,-25, -3,  9,-23,-18, -8,-19, 14,-19, -9, -2, -1,  9, 11, -1,  0,-16,-23,-12,  8; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-8;
/M: SY='N'; M= -8,  6,-26,  6,  3,-23,-11, -5,-18, -3,-22,-14,  8,  7,  3, -5,  0, -3,-20,-28,-16,  1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-8;
/M: SY='Y'; M=-14,-20,-25,-23,-17, 17,-21,  1,  1,-19,  8,  4,-15,-25,-16,-13,-17,-10, -4, -7, 19,-17;
/M: SY='D'; M=-12, 10,-21, 13,  4,-18,-10, -5,-19, -7,-14,-12,  5,-11, -6,-10, -4, -7,-18,-30,-14, -1;
/M: SY='M'; M= -4,-13,-16,-14, -8, -8,-22,-14, -2, -4, -1,  1,-13,-20, -4, -7, -8, -6,  1,-22, -6, -6;
/I:         I=0; MD=-2;
/M: SY='T'; M= -7, -3,-14, -7, -4, -8,-16, -7, -9, -5,-10, -4, -2,-16, -4, -6,  0,  3, -6,-24, -7, -4; D=0;
/I:         I=0; MD=-2;
/M: SY='P'; M= -6, -3,-21, -2,  3,-23,-10, -3,-21, -1,-22,-14,  0,  7,  0, -4,  0, -6,-20,-23,-15,  0; D=0;
/I:         I=0; MD=-2;
/M: SY='F'; M=-16,-22,-20,-27,-23, 39,-26,-18,  0,-22,  5, -2,-19,-26,-27,-17,-19,-11, -2, 13, 18,-22; D=0;
/I:         I=0; MD=-2;
/M: SY='Q'; M= -3, -3,-22, -4,  3,-20, -7, -7,-18,  1,-19,-10, -1, -1,  6, -3,  3,  1,-16,-21,-10,  4; D=0;
/I:         I=0; MD=-2;
/M: SY='Y'; M=-12,-19,-23,-22,-17,  2,-24, -8,  6, -7,  3,  8,-16,-21, -8,  1,-15, -7,  3,  3, 13,-15; D=0;
/I:         I=0; MD=-2;
/M: SY='K'; M= -9, -7,-22, -9,  1, -6,-20, -8, -9,  4, -9, -5, -5,-10,  0,  4, -6, -4, -9,-16, -3,  0; D=0;
/I:         I=0; MD=-2;
/M: SY='N'; M= -9,  4, -9,  1, -3,-17,-14, -1,-18,  1,-15,-11,  7,-13, -1,  6, -2, -4,-16,-25,-10, -3; D=0;
/I:         I=0; MD=-2;
/M: SY='M'; M= -3,-15, -9,-20,-14, -7,-21,-10,  9,-15,  7, 10,-11,-19, -8,-13,-11, -7,  5,-22, -6,-12; D=0;
/I:         I=0; MD=-2;
/M: SY='E'; M= -8,  0,-22,  2,  3,-19,-14, -6,-12, -4,-11, -8, -2,  1,  2, -7, -2,  0,-12,-24,-12,  1; D=0;
/I:         I=0; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2;
/M: SY='K'; M= -7,  5,-24,  2,  5,-24, -4, -5,-24, 13,-23,-13,  8, -9,  6, 11, -1, -5,-21,-23,-15,  5; D=0;
/I:         I=0; DM=-2;
/M: SY='V'; M= -1,-24,-10,-27,-23, -2,-26,-24, 18,-19, 11,  9,-23,-26,-21,-16, -9,  1, 28,-28, -9,-23;
/M: SY='P'; M= -5,-15,-33,-11, -3,-19,-18,-13,-16, -7,-23,-15,-14, 49, -6,-15, -8, -8,-23,-20,-13, -8;
/M: SY='Q'; M= -9, -3,-28, -3, 11,-31,-20,  2,-17,  9,-15, -2, -2,-13, 35, 12, -3, -9,-21,-22,-10, 22;
/M: SY='Q'; M=-11, 12,-27,  6, 12,-32,-14, 12,-21,  8,-24, -7, 19,-14, 36,  9,  2, -7,-29,-27,-12, 24;
/M: SY='P'; M= -9, -7,-26, -8, -4,-18,-18,-11,-12,  2,-14, -6, -4,  3, -2,  2, -4, -1,-13,-25,-11, -5;
/M: SY='N'; M= -9, 20,-22,  8, -2,-19, -7, -1,-15, -3,-22,-15, 31,-14, -3, -1,  6,  4,-20,-34,-17, -3;
/M: SY='T'; M= -5,  5,-20,  4, -5,-12, -3,-13,-20, -9,-19,-14,  4,-10, -9,-11,  9, 11,-14,-28,-13, -7;
/M: SY='G'; M= -6,-14,-19,-16,-17,  1, 11, -9,-19,-18,-16,-12, -7,-18,-17,-16,  0, -8,-14,-12,  2,-18;
/M: SY='D'; M=-19, 45,-30, 62, 19,-38,-11,  4,-38,  1,-29,-28, 20,-11,  1, -7,  0,-10,-30,-39,-18, 10;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='G'; M=  0, -8,-29, -7,-18,-30, 64,-19,-39,-19,-30,-20,  1,-19,-18,-19,  2,-18,-29,-22,-29,-18;
/M: SY='I'; M= -2,-24,-23,-24,-17,-10,-25,-24, 12,-18,  1,  3,-23, 10,-18,-21,-11, -5, 12,-27,-14,-20;
/M: SY='Y'; M=-17,-20,-24,-22,-20, 30,-27, 17, -3,-17, -1,  0,-14,-27,-17,-12,-15,-10, -4,  3, 40,-20;
/M: SY='V'; M=  9,-14,-14,-20,-17, -9,-18,-17,  7,-15, -1,  3,-11,-19,-14,-16,  2,  7, 15,-27,-11,-16;
/M: SY='C'; M= -8,-19, 20,-27,-21, -5,-25,-16,  2,-20, 12, 15,-18,-28,-15,-16,-17, -9,  2,-30,-11,-18;
/M: SY='K'; M= -6, -6,-25, -9,  2,-11,-19,  0,-14, 11,-10,  1, -5,-15,  3,  4,-10, -9,-13,-17, -1,  2;
/M: SY='F'; M=-17,-13,-22,-23,-21, 45,-24,-10, -2,-21,  1, -1, -5,-26,-26,-15,-13, -7, -5, -1, 22,-21;
/M: SY='I'; M=  4,-19,-14,-25,-17, -6,-24,-22, 13,-20, 11,  5,-16,-19,-13,-19, -6,  4, 11,-24, -8,-17;
/M: SY='E'; M=-11,  5,-28, 10, 33,-24,-19, -3,-25, 11,-16,-15,  1, -8, 12, 11, -2, -8,-23,-28,-16, 22;
/M: SY='Y'; M=-11,-17,-14,-19,-12,  2,-21, -7, -4,-11,  2,  1,-13,-23,-10, -4,-11, -6, -5,-15,  6,-13;
/M: SY='F'; M=-14,-24,-23,-28,-19, 27,-27,-11,  8,-24, 17,  7,-20,-26,-20,-17,-20,-10,  2, -7, 15,-19;
/I:         MD=0;
/M: D=0;
/I:         I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
/M: D=0;
/I:         I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
/M: D=0;
/I:         I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
/M: D=0;
/I:         I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
/M: D=0;
/I:         I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
/M: D=0;
/I:         I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
/M: D=0;
/I:         I=0; E1=0; MI=0; IE=0; DE=0;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 41 in 41 different sequences
Number of true positive hits 41 in 41 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 12
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 77.36 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] window20
Author [info] L_Falquet
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
41 sequences

CDUB1_CHLT2 (B0B9A0), CDUB1_CHLTR (O84876), ESD4_ARATH  (Q94F30), 
NEP1_SCHPO  (O42980), NEP2_SCHPO  (O13612), RUBP1_ARATH (Q9LSS7), 
SENP1_HUMAN (Q9P0U3), SENP1_MOUSE (P59110), SENP1_PONAB (Q5RBB1), 
SENP2_HUMAN (Q9HC62), SENP2_MOUSE (Q91ZX6), SENP2_PONAB (Q5R7K7), 
SENP2_RAT   (Q9EQE1), SENP3_HUMAN (Q9H4L4), SENP3_MOUSE (Q9EP97), 
SENP5_HUMAN (Q96HI0), SENP5_MACFA (Q8WP32), SENP5_MOUSE (Q6NXL6), 
SENP6_HUMAN (Q9GZR1), SENP6_MOUSE (Q6P7W0), SENP7_BOVIN (A7MBJ2), 
SENP7_HUMAN (Q9BQF6), SENP7_MOUSE (Q8BUH8), SENP7_RAT   (D3ZF42), 
SENP8_DICDI (Q54XR2), SENP8_HUMAN (Q96LD8), SENP8_MOUSE (Q9D2Z4), 
SENP8_RAT   (Q5FVJ8), SENP_CAEEL  (Q09353), ULP1A_ARATH (Q8GYL3), 
ULP1B_ARATH (O65278), ULP1C_ARATH (Q8RWN0), ULP1D_ARATH (Q2PS26), 
ULP1_SCHPO  (O42957), ULP1_YEAST  (Q02724), ULP2A_ARATH (Q0WKV8), 
ULP2B_ARATH (Q8L7S0), ULP2_SCHPO  (O13769), ULP2_YEAST  (P40537), 
ULP4_CAEEL  (Q09275), YR355_MIMIV (Q5UQV0)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
12 sequences

CDUB1_CHLTA (Q3KKG8), CDUB1_CHLTB (B0BAX9), CDUB1_CHLTJ (C4PQR0), 
CDUB1_CHLTS (D3UTF4), CDUB1_CHLTZ (C4PLJ5), CDUB2_CHLT2 (B0B999), 
CDUB2_CHLTA (Q3KKG9), CDUB2_CHLTB (B0BAX8), CDUB2_CHLTJ (C4PQQ9), 
CDUB2_CHLTR (O84875), CDUB2_CHLTS (D3UTF3), CDUB2_CHLTZ (C4PLJ4)
» More

PDB
[Detailed view]
24 PDB

1EUV; 1TGZ; 1TH0; 1XT9; 2BKQ; 2BKR; 2CKG; 2CKH; 2G4D; 2HKP; 2HL8; 2HL9; 2IO0; 2IO1; 2IO2; 2IO3; 2IY0; 2IY1; 2IYC; 2IYD; 2XPH; 2XRE; 3EAY; 3ZO5
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission