Entry: PS50833

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] BRIX
Accession [info] PS50833
Entry type [info] MATRIX
Date [info] AUG-2003 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50833
Associated ProRule [info] PRU00034

Name and characterization of the entry

Description [info] Brix domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=190;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=185;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1403372; R2=0.0195778; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=10712.58969; R2=23.92165; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=320; N_SCORE=8.4; H_SCORE=17865; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=223; N_SCORE=6.5; H_SCORE=16047; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='P'; M=-10,-11,-34, -6,  6,-25,-20,-12,-20,  6,-24,-12,-12, 40,  0, -4, -8, -7,-24,-24,-17,  0;
/M: SY='R'; M=-12, -4,-27, -6,  1,-22,-20,  6,-21, 24,-19, -1,  0,-15,  8, 26, -8, -8,-15,-23, -6,  3;
/M: SY='I'; M=  3,-19,-14,-25,-19, -8,-22,-19, 16,-17,  4, 12,-15,-19,-12,-18, -4,  1, 16,-26, -9,-16;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-32,-23, 12,-30,-20, 22,-25, 33, 20,-26,-27,-20,-17,-24, -9, 15,-18,  1,-22;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-20,-34,-27, 14,-33,-26, 28,-27, 24, 14,-26,-27,-26,-23,-20, -7, 26,-19,  1,-27;
/M: SY='T'; M= -4,-12,-12,-21,-17, -3,-23,-22,  5,-19,  4,  0,-10,-17,-15,-17,  2, 23,  6,-26, -7,-17;
/M: SY='T'; M= -6, -3, -9, -8, -7,-14,-19, -2,-17, -6,-15, -9, -1,-12, -4, -3,  8, 20,-10,-28, -6, -6;
/M: SY='S'; M=  3, -3,-15, -4, -5,-22, 11,-11,-25, -7,-27,-18,  6,-14, -4, -2, 22,  8,-15,-32,-20, -5;
/M: SY='R'; M=-11, -5,-27, -5, -3,-23, -3,  1,-28, 11,-22,-12,  3,-16,  3, 29, -3, -8,-20,-24,-13, -3;
/M: SY='K'; M= -9,  6,-22,  6,  5,-23,-10, -7,-26, 13,-20,-14,  7,-16,  1, 13, -4, -8,-20,-27,-15,  2;
/M: SY='P'; M=  6,-15,-15,-16, -9,-20,-17,-21,-10,-13,-17,-12,-14, 28,-13,-19, -1,  2, -8,-29,-22,-14;
/M: SY='S'; M=  0,  7,-13,  3, -4,-22,  7, -7,-24, -7,-28,-18, 16,-16, -5, -7, 18,  6,-18,-35,-20, -5;
/M: SY='Q'; M= -4,-10,-25,-11, -3,-17,-14, -7,-13,  1,-15, -7, -6, -8,  4,  3, -2, -4,-11,-21, -9, -1;
/M: SY='R'; M=-13, -4,-26, -8, -3,-16,-19,  0,-18, 13,-17, -8,  4,-16,  4, 29, -4, -2,-15,-21, -4, -3;
/M: SY='T'; M= -3,-17,-14,-22,-18, -3,-24,-17,  9,-20, 10,  4,-15,-21,-16,-17, -5, 11, 11,-24, -4,-18;
/M: SY='R'; M=-12, -8,-25,-10, -4,-13,-19, -2,-19, 13,-15, -8, -2,-17,  1, 28, -4, -3,-13,-20, -3, -4;
/M: SY='Q'; M= -8,  6,-24,  7,  5,-23,-11,  8,-21,  0,-19, -8,  6,-14,  9,  1,  5, -4,-19,-28, -8,  6;
/M: SY='F'; M=-12,-29,-14,-35,-26, 41,-29,-22, 10,-28, 20,  7,-24,-29,-31,-21,-20, -9,  9, -7, 12,-26;
/M: SY='M'; M=  8,-16,-12,-22,-15, -9,-11,-15,  3,-15,  4, 13,-14,-18,-10,-16, -4, -2,  5,-24,-11,-13;
/M: SY='K'; M= -9, -3,-25, -5,  0,-18,-15,  0,-17, 11,-13, -4,  0,-16,  4, 10, -6, -6,-14,-24, -8,  1;
/M: SY='D'; M=-14, 24,-28, 36, 24,-30,-16, -3,-26,  1,-20,-20,  8,-10,  3, -5, -2, -9,-20,-34,-18, 13;
/M: SY='L'; M=-11,-29,-22,-32,-23, 12,-30,-20, 21,-27, 37, 20,-28,-28,-20,-20,-27,-10, 12,-13,  3,-21;
/M: SY='R'; M= -7, -7,-23, -8,  1,-12,-18, -1,-17,  6,-15, -8, -3,-16,  3, 13,  0, -2,-12,-20, -2,  1;
/M: SY='R'; M= -3, -2,-23, -4, -2,-14,-12, -8,-18,  2,-10, -9,  0,-17, -2, 12, -4, -6,-13,-23,-11, -3;
/M: SY='I'; M= -7,-27,-13,-31,-25,  5,-31,-24, 24,-25, 24, 14,-24,-26,-22,-22,-18, -3, 22,-23, -3,-24;
/M: SY='M'; M=-12,-22,-24,-28,-18, 13,-28,-17, 11,-10, 13, 15,-18,-22,-15,-10,-20,-10,  6,-14,  4,-17;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='P'; M= -8,-17,-35, -9, -1,-26,-14,-17,-18, -9,-26,-17,-17, 75, -9,-17, -8, -9,-26,-26,-26, -9; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-29;
/M: SY='N'; M=-12, 10,-25,  3, -7,-10,  0, 10,-20,-11,-16,-12, 19,-21, -8, -9, -3, -9,-23,-22, -6, -8;
/M: SY='A'; M= 13,-10,-11,-16,-12,-13, -8,-18,-10,-13,-14,-10, -7,-15,-10,-16, 12, 10, -3,-15,-13,-11;
/M: SY='K'; M= -1,-11,-22,-13, -3,-14,-20,-10, -8,  2, -9, -4,-10,-12, -2,  1, -5, -3, -2,-22, -8, -3;
/M: SY='R'; M=-12,-11,-26,-13, -8, -4,-19, -5,-12,  8,-12, -5, -6,-20, -3, 14, -9, -7, -9,-12,  8, -8;
/M: SY='M'; M=-12,-12,-24,-15,-12,  4,-25,-10,  4, -8,  3,  7,-10,-22,-11, -6,-14, -8,  2,-16,  4,-12;
/M: SY='N'; M= -7,  7,-21,  1, -2,-16,-14, -6,-12, -2,-12, -9, 13,-13,  0, -3,  3,  5,-15,-30,-12, -1;
/M: SY='R'; M=-17, -7,-30, -7,  3,-23,-20,  1,-30, 34,-23, -9,  0,-17, 12, 55,-10,-10,-21,-20, -9,  4;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='K'; M= -5, -6,-14, -5,  0, -9,-10, -4, -6,  5, -4, -2, -5, -9, -1,  4, -6, -4, -3,-13, -5, -1; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='G'; M= -6, -6,-28, -7, -9,-25, 24, -6,-31,  0,-23,-13,  1,-18, -5,  2, -3,-11,-24,-22,-17, -8;
/M: SY='K'; M=-10,  1,-28,  0,  2,-23,-16, -1,-21, 11,-22, -9,  4,  3,  3,  6, -3, -6,-20,-26,-11,  1;
/M: SY='F'; M=-12,-10,-23,-16,-12, 12,-22, -6, -6, -3, -3,  0, -4,-22,-11, -4,-11, -7, -7,-11, 11,-11;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='E'; M= -3,  6,-19,  9, 13,-22,-12, -7,-20,  0,-20,-16,  5,-10,  4, -1, 13,  5,-14,-32,-16,  8; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='L'; M=-10,-12,-23,-11,-14, -7,-20,-17,  8,-18, 16,  9,-16,-23,-15,-17,-17,-10,  6,-25, -7,-15;
/M: SY='K'; M= -5, -2,-27, -2, 11,-26,-15, -5,-20, 14,-20, -8, -1, -5, 12,  9, -3, -6,-19,-24,-13, 11;
/M: SY='D'; M= -7, 14,-23, 19, 18,-27,-15, -6,-24,  2,-21,-17,  6, -9,  8, -4,  8,  5,-18,-32,-16, 13;
/M: SY='L'; M= -8,-25,-17,-28,-20,  8,-27,-22, 15,-25, 16,  7,-20,-17,-20,-21,-13, -5, 10,-21, -3,-21;
/M: SY='L'; M= -1,-19,-15,-25,-21,  4,-23,-19, 15,-21, 16,  9,-15,-25,-19,-19,-13, -5, 14,-22, -5,-20;
/M: SY='E'; M= -6, -1,-21,  3, 19,-24,-14, -6,-18,  1,-15,-10, -5,-10,  4, -3, -4, -9,-14,-28,-16, 11;
/M: SY='F'; M= -3,-16,-22,-21, -9,  5,-23,-14,  4,-12,  3,  3,-12,-19,-10, -9, -9, -6,  2,-17, -2,-10;
/M: SY='A'; M= 20,-13,  6,-20,-15, -5,-10,-20,-11,-17, -8,-10,-11,-19,-17,-21,  1, -3, -3,-22,-13,-16;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='S'; M=  0, -6,-21, -8,  0,-16, -6,-10,-13,  0,-15, -9, -2,-12, -2,  1,  4, -1, -9,-21,-10, -2; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='E'; M= -2, -4,-21, -5,  3,-13,-15, -9,-10,  0, -9, -3, -4, -6,  0, -3, -3, -4, -9,-22,-10,  1; D=-4;
/I:         I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
/M: SY='R'; M=-11, -6,-23, -8, -1, -9,-17, -4,-15, 13, -9, -4, -2,-16,  0, 17,-10, -8,-13,-16, -2, -1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='G'; M= -6, 11,-22,  8, -3,-20, 17, -2,-26, -8,-23,-16, 16,-15, -6, -9,  4, -6,-23,-25,-17, -4; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='V'; M= -3, -3, -8, -2,-10, -1,-17,-11, -7,-12, -8, -8, -8,-19,-14,-14, -3, -3,  1,-18,  0,-12; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='T'; M=  1, -1, -1, -6, -3,-17,-13,-16,-17, -9,-15,-13,  0,-14, -8,-11, 12, 20, -9,-32,-16, -6;
/M: SY='D'; M= -8, 12,-25, 15,  4,-24,-11, 14,-27,  0,-24,-16, 10,-10,  2,  2,  4, -5,-22,-30, -7,  1;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-15,-32,-24, 12,-30,-22, 22,-27, 30, 17,-27,-29,-23,-21,-22, -8, 19,-20,  0,-24;
/M: SY='L'; M= -5,-26,-20,-30,-22, 13,-23,-20, 13,-23, 19, 13,-23,-26,-20,-19,-19, -9, 11, -9,  2,-20;
/M: SY='V'; M= -7,-28,-19,-33,-27, 10,-32,-24, 28,-23, 16, 15,-24,-26,-24,-21,-16, -4, 29,-19,  2,-27;
/M: SY='F'; M=-11,-29,-20,-34,-27, 26,-31,-22, 21,-26, 20, 13,-24,-28,-27,-21,-20, -8, 20,-12,  9,-27;
/M: SY='N'; M= -3,  4,-22, -1, -1,-20,  5,  6,-22, -9,-19,-11, 11,-16, -2, -8,  6, -1,-20,-29,-14, -2;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='E'; M=  2,  1,-14,  3, 22,-21,-13, -8,-18, -1,-16,-14, -1, -7,  6, -6,  9,  3,-13,-28,-17, 14; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='R'; M=-10,  4,-24,  4,  1,-16,-14,  4,-22,  5,-21,-13,  6,-16,  0, 10,  1, -2,-17,-20, -7,  0; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='K'; M=-10, -2,-28, -3,  5,-26,-18, -3,-27, 32,-26,-10,  2,-10,  8, 31, -6, -7,-20,-23,-10,  5;
/M: SY='G'; M= -4, -3,-27, -3, -2,-27, 14, -6,-32,  9,-27,-14,  2,-15, -3,  5, -1,-10,-23,-23,-17, -3;
/M: SY='R'; M= -8,  6,-23, -1, -1,-21,-12, -5,-18, 12,-20,-10, 13,-16,  3, 15,  0, -1,-15,-27,-13,  0;
/M: SY='P'; M= -9, -7,-34,  0,  1,-29,-15,-15,-21, -6,-27,-18, -8, 52, -6,-14, -5, -7,-25,-31,-25, -6;
/M: SY='B'; M= -4,  7,-20,  4, -7,-15, -9, -6,-11,-12, -5, -8,  6,-19,-10,-12, -3, -1, -9,-30,-13, -8;
/M: SY='N'; M= -5, -2,-18, -7, -9,-14,  0, -6,-16, -6,-19,-12,  7,-19, -5, -3,  4, -2,-15,-22, -5, -9;
/M: SY='L'; M=-11,-29,-22,-32,-22, 12,-30,-19, 24,-27, 38, 24,-26,-27,-19,-20,-26,-10, 13,-18,  2,-21;
/M: SY='T'; M= -7,-14,-22,-19,-15, -7,-24,-20,  1, -6, -4, -2,-11,-19,-12, -4, -6,  8,  4, -8, -4,-14;
/M: SY='I'; M=-10,-29,-20,-34,-27, 20,-30,-23, 22,-25, 20, 15,-25,-27,-25,-21,-20, -8, 20, -9,  5,-26;
/M: SY='V'; M= -3,-18,-12,-22,-20, -4,-11,-13,  3,-18, -3,  3,-13,-23,-15,-18, -4, -4,  4,-19,  1,-19;
/M: SY='R'; M=-15,  4,-29,  6,  6,-24,-16, 24,-30, 14,-23,-11,  7,-16,  8, 27, -7,-12,-24,-26, -5,  3;
/M: SY='L'; M= -8,-22,-19,-25,-17,  9,-26,-18, 10,-19, 18, 10,-20,-21,-18,-14,-14, -1, 10,-20, -2,-17;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='P'; M=-12,-14,-31, -9,  3, -6,-21, -5,-17, -8,-18,-13,-13, 31, -7,-10, -9, -9,-21,-17, -4, -4; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='N'; M=-13,  5,-28,  5,  5,-16, -8, -2,-23,  1,-18,-13,  6,-13,  1,  1, -6,-10,-23,-16, -8,  3;
/M: SY='G'; M= -4, -6,-28, -6,-15,-22, 40, -9,-32,-14,-26,-17,  1,-19,-14,-14,  0,-13,-25,-18,-14,-15;
/M: SY='P'; M=-12,-14,-35,-10,  0,-21,-21, -7,-15, -4,-20,-12,-12, 40, -1, -6,-10,-10,-23,-22,-12, -5;
/M: SY='T'; M= -2,-11,-15,-16,-11, -8,-22,-20,  3,-13,  0, -2, -9,-16,-12,-13,  6, 20,  8,-28, -9,-12;
/M: SY='L'; M=  2,-23,-18,-26,-20,  5,-20,-17, 11,-21, 16,  7,-21,-24,-18,-19,-13, -6, 11,-15,  3,-20;
/M: SY='Y'; M=-10,  3,-22,  5, -3, -3,-17,  0,-18, -4,-16,-12,  0,-17, -6, -7,  2,  2,-13,-18,  8, -5;
/M: SY='F'; M=-17,-25,-20,-35,-26, 56,-27,-15,  4,-25, 13, 11,-17,-28,-30,-17,-20,-10,  1,  0, 20,-24;
/M:         M= -6,-12,-25,-16, -9, -9,-22,-13, -1, -1, -6, -1, -8,-12, -4, -4, -5, -1, -4,-19, -2, -8;
/M: SY='L'; M= -5,-19,-19,-18, -5, -5,-26,-18, 12,-16, 13,  7,-19,-21,-12,-16,-11, -5, 13,-27, -9, -9;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='H'; M= -6, -9,-17,-10, -7, -8,-17,  7, -9, -9, -2, -2, -3,-19, -4, -7, -2, -4, -8,-26, -3, -6; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='N'; M= -4, 11,-23,  6, -1,-24, 14, -4,-25, -3,-25,-15, 18,-15,  0, -4,  6, -6,-24,-29,-20, -1; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-29;
/M: SY='V'; M= -8,-29,-19,-32,-27, 12,-31,-21, 26,-23, 18, 14,-26,-28,-24,-20,-18, -6, 27,-17,  6,-26;
/M: SY='S'; M= -2, -5,-18, -7, -2,-17,-17, -3,-11,  2,-16, -7, -2,-15, -3, -1,  5,  5, -2,-30,-10, -3;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='L'; M= -8,-11,-19,-14, -9, -4,-22,-13,  0, -8, 12,  8,-11,-19, -8, -6,-11,  1, -1,-23, -5, -9; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='R'; M= -3, -7,-21,-10, -5,-16,-12, -4, -9, -1,-11, -1, -2, -4,  2,  4, -3, -4, -9,-22,-11, -4; D=-5;
/I:         I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='R'; M=-14, -6,-25, -6, -1, -6,-19, 12,-21, 10,-16, -7, -2,-17,  2, 18, -7, -9,-17,-13,  8, -1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='D'; M=-13, 20,-29, 30, 30,-33,-17,  0,-31, 14,-25,-19,  6, -7, 10,  3, -3,-10,-25,-31,-16, 20;
/M: SY='I'; M= -5,-23,-22,-28,-21, -1,-27,-19, 22,-21, 14, 14,-18,-22,-15,-18,-11, -4, 16,-22, -1,-20;
/M:         M= -5, -9,-18,-11, -9,-16,-17,-16, -5, -3, -9, -4, -6,-10, -8, -6, -6, -6, -3,-27,-13,-10;
/M: SY='N'; M= -7,  4,-23,  3, -4,-14, -6, -8,-18, -4,-18,-12,  6,-17, -5, -3,  2, -4,-14,-22,-11, -4;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='S'; M= -3,  0, -9, -1, -1,-16,-12, -3,-18, -6,-16,-11,  1,-15, -5, -6,  5,  1,-12,-29,-12, -3; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='G'; M= -7,-15,-23,-17,-15,  0, 11,-13,-14,-15, -6, -5, -8,-20,-14,-13, -8,-12,-13,-13, -5,-14; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='R'; M= -8,  3,-22, -2,  1,-16,-14, -4,-17, 10,-18,-10,  9,-10,  1, 11,  1,  0,-15,-25,-11,  0; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='R'; M= -5, -3,-12, -7, -3,-15,-15, -1,-14,  1,-14, -3, -1,-12,  2,  3, -2, -4,-13,-21, -5, -2; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='T'; M= -3, -6,-20, -7, -4,-14,-14, -9, -7,-12, -7, -6, -3,  1, -5,-12,  1,  3, -9,-27,-13, -6; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='K'; M= -8, -3,-23, -3,  5,-18,-17,-10,-16, 14,-16, -7, -3, -8,  1, 10, -4, -2,-10,-22,-11,  2; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M:         M= -1, -9,-17,-12, -9,-12, -5, -4, -9, -8, -9,  0, -6,-16, -4, -8, -5, -9, -8,-20, -8, -8; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='H'; M= -7, -6,-20, -7, -5,-10,-12,  3, -9, -9,-10, -4, -3,-10, -5, -9, -1, -1, -7,-21, -3, -7; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='D'; M= -4,  3,-15,  4,  4,-12, -9, -3,-11,  1, -9, -8,  2, -5, -1,  3, -2, -4, -9,-16, -7,  1; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M: SY='P'; M= -9,-17,-37, -8,  2,-30,-16,-18,-22, -7,-30,-20,-16, 74, -8,-17, -7, -9,-29,-30,-28, -7;
/M: SY='M'; M= -6,-14,-12,-17, -8, -6,-23,  1,  1,-16,  6,  7,-12,-21, -9,-14,-12, -9,  0,-26, -4, -9;
/M: SY='L'; M= -7,-29,-18,-30,-24,  7,-31,-24, 24,-24, 29, 15,-28,-29,-23,-17,-21, -7, 24,-22, -3,-24;
/M: SY='I'; M= -6,-24,-10,-30,-25, -1,-31,-26, 23,-22,  8,  8,-19,-23,-21,-20,-10, -2, 22,-26, -6,-25;
/M: SY='F'; M=-11,-24,-20,-31,-22, 31,-27,-19,  7,-20, 16,  9,-20,-25,-24,-15,-18, -6,  6, -9,  9,-21;
/M: SY='N'; M= -7, 18,-23, 12,  5,-23, -7,  0,-19,  0,-23,-15, 24,-15,  4, -2,  5, -2,-21,-33,-16,  4;
/M: SY='N'; M= -2,  9,-23,  4, -5,-24, 17, -7,-25, -7,-25,-17, 19,-14, -5, -9,  7, -5,-24,-31,-22, -5;
/M: SY='F'; M= -6,-14,-16,-19,-13, 20,-20,-15,-10,-13, -3, -7, -9,-15,-19, -9,-10, -8, -9,-13,  1,-15;
/I:         I=-2; MD=-13;
/M: SY='S'; M= -2, -1,-20, -3, -1,-11, -6,-12,-18, -5,-17,-13,  1, -9, -6, -6,  6,  4,-12,-24,-12, -3; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-13;
/M: SY='T'; M= -7, -7,-12,-10, -8,  3,-15,-12,-12,-14, -9, -9, -6,-13,-13,-13,  1,  8, -7,-16, -4,-10; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-13;
/M: SY='R'; M= -6,  5,-24,  8,  6,-24, -3, -3,-26,  8,-22,-14,  4, -6,  3,  9,  0, -7,-20,-24,-15,  3; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-13;
/M: SY='L'; M= -4, -6,-18, -6, -8,-10,-11,-12, -4,-10,  3,  0, -7,-17, -8,-10, -6, -2, -2,-23, -9, -8; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-13;
/M: SY='G'; M= -3, -2,-22, -2, -7,-20, 10, -3,-20, -7,-17, -9,  0, -8, -6, -8, -2, -7,-16,-22,-15, -7; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-13;
/M: SY='H'; M= -7, -3,-23, -2,  6,-20,-13, 18,-18,  1,-15, -5,  0, -5,  7,  0, -3, -8,-17,-24, -5,  5; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-13;
/M:         M= -6, -4,-13, -2, -1, -5, -9,  0, -5, -7,  0, -2, -5,-10, -4, -6, -6, -4, -4, -7,  0, -3; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='R'; M=-10, -9,-25, -8, -1,-15,-21, -2,-13, -2, -3, -4, -7,-10, -1,  9, -9, -4,-12,-25, -9, -3;
/M: SY='I'; M= -9,-28,-21,-33,-27, 15,-28,-24, 24,-25, 18, 14,-23,-26,-24,-22,-18, -7, 21,-17,  2,-26;
/M: SY='K'; M=  4, -5,-22, -7, -4,-23, -3,-14,-19,  6,-17, -9, -4,-14, -1,  1,  0, -4,-10,-23,-15, -3;
/M: SY='E'; M= -5,  6,-20,  5,  9,-23,-14, -6,-23,  6,-22,-15,  8, -8,  5,  9,  6,  3,-19,-30,-16,  6;
/M: SY='L'; M= -4,-20,-20,-24,-20,  3,-22,-17, 13,-20, 18, 15,-20,-23,-17,-18,-15, -4, 11,-20, -1,-19;
/M: SY='F'; M=-15,-29,-20,-34,-25, 42,-30,-18, 11,-28, 26, 11,-24,-29,-28,-20,-24,-10,  7, -5, 17,-25;
/M: SY='Q'; M= -5,-12,-16,-14, -4,-14,-21,-12, -5, -3, -4,  1,-10,-18,  4, -4, -5, -3, -4,-23, -9,  0;
/M: SY='B'; M= -7, 12,-21, 11,  1,-21,-10,  7,-18, -7,-19,-13, 12,-16,  0, -9,  2, -6,-17,-31,-10,  0;
/M: SY='L'; M= -7,-20,-22,-24,-19,  9,-25,-16, 10,-22, 20, 11,-18,-24,-17,-18,-18, -6,  4,-11,  4,-18;
/M: SY='F'; M=-17,-25,-20,-33,-26, 57,-28,-18,  3,-26, 11,  6,-18,-27,-32,-19,-18, -7,  2,  1, 21,-25;
/I:         I=-3; MD=-14;
/M: SY='P'; M=-11, -9,-26, -7,  0,-24,-13, -6,-22, -2,-23,-14, -5, 28, -2,  1, -6, -8,-24,-27,-19, -5; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-14;
/M: SY='G'; M=  1,-10,-20,-11, -9,-16,  4, -8,-14,-11,-15, -8, -5, -9, -5,-10,  3, -4, -9,-22,-13, -8; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-14;
/M: SY='P'; M= -9, -5,-27, -2,  5,-19,-17,-11,-10, -5,-10, -9, -7, 16, -3, -8, -8, -7,-15,-24,-15, -1; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-14;
/M: SY='P'; M= -9, -3,-24, -4, -1,-11,-15, -6,-15,  1,-17,-10,  2, 11, -5, -4, -4, -4,-16,-23,-11, -4; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-14;
/M: SY='V'; M= -6, -8,-18, -8, -5,-12,-16,-10, -1, -5, -5, -2, -8, -8, -7, -7, -6, -4,  4,-23,-10, -7; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-14;
/M: SY='D'; M= -6,  6,-22,  9,  2,-14,-13,  3,-17, -5,-15,-11,  2, -4, -1, -7, -2, -7,-15,-22, -7,  0; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-14;
/M: SY='R'; M= -5, -2,-19, -4, -1,-16,-14, -8,-14,  4,-15, -9,  2, -3,  0,  8,  3,  6,-11,-23,-12, -2; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-14;
/M:         M= -4,-11,-18,-13,-10,-12, -4,-12, -4, -6, -5, -1, -8,-15, -7, -5, -5, -4,  0,-19, -9, -9; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-14;
/M: SY='R'; M= -8,  8,-17,  8,  5,-18, -8,  0,-19,  6,-18,-11, 10, -8,  6, 14,  4, -2,-16,-21,-11,  4; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-14;
/M: SY='L'; M= -3, -9,-11,-10, -5, -4,-12, -8,  2, -4,  7,  3, -8,-11, -3, -4, -6, -3,  1,-12, -3, -4; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='R'; M=-14, -5,-25, -6,  2,-17,-18, 17,-22, 10,-16, -6,  1,-16, 12, 27, -4, -5,-19,-18,  2,  4; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-14;
/M: SY='V'; M=  1,-23, -2,-26,-24, -7,-23,-21, 13,-17,  4,  6,-22,-26,-22,-18,-10, -5, 25,-29,-11,-24;
/M: SY='I'; M= -5,-26,-16,-31,-24, 11,-29,-20, 20,-24, 20, 13,-23,-26,-21,-21,-18, -7, 17,-16,  5,-24;
/M: SY='T'; M= -2, -4,-16,-10, -9,-12,-10,-11, -5,-13, -7, -5,  1,-17,-10,-12,  7, 12,  0,-30,-12,-10;
/M: SY='F'; M=-14,-29,-16,-36,-28, 40,-31,-21, 14,-27, 16,  8,-22,-28,-30,-21,-20, -9, 12, -6, 15,-28;
/M: SY='S'; M=  1,  5,-17,  2, -2,-19,-10,  7,-18, -7,-19,-12,  8,-14, -2, -7, 14, 10,-12,-33,-10, -3;
/M: SY='N'; M= -2,  5,-19, -2, -2,-11,-15, -4, -6, -6,-11, -8,  9,-18, -6, -9, -3, -5, -9,-23, -3, -5;
/M: SY='Q'; M= -4,  5,-22,  3,  1,-23,-12, -4,-14, -3,-14, -8,  5,-15,  8, -3,  2,  0,-13,-28,-13,  4;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='D'; M=-10,  6,-19, 10,  7,-22, -9, -2,-25,  0,-22,-17,  5, -8,  0,  4,  2, -5,-20,-29,-13,  2; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='D'; M= -2,  6,-13,  8,  6,-13, -4, -4,-10, -3,-10, -9,  3, -2, -1, -6,  1, -3, -8,-16,-10,  2; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='D'; M=-15, 26,-29, 37, 12,-33, -8, -1,-32,  0,-26,-20, 10, -4,  1, -5, -1, -7,-26,-34,-18,  6;
/M: SY='Y'; M= -8, -9,-23,-11, -5, -1,-21, -4, -6, -2, -7, -4, -6,-20, -7, -5, -8, -6, -5,-12,  7, -7;
/M: SY='I'; M= -7,-29,-22,-34,-28,  2,-33,-28, 33,-26, 19, 14,-25,-25,-23,-24,-18, -5, 29,-16, -2,-27;
/M: SY='F'; M= -5,-11,-23,-12, -5,  3,-18, -9,-10,-14, -6, -8,-10,-19, -9,-13, -4, -5, -9, -3,  2, -6;
/M: SY='F'; M=-12,-24,-19,-32,-25, 38,-26,-17,  8,-22, 11, 10,-17,-27,-26,-15,-17, -8,  8, -7, 12,-23;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='R'; M=-19,-10,-29,-10, -1,-18,-20,  0,-28, 28,-19,-10, -1,-20,  8, 62, -9, -8,-19,-18, -6, -1;
/M: SY='H'; M=-12,  1,-24, -2, -4,-17,-14, 34,-20, -5,-16, -6,  7,-18,  1,  0, -2, -4,-16,-29,  0, -4;
/M: SY='Y'; M=-16,-11,-23,-11,-11,  3,-25, 27,-11,-10,-10, -3, -9,-15, -7, -9,-13,-10,-13, -8, 28,-13;
/M: SY='R'; M= -5, -9,-23,-10,  1,-16,-19, -4,-15, 10,-15, -6, -5,-16,  4, 16, -3, -5, -8,-21, -7,  1;
/M: SY='Y'; M=-11,-23,-26,-25,-19,  8,-27,-11, 15,-19, 10,  6,-20,-21,-16,-18,-16, -7,  8, -7, 19,-21;
/M:         M= -6, -7,-22, -9, -6,-12,-21,-11, -2, -1, -3,  0, -6,-19, -5, -2, -7, -3,  0,-24, -6, -6;
/M: SY='F'; M= -5,-18,-20,-21,-16,  9,-24,-15,  3,-11,  4,  2,-15,-22,-17,-10,-11, -5,  7,-16,  2,-16;
/M: SY='K'; M= -6,-11,-17,-12, -5,-16,-16,-15,-14,  5,-15, -9, -9,-14, -6,  5, -5, -2, -5,-17, -9, -6;
/M: SY='K'; M= -8,  5,-26,  4,  7,-22,-15, -5,-20, 10,-21,-13,  5, -6,  1,  3, -1, -2,-16,-26,-11,  3;
/M: SY='S'; M= -4, -5,-20, -5,  1,-14,-11, -9,-12, -5,-12, -6, -2,-14, -3, -7,  3, -1, -7,-28,-13, -1;
/M: SY='G'; M= -6, -3,-28, -3,  1,-19, 15,-10,-27, -7,-20,-15,  0,-16, -5, -8, -4,-13,-24,-14,-13, -2;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='L'; M= -6,-13,-16,-14, -7, -6,-21,-11, -4, -7,  2, -1, -9,-18, -4, -3, -7, -3, -4,-21, -5, -6; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M:         M= -5, -8,-20, -9, -3,-11,-15,-11, -7,  0, -8, -2, -6,-11, -5,  0, -4, -4, -3,-22, -9, -5; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='R'; M= -7, -3,-22, -3, -1,-15, -6,-11,-17,  1,-14,-10, -3,-12, -4,  4, -2, -2,-11,-21,-12, -3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M:         M= -2,-11,-20,-12, -9, -9,-15,-12, -2, -8, -3, -3,-10, -2, -9, -9, -7, -4, -3,-17, -5,-11; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='R'; M= -6, -5,-15, -5,  0,-10,-12, -6, -8,  3, -4, -2, -5,-12, -1, 10, -5, -3, -3,-16, -8, -2; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='K'; M= -6, -6,-15, -7, -4, -9, -9, -8, -3,  2, -2,  2, -6,-11, -2,  1, -8, -6, -2,-13, -5, -4; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-3; IM=0; DM=-3;
/M: SY='Q'; M= -2, -5,-20, -7,  1,-18,-20, -3, -8, -3, -9, -2, -6,-14,  5, -3,  0,  4, -4,-26,-10,  2;
/M: SY='E'; M= -9,  4,-30, 13, 47,-28,-20, -4,-26,  7,-18,-18, -4,  7, 14, -2, -2,-10,-27,-29,-20, 30;
/M: SY='I'; M= -2,-25,-17,-31,-24, -1,-28,-23, 27,-22, 17, 19,-22,-23,-19,-21,-14, -4, 25,-24, -5,-23;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-29,-11,-20,-27, 62,-20,-36,-20,-26,-18, -1,-20,-20,-20,  0,-16,-27,-20,-28,-20;
/M: SY='P'; M=-11,-20,-38,-12, -2,-21,-21,-20,-19, -9,-27,-18,-19, 75,-12,-18,-11,-10,-27,-26,-24,-11;
/M: SY='R'; M=-13, -7,-26, -8, -1,-19,-17, -3,-22, 18,-15, -6,  1,-18,  8, 39, -4, -5,-16,-24,-11,  1;
/M: SY='F'; M=-12,-28,-22,-35,-25, 31,-30,-20, 18,-27, 24, 17,-23,-26,-24,-21,-22,-10, 10, -9, 10,-24;
/M: SY='T'; M= -8,  7,-16,  8,  4,-20,-17,-10,-19,  0,-15,-14,  3,-14, -3,  1,  5, 11,-10,-32,-14,  0;
/M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-33,-24, 20,-30,-19, 21,-27, 32, 21,-26,-27,-22,-20,-24, -9, 13,-15,  5,-22;
/M: SY='K'; M= -8, -3,-25, -4,  6,-22,-16, -7,-19, 16,-16, -7,  0,-15,  7, 15, -5, -6,-14,-24,-12,  6;
/M: SY='L'; M= -9,-20,-24,-21,-15, -4,-27,-19, 13,-15, 17, 12,-19,-14,-13,-14,-18, -8,  7,-23, -6,-15;
/M: SY='I'; M=-12,-21,-27,-24,-18,  2,-24,-13,  5, -7, -2,  5,-15,-19,-11,  1,-14, -9,  3, -7,  5,-17;
/M: SY='R'; M=-10, -9,-27,-10,  1,-20,-20, -7,-17, 18,-15, -4, -4,-15,  7, 27, -7, -7,-13,-18, -9,  2;
/M: SY='I'; M= -8,-22,-22,-26,-19, -2,-30,-21, 22,-18, 17, 13,-18,-23,-16,-15,-16, -4, 17,-24, -5,-19;
/M: SY='E'; M=-11, -4,-27, -4, 13,-15,-17,  3,-21,  6,-15, -6, -3,-13, 13,  7, -4, -8,-20,-21, -7, 13;
/M: SY='E'; M= -5, -4,-24, -2,  7,-16,-17,-10,-11, -6, -2, -6, -7,-11, -3, -7, -6, -6,-10,-27,-13,  1;
/M: SY='G'; M=  6,-10,-27,-11,-14,-28, 41,-18,-32,-12,-26,-18, -3, -9,-14,-13,  2,-14,-24,-22,-26,-15;
/M: SY='T'; M= -4, -6,-18, -9, -7, -9,-18,-15, -4,-10, -7, -6, -2,-16, -8, -6,  7, 12, -1,-29,-10, -8;
/M: SY='F'; M=-10,-10,-19, -8, -9,  2,-15,-15,-12,-13, -1, -7,-11,-18,-15,-10,-11, -9, -9,-17, -5,-12;
/M: SY='D'; M= -8, 13,-28, 21, 18,-28, -2, -7,-31, -1,-24,-22,  4,-10,  2, -6,  2, -7,-25,-22,-18, 10;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 69 in 69 different sequences
Number of true positive hits 69 in 69 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Archaea, Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Brix
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
69 sequences

BRIX_AERPE  (Q9YC08), BRIX_ARCFU  (O29159), BRIX_METAC  (Q8TQ11), 
BRIX_METBF  (Q467K0), BRIX_METBU  (Q12ZB3), BRIX_METJA  (Q58012), 
BRIX_METKA  (Q8TYC5), BRIX_METMA  (Q8PTT5), BRIX_METMP  (Q6M0M3), 
BRIX_METTH  (O26776), BRIX_PYRAB  (Q9V200), BRIX_PYRAE  (Q8ZVN2), 
BRIX_PYRFU  (Q8TZI2), BRIX_PYRHO  (O74104), BRIX_SULSO  (Q9UXB9), 
BRIX_SULTO  (Q975H1), BRIX_THEKO  (Q5JDM5), BRX1_BOVIN  (Q3SZZ0), 
BRX1_CAEEL  (P34524), BRX1_DICDI  (Q54JN0), BRX1_DROME  (Q9VZE6), 
BRX1_HUMAN  (Q8TDN6), BRX1_MOUSE  (Q9DCA5), BRX1_PONAB  (Q5RAN2), 
BRX1_RAT    (Q4QQT6), BRX1_SCHPO  (Q9HGL6), BRX1_XENLA  (Q8UVY2), 
BRX1_YEAST  (Q08235), IMP4_ASHGO  (Q755T8), IMP4_BOVIN  (Q0VD01), 
IMP4_CANGA  (Q6FNN7), IMP4_DEBHA  (Q6BYD9), IMP4_HUMAN  (Q96G21), 
IMP4_MOUSE  (Q8VHZ7), IMP4_PONAB  (Q5R947), IMP4_RAT    (Q5PQR5), 
IMP4_SCHPO  (O13823), IMP4_YARLI  (Q6C804), IMP4_YEAST  (P53941), 
PPAN_ARATH  (Q9ASU7), PPAN_DICDI  (Q54N44), PPAN_DROME  (Q9VDE5), 
RPF1_DANRE  (Q6IQU6), RPF1_DROME  (Q9VKB4), RPF1_HUMAN  (Q9H9Y2), 
RPF1_MOUSE  (Q7TND5), RPF1_PONAB  (Q5R631), RPF1_RAT    (Q5RJS9), 
RPF1_XENLA  (Q8AVP1), RPF1_YEAST  (P38805), RPF2_ARATH  (Q9LUG5), 
RPF2_BOVIN  (Q2YDN6), RPF2_CAEEL  (Q9N3F0), RPF2_DICDI  (Q54DJ0), 
RPF2_DROME  (Q9VEB3), RPF2_HUMAN  (Q9H7B2), RPF2_MOUSE  (Q9JJ80), 
RPF2_ORYSJ  (Q9AWM9), RPF2_SCHPO  (Q9UUG1), RPF2_YEAST  (P36160), 
SSF1_HUMAN  (Q9NQ55), SSF1_MOUSE  (Q91YU8), SSF1_PONAB  (Q5REM3), 
SSF1_YEAST  (P38789), SSF2_YEAST  (Q12153), YDD3_SCHPO  (O14206), 
YDS4_SCHPO  (O14180), YHPK_CAEEL  (O62518), YUY1_CAEEL  (P54073)
» More

PDB
[Detailed view]
2 PDB

1W94; 2CXH

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission