Due to maintenance work, this service will be unavailable from
Mon Nov 11 17:30 until
Tue Nov 12 09:00
CET.
Apologies for the inconvenience.
PROSITE entry PS50917
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | SPOC |
| Accession [info] | PS50917 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-AUG-2003 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50917 |
| Associated ProRule [info] | PRU00249 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | SPOC domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=167; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=162; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4068782; R2=0.0127000; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=18424.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=480; H_SCORE=18424; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=323; H_SCORE=18424; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='V'; M= -9,-19,-19,-21, -8, 11,-26,-15, 8,-14, 5, 11,-19,-21,-15,-14,-12, -6, 14,-19, -1,-11; /M: SY='A'; M= 17,-13,-19,-16, -6,-22,-14,-15, -6, -8,-12, -6,-13, 3, 1,-13, 0, -4, -2,-24,-18, -3; /M: SY='E'; M= -3, 11,-22, 16, 21,-30,-10, -2,-26, 0,-26,-18, 8, -8, 16, -4, 17, 2,-22,-34,-18, 18; /M: SY='L'; M= 1,-26,-16,-30,-22, 18,-24,-22, 12,-24, 23, 8,-24,-26,-24,-20,-17, -6, 13,-15, 1,-22; /M: SY='S'; M= 8, -5,-16, -5, 8,-16,-10,-11,-13,-10, -9,-10, -3,-12, -1,-11, 12, 4, -9,-30,-16, 3; /M: SY='E'; M=-12, -3,-32, 1, 20,-30,-20, -4,-26, 17,-24,-12, -4, 10, 19, 16, -6,-10,-26,-24,-16, 18; /M: SY='K'; M= 1, -2,-26, -4, 3,-26,-16, 12,-26, 24,-23, -8, 0,-12, 6, 12, -6,-10,-18,-22, -6, 3; /M: SY='Y'; M=-16,-24, 0,-28,-24, 29,-30, -5, -1,-22, 8, 0,-22,-32,-22,-18,-20,-10, -4, 2, 35,-24; /M: SY='P'; M= 7,-14, 3,-14, -8,-24,-14,-20,-20,-14,-24,-18,-13, 26,-12,-20, 3, -3,-16,-33,-26,-12; /M: SY='M'; M= 5,-18,-18,-26,-18, -4,-21,-18, 14,-18, 14, 17,-16,-18,-12,-18, -9, 2, 10,-22, -6,-16; /M: SY='V'; M= 10,-20,-10,-24,-22, -6,-22,-26, 13,-16, 2, 2,-20,-22,-22,-18, 0, 11, 29,-28,-12,-22; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='T'; M= -2, 0,-18, -4, 4,-24,-16, -6,-16, -2,-18, -8, 2,-10, 19, -2, 17, 20,-14,-28,-12, 12; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='R'; M= -2,-14,-23,-17, -7,-12,-19,-10, -7, 8, 1, 9,-11,-18, -1, 13,-12, -8, -5,-20, -8, -5; /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20, 8,-28,-16, 20,-26, 43, 29,-28,-28,-16,-18,-28,-10, 10,-20, 0,-18; /M: SY='A'; M= 28,-17,-15,-25,-15,-11,-13,-22, 6,-17, 7, 1,-16,-16,-14,-22, -3, -4, 7,-20,-13,-15; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='N'; M= -2, 16,-18, 8, 2,-22, -4, -2,-22, 7,-30,-18, 27,-14, 2, 3, 17, 6,-20,-36,-18, 2; /M: SY='T'; M= 0, 10,-14, 9, 0,-20,-11,-12,-20, -8,-21,-18, 8,-10, -4,-10, 23, 27,-10,-36,-16, -2; /M: SY='D'; M=-10, 16,-22, 17, 12,-20,-16, -5,-18, -5,-10,-13, 11,-13, -1, -8, 1, 4,-17,-32,-15, 6; /M: SY='F'; M= 9,-19,-18,-27,-19, 27,-18,-11, -4,-17, -1, -4,-16,-22,-21,-18, -8, -6, -2, 2, 20,-19; /M: SY='P'; M= 2,-18,-30,-16, -6,-21,-16,-16, -9,-10,-15, 0,-18, 46, -8,-18, -8, -8,-15,-26,-21,-10; /M: SY='V'; M= 8,-21,-14,-25,-21, -7,-21,-24, 18,-19, 1, 3,-17,-21,-19,-20, 1, 2, 26,-28,-11,-21; /M: SY='N'; M=-10, 17,-26, 8, 8,-28,-12, 2,-24, 22,-28,-12, 25,-14, 16, 14, 0, -6,-26,-28,-14, 12; /M: SY='F'; M=-14,-28,-20,-34,-24, 35,-28,-16, 12,-26, 29, 20,-24,-28,-24,-18,-24,-10, 6, -8, 12,-22; /M: SY='H'; M=-20, -4,-30, -4, -4, -9,-22, 82,-23,-10,-16, 0, 3,-22, 6, -2,-12,-18,-26,-17, 33, -4; /M: SY='L'; M=-14,-26,-22,-28,-18, 17,-28,-16, 5,-17, 27, 9,-21,-28,-17, 0,-24,-10, 1,-14, 4,-18; /M: SY='V'; M= -4,-25,-16,-29,-25, 0,-30,-26, 26,-22, 17, 11,-23,-24,-22,-20,-11, 4, 29,-26, -6,-25; /M: SY='N'; M=-10, 13,-24, 12, 3,-16,-12, 7,-19, -2,-21,-13, 14,-17, 9, -4, 6, -2,-22,-21, 4, 5; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='D'; M= 4, 24,-19, 25, 5,-27, -4, -5,-25, -4,-26,-21, 19,-12, -2,-10, 13, 1,-19,-36,-20, 1; /M: SY='E'; M= -8, 6,-23, 5, 21,-17,-18, -5,-15, -3, -7,-11, 6,-11, 3, -6, 0, 2,-17,-30,-14, 12; /M: SY='R'; M=-10, 0,-22, 2, -1,-21,-20, -8,-14, 2,-14, -8, -2,-16, 6, 10, 0, 5, -5,-28,-12, 1; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-34,-26, 22,-32,-24, 23,-28, 28, 14,-26,-28,-26,-22,-22, -8, 19,-15, 5,-26; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='P'; M= 5,-18,-17,-18,-11, -8,-16,-18, 3,-14, 4, 0,-18, 6,-14,-16, -9, -4, 4,-20,-12,-14; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='H'; M= -8, 4,-18, 1, 4,-13,-14, 15, -9, -5,-12, -6, 9,-15, -1, -4, -2, -6, -7,-26, -6, 0; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='K'; M= 1, 7,-23, 10, 5,-27,-11, -8,-27, 13,-24,-16, 4,-12, 2, 13, 5, -3,-17,-28,-16, 2; /M: SY='V'; M= 0,-18,-14,-18,-14, -4,-18,-18, 7,-20, 10, 2,-14,-22,-14,-16, 2, 4, 11,-30,-10,-14; /M: SY='L'; M= -6,-23,-18,-24,-16, 3,-23,-15, 12,-23, 29, 19,-21,-24,-13,-16,-15, -4, 6,-24, -4,-14; /M: SY='R'; M=-12,-16,-30,-14, -8,-18, -2,-12,-21, 0,-11, -8,-10, 0, -6, 15,-12,-12,-18,-22,-16,-10; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='L'; M=-12, 1,-22, 9, -7,-12,-22,-14, -1,-16, 10, -2,-10,-22,-14,-16,-14, -8, 3,-30,-10,-10; /M: SY='E'; M= -2, -2,-18, 0, 15,-18,-18,-12,-12, -4,-14,-12, -4,-10, 0, -8, 10, 11, -4,-32,-16, 8; /M: SY='E'; M=-12, 19,-30, 31, 51,-32,-18, 0,-32, 8,-22,-22, 4, -2, 16, -2, 0,-10,-30,-32,-20, 33; /M: SY='G'; M= -7, 8,-30, 14, 6,-32, 33,-11,-38, -9,-28,-22, 4,-13, -7,-13, 0,-16,-30,-27,-26, 0; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='R'; M= -6,-10,-20,-10, -8,-15, 0,-11,-14, 7,-13, -6, -6,-16, -6, 13, -6, -8, -4,-18,-12, -8; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='P'; M= 0, -2,-24, 3, -4,-22,-16, 3,-13,-10,-16,-10, -6, 4, -9,-14, -4, -8, -7,-30,-13, -8; /M: SY='P'; M= -6, -2,-28, -1, 4,-28,-12, -7,-20, -4,-28,-16, 4, 30, 7, -9, 6, -2,-26,-32,-22, 4; /M: SY='L'; M= -8,-30,-18,-30,-22, 8,-30,-22, 22,-28, 41, 18,-30,-30,-22,-20,-26, -8, 19,-22, -2,-22; /M: SY='R'; M=-16, -6,-30, -6, 4,-24,-20, -4,-30, 38,-24,-10, 0,-16, 10, 53,-10,-10,-20,-20,-10, 4; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='T'; M= 8, -9,-12,-16,-12, -8,-18,-20, -3,-14, 3, -3, -9,-14,-12,-14, 7, 27, 2,-26,-10,-12; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20, 8,-28,-16, 20,-26, 44, 28,-28,-28,-16,-18,-28,-10, 10,-20, 0,-18; /M: SY='R'; M=-13, -8,-26, -8, 0,-20,-16, -2,-28, 21,-22,-12, 2,-18, 8, 52, 1, -3,-18,-24,-12, 0; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='D'; M=-11, 31,-26, 45, 23,-34,-10, -2,-34, 0,-28,-26, 14, -8, 4, -8, 9, -3,-26,-38,-20, 14; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='N'; M= 4, 3,-19, -1, 2,-21, -7, -3,-14, -2,-18,-10, 8, 7, 8, -5, 2, -4,-17,-22,-15, 4; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='P'; M= -1, -9,-25, -8, -6,-24, 4,-18,-22,-12,-26,-18, -5, 24,-10,-16, 9, 6,-20,-30,-24,-10; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 16,-36,-20, 3,-24, 25,-24, -4, 0,-10, 42, 17, -4,-10,-26,-20,-10, 29; /M: SY='L'; M= -8,-15,-18,-19,-18, 1,-23,-16, 13,-21, 24, 9,-10,-28,-18,-16,-17, -6, 10,-27, -7,-18; /M: SY='E'; M=-14, 16,-28, 27, 28,-25,-19, -4,-23, -2, -8,-15, 1,-10, 4, -8, -7,-10,-21,-31,-16, 16; /M: SY='H'; M=-12, 2,-28, 7, 7,-21, -3, 14,-23,-11, -8, -8, -1,-17, -2,-10, -9,-14,-21,-28, -9, 1; /M: SY='V'; M= -7,-30,-17,-34,-30, 18,-32,-28, 28,-24, 12, 10,-26,-28,-30,-22,-14, -4, 35,-19, 1,-30; /M: SY='Y'; M= -1, 5,-22, 5, 0,-15,-16, -2,-16, -4,-14,-11, -2,-14, 4, -9, 1, 4,-14,-15, 6, 1; /M: SY='R'; M=-16, -6,-30, -6, 4,-24,-20, -4,-30, 38,-24,-10, 0,-16, 10, 54,-10,-10,-20,-20,-10, 4; /M: SY='R'; M=-16,-19,-28,-21,-11, -9,-27,-11, -1, 4, 4, 3,-11,-22, -3, 28,-17,-10, -2,-20, -6,-11; /M: SY='I'; M= 3,-24,-21,-31,-21, -2,-25,-20, 24,-22, 20, 21,-20,-20,-14,-22,-16, -8, 15,-20, -4,-19; /M: SY='T'; M= 9, -2,-14, -8, -4,-18,-12,-16,-16, 2,-18,-12, 1,-10, -4, -4, 17, 23, -6,-29,-14, -4; /M: SY='C'; M= -3, -7, 16,-14,-18,-12,-18,-18, -3,-16,-12, -8, -1,-27,-18,-16, 3, 1, 9,-38,-18,-18; /M: SY='S'; M= 9, -4,-21, -2, 10,-24, -8,-12,-20, -6,-24,-18, -2, 14, 0,-12, 15, 4,-16,-32,-22, 4; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='N'; M= 0, 8, -8, 2, -2, -9, -4, -4, -9, -4,-13, -9, 13, -8, -2, -4, 13, 13, -7,-20, -9, -2; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='D'; M= -2, 10,-22, 16, 13,-28, 7, -8,-30, -6,-28,-22, 8,-10, 1,-10, 16, 0,-22,-34,-22, 7; /M: SY='Y'; M=-18,-12,-30,-12,-10, 8,-26, 27,-12, 3,-10, -2,-10,-24, -2, 1,-16,-12,-16, 9, 50,-10; /M: SY='A'; M= 25, -8, 11,-13, 2,-22,-10,-18,-18,-10,-14,-14,-10,-14, -7,-18, 4, -4, -9,-28,-22, -3; /M: SY='L'; M=-10,-28, 7,-34,-26, 0,-34,-26, 20,-30, 24, 11,-24,-29,-22,-26,-22,-10, 13,-27, -7,-26; /M: SY='C'; M= -7,-21, 13,-25,-19, 9,-23,-20, -3,-26, 10, -1,-17,-28,-21,-20, -8, -3, -1,-26, -6,-19; /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20, 8,-28,-17, 20,-27, 45, 27,-28,-28,-17,-18,-28,-10, 10,-20, 0,-18; /M: SY='A'; M= 30,-10,-18,-16,-14,-24, 27,-20,-22,-14,-18,-14, -6,-14,-14,-20, 6, -8,-12,-20,-24,-14; /M: SY='L'; M= -6,-30,-16,-30,-24, 6,-30,-24, 24,-26, 33, 16,-30,-30,-24,-20,-22, -6, 27,-24, -4,-24; /M: SY='P'; M= 5,-16,-26,-16, -8,-19,-17,-20, -3,-14,-16, -9,-12, 27,-10,-20, 2, -2, -7,-28,-19,-12; /M: SY='G'; M= 0, -8, 8,-12,-15,-21, 15,-20,-27,-18,-24,-18, -2,-20,-15,-18, 11, 6,-15,-32,-23,-15; /M: SY='G'; M= 4,-11,-18,-11,-15,-20, 23,-19,-17,-16,-21,-13, -3,-19,-15,-16, 12, -1, -5,-29,-22,-15; /M: SY='R'; M= -6, 7,-21, 1, 1,-21,-12, -5,-22, 13,-25,-14, 15,-14, 2, 17, 9, 8,-17,-30,-14, 1; /M: SY='B'; M=-14, 35,-26, 35, 10,-30, -8, 2,-30, 11,-30,-22, 31,-14, 2, 3, 2, -6,-28,-36,-18, 6; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='Q'; M= 4, -2,-18, -9, -5,-15,-13, -7, 2, -7, -7, -1, 4,-12, 5, -8, -1, -4, -4,-19, -9, -1; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='E'; M= -4, 1, 6, 3, 20,-20,-13, -7,-21, -3,-18,-16, -1, -9, 3, -7, 6, -2,-16,-29,-17, 12; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='D'; M=-13, 37,-21, 44, 11,-27, -6, 2,-27, 0,-23,-21, 24,-10, 0, -6, 2, -6,-23,-31,-16, 6; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='E'; M= -8, -2,-20, 2, 4,-13,-22,-14, -5,-10, 1, -5, -9,-16, -8,-12, -5, 4, 0,-30,-12, -2; /M: SY='A'; M= 14,-16,-17,-20,-12,-12,-17,-20, 0, -3, 3, 1,-16,-18,-12, -9, -7, -4, 8,-22,-11,-12; /M: SY='S'; M= 4, 2,-14, 2, 11,-20, -8,-10,-20, -6,-24,-18, 6, -8, 2, -8, 27, 19,-12,-36,-18, 7; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='N'; M= -2, 4,-14, -1, -1,-16, -9, -3, -7, -3,-15, -7, 10,-13, 7, -3, 8, 2, -6,-26,-12, 3; D=-12; /I: I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; /M: SY='T'; M= -6, 11,-16, 11, 4,-19,-13, -6,-16, -2,-14,-10, 4, -8, 6, -4, 8, 16,-12,-24,-10, 5; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='T'; M= -4, 2,-16, 0, 12,-18,-16, -6,-14, 0,-12, -8, 0, -6, 12, -2, 8, 16,-12,-21,-10, 12; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='R'; M= -7, 5,-17, 1, 0,-16, -7, 0,-19, 9,-20,-12, 15,-14, 4, 23, 6, 0,-16,-24,-12, 0; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='P'; M=-12, -9,-29, -1, -4,-16,-22,-16, -8,-16, 3, -6,-15, 18,-12,-18,-16,-10,-13,-28,-15,-10; /M: SY='L'; M=-10,-18,-24,-18, -8, -7,-26,-16, -1, 3, 17, 8,-18,-22, -8, 1,-22,-10, -2,-20, -4, -8; /M: SY='R'; M= 3, -6,-22, -8, 2,-24,-12, -4,-22, 9,-20,-10, 0,-14, 15, 22, 7, -1,-16,-24,-14, 7; /M: SY='N'; M= 0, 8,-25, 1, -2,-22, -9, 17,-20, -6,-24,-14, 18, 6, -2, -8, 1, -7,-24,-32,-13, -4; /M: SY='F'; M=-14,-30,-20,-34,-24, 39,-30,-20, 12,-30, 33, 12,-26,-30,-28,-20,-26,-10, 6, -8, 12,-24; /M: SY='V'; M= -4,-30,-18,-34,-30, 0,-34,-30, 38,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 42,-26, -6,-30; /M: SY='N'; M= -3, 20,-17, 18, 2,-22, -6, -5,-22, -6,-26,-20, 21,-12, -2, -8, 21, 15,-17,-38,-18, 0; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22, 25,-30,-20, 16,-30, 41, 16,-28,-30,-24,-20,-28,-10, 8,-13, 7,-22; /M: SY='K'; M= -8, -7,-26,-11, -1,-21,-24,-13, -6, 11,-13, -1, -4,-12, 9, 4, -4, 3, -7,-22, -8, 3; /M: SY='N'; M= 2, 16,-22, 5, 5,-27, -7, 4,-18, 2,-22,-11, 24,-14, 20, 0, 6, -4,-24,-29,-16, 13; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='E'; M=-10, 4,-30, 8, 33,-34,-20, 2,-26, 19,-22,-10, 0, -6, 33, 10, -2,-10,-28,-24,-14, 33; /M: SY='A'; M= 37,-14,-14,-24,-14,-16, -9,-22, 3,-14, -3, -3,-12,-12,-12,-22, 3, -2, 7,-20,-16,-14; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='V'; M= -4,-30,-18,-34,-30, 0,-34,-30, 38,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 42,-26, -6,-30; /M: SY='I'; M= -3,-23,-21,-29,-23, -4,-29,-26, 30,-23, 7, 9,-16,-20,-18,-23, -5, -1, 26,-27, -7,-23; /M: SY='S'; M= 4, 8,-12, 2, -2,-18, -4, -8,-18, -8,-26,-18, 18,-12, -2, -8, 30, 23,-12,-38,-18, -2; /M: SY='L'; M= -6,-30,-16,-30,-24, 6,-30,-24, 24,-26, 33, 16,-30,-30,-24,-20,-22, -6, 27,-24, -4,-24; /M: SY='P'; M= -8,-20,-34,-13, -8,-23, -2,-20,-18,-16,-16,-13,-17, 45,-14,-20,-11,-12,-23,-26,-25,-14; /M: SY='N'; M= -6, 9,-22, 4, 3,-21, 5, -7,-17, -6,-20,-14, 16,-18, -6, -8, 2, -7,-15,-31,-20, -1; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='P'; M= -2,-12,-16,-10,-10,-12, 3,-14, -5,-10, -9, -6,-11, 7,-12,-12, -4, -6, -1,-16,-14,-12; D=-9; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='G'; M= -2, -2,-18, 0, 5,-18, 23, -8,-22, -6,-16,-12, 0, -8, -3, -8, 0,-10,-18,-14,-16, 1; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='D'; M= -4, 11,-15, 15, 12,-19,-10, -6,-19, -2,-17,-15, 6, -6, 1, -6, 12, 11,-13,-27,-13, 7; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='K'; M= -6, 8,-18, 2, 2,-18,-12, -6,-18, 19,-20,-10, 12,-10, 2, 11, 1, 4,-14,-21,-10, 2; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='E'; M=-10, -3,-21, -2, 19, -1,-18, -2,-15, -1, -9, -7, -4, -9, 10, -2, -4, -8,-17,-13, -3, 16; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='P'; M= 2, 2,-20, -2, 0,-20, -8, -8,-16, 7,-20,-12, 6, 10, -1, -1, -1, -4,-16,-21,-15, -1; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='T'; M= 12, -2, -8, -8, -6,-12, -7,-13,-10, -8,-12,-10, 0, -8, -6,-10, 18, 23, -2,-24,-12, -6; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='G'; M= 7,-12,-26,-14,-18,-16, 35,-12,-26,-16,-20,-14, -6,-20,-16,-18, -2,-14,-19,-10, -6,-18; /M: SY='V'; M= -7,-26,-19,-28,-23, -4,-30,-23, 21,-11, 6, 8,-21,-26,-19, -2,-12, -4, 30,-26, -8,-23; /M: SY='L'; M= -8,-30,-18,-30,-22, 8,-30,-22, 22,-28, 41, 18,-30,-30,-22,-20,-26, -8, 19,-22, -2,-22; /M: SY='H'; M=-18, -8,-30, -8, -4, -4,-24, 51,-16, -6,-12, 0, -4,-22, 12, -2,-12,-14,-22, -5, 38, 0; /M: SY='I'; M= 14,-23,-18,-31,-23, -7,-23,-26, 24,-21, 7, 7,-19,-19,-19,-24, -7, -4, 23,-22, -9,-23; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='P'; M= 3,-18,-33,-12, -2,-28,-16,-20,-18,-10,-26,-18,-18, 68,-10,-20, -6, -8,-23,-28,-28,-10; /M: SY='P'; M=-12,-22,-36,-17, -7, -6,-22,-20,-16,-14,-21,-16,-20, 64,-17,-20,-12,-10,-23,-21,-17,-14; /M: SY='C'; M= -8,-18, 87,-26,-28,-22, -8,-28,-32,-28,-22,-20,-16,-36,-28,-28, -8,-12,-14,-43,-30,-28; /M: SY='E'; M=-12, 17,-30, 29, 53,-32,-18, 0,-32, 8,-22,-22, 3, -2, 17, -2, 0,-10,-30,-32,-20, 35; /M: SY='F'; M=-18,-30,-22,-40,-30, 62,-32,-22, 11,-30, 12, 4,-20,-28,-36,-22,-20,-10, 7, 3, 23,-30; /M: SY='S'; M= 17, -9,-10,-11, -9,-16, -7,-17, -7,-12,-17,-11, -3,-14, -9,-14, 22, 11, 5,-33,-18, -9; /M: SY='E'; M= -8, 4,-22, 0, 10,-18,-18, -4,-11, -4, -5, -6, 7,-15, 9, -4, -1, 2,-16,-28,-12, 9; /M: SY='R'; M= -8, 0,-26, 1, 16,-28,-16, -2,-26, 19,-24,-12, 2,-10, 19, 22, 3, -4,-22,-26,-14, 17; /M: SY='Y'; M=-16,-22,-24,-24,-18, 22,-28, 12, 2,-22, 18, 8,-18,-28,-16,-14,-22,-12, -4, -5, 27,-18; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='S'; M= 10, 7,-17, 9, 3,-26, -5,-10,-23, 2,-26,-18, 6,-10, -1, -5, 17, 5,-13,-32,-18, 1; /M: SY='E'; M=-10, 1,-26, 5, 26,-24,-16, -2,-28, 13,-22,-16, 2, -9, 12, 24, 4, -4,-22,-28,-16, 18; /M: SY='L'; M=-11,-23,-22,-25,-17, 14,-26,-20, 3,-23, 16, 3,-21, -3,-21,-18,-15, 0, -2,-17, -1,-19; /M: SY='A'; M= 29, -9, 12,-19,-13,-18,-10,-22,-13,-13,-12,-12, -9,-15,-13,-19, 9, 9, -2,-27,-19,-13; /M: SY='P'; M=-10, -8,-30, -6, 0,-24,-20, 2,-21, 2,-24,-12, -7, 30, -3, -5, -3, 1,-21,-28,-13, -4; /M: SY='S'; M= 7, 8,-18, 10, 6,-28, -6, -6,-22, -4,-24,-16, 6,-10, 11, -8, 18, 4,-16,-32,-18, 9; /M: SY='L'; M= -8,-30,-18,-30,-22, 8,-30,-22, 22,-28, 41, 18,-30,-30,-22,-20,-26, -8, 19,-22, -2,-22; /M: SY='H'; M= 1, 1,-19, -7, -8,-12,-14, 13,-11,-12, -5, -4, 8,-18, -5, -9, -1, 2,-11,-28, -6, -8; /M: SY='D'; M= 2, 4,-22, 8, 8,-24,-16,-12,-15, 5,-16,-12, -4,-13, -3, -5, -2, -6, -5,-28,-16, 2; /M: SY='Y'; M= -7, -9,-20,-10, -1, 11,-17, -4,-13,-11,-13,-11, -5,-17, -8,-11, 7, 2,-11,-12, 13, -4; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='I'; M= -6, -5,-20,-12,-14, -7, -3,-11, 3,-16, 3, 1, 3,-18,-12,-14, -8, -8, -4,-21,-10,-14; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='E'; M= -4, -3,-19, -1, 14,-18,-14, -3,-12, -3, -6, -5, -3, -9, 14, -3, 3, -2,-13,-22,-11, 14; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='N'; M=-10, 27,-24, 17, 13,-24, -7, 5,-24, 10,-28,-18, 38,-14, 6, 5, 5, -4,-28,-35,-18, 9; /M: SY='C'; M= -8, -7, 7, -9, 7,-18,-26,-17,-10,-11,-10,-10, -8,-15, -5,-15, -2, 3, -7,-32,-16, 0; /M: SY='D'; M=-12, 25,-28, 39, 12,-34,-10, -6,-32, -4,-30,-26, 9, 12, -2,-12, 6, -4,-26,-38,-22, 4; /M: SY='Y'; M=-14,-14,-25,-17,-13, 12,-24, 8,-11,-14, -9, -6,-11, 0,-13,-12, -8, 1,-13,-10, 17,-15; /M: SY='L'; M=-14,-20,-24,-20,-12, -2,-26, 8, -1,-13, 21, 9,-16,-26, -8, 4,-22,-12, -4,-22, 2,-12; /M: SY='L'; M= -9,-28,-19,-28,-24, 11,-30,-15, 19,-22, 24, 12,-28,-30,-21,-18,-21, -6, 20,-13, 14,-24; /M: SY='M'; M= -8,-22,-24,-27,-22, -4, -6,-14, 12,-20, 16, 27,-18,-22,-12,-18,-18,-12, 5,-20, -7,-18; /M: SY='I'; M= 5,-26,-20,-32,-23, -2,-27,-26, 27,-24, 18, 12,-22,-22,-19,-24,-14, -6, 22,-22, -6,-23; /M: SY='I'; M= -6,-30,-20,-34,-28, 2,-34,-28, 36,-26, 23, 16,-26,-26,-24,-24,-19, -6, 33,-24, -4,-28; /M: SY='V'; M= 9,-26,-14,-30,-26, -4,-25,-28, 25,-20, 8, 8,-24,-24,-24,-22, -8, -2, 35,-26,-10,-26; /M: SY='R'; M= -2,-19,-19,-23,-15, 6,-20,-15, -6, -2, -5, -3,-13,-22,-14, 13, -8, -6, 4,-16, -3,-15; /M: SY='G'; M= -2, -6,-22, -8, -9,-21, 17,-14,-27, -5,-23,-16, 2,-16, -7, 4, 10, 5,-17,-26,-19, -9; /M: SY='A'; M= 5, -7,-18,-15,-17, 2, 0,-15, -8,-15,-10, -8, 1,-22,-19,-16, -1, -5, -2,-21,-10,-17; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 9 in 9 different sequences |
| Number of true positive hits | 9 in 9 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 3 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 75.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | SPOC |
| Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
9 sequences
DIN1_CAEEL (G5EGK6), MINT_HUMAN (Q96T58), MINT_MOUSE (Q62504), NITO_DROME (Q7KMJ6), RB15B_HUMAN (Q8NDT2), RB15B_MOUSE (Q6PHZ5), RBM15_HUMAN (Q96T37), RBM15_MOUSE (Q0VBL3), SPEN_DROME (Q8SX83)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
3 sequences
FPA_ARATH (Q8LPQ9), SPOC1_HUMAN (Q6ZMY3), SPOC1_MOUSE (B1ASB6) |
| PDB [Detailed view] |
4 PDB
1OW1; 2RT5; 7Z1K; 7Z27 |