Entry: PS50909

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] GAT
Accession [info] PS50909
Entry type [info] MATRIX
Date [info] NOV-2004 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50909
Associated ProRule [info] PRU00373

Name and characterization of the entry

Description [info] GAT domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=128;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=123;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2406266; R2=0.0125046; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4968.66265; R2=37.48059; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=501; N_SCORE=8.5; H_SCORE=20748; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=341; N_SCORE=6.5; H_SCORE=17750; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-7; D=-100; I=-100; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D'; M=-12, 14,-27, 20, 14,-26, -9, -3,-26,  1,-17,-16,  8,-14,  4,  3, -2, -8,-23,-31,-16,  8;
/M: SY='E'; M=-11,  6,-29, 12, 30,-24,-23, -7,-14,  0,-13,-12, -1, -7,  7, -5, -3, -6,-16,-29,-15, 17;
/M: SY='A'; M= 16, -4,-20, -5, 16,-22,-13,-13,-12, -1,-12,-11, -7, -8,  1,-10,  2, -5, -8,-24,-17,  8;
/M: SY='Q'; M=-12,  3,-29,  4, 13,-30,-19, 18,-24, 16,-21, -2,  2,-12, 26, 11, -6,-12,-24,-24, -5, 19;
/M: SY='S'; M= 17, -2,-14, -4,  3,-22, -4,-11,-19, -4,-23,-16,  3, -9,  3, -8, 24,  9,-10,-32,-19,  3;
/M: SY='A'; M= 24, -8,-17,-14, -4,-22,-10,-16,-13,  8,-15, -8, -8,-12, -2, -4,  2, -4, -3,-21,-16, -3;
/M: SY='K'; M=-10,-11,-25,-14, -4,-14,-22,-10, -7, 18,  0, 13,-11,-17,  1, 10,-17,-10, -6,-20, -5, -1;
/M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21, 15,-30,-20, 19,-30, 47, 19,-29,-30,-21,-20,-29,-10,  9,-18,  2,-21;
/M: SY='Q'; M=  7, -1,-23, -2, 15,-29,-14, -5,-20,  9,-19, -9, -2, -8, 20,  1,  4, -2,-18,-23,-15, 18;
/M: SY='E'; M= -7,  1,-28,  5, 30,-27,-18, -2,-28, 17,-20,-14, -1, -8, 16, 20, -3, -9,-24,-25,-16, 22;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,  5,-35,-25, 35,-30, 35, 20,-25,-25,-20,-25,-25,-10, 20,-20,  0,-25;
/M: SY='R'; M=-10, -4,-27, -5,  3,-23,-16, -5,-28, 30,-24,-11,  2,-15,  8, 42, -4, -6,-18,-23,-12,  3;
/M: SY='R'; M= -2, -4,-18, -4,  0,-20, -8, -6,-24,  6,-26,-16,  6,-14,  4, 22, 20,  8,-14,-32,-16,  0;
/M: SY='G'; M= -2,  4,-25, -1,-11,-26, 36,-11,-31, -9,-29,-19, 15,-18,-11,-11,  7, -8,-26,-28,-25,-11;
/M: SY='H'; M=-11,  3,-24, -2,  0,-20,-16, 18,-24, 10,-21,-10, 11,-16,  4, 18,  1,  3,-19,-28, -5,  0;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='E'; M= -7,  9,-28, 17, 40,-29,-18, -1,-26,  7,-18,-14,  0, -5, 16,  1, -1, -9,-25,-29,-18, 28;
/M: SY='D'; M=-19, 49,-29, 64, 17,-37, -9,  1,-37,  0,-30,-29, 25,-11,  0, -9,  1, -9,-30,-40,-20,  9;
/M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21, 19,-30,-20, 17,-30, 45, 17,-29,-30,-23,-20,-29,-10,  9,-16,  4,-21;
/M: SY='Q'; M= -5, -3,-27, -3, 15,-29,-17, -1,-24, 18,-20, -8, -1,-11, 24, 24, -3, -9,-22,-21,-13, 18;
/M: SY='E'; M=  4,  3,-24,  5, 31,-25,-15, -7,-24,  7,-17,-16, -2, -5,  9,  1,  3, -2,-19,-26,-18, 19;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='K'; M= -9, -2,-27, -5,  2,-21,-18, -3,-22, 25,-16, -7,  2,-16,  4, 23, -9, -9,-16,-22, -9,  2;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='M'; M=-10,-25,-24,-34,-24,  1,-30,-15, 33,-20, 22, 39,-21,-21,-10,-20,-21,-10, 19,-20,  0,-20;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 11,-31,-20, -7,-29, 45,-29, -9,  0,-10, 16, 27, -9,-10,-21,-20,-10, 14;
/M: SY='I'; M= -6, -9,-20,-13, -8, -7,-24,-14, 10,-13, -3, -1, -5,-19,-11,-14, -3,  1, 10,-26, -5,-11;
/M: SY='M'; M=-11,-22,-21,-29,-19,  1,-23, -6, 18,-13, 24, 44,-21,-22, -5, -8,-22,-10,  9,-20, -1,-13;
/M: SY='A'; M= 23,-19,-12,-25,-19, -8,-15,-20,  8,-14,  0,  3,-19,-20,-17,-19, -2, -1, 19,-21, -9,-18;
/M: SY='G'; M= -2, -5,-29, -5,  0,-30, 25,-11,-32,  1,-26,-14, -1,-15,  3, -1, -1,-14,-26,-21,-21,  1;
/M: SY='Y'; M=-15, -7,-25, -7,  7, 14,-24, -3,-13, -8, -7, -9, -9,-17, -4, -9, -8, -4,-15, -6, 16,  2;
/M: SY='D'; M=-14, 24,-30, 35, 29,-34,-16, -3,-34, 17,-27,-21,  8, -7,  9,  4, -3,-10,-27,-31,-17, 19;
/M: SY='E'; M= -5,  9,-26, 13, 33,-30,-18, -2,-25,  5,-19,-14,  1, -5, 21, -1,  3, -1,-24,-28,-16, 27;
/M: SY='E'; M=-10, 11,-28, 17, 18,-28,-15,  6,-31, 14,-24,-16,  6,-11,  8, 14, -2, -9,-24,-29,-13, 11;
/M: SY='R'; M=-12,  7,-25,  1,  3,-23,-13,  0,-25, 21,-25,-13, 16,-16, 10, 31,  0, -3,-22,-27,-13,  5;
/M: SY='M'; M= -5,-10,-21,-17,-12,-10,-21,-14,  5, -5,  1, 11, -6,-16, -6, -7, -5,  3,  2,-25, -7,-10;
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='E'; M= -5,  1,-25,  5, 19,-21,-19, -8,-15,  0,-12,-11, -5, -6,  5, -6, -3, -7,-13,-27,-14, 12;
/M: SY='Q'; M= -7, -1,-26,  0,  8,-23,-19, -5,-16,  8,-16, -5, -3, -9, 16,  2, -3, -6,-16,-23, -9, 12;
/M: SY='I'; M= -2,-18,-24,-21,-13, -8,-24,-17,  9,-11, -1,  2,-14, -6,-12,-13, -9, -6,  6,-20, -4,-15;
/M: SY='S'; M=  4, -1,-20, -1,  0,-22, -5, -9,-19,  2,-19,-12, -1,-13, -3, -3,  7,  1,-10,-28,-15, -2;
/M: SY='K'; M= -7, -2,-27, -1, 14,-25,-19, -6,-21, 18,-16, -7, -3,-12, 15, 14, -5, -7,-18,-23,-12, 14;
/M: SY='R'; M= -6,-14,-22,-16, -7,-10,-21, -6, -4, -4,  3,  2,-10,-17, -4,  4, -8, -3, -4,-24, -7, -7;
/M: SY='R'; M= -2,-16,-20,-18,-11, -9,-21, -9, -2, -3,  2,  2,-12,-21, -7,  5, -9, -4,  3,-23, -6,-11;
/M: SY='S'; M=  6,  2,-17, -1,  4,-18, -9, -6,-17, -4,-17,-13,  8,-12,  0, -5, 13,  6,-13,-31,-16,  2;
/I:         I=-30; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E'; M= -1,  6,-24, 11, 22,-25,-16, -8,-20,  2,-16,-14,  0, -8,  5, -3,  2, -3,-16,-29,-17, 13;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-33,-24, 10,-32,-23, 27,-29, 37, 19,-27,-27,-21,-22,-25, -9, 18,-19,  1,-24;
/M: SY='E'; M= -7, 16,-22, 22, 26,-31,-13, -2,-28,  3,-22,-18,  6, -8, 12, -3,  2, -6,-25,-31,-18, 19;
/M: SY='E'; M= -7, -5,-24, -5,  8,-18,-21, -7, -8,  6,-12, -4, -3,-13,  1,  0, -3, -5, -6,-27,-11,  4;
/M: SY='V'; M= 12,-23,-14,-27,-22, -5,-21,-25, 16,-18,  8,  6,-22,-22,-20,-20, -7, -1, 24,-20,-10,-22;
/M: SY='R'; M= -9, -1,-26, -4,  3,-23,-16, -3,-23, 20,-22,-10,  7,-15, 11, 31, -1, -5,-18,-25,-12,  5;
/M: SY='N'; M= -7,  7,-23,  1,  0,-21,  2, -4,-20, -1,-20,-10, 15,-16,  1,  3,  4, -1,-20,-29,-17,  0;
/M: SY='N'; M= -1,  8,-19,  0, -3,-18,-11, -4,-13,  4,-19,-11, 17,-16, -3, -1,  6,  2,-12,-31,-14, -3;
/M: SY='V'; M=  8,-20, -9,-26,-20, -3,-20,-20, 11,-17,  7, 11,-19,-21,-17,-18, -6,  0, 17,-24, -9,-19;
/M: SY='D'; M= -9, 11,-27, 15, 13,-28,-12, -5,-28, 15,-23,-16,  6,-11,  7, 11, -1, -5,-22,-28,-15, 10;
/M: SY='L'; M= -7,-26,-18,-27,-21,  1,-26,-21, 20,-22, 25, 13,-24,-28,-19,-17,-19, -7, 20,-24, -5,-20;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-21, 13,-28,-17, 18,-25, 35, 23,-27,-25,-19,-18,-25, -9, 11,-18,  1,-20;
/M: SY='S'; M=  1,  2,-19,  0,  2,-21,  0, -7,-21, -3,-21,-12,  8,-13, -1, -4, 13,  5,-15,-31,-17,  0;
/M: SY='E'; M= -8, 12,-27, 18, 37,-30,-16,  3,-27,  5,-21,-17,  5, -5, 18, -2,  4, -5,-26,-31,-17, 27;
/M: SY='M'; M= -9,-21,-20,-29,-20,  3,-24, -9, 18,-12, 16, 39,-20,-21, -8,-10,-17, -6, 13,-20, -1,-14;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-29,-20,  8,-29,-18, 19,-25, 40, 19,-28,-29,-19,-16,-26, -9, 13,-20,  1,-20;
/M: SY='N'; M= -4,  5,-20,  2,  0,-20, -9, -4,-14, -7,-13, -7,  7,-12,  2, -8,  6,  4,-14,-30,-14,  1;
/M: SY='S'; M=  4,  4,-16,  3,  9,-23, -9, -3,-19, -4,-19,-11,  4,-11,  5, -8, 11,  3,-15,-31,-16,  7;
/M: SY='Y'; M= -9,-13,-23,-16,-11,  0,-22,  1,  1,-11,  1,  5,-10,-19, -7,-10, -9, -3, -1,-15, 10,-11;
/I:         I=-18; MD=-18;
/M: SY='D'; M= -6, 10,-19, 14,  5,-21,-11, -3,-18,  2,-17,-12,  6,-11,  1,  2,  3, -1,-11,-27,-12,  2; D=-18;
/I:         I=-18; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='P'; M= -5,-10,-22, -7, -2,-15, -9, -9,-13, -3,-13, -9, -9, 24, -3, -4, -5, -6,-15,-17,-12, -5; D=-18;
/I:         I=-18; DM=-18;
/M: SY='G'; M= -3, -6,-24, -4, -2,-23, 16,-12,-24, -8,-21,-14, -3,  5, -6, -9,  1, -8,-21,-22,-21, -5; D=-18;
/I:         I=-18; DM=-18;
/M: SY='Q'; M= -3,  5,-23,  5,  6,-25, -3, -1,-22,  1,-22,-13,  7, -3,  8, -3,  3, -5,-21,-25,-14,  6; D=-18;
/I:         I=-18; DM=-18;
/M: SY='E'; M= -3, -1,-24,  1, 10,-20,-17,  0,-20,  1,-18,-12, -2, -3,  4, -2,  2,  0,-16,-25, -9,  6;
/M: SY='E'; M= -2,  6,-24,  8, 15,-25,-13, -7,-22,  6,-23,-16,  5, -3,  4, -1,  6, -1,-18,-30,-18,  9;
/M: SY='A'; M=  1, -5,-25, -4, -5,-18, -5, -9,-14,-13,-14,-10, -4, -1, -7,-15, -1, -7,-13,-25,-15, -7;
/M: SY='A'; M=  3, -4,-20, -2, -4,-15,-12,-14, -9,-12, -4, -8, -6,-12, -9,-14,  0, -2, -5,-26,-14, -7;
/M: SY='D'; M=-10, 18,-26, 25, 14,-30, -9, -5,-29,  7,-27,-20, 10, -9,  4,  0,  4, -4,-22,-33,-18,  9;
/M: SY='B'; M=-10, 12,-25, 12, 10,-22,-10, -3,-18, -3,-14,-11, 10,-14,  4, -6, -1, -6,-19,-29,-13,  7;
/M: SY='E'; M= -9, 16,-28, 26, 38,-31,-14, -2,-29,  5,-20,-19,  4, -5, 13, -4,  0, -9,-27,-31,-19, 25;
/M: SY='L'; M= -2,-23,-16,-26,-20,  5,-26,-22, 14,-23, 25,  9,-22,-24,-20,-18,-13,  3, 14,-22, -4,-20;
/M: SY='L'; M= -7,-24,-21,-29,-22,  6,-29,-19, 21,-23, 25, 17,-22,-24,-17,-20,-17, -2, 15,-19,  2,-21;
/M: SY='Q'; M= -4, -4,-21, -5,  1,-22,-19, -6,-10,  2,-12, -4, -5,-15,  9,  0,  0,  0, -5,-26,-11,  5;
/M: SY='E'; M=-11, 15,-27, 24, 31,-29,-17, -4,-26,  5,-20,-18,  3, -7,  9, -1,  1, -5,-21,-32,-18, 20;
/M: SY='L'; M= -9,-28,-19,-30,-21, 13,-29,-20, 18,-26, 37, 18,-27,-28,-20,-17,-25, -9, 12,-18,  1,-21;
/M: SY='Y'; M= -6,-15,-16,-19,-19,  9,-24, -4,  4,-13, -1,  0,-13,-25,-14,-13, -9, -2,  6, -7, 21,-18;
/M: SY='E'; M= -5,  7,-24, 10, 19,-26,-11, -3,-24,  5,-22,-15,  5,-10, 11,  1,  7, -2,-20,-29,-14, 15;
/M: SY='Q'; M= -2, -2,-16, -5,  3,-24,-15, -6,-19,  5,-18, -9,  1,-13, 13, 11,  6,  4,-15,-26,-14,  7;
/M: SY='C'; M= -9,-22, 74,-28,-26,-14,-26,-27,-17,-28, -6,-11,-21,-32,-27,-27,-13, -9, -5,-41,-23,-27;
/M: SY='R'; M=-11, -4,-27, -3, 11,-23,-20, -6,-23, 22,-20,-10, -1,-13,  9, 27, -3, -5,-17,-23,-11,  8;
/M: SY='S'; M=  1, -2,-19, -4,  3,-18,-14, -7,-16,  1,-18, -9,  0,-12,  6, -1,  9,  6,-10,-27,-12,  4;
/M: SY='M'; M=  4,-11,-17,-17,-11, -7,-14, -3, -1,-10,  1, 12, -9,-18, -3,-11, -4, -4, -3,-19,  0, -8;
/M: SY='Q'; M=-11, -2,-29, -2, 12,-32,-19, 11,-23, 14,-20, -3,  0,-13, 37, 20, -2, -9,-25,-22, -8, 24;
/M: SY='P'; M=-11, -7,-32, -3, 11,-29,-17, -5,-24,  6,-24,-13, -5, 23, 13,  7, -3, -7,-26,-26,-18,  9;
/M: SY='R'; M= -9, -7,-23,-10, -4,-17,-20,-10,-17, 14,-14, -7, -1,-16,  1, 26, -2,  5, -9,-24,-10, -4;
/M: SY='I'; M= -9,-27,-22,-34,-27, 12,-33,-25, 30,-26, 21, 15,-22,-26,-24,-23,-19, -7, 24,-19,  1,-27;
/M: SY='M'; M= -9,-16,-22,-19,-10,  0,-24, -8,  3, -9,  4, 12,-15,-21,  2, -6,-12, -7,  1,-17,  1, -4;
/M: SY='R'; M=-13,  5,-29,  8, 14,-27,-13,  6,-29, 17,-23,-12,  4,-13, 11, 20, -5,-10,-24,-25,-11, 11;
/M: SY='L'; M=-11,-27,-23,-30,-22, 10,-31,-16, 22,-25, 32, 20,-25,-26,-18,-20,-24, -8, 12,-14,  9,-21;
/M: SY='I'; M=  2,-25,-11,-31,-24, -4,-28,-26, 23,-23, 12, 10,-22,-20,-20,-24,-12, -5, 22,-25, -8,-24;
/M: SY='E'; M= -5,  4,-23,  5, 18,-24,-11, -2,-21,  0,-21,-13,  6, -4,  8, -1,  9,  0,-20,-32,-17, 12;
/M: SY='E'; M= -6,  4,-22,  7, 14,-19,-17, -2,-20, -1,-15,-13,  1,-11,  3, -2,  5,  4,-15,-29,-11,  8;
/I:         I=-30; MD=-32;
/M: SY='T'; M= -1, -9,-14,-12, -6, -9,-21,-18,  0,-12,  0, -2,-10,-15,-10,-12,  3, 17,  7,-28,-10, -8; D=-30;
/I:         I=-30; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='S'; M= -1,  2,-21,  2,  4,-23, -3, -4,-20, -4,-20,-13,  4,-13,  2, -4,  9,  2,-14,-30,-16,  3;
/I:         I=-24; MD=-25;
/M: SY='D'; M=-13, 22,-25, 33, 16,-28,-11,  3,-27,  0,-22,-19,  7, -1,  4, -7, -2, -9,-24,-23,-13, 10; D=-24;
/I:         I=-24; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='B'; M=-10, 28,-19, 27,  7,-21, -5,  5,-21, -2,-21,-17, 26,-12,  0, -4,  5, -3,-21,-31,-14,  4; D=-24;
/I:         I=-24; DM=-25;
/M: SY='D'; M=-15, 28,-30, 41, 40,-34,-15,  3,-34,  5,-25,-24, 10, -5, 11, -4,  0,-10,-30,-35,-19, 25;
/I:         I=-28; MD=-29;
/M: SY='E'; M= -4, 11,-26, 15, 22,-28,-11, -3,-25,  4,-22,-17,  5, -5,  9, -3,  2, -6,-22,-28,-16, 15; D=-28;
/I:         I=-28; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='L'; M=  2,-21,-12,-24,-18, -1,-22,-19,  7,-18, 14,  7,-20,-23,-16,-17,-11, -2, 10,-18, -5,-17;
/M: SY='L'; M= -6,-23,-16,-26,-21,  3,-28,-21, 16,-22, 24, 13,-23,-25,-19,-17,-14,  5, 17,-23, -2,-20;
/M: SY='A'; M=  6, -7,-15,-10,  1,-12, -6,-11,-16, -7,-14, -9, -6,-15, -2,-11,  1, -6,-11,-21,-11,  0;
/M: SY='E'; M=-10,  9,-28, 14, 31,-30,-16, -2,-27, 10,-21,-15,  3, -7, 18,  4,  1, -6,-25,-28,-16, 25;
/M: SY='L'; M=  1,-23,-20,-26,-20, -2,-14,-22, 11,-24, 20,  8,-20,-23,-19,-21,-15, -7,  8,-21, -8,-20;
/M: SY='L'; M= -9,-27,-21,-28,-20,  8,-29,-20, 20,-28, 39, 16,-26,-27,-19,-21,-24, -9, 11,-21, -1,-20;
/M: SY='Q'; M= -6,  5,-25,  6, 13,-26,-13,  5,-21,  4,-19, -9,  5, -9, 14,  2,  1, -7,-21,-28,-13, 12;
/M: SY='L'; M=  3,-24,-17,-29,-22,  4,-25,-23, 17,-23, 19,  9,-22,-23,-21,-21,-13, -2, 17,-21, -4,-22;
/M: SY='N'; M=-10, 35,-21, 17,  0,-21, -2, 12,-21,  1,-30,-19, 53,-17,  0,  0,  9, -1,-29,-39,-18,  0;
/M: SY='D'; M=-18, 41,-26, 59, 21,-38,-11, -2,-38,  0,-29,-28, 16, -8,  1,-10,  1, -9,-29,-39,-21, 11;
/M: SY='E'; M= -6, 10,-23, 13, 16,-23,-14, -4,-20, -1,-15,-14,  6,-12,  7, -4,  4, -2,-19,-30,-14, 11;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-21,-31,-22,  7,-29,-22, 23,-29, 41, 18,-28,-29,-21,-21,-26, -9, 15,-21, -2,-22;
/M: SY='N'; M= -6, 10,-22,  2,  1,-22,-13,  6,-13, -3,-18, -8, 19,-14, 11, -3,  5,  2,-18,-31,-12,  6;
/M: SY='Q'; M= -8,  6,-24,  0,  4,-25,-13,  2,-19,  9,-22, -9, 13,-15, 18, 15,  4, -3,-20,-28,-13, 10;
/M: SY='V'; M=  3,-23,-15,-26,-22, -3,-21,-25, 16,-21, 13,  7,-22,-24,-22,-20, -9,  1, 23,-25, -9,-22;
/M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-31,-24, 20,-31,-22, 21,-27, 28, 14,-25,-28,-25,-21,-22, -9, 16,-16,  4,-24;
/M: SY='E'; M= -3, -2,-22, -4,  4,-18,-14, -8,-11, -5, -8, -5,  0,-11,  4, -5,  1, -1,-12,-28,-14,  4;
/M: SY='R'; M=-12, -5,-27, -5,  5,-23,-17, -2,-24, 21,-18, -8, -1,-15, 10, 29, -6, -6,-18,-22,-10,  6;
/M: SY='Y'; M=-19,-13,-25,-15,-15, 16,-24, 36,-11,-12, -7, -2, -8,-27, -7, -8,-15,-13,-16,  6, 50,-15;
/M: SY='E'; M=-10, 13,-29, 19, 24,-31,-16,  0,-29, 13,-24,-16,  5, -9, 15,  8, -2, -9,-26,-24,-14, 19;
/M: SY='R'; M= -7, -5,-24, -6,  0,-18,-18, -1,-14,  2, -7, -4, -2,-17,  7, 13, -5, -5,-12,-24, -9,  2;
/M: SY='L'; M= -8,-25,-22,-29,-20, 15,-27,-17, 13,-21, 17, 11,-21,-19,-19,-18,-17, -8,  8,-14,  6,-20;
/M: SY='E'; M=  0, -5,-21, -5,  2,-14,-19,-14, -8,  1, -8, -6, -8,-15, -6, -4, -5, -4, -1,-25,-11, -2;
/M: SY='R'; M= -6, -3,-19, -3,  7,-22,-15, -8,-21, 10,-17,-11, -1,-11,  4, 12,  0, -4,-16,-27,-14,  4;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_09 which contains 546'439 sequence entries.


Total number of hits 20 in 20 different sequences
Number of true positive hits 20 in 20 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] GAT
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
20 sequences

GGA1_HUMAN  (Q9UJY5), GGA1_MOUSE  (Q8R0H9), GGA1_YEAST  (Q06336), 
GGA2_HUMAN  (Q9UJY4), GGA2_MOUSE  (Q6P5E6), GGA2_YEAST  (P38817), 
GGA3_HUMAN  (Q9NZ52), GGA3_MOUSE  (Q8BMI3), TM1L1_HUMAN (O75674), 
TM1L1_MOUSE (Q923U0), TM1L1_RAT   (F1LM81), TM1L2_HUMAN (Q6ZVM7), 
TM1L2_MOUSE (Q5SRX1), TM1L2_XENLA (Q68FJ8), TOM1_CHICK  (O12940), 
TOM1_DICDI  (Q54GH3), TOM1_HUMAN  (O60784), TOM1_MOUSE  (O88746), 
YB0G_SCHPO  (P87157), YD85_SCHPO  (Q10410)
» More

PDB
[Detailed view]
9 PDB

1J2J; 1NAF; 1NWM; 1O3X; 1OXZ; 1WR6; 1WRD; 1X79; 1YD8

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission