Entry: PS50841

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] DIX
Accession [info] PS50841
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2002 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAR-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50841
Associated ProRule [info] PRU00069

Name and characterization of the entry

Description [info] DIX domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=83;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=78;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1577; R2=0.01232826; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4532.08240; R2=20.80974; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=514; N_SCORE=8.5; H_SCORE=13543; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=352; N_SCORE=6.5; H_SCORE=11857; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='C'; M= -2,-17, 54,-22,-22,-15,-22,-25,-12,-22,-15,-12,-15,-30,-22,-22,  3,  0,  5,-42,-22,-22;
/M: SY='D'; M=-10, 23,-25, 31,  3,-30,  8,-10,-33, -7,-25,-23, 10,-13, -7,-13,  5,  2,-23,-33,-20, -2;
/M: SY='E'; M= -5,  5,-25, 10, 33,-27,-15, -5,-27, 15,-25,-18,  3, -5, 13,  5,  8, -2,-23,-30,-18, 23;
/M: SY='T'; M= -3,-15,-15,-22,-20, -5,-27,-25, 15,-17,  2,  2,-12,-17,-17,-17,  3, 23, 20,-27, -7,-20;
/M: SY='K'; M= -7,-15,-23,-15, -7,-13,-25,-17, -3, 13, -1,  2,-15,-20, -7,  5,-15, -7,  5,-23, -8, -7;
/M: SY='V'; M= -7,-28,-20,-30,-28,  7,-33,-18, 28,-20, 10, 10,-25,-27,-23,-20,-15, -5, 30,-13, 14,-28;
/M: SY='V'; M=  5,-25,-17,-32,-25, 14,-25,-25, 18,-22,  7,  5,-20,-22,-25,-23,-10, -5, 20,-15,  0,-25;
/M: SY='Y'; M=-15,-15,-25,-18,-18, 20,-28, 10, -2,-10, -2, -2,-15,-25,-10,-10,-10,  4, -8, 16, 58,-18;
/M: SY='Y'; M=-20,  2,-30,  7, -5,  1,-23, 35,-17, -8,-12, -7, -3,-23, -3, -7,-13,-13,-20, -2, 41, -8;
/M: SY='L'; M=-15,-25,-22,-28,-18, 21,-28,-15,  3,-16, 23,  8,-20,-28,-18,  2,-23,-10,  0,-12,  5,-18;
/M: SY='C'; M= -5,  5, 13,  7, -8,-28,  8,-15,-33,-15,-27,-23,  2,-20,-13,-18,  7, -5,-20,-37,-25,-10;
/M: SY='D'; M=-10,  6,-28, 13, 10,-23,  3,-10,-23,-10, -8,-13, -2,-15, -5,-12, -7,-13,-20,-28,-18,  3;
/M: SY='E'; M= -8,  8,-25, 13, 43,-25,-20, -5,-25,  5,-18,-18,  0, -2, 13, -2,  5,  4,-23,-30,-18, 28;
/M: SY='P'; M=-10, -7,-35,  0, 20,-33,-20, -7,-23,  0,-25,-15,-10, 42, 15, -7, -5,-10,-30,-27,-22, 15;
/M: SY='T'; M= -7,-15,-17,-25,-20, 14,-27,-23,  8,-20,  2,  0,-10,-17,-20,-17,  0, 20,  8,-18,  2,-20;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-35,-15, -5,-23,-20,-15,-10,-10,-18, -1,-20, 64, -8,-18,-12,-10,-20,-28,-23,-10;
/M: SY='Y'; M=-15,-22,-25,-22,-22, 23,-30,  8,  7,-12,  2,  2,-22,-30,-15,-12,-18, -8,  4, 16, 58,-22;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='R'; M=-10, -1,-22, -5, -5,-17,-18, -8,-12, 15,-17, -7,  7,-20, -3, 20, -5, -5, -4,-27,-12, -5;
/M: SY='I'; M= -2,-15,-20,-22,-17, -8,-25,-22, 17,-20,  0,  2, -7,-15,-12,-20,  5, 13, 12,-28, -8,-17;
/M: SY='P'; M=-10,-17,-32,-12, -2,-20,-23,-17,-12,  0,-10, -7,-17, 34, -7, -7,-15,-10,-17,-25,-17, -7;
/M: SY='V'; M= -5,-23,-20,-25,-20, -7,-30,-25, 21, -6,  3,  8,-20,-23,-18,-11,-13, -5, 28,-25, -7,-20;
/M: SY='R'; M=-15,  0,-30, -2,  0,-23,-15, -2,-25, 12,-25,-15, 10,  8,  2, 29, -5, -7,-25,-28,-18, -3;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='A'; M=  8,-17,-25,-17,-12,-18,  5,-20,-13,-17, -6, -8,-15,  8,-15,-20, -7,-10,-13,-23,-20,-15;
/M: SY='E'; M=-15, 15,-30, 25, 35,-30,-17,  0,-33, 12,-23,-20,  5, -8, 12, 15, -3,-10,-27,-30,-17, 22;
/M: SY='E'; M=  8, -3,-20, -3, 12,-22,-10, -8,-22,  5,-20,-15,  0,-10,  5, 10, 10,  0,-15,-28,-17,  7;
/M: SY='I'; M= -5,-30,-20,-35,-30,  0,-35,-30, 40,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 40,-25, -5,-30;
/M: SY='T'; M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='G'; M= -2, -8,-30, -8,-13,-30, 48,-18,-38, -3,-30,-18,  0,-18,-13, -8, -2,-18,-28,-20,-25,-13;
/M: SY='D'; M=-17, 37,-30, 52, 20,-40,-13,  3,-35,  3,-27,-22, 15,-10, 15, -5,  0,-10,-30,-35,-17, 18;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='A'; M= 25, -2,-15, -5, 10,-23, -5,-12,-18, -5,-18,-15, -2, -7,  0,-12, 15,  2,-10,-28,-20,  5;
/M: SY='A'; M= 22,-20,-13,-25,-18, -7,-15,-23,  8,-18, 10,  3,-20,-20,-18,-20, -5, -3, 15,-23,-12,-18;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,  5,-35,-25, 35,-30, 35, 20,-25,-25,-20,-25,-25,-10, 20,-20,  0,-25;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='D'; M= -7, 12,-17, 14,  7,-22,-12, -3,-17,  0,-15,-10,  5, -7, 13, -2,  5,  8,-15,-22,-10, 10; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5,  5,-25,-20, -5,-30, 40,-25,-10,  0,-15, 10, 50,-10,-10,-20,-20,-10,  5;
/M: SY='K'; M=-10, -3,-33,  2, 19,-30,-20,-10,-27, 25,-28,-15, -5, 18,  7, 10, -8,-10,-25,-25,-17, 12;
/M: SY='G'; M= 10,-15,-25,-20,-20,-20, 24,-23, -9,-20,-12, -7, -8,-17,-17,-23, -3,-12, -7,-20,-20,-20;
/M: SY='N'; M= -2, 17,-20,  7, -5,-23, 18, -3,-25, -8,-30,-20, 32,-17, -5, -8, 15,  0,-25,-35,-23, -5;
/M: SY='Y'; M= -2,-13,-25,-15,-13,  5,-20, 29,-10,-10, -7, -3,-10,-23, -5,-10,-10,-10,-12,  3, 41,-13;
/M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5,  5,-25,-20, -5,-30, 40,-25,-10,  0,-15, 10, 50,-10,-10,-20,-20,-10,  5;
/M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-25,-23, 43,-30, 10,  0,-15,  3,  0,-20,-30,-18,-13,-20,-10, -7, 25, 67,-23;
/M: SY='F'; M=-20,-20,-25,-25,-20, 43,-28, 19, -7,-20,  0,  0,-13,-28,-20,-13,-18,-12,-10,  5, 40,-20;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='A'; M= 12, -2,-12, -5,  0,-17, -5,-10,-15,  8,-18,-10,  0, -7,  0,  0, 10,  2, -8,-20,-12,  0; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='M'; M= -5,-20,-12,-22,-17,  2,-20,-12, 17,-15, 20, 22,-20,-20,-12,-12,-15, -5, 18,-17, -3,-15; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='D'; M= -5, 25,-20, 34, 10,-30, -5, -5,-30, -5,-30,-25, 15,-10,  0,-10, 20,  5,-20,-40,-20,  5;
/M: SY='P'; M=-10,  8,-27, 13,  8,-30,-17, -7,-22, -2,-22,-15,  0, 14, 10, -7,  3,  5,-22,-30,-17,  8;
/M: SY='D'; M=-15, 30,-30, 45, 40,-35,-15,  0,-35,  5,-25,-25, 10, -5, 10, -5,  0,-10,-30,-35,-20, 25;
/M: SY='F'; M= -2,-25,-17,-35,-25, 54,-22,-20, -3,-25,  5, -3,-17,-25,-32,-20,-12, -7,  0,  2, 17,-25;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='D'; M=-10, 25,-15, 36, 10,-20, -5,  0,-20,  0,-15,-15, 10, -5,  0, -5,  0, -5,-15,-20,-10,  5; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='C'; M= -8,-13, 25,-18,-15, 15,-15,-13, -8,-15, -2, -5,-10,-18,-18,-13, -8, -5, -3,-10,  0,-15; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='V'; M=  0,-23,-10,-25,-25, -2,-28,-28, 20,-18,  5,  5,-23,-25,-25,-18, -3, 12, 38,-30,-10,-25;
/M: SY='V'; M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='K'; M=-13, -8,-27,-10,  0, -2,-23,-13,-22, 30,-20, -7, -5,-15, -3, 17,-13,-10,-15,-12,  0,  0;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='I'; M= -5,-30,-20,-35,-30,  0,-35,-30, 40,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 40,-25, -5,-30;
/M: SY='T'; M= -7,-10,-17,-15,-10,  7,-17,-12,-15, -5,-13,-10, -2,-17,-10,  8,  8, 13, -8,-20, -3,-10;
/M: SY='D'; M=-15, 25,-27, 28, 20,-28,-12, 27,-30,  0,-25,-18, 23,-12,  7, -3,  0,-10,-30,-35,-10, 13;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='D'; M=-12, 25,-27, 27, 23,-30,-13,  0,-30, 15,-27,-20, 20,-10,  8,  5,  0, -7,-27,-32,-17, 15;
/M: SY='A'; M= 23,  7,-15,  7,  0,-25, -2,-13,-20, -8,-20,-17,  2,-10, -5,-15, 15,  3,-10,-30,-20, -3;
/M: SY='I'; M=  2,-20,-25,-28,-18,-10,-25,-20, 16,-10,  3,  5,-13,-18,-10, -2,-10, -8, 10,-20, -7,-18;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,  8,-32,-22, 27,-30, 43, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 15,-20,  0,-22;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='C'; M= -5,-23, 15,-25,-25,-10, -6,-25, -4,-25,  3, -2,-20,-30,-25,-23,-13,-10,  6,-30,-17,-25;
/M: SY='F'; M=-17,-30,  9,-37,-30, 38,-28,-25,-12,-28, -5,-10,-25,-33,-33,-23,-22,-15,-10, 28, 15,-28;
/M: SY='E'; M=-13, 28,-27, 33, 35,-30,-12,  3,-30,  5,-25,-23, 20, -8, 10, -3,  3, -7,-30,-35,-20, 22;
/M: SY='G'; M= -5,  8,-27,  5,  5,-27, 29, -7,-32, -7,-27,-20, 15,-15, -5,-10,  3,-12,-30,-28,-25,  0;
/M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5,  5,-25,-20, -5,-30, 40,-25,-10,  0,-15, 10, 50,-10,-10,-20,-20,-10,  5;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-25,-37,-30,  0,-37,-30, 45,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 35,-23, -3,-30;
/M: SY='V'; M= -3,-30,-15,-33,-30,  0,-33,-30, 35,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 45,-27, -7,-30;
/M: SY='A'; M= 27, -7,-15,-12,-10,-23, 18,-17,-20,-13,-20,-15, -2,-13,-10,-17, 15,  0,-10,-25,-23,-10;
/M: SY='W'; M=-17,-30,-45,-30,-20,  0,-20,-25,-23, -2,-23,-17,-30,-25,-12, -7,-32,-25,-27,107, 20,-12;
/M: SY='L'; M= -5,-30,-15,-30,-25,  5,-30,-25, 25,-25, 30, 15,-30,-30,-25,-20,-20, -5, 30,-25, -5,-25;
/M: SY='E'; M= -7, -3,-25,  2, 25,-22,-23,-10,-15, 13,-15,-10, -8,-10,  5,  3, -5, -7, -7,-27,-15, 15;
/M: SY='E'; M= 10,  0,-20,  0, 14,-25,-10,-10,-22, 10,-22,-15,  0, -8,  5,  0, 10,  0,-15,-27,-17, 10;
/M: SY='P'; M= -5, -1,-22,  7, -3,-22,-15,-15,-12,-10,-20,-15, -5, 11,-10,-15,  5,  0, -5,-35,-20, -8;
/M: SY='D'; M=-20, 38,-30, 53, 15,-35,-12, 24,-38, -2,-28,-23, 18,-12,  2, -8, -2,-12,-30,-38,-10,  8;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_04 which contains 544'996 sequence entries.


Total number of hits 34 in 34 different sequences
Number of true positive hits 34 in 34 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] DIX
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
34 sequences

AXIN1_CHICK (O42400), AXIN1_DANRE (P57094), AXIN1_HUMAN (O15169), 
AXIN1_MOUSE (O35625), AXIN1_RAT   (O70239), AXIN1_XENLA (Q9YGY0), 
AXIN2_DANRE (P57095), AXIN2_HUMAN (Q9Y2T1), AXIN2_MOUSE (O88566), 
AXIN2_RAT   (O70240), AXLP1_CAEBR (A8XFZ3), AXLP1_CAEEL (Q3LRZ3), 
AXNR_XENLA  (Q9PTP2), AXN_DROME   (Q9V407), DIX1A_DANRE (Q804T6), 
DIXC1_HUMAN (Q155Q3), DIXC1_MOUSE (Q80Y83), DIXC1_RAT   (Q2VUH7), 
DSH_DROME   (P51140), DVL1_HUMAN  (O14640), DVL1_MOUSE  (P51141), 
DVL1_PANTR  (Q5IS48), DVL1_RAT    (Q9WVB9), DVL2_HUMAN  (O14641), 
DVL2_MOUSE  (Q60838), DVL2_XENLA  (P51142), DVL2_XENTR  (Q05AS8), 
DVL3_HUMAN  (Q92997), DVL3_MOUSE  (Q61062), DVL3_XENLA  (Q6DKE2), 
DVL3_XENTR  (B1WAP7), DVLP1_HUMAN (P54792), PRY1_CAEBR  (A8XU52), 
PRY1_CAEEL  (O62090)
» More

PDB
[Detailed view]
4 PDB

1WSP; 2D5G; 3PZ7; 3PZ8

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission