PROSITE entry PS50851
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | CHEW |
| Accession [info] | PS50851 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JAN-2003 CREATED;
26-FEB-2020 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50851 |
| Associated ProRule [info] | PRU00052 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | CheW-like domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=140; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=135; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0562000; R2=0.0254549; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6912.7973633; R2=4.5260224; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=313; H_SCORE=8329; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=175; H_SCORE=7705; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: M= -3, -9,-23,-11, -4,-15,-15,-15, 0,-10, -5, -1, -8,-14, -5,-11, -2, -1, 0,-26,-12, -6; /M: SY='L'; M= -7,-16,-20,-19,-12, -2,-23,-15, 4,-14, 9, 7,-16,-20, -8,-11,-13, -7, 2,-17, -4,-10; /M: SY='Q'; M= -8, 4,-27, 7, 15,-29,-13, 0,-25, 8,-21,-12, 1, -7, 17, 7, 1, -5,-23,-27,-14, 15; /M: SY='L'; M= -4,-22,-18,-25,-22, 6,-11,-16, 4,-21, 7, 4,-18,-25,-20,-18,-12, -7, 6,-14, 2,-21; /M: SY='L'; M= -8,-29,-19,-31,-23, 7,-31,-22, 25,-26, 33, 18,-27,-28,-21,-21,-23, -8, 20,-21, -1,-22; /M: SY='L'; M= -5,-16,-11,-19,-13, -5,-18,-17, 2,-17, 6, 2,-13,-22,-13,-15, -8, -1, 3,-23, -8,-14; /M: SY='F'; M=-13,-29,-15,-36,-29, 45,-31,-23, 12,-27, 12, 6,-23,-29,-33,-21,-18, -8, 15, -6, 15,-29; /M: SY='R'; M=-10, -4,-24, -4, 2,-18,-19, -4,-16, 9,-13, -5, -3,-14, 6, 16, -5, -4,-12,-23, -9, 2; /M: SY='L'; M= -2,-25,-14,-28,-22, 1,-28,-23, 21,-24, 22, 12,-23,-25,-20,-20,-14, -2, 21,-25, -6,-22; /M: SY='G'; M= 2, 1,-26, 1, -7,-28, 36,-13,-33,-13,-25,-19, 4,-15,-11,-15, 2,-13,-25,-24,-24, -9; /M: SY='D'; M= -5, 11,-26, 16, 12,-29, 0, -8,-29, 3,-25,-19, 6, -8, 1, -4, 3, -6,-23,-30,-19, 6; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='E'; M= -8, 4,-27, 9, 25,-28,-17, 0,-23, 7,-18,-11, -1, -8, 17, 6, -1, -8,-21,-27,-15, 20; /M: SY='T'; M= -7,-12,-21,-13, -5, -7,-21, -9, -6, -9, 0, -2,-11,-16, -7, -4, -6, 2, -3,-17, -4, -7; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='Y'; M=-16,-24,-23,-28,-22, 36,-29, -3, 3,-18, 9, 3,-21,-29,-21,-14,-20,-10, -2, 12, 43,-22; /M: SY='A'; M= 25,-13,-11,-20,-16,-18, 8,-21,-11,-16, -8, -8,-11,-17,-15,-20, 3, -4, -1,-23,-20,-16; /M: SY='I'; M= -7,-29,-21,-34,-27, 8,-32,-25, 31,-26, 22, 16,-24,-25,-23,-23,-18, -7, 26,-20, -1,-26; /M: SY='P'; M= -9, 2,-31, 9, 6,-28,-13,-10,-23, -6,-27,-20, 0, 37, -4,-13, 0, -5,-26,-33,-24, -2; /M: SY='I'; M= -1,-22,-18,-27,-21, -1,-26,-22, 21,-22, 17, 11,-18,-23,-18,-20,-12, -1, 18,-24, -6,-20; /M: SY='A'; M= 1, -5,-20, -7, -5,-11,-10, -7, -9,-10, -7, -3, -3,-16, -6,-10, 0, -1, -7,-25,-10, -6; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='Q'; M= -2, 0,-15, -1, 3,-18,-10, -1,-15, 3,-15, -8, 1,-11, 4, -1, 1, -2,-12,-20, -7, 3; D=-12; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='V'; M= -2,-22,-13,-25,-22, 1,-25,-23, 24,-18, 11, 9,-20,-21,-20,-18,-10, 0, 29,-21, -5,-22; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='R'; M= -6, -6,-19, -6, 3,-17,-11, -5,-14, 6,-12, -5, -4,-13, 4, 12, -4, -6, -9,-19,-10, 2; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='E'; M= -7, 8,-27, 15, 38,-27,-14, 0,-27, 5,-20,-16, 3, -5, 14, -1, 4, -7,-25,-30,-18, 25; /M: SY='I'; M= -4,-28,-20,-33,-28, 0,-33,-28, 35,-24, 13, 13,-23,-24,-23,-24,-12, -3, 35,-25, -5,-28; /M: SY='L'; M= -5,-20,-21,-23,-15, -2,-26,-16, 13,-16, 14, 9,-18,-23,-13,-11,-14, -6, 12,-22, -4,-15; /M: SY='R'; M= -9, -1,-28, 1, 8,-25, -9, -3,-25, 8,-20,-12, 0, -7, 6, 12, -3, -7,-20,-25,-14, 5; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='I'; M= -5,-21,-22,-24,-17, -1,-22,-14, 6,-16, 2, 4,-19,-12,-14,-15,-12, -5, 4, -9, 3,-17; /M: SY='P'; M= -5, -6,-24, -5, 1,-21,-16, -7,-13, -5,-15, -8, -5, 4, 3, -6, -1, -3,-14,-27,-15, 0; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='E'; M= -9, 1,-28, 3, 9,-25,-14, -5,-23, 5,-23,-14, 2, 6, 6, 6, 1, -3,-22,-28,-16, 6; /M: SY='I'; M= -5,-23,-21,-26,-20, -1,-29,-23, 21,-21, 13, 9,-21,-17,-19,-20,-13, -4, 19,-23, -5,-21; /M: SY='T'; M= -3, 3,-15, 0, 0,-18,-16, -9,-18, -2,-17,-13, 2, -8, -1, -4, 10, 18,-11,-29,-12, -1; /M: SY='P'; M= -7,-13,-27,-10, -1,-19,-19, -9,-11, -2,-14, -8,-11, 11, -4, 0, -5, -6,-10,-26,-14, -5; /M: SY='I'; M= -6,-18,-21,-21,-17, -3,-26,-16, 15,-18, 12, 9,-17,-23,-14,-16,-14, -6, 13,-23, -4,-17; /M: SY='P'; M= -8,-11,-33, -5, 2,-25,-18,-12,-18, -7,-23,-16,-11, 48, -5,-13, -6, -8,-24,-28,-21, -5; /M: SY='N'; M=-10, -2,-25, -5, -7,-16, -1, 0,-15, -8,-11, -7, 4,-20, -5, -6, -7,-10,-16,-23, -9, -7; /M: SY='A'; M= 11, -8,-15,-13, -6,-16,-11,-14, -9, -5, -9, -4, -7,-13, -4, -9, 4, 4, -2,-25,-14, -5; /M: SY='P'; M= -9, -8,-31, -2, 4,-26,-12,-10,-21, -3,-22,-15, -7, 28, -1, -5, -4, -7,-23,-29,-21, -2; /M: SY='P'; M= -1, -2,-25, -1, -2,-22, -9,-10,-13, -9,-17,-12, -2, 4, -6,-13, 1, -4,-12,-29,-18, -6; /M: SY='Y'; M=-10,-11,-25,-12, -6, 1,-14, 4,-16,-12,-12, -9,-10,-21, -7,-11,-11,-12,-17, 8, 14, -7; /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='V'; M= -5,-19,-18,-21,-20, -2,-13,-17, 12,-18, 8, 7,-16,-22,-18,-17,-11, -6, 14,-19, -3,-20; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='L'; M= -4,-12,-17,-14, -5, -9,-20,-11, -1, -7, 5, 2,-11,-17, -5, -3,-10, -5, -2,-19, -7, -6; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='G'; M= -1, -7,-29, -6, -9,-28, 44,-16,-34,-14,-27,-19, 0, -8,-13,-16, 0,-15,-28,-23,-27,-11; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='V'; M= -2,-25,-16,-27,-23, 3,-27,-21, 19,-20, 13, 10,-22,-25,-21,-18,-11, -2, 26,-24, -5,-22; /M: SY='I'; M= -7,-24,-20,-29,-23, 9,-28,-17, 19,-22, 15, 12,-20,-24,-18,-20,-15, -6, 14,-16, 6,-22; /M: SY='N'; M= -7, 18,-21, 9, 0,-19, -8, 0,-17, -2,-21,-15, 26,-17, -1, 1, 5, 1,-19,-31,-14, -1; /M: SY='L'; M= -9,-25,-19,-26,-21, 4,-27,-12, 11,-22, 17, 7,-23,-28,-17,-18,-20, -9, 8, -2, 8,-20; /M: SY='R'; M=-17, -7,-29, -7, 2,-20,-19, 0,-28, 24,-20,-11, 2,-16, 10, 56, -8, -9,-21,-21,-10, 2; /M: SY='G'; M= -1, 0,-28, 2, -9,-30, 48,-15,-37,-15,-28,-21, 4,-17,-14,-17, 2,-16,-28,-24,-27,-12; /M: SY='E'; M= -6, -2,-25, -2, 10,-22,-13, -6,-19, 7,-16,-10, 0,-13, 7, 8, -1, -5,-16,-23,-13, 8; /M: SY='I'; M= -6,-21,-17,-25,-19, -4,-27,-19, 15,-18, 9, 7,-18,-17,-15,-17,-12, -3, 14,-24, -5,-19; /M: SY='I'; M= -8,-27,-20,-31,-25, 7,-31,-22, 26,-24, 23, 16,-24,-26,-21,-21,-18, -4, 22,-19, 2,-24; /M: SY='P'; M= -7,-16,-35,-10, -3,-25,-15,-19,-19,-10,-26,-18,-15, 57,-10,-18, -6, -6,-25,-19,-23,-10; /M: SY='V'; M= -4,-28,-14,-31,-25, 5,-30,-25, 24,-25, 23, 12,-25,-28,-24,-22,-18, -6, 26,-23, -4,-25; /M: SY='I'; M= -5,-28,-20,-32,-26, 4,-31,-24, 29,-23, 17, 14,-23,-25,-22,-21,-16, -6, 28,-21, -2,-26; /M: SY='D'; M=-13, 27,-23, 35, 10,-29,-11, -2,-30, 0,-26,-22, 15, -9, 0, -3, 4, -4,-24,-34,-16, 4; /M: SY='L'; M= -8,-27,-19,-30,-21, 11,-28,-20, 18,-26, 34, 17,-25,-26,-20,-19,-22, -6, 12,-19, 0,-21; /M: SY='R'; M= 0, -5,-23, -6, -1,-22, -3, -4,-25, 7,-21,-13, 0,-13, 1, 14, 0, -7,-18,-22,-14, -2; /M: SY='R'; M= -4, -5,-25, -5, 5,-18,-15, -8,-17, 6,-11, -8, -4,-12, 2, 7, -5, -7,-14,-23,-11, 3; /M: SY='L'; M= -9,-22,-25,-24,-15, 5,-22,-16, -2,-10, 8, 3,-19,-22,-13, -2,-18, -9, -2, 0, 1,-14; /M: SY='L'; M=-11,-28,-20,-31,-22, 26,-28,-20, 13,-27, 27, 11,-24,-28,-23,-19,-21, -8, 8,-10, 8,-22; /M: SY='G'; M= -4, 1,-24, -1, -7,-23, 23, -5,-28, -9,-23,-14, 7,-16, -7, -8, 1,-11,-23,-25,-19, -7; /M: SY='L'; M= -9,-20,-23,-22,-13, 1,-20,-15, 6,-16, 12, 9,-18,-19,-13,-13,-17, -9, 2,-16, -1,-14; /M: SY='P'; M= -5, -1,-27, 1, 3,-25, -7, -9,-21, 0,-21,-14, -1, 7, -1, -3, -1, -5,-18,-28,-18, -1; /M: SY='E'; M= -1, -4,-23, -3, 7,-21, -8,-10,-22, -1,-20,-14, -2, 2, 1, 0, 3, -3,-18,-27,-18, 3; /M: SY='E'; M= -1, -4,-23, -4, 1,-19,-11,-11,-14, -5,-14, -9, -3, -5, -1, -7, 1, 0,-12,-24,-12, -1; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='E'; M= -4, 1,-25, 4, 12,-24,-12, -6,-20, 3,-20,-14, 0, -3, 4, 0, 3, -4,-16,-29,-17, 7; /M: SY='E'; M= -6, -2,-25, 0, 2,-19,-14, -8,-15, -2,-15,-10, -2, -2, -2, -2, -1, -4,-13,-27,-13, -2; /M: SY='N'; M= -4, 2,-20, 0, -3,-18, -8, -8,-15, -6,-13,-10, 3,-14, -3, -5, 2, 2,-13,-27,-12, -4; /M: SY='E'; M= -8, 2,-25, 5, 6,-20,-12, -7,-19, 0,-16,-12, 0, -7, -1, -1, -1, -4,-15,-27,-13, 1; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='E'; M= -9, 5,-25, 7, 13,-23,-12, 2,-25, 8,-21,-13, 5,-11, 10, 11, 1, -5,-21,-24,-11, 10; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='T'; M= -2, 1,-19, -1, -2,-18, -5, -6,-18, -3,-15,-10, 2,-10, 1, -3, 6, 7,-13,-24,-11, -1; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='R'; M=-10,-13,-23,-14, -8, -8,-17, -8, -9, 2, -9, -3, -9, -7, -5, 9, -9, -7, -7,-15, -4, -9; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='V'; M= 2,-24,-17,-29,-24, -1,-25,-23, 23,-21, 13, 11,-21,-24,-20,-20,-12, -4, 25,-22, -5,-23; /M: SY='I'; M= -7,-29,-19,-33,-27, 4,-33,-25, 32,-26, 23, 16,-26,-26,-23,-23,-19, -7, 29,-22, -1,-27; /M: SY='V'; M= -4,-29,-17,-32,-28, 1,-31,-28, 32,-24, 16, 14,-27,-27,-26,-22,-15, -4, 38,-25, -6,-28; /M: SY='V'; M= -3,-25, -8,-28,-25, -1,-26,-25, 19,-22, 13, 9,-23,-26,-23,-20,-11, 0, 26,-27, -8,-24; /M: SY='E'; M= -9, 7,-26, 9, 15,-25,-11, 0,-26, 9,-22,-14, 7,-12, 8, 11, 0, -6,-22,-27,-15, 11; /M: SY='V'; M= -3,-12,-17,-14,-12, -4,-15,-10, -4,-12, -4, -4, -9,-20,-12,-12, -3, -2, 1,-22, -3,-13; /M: SY='E'; M= -3, 1,-26, 1, 4,-25, 4, -6,-24, -3,-20,-13, 4, -8, 1, -3, 1, -8,-21,-27,-19, 2; /M: SY='D'; M= -8, 11,-25, 12, 4,-24, 1, -4,-26, 0,-22,-17, 12,-14, -1, 1, 2, -6,-22,-30,-17, 1; /M: SY='Q'; M= -5, -5,-22, -6, -4,-19, -7, -4,-16, -3,-15, -6, -4,-14, 1, -3, -2, -4,-13,-21, -8, -2; /M: SY='R'; M= -6, -9,-22,-10, -3,-13,-17, -8, -9, -1, -7, -3, -7,-15, -4, 2, -4, -2, -5,-24, -9, -4; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='I'; M= -1,-24,-18,-29,-23, 6,-26,-20, 16,-21, 12, 8,-21,-24,-19,-20,-13, -4, 16,-12, 3,-21; /M: SY='G'; M= 17,-11,-20,-14,-17,-25, 40,-20,-27,-17,-21,-16, -5,-17,-17,-20, 3,-12,-17,-21,-26,-17; /M: SY='L'; M= -8,-29,-20,-33,-24, 17,-30,-22, 22,-27, 28, 15,-25,-27,-23,-21,-22, -8, 16,-15, 3,-24; /M: SY='I'; M= -2,-22,-20,-26,-18, -2,-25,-18, 15,-17, 13, 10,-19,-20,-14,-15,-13, -5, 13,-22, -5,-17; /M: SY='V'; M= 5,-26,-12,-28,-26, -3,-26,-28, 25,-19, 7, 7,-25,-26,-25,-20, -7, 1, 39,-28,-10,-26; /M: SY='D'; M=-17, 35,-29, 49, 20,-35,-11, 2,-35, 1,-26,-24, 14, -9, 3, -6, 0, -9,-28,-35,-17, 11; /M: SY='E'; M= -3, 1,-24, 2, 14,-25, -9, -5,-25, 7,-20,-14, 1,-10, 11, 8, 5, -2,-20,-26,-15, 12; /M: SY='V'; M= -2,-28,-16,-32,-27, 4,-30,-27, 28,-24, 16, 12,-25,-26,-25,-23,-14, -5, 32,-23, -5,-27; /M: M= -2,-10,-19,-12, -9, -9,-17,-13, -2,-12, -2, -3, -8,-14,-10,-12, -3, -1, 0,-24, -9,-10; /M: SY='G'; M= -9, 7,-29, 12, 10,-30, 17, -7,-35, -1,-26,-20, 6,-13, 0, -1, 0,-13,-28,-27,-22, 4; /M: SY='V'; M= -5,-15,-20,-18, -8, -9,-26,-17, 12,-13, 2, 5,-13,-19, -6,-14, -6, -1, 13,-26, -9, -8; /M: SY='R'; M=-10,-13,-24,-14, -4,-10,-24, -4, -2, -6, 0, 1, -9,-19, 1, 2, -8, -5, -2,-23, -5, -3; /M: SY='E'; M= -6, 0,-25, 1, 13,-21,-13, -4,-23, 4,-19,-13, 0,-10, 7, 7, 3, 0,-19,-22,-12, 9; /M: SY='I'; M= -8,-25,-16,-28,-22, 5,-30,-22, 20,-22, 18, 11,-23,-25,-20,-19,-18, -7, 19,-21, -1,-22; /M: SY='S'; M= -3, 0,-21, 2, -2,-20,-14,-10,-11, -6,-16,-10, -2, -6, -7, -9, 3, 0, -4,-32,-16, -6; /M: SY='I'; M= -6,-15,-27,-16, -8,-12,-21,-19, 1,-12, -5, -4,-15, -8, -9,-13,-10, -7, -1, -7, -8,-10; /M: SY='K'; M= -5, 8,-23, 8, 8,-23,-13, -5,-23, 10,-21,-13, 7,-12, 3, 7, 3, -1,-17,-28,-14, 5; /M: SY='E'; M= -8, 4,-27, 9, 13,-27,-16, -3,-20, 0,-20,-13, 2, 4, 11, -3, 2, -4,-21,-30,-17, 11; /M: SY='I'; M= -7,-26,-21,-31,-22, 5,-30,-22, 26,-24, 22, 17,-22,-23,-19,-22,-19, -8, 18,-20, -1,-22; /M: SY='E'; M= -8, 0,-27, 4, 12,-24, -8, -5,-20, 1,-14, -9, -2,-10, 6, -2, -4, -9,-19,-26,-15, 8; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='P'; M= -2, -5,-21, -1, 5,-20, -8, -8,-16, -3,-18,-12, -5, 23, 0, -7, 1, -3,-17,-21,-16, 1; D=-7; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='P'; M= 2, -9,-15, -9, -5,-10, -8,-11, -5, -7, -8, -6, -8, 15, -7,-10, -2, -1, -6,-14,-10, -7; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='E'; M= -3, -1,-19, 0, 1,-16, -7, -6,-13, -2,-13, -9, -3, 0, 0, -5, -2, -4,-13,-10, -8, 0; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: M= -5, -5,-19, -7, -6, -9,-11, -7, -5, -6, -5, -2, -1,-12, -5, -5, -5, -4, -6,-20, -7, -6; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='L'; M= -4,-14,-21,-17,-13, -3, -8,-15, -2,-17, 1, -1,-10,-19,-14,-15, -6, -4, -1,-21, -6,-14; /M: SY='S'; M= 4, -4,-22, -4, -1,-22, 1,-12,-19, -7,-17,-12, -2, -7, 1, -9, 6, 0,-16,-26,-18, -1; /M: SY='S'; M= 1, -1,-22, -2, -1,-22, -3,-10,-19, 0,-18,-11, 1,-11, -2, -2, 4, -3,-13,-27,-16, -2; /M: M= -2,-10,-23,-11, -9,-13, -7,-16, -6,-10, -9, -6, -7,-14,-11,-10, -3, -6, -3,-21,-13,-11; /M: SY='E'; M= -6, -5,-26, -3, 4,-19,-12, -9,-16, -2,-14,-10, -4, -3, 0, -3, -4, -6,-16,-21,-13, 1; /M: SY='G'; M= 2, -4,-24, -5, -3,-20, 5,-11,-20, -5,-17,-12, -2,-11, -5, -5, 0, -8,-15,-24,-17, -5; /M: M= -7,-10,-25,-11, -6,-12,-17,-13, -5, -7,-10, -6, -7, -2, -9, -8, -6, -5, -5,-25,-11, -9; /M: SY='Y'; M= -5,-18,-21,-20,-16, 12,-21, -4, -4,-14, 0, -2,-14,-23,-14,-12, -9, -6, -5, -1, 18,-15; /M: SY='I'; M= -1,-20,-22,-23,-19, -8, -6,-22, 7,-22, 7, 4,-15,-20,-17,-20,-10, -7, 6,-23,-12,-19; /M: SY='A'; M= 6, -6,-16,-10, -4,-18,-10, -8,-15, -1,-14, -8, -4,-14, -1, 0, 3, 0, -9,-24,-12, -3; /M: SY='G'; M= 7, -7,-22,-11,-13,-23, 29,-18,-26,-13,-22,-15, -1,-13,-13,-13, 6, 0,-17,-23,-23,-13; /M: SY='I'; M= -4,-24,-18,-29,-23, 0,-29,-24, 24,-21, 13, 11,-20,-22,-20,-19,-12, -2, 23,-23, -5,-23; /M: SY='V'; M= -4,-21,-17,-24,-20, 1,-20,-19, 7,-18, 9, 4,-19,-24,-18,-15,-11, -2, 10,-16, -3,-19; /M: SY='R'; M= -5, -3,-26, -3, -3,-23, 3, -8,-23, 4,-19,-10, 1,-15, -2, 6, -2, -8,-18,-24,-16, -4; /I: I=-7; MD=-14; /M: SY='L'; M= -5, -7,-15, -8, -5, -4,-14, -8, -1, -7, 1, 0, -6,-12, -3, -5, -5, -2, -2,-11, -2, -5; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='D'; M=-12, 25,-25, 31, 14,-30, -4, 0,-29, 1,-25,-20, 15, -7, 4, -2, 2, -8,-26,-31,-18, 9; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='G'; M= -5, 3,-28, 6, 1,-30, 28,-10,-34, -7,-27,-19, 6,-12, -5,-10, 2,-12,-27,-26,-24, -2; /M: SY='R'; M= -9, -2,-24, -2, 7,-24,-11, -2,-27, 16,-23,-12, 3,-14, 9, 25, 0, -4,-20,-25,-14, 6; /M: SY='I'; M= -5,-22,-20,-25,-19, 0,-26,-17, 16,-19, 15, 14,-19,-19,-15,-16,-14, -4, 14,-22, -3,-18; /M: SY='V'; M= 1,-23,-15,-28,-22, 1,-24,-21, 15,-21, 10, 8,-20,-23,-19,-20,-11, -3, 16,-15, -3,-21; /M: SY='L'; M= -6,-18,-17,-21,-13, -5,-23,-15, 6,-17, 11, 7,-16,-19, -9,-13,-12, -5, 4,-23, -7,-12; /M: SY='I'; M= -9,-28,-21,-32,-24, 4,-32,-24, 28,-25, 23, 15,-24,-26,-21,-22,-21, -8, 22,-17, 0,-24; /M: SY='L'; M= -9,-28,-22,-30,-21, 7,-31,-21, 22,-27, 34, 16,-26,-22,-20,-21,-24, -9, 13,-19, 0,-21; /M: SY='D'; M=-16, 39,-27, 51, 15,-34, -9, 5,-35, 0,-29,-25, 22,-12, 1, -6, 3, -7,-28,-38,-18, 8; /M: SY='V'; M= 0,-24,-15,-27,-20, -1,-25,-24, 16,-20, 10, 6,-23,-16,-21,-20,-12, -4, 21,-24, -9,-21; /M: SY='E'; M= -2, 7,-24, 10, 13,-24, -7, -2,-24, -3,-20,-15, 4, -5, 3, -7, 3, -6,-21,-29,-17, 7; /M: SY='K'; M= 2, -3,-24, -4, 3,-21,-10, -8,-20, 8,-17,-10, -2,-11, 2, 3, -2, -6,-15,-23,-13, 2; /M: SY='L'; M= -9,-28,-21,-32,-23, 8,-32,-22, 26,-27, 33, 19,-25,-26,-20,-21,-23, -7, 18,-20, 1,-23; /M: SY='L'; M= -6,-25,-21,-30,-20, 12,-28,-20, 17,-24, 22, 13,-21,-23,-19,-20,-17, -6, 12,-17, 1,-20; /M: SY='B'; M= -2, 7,-22, 7, 5,-24, -8, -5,-21, -1,-20,-15, 6, -8, 2, -2, 6, 1,-17,-29,-15, 3; /M: SY='D'; M= -2, 0,-22, 1, 1,-17,-11, -6,-15, -4,-13, -8, -1,-14, -3, -5, 1, -3,-11,-25,-11, -2; /M: M= -2,-11,-20,-12, -6,-11,-16,-15, -4, -9, -4, -4,-10,-14, -7, -8, -5, -4, -2,-23, -9, -7; /M: SY='E'; M= -1, -6,-22, -8, 4,-13,-14, -7,-13, -3, -9, -6, -5,-14, -1, -1, -2, -4,-10,-23, -9, 1; /M: M= -6,-10,-26,-10, -3,-13,-13,-11,-13, -2,-11, -5, -7, -7, -4, 0, -6, -7,-12,-18,-10, -4; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 34 in 34 different sequences |
| Number of true positive hits | 34 in 34 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Archaea, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | CheW-like |
| Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
34 sequences
CHEAY_HELPY (O25153), CHEA_BACSU (P29072), CHEA_BORBU (Q44737), CHEA_CERSP (Q53135), CHEA_ECOLI (P07363), CHEA_HALS3 (B0R4J9), CHEA_KLEAK (P21813), CHEA_LISIN (Q92DW2), CHEA_LISMO (Q48768), CHEA_RHIME (Q52880), CHEA_SALTY (P09384), CHEA_THEMA (Q56310), CHEA_TREPA (P96123), CHEV1_HELPY (O24864), CHEV2_HELPY (O25337), CHEV3_HELPY (O25154), CHEV_BACSU (P37599), CHEW_BACSU (P39802), CHEW_CAUVC (O87715), CHEW_CERSP (Q60251), CHEW_ECO57 (P0A966), CHEW_ECOL6 (P0A965), CHEW_ECOLI (P0A964), CHEW_HELPY (O25152), CHEW_KLEAK (P21821), CHEW_RHIEC (Q2KCI0), CHEW_RHIME (Q52881), CHEW_SALTY (P06110), CHEW_SHIFL (P0A967), CHEW_THEMA (Q56311), CHEW_TREPA (O83453), FRZA_MYXXA (P43498), FRZE_MYXXA (P18769), PILI_PSEAE (P43502)» more
|
| PDB [Detailed view] |
9 PDB
1B3Q; 1K0S; 2CH4; 2HO9; 3JA6; 3UR1; 4JPB; 6S1K; 8C5V |