Entry: PS50802

General information about the entry

Entry name [info] OTU
Accession [info] PS50802
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2001 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2016 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50802
Associated ProRule [info] PRU00139

Name and characterization of the entry

Description [info] OTU domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=128;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=123;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7570; R2=0.02129120; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=317; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=223; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='L'; M=-10,-25,-23,-26,-20,  7,-16,-12, 10,-24, 30, 17,-24,-28,-16,-18,-24,-11,  2,-13,  7,-19;
/M: SY='T'; M=  1, -9,-18,-11, -5, -3,-19, -7, -6, -9, -9, -7, -9,-17, -8,-11,  5, 11, -1,-15,  9, -8;
/M: SY='C'; M= -2,-23, 11,-29,-22, -8,-27,-24,  7,-19,  5,  2,-19,-26,-19,-14,-13, -7, 10,-28,-12,-22;
/M: SY='I'; M=-11,-20,-25,-24,-14,  0,-29,-16,  8, -6,  5,  6,-15,-21, -6, -1,-15, -9,  6,-18, -1,-11;
/M: SY='H'; M=-14,  6,-29,  4,  6,-18,-16, 25,-22,  3,-23,-11, 12, -3,  4,  0, -5,-10,-26,-24,  2,  3;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='V'; M= -3,-19,-14,-24,-21, -3,-27,-24, 21,-18,  6,  6,-16,-19,-19,-18, -4, 10, 26,-24, -6,-21; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='P'; M= -3, -2,-25, -4,  1,-23,-13, -9,-20, 13,-23,-13,  2, 14,  0,  9, -4, -6,-19,-23,-16, -1; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='G'; M=  8,-10,-23,-11,-10,-23, 23,-15,-24, -8,-20,-14, -5, -1,-10, -7,  0,-10,-18,-19,-22,-12; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='D'; M=-18, 44,-27, 62, 18,-35, -9,  0,-35,  0,-27,-27, 18, -9,  0, -9,  0, -9,-27,-35,-18,  9; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='G'; M=  6, -9,-24,-10,-16,-25, 53,-18,-32,-16,-24,-16, -1,-16,-16,-18,  1,-15,-23,-18,-25,-16; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='N'; M=-10, 28,-20, 25,  5,-23, -5, 15,-24, -2,-25,-18, 31,-14,  1, -4,  8, -3,-24,-34,-13,  2; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='C'; M= -6,-15, 90,-23,-23,-18,-23,-24,-25,-24,-19,-18,-14,-32,-23,-24, -3, -5, -9,-43,-25,-23; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='F'; M=-14,-27,-18,-32,-23, 44,-27,-18,  8,-27, 24,  8,-22,-27,-28,-18,-22, -9,  4, -3, 15,-23; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='W'; M=-16,-24,-29,-26,-21, 24,-23, -2, -2,-14, -1,  3,-23,-25,-14,-12,-23,-14,-10, 46, 42,-18; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='H'; M=-18, -5,-27, -5,  0,-18,-18, 38,-27, 12,-18, -5,  4,-18,  9, 36, -9,-13,-21,-21,  2,  0; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='A'; M= 34,-10, -9,-17,-10,-15, -4,-18, -5,-10, -9, -8, -9,-11,-10,-17, 10,  2,  5,-21,-16,-10; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='V'; M=  2,-23,-16,-26,-23,  1,-25,-18, 22,-17,  7,  7,-20,-21,-19,-19,-10, -4, 24,-15,  4,-23; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='A'; M= 11, -8,  5,-10, -1,-15,-10,-14,-13,-12, -9,-10, -7,-14, -7,-14,  7,  1, -6,-28,-17, -4; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='V'; M= -4, -5,-16, -6,  0,-13,-16, -9, -1, -7, -4, -3, -2,-16,  0, -7,  0, -1,  1,-27,-11,  0; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='Y'; M= -8,-11,-23,-13,-11, -5,  3, -3, -7,-10, -8, -3, -8,-16, -3,-10, -8,-10,-10, -3, 11, -9; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='L'; M=-10,-23,-19,-25,-18, 15,-20,-14,  7,-19, 20, 13,-22,-22,-15,-14,-22,-10,  1, 11,  8,-15; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='G'; M= -5,-16,-25,-17,-13,-12,  3,-15, -8,-15, -7, -5,-11,-18, -5,-14, -7,-10,-11,  3, -7, -9; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='L'; M= -4,-14,-18,-14, -6, -8, -7,-13, -1,-14,  6,  6,-12,-18, -9,-13, -6, -5,  0,-23,-10, -7; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='Y'; M= -2,-12,-21,-12,  0, -2,-21, -6,  2, -8, -2, -2,-13,-15, -6,-12, -7, -6,  1, -9, 11, -4; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='A'; M=  7, -3,-17, -4, -2,-16,-10, -7, -7, -8, -3,  2, -5,-13,  3,-10,  1, -3, -6,-23,-11,  0; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='R'; M=-12, -4,-22, -3, -5, -7,-19, -3, -9,  2, -2,  2, -6,-17, -3,  5, -9, -2, -8,-15,  4, -5; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='E'; M= -5,  3,-17,  4, 18,-18,-13, -3,-15,  9,-13, -8,  0, -4, 12,  4,  1,  2,-14,-17, -9, 15; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='D'; M= -8, 12,-16, 16, 10,-16,-10, -3,-13, -1, -9, -4,  3, -6,  1, -5,  0,  1,-11,-21, -9,  5; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='L'; M= -5, -9,-10,-10, -6, -1,-13, -8,  0, -5,  9,  3, -8,-11, -5,  2, -6,  3,  0,-11, -3, -6; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-3; IM=0; DM=-3;
/M: SY='E'; M= -8, -9,-22, -7, 10,  0,-21, -6, -8, -6, -7, -2,-10,-15, -3, -9, -3, -5, -6,-18,  1,  4;
/M: SY='L'; M= -9,-26,-21,-30,-21, 12,-28,-21, 19,-27, 27, 12,-21,-25,-20,-21,-17, -6, 11,-19,  1,-21;
/M: SY='R'; M=-18, -8,-30, -8,  2,-22,-20, -2,-30, 35,-22,-10,  0,-18, 10, 60,-10,-10,-20,-20,-10,  2;
/M: SY='E'; M= -9,  5,-24,  6,  8,-20,-16, -5,-15,  0, -8, -7,  4,-15,  6, -2, -2, -5,-16,-29,-12,  7;
/M: SY='A'; M=  4,  0,-21, -3, -1,-15,-15,-10, -3,-10, -1,  1, -2,-15, -5,-14, -5, -6, -5,-26,-12, -4;
/M: SY='T'; M=  0,-17,  0,-23,-18, -8,-24,-22,  2,-14,  2, -1,-14,-21,-15,-10, -4,  8,  8,-27,-11,-18;
/M: SY='V'; M=  3,-14,  3,-15,-10,-14,-20, -6, -4,-14, -9, -5,-13,-22,-13,-15,  0, -3,  9,-33,-13,-12;
/M: SY='R'; M= -2, -4,-21, -8,  1, -6,-15, -9,-15,  1,-10, -9,  2,-16, -4,  3, -1, -3,-13,-22, -9, -1;
/M: SY='F'; M=-16,-14,-24,-18, -7, 23,-25, -7,-13, -5, -5, -6,-10,-21,-12,  7,-10, -2,-10, -5, 15, -9;
/M: SY='M'; M= -2, -8,-21,-13, -2,-11,-18, -5,  0, -9,  8, 14, -7,-18,  4, -9,-10, -8, -6,-23, -8,  1;
/M: SY='K'; M= -3, -5,-24, -6,  7,-20,-19,-11,-19, 18,-13, -8, -5,-12,  3, 14, -5, -2,-13,-23,-11,  4;
/M: SY='E'; M= -1, -1,-21, -3, 11,-10,-15, -6,-14, -6, -9, -9,  1,-13,  4, -7,  2, -4,-15,-24,-11,  8;
/M: SY='H'; M=-10,  3,-23, -2,  3,-17,-20, 15,-14, -1,-15, -7,  8,-14,  1, -2,  1,  5,-14,-29, -4,  0;
/M: SY='R'; M= -4,  4,-25,  7, 11,-26,-14, -6,-28, 18,-24,-15,  3,-11,  6, 20,  1, -5,-19,-26,-15,  7;
/M:         M= -1, -4, -3, -9, -4,-17, -7,-13,-18, -8,-10,-11, -1,-19, -8, -4, -1, -1,-13,-29,-17, -6;
/M:         M= -3, -6,-24, -6, -1,-15,-20,-14, -1, -9, -2, -3, -6,-15, -5, -5, -5, -5, -3,-26,-11, -5;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='F'; M=-16,  5,-22,  4, -8, 20,-17, -3,-13,-12, -8,-11,  3,-20,-16,-11, -8, -8,-13, -8, 13,-11; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='E'; M= -3,-11,-20,-11,  5,  0,-19,-12, -7, -4,  5, -2,-12,-14, -6, -7,-11, -8, -7,-16, -4,  0; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='P'; M= -9,-10,-30, -7,  6,-23,-20,-14,-13,  6,-19,-10,-10, 30, -2, -4, -9, -9,-16,-23,-16,  0; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='F'; M=-13,-17,  1,-22,-12, 36,-22,-14, -7,-18,  0, -5,-13,-21,-22,-14,-12, -8, -5, -5,  9,-15; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='I'; M= -2,-13,-19,-17, -5,  1,-19,-13,  3, -7,  0,  0, -9,-13, -8, -3, -7, -6,  1,-13, -3, -8; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='W'; M= -8, -5,-23, -2, -3,-13,-13,-12,-14, -3,-12,-10, -8, -1, -5, -6, -6, -6,-14,  1, -6, -4; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='S'; M=  0,  0,-14,  1,  8,-18,  3, -4,-17, -2,-17,-10,  3, -6,  8, -4, 10,  0,-14,-19,-13,  8; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='D'; M= -4,  2,-15,  6,  5,-14,  1, -7,-14, -7, -7, -9,  0, -9, -3, -8,  1, -4,-11,-19,-11,  1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='P'; M= -6, -9,-18, -9, -1, -2, -3, -8, -9, -7, -7,  0, -8,  3, -6, -9, -6, -8,-11,-12, -7, -3; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='S'; M=  4,  5,-11,  5,  1,-15, -6, -8,-14,  2,-14,-10,  2, -6, -1, -3,  8,  6, -8,-19,-10,  0; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='V'; M= -1, -6, -9, -9,-10, -4,-12,-10,  5,-10,  2,  0, -2,-16,-10, -9,  0,  1,  9,-21, -8,-10; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='A'; M= 10, -1,-10, -3,  6,-13, -5, -7,-10,  5, -9, -6, -3, -4,  1, -1,  1, -3, -6,-12, -9,  4; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='Y'; M=-16,  1, -8, -1, -6, -7,-21,  6,-18, -3,-15,-10,  1,-24,  1,  0, -8, -9,-19,-11, 18, -5;
/M: SY='Y'; M=-14,-25, -5,-29,-23, 19,-29, -8,  6,-22, 19, 12,-24,-30,-19,-17,-22,-10,  1, -7, 21,-21;
/M: SY='C'; M=-10, -1, 11,  1,  4,-27,-22,-12,-23,  4,-20,-13, -6,-19,  1, -3, -6, -9,-13,-33,-18,  2;
/M: SY='E'; M= -3,  9,-25, 13, 29,-26,-16, -5,-26,  6,-19,-17,  1, -6,  8,  3,  3, -1,-21,-29,-18, 18;
/M: SY='Q'; M=-10, -8,-25, -7, 12,-19,-22, -4, -8,  2, -3,  4,-10,-15, 15,  6, -9, -9, -9,-24,-10, 13;
/M: SY='E'; M= -8,  2,-22, -1, 15,-16,-15,  0, -9, -1, -8, 10,  2,-11,  7, -5, -1, -5,-13,-29,-12, 11;
/M:         M=  0, -7,-26,-12, -8,-18, -5,-13,-13, -4,-18,-10, -1,-16,  0, -8, -2, -8,-15, -2, -9, -4;
/M: SY='P'; M=-10,  6,-30, 11, 17,-27,-16, -8,-24, -2,-25,-20,  3, 28,  0,-10,  0, -1,-26,-32,-22,  7;
/M: SY='K'; M= -4, -1,-27,  2,  5,-26,-17,-10,-20, 13,-16, -9, -5,  0,  5,  3, -8, -9,-17,-24,-14,  4;
/M: SY='V'; M=  1,-13,-18,-14,  0,-10,-21,-15,  2,-10,  4,  5,-15,-16, -7,-13, -5,  1,  7,-26,-11, -4;
/M: SY='W'; M=-19,-30,-42,-30,-21,  8,-22,-12,-15,-13,-15,-12,-30,-27, -7,-13,-30,-22,-25, 97, 37,-12;
/M: SY='A'; M=  7, -6,-22, -5,-10,-20,  6,-17,-15, -7,-10, -9, -7,-17,-12,-12, -4, -9, -7,-24,-17,-11;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M: SY='E'; M= -4,  6,-21, 10, 11,-24,  8, -9,-26, -5,-21,-17,  4, -9, -1, -9,  7,  0,-20,-26,-19,  5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='Q'; M=-11, 10,-23, 10, 13,-23,-14, 16,-17,  1,-15, -1,  9,-11, 18,  0, -2, -9,-21,-25, -7, 15; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='L'; M=  1,-15,-16,-18, -8, -5,-21,-18,  9,-15, 12,  4,-15,-16,-11,-15, -8,  1,  9,-21, -7,-10; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='E'; M=  7,  1,-19,  2, 19,-21,-10,  7,-20, -1,-16,-12,  0, -6,  6, -6,  6, -4,-16,-25,-12, 12; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='I'; M= -7,-26,-21,-31,-23,  2,-31,-23, 33,-25, 24, 16,-21,-21,-19,-22,-19, -7, 24,-19, -1,-23; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='N'; M= -6, -5,-17,-10,-10,  0, -4,-10,-13, -9, -8, -8,  3,-17,-10, -1,  1,  2,-10,-19, -7,-10; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='A'; M= 23, -3,-11, -6, -7,-17, -5,-15, -8, -9,-11,-10, -5,-11, -9,-15,  9,  1,  2,-23,-16, -8; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='L'; M= -7,-20,  0,-23,-17,  1,-23,-16,  8,-21, 24, 14,-20,-23,-15,-16,-16, -1,  5,-22, -5,-16; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='C'; M=  6,-10, 21,-16,-14,-16,-15,-20,-11,-18,-16,-13, -5,-19,-13,-19, 13, 10, -3,-37,-19,-14;
/M: SY='C'; M=-10, -7, 12,-13,-12, -5,-19, -1,-18,-11,-12, -9,  0,-25,-12,-10, -4, -6,-13,-30, -7,-12;
/M: SY='L'; M= -2,-21, -1,-29,-21,  5,-25,-20,  8,-22, 13,  9,-19,-24,-19,-20,-12, -1,  6,-22, -4,-20;
/M: SY='Y'; M= -7,-21,-24,-24,-19, 15,-25,  2,  6,-15, 14, 12,-21,-26,-11,-14,-19, -9, -1,  4, 36,-17;
/M: SY='R'; M=-12,  2, -7, -4, -5,-23, -5, -5,-29, 11,-25,-15, 12,-21, -2, 23, -4, -9,-22,-29,-18, -5;
/M: SY='R'; M= -9,-10,-24,-12, -5,-15,-21,-12,-10, 10, -9, -4, -5,-16, -1, 17, -3,  2, -6,-24, -9, -5;
/M: SY='H'; M=-15, -1,-29, -2, -4, -9,-20,  4,-15,  0,-16, -9,  3, -4, -5,  3, -9,-10,-17,-23, -5, -6;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-23,-36,-29, 10,-35,-28, 35,-28, 20, 15,-24,-25,-25,-25,-19, -8, 29,-19,  1,-29;
/M: SY='I'; M=-12,-14,-27,-17,-16,-10,-30,-19, 16,-10,  2,  5,-11,-20,-11, -2,-14, -9, 12,-24, -6,-17;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-22,-35,-27,  3,-35,-27, 37,-27, 25, 17,-25,-25,-23,-25,-20, -7, 30,-23, -3,-27;
/M: SY='Y'; M=-14,-16,-28,-16, -9,  7,-29,  1,  3, -4, -2,  0,-16,-22, -7, -8,-15, -9, -1,  3, 35,-11;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='Y'; M= -7,-10,-18,-10, -1,  3,-16, -5,-10, -6, -5, -6, -6,-16, -5, -1,  1, -1, -9,-14,  5, -4; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='E'; M= -7, -1,-23,  4,  8,-20, -6, -9,-14, -5,-12, -5, -6,  1, -3,-10, -5, -9,-11,-25,-16,  2; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='H'; M= -8,  0,-25,  4, -1,-17, -3,  7,-22, -1,-21,-12,  0, -2, -2, -5, -1, -7,-20,-19, -2, -4; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='N'; M= -4,  2,-18, -6, -1, -3,-11, -3,-11, -1, -9, -2,  8,-15, -3,  2, -3, -5,-12,-19, -7, -2; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='L'; M= -8,-10,-19, -8,-10, -8,-20,-13,  2,-14,  7,  6,-13, -4,-11,-14,-10,  0,  2,-24, -9,-11; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='D'; M= -3,  9,-21, 13,  1,-24,  1,  5,-26, -2,-21,-15,  6,-12, -1,  1,  3, -6,-19,-26,-13, -1; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='T'; M=  5, -6,-15, -7,  0,-15,-13,-15, -9, -7,-12,-10, -6,  2, -6,-11,  9, 12, -2,-26,-15, -4; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='S'; M= -4, -9,-21, -6,  0,-11, -4, -8,-13,-10,-10,-10, -6, -1, -5,-11,  2, -3,-14,-19, -6, -4; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='M'; M= -6, -4,-17, -7,  0, -3,-15, -5, -5, -6, -7,  1,  0,-15,  1, -6,  0, -3, -5,-21, -6,  1; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='V'; M=  0,-16,-17,-15,-16,-14,  4,-20, -4,-15,-11, -6,-12, -7,-17,-16,  1, -4,  6,-25,-17,-17; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='G'; M= -5, -2,-19, -8,-10, -7,  7,-13,-19, -5,-16,-11,  4,-15,-11, -6,  2,  4,-14,-18,-10,-10; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='E'; M= -7,  4,-22,  7,  9,-16,-12, -8,-16, -4,-17,-15,  2,-12, -1, -8,  0, -5,-13, -7,-10,  5; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='H'; M=-12,  4,-22,  0,  3, -9,-15, 15,-14, -1, -9, -6, 10,-17,  1,  5, -6, -7,-18,-18,  4,  0; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='N'; M=-12, -1,-24, -6, -5,  0,-15, -2,-15,  3,-16,-10,  6, -5, -5,  6, -7, -6,-17,-13,  3, -7; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='L'; M= -4, -7,-20, -6, -3,  4,-18, -8, -5,-12,  6, -2,-11,-17,-10,-13,-11, -7, -6,-11,  6, -6; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='P'; M= -2,  2,-23,  6, -1,-21,-15,-14,-11, -9,-15,-12, -4, 15, -7,-15, -1,  0,-11,-26,-16, -6; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='E'; M= -5, -3,-21,  1, 18,-17,-16, -9,-14, -4, -9,-11, -5,  5,  2, -8,  2,  2,-15,-26,-15,  9; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='S'; M= -1,  4,-17,  0, -1,-20,  2, -9,-21,  6,-24,-14, 10,-11, -1,  1, 11,  6,-15,-26,-15, -1; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='D'; M= -7, -2,-19,  1,  0, -6, -5,-10,-13, -1,-11, -9, -4,-13, -8, -5, -5, -7, -7,-16, -8, -3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='D'; M= -9, 10,-19, 15,  4,-20,  2, -4,-23,  7,-18,-13,  5, -9,  0,  7, -2, -8,-17,-18,-12,  1; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='D'; M= -5,  5,-15,  8,  4,-18,  3, -3,-17,  5,-14, -8,  3, -6,  6,  1, -1, -6,-14,-13, -9,  5; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='I'; M= -4, -9,-15,-12, -8, -9, -4, -9,  5, -9, -1,  3, -5, -9,  0, -9, -5, -6,  0,-10, -5, -5; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='P'; M= -4, -9,-14, -9, -6, -2,-12, -5,  1, -8, -5, -3, -6,  4, -5, -9, -1, -1, -3, -7,  4, -8; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
/M: SY='V'; M= -8,-14,-19,-14,-18, -1,-27,-17, 13,-17,  7,  3,-17,-24,-18,-17,-10,  1, 17,-21,  3,-19;
/M: SY='G'; M= -7,-21,-27,-21,-17, -1,  2,-20,-13,-21, -5, -8,-16, -9,-19,-19,-11,-11,-14, -1, -7,-17;
/M: SY='L'; M=-12,-27,-23,-30,-24, 21,-31,-13, 18,-24, 23, 11,-25,-29,-21,-19,-22, -9, 12, -5, 23,-24;
/M: SY='Y'; M=-11,-12, -8,-17,-15, -6,-25,  1,  0,-11, -2,  1, -7,-25,-12,-11,-13, -9,  0,-22,  4,-15;
/M: SY='R'; M=-14, -8,-24,-15,-13,  2,-22, -9, -1, -8,  5,  1,  1,-24,-10,  6,-13, -8, -6,-21, -4,-13;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='H'; M= -2, -9,-15, -9, -8, -9,  0,  3, -9,-14, -2, -3, -3,-15, -6,-10,  1, -3, -8,-21, -6, -8; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='N'; M=  1,  6,-10,  0, -4, -3, -4,  3, -6, -3, -9, -6, 11,-10, -3, -4,  1, -1, -9, -8,  3, -4; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='G'; M= -6, -6,-10, -5,  1,-28,  3,  0,-28,-10,-25,-15, -3, -4,  2,-11,  2,-10,-25,-30,-19,  0;
/M: SY='N'; M=-10,  7,-26,  3,  7,-24, -4, 12,-22,  4,-20, -4, 13,-15, 11,  2, -3,-10,-24,-27,-11,  8;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='F'; M=-17,-22,-22,-29,-24, 50,-29, -5, -1,-20,  4, -1,-17,-27,-25,-15,-15, -2, -4, 12, 43,-24;
/M: SY='D'; M= -5, 22, -6, 27,  1,-27,-12, -9,-23, -7,-21,-20, 10,-17, -9,-14,  0, -6,-13,-37,-20, -4;
/M: SY='P'; M= -2,-16,-21,-16,-11,-13,-20,-20,  1,-16, -6, -5,-12,  9,-12,-17,  3,  7,  1,-30,-15,-14;
/M: SY='V'; M=  8,-25,-15,-29,-22, -2,-24,-25, 20,-22, 17,  9,-24,-24,-21,-21,-12, -4, 25,-24, -8,-22;
/M: SY='Y'; M=-10,-23,-22,-24,-22,  7,-30,-10, 15,-10,  3,  5,-22,-26,-17,-12,-15, -6, 17, -6, 24,-22;
/M: SY='P'; M= -3, -6,-27, -4, -2,-15,-17,-16,-19, -4,-20,-15, -9, 25,-10,-11, -3, -1,-17,-24,-15, -7;
/M: SY='I'; M= -3,-20,-22,-25,-16,  2,-26,-21,  9, -6,  5,  5,-16,-20,-15,-10,-14, -8,  9,-17, -2,-16;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2016_07 which contains 551'705 sequence entries.


Total number of hits 80 in 80 different sequences
Number of true positive hits 80 in 80 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 5
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 94.12 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] OTU
Version [info] 3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
80 sequences

ALG13_HUMAN (Q9NP73    ), ALG13_MOUSE (Q9D8C3    ), L_CCHFI     (Q6TQR6    ), 
L_DUGBA     (Q66431    ), OTU1_BOVIN  (Q05B57    ), OTU1_CHICK  (Q5F3A6    ), 
OTU1_DANRE  (Q567B1    ), OTU1_DICDI  (Q55BI3    ), OTU1_DROME  (Q9VRJ9    ), 
OTU1_DROPS  (Q29FC9    ), OTU1_HUMAN  (Q5VVQ6    ), OTU1_MOUSE  (Q8CB27    ), 
OTU1_RAT    (Q32Q05    ), OTU1_SCHPO  (O13974    ), OTU1_XENLA  (Q0IH43    ), 
OTU1_YEAST  (P43558    ), OTU2_SCHPO  (Q9UUK3    ), OTU2_YEAST  (P38747    ), 
OTU5A_DANRE (Q08BW0    ), OTU5A_XENLA (Q7ZX21    ), OTU5B_XENLA (Q640H3    ), 
OTU6A_HUMAN (Q7L8S5    ), OTU6A_MOUSE (Q6IE21    ), OTU6B_CHICK (Q5ZIP6    ), 
OTU6B_DANRE (Q7ZV00    ), OTU6B_HUMAN (Q8N6M0    ), OTU6B_MOUSE (Q8K2H2    ), 
OTU6B_XENLA (Q6GM06    ), OTU6B_XENTR (Q5M8L0    ), OTU7A_HUMAN (Q8TE49    ), 
OTU7A_MOUSE (Q8R554    ), OTU7B_HUMAN (Q6GQQ9    ), OTU7B_MOUSE (B2RUR8    ), 
OTUB1_HUMAN (Q96FW1    ), OTUB1_MOUSE (Q7TQI3    ), OTUB1_RAT   (B2RYG6    ), 
OTUB2_HUMAN (Q96DC9    ), OTUB2_MOUSE (Q9CQX0    ), OTUBL_ARATH (Q8LG98    ), 
OTUBL_CAEBR (A8XDJ2    ), OTUBL_CAEEL (Q9XVR6    ), OTUBL_DROME (Q9VL00    ), 
OTUD1_HUMAN (Q5VV17    ), OTUD1_MOUSE (Q9CUB6    ), OTUD3_HUMAN (Q5T2D3    ), 
OTUD3_MOUSE (B1AZ99    ), OTUD4_HUMAN (Q01804    ), OTUD4_MOUSE (B2RRE7    ), 
OTUD5_HUMAN (Q96G74    ), OTUD5_MOUSE (Q3U2S4    ), OTUD5_RAT   (Q2YDU3    ), 
OTUD5_XENTR (Q6GL44    ), OTU_ARATH   (Q8LBZ4    ), OTU_DROME   (P10383    ), 
POLG_CILVC  (Q1KZ59    ), RDRP_ASPVP  (Q64962    ), RDRP_BBSCV  (Q65652    ), 
RDRP_CLBVS  (Q91QZ3    ), RDRP_PVMR   (P17965    ), RDRP_RSVT   (Q85431    ), 
TNAP3_HUMAN (P21580    ), TNAP3_MACFA (Q4R8W3    ), TNAP3_MOUSE (Q60769    ), 
TRBID_DROME (Q9VH90    ), VCIP1_HUMAN (Q96JH7    ), VCIP1_MOUSE (Q8CDG3    ), 
VCIP1_RAT   (Q8CF97    ), VF232_IIV3  (Q196X6    ), VF232_IIV6  (Q91FU0    ), 
VG65_ICHVA  (Q00106    ), VL96_IRV1   (P22856    ), Y4757_DICDI (Q54P70    ), 
Y483_CHLPN  (Q9Z868    ), ZRAN1_BOVIN (A6QP16    ), ZRAN1_HUMAN (Q9UGI0    ), 
ZRAN1_MOUSE (Q7M760    ), ZRAN1_XENTR (B1H2Q2    ), ZRN1A_XENLA (Q5U595    ), 
ZRN1B_DANRE (A0JMQ9    ), ZRN1B_XENLA (Q6NUB7    )
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
5 sequences

F105A_HUMAN (Q9NUU6    ), F105A_MOUSE (Q3TVP5    ), F105A_RAT   (Q3B7D8    ), 
OTUL_HUMAN  (Q96BN8    ), OTUL_MOUSE  (Q3UCV8    )
» more

PDB
[Detailed view]
32 PDB

1TFF; 2VFJ; 2ZFY; 3BY4; 3C0R; 3DKB; 3PFY; 3PHU; 3PHW; 3PHX; 3TMO; 3TMP; 3VON; 3ZJD; 3ZJE; 3ZJF; 3ZJG; 3ZNH; 3ZRH; 4BOP; 4BOQ; 4BOU; 4DDG; 4DDI; 4DHI; 4DHJ; 4DHZ; 4FJV; 4HXD; 4I6L; 4LDT; 5DQ6
» more

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission