PROSITE entry PS50804
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | SCAN_BOX |
Accession [info] | PS50804 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-DEC-2001 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC50804 |
Associated ProRule [info] | PRU00187 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | SCAN box profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=83; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=78; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.8523000; R2=0.0123557; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4619.7290039; R2=11.3348198; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=757; H_SCORE=13200; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=596; H_SCORE=11375; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: E1=*; BI=-105; BD=-105; /M: SY='R'; M=-20, -9,-30, -9, -1,-17,-21, 17,-28, 21,-19, -8, 0,-21, 9, 54,-11,-12,-21,-18, 0, -1; /M: SY='Q'; M=-11, -9,-27, -9, 7,-24,-23, -1,-11, 5, -2, 4, -8,-16, 30, 7,-10,-10,-17,-20, -7, 18; /M: SY='R'; M=-15, -9,-26,-10, -3,-13,-20, 9,-18, 7, -9, -4, -1,-21, 6, 28, -8, -8,-16,-20, 0, -2; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9, 1,-21,-20, -1,-30, 31,-21,-10, 0,-19, 10, 68,-10,-10,-20,-20,-10, 1; /M: SY='Q'; M=-13, -4,-16, -5, 10,-33,-21, 10,-23, 9,-20, -4, -1,-15, 39, 17, -3,-11,-26,-23,-10, 23; /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26, 55,-30,-20, 7,-30, 24, 7,-24,-30,-33,-20,-24,-10, 4, -1, 19,-26; /M: SY='R'; M=-14,-12, 17,-16,-10,-22,-12,-11,-31, 4,-21,-14, -6,-26, -3, 24, -8,-11,-19,-29,-19, -9; /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-21,-21, 33,-30, 18, 0,-11, 1, 0,-20,-30,-12,-11,-20,-10, -9, 29, 77,-21; /M: SY='Q'; M=-12, 0,-30, 1, 16,-33,-15, 32,-25, 3,-21, -3, 3,-12, 38, 5, -3,-13,-30,-24, -4, 26; /M: SY='E'; M=-13, 23,-30, 36, 47,-33,-17, 0,-33, 7,-23,-23, 6, -3, 14, -3, 0,-10,-30,-33,-20, 31; /M: SY='T'; M= 15, -9,-10,-15,-12,-13,-12,-20, -4,-12,-10, -8, -7,-14,-12,-15, 16, 19, 8,-30,-15,-12; /M: SY='A'; M= 10,-12,-20,-13, -7,-18,-11,-11, -9,-13,-14,-10, -7, 9, -7,-17, 8, 1, -8,-29,-17, -9; /M: SY='G'; M= 1, -9,-29, -9,-19,-29, 66,-19,-39,-19,-30,-20, 1,-19,-19,-19, 2,-18,-29,-21,-29,-19; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='R'; M=-16, -8,-29, -7, 7,-22,-21, 6,-22, 15,-12, -5, -3,-17, 19, 37, -9,-11,-20,-21, -8, 10; /M: SY='E'; M=-11, 12,-30, 23, 58,-31,-19, 0,-31, 9,-21,-21, 1, -1, 19, -1, 0,-10,-30,-31,-20, 38; /M: SY='A'; M= 44, -9,-10,-19,-10,-19, -2,-20,-10,-10,-10,-10, -9,-10,-10,-19, 11, 6, 0,-21,-19,-10; /M: SY='L'; M=-10,-30,-19,-31,-21, 13,-30,-21, 20,-29, 45, 18,-29,-30,-22,-20,-28, -9, 12,-19, 1,-21; /M: SY='S'; M= 11, -5,-12, -7, -5,-17, -6,-14,-10,-12,-21,-14, 4,-11, -4,-13, 29, 16, -4,-35,-17, -5; /M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5, 10,-30,-20, 5,-25, 20,-20, -5, 0,-15, 34, 41, -5,-10,-25,-20,-10, 19; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 48, 20,-30,-30,-20,-20,-29,-10, 12,-20, 0,-20; /M: SY='R'; M=-19,-13,-33,-13, -2,-18,-20, -3,-28, 21,-20,-10, -5,-20, 12, 51,-13,-13,-22, 2, -5, 2; /M: SY='E'; M= -5, 3,-26, 10, 42,-27,-20, -4,-21, 5,-16,-14, -4, -5, 16, -3, 0, -8,-19,-28,-18, 29; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='H'; M=-18,-10, 2,-12, -7,-17,-23, 24,-28, 3,-19, -9, -2,-25, 0, 24,-11,-13,-20,-27, -1, -7; /M: SY='Q'; M=-12, -8,-31, -7, 10,-25,-16, -1,-21, 6,-15, -6, -7,-15, 27, 13, -8,-13,-25, -2, -7, 18; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='R'; M=-18, -8,-30, -8, 3,-23,-20, 1,-29, 28,-20, -9, 0,-18, 16, 60, -9,-10,-21,-20,-10, 6; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='E'; M=-13, 19,-30, 30, 48,-32,-18, 5,-32, 7,-22,-21, 5, -3, 15, -2, -1,-11,-30,-32,-18, 31; /M: SY='L'; M= -4,-24,-17,-27,-21, 1,-27,-21, 18,-20, 23, 14,-23,-25,-18,-15,-15, -1, 19,-24, -5,-20; /M: SY='H'; M=-15, -3,-26, -5, -4,-14,-18, 39,-19, -4, -9, -2, 6,-21, 3, 11, -9,-11,-19,-28, 3, -4; /M: SY='T'; M= 3, 0,-10, -7, -7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13, 3,-10, -7,-10, 26, 40, -3,-33,-13, -7; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='E'; M= 0, 7,-27, 13, 49,-28,-17, -3,-27, 7,-18,-18, -2, -2, 15, -3, 2, -8,-25,-28,-20, 32; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='I'; M= -9,-30,-28,-39,-30, 0,-39,-30, 48,-29, 19, 19,-21,-21,-21,-29,-19, -9, 32,-21, -1,-30; /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20, 9,-29,-19, 20,-29, 48, 23,-29,-29,-19,-19,-29,-10, 10,-20, 0,-19; /M: SY='E'; M=-11, 12,-30, 23, 58,-31,-19, 0,-31, 9,-21,-21, 1, -1, 19, -1, 0,-10,-30,-31,-20, 38; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21, 9,-30,-21, 21,-29, 47, 19,-30,-30,-21,-20,-29, -9, 13,-21, -1,-21; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20, 9,-29,-18, 20,-28, 48, 23,-29,-29,-18,-19,-29,-10, 10,-20, 0,-19; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21, 9,-30,-21, 21,-29, 47, 19,-30,-30,-21,-20,-29, -9, 13,-21, -1,-21; /M: SY='T'; M= 6, -2,-12, -9, -9,-15, -6,-18,-15,-11,-16,-13, 1,-11, -9,-12, 22, 33, -5,-31,-15, -9; /M: SY='I'; M= -3,-28,-26,-37,-28, -2,-35,-29, 42,-27, 16, 16,-20,-20,-20,-28,-16, -8, 29,-21, -3,-28; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='G'; M= -7, -6,-32, -3, 6,-31, 13,-11,-31, 1,-27,-16, -3, 5, 4, -3, -3,-14,-28,-23,-22, 4; /M: SY='E'; M=-10, 12,-30, 22, 58,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 1, 0, 19, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 39; /M: SY='L'; M=-11,-30,-23,-34,-24, 11,-33,-23, 29,-30, 37, 19,-26,-27,-21,-23,-26,-10, 16,-18, 2,-24; /M: SY='Q'; M=-12, -2,-30, -2, 17,-37,-20, 8,-22, 13,-20, -2, 0,-12, 52, 20, -2,-10,-28,-20,-10, 33; /M: SY='A'; M= 22, -9,-12,-15,-12,-16, 0,-20,-10,-12,-12,-10, -7,-13,-12,-17, 12, 12, 1,-26,-18,-12; /M: SY='W'; M=-18,-30,-42,-30,-20, 3,-21,-18,-17,-10,-14,-12,-29,-27, -8, -4,-30,-22,-24, 90, 22,-12; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5, 9,-29,-20, 8,-26, 21,-21, -5, 0,-15, 31, 38, -6,-10,-25,-20, -9, 18; /M: SY='E'; M=-12, 8,-28, 16, 20,-25, -7, 3,-25, -5,-12,-13, 0,-12, 4, -8, -6,-12,-23,-29,-14, 12; /M: SY='H'; M=-17, -3,-29, -3, 4,-24,-21, 60,-24, -2,-16, 0, 4,-18, 22, 7, -8,-16,-27,-26, 8, 10; /M: SY='H'; M=-14, -2, -2, -7, -8,-16,-18, 27,-25, -9,-21,-11, 5,-24, 0, -4, -6,-11,-23,-15, 2, -5; /M: SY='P'; M=-10,-21,-39,-11, -1,-27,-21,-20,-17,-11,-24,-17,-21, 82,-11,-20,-11,-10,-27,-29,-28,-11; /M: SY='E'; M= -8, 3,-29, 10, 37,-28, -2, -4,-28, 2,-19,-13, -2, -6, 10, -5, -2,-12,-27,-27,-20, 24; /M: SY='S'; M= 7, 6,-11, 3, 0,-20, 0, -7,-20, -9,-30,-20, 17,-11, 0, -9, 36, 17,-13,-40,-20, 0; /M: SY='G'; M= 1,-11,-27,-11,-15,-27, 41,-18,-31,-14,-26,-17, -3, -9,-15,-13, 2,-13,-22,-23,-26,-16; /M: SY='E'; M=-10, 9,-30, 18, 56,-30,-20, -1,-30, 13,-21,-19, 0, -1, 19, 2, -1,-10,-29,-29,-19, 38; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='A'; M= 29,-16,-13,-24,-16,-12,-12,-22, 4,-15, 2, -1,-15,-16,-15,-20, 1, 0, 11,-22,-14,-16; /M: SY='V'; M= 6,-28,-14,-29,-27, -2,-24,-28, 18,-18, 3, 3,-28,-27,-26,-20,-10, -3, 33, -8, -7,-26; /M: SY='T'; M= 15, -7,-14,-15,-10,-15,-14,-21, -8,-11,-11,-10, -7, 1,-11,-16, 11, 23, -2,-26,-15,-11; /M: SY='L'; M= -9,-30, -5,-31,-24, 4,-30,-24, 15,-27, 27, 11,-29,-31,-23,-22,-24, -9, 14,-13, -3,-24; /M: SY='L'; M= -8,-30,-21,-30,-24, 3,-29,-24, 18,-21, 20, 9,-28,-29,-22,-14,-21, -8, 20, -5, -1,-23; /M: SY='E'; M=-11, 11,-29, 19, 45,-28,-19, -1,-29, 10,-20,-19, 2, -4, 15, 6, 0, -6,-27,-30,-18, 29; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='D'; M=-11, 24,-24, 34, 11,-30, 0, -4,-32, -1,-26,-23, 12,-11, 0, -2, 6, -5,-23,-33,-19, 5; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='L'; M=-11,-28, -5,-31,-23, 11,-30,-21, 15,-29, 35, 16,-27,-30,-22,-21,-26,-10, 8,-21, -1,-22; /M: SY='Q'; M=-13, 2,-30, 5, 29,-31,-20, 12,-26, 12,-20, -9, 1, -9, 31, 18, -3,-11,-28,-24,-11, 29; /M: SY='R'; M=-14,-10,-30,-10, -2,-21, -9, -7,-29, 19,-23,-12, -3,-18, 5, 37, -8,-11,-22, -6, -9, -1; /M: SY='E'; M= 0, 5,-25, 8, 28,-29,-12, -4,-24, 3,-18,-14, -1, -6, 16, -4, 4, -2,-22,-27,-18, 22; /M: SY='L'; M= -8,-25,-22,-25,-16, 2,-27,-20, 13,-25, 30, 11,-24,-14,-17,-19,-19, -5, 5,-23, -5,-18; /I: B1=*; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 127 in 127 different sequences |
Number of true positive hits | 126 in 126 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 1 |
Number of false negative sequences | 1 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 99.21 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 99.21 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | CJA_Sigrist |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | SCAN box |
Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
126 sequences
MZF1_HUMAN (P28698), NRIF1_MOUSE (Q923B3), NRIF1_RAT (Q4V8E9), NRIF2_MOUSE (Q921B4), PEG3_BOVIN (Q6H236), PEG3_GORGO (A1YFC1), PEG3_HUMAN (Q9GZU2), PEG3_PANPA (A1YGK6), PEG3_PANTR (A2T7F2), PGBD1_HUMAN (Q96JS3), SCND1_BOVIN (Q32PG5), SCND1_GORGO (A1YEW3), SCND1_HUMAN (P57086), SCND1_PANPA (A1YG31), SCND1_PANTR (A2T715), SCND1_PONPY (A2T7M0), SCND2_HUMAN (Q9GZW5), SCND3_HUMAN (Q6R2W3), ZFP69_BOVIN (A7MBI1), ZKSC1_HUMAN (P17029), ZKSC1_MOUSE (Q8BGS3), ZKSC1_PONAB (Q5R670), ZKSC1_RAT (Q4KLI1), ZKSC2_HUMAN (Q63HK3), ZKSC3_HUMAN (Q9BRR0), ZKSC3_MOUSE (Q91VW9), ZKSC4_HUMAN (Q969J2), ZKSC5_HUMAN (Q9Y2L8), ZKSC5_MOUSE (Q9Z1D8), ZKSC5_PANTR (A2T7D2), ZKSC7_HUMAN (Q9P0L1), ZKSC8_HUMAN (Q15776), ZKSC8_PANPA (A1YG60), ZKSC8_PANTR (A2T736), ZN165_HUMAN (P49910), ZN174_HUMAN (Q15697), ZN197_HUMAN (O14709), ZN202_HUMAN (O95125), ZN213_HUMAN (O14771), ZN215_HUMAN (Q9UL58), ZN215_PONAB (Q5RE50), ZN232_HUMAN (Q9UNY5), ZN263_HUMAN (O14978), ZN263_MOUSE (Q8CF60), ZN274_BOVIN (A6QPT6), ZN274_HUMAN (Q96GC6), ZN274_MACFA (Q4R8H9), ZN287_HUMAN (Q9HBT7), ZN287_MOUSE (Q9EQB9), ZN287_PONPY (A2T812), ZN394_HUMAN (Q53GI3), ZN394_MOUSE (Q9Z1D9), ZN394_PANPA (A1YG48), ZN394_PONAB (Q5R741), ZN394_RAT (Q9Z2K3), ZN396_HUMAN (Q96N95), ZN397_BOVIN (Q1LZ87), ZN397_HUMAN (Q8NF99), ZN444_HUMAN (Q8N0Y2), ZN445_HUMAN (P59923), ZN445_MOUSE (Q8R2V3), ZN446_HUMAN (Q9NWS9), ZN449_GORGO (A1YEQ3), ZN449_HUMAN (Q6P9G9), ZN449_PANPA (A1YFW6), ZN449_PANTR (A2T6W2), ZN483_HUMAN (Q8TF39), ZN496_HUMAN (Q96IT1), ZN496_MOUSE (Q5SXI5), ZN500_HUMAN (O60304), ZN75C_HUMAN (Q92670), ZN75D_HUMAN (P51815), ZNF18_HUMAN (P17022), ZNF18_MOUSE (Q810A1), ZNF18_RAT (Q642B9), ZNF24_HUMAN (P17028), ZNF24_MOUSE (Q91VN1), ZNF24_PANPA (A1YGJ4), ZNF24_PANTR (A2T7D7), ZNF24_PONAB (Q5RAE6), ZNF24_RAT (Q7TNK3), ZSA5A_HUMAN (Q9BUG6), ZSA5B_HUMAN (A6NJL1), ZSA5C_HUMAN (A6NGD5), ZSA5D_HUMAN (P0CG00), ZSC10_HUMAN (Q96SZ4), ZSC10_MOUSE (Q3URR7), ZSC12_GORGO (A1YEP8), ZSC12_HUMAN (O43309), ZSC12_MACNE (A2T6E3), ZSC12_MOUSE (Q9Z1D7), ZSC12_PANPA (A1YFW2), ZSC12_PANTR (A2T6V8), ZSC12_PONPY (A2T7F4), ZSC16_HUMAN (Q9H4T2), ZSC18_HUMAN (Q8TBC5), ZSC20_HUMAN (P17040), ZSC20_MOUSE (B2KFW1), ZSC21_GORGO (A1YEV9), ZSC21_HUMAN (Q9Y5A6), ZSC21_MOUSE (Q07231), ZSC21_PANPA (A1YG26), ZSC21_PANTR (A2T712), ZSC21_PONPY (A2T7L7), ZSC22_HUMAN (P10073), ZSC23_HUMAN (Q3MJ62), ZSC25_HUMAN (Q6NSZ9), ZSC26_BOVIN (A6QNZ0), ZSC26_HUMAN (Q16670), ZSC26_MOUSE (Q5RJ54), ZSC29_HUMAN (Q8IWY8), ZSC30_HUMAN (Q86W11), ZSC31_HUMAN (Q96LW9), ZSC32_HUMAN (Q9NX65), ZSC4C_MOUSE (Q80VJ6), ZSC4D_MOUSE (A7KBS4), ZSC4F_MOUSE (Q3URS2), ZSC9_HUMAN (O15535), ZSCA1_HUMAN (Q8NBB4), ZSCA2_HUMAN (Q7Z7L9), ZSCA2_MOUSE (Q07230), ZSCA2_PONAB (Q5RCD9), ZSCA4_AILME (D2HQI1), ZSCA4_HUMAN (Q8NAM6), ZSCA4_PANPA (A1YFX5), ZSCA4_PONPY (A2T7G6)» more
|
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
1 sequence
ZFP69_HUMAN (Q49AA0) |
UniProtKB/Swiss-Prot False positive sequences |
1 sequence
ZF69B_HUMAN (Q9UJL9) |
PDB [Detailed view] |
5 PDB
1Y7Q; 2FI2; 3LHR; 4BHX; 4E6S |