Entry: PS50895

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] SURF1
Accession [info] PS50895
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JAN-2003 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC01040

Name and characterization of the entry

Description [info] SURF1 family profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=226;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=221;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5675; R2=0.01324166; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=16858.68765; R2=32.89277; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=448; N_SCORE=8.5; H_SCORE=29095; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=296; N_SCORE=6.5; H_SCORE=26628; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='F'; M= -8,-19,-25,-22,-18, 11,-19,-19, -1,-17,  1,  0,-17,-12,-19,-17,-14, -8, -2, -3,  1,-18;
/M: SY='L'; M= -6,-23,-23,-24,-20,  4, -8,-19, -1,-19,  8,  1,-20,-22,-20,-17,-16,-11,  0, -7, -1,-20;
/M: SY='I'; M=  3,-19,-22,-22,-14, -9,-16,-19,  4,-17,  4,  3,-16, -7,-11,-18, -6, -2,  1,-18,-10,-14;
/M:         M= -8,-12,-24,-16,-15, -6, -4,-15, -7,-16, -1, -1, -7,-17,-12,-14, -9, -4, -9,-11, -8,-13;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-18,-32,-25, 17,-31,-23, 22,-27, 31, 14,-28,-29,-26,-21,-22, -7, 21,-18,  2,-25;
/M: SY='L'; M=  3,-22,-15,-27,-20,  4,-22,-19, 12,-20, 18, 14,-21,-23,-17,-18,-12, -1, 13,-20, -4,-18;
/M: SY='V'; M= -6,-24,-19,-27,-23,  6,-18,-23, 14,-24, 15,  7,-20,-25,-23,-20,-12, -3, 16,-21, -5,-23;
/M: SY='L'; M= 10,-22,-15,-26,-18,  2,-20,-21,  9,-21, 21,  7,-22,-23,-19,-19,-12, -2, 11,-20, -7,-18;
/M: SY='L'; M= -5,-24,-12,-29,-23,  4,-23,-22, 15,-25, 18, 10,-21,-25,-20,-21,-15, -5, 12,-22, -5,-22;
/M: SY='P'; M=  4,-14,-22,-16,-11,-16,-11,-21, -7,-15, -9, -8,-12, 12,-13,-18,  1,  6, -6,-27,-18,-14;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='F'; M= -6,-14,-14,-17,-13, 11,-12,-10,  7,-14,  7,  3,-10,-14,-12,-12, -8, -5,  3, -5,  7,-13; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='A'; M= 11,-21,-21,-24,-16,-12,-16,-23,  7,-18,  1, -1,-19,  1,-17,-21, -7, -5,  8,-24,-15,-18;
/M: SY='V'; M= -4,-21, -3,-29,-24,  4,-28,-24, 14,-22,  4,  6,-17,-23,-21,-22, -7,  2, 16,-24, -5,-23;
/M: SY='L'; M= -3,-18, -6,-24,-18, 10,-22,-19,  0,-21, 11,  3,-15,-23,-18,-17, -6,  6,  2,-21, -3,-17;
/M: SY='F'; M=-11,-25, -2,-33,-26, 24,-31,-24,  9,-27, 13,  4,-20,-27,-27,-22,-15, -2,  9,-16,  4,-26;
/M: SY='G'; M=  4, -9,-21,-13,-14,-10, 12,-16,-19,-12,-18,-13, -3,-18,-14,-13,  3, -4,-12,-12,-10,-14;
/M: SY='L'; M= -6,-28,-19,-29,-19,  7,-27,-19, 18,-27, 44, 21,-28,-28,-18,-19,-27, -9,  9,-20, -1,-19;
/M: SY='G'; M=  4,-10,-29,-11,-19,-29, 65,-20,-38,-19,-29,-19, -1,-19,-19,-20,  1,-19,-28,-20,-29,-19;
/M: SY='T'; M= -4,-13,-12,-18,-14, -2,-21,-19, -3,-14, -9, -7, -8,-10,-14,-11,  7, 16,  3,-27, -9,-15;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='L'; M= -7,-28,-18,-30,-24,  4,-30,-23, 25,-25, 30, 18,-27,-27,-21,-20,-20, -4, 24,-23, -3,-23;
/M: SY='Q'; M= -8, -6,-26, -6,  4,-17, -6, -1,-22,  3,-19, -8, -2,-15, 11,  2, -1, -8,-19,-21, -9,  8;
/M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9,  1,-21,-20, -1,-30, 31,-21,-10,  0,-19, 10, 67,-10,-10,-20,-20,-10,  1;
/M: SY='R'; M= -8,-15,-23,-18,-11,  0,-21, -9, -6, -4,  8,  1,-10,-23, -8, 11,-15, -8, -6,-16,  0,-11;
/M: SY='E'; M= -7, -2,-26, -1,  9,-16,-15,  5,-18,  3,-15, -7, -3,-13,  1, -2, -5, -8,-14,-22, -4,  4;
/M: SY='W'; M=-12,-13,-38, -9,  5,-12,-18,-15,-24, -3,-21,-18,-18,-17,  0, -8,-19,-19,-28, 56,  5,  5;
/M: SY='K'; M=-11, -2,-29, -3,  7,-27,-20, -9,-29, 42,-27,-10,  0,-12,  9, 35, -8, -6,-19,-21,-10,  7;
/M: SY='E'; M= -8,-11,-22,-11,  2, -8,-23, -7, -5, -4,  0,  1,-10,-16, -4, -3, -7, -2, -4,-24, -6, -2;
/M: SY='Q'; M=  1,  4,-25,  6,  8,-28, -4, -6,-24,  4,-18,-12,  2,-12,  9,  1, -1, -9,-20,-25,-17,  8;
/M: SY='L'; M=-11,-17,-22,-17,-10,  2,-27,-16,  6,-16, 22,  7,-18,-24,-13, -7,-18, -6,  3,-22, -4,-12;
/M: SY='I'; M=-11,-16,-26,-24,-18, -4,-29, -9, 23,-21, 15, 14, -8,-22,-10,-18,-16, -9,  9,-23, -2,-17;
/M: SY='A'; M= 16,  6,-20,  5, 16,-27, -9, -8,-21,  1,-17,-15,  1, -8,  6, -8,  5, -5,-16,-26,-19, 11;
/M: SY='R'; M= -4,  1,-22,  0,  1,-18,-14,  0,-19,  2,-16,-11,  4,-15,  4, 10,  4,  3,-15,-25, -8,  1;
/M: SY='I'; M= -5,-23,-15,-27,-20, -1,-29,-14, 17,-22, 17, 10,-20,-24,-15,-19,-16, -6, 14,-21,  0,-19;
/M: SY='E'; M= -6,  9,-25, 12, 24,-28,-16, -4,-26, 10,-22,-16,  4, -8, 13,  5,  4, -1,-22,-29,-16, 18;
/M: SY='Q'; M=  4, -1,-21, -4,  5,-19,-10,  0,-17, -2,-17,-10,  0,-13,  6, -6,  5,  1,-14,-23, -8,  5;
/M: SY='R'; M=-10,-10,-26,-12, -2,-18,-19,  1,-16, 11,-11, -1, -4,-18,  9, 30, -7, -8,-13,-22, -8,  1;
/M: SY='L'; M= -4,-19,-23,-21, -9, -7,-25,-16,  7,-10, 16,  8,-17,-21, -6, -5,-16, -9,  3,-21, -6, -9;
/M: SY='H'; M= -7,  7,-24,  5,  6,-22,-11, 14,-19, -3,-17,-10, 10,-14,  4, -4,  1, -3,-19,-30, -9,  4;
/M: SY='A'; M= 23, -6,-14,-12, -3,-18, -7,-12,-12, -7,-13, -7, -5,-11,  0,-12, 13,  7, -6,-23,-13, -2;
/M: SY='P'; M=  2, -8,-28, -4, 11,-26,-15,-14,-20, -5,-23,-18,-10, 38, -2,-14,  2, -2,-21,-29,-24,  2;
/M: SY='P'; M=  9,-18,-28,-15, -7,-23,-10,-21,-13,-12,-17,-13,-17, 41,-12,-20, -5, -7,-14,-26,-24,-12;
/M: SY='V'; M= -1,-22,-20,-26,-18, -7,-27,-21, 18,-15,  8,  8,-18,-21,-11,-12,-10, -2, 19,-24, -7,-16;
/M: SY='P'; M= -5,  2,-28,  7,  9,-26,-15,-11,-22, -1,-22,-17, -2, 21, -2, -6, -1, -4,-22,-30,-21,  1;
/M: SY='L'; M=  1,-26,-18,-27,-18,  2,-24,-21, 14,-24, 31, 12,-26,-20,-19,-20,-20, -7, 11,-22, -6,-19;
/M: SY='P'; M= -1, -9,-28, -6,  3,-25,-12,-16,-18, -4,-23,-15, -8, 31, -6,-12, -1, -3,-18,-29,-23, -4;
/M: SY='E'; M= -1, -1,-26,  0,  6,-26,-11,-10,-20,  5,-20,-12, -2,  0,  6,  1,  1, -3,-17,-26,-16,  5;
/M: SY='P'; M= -6, -6,-24, -2, -2,-17,-21,-14, -5,-12, -3, -4,-11,  1, -6,-15, -7, -4, -5,-28,-14, -6;
/M: SY='L'; M= -1,-13,-21,-13, -1, -8,-20, -9, -5,-14,  4, -2,-13, -8, -5,-13, -6, -2, -6,-25, -9, -4;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='T'; M=  6, -4,-16, -7, -5,-17,-13,-14,-10, -6,-13, -8, -5,  2, -4,-10,  8, 13, -5,-25,-14, -5; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='E'; M= -4,  3,-10,  7, 12,-15,-13, -6,-14, -3,-10,-11, -3, -4,  0, -7, -1, -4,-11,-21,-10,  6; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='K'; M= -1, -4,-16, -4,  1,-14, -8, -8,-10,  3, -6, -4, -4,-11,  0,  1, -3, -4, -6,-17, -9,  0; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='N'; M= -3,  4,-19,  0, -2,-17, -8, -8,-12, -6,-13, -8,  7,-14, -2, -4,  6,  4,-11,-28,-14, -3; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='P'; M=  4,-16,-15,-17, -9,-13,-14,-19, -6,-15, -1, -5,-16,  8,-13,-18, -6, -1, -5,-25,-16,-12; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='E'; M=  1,  3,-23,  3,  9,-24, -7,-10,-21,  2,-20,-15,  3, -5, -1, -3,  3, -3,-16,-28,-19,  3;
/M: SY='D'; M= -7, 19,-27, 24, 12,-30, -8, -4,-29,  4,-25,-20, 11, -6,  3,  1,  1, -6,-24,-31,-19,  7;
/M: SY='L'; M= -7,-14,-16,-13,-10, -7,-24,-16,  0,-13,  7,  2,-17,-17,-12,-14,-16, -9, -1,-16, -5,-12;
/M: SY='E'; M=  1,  0,-25,  3, 31,-24,-17, -4,-20,  4,-12, -9, -5, -7, 13, -1, -1, -8,-19,-26,-16, 22;
/M: SY='Y'; M=-19,-23,-31,-25,-22, 28,-27,  3, -5,-14, -4, -5,-22,-29,-15,-13,-21, -9,-12, 47, 59,-20;
/M: SY='R'; M=-13,-11,-16,-12, -7,-16,-21, -3,-19, 12,-16, -8, -4,-21,  0, 36, -4,  0, -8,-26,-10, -7;
/M: SY='R'; M=-14,-10,-30, -9, -1,-22,-14, -2,-26, 17,-20,-10, -3, -4,  3, 34, -8, -8,-20,-22,-12, -3;
/M: SY='V'; M= -1,-29,-11,-29,-28, -1,-29,-28, 26,-16,  8,  9,-28,-29,-27,-13,-10, -1, 45,-29,-10,-28;
/M: SY='R'; M= -5, -6,-21, -9, -2,-18,-18,-12,-14,  9,-15, -7, -2,-14,  3, 11,  4,  9, -7,-26,-11, -1;
/M: SY='L'; M=  0,-25,-10,-29,-22,  4,-26,-23, 15,-24, 22,  9,-23,-25,-21,-21,-15, -2, 16,-23, -5,-22;
/M: SY='T'; M= -5,  4,-19,  2, -1,-20,-16, -5,-22,  5,-19,-13,  3,-12, -1,  9,  8, 16,-12,-29,-11, -2;
/M: SY='G'; M=  2,-12,-17,-13,-21,-27, 52,-21,-33,-20,-25,-17, -4,-22,-21,-21, -1,-17,-21,-23,-28,-21;
/M: SY='T'; M= -6, -6,-15, -9, -3,-19,-14, -7,-17, -1,-15, -9, -3,-16,  2,  7,  5, 10, -9,-27,-12, -2;
/M: SY='F'; M=-18,-22,-22,-28,-25, 57,-21,-16, -5,-26,  5, -3,-16,-28,-33,-19,-18,-11, -5,  4, 24,-25;
/M: SY='D'; M=-11,  2,-16,  8, -5,-14,-20,-12, -9,-13,  6, -5, -8,-21,-11,-10,-13, -9, -5,-29,-11, -8;
/M: SY='H'; M= -9,  1,-27,  1,  1,-19,-11, 25,-21, -8,-19,-10,  4, -4, -1, -8, -4, -8,-21,-26, -1, -2;
/M: SY='D'; M= -7, 19,-25, 24, 11,-30, -1, -4,-30, -1,-25,-20, 13,-12,  4, -4,  5, -4,-25,-32,-19,  8;
/M: SY='R'; M=-12, -1,-29,  2,  8,-26,-11,  4,-26, 14,-22,-11, -1, -9,  6, 16, -7,-11,-20,-25,-12,  5;
/M: SY='E'; M= -8, 10,-26, 15, 28,-29,-16, -3,-25,  3,-22,-17,  5,  1, 15, -3,  6,  0,-25,-31,-18, 21;
/M: SY='V'; M= -5,-24,-10,-28,-22,  2,-27,-20, 14,-18, 15, 14,-21,-25,-18,-12,-15, -4, 16,-23, -5,-20;
/M: SY='L'; M=-12,-23,-24,-23,-16,  5,-28, -2,  8,-18, 18, 11,-21,-18,-11,-12,-21,-10,  1,-14, 11,-15;
/M: SY='V'; M= -2,-28,-15,-31,-25,  9,-28,-24, 22,-24, 22, 13,-27,-28,-25,-20,-17, -5, 27,-22, -3,-25;
/M:         M=-10,-10,-27, -9, -7,-10,  0, -7,-17, -7,-13, -8, -8,-12, -6, -3, -7,-10,-15,-15, -2, -8;
/M: SY='P'; M= -1, -7,-27, -7, -1,-18,-11,-11,-16, -7,-17,-13, -4, 18, -6, -9, -2, -4,-19,-24,-14, -6;
/M: SY='R'; M=-13,-12,-25,-13, -7,-17,-15, -8,-18, 13,-15, -8, -4,-20,  0, 38, -5, -3, -9,-23,-11, -7;
/M: SY='T'; M= -4, -9,-19,-11, -9,-14,-10,-10,-12, -4,-13, -8, -6,-11, -9, -4,  4,  9, -4,-26, -9,-10;
/M: SY='R'; M=-12, -6,-26, -4,  0,-17,-21, -3,-11,  5, -5, -1, -6,-18,  1, 12,-10, -8, -8,-25, -8, -1;
/M: SY='B'; M= -3,  1,-24,  1, -1,-16, -3,-11,-14,-11,-11, -9,  0,-10, -8,-14, -3, -8,-13,-26,-15, -5;
/M: SY='G'; M= -3,  4,-26,  7, -4,-27, 18,-13,-26,-10,-22,-16,  2,-15, -7,-12,  2, -8,-18,-27,-21, -6;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='D'; M=-10,  6,-26, 10,  6,-22,-14, -2,-20,  2,-19,-11,  2,  5,  6,  2, -2, -7,-20,-23,-10,  4; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='P'; M= -4, -2,-24, -2,  0,-22, -6, -6,-15, -5,-18,-10,  0,  3, -1, -9, -1, -5,-14,-26,-16, -2; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='G'; M=  4,-11,-27,-12,-20,-27, 58,-21,-33,-19,-26,-17, -3,-20,-20,-20,  0,-17,-22,-21,-28,-20;
/M: SY='Y'; M=-14,-24,-25,-28,-24, 38,-23, -6, -3,-19,  0, -3,-20,-28,-23,-16,-17, -8, -5, 21, 40,-23;
/M: SY='Y'; M=-17,-16,-31,-15, -3,  7,-24, 13,-13, -9, -5, -5,-14,-22, -5, -4,-18,-15,-18, 17, 26, -5;
/M: SY='V'; M=  4,-28,-13,-30,-26, -1,-27,-27, 25,-21, 14, 10,-27,-27,-25,-21,-11, -2, 36,-26, -9,-26;
/M: SY='L'; M=-10,-26,-21,-29,-21, 11,-29,-15, 18,-22, 24, 17,-24,-27,-15,-17,-20, -8, 14,-15,  7,-18;
/M: SY='T'; M=  3, -4,-13,-12, -9,-11,-19,-18, -6,-11, -7, -7, -3,-12, -7,-11, 15, 35,  0,-28,-10, -8;
/M: SY='P'; M=-10,-21,-39,-11, -1,-27,-21,-20,-17,-11,-24,-17,-21, 81,-11,-20,-11,-10,-27,-29,-28,-11;
/M: SY='F'; M=-12,-28, -9,-35,-25, 42,-28,-20,  5,-28, 20,  7,-23,-29,-29,-20,-21, -9,  3, -7, 12,-25;
/M: SY='R'; M= -8,-13,-24,-16, -7,-11,-22, -5, -3,  3, -5,  6,-10,-19,  0, 12, -9, -5,  0,-20, -3, -6;
/M: SY='L'; M= -8,-17,-16,-18,-15, -6,-26,-20,  4,-16, 10,  2,-17,-11,-15,-11,-11,  2,  5,-26, -9,-16;
/M: SY='D'; M= -4, 10,-26, 14, 10,-25,-16, -9,-16, -3,-14,-12,  3, -6,  1,-10, -2, -6,-15,-29,-16,  5;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='D'; M= -3, 18,-24, 25,  2,-29, 13, -8,-30, -7,-24,-21,  9, -7, -7,-13,  1,-10,-23,-28,-21, -3; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='S'; M=  2, -5,-11, -6, -4, -9, -2, -8, -8, -5, -8, -4, -2, -1, -4, -5,  6,  5, -5,-16, -9, -5; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='G'; M= -4, -5,-30, -3,-14,-27, 51,-14,-36,-16,-27,-19,  0,-19,-14,-17, -1,-18,-29,-18,-20,-14;
/M: SY='R'; M=-11, -2,-26, -1,  9,-18,-18, -5,-21, 10,-17,-11,  1, -7,  5, 16, -3, -6,-18,-25,-13,  6;
/M: SY='I'; M= -1,-19,-21,-25,-18,  0,-22,-19,  7,-13,  0,  6,-16,-14,-14,-13, -8, -1,  7,-12, -4,-17;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-19,-34,-28,  2,-34,-28, 35,-26, 23, 16,-26,-26,-24,-24,-18, -6, 34,-24, -4,-28;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-29,-20,  9,-29,-20, 18,-27, 37, 18,-28,-20,-20,-20,-26, -9, 10,-20, -1,-20;
/M: SY='V'; M= -1,-30,-13,-31,-30,  0,-31,-30, 33,-21, 11, 11,-29,-29,-29,-21,-11, -1, 47,-29, -9,-30;
/M: SY='N'; M=-11, 32,-21, 23,  3,-22, -7,  3,-18, -2,-24,-18, 38,-18, -3, -4,  5, -2,-20,-38,-19,  0;
/M: SY='R'; M=-16,-10,-29,-11, -1,-20,-19, -1,-29, 28,-19,-10, -1,-19,  9, 65, -9, -9,-19,-20,-11, -1;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='W'; M=-19,-35,-38,-38,-29, 30,-24,-24,-10,-22, -8,-11,-32,-30,-25,-19,-31,-21,-15, 90, 31,-23;
/M: SY='V'; M= -5,-30,-16,-33,-28,  6,-32,-28, 31,-24, 19, 13,-27,-28,-27,-22,-16, -4, 36,-24, -4,-28;
/M: SY='P'; M= -2,-14,-32, -8,  2,-27,-15,-16,-20, -6,-27,-18,-12, 54, -6,-11, -1, -5,-24,-30,-26, -5;
/M: SY='R'; M= -7, -7,-27,-10, -5,-14, -4, -8,-19, -2,-19,-12,  0,-11, -2,  6, -3, -8,-18,-13, -9, -5;
/M: SY='E'; M=-10,  8,-25, 13, 14,-21,-12, -7,-24,  1,-17,-15,  2,-11,  4, -1,  2, -1,-19,-28,-14,  9;
/M:         M= -7, -9,-26,-10, -8,-12,-14,-10,-14,  0,-14, -4, -7, -4, -5,  0, -8, -5,-12,-13, -6, -7;
/M: SY='R'; M= -6, -8,-26, -7, -7,-19, -2,-14,-19,  4,-18,-10, -6,-12, -6,  5, -6,-10,-10,-22,-14, -7;
/M: SY='E'; M= -4, 12,-25, 16, 19,-29,-12, -4,-26,  5,-24,-18,  8, -2,  9,  0,  5, -4,-23,-31,-19, 13;
/M: SY='P'; M= -3,-11,-28, -9,  1,-23,-18,  2,-15, -1,-18, -8, -8, 11,  3, -1, -4, -8,-15,-26,-13, -1;
/M: SY='S'; M=  3, -6,-19, -7,  0,-14,-15,-13,-12, -5,-14,-11, -4, -8, -5, -3,  7,  5, -6,-27,-14, -3;
/M: SY='T'; M=  3, -8,-21,-10, -2,-20,-15,-14,-13, -3,-17, -9, -7,  8, -2, -6,  7,  9, -9,-28,-17, -3;
/M: SY='R'; M= -9,-11,-28,-11,  2,-15,-20, -8,-16,  8,-14, -5, -7,  0,  3, 18, -7, -6,-15,-21,-11,  0;
/M: SY='P'; M=  2, -5,-25, -4,  0,-22,-16,-13,-11, -9,-11,-10, -7, 13, -2,-14, -2, -4,-13,-27,-18, -3;
/M: SY='P'; M= -4, -7,-28, -4,  2,-24,-13,-13,-21,  7,-19,-13, -7, 12, -2,  4, -4, -5,-18,-26,-18, -2;
/M: SY='G'; M=  1, -6,-24, -8, -6,-20,  7, -7,-20, -8,-19,-12, -1, -9, -5, -7,  2, -3,-16,-22,-13, -7;
/M:         M= -5, -5,-23, -8, -2,-10,-14, -4,-12, -9,-11, -8, -2, -5, -1, -9, -1,  0,-13,-22, -6, -2;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
/M: SY='P'; M= -1,-12,-21,-11, -5,-14, -9,-12, -8, -8,-10, -7,-11, 16, -3,-11, -5, -4,-12, -7,-11, -5; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='A'; M=  4, -5,-17, -5,  2,-18,  3, -9,-16,  1,-13, -9, -3,-10,  0,  1,  1, -4,-11,-17,-14,  0; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='G'; M=  3, -5,-25, -4, -4,-28, 21,-14,-27, -8,-24,-15, -2, -7, -4,-12,  4, -9,-20,-25,-23, -4;
/M: SY='P'; M= -6, -7,-25, -5,  6,-20,-19, -9,-12, -6,-17,-12, -6, 13, -3, -8,  1,  1,-11,-31,-17, -1;
/M: SY='V'; M= -6,-23,-18,-23,-18, -6,-27,-15, 13,-15,  7,  6,-21,-19,-14,-10,-11, -2, 21,-27, -8,-17;
/M: SY='T'; M= -5,  1,-20,  1,  7,-19,-20,-11,-15,  1,-11,-10, -3,-12,  1,  0,  2, 10, -8,-28,-13,  4;
/M: SY='V'; M= -5,-25,-18,-28,-25,  0,-25,-24, 25,-24, 19, 12,-21,-27,-23,-21,-16, -6, 26,-25, -7,-25;
/M: SY='T'; M= -4,-12,-19,-14, -5,-10,-20,-20,  1,-13, -1, -3,-12,-11,-12,-14, -1, 11,  6,-28,-12, -9;
/M: SY='G'; M=  5, -9,-21,-10,-18,-27, 44,-20,-29,-19,-23,-16, -3,-19,-18,-21,  0,-16,-21,-22,-26,-18;
/M: SY='V'; M= -1,-22,-20,-25,-18, -3,-25,-18, 11,-15, 10,  7,-20,-16,-15,-10,-12, -2, 12,-21, -4,-18;
/M: SY='L'; M=  5,-26,-18,-29,-22,  0,-24,-23, 17,-22, 20, 11,-25,-24,-19,-21,-16, -7, 17,-13, -5,-21;
/M: SY='R'; M= -9,-11,-25,-13, -4,-18,-18, -5,-17, 12,-14, -1, -5,-13,  6, 32, -4, -3,-11,-23,-11, -2;
/M: SY='P'; M=  0,-14,-27,-14, -7,-12,-14,-14,-10, -8, -7, -4,-15, 12, -8,-13,-10, -9,-13,-19,-10, -9;
/M: SY='P'; M= -4, -5,-25, -3, -6,-20,-10, -4,-15,-10,-15,-10, -4,  2, -7, -9,  0, -2,-12,-29,-14, -9;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='E'; M= -3,  4,-24,  9, 29,-23,-17, -7,-20,  2,-12,-13, -4, -1,  7, -5, -2, -5,-19,-26,-16, 18; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='S'; M=  0,  1,-19,  1,  1,-22,-10,-11,-20,  3,-24,-15,  3,  6, -1, -3, 12,  9,-15,-30,-17, -1; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='P'; M=-10,-12,-29, -9, -1,-20,-10,-13,-21,  2,-21,-14, -9, 14, -4,  7, -6, -4,-19,-14,-15, -5; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='G'; M= -4,-12,-26, -9, -6,-21, 10,-16,-19,-11,-16,-11, -8,  6, -9,-13, -3, -9,-16,-24,-20, -8; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='A'; M=  3,-12,-21,-13, -9,-14, -5,-12,-10,-10,-13, -8, -8, -8, -4, -9,  3, -3, -8,-13, -8, -7; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='F'; M= -8,-21,-17,-24,-20, 24,-16,-16,  2,-22,  7,  1,-16,-24,-23,-16, -9, -4,  4,-11,  7,-20; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='L'; M= -3,-17,-18,-20,-15, -1,-10,-10, -2,-15,  5,  3,-13,-21,-12,-10, -9, -4,  1,-19, -5,-14; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='P'; M= -8,-19,-29,-17,-12,-16, -5,-17,-10,-11,-11, -5,-16, 16,-12,-10,-12,-11,-12,-15,-16,-14; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='A'; M=  5, -1,-20, -2,  1,-20,-11,-11,-19,  5,-19,-12, -2,-11,  1,  1,  5,  0,-12,-15,-12,  1; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='N'; M=-11, 26,-24, 22,  6,-25, -1,  5,-26,  3,-27,-19, 30,-11,  1, -1,  3, -6,-27,-32,-17,  3; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='D'; M=-10, 17,-23, 26, 10,-25, -8, -7,-23, -5,-18,-17,  6, -4, -3,-10,  1, -3,-18,-31,-17,  3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='P'; M= -3,-17,-27,-17,-11, -9, -8,-16, -7,-12,-12, -8,-13, 18,-13,-14, -8, -9,-11,-16,-10,-14; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='E'; M=  1,  1,-25,  3,  9,-21,-10, -8,-20,  1,-18,-14, -2,-13,  3, -6, -1, -7,-16,-15,-10,  6;
/M: SY='R'; M= -9,  0,-26, -3,  2,-26, -9, -5,-25, 14,-23,-11,  5, -9, 11, 19,  1, -1,-21,-25,-14,  5;
/M: SY='N'; M=-11,  9,-26,  4, -3,-23,  6, -2,-26,  2,-21,-14, 18,-19,  0, 13, -2, -9,-25,-28,-18, -3;
/M: SY='L'; M= -4,-18,-23,-21,-15,-11,-11,-13,  1,-13,  3,  2,-13,-22,-10, -5,-10, -8,  3,-23,-10,-14;
/M: SY='W'; M=-16,-31,-35,-34,-27, 19,-18,-22, -7,-19, -7, -5,-27,-27,-21,-15,-26,-19,-11, 62, 19,-22;
/M: SY='Y'; M=-12,-10,-25,-10, -9,  4,-18,  3, -9,-11, -2, -2,-10,-22, -1, -9, -9, -6,-12, -7, 19, -6;
/M: SY='Y'; M= -5,-14,-23,-17,-13, -2,-20, -8, -3, -9, -8, -4,-10,-21, -4, -6, -5, -3, -3,  0,  9, -9;
/M: SY='R'; M= -3,-10,-23,-11, -8,-14,-19,-12, -7,  2, -4, -3, -7,-15, -6, 10, -9, -7, -3,-24,-11, -9;
/M: SY='D'; M=-15, 31,-26, 40, 10,-28,-12,  6,-31,  1,-26,-22, 17,-13,  0, -6,  2, -3,-24,-32, -9,  4;
/M: SY='L'; M= -7,-24,-21,-25,-17,  0,-28,-16, 17,-23, 21, 10,-22,-25,-17,-18,-17, -7, 14,-18, -3,-18;
/M:         M=  0, -9,-25, -9, -4,-16,-19,-12, -7, -3, -6, -5, -9, -1, -4, -6, -8, -7, -8,-22,-10, -5;
/M: SY='E'; M= 12,  6,-21,  2, 14,-26, -9, -5,-20,  1,-18,-13,  6,-10, 10, -4,  5, -5,-18,-26,-18, 12;
/M: SY='M'; M= -3,-19,-20,-27,-18,  4,-22,-13, 11,-15, 11, 20,-16,-20,-11,-11,-11, -3,  7,-19, -2,-15;
/M: SY='A'; M= 24,-13,-11,-19,-11,-11, -4,-20,-11,-13,-11,-11,-11,-15,-13,-18,  4, -1, -3,-13,-14,-11;
/M: SY='R'; M= -1, -5,-26, -4, 10,-27,-15, -5,-23, 12,-21,-11, -2, -4, 16, 17,  1, -5,-20,-24,-15, 11;
/M: SY='A'; M= 12, -7,-18, -9, -5,-14,-13, -8, -8, -8, -7, -6, -8,-15, -7,-13,  1, -2, -3,-22, -6, -7;
/M:         M= -2, -5,-21, -6, -7, -9,-17, -5,-10, -6, -7, -6, -5,-18, -7, -2, -3, -1, -5,-22, -4, -8;
/M: SY='G'; M=  5, -9,-26,-10,-12,-26, 38,-19,-29, -8,-24,-15, -4,-17,-14,-13, -1,-14,-19,-21,-24,-13;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='T'; M=  0,-10,-14, -9, -5,-15,-20,-18, -6,-10, -5, -7,-13, -4,-11,-11, -4,  2,  0,-28,-15, -9;
/M: SY='A'; M= 12, -2,-18, -8, -4,-17, -6, -7,-12,-10,-10, -9,  1,-10, -7,-13,  3,  1, -9,-27,-15, -6;
/M: SY='P'; M=-10,-13,-35, -8, -6,-21, -3,-11,-24,-12,-25,-17,-12, 32, -8,-16, -8,-11,-27,-13,-17, -9;
/M: SY='I'; M=-10,-26,-22,-28,-21, 14,-31,-17, 17,-21, 11,  7,-23,-20,-21,-19,-17, -7, 16,-11, 12,-23;
/M: SY='Y'; M= -9,-20,-23,-23,-16, 12,-26, -9,  3,-14,  3,  2,-17,-18,-10,-10,-12, -4,  1, -7, 15,-14;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-21,-32,-25,  6,-31,-26, 24,-25, 22, 12,-28,-22,-23,-22,-21, -8, 21,-13, -2,-25;
/M: SY='D'; M= -4,  9,-22, 12,  7,-19,-16, -6,-14, -5,-10, -8,  1,-14, -1,-10, -2, -4,-10,-27,-10,  3;
/M: SY='A'; M=  5, -6,-22, -7,  5,-15,-11,-13,-11, -3, -8, -5, -9,-13, -5, -9, -4, -8, -6,-22,-13,  0;
/M:         M= -4, -6,-21, -5, -2,-16, -8,-13,-10,-10, -4, -6, -6,-18, -5, -8, -3, -3, -6,-27,-14, -4;
/M: SY='Y'; M=-11, -3,-28, -1,  3, -9,-20,  5,-16, -3,-12, -7, -6,-11,  8, -5, -7, -9,-19,-12, 10,  5;
/M: SY='E'; M= -5,  6,-24, 13, 17,-24,-16, -9,-20, -4,-16,-16, -1,  0,  3, -9,  4,  0,-17,-32,-18,  9;
/I:         I=-2; MD=-5;
/M: SY='P'; M= -5, -4,-15, -4, -3, -7, -4, -1, -7, -7, -8, -2, -3,  1, -1, -7, -3, -5, -9,-12, -5, -3; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M: SY='P'; M= -2, -5,-25, -7, -3,-17,-12, -8,-13, -6,-15, -6, -4,  5, -4,-11, -1, -1,-13,-26,-13, -5;
/M: SY='N'; M= -3, -4,-24, -8, -5,-16,-11,-12,-13, -5,-14,-11,  2, -4, -7, -3, -2, -1,-13,-17,-14, -7;
/M: SY='D'; M=  5,  3,-23,  7,  2,-27,-12,-12,-19, -2,-21,-15, -3,  7, -2,-10,  3, -4,-13,-30,-20, -1;
/M:         M= -1, -7,-24, -9, -8,-20, -2,-13,-14, -6,-13, -8, -4, -9, -5, -2, -3, -6,-11,-24,-17, -8;
/M: SY='G'; M= -5,-11,-31, -8, -6,-26, 23,-12,-29,-12,-24,-17, -6,  9,-11,-12, -3,-13,-26,-25,-24,-10;
/M: SY='L'; M= -7,-22,-26,-22,-17, -1, -4,-18, -4,-18,  3, -2,-18,-24,-17,-14,-16,-13, -4, -1, -2,-17;
/M: SY='P'; M= -8,-12,-34, -4,  3,-28,-12,-15,-20, -9,-23,-17,-13, 50, -4,-16, -5, -9,-26,-29,-25, -4;
/M: SY='I'; M= -4,-20,-21,-25,-17, -6,-27,-19, 13,-13,  9,  7,-16,-21,-11, -5,-10,  0, 13,-23, -6,-16;
/M: SY='G'; M= -5, -2,-31,  4, -7,-31, 31,-16,-34,-14,-30,-22, -1,  9,-13,-18,  0,-14,-29,-27,-28,-11;
/M: SY='G'; M= -6,-12,-29,-12,-10,-20, 16,-11,-24,-10,-18,-12, -8,-19, -8, -9, -7,-12,-19, -4,-13, -9;
/M: SY='P'; M= -9, -7,-28, -6, -2,-21,-20,-12,-10, -4,-13, -8, -6, 18, -2, -9, -8, -7,-13,-28,-17, -4;
/M: SY='T'; M= -5,-11,-19,-15,-13,-10,-11,-13, -7,-14,  0, -3, -8,-13,-12,-10,  0, 15, -4,-25, -9,-13;
/M:         M= -5, -6,-22, -9,-12,-11,-13,-11, -4, -7, -6, -3, -3,-14,-11, -6, -7, -4, -2,-24, -8,-12;
/M: SY='V'; M=  1,-17,-19,-18,-13, -9,-23,-22, 12,-17,  4,  2,-17,-12,-16,-19, -6, -1, 15,-27,-11,-16;
/M: SY='H'; M=-11, 12,-23, 12,  6,-19,-16, 13,-19, -7,-13, -8,  9,-14,  0, -7,  1,  1,-17,-32, -8,  3;
/M: SY='L'; M= -7,-27,-23,-31,-22, 11,-24,-23, 17,-27, 23, 11,-23,-20,-22,-22,-20, -9, 10,-17, -1,-23;
/M: SY='R'; M= -4, -5,-26, -4,  0,-20,-16,-11,-23, 12,-22,-14, -4,  5, -1, 13, -2, -3,-17,-24,-14, -2;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='N'; M= -5, 24,-22, 16,  5,-23, -5,  1,-21, -2,-26,-19, 31, -1, -1, -6,  7, -2,-25,-34,-20,  1; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='D'; M=-11, 11,-25, 13,  8,-24,-14, -3,-21,  2,-20,-14, 10, -8,  4,  7,  1, -5,-19,-32,-16,  5;
/M: SY='H'; M=-18,  5,-27,  1, -2,-13,-17, 74,-26,-10,-20, -4, 17,-21,  5, -1, -7,-15,-28,-29, 13, -2;
/M: SY='L'; M= -9,-25,-19,-26,-18, 11,-27,-17, 12,-26, 34, 12,-23,-27,-18,-18,-20, -2,  6,-18,  4,-18;
/M: SY='Q'; M= -1,  1,-23, -1,  8,-26,  2, -5,-20, -4,-20, -9,  4,-13, 11, -6,  6, -5,-19,-27,-18,  9;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='A'; M= 24,-14,-16,-22,-14,-13, -6,-21,  0,-16,  0, -3,-12,-15,-13,-20,  2,  0,  3,-22,-14,-14;
/M: SY='I'; M= -2,-27,-18,-32,-26,  4,-31,-27, 29,-24, 16, 11,-23,-24,-24,-23,-13, -3, 29,-22, -4,-26;
/M: SY='T'; M= -4, -1,-17, -7,  1,-13,-21,-11,-13, -5,-12, -8, -1,-10,  7, -5, 11, 28, -9,-25, -8,  5;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='F'; M=-19,-28,-26,-34,-27, 55,-30, -9,  2,-23,  6,  0,-21,-29,-28,-18,-21,-11, -3, 22, 43,-26;
/M: SY='G'; M= 11, -8,-17,-11,-11,-19, 15,-17,-17,-15,-17,-13, -1,-15,-11,-16, 14,  5,-10,-28,-20,-11;
/M: SY='L'; M=-12,-29,-21,-33,-23, 23,-30,-19, 18,-29, 38, 18,-27,-29,-23,-20,-27,-10,  9,-14,  6,-22;
/M: SY='A'; M= 29, -8,-11,-15,-10,-18,  1,-19,-11,-11,-14,-11, -5,-12,-10,-17, 15,  8, -1,-26,-19,-10;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='A'; M= 16,-14,-12,-20,-15, -6, -8,-18,  4,-14,  0, -1,-12,-14,-14,-17, -1,  0,  9,-16, -9,-15; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='A'; M= 13,-17,-16,-23,-17, -5, -5,-19,  0,-18,  6,  4,-16,-19,-16,-18, -6, -3,  4,-20,-11,-16;
/M: SY='V'; M=  5,-23,-14,-25,-20,  3,-21,-22, 12,-21, 12,  5,-20,-24,-21,-18, -6, -1, 19,-24, -7,-20;
/M: SY='V'; M=  4,-18,-18,-21,-16, -8,-19,-22,  5,-18,  6,  0,-17, -6,-17,-18, -5,  6,  7,-25,-12,-17;
/M: SY='I'; M=  1,-22,-20,-29,-22,  7,-26,-20, 19,-21,  9,  9,-17,-21,-19,-21, -9, -3, 15,-16,  2,-22;
/M: SY='F'; M= -1,-22,-23,-27,-22,  8, -6,-17,  2,-20,  4,  5,-17,-23,-19,-19,-13,-11,  1, -5,  4,-21;
/M: SY='L'; M= -5,-25,-22,-28,-21,  9,-20,-13,  9,-20, 20, 16,-24,-26,-16,-17,-21,-10,  4, -3,  9,-18;
/M: SY='W'; M= -5,-26,-33,-28,-24,  1, -7,-19, -7,-19, -8, -8,-23,-25,-18,-19,-20,-17,-11, 45, 14,-20;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='V'; M= -2,-15,-12,-17,-14,  7,-16,-11,  6, -9,  4,  2,-12,-16,-13, -4, -8, -4, 10, -9,  2,-14; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='Y'; M= -3,-12, -5,-13,-12, -1, -3, -8, -4,-11,  1, -2,-11,-15,-10,-10, -9, -7, -3,  1,  3,-11; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='F'; M=-10,-27,-24,-30,-24, 22,-27,-16,  6,-17,  5,  1,-24,-27,-22,-16,-19,-10,  7, 16, 22,-23;
/M: SY='R'; M=-19,-11,-30,-11, -1,-14,-21,  2,-27, 23,-19, -9, -2,-14,  5, 52,-11,-11,-20,-19, -7, -2;
/M: SY='R'; M= -9, -6,-26, -9, -3,-18,-13,  0,-19, 13,-12, -3,  1,-18,  4, 24, -9, -9,-16,-22, -9, -2;
/M: SY='Y'; M= -4,-15,-23,-18, -9, -1,-13,-10, -4,-11,  1, -1,-12,-20, -8, -9, -8, -7, -6,-13,  3, -9;
/M: SY='R'; M= -3, -6,-24, -8, -3,-21, -7, -9,-23, 15,-20,-11,  0,-16,  1, 25, -1, -6,-14,-23,-14, -3;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_09 which contains 546'439 sequence entries.


Total number of hits 22 in 22 different sequences
Number of true positive hits 22 in 22 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
22 sequences

SHY1_SCHPO  (Q9Y810), SHY1_YEAST  (P53266), SURF1_ARATH (Q9SE51), 
SURF1_CAEBR (A8Y2C9), SURF1_CAEEL (Q9N5N8), SURF1_CHICK (Q800L1), 
SURF1_DICDI (Q556J9), SURF1_DROME (Q9U4F3), SURF1_HUMAN (Q15526), 
SURF1_MONBE (A9UWF0), SURF1_MOUSE (P09925), SURF1_RAT   (Q9QXU2), 
SURF1_RICBR (Q1RJM4), SURF1_RICCN (Q92GL0), SURF1_RICFE (Q4UN32), 
SURF1_RICPR (Q9ZCJ8), SURF1_TAKRU (O57593), SURF1_XENTR (A4IHH4), 
SURFL_ARATH (Q9LP74), Y2235_MYCTO (P9WGA6), Y2235_MYCTU (P9WGA7), 
Y2259_MYCBO (P66884)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission