Entry: PS50817

General information about the entry

Entry name [info] INTEIN_N_TER
Accession [info] PS50817
Entry type [info] MATRIX
Date [info] MAY-2002 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAY-2016 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00687

Name and characterization of the entry

Description [info] Intein N-terminal splicing motif profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=80;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=75;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.8451000; R2=0.0257841; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3172.8544922; R2=3.0545454; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=270; H_SCORE=3998; N_SCORE=7.8; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=220; H_SCORE=3845; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='C'; M= -1,-16, 83,-24,-23,-19,-22,-25,-25,-24,-20,-17,-14,-32,-22,-25,  0, -4, -9,-45,-27,-23;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-32,-24, 17,-28,-21, 19,-26, 26, 12,-25,-28,-24,-20,-21, -8, 17,-17,  3,-24;
/M: SY='S'; M=  4, -2,-20, -3, -3,-18,-12, -7,-15,-10,-16,-12, -1,  2, -6,-12,  9,  7,-12,-30,-14, -6;
/M: SY='P'; M= -5,-14,-31,-11, -7,-16,  5,-12,-21, -7,-18,-13,-11,  6,-10,-11, -8,-12,-21,-12, -7,-10;
/M: SY='D'; M=-12, 25,-27, 32, 11,-26,  0, -4,-32, -4,-25,-23, 14,-13, -3,-10,  1, -8,-26,-28,-16,  4;
/M: SY='T'; M=  4,  1,-15, -3,  7,-17,-16,-12,-16, -6,-15,-13,  0, -8, -2, -9, 16, 27, -8,-30,-14,  3;
/M: SY='R'; M=-11, -6,-28, -6,  4,-16,-20, -7,-15,  4,-11, -8, -4, -5,  0,  6, -9, -5,-16,-16, -9,  1;
/M: SY='I'; M= -5,-29,-20,-33,-27,  0,-33,-28, 35,-24, 18, 15,-25,-25,-22,-23,-16, -6, 34,-24, -5,-27;
/M: SY='L'; M= -8,-23,-24,-25,-17,  0,-27,-18, 13,-20, 15,  9,-20,-12,-14,-16,-16, -5,  6,-18, -3,-17;
/M: SY='L'; M= -7,-19,-19,-24,-19,  5,-27,-19, 11,-19, 14,  8,-17,-21,-16,-16,-10,  7,  9,-16,  1,-18;
/M: SY='E'; M=  0, -6,-25, -5,  5,-19,-15,-12,-17,  4,-17,-12, -6,  3, -1,  0, -1, -5,-14,-25,-15,  1;
/M: SY='D'; M=-12, 11,-26, 13,  7,-19,-10, -1,-22, -1,-18,-14,  9,-15,  0,  0, -1, -6,-19,-29,-13,  3;
/M: SY='G'; M= -5,  1,-27, -1, -8,-24, 33,-12,-31, -9,-26,-18,  8,-18,-11,-11,  0,-11,-25,-23,-20,-10;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='G'; M= -3,  0,-18,  1, -1,-18, 13, -8,-22, -4,-18,-13,  3,-10, -4, -3,  5, -3,-16,-20,-15, -3; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M: SY='F'; M=-10,-19,-20,-21,-13,  6,-22,-15,  0,-12,  1,  0,-16,-12,-13,-10,-13, -6, -2,  2,  2,-13; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='V'; M= -7,-14,-20,-16, -8, -9,-25,-15,  5, -4,  0,  4,-13,-18, -9, -2, -8, -1,  9,-24, -8,-10; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='K'; M= -6, -1,-21,  0,  6,-22,-17,-11,-23, 14,-22,-14, -1,  0,  1,  9,  1,  2,-17,-26,-14,  3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='I'; M=-10,-28,-26,-37,-27,  7,-35,-25, 38,-27, 23, 21,-21,-22,-19,-25,-20, -9, 23,-18,  2,-26; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='G'; M=  0, -4,-26, -3,  4,-24, 14,-12,-29,  1,-22,-15, -1,-13, -3, -1,  0, -9,-21,-22,-19,  0; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='E'; M=-11, 21,-27, 28, 31,-30,-15,  0,-29,  7,-24,-20, 11, -7,  9, -1,  2, -6,-26,-32,-18, 20; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='L'; M= -9,-28,-19,-32,-24, 17,-30,-22, 22,-26, 26, 15,-25,-25,-24,-21,-21, -8, 18,-17,  3,-24; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='V'; M= -4,-13,-19,-15,-10, -3,-23,-14,  3, -8, -4, -1,-12,-18,-10, -9, -6, -2,  8,-20, -1,-11; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='D'; M= -6, 19,-21, 23, 19,-23, -9, -1,-23,  3,-20,-17, 13, -7,  6, -3,  4, -4,-21,-27,-15, 12; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='K'; M= -6,  4,-20,  6,  7,-20, -9, -2,-18, 10,-17, -9,  4, -8,  5,  8, -1, -5,-15,-20,-10,  5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='Y'; M= -7, -9,-18,-11, -5,  5,-17, -5, -5, -3, -3, -3, -8,-15, -6, -3, -8, -4, -5, -2, 10, -6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='M'; M= -7, -9,-17,-11, -8, -2,-18,-10,  3, -5,  3,  6, -8,-15, -8, -4, -9, -5,  3,-17, -3, -8; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='E'; M= -5,  4,-19,  7, 11,-16,-11, -1,-16,  3,-11, -8,  1, -6,  2, -2, -2, -5,-14,-20, -8,  6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='K'; M= -5,  0,-10,  0,  1,-11, -9, -5,-10,  3, -9, -5,  0, -9,  0,  2, -1, -1, -6,-16, -8,  1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M:         M= -3, -3,-14, -4, -1, -6, -6, -4, -6, -4, -6, -5, -1, -5, -3, -4, -3, -4, -7,-11, -3, -3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='D'; M= -4,  2,-14,  4,  2,-12,  0, -1,-14,  0,-12, -8,  1, -7, -2, -3, -1, -5,-10,-14, -7,  0; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='E'; M= -4,  0,-15,  2,  5,-12, -9, -7,-11,  0,-11, -8, -2, -1, -2, -2,  0, -2, -8,-17,-10,  1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='V'; M= -3,-17,-12,-18,-13,  0,-20,-17, 12,-15, 12,  6,-16,-18,-14,-14,-11, -3, 13,-16, -4,-14; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='D'; M= -4,  5,-20,  8,  6,-20,  3, -7,-22,  1,-19,-14,  4, -6, -1, -2,  1, -6,-18,-21,-15,  2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='G'; M= -6,  8,-20,  8,  3,-21, 12, -5,-24,  0,-20,-14, 10, -9, -2, -1,  1, -8,-20,-21,-16,  0; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='E'; M= -9, -6,-23, -5,  7, -5,-19,  4,-14,  5,-10, -4, -6,-12,  3,  2, -7, -7,-13,-11,  7,  4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='V'; M=  4,-23,-15,-26,-23, -4,-19,-23, 17,-19,  8,  7,-21,-24,-21,-19, -7, -1, 26,-25, -8,-22; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='L'; M=-12,-21,-26,-23,-17,  7,-27, -9,  8,-17, 12,  6,-19,-17,-15,-15,-19, -9,  2, -5, 12,-17; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='S'; M=  5,  0,-19, -3, -5,-21,  5,-13,-20,-10,-23,-16,  6, -2, -6,-12, 14,  7,-15,-31,-21, -6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='F'; M= -9,-22,-20,-26,-20, 14,-25,-15,  6,-15,  8,  3,-17,-23,-19,-10,-15, -8,  6,-12,  4,-20; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='D'; M=-11, 23,-24, 25,  6,-27, -7, -4,-26,  0,-25,-19, 18, -9, -2, -4,  1, -5,-23,-33,-18,  1;
/I:         I=-3; MD=-14;
/M: SY='E'; M= -4, -2,-25, -2,  1,-20, -3, -8,-17, -2,-17,-11, -1, -9, -2, -5, -2, -8,-14,-23,-12, -1; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-14;
/M: SY='D'; M= -7,  9,-25, 11, 10,-24, -4, -6,-25,  5,-20,-15,  6,-12,  2,  4, -1, -7,-20,-23,-15,  6; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='G'; M= -5, -8,-13, -9, -6, -5,  1, -7, -7, -5, -2, -2, -6,-13, -6, -4, -7, -7, -6,-10, -3, -6; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-14;
/M: SY='K'; M= -9, -7,-26, -7,  1,-17,-20,-10,-13, 13,-16, -7, -5, -8,  1, 11, -8, -7,-10,-13, -6,  0; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-14;
/M: SY='I'; M= -5,-20,-20,-23,-16,  5,-24,-17,  8,-18,  8,  3,-18,-15,-17,-16,-11, -2,  8,-14, -1,-17; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-14;
/M: SY='R'; M= -9, -6,-24, -7,  4,-14,-20, -4,-14,  7,-13, -7, -4,-16,  2,  9, -4, -4, -8,-21, -7,  3;
/M: SY='Y'; M=-11,-14,-28,-16, -9, -6,-21, -6, -8, -4, -5, -2,-11,-17, -6, -1,-14,-10, -9, -1,  1, -8;
/M: SY='K'; M= -5, -7,-23, -8, -6,-17,-13,-11,-14,  7,-12, -5, -6,-17, -4,  6, -5, -2, -6,-23, -9, -5;
/M: SY='K'; M= -5, -5,-25, -4,  0,-23, -8,-12,-24,  9,-23,-14, -5,  2, -3,  7, -3, -5,-18,-23,-14, -3;
/M: SY='V'; M=  1,-18,-20,-20,-14, -4,-21,-20,  8,-14,  1,  1,-17,-17,-15,-15, -9, -6, 13,-20, -7,-15;
/M: SY='E'; M= -6, -7,-24, -8,  1,-17,-14, -6,-14,  0,-13, -8, -5,-10, -2,  0, -1,  0,-10,-23,-10, -2;
/M: SY='E'; M= -3, -1,-25,  0,  6,-20,-14,  0,-20,  5,-18,-11, -1,-10,  6,  3,  0, -4,-17,-21, -5,  4;
/M: SY='V'; M= -2,-24,-16,-27,-20,  3,-26,-21, 14,-17, 10,  9,-23,-24,-19,-17,-13, -4, 18,-14, -3,-19;
/M: SY='Y'; M=-14,-24,-28,-28,-20, 14,-25, -8,  6,-18,  6,  5,-20,-25,-15,-14,-19,-12, -2, 14, 20,-18;
/M: SY='R'; M=-13,  0,-26,  2, 10,-23,-20, -3,-24, 19,-19,-11,  0,-12,  8, 24, -7, -8,-19,-24,-10,  7;
/I:         I=-1; MD=-6;
/M: SY='H'; M= -8,-10,-22,-11, -9,-10,-11,  8,-11, -7, -9, -3, -5,-20, -6,  1, -6, -7, -7,-22, -3,-10; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-6;
/M: SY='R'; M= -9, -1,-25,  0,  7,-22, -7, -5,-24, 15,-21,-12,  1, -7,  4, 16, -5, -8,-19,-20,-11,  4; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-6;
/M: SY='Y'; M= -3, -9,-19,-11, -7, -7,-17, -3, -5, -7, -4, -3, -9,-13, -4, -8, -4,  2, -3,-13,  3, -7; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
/M: SY='E'; M= -7,  0,-23,  3,  7,-22,  2, -5,-22,  7,-19,-11,  1,-10,  3,  6, -2, -9,-18,-20,-14,  4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-6;
/M: SY='K'; M= -8, -2,-24,  0,  7,-21,-10, -3,-21, 10,-19,-10, -2,  1,  4,  7, -4, -6,-18,-19,-10,  4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-6;
/M: SY='M'; M= -4,-16,-11,-20,-16, -4,-18,-14,  9,-13,  9, 11,-14,-19,-12,-12,-11, -3, 10,-20, -6,-15; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-6;
/M: SY='Y'; M=-12,-18,-21,-20,-17, 15,-25, -5, 11,-14,  9,  6,-16,-21,-14,-13,-16, -8,  4,  1, 25,-17; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-6;
/M: SY='R'; M= -8, -3,-23, -2,  8,-20,-11, -7,-21, 14,-18,-11, -1, -9,  4, 19, -2, -5,-14,-21,-13,  5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-6;
/M: SY='I'; M= -7,-22,-18,-26,-21,  6,-26,-20, 24,-19, 13, 10,-17,-19,-17,-17,-13, -5, 20,-15,  1,-21; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-6;
/M: SY='R'; M= -9, -4,-21, -4,  4,-16,-15, -6,-17, 15,-16, -8, -1,-11,  4, 20, -3, -2,-12,-13, -8,  3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-6;
/M: SY='S'; M= -3,  7,-22,  7,  5,-21, -5, -7,-22, -1,-20,-15,  7,-12,  1, -4,  8,  0,-18,-29,-15,  2;
/M: SY='G'; M= -2, -7,-28, -8,-14,-24, 38,-13,-30,-13,-24,-16,  1,-18,-14,-11, -1,-15,-23,-19,-22,-14;
/M: SY='R'; M= -9, -8,-25,-10, -5,-11,-17,  0,-18,  6,-14, -8, -4,-19, -1, 15, -5, -4,-14,-10,  2, -5;
/M: SY='E'; M= -3, -2,-21, -1, 13,-19,-15, -8,-18,  3,-17,-12, -4,-12,  3, -2,  2, -2,-13,-21, -9,  8;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-23,-35,-27, 10,-34,-26, 33,-28, 25, 16,-25,-26,-24,-24,-21, -8, 25,-19,  1,-27;
/M: SY='K'; M= -4, -4,-23, -5,  3,-17,-18,-12,-14,  7,-13, -9, -4,-14, -1,  5, -2,  1, -8,-22,-10,  0;
/M: SY='V'; M=  8,-20, -2,-25,-21, -8,-17,-23,  6,-19,  5,  3,-18,-23,-19,-20, -5,  0, 14,-27,-13,-20;
/M: SY='T'; M= -1,  4,-11, -4, -8,-12,-18,-18,-12, -9,-12,-12,  3,-10, -9,-10, 19, 44, -3,-31,-11, -8;
/M: SY='P'; M=  4,-11,-27, -8,  1,-25, -3,-12,-21, -6,-22,-15, -9, 22, -5,-10,  1, -7,-19,-27,-22, -4;
/M: SY='D'; M=-10, 23,-26, 26, 12,-27, -3, -2,-28, -2,-25,-21, 18,-13,  1, -7,  4, -5,-26,-29,-16,  7;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20, 98,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0, -9,-19,-29,-30, 19,  0;
/M: SY='P'; M= -7,-10,-28, -6,  3,-23,-16,-11,-19,  6,-20,-12, -7, 15,  2,  3, -1, -5,-19,-26,-15,  1;
/M: SY='F'; M=-10,-30,-20,-34,-27, 24,-30,-24, 19,-26, 20, 11,-26,-28,-27,-21,-21, -9, 18, -5,  7,-26;
/M: SY='F'; M=-13,-24,-23,-27,-19, 19,-27,-14,  8,-20, 19,  8,-20,-21,-19,-12,-20, -9,  3,-11, 10,-20;
/M: SY='T'; M=  0,-14, -9,-20,-18, -8,-21,-23,  4,-13, -2, -1,-13,-19,-17,-12,  3, 18, 16,-29,-11,-18;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2016_06 which contains 551'385 sequence entries.


Total number of hits 145 in 132 different sequences
Number of true positive hits 143 in 130 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 2 in 2 different sequences
Number of false negative sequences 6
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 98.62 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 95.97 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Archaea, Bacteriophages, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 3
Version [info] 4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
130 sequences

CLPP_CHLMO  (P42379    ), DHHA_XENLA  (Q91610    ), DHH_MOUSE   (Q61488    ), 
DNAB_MYCBO  (P59966    ), DNAB_MYCTO  (P9WMR2    ), DNAB_MYCTU  (P9WMR3    ), 
DNAB_NOSS1  (Q8YZA1    ), DNAB_PORPU  (P51333    ), DNAB_RHOMR  (O30477    ), 
DNAB_SYNY3  (Q55418    ), DP2L_HALMA  (Q5UZ40    ), DP2L_HALSA  (Q9HMX8    ), 
DP2L_HALWD  (Q18ER3    ), DP2L_METHJ  (Q2FSF9    ), DP2L_METMJ  (A3CXE7    ), 
DP2L_PYRAB  (Q9V2F4    ), DP2L_PYRHO  (O57861    ), DP2L_THEKO  (Q5JET0    ), 
DPO3A_SYNY3 (P74750    ), DPOL_BPAPS  (Q9T1Q3    ), DPOL_METJA  (Q58295    ), 
DPOL_PYRHO  (O59610    ), DPOL_PYRSD  (Q51334    ), DPOL_THEAG  (O33845    ), 
DPOL_THEFM  (P74918    ), DPOL_THEG8  (Q9HH84    ), DPOL_THEHY  (Q9HH05    ), 
DPOL_THEKO  (P77933    ), DPOL_THELI  (P30317    ), EF2_METKA   (Q8TXJ4    ), 
GLMS_METJA  (Q58815    ), GYRA_MYCFV  (Q49166    ), GYRA_MYCGO  (Q49467    ), 
GYRA_MYCKA  (Q49608    ), GYRA_MYCLE  (Q57532    ), GYRA_MYCMA  (O33149    ), 
GYRA_MYCXE  (P72065    ), GYRB_SYNY3  (P77966    ), HELS_METJA  (Q58524    ), 
HELS_THEKO  (Q5JGV6    ), HH_DROAN    (B3LV44    ), HH_DROER    (B3P7F8    ), 
HH_DROGR    (B4JTF5    ), HH_DROHY    (P56674    ), HH_DROME    (Q02936    ), 
HH_DROMO    (B4K4M0    ), HH_DROPE    (B4G2I8    ), HH_DROPS    (Q29AA9    ), 
HH_DROSE    (B4HFB7    ), HH_DROSI    (B4R1D8    ), HH_DROVI    (B4LZT9    ), 
HH_DROWI    (B4NJP3    ), HH_DROYA    (B4PN49    ), IF2P_METJA  (Q57710    ), 
IF2P_PYRAB  (Q9UZK7    ), IF2P_PYRFU  (Q8U1R8    ), IF2P_PYRHO  (O58822    ), 
IF2P_THEKO  (Q5JGR9    ), IHH_DANRE   (Q98862    ), IHH_HUMAN   (Q14623    ), 
IHH_MOUSE   (P97812    ), LONB_PYRAB  (Q9UYC6    ), LONB_PYRHO  (O58221    ), 
NDRZ_PYRFU  (E7FHX6    ), NRDEB_BACSU (O31875    ), NRDEB_BPSPB (O64173    ), 
PPSA_METJA  (Q57962    ), QUA1_CAEEL  (G5EC21    ), RADA_PYRHO  (O58001    ), 
RADA_THEKO  (Q5JET4    ), RECA_MYCBO  (P0A5U5    ), RECA_MYCCI  (Q9F417    ), 
RECA_MYCFA  (Q9F416    ), RECA_MYCFV  (Q9F415    ), RECA_MYCGS  (Q9F414    ), 
RECA_MYCLE  (P35901    ), RECA_MYCSH  (Q9F410    ), RECA_MYCT3  (Q9F407    ), 
RECA_MYCTO  (P9WHJ2    ), RECA_MYCTU  (P9WHJ3    ), RFCS_HALWD  (Q18E75    ), 
RFCS_METJA  (Q58817    ), RFCS_METKA  (Q8TZC4    ), RFCS_PYRAB  (Q9V2G4    ), 
RFCS_PYRFU  (Q8U4J3    ), RFCS_PYRHO  (O57852    ), RFCS_THEKO  (Q5JHP2    ), 
RGYR_METJA  (Q58907    ), RGYR_PYRHO  (O58530    ), RGYR_THEKO  (Q6F598    ), 
RIR1_IIV6   (O55716    ), RIR2_AQUAE  (O67475    ), RPC2_DICDI  (Q54IZ9    ), 
RPOA1_METJA (Q58445    ), RPOA2_METJA (Q58446    ), RTCB_METJA  (Q58095    ), 
RTCB_METKA  (Q8TUS2    ), RTCB_PYRAB  (Q9V168    ), RTCB_PYRFU  (Q8U0H4    ), 
RTCB_PYRHO  (O59245    ), SHH_CHICK   (Q91035    ), SHH_CYNPY   (Q90385    ), 
SHH_DANRE   (Q92008    ), SHH_HUMAN   (Q15465    ), SHH_MOUSE   (Q62226    ), 
SHH_RAT     (Q63673    ), SHH_XENLA   (Q92000    ), TF2B_METJA  (Q58192    ), 
TOP1_PYRFU  (O73954    ), UGP1_CANAL  (Q59KI0    ), VATA_CANTR  (P38078    ), 
VATA_PYRAB  (Q9UXU7    ), VATA_PYRFU  (Q8U4A6    ), VATA_PYRHO  (O57728    ), 
VATA_THEAC  (Q9P997    ), VATA_THEVO  (Q97CQ0    ), VATA_YEAST  (P17255    ), 
VATB_METKA  (Q8TUT0    ), WRT1_CAEEL  (Q94128    ), WRT4_CAEEL  (Q94129    ), 
WRT6_CAEEL  (P91573    ), WRT8_CAEEL  (Q94130    ), Y043_METJA  (Q60348    ), 
Y1054_METJA (Q58454    ), Y1461_MYCTO (P9WFP6    ), Y1461_MYCTU (P9WFP7    ), 
Y1496_MYCBO (P67126    ), Y593_MYCLE  (Q49689    ), Y781_METJA  (Q58191    ), 
Y832_METJA  (Q58242    )
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
6 sequences

DNAB_GUITH  (O78411    ), DNAB_MYCIT  (Q9F5P4    ), DNAB_MYCLE  (P46394    ), 
DNAB_PYRYE  (Q1XDF3    ), DPOL_CEV01  (A7U6F1    ), DPOL_MIMIV  (Q5UQR0    )
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
False positive sequences
2 sequences

ERC6L_DANRE (A2BGR3    ), HIR1_ASHGO  (Q74ZN0    )

		
PDB
[Detailed view]
28 PDB

1AM2; 1AT0; 1DFA; 1DQ3; 1LWS; 1MI8; 1VDE; 1ZD7; 1ZDE; 2CW7; 2CW8; 2IMZ; 2IN0; 2IN8; 2IN9; 2JMZ; 2JNQ; 2L8L; 2LCJ; 2LQM; 3IFJ; 3IGD; 3NZM; 4E2T; 4E2U; 4GIG; 4O1S; 4OZ6
» more

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission