Entry: PS50851

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] CHEW
Accession [info] PS50851
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JAN-2003 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); OCT-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50851
Associated ProRule [info] PRU00052

Name and characterization of the entry

Description [info] CheW-like domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=140;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=135;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0562; R2=0.02545486; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6866.91003; R2=36.48586; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=313; N_SCORE=10.0; H_SCORE=16828; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=174; N_SCORE=6.5; H_SCORE=13252; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M:         M= -3, -9,-23,-11, -4,-15,-15,-15,  0,-10, -5, -1, -8,-14, -5,-11, -2, -1,  0,-26,-12, -6;
/M: SY='L'; M= -7,-16,-20,-19,-12, -2,-23,-15,  4,-14,  9,  7,-16,-20, -8,-11,-13, -7,  2,-17, -4,-10;
/M: SY='Q'; M= -8,  4,-27,  7, 15,-29,-13,  0,-25,  8,-21,-12,  1, -7, 17,  7,  1, -5,-23,-27,-14, 15;
/M: SY='L'; M= -4,-22,-18,-25,-22,  6,-11,-16,  4,-21,  7,  4,-18,-25,-20,-18,-12, -7,  6,-14,  2,-21;
/M: SY='L'; M= -8,-29,-19,-31,-23,  7,-31,-22, 25,-26, 33, 18,-27,-28,-21,-21,-23, -8, 20,-21, -1,-22;
/M: SY='L'; M= -5,-16,-11,-19,-13, -5,-18,-17,  2,-17,  6,  2,-13,-22,-13,-15, -8, -1,  3,-23, -8,-14;
/M: SY='F'; M=-13,-29,-15,-36,-29, 45,-31,-23, 12,-27, 12,  6,-23,-29,-33,-21,-18, -8, 15, -6, 15,-29;
/M: SY='R'; M=-10, -4,-24, -4,  2,-18,-19, -4,-16,  9,-13, -5, -3,-14,  6, 16, -5, -4,-12,-23, -9,  2;
/M: SY='L'; M= -2,-25,-14,-28,-22,  1,-28,-23, 21,-24, 22, 12,-23,-25,-20,-20,-14, -2, 21,-25, -6,-22;
/M: SY='G'; M=  2,  1,-26,  1, -7,-28, 36,-13,-33,-13,-25,-19,  4,-15,-11,-15,  2,-13,-25,-24,-24, -9;
/M: SY='D'; M= -5, 11,-26, 16, 12,-29,  0, -8,-29,  3,-25,-19,  6, -8,  1, -4,  3, -6,-23,-30,-19,  6;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='E'; M= -8,  4,-27,  9, 25,-28,-17,  0,-23,  7,-18,-11, -1, -8, 17,  6, -1, -8,-21,-27,-15, 20;
/M: SY='T'; M= -7,-12,-21,-13, -5, -7,-21, -9, -6, -9,  0, -2,-11,-16, -7, -4, -6,  2, -3,-17, -4, -7;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='Y'; M=-16,-24,-23,-28,-22, 36,-29, -3,  3,-18,  9,  3,-21,-29,-21,-14,-20,-10, -2, 12, 43,-22;
/M: SY='A'; M= 25,-13,-11,-20,-16,-18,  8,-21,-11,-16, -8, -8,-11,-17,-15,-20,  3, -4, -1,-23,-20,-16;
/M: SY='I'; M= -7,-29,-21,-34,-27,  8,-32,-25, 31,-26, 22, 16,-24,-25,-23,-23,-18, -7, 26,-20, -1,-26;
/M: SY='P'; M= -9,  2,-31,  9,  6,-28,-13,-10,-23, -6,-27,-20,  0, 37, -4,-13,  0, -5,-26,-33,-24, -2;
/M: SY='I'; M= -1,-22,-18,-27,-21, -1,-26,-22, 21,-22, 17, 11,-18,-23,-18,-20,-12, -1, 18,-24, -6,-20;
/M: SY='A'; M=  1, -5,-20, -7, -5,-11,-10, -7, -9,-10, -7, -3, -3,-16, -6,-10,  0, -1, -7,-25,-10, -6;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='Q'; M= -2,  0,-15, -1,  3,-18,-10, -1,-15,  3,-15, -8,  1,-11,  4, -1,  1, -2,-12,-20, -7,  3; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='V'; M= -2,-22,-13,-25,-22,  1,-25,-23, 24,-18, 11,  9,-20,-21,-20,-18,-10,  0, 29,-21, -5,-22; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='R'; M= -6, -6,-19, -6,  3,-17,-11, -5,-14,  6,-12, -5, -4,-13,  4, 12, -4, -6, -9,-19,-10,  2; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='E'; M= -7,  8,-27, 15, 38,-27,-14,  0,-27,  5,-20,-16,  3, -5, 14, -1,  4, -7,-25,-30,-18, 25;
/M: SY='I'; M= -4,-28,-20,-33,-28,  0,-33,-28, 35,-24, 13, 13,-23,-24,-23,-24,-12, -3, 35,-25, -5,-28;
/M: SY='L'; M= -5,-20,-21,-23,-15, -2,-26,-16, 13,-16, 14,  9,-18,-23,-13,-11,-14, -6, 12,-22, -4,-15;
/M: SY='R'; M= -9, -1,-28,  1,  8,-25, -9, -3,-25,  8,-20,-12,  0, -7,  6, 12, -3, -7,-20,-25,-14,  5;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='I'; M= -5,-21,-22,-24,-17, -1,-22,-14,  6,-16,  2,  4,-19,-12,-14,-15,-12, -5,  4, -9,  3,-17;
/M: SY='P'; M= -5, -6,-24, -5,  1,-21,-16, -7,-13, -5,-15, -8, -5,  4,  3, -6, -1, -3,-14,-27,-15,  0;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='E'; M= -9,  1,-28,  3,  9,-25,-14, -5,-23,  5,-23,-14,  2,  6,  6,  6,  1, -3,-22,-28,-16,  6;
/M: SY='I'; M= -5,-23,-21,-26,-20, -1,-29,-23, 21,-21, 13,  9,-21,-17,-19,-20,-13, -4, 19,-23, -5,-21;
/M: SY='T'; M= -3,  3,-15,  0,  0,-18,-16, -9,-18, -2,-17,-13,  2, -8, -1, -4, 10, 18,-11,-29,-12, -1;
/M: SY='P'; M= -7,-13,-27,-10, -1,-19,-19, -9,-11, -2,-14, -8,-11, 11, -4,  0, -5, -6,-10,-26,-14, -5;
/M: SY='I'; M= -6,-18,-21,-21,-17, -3,-26,-16, 15,-18, 12,  9,-17,-23,-14,-16,-14, -6, 13,-23, -4,-17;
/M: SY='P'; M= -8,-11,-33, -5,  2,-25,-18,-12,-18, -7,-23,-16,-11, 48, -5,-13, -6, -8,-24,-28,-21, -5;
/M: SY='N'; M=-10, -2,-25, -5, -7,-16, -1,  0,-15, -8,-11, -7,  4,-20, -5, -6, -7,-10,-16,-23, -9, -7;
/M: SY='A'; M= 11, -8,-15,-13, -6,-16,-11,-14, -9, -5, -9, -4, -7,-13, -4, -9,  4,  4, -2,-25,-14, -5;
/M: SY='P'; M= -9, -8,-31, -2,  4,-26,-12,-10,-21, -3,-22,-15, -7, 28, -1, -5, -4, -7,-23,-29,-21, -2;
/M: SY='P'; M= -1, -2,-25, -1, -2,-22, -9,-10,-13, -9,-17,-12, -2,  4, -6,-13,  1, -4,-12,-29,-18, -6;
/M: SY='Y'; M=-10,-11,-25,-12, -6,  1,-14,  4,-16,-12,-12, -9,-10,-21, -7,-11,-11,-12,-17,  8, 14, -7;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='V'; M= -5,-19,-18,-21,-20, -2,-13,-17, 12,-18,  8,  7,-16,-22,-18,-17,-11, -6, 14,-19, -3,-20; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='L'; M= -4,-12,-17,-14, -5, -9,-20,-11, -1, -7,  5,  2,-11,-17, -5, -3,-10, -5, -2,-19, -7, -6; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='G'; M= -1, -7,-29, -6, -9,-28, 44,-16,-34,-14,-27,-19,  0, -8,-13,-16,  0,-15,-28,-23,-27,-11; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='V'; M= -2,-25,-16,-27,-23,  3,-27,-21, 19,-20, 13, 10,-22,-25,-21,-18,-11, -2, 26,-24, -5,-22;
/M: SY='I'; M= -7,-24,-20,-29,-23,  9,-28,-17, 19,-22, 15, 12,-20,-24,-18,-20,-15, -6, 14,-16,  6,-22;
/M: SY='N'; M= -7, 18,-21,  9,  0,-19, -8,  0,-17, -2,-21,-15, 26,-17, -1,  1,  5,  1,-19,-31,-14, -1;
/M: SY='L'; M= -9,-25,-19,-26,-21,  4,-27,-12, 11,-22, 17,  7,-23,-28,-17,-18,-20, -9,  8, -2,  8,-20;
/M: SY='R'; M=-17, -7,-29, -7,  2,-20,-19,  0,-28, 24,-20,-11,  2,-16, 10, 56, -8, -9,-21,-21,-10,  2;
/M: SY='G'; M= -1,  0,-28,  2, -9,-30, 48,-15,-37,-15,-28,-21,  4,-17,-14,-17,  2,-16,-28,-24,-27,-12;
/M: SY='E'; M= -6, -2,-25, -2, 10,-22,-13, -6,-19,  7,-16,-10,  0,-13,  7,  8, -1, -5,-16,-23,-13,  8;
/M: SY='I'; M= -6,-21,-17,-25,-19, -4,-27,-19, 15,-18,  9,  7,-18,-17,-15,-17,-12, -3, 14,-24, -5,-19;
/M: SY='I'; M= -8,-27,-20,-31,-25,  7,-31,-22, 26,-24, 23, 16,-24,-26,-21,-21,-18, -4, 22,-19,  2,-24;
/M: SY='P'; M= -7,-16,-35,-10, -3,-25,-15,-19,-19,-10,-26,-18,-15, 57,-10,-18, -6, -6,-25,-19,-23,-10;
/M: SY='V'; M= -4,-28,-14,-31,-25,  5,-30,-25, 24,-25, 23, 12,-25,-28,-24,-22,-18, -6, 26,-23, -4,-25;
/M: SY='I'; M= -5,-28,-20,-32,-26,  4,-31,-24, 29,-23, 17, 14,-23,-25,-22,-21,-16, -6, 28,-21, -2,-26;
/M: SY='D'; M=-13, 27,-23, 35, 10,-29,-11, -2,-30,  0,-26,-22, 15, -9,  0, -3,  4, -4,-24,-34,-16,  4;
/M: SY='L'; M= -8,-27,-19,-30,-21, 11,-28,-20, 18,-26, 34, 17,-25,-26,-20,-19,-22, -6, 12,-19,  0,-21;
/M: SY='R'; M=  0, -5,-23, -6, -1,-22, -3, -4,-25,  7,-21,-13,  0,-13,  1, 14,  0, -7,-18,-22,-14, -2;
/M: SY='R'; M= -4, -5,-25, -5,  5,-18,-15, -8,-17,  6,-11, -8, -4,-12,  2,  7, -5, -7,-14,-23,-11,  3;
/M: SY='L'; M= -9,-22,-25,-24,-15,  5,-22,-16, -2,-10,  8,  3,-19,-22,-13, -2,-18, -9, -2,  0,  1,-14;
/M: SY='L'; M=-11,-28,-20,-31,-22, 26,-28,-20, 13,-27, 27, 11,-24,-28,-23,-19,-21, -8,  8,-10,  8,-22;
/M: SY='G'; M= -4,  1,-24, -1, -7,-23, 23, -5,-28, -9,-23,-14,  7,-16, -7, -8,  1,-11,-23,-25,-19, -7;
/M: SY='L'; M= -9,-20,-23,-22,-13,  1,-20,-15,  6,-16, 12,  9,-18,-19,-13,-13,-17, -9,  2,-16, -1,-14;
/M: SY='P'; M= -5, -1,-27,  1,  3,-25, -7, -9,-21,  0,-21,-14, -1,  7, -1, -3, -1, -5,-18,-28,-18, -1;
/M: SY='E'; M= -1, -4,-23, -3,  7,-21, -8,-10,-22, -1,-20,-14, -2,  2,  1,  0,  3, -3,-18,-27,-18,  3;
/M: SY='E'; M= -1, -4,-23, -4,  1,-19,-11,-11,-14, -5,-14, -9, -3, -5, -1, -7,  1,  0,-12,-24,-12, -1;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='E'; M= -4,  1,-25,  4, 12,-24,-12, -6,-20,  3,-20,-14,  0, -3,  4,  0,  3, -4,-16,-29,-17,  7;
/M: SY='E'; M= -6, -2,-25,  0,  2,-19,-14, -8,-15, -2,-15,-10, -2, -2, -2, -2, -1, -4,-13,-27,-13, -2;
/M: SY='N'; M= -4,  2,-20,  0, -3,-18, -8, -8,-15, -6,-13,-10,  3,-14, -3, -5,  2,  2,-13,-27,-12, -4;
/M: SY='E'; M= -8,  2,-25,  5,  6,-20,-12, -7,-19,  0,-16,-12,  0, -7, -1, -1, -1, -4,-15,-27,-13,  1;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='E'; M= -9,  5,-25,  7, 13,-23,-12,  2,-25,  8,-21,-13,  5,-11, 10, 11,  1, -5,-21,-24,-11, 10; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='T'; M= -2,  1,-19, -1, -2,-18, -5, -6,-18, -3,-15,-10,  2,-10,  1, -3,  6,  7,-13,-24,-11, -1; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='R'; M=-10,-13,-23,-14, -8, -8,-17, -8, -9,  2, -9, -3, -9, -7, -5,  9, -9, -7, -7,-15, -4, -9; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='V'; M=  2,-24,-17,-29,-24, -1,-25,-23, 23,-21, 13, 11,-21,-24,-20,-20,-12, -4, 25,-22, -5,-23;
/M: SY='I'; M= -7,-29,-19,-33,-27,  4,-33,-25, 32,-26, 23, 16,-26,-26,-23,-23,-19, -7, 29,-22, -1,-27;
/M: SY='V'; M= -4,-29,-17,-32,-28,  1,-31,-28, 32,-24, 16, 14,-27,-27,-26,-22,-15, -4, 38,-25, -6,-28;
/M: SY='V'; M= -3,-25, -8,-28,-25, -1,-26,-25, 19,-22, 13,  9,-23,-26,-23,-20,-11,  0, 26,-27, -8,-24;
/M: SY='E'; M= -9,  7,-26,  9, 15,-25,-11,  0,-26,  9,-22,-14,  7,-12,  8, 11,  0, -6,-22,-27,-15, 11;
/M: SY='V'; M= -3,-12,-17,-14,-12, -4,-15,-10, -4,-12, -4, -4, -9,-20,-12,-12, -3, -2,  1,-22, -3,-13;
/M: SY='E'; M= -3,  1,-26,  1,  4,-25,  4, -6,-24, -3,-20,-13,  4, -8,  1, -3,  1, -8,-21,-27,-19,  2;
/M: SY='D'; M= -8, 11,-25, 12,  4,-24,  1, -4,-26,  0,-22,-17, 12,-14, -1,  1,  2, -6,-22,-30,-17,  1;
/M: SY='Q'; M= -5, -5,-22, -6, -4,-19, -7, -4,-16, -3,-15, -6, -4,-14,  1, -3, -2, -4,-13,-21, -8, -2;
/M: SY='R'; M= -6, -9,-22,-10, -3,-13,-17, -8, -9, -1, -7, -3, -7,-15, -4,  2, -4, -2, -5,-24, -9, -4;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='I'; M= -1,-24,-18,-29,-23,  6,-26,-20, 16,-21, 12,  8,-21,-24,-19,-20,-13, -4, 16,-12,  3,-21;
/M: SY='G'; M= 17,-11,-20,-14,-17,-25, 40,-20,-27,-17,-21,-16, -5,-17,-17,-20,  3,-12,-17,-21,-26,-17;
/M: SY='L'; M= -8,-29,-20,-33,-24, 17,-30,-22, 22,-27, 28, 15,-25,-27,-23,-21,-22, -8, 16,-15,  3,-24;
/M: SY='I'; M= -2,-22,-20,-26,-18, -2,-25,-18, 15,-17, 13, 10,-19,-20,-14,-15,-13, -5, 13,-22, -5,-17;
/M: SY='V'; M=  5,-26,-12,-28,-26, -3,-26,-28, 25,-19,  7,  7,-25,-26,-25,-20, -7,  1, 39,-28,-10,-26;
/M: SY='D'; M=-17, 35,-29, 49, 20,-35,-11,  2,-35,  1,-26,-24, 14, -9,  3, -6,  0, -9,-28,-35,-17, 11;
/M: SY='E'; M= -3,  1,-24,  2, 14,-25, -9, -5,-25,  7,-20,-14,  1,-10, 11,  8,  5, -2,-20,-26,-15, 12;
/M: SY='V'; M= -2,-28,-16,-32,-27,  4,-30,-27, 28,-24, 16, 12,-25,-26,-25,-23,-14, -5, 32,-23, -5,-27;
/M:         M= -2,-10,-19,-12, -9, -9,-17,-13, -2,-12, -2, -3, -8,-14,-10,-12, -3, -1,  0,-24, -9,-10;
/M: SY='G'; M= -9,  7,-29, 12, 10,-30, 17, -7,-35, -1,-26,-20,  6,-13,  0, -1,  0,-13,-28,-27,-22,  4;
/M: SY='V'; M= -5,-15,-20,-18, -8, -9,-26,-17, 12,-13,  2,  5,-13,-19, -6,-14, -6, -1, 13,-26, -9, -8;
/M: SY='R'; M=-10,-13,-24,-14, -4,-10,-24, -4, -2, -6,  0,  1, -9,-19,  1,  2, -8, -5, -2,-23, -5, -3;
/M: SY='E'; M= -6,  0,-25,  1, 13,-21,-13, -4,-23,  4,-19,-13,  0,-10,  7,  7,  3,  0,-19,-22,-12,  9;
/M: SY='I'; M= -8,-25,-16,-28,-22,  5,-30,-22, 20,-22, 18, 11,-23,-25,-20,-19,-18, -7, 19,-21, -1,-22;
/M: SY='S'; M= -3,  0,-21,  2, -2,-20,-14,-10,-11, -6,-16,-10, -2, -6, -7, -9,  3,  0, -4,-32,-16, -6;
/M: SY='I'; M= -6,-15,-27,-16, -8,-12,-21,-19,  1,-12, -5, -4,-15, -8, -9,-13,-10, -7, -1, -7, -8,-10;
/M: SY='K'; M= -5,  8,-23,  8,  8,-23,-13, -5,-23, 10,-21,-13,  7,-12,  3,  7,  3, -1,-17,-28,-14,  5;
/M: SY='E'; M= -8,  4,-27,  9, 13,-27,-16, -3,-20,  0,-20,-13,  2,  4, 11, -3,  2, -4,-21,-30,-17, 11;
/M: SY='I'; M= -7,-26,-21,-31,-22,  5,-30,-22, 26,-24, 22, 17,-22,-23,-19,-22,-19, -8, 18,-20, -1,-22;
/M: SY='E'; M= -8,  0,-27,  4, 12,-24, -8, -5,-20,  1,-14, -9, -2,-10,  6, -2, -4, -9,-19,-26,-15,  8;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='P'; M= -2, -5,-21, -1,  5,-20, -8, -8,-16, -3,-18,-12, -5, 23,  0, -7,  1, -3,-17,-21,-16,  1; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='P'; M=  2, -9,-15, -9, -5,-10, -8,-11, -5, -7, -8, -6, -8, 15, -7,-10, -2, -1, -6,-14,-10, -7; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='E'; M= -3, -1,-19,  0,  1,-16, -7, -6,-13, -2,-13, -9, -3,  0,  0, -5, -2, -4,-13,-10, -8,  0; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M:         M= -5, -5,-19, -7, -6, -9,-11, -7, -5, -6, -5, -2, -1,-12, -5, -5, -5, -4, -6,-20, -7, -6; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='L'; M= -4,-14,-21,-17,-13, -3, -8,-15, -2,-17,  1, -1,-10,-19,-14,-15, -6, -4, -1,-21, -6,-14;
/M: SY='S'; M=  4, -4,-22, -4, -1,-22,  1,-12,-19, -7,-17,-12, -2, -7,  1, -9,  6,  0,-16,-26,-18, -1;
/M: SY='S'; M=  1, -1,-22, -2, -1,-22, -3,-10,-19,  0,-18,-11,  1,-11, -2, -2,  4, -3,-13,-27,-16, -2;
/M:         M= -2,-10,-23,-11, -9,-13, -7,-16, -6,-10, -9, -6, -7,-14,-11,-10, -3, -6, -3,-21,-13,-11;
/M: SY='E'; M= -6, -5,-26, -3,  4,-19,-12, -9,-16, -2,-14,-10, -4, -3,  0, -3, -4, -6,-16,-21,-13,  1;
/M: SY='G'; M=  2, -4,-24, -5, -3,-20,  5,-11,-20, -5,-17,-12, -2,-11, -5, -5,  0, -8,-15,-24,-17, -5;
/M:         M= -7,-10,-25,-11, -6,-12,-17,-13, -5, -7,-10, -6, -7, -2, -9, -8, -6, -5, -5,-25,-11, -9;
/M: SY='Y'; M= -5,-18,-21,-20,-16, 12,-21, -4, -4,-14,  0, -2,-14,-23,-14,-12, -9, -6, -5, -1, 18,-15;
/M: SY='I'; M= -1,-20,-22,-23,-19, -8, -6,-22,  7,-22,  7,  4,-15,-20,-17,-20,-10, -7,  6,-23,-12,-19;
/M: SY='A'; M=  6, -6,-16,-10, -4,-18,-10, -8,-15, -1,-14, -8, -4,-14, -1,  0,  3,  0, -9,-24,-12, -3;
/M: SY='G'; M=  7, -7,-22,-11,-13,-23, 29,-18,-26,-13,-22,-15, -1,-13,-13,-13,  6,  0,-17,-23,-23,-13;
/M: SY='I'; M= -4,-24,-18,-29,-23,  0,-29,-24, 24,-21, 13, 11,-20,-22,-20,-19,-12, -2, 23,-23, -5,-23;
/M: SY='V'; M= -4,-21,-17,-24,-20,  1,-20,-19,  7,-18,  9,  4,-19,-24,-18,-15,-11, -2, 10,-16, -3,-19;
/M: SY='R'; M= -5, -3,-26, -3, -3,-23,  3, -8,-23,  4,-19,-10,  1,-15, -2,  6, -2, -8,-18,-24,-16, -4;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='L'; M= -5, -7,-15, -8, -5, -4,-14, -8, -1, -7,  1,  0, -6,-12, -3, -5, -5, -2, -2,-11, -2, -5; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='D'; M=-12, 25,-25, 31, 14,-30, -4,  0,-29,  1,-25,-20, 15, -7,  4, -2,  2, -8,-26,-31,-18,  9; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='G'; M= -5,  3,-28,  6,  1,-30, 28,-10,-34, -7,-27,-19,  6,-12, -5,-10,  2,-12,-27,-26,-24, -2;
/M: SY='R'; M= -9, -2,-24, -2,  7,-24,-11, -2,-27, 16,-23,-12,  3,-14,  9, 25,  0, -4,-20,-25,-14,  6;
/M: SY='I'; M= -5,-22,-20,-25,-19,  0,-26,-17, 16,-19, 15, 14,-19,-19,-15,-16,-14, -4, 14,-22, -3,-18;
/M: SY='V'; M=  1,-23,-15,-28,-22,  1,-24,-21, 15,-21, 10,  8,-20,-23,-19,-20,-11, -3, 16,-15, -3,-21;
/M: SY='L'; M= -6,-18,-17,-21,-13, -5,-23,-15,  6,-17, 11,  7,-16,-19, -9,-13,-12, -5,  4,-23, -7,-12;
/M: SY='I'; M= -9,-28,-21,-32,-24,  4,-32,-24, 28,-25, 23, 15,-24,-26,-21,-22,-21, -8, 22,-17,  0,-24;
/M: SY='L'; M= -9,-28,-22,-30,-21,  7,-31,-21, 22,-27, 34, 16,-26,-22,-20,-21,-24, -9, 13,-19,  0,-21;
/M: SY='D'; M=-16, 39,-27, 51, 15,-34, -9,  5,-35,  0,-29,-25, 22,-12,  1, -6,  3, -7,-28,-38,-18,  8;
/M: SY='V'; M=  0,-24,-15,-27,-20, -1,-25,-24, 16,-20, 10,  6,-23,-16,-21,-20,-12, -4, 21,-24, -9,-21;
/M: SY='E'; M= -2,  7,-24, 10, 13,-24, -7, -2,-24, -3,-20,-15,  4, -5,  3, -7,  3, -6,-21,-29,-17,  7;
/M: SY='K'; M=  2, -3,-24, -4,  3,-21,-10, -8,-20,  8,-17,-10, -2,-11,  2,  3, -2, -6,-15,-23,-13,  2;
/M: SY='L'; M= -9,-28,-21,-32,-23,  8,-32,-22, 26,-27, 33, 19,-25,-26,-20,-21,-23, -7, 18,-20,  1,-23;
/M: SY='L'; M= -6,-25,-21,-30,-20, 12,-28,-20, 17,-24, 22, 13,-21,-23,-19,-20,-17, -6, 12,-17,  1,-20;
/M: SY='B'; M= -2,  7,-22,  7,  5,-24, -8, -5,-21, -1,-20,-15,  6, -8,  2, -2,  6,  1,-17,-29,-15,  3;
/M: SY='D'; M= -2,  0,-22,  1,  1,-17,-11, -6,-15, -4,-13, -8, -1,-14, -3, -5,  1, -3,-11,-25,-11, -2;
/M:         M= -2,-11,-20,-12, -6,-11,-16,-15, -4, -9, -4, -4,-10,-14, -7, -8, -5, -4, -2,-23, -9, -7;
/M: SY='E'; M= -1, -6,-22, -8,  4,-13,-14, -7,-13, -3, -9, -6, -5,-14, -1, -1, -2, -4,-10,-23, -9,  1;
/M:         M= -6,-10,-26,-10, -3,-13,-13,-11,-13, -2,-11, -5, -7, -7, -4,  0, -6, -7,-12,-18,-10, -4;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_11 which contains 547'085 sequence entries.


Total number of hits 29 in 29 different sequences
Number of true positive hits 29 in 29 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Archaea, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] CheW-like
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
29 sequences

CHEA_BACSU  (P29072), CHEA_BORBU  (Q44737), CHEA_ECOLI  (P07363), 
CHEA_ENTAK  (P21813), CHEA_HALS3  (B0R4J9), CHEA_LISIN  (Q92DW2), 
CHEA_LISMO  (Q48768), CHEA_RHIME  (Q52880), CHEA_RHOSH  (Q53135), 
CHEA_SALTY  (P09384), CHEA_THEMA  (Q56310), CHEA_TREPA  (P96123), 
CHEV_BACSU  (P37599), CHEW_BACSU  (P39802), CHEW_CAUCR  (O87715), 
CHEW_ECO57  (P0A966), CHEW_ECOL6  (P0A965), CHEW_ECOLI  (P0A964), 
CHEW_ENTAK  (P21821), CHEW_RHIEC  (Q2KCI0), CHEW_RHIME  (Q52881), 
CHEW_RHOSH  (Q60251), CHEW_SALTY  (P06110), CHEW_SHIFL  (P0A967), 
CHEW_THEMA  (Q56311), CHEW_TREPA  (O83453), FRZA_MYXXA  (P43498), 
FRZE_MYXXA  (P18769), PILI_PSEAE  (P43502)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission