Entry: PS50804

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] SCAN_BOX
Accession [info] PS50804
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2001 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); OCT-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50804
Associated ProRule [info] PRU00187

Name and characterization of the entry

Description [info] SCAN box profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=83;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=78;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.8523; R2=0.01235572; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-3162.21347; R2=34.58093; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=756; N_SCORE=8.5; H_SCORE=20214; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=595; N_SCORE=6.5; H_SCORE=17413; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         E1=*; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='R'; M=-20, -9,-30, -9, -1,-17,-21, 17,-28, 21,-19, -8,  0,-21,  9, 54,-11,-12,-21,-18,  0, -1;
/M: SY='Q'; M=-11, -9,-27, -9,  7,-24,-23, -1,-11,  5, -2,  4, -8,-16, 30,  7,-10,-10,-17,-20, -7, 18;
/M: SY='R'; M=-15, -9,-26,-10, -3,-13,-20,  9,-18,  7, -9, -4, -1,-21,  6, 28, -8, -8,-16,-20,  0, -2;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9,  1,-21,-20, -1,-30, 31,-21,-10,  0,-19, 10, 68,-10,-10,-20,-20,-10,  1;
/M: SY='Q'; M=-13, -4,-16, -5, 10,-33,-21, 10,-23,  9,-20, -4, -1,-15, 39, 17, -3,-11,-26,-23,-10, 23;
/M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26, 55,-30,-20,  7,-30, 24,  7,-24,-30,-33,-20,-24,-10,  4, -1, 19,-26;
/M: SY='R'; M=-14,-12, 17,-16,-10,-22,-12,-11,-31,  4,-21,-14, -6,-26, -3, 24, -8,-11,-19,-29,-19, -9;
/M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-21,-21, 33,-30, 18,  0,-11,  1,  0,-20,-30,-12,-11,-20,-10, -9, 29, 77,-21;
/M: SY='Q'; M=-12,  0,-30,  1, 16,-33,-15, 32,-25,  3,-21, -3,  3,-12, 38,  5, -3,-13,-30,-24, -4, 26;
/M: SY='E'; M=-13, 23,-30, 36, 47,-33,-17,  0,-33,  7,-23,-23,  6, -3, 14, -3,  0,-10,-30,-33,-20, 31;
/M: SY='T'; M= 15, -9,-10,-15,-12,-13,-12,-20, -4,-12,-10, -8, -7,-14,-12,-15, 16, 19,  8,-30,-15,-12;
/M: SY='A'; M= 10,-12,-20,-13, -7,-18,-11,-11, -9,-13,-14,-10, -7,  9, -7,-17,  8,  1, -8,-29,-17, -9;
/M: SY='G'; M=  1, -9,-29, -9,-19,-29, 66,-19,-39,-19,-30,-20,  1,-19,-19,-19,  2,-18,-29,-21,-29,-19;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='R'; M=-16, -8,-29, -7,  7,-22,-21,  6,-22, 15,-12, -5, -3,-17, 19, 37, -9,-11,-20,-21, -8, 10;
/M: SY='E'; M=-11, 12,-30, 23, 58,-31,-19,  0,-31,  9,-21,-21,  1, -1, 19, -1,  0,-10,-30,-31,-20, 38;
/M: SY='A'; M= 44, -9,-10,-19,-10,-19, -2,-20,-10,-10,-10,-10, -9,-10,-10,-19, 11,  6,  0,-21,-19,-10;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-19,-31,-21, 13,-30,-21, 20,-29, 45, 18,-29,-30,-22,-20,-28, -9, 12,-19,  1,-21;
/M: SY='S'; M= 11, -5,-12, -7, -5,-17, -6,-14,-10,-12,-21,-14,  4,-11, -4,-13, 29, 16, -4,-35,-17, -5;
/M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5, 10,-30,-20,  5,-25, 20,-20, -5,  0,-15, 34, 41, -5,-10,-25,-20,-10, 19;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 48, 20,-30,-30,-20,-20,-29,-10, 12,-20,  0,-20;
/M: SY='R'; M=-19,-13,-33,-13, -2,-18,-20, -3,-28, 21,-20,-10, -5,-20, 12, 51,-13,-13,-22,  2, -5,  2;
/M: SY='E'; M= -5,  3,-26, 10, 42,-27,-20, -4,-21,  5,-16,-14, -4, -5, 16, -3,  0, -8,-19,-28,-18, 29;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='H'; M=-18,-10,  2,-12, -7,-17,-23, 24,-28,  3,-19, -9, -2,-25,  0, 24,-11,-13,-20,-27, -1, -7;
/M: SY='Q'; M=-12, -8,-31, -7, 10,-25,-16, -1,-21,  6,-15, -6, -7,-15, 27, 13, -8,-13,-25, -2, -7, 18;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='R'; M=-18, -8,-30, -8,  3,-23,-20,  1,-29, 28,-20, -9,  0,-18, 16, 60, -9,-10,-21,-20,-10,  6;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='E'; M=-13, 19,-30, 30, 48,-32,-18,  5,-32,  7,-22,-21,  5, -3, 15, -2, -1,-11,-30,-32,-18, 31;
/M: SY='L'; M= -4,-24,-17,-27,-21,  1,-27,-21, 18,-20, 23, 14,-23,-25,-18,-15,-15, -1, 19,-24, -5,-20;
/M: SY='H'; M=-15, -3,-26, -5, -4,-14,-18, 39,-19, -4, -9, -2,  6,-21,  3, 11, -9,-11,-19,-28,  3, -4;
/M: SY='T'; M=  3,  0,-10, -7, -7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,  3,-10, -7,-10, 26, 40, -3,-33,-13, -7;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='E'; M=  0,  7,-27, 13, 49,-28,-17, -3,-27,  7,-18,-18, -2, -2, 15, -3,  2, -8,-25,-28,-20, 32;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-28,-39,-30,  0,-39,-30, 48,-29, 19, 19,-21,-21,-21,-29,-19, -9, 32,-21, -1,-30;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,  9,-29,-19, 20,-29, 48, 23,-29,-29,-19,-19,-29,-10, 10,-20,  0,-19;
/M: SY='E'; M=-11, 12,-30, 23, 58,-31,-19,  0,-31,  9,-21,-21,  1, -1, 19, -1,  0,-10,-30,-31,-20, 38;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21,  9,-30,-21, 21,-29, 47, 19,-30,-30,-21,-20,-29, -9, 13,-21, -1,-21;
/M: SY='V'; M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,  9,-29,-18, 20,-28, 48, 23,-29,-29,-18,-19,-29,-10, 10,-20,  0,-19;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21,  9,-30,-21, 21,-29, 47, 19,-30,-30,-21,-20,-29, -9, 13,-21, -1,-21;
/M: SY='T'; M=  6, -2,-12, -9, -9,-15, -6,-18,-15,-11,-16,-13,  1,-11, -9,-12, 22, 33, -5,-31,-15, -9;
/M: SY='I'; M= -3,-28,-26,-37,-28, -2,-35,-29, 42,-27, 16, 16,-20,-20,-20,-28,-16, -8, 29,-21, -3,-28;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='G'; M= -7, -6,-32, -3,  6,-31, 13,-11,-31,  1,-27,-16, -3,  5,  4, -3, -3,-14,-28,-23,-22,  4;
/M: SY='E'; M=-10, 12,-30, 22, 58,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  1,  0, 19,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 39;
/M: SY='L'; M=-11,-30,-23,-34,-24, 11,-33,-23, 29,-30, 37, 19,-26,-27,-21,-23,-26,-10, 16,-18,  2,-24;
/M: SY='Q'; M=-12, -2,-30, -2, 17,-37,-20,  8,-22, 13,-20, -2,  0,-12, 52, 20, -2,-10,-28,-20,-10, 33;
/M: SY='A'; M= 22, -9,-12,-15,-12,-16,  0,-20,-10,-12,-12,-10, -7,-13,-12,-17, 12, 12,  1,-26,-18,-12;
/M: SY='W'; M=-18,-30,-42,-30,-20,  3,-21,-18,-17,-10,-14,-12,-29,-27, -8, -4,-30,-22,-24, 90, 22,-12;
/M: SY='V'; M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5,  9,-29,-20,  8,-26, 21,-21, -5,  0,-15, 31, 38, -6,-10,-25,-20, -9, 18;
/M: SY='E'; M=-12,  8,-28, 16, 20,-25, -7,  3,-25, -5,-12,-13,  0,-12,  4, -8, -6,-12,-23,-29,-14, 12;
/M: SY='H'; M=-17, -3,-29, -3,  4,-24,-21, 60,-24, -2,-16,  0,  4,-18, 22,  7, -8,-16,-27,-26,  8, 10;
/M: SY='H'; M=-14, -2, -2, -7, -8,-16,-18, 27,-25, -9,-21,-11,  5,-24,  0, -4, -6,-11,-23,-15,  2, -5;
/M: SY='P'; M=-10,-21,-39,-11, -1,-27,-21,-20,-17,-11,-24,-17,-21, 82,-11,-20,-11,-10,-27,-29,-28,-11;
/M: SY='E'; M= -8,  3,-29, 10, 37,-28, -2, -4,-28,  2,-19,-13, -2, -6, 10, -5, -2,-12,-27,-27,-20, 24;
/M: SY='S'; M=  7,  6,-11,  3,  0,-20,  0, -7,-20, -9,-30,-20, 17,-11,  0, -9, 36, 17,-13,-40,-20,  0;
/M: SY='G'; M=  1,-11,-27,-11,-15,-27, 41,-18,-31,-14,-26,-17, -3, -9,-15,-13,  2,-13,-22,-23,-26,-16;
/M: SY='E'; M=-10,  9,-30, 18, 56,-30,-20, -1,-30, 13,-21,-19,  0, -1, 19,  2, -1,-10,-29,-29,-19, 38;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='A'; M= 29,-16,-13,-24,-16,-12,-12,-22,  4,-15,  2, -1,-15,-16,-15,-20,  1,  0, 11,-22,-14,-16;
/M: SY='V'; M=  6,-28,-14,-29,-27, -2,-24,-28, 18,-18,  3,  3,-28,-27,-26,-20,-10, -3, 33, -8, -7,-26;
/M: SY='T'; M= 15, -7,-14,-15,-10,-15,-14,-21, -8,-11,-11,-10, -7,  1,-11,-16, 11, 23, -2,-26,-15,-11;
/M: SY='L'; M= -9,-30, -5,-31,-24,  4,-30,-24, 15,-27, 27, 11,-29,-31,-23,-22,-24, -9, 14,-13, -3,-24;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-21,-30,-24,  3,-29,-24, 18,-21, 20,  9,-28,-29,-22,-14,-21, -8, 20, -5, -1,-23;
/M: SY='E'; M=-11, 11,-29, 19, 45,-28,-19, -1,-29, 10,-20,-19,  2, -4, 15,  6,  0, -6,-27,-30,-18, 29;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='D'; M=-11, 24,-24, 34, 11,-30,  0, -4,-32, -1,-26,-23, 12,-11,  0, -2,  6, -5,-23,-33,-19,  5; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='L'; M=-11,-28, -5,-31,-23, 11,-30,-21, 15,-29, 35, 16,-27,-30,-22,-21,-26,-10,  8,-21, -1,-22;
/M: SY='Q'; M=-13,  2,-30,  5, 29,-31,-20, 12,-26, 12,-20, -9,  1, -9, 31, 18, -3,-11,-28,-24,-11, 29;
/M: SY='R'; M=-14,-10,-30,-10, -2,-21, -9, -7,-29, 19,-23,-12, -3,-18,  5, 37, -8,-11,-22, -6, -9, -1;
/M: SY='E'; M=  0,  5,-25,  8, 28,-29,-12, -4,-24,  3,-18,-14, -1, -6, 16, -4,  4, -2,-22,-27,-18, 22;
/M: SY='L'; M= -8,-25,-22,-25,-16,  2,-27,-20, 13,-25, 30, 11,-24,-14,-17,-19,-19, -5,  5,-23, -5,-18;
/I:         B1=*; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_11 which contains 547'085 sequence entries.


Total number of hits 126 in 126 different sequences
Number of true positive hits 125 in 125 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits 1
Number of false negative sequences 1
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 99.21 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 99.21 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] SCAN box
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
125 sequences

MZF1_HUMAN  (P28698), NRIF1_MOUSE (Q923B3), NRIF1_RAT   (Q4V8E9), 
NRIF2_MOUSE (Q921B4), PEG3_BOVIN  (Q6H236), PEG3_GORGO  (A1YFC1), 
PEG3_HUMAN  (Q9GZU2), PEG3_PANPA  (A1YGK6), PEG3_PANTR  (A2T7F2), 
PGBD1_HUMAN (Q96JS3), SCND1_BOVIN (Q32PG5), SCND1_GORGO (A1YEW3), 
SCND1_HUMAN (P57086), SCND1_PANPA (A1YG31), SCND1_PANTR (A2T715), 
SCND1_PONPY (A2T7M0), SCND2_HUMAN (Q9GZW5), SCND3_HUMAN (Q6R2W3), 
ZFP69_BOVIN (A7MBI1), ZKSC1_HUMAN (P17029), ZKSC1_MOUSE (Q8BGS3), 
ZKSC1_PONAB (Q5R670), ZKSC1_RAT   (Q4KLI1), ZKSC2_HUMAN (Q63HK3), 
ZKSC3_HUMAN (Q9BRR0), ZKSC3_MOUSE (Q91VW9), ZKSC4_HUMAN (Q969J2), 
ZKSC5_HUMAN (Q9Y2L8), ZKSC5_MOUSE (Q9Z1D8), ZKSC5_PANTR (A2T7D2), 
ZKSC7_HUMAN (Q9P0L1), ZKSC8_HUMAN (Q15776), ZKSC8_PANPA (A1YG60), 
ZKSC8_PANTR (A2T736), ZN165_HUMAN (P49910), ZN174_HUMAN (Q15697), 
ZN197_HUMAN (O14709), ZN202_HUMAN (O95125), ZN213_HUMAN (O14771), 
ZN215_HUMAN (Q9UL58), ZN215_PONAB (Q5RE50), ZN232_HUMAN (Q9UNY5), 
ZN263_HUMAN (O14978), ZN274_BOVIN (A6QPT6), ZN274_HUMAN (Q96GC6), 
ZN274_MACFA (Q4R8H9), ZN287_HUMAN (Q9HBT7), ZN287_MOUSE (Q9EQB9), 
ZN287_PONPY (A2T812), ZN394_HUMAN (Q53GI3), ZN394_MOUSE (Q9Z1D9), 
ZN394_PANPA (A1YG48), ZN394_PONAB (Q5R741), ZN394_RAT   (Q9Z2K3), 
ZN396_HUMAN (Q96N95), ZN397_BOVIN (Q1LZ87), ZN397_HUMAN (Q8NF99), 
ZN444_HUMAN (Q8N0Y2), ZN445_HUMAN (P59923), ZN445_MOUSE (Q8R2V3), 
ZN446_HUMAN (Q9NWS9), ZN449_GORGO (A1YEQ3), ZN449_HUMAN (Q6P9G9), 
ZN449_PANPA (A1YFW6), ZN449_PANTR (A2T6W2), ZN483_HUMAN (Q8TF39), 
ZN496_HUMAN (Q96IT1), ZN496_MOUSE (Q5SXI5), ZN500_HUMAN (O60304), 
ZN75C_HUMAN (Q92670), ZN75D_HUMAN (P51815), ZNF18_HUMAN (P17022), 
ZNF18_MOUSE (Q810A1), ZNF18_RAT   (Q642B9), ZNF24_HUMAN (P17028), 
ZNF24_MOUSE (Q91VN1), ZNF24_PANPA (A1YGJ4), ZNF24_PANTR (A2T7D7), 
ZNF24_PONAB (Q5RAE6), ZNF24_RAT   (Q7TNK3), ZSA5A_HUMAN (Q9BUG6), 
ZSA5B_HUMAN (A6NJL1), ZSA5C_HUMAN (A6NGD5), ZSA5D_HUMAN (P0CG00), 
ZSC10_HUMAN (Q96SZ4), ZSC10_MOUSE (Q3URR7), ZSC12_GORGO (A1YEP8), 
ZSC12_HUMAN (O43309), ZSC12_MACNE (A2T6E3), ZSC12_MOUSE (Q9Z1D7), 
ZSC12_PANPA (A1YFW2), ZSC12_PANTR (A2T6V8), ZSC12_PONPY (A2T7F4), 
ZSC16_HUMAN (Q9H4T2), ZSC18_HUMAN (Q8TBC5), ZSC20_HUMAN (P17040), 
ZSC20_MOUSE (B2KFW1), ZSC21_GORGO (A1YEV9), ZSC21_HUMAN (Q9Y5A6), 
ZSC21_MOUSE (Q07231), ZSC21_PANPA (A1YG26), ZSC21_PANTR (A2T712), 
ZSC21_PONPY (A2T7L7), ZSC22_HUMAN (P10073), ZSC23_HUMAN (Q3MJ62), 
ZSC25_HUMAN (Q6NSZ9), ZSC26_BOVIN (A6QNZ0), ZSC26_HUMAN (Q16670), 
ZSC26_MOUSE (Q5RJ54), ZSC29_HUMAN (Q8IWY8), ZSC30_HUMAN (Q86W11), 
ZSC31_HUMAN (Q96LW9), ZSC32_HUMAN (Q9NX65), ZSC4C_MOUSE (Q80VJ6), 
ZSC4D_MOUSE (A7KBS4), ZSC4F_MOUSE (Q3URS2), ZSC9_HUMAN  (O15535), 
ZSCA1_HUMAN (Q8NBB4), ZSCA2_HUMAN (Q7Z7L9), ZSCA2_MOUSE (Q07230), 
ZSCA2_PONAB (Q5RCD9), ZSCA4_AILME (D2HQI1), ZSCA4_HUMAN (Q8NAM6), 
ZSCA4_PANPA (A1YFX5), ZSCA4_PONPY (A2T7G6)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
1 sequence

ZFP69_HUMAN (Q49AA0)

		
UniProtKB/Swiss-Prot
False positive sequences
1 sequence

ZF69B_HUMAN (Q9UJL9)

		

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission