Entry: PS50918

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] WWE
Accession [info] PS50918
Entry type [info] MATRIX
Date [info] AUG-2003 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50918
Associated ProRule [info] PRU00248

Name and characterization of the entry

Description [info] WWE domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=77;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=77;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2463019; R2=0.0222387; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3126.38421; R2=20.51053; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=304; N_SCORE=9.0; H_SCORE=8439; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=169; N_SCORE=6.0; H_SCORE=6593; MODE=1; TEXT='RR';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='S'; M= -4,  3,-21,  2,  2,-19, -9, -3,-16, -3,-19,-10,  7,-11, -1, -4, 10,  3,-13,-31,-13,  0;
/M: SY='L'; M= -7,-15,-20,-18,-10,  5,-21,-13,  1,-14,  9,  3,-13,-21,-11,-11,-11, -5,  0,-18,  0,-11;
/M:         M= -9, -5,-24, -4, -1, -8,-16, -8,-15, -3,-12, -9, -6,-11, -3, -3, -4, -1,-12,-18, -2, -3;
/M: SY='E'; M=  2,  2,-25,  5,  6,-24,-11,-11,-21,  3,-21,-15, -1,  4, -1, -5,  2, -5,-17,-27,-18,  2;
/M: SY='P'; M= -5, -5,-20, -3, -1,-22,-13, -9,-20, -2,-22,-14, -5, 10,  1, -5,  1, -2,-18,-25,-13, -2;
/M: SY='S'; M=  0, -6,-10,-10, -7,-13,-16,-10, -7,-10,-12, -5, -3,-10, -6,-12,  2,  0, -6,-27,-10, -7;
/M: SY='N'; M= -2,  8,-17,  5,  0,-20, -8,  4,-20, -3,-20,-12, 12,-15, -1, -4,  8,  2,-16,-32,-12, -1;
/M: SY='R'; M= -3, -6,-18, -8, -6,-14,-17, -8,-14,  0,-14, -9, -4,-11, -4,  3, -1, -1, -9,-23, -7, -6;
/M: SY='A'; M=  3, -8,-22,-10, -6,-18,-13,-15, -7, -9,-15, -9, -5,  3, -7,-13,  2,  0, -6,-24,-15, -8;
/M: SY='S'; M= -2, -2,-22, -3, -6,-16,  1,  0,-19,-10,-16,-11,  2,-13, -6, -8,  3, -3,-15,-26,-10, -7;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='T'; M= -4, -5,-21, -5,  0,-14,-18,-11,-10,  1, -9, -6, -6,-16, -3, -1, -1,  3, -5,-24, -7, -2;
/M:         M= -4, -9,-24, -9, -8,-16, -3,-10,-14, -4,-17, -9, -5, -8, -8, -7, -3, -8, -8,-24,-12, -9;
/M: SY='Y'; M= -2,-19,-21,-23,-19,  1,-22,-15,  2,-13, -3, -2,-17,-19,-15,-16,-12, -6,  2,  5,  9,-18;
/M: SY='V'; M= -7,-15,-22,-17, -9, -6,-22, -6,  0, -6, -4,  0,-11,-21, -7, -2, -8, -7,  5,-21, -2, -9;
/M: SY='W'; M=-19,-38,-48,-38,-29,  8,-20,-29,-19,-18,-19,-19,-38,-30,-19,-16,-38,-28,-27,137, 27,-20;
/M: SY='Y'; M=-14,-10,-24,-10,  6,  2,-25,  0,-10, -3, -6, -2,-11,-18,  5, -3,-11, -9,-14, -8, 15,  4;
/M: SY='W'; M=-20,-31,-37,-33,-27, 28,-25,-11,-10,-18, -8,-10,-30,-30,-20,-17,-30,-20,-18, 85, 46,-22;
/M: SY='E'; M= -5, -8,-19,-10,  3,-10,-19, -6,-11, -3, -5, -4, -6,-16, -1,  0, -5, -4,-10,-23, -7,  0;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='D'; M= -6, 17,-19, 19,  3,-20,  3, -1,-22, -2,-20,-16, 14,-11, -2, -4,  4, -5,-19,-23,-12,  0; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='D'; M=-10, 17,-26, 25, 19,-29, -5,  0,-31,  1,-24,-19,  9,-10,  4, -2,  4, -6,-25,-32,-18, 11;
/M: SY='N'; M=-10,  4,-20,  0, -2,-15, -9,  7,-22,  1,-19,-11, 11,-18,  0,  7, -1, -6,-20,-27, -9, -2;
/M: SY='G'; M= -5,  2,-26, -1,-10,-18, 32,-11,-30,-13,-25,-18, 11,-19,-12,-12,  1,-13,-26,-23,-20,-10;
/M:         M= -5, -7,-22, -7, -2,-20, -2,-11,-17,  0,-16,-10, -4,-15, -5, -2, -1, -4,-11,-26,-15, -4;
/M: SY='W'; M=-18,-33,-45,-33,-25,  7,-18,-24,-19,-18,-19,-18,-33,-28,-16,-18,-32,-24,-27,120, 27,-17;
/M: SY='H'; M=-11,-11,-23,-15, -9,-11,-22,  1, -9, -6,-10, -5, -6,-19, -3, -1, -8, -3,-10, -2,  1, -7;
/M: SY='P'; M= -7,  1,-21,  6,  8,-29,-16, -8,-24,  0,-24,-15, -3, 15,  5, -3, -2, -7,-23,-30,-20,  5;
/M: SY='Y'; M=-18,-23,-27,-25,-21, 36,-30,  6,  2,-16,  8,  3,-21,-30,-16,-13,-21,-10, -6, 18, 57,-21;
/M: SY='D'; M= -8, 19,-26, 25,  9,-30, -2, -5,-29, -3,-28,-22, 14,  0,  0, -8,  8, -2,-25,-35,-21,  4;
/M: SY='E'; M= -4,  1,-26,  2,  9,-23,-15, -1,-19,  1,-18, -9,  0,  4,  3, -2, -1, -6,-19,-27,-14,  5;
/M: SY='H'; M= -7, -3,-24, -3,  2,-16,-18,  6,-14,  0,-11, -1, -3,-13,  4,  4, -3, -4,-13,-23, -3,  1;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='V'; M= -5, -3,-14, -5,-12,-12,-17,-16,  2,-12, -6, -4, -3,-18,-12,-14,  1,  5,  8,-29,-12,-13; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='S'; M= -2, -2,  4, -6, -3,-15,-11,-11,-15,-11,-18,-13,  5,-17, -5,-10, 12,  4,-10,-33,-16, -4; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='E'; M= -6, -4,-10, -5,  4,-21,-18, -4,-17,  2,-16, -9, -1,-15,  4,  4,  0, -5,-14,-29,-13,  3;
/M: SY='E'; M=-10, -2,-25,  0,  3, -9,-22,  0,-10, -6, -2, -4, -7,-17, -2, -8, -9, -5,-11,-19,  3, -1;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-21,-36,-27,  3,-36,-26, 37,-29, 28, 19,-24,-24,-20,-26,-23,-10, 23,-21, -1,-26;
/M: SY='E'; M=-11, 10,-30, 18, 49,-31,-19,  1,-29, 12,-21,-18,  2, -3, 21,  5, -1,-10,-29,-29,-18, 35;
/M: SY='D'; M= -7, 15,-24, 16, 15,-27,-12,  0,-25,  7,-24,-16, 14,-11, 10,  5,  5, -3,-22,-31,-16, 12;
/M: SY='A'; M= 25, -7,-12,-12, -4,-18, -8,-13,-10, -9,-10, -9, -7,-13, -4,-15,  6, -2, -4,-23,-15, -4;
/M: SY='Y'; M=-17,-19,-26,-22,-18, 26,-26,  0, -1,-15,  4,  0,-15,-28,-16,-11,-19,-10, -7, 14, 34,-18;
/M: SY='E'; M= -1, -2,-11, -4,  5,-21,-13, -9,-18,  3,-15,-10,  0,-15,  3,  0,  1, -3,-13,-29,-16,  4;
/M: SY='K'; M=  3,  1,-21, -2,  6,-21,-12, -6,-19,  7,-18,-11,  4,-12,  3,  7,  4, -2,-14,-27,-15,  4;
/M: SY='G'; M= -8,  0,-24, -1, -3,-25,  8, -5,-29,  2,-25,-14,  3,-11,  0,  0, -2,-10,-24,-23,-14, -2;
/M: SY='K'; M= -9, -4,-21, -4,  2,-18,-15, -5,-18,  6,-13, -7, -3, -9, -1,  4, -6, -8,-15,-26,-12, -1;
/M: SY='K'; M= -4, -5,-19, -6,  0,-22,-15,-11,-20,  7,-19,-11, -3, -2,  1,  6, -2, -2,-16,-25,-15, -1;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='T'; M= -3, -5,-19, -8, -5,-11,-17,-11, -8, -8, -8, -5, -4,-13, -7, -8,  1,  6, -4,-19, -9, -6; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='L'; M= -5,-24, -6,-28,-20, -1,-29,-21, 17,-24, 20, 10,-22,-25,-19,-21,-16, -4, 15,-25, -6,-21; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='E'; M= -9,  5,-25,  9, 11,-23, -9, -7,-20,  1,-19,-14,  3, -9,  1,  0,  1, -5,-16,-28,-15,  5; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='F'; M= -7,-22,-19,-27,-21, 18,-25,-16,  9,-18,  8,  8,-17,-22,-19,-15,-12, -6,  9,-13,  6,-19;
/M: SY='T'; M= -6,  1,-18, -1, -3,-17,-16, -7,-14, -3,-13, -7,  1,-10, -1, -5, -1,  2,-12,-26,-10, -2;
/M: SY='A'; M=  2,-15,-23,-19,-11,-13,-20,-16,  1, -9, -5, -1,-12, -5, -9,-12, -4,  0,  1,-19,-10,-12;
/M:         M= -2,-10, -2,-14,-12,-11, -7,-14,-13,-16,-11, -9, -6,-21,-12,-15, -1, -5, -9,-22,-13,-12;
/M: SY='G'; M= -4, -4,-26, -5,-11,-20, 26,-11,-27,-11,-18,-13,  2,-19,-12, -9, -1,-12,-21,-24,-19,-12;
/M: SY='H'; M= -8, -6,-25, -8, -4, -6,-14,  6,-17, -1,-12, -7, -2,-19,  0,  4, -6, -7,-15,-16,  3, -3;
/M: SY='P'; M= -7, -3,-20, -3,  0,-21,-13,  1,-19, -4,-20,-12,  2,  4, -2, -2,  1, -3,-17,-31,-15, -3;
/M: SY='Y'; M=-19,-19,-26,-20,-17, 27,-28, 17, -5,-10, -2,  0,-16,-28,-11, -6,-18,-11,-11, 16, 58,-17;
/M: SY='I'; M= -9,-12,-18,-15,-10, -3,-27,-14,  5,-15,  2,  0,-11,-18,-12,-15, -6,  3,  4,-22, -1,-12;
/M: SY='V'; M= -4,-28,-18,-31,-26,  3,-31,-26, 28,-23, 21, 13,-26,-26,-23,-21,-17, -6, 30,-23, -4,-26;
/M: SY='D'; M=-15, 33,-26, 39, 11,-29,-10, 12,-31,  0,-27,-22, 23,-14,  3, -5,  3, -7,-27,-35,-11,  6;
/M: SY='F'; M=-14,-21,-21,-28,-23, 38,-28,-17,  7,-25, 16,  4,-16,-27,-27,-18,-18, -6,  3, -7, 14,-23;
/M: SY='Q'; M= -6,  0,-20, -2,  2,-21,-14, -3,-15,  1,-14, -8,  3,-11,  4, -1, -1, -4,-14,-28,-13,  2;
/M: SY='S'; M=  1,  5,-17,  2,  2,-19, -7, -1,-21, -5,-20,-14,  7,-13,  0, -6, 10,  6,-16,-29,-13,  1;
/M: SY='M'; M=-13,-19,-20,-26,-18,  7,-20, -2,  5,-11, 11, 30,-16,-21, -8, -6,-19,-11,  0,-11,  5,-13;
/M: SY='T'; M= -3,-10,-13,-16,-13,-10,-20,-12, -1,-10, -3, -1, -6,-19, -8, -7,  0,  9,  3,-26, -7,-11;
/M: SY='Q'; M= -8, -2,-28, -3, 13,-32,-18,  7,-21, 11,-20, -3,  0,-12, 42, 16, -1, -9,-25,-19, -8, 26;
/M: SY='Y'; M= -9,-15,-22,-19,-11,  2,-23,-13,  1,-11,  3,  3,-14,-17,-11,-11, -9,  3,  1,-12,  5,-11;
/M: SY='N'; M= -8,  9,-25,  5,  1,-23,-12, -2,-21,  7,-22,-12, 15, -9,  4, 14,  1, -5,-20,-29,-16,  0;
/M: SY='R'; M=-10,-12,-25,-12, -1,-10,-24, -8, -7,  4, -5,  0,-10,-15,  3,  5, -9, -5, -6,-18, -1,  0;
/M: SY='D'; M= -5,  8,-26, 11,  9,-23, -9, -4,-22,  0,-19,-14,  4,-11,  4, -4, -1, -6,-19,-22,-11,  6;
/M: SY='T'; M= -4,  3,-20,  1, -1,-16,-10, -9,-19, -5,-19,-15,  3,-14, -3, -5,  9, 12,-14,-17, -8, -2;
/M: SY='G'; M= -7, -5,-28, -3, -1,-26, 11, -4,-28, -3,-23,-14, -1, -4, -2, -3, -1, -9,-24,-25,-18, -3;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='T'; M= -5,-11,-19,-15, -9, -6,-21,-14, -7, -1, -3, -3, -8,-15, -7,  5, -4,  8, -2,-21, -6, -9; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='R'; M= -5,-12,-17,-15, -6,-15,-20, -7,-11,  4,-10,  2, -9,-15,  4,  8, -7, -6, -9,-18, -8, -2;
/M: SY='R'; M=-16,-10,-28,-11, -2,-18,-21, -5,-22, 22,-16, -8, -2,-19,  6, 51, -8, -5,-14,-21, -9, -2;
/M: SY='E'; M= -7, -7,-25, -5,  2,-20,-14, -3,-16, -1,-13, -9, -3, -1,  2,  2,  0, -3,-16,-28,-13,  0;
/M: SY='V'; M= -4,-27, -7,-30,-27,  2,-31,-27, 24,-23, 15, 10,-26,-28,-26,-21,-13, -1, 32,-27, -7,-27;
/M: SY='R'; M= -6,-10,-20,-12, -2,-17,-20,-10,-18, 17,-15, -6, -6,-17,  2, 24, -8, -8,-11,-21,-10, -2;
/M: SY='R'; M=-15,-13,-29,-13, -4,-16,-19, -6,-23, 17,-17,-10, -5,-17,  4, 43, -9, -8,-16, -8, -6, -4;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 54 in 44 different sequences
Number of true positive hits 54 in 44 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 2
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] WWE
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
44 sequences

DDHD2_HUMAN (O94830), DDHD2_MOUSE (Q80Y98), DTX1_HUMAN  (Q86Y01), 
DTX1_MOUSE  (Q61010), DTX1_XENLA  (Q8AW93), DTX2_HUMAN  (Q86UW9), 
DTX2_MOUSE  (Q8R3P2), DTX4_HUMAN  (Q9Y2E6), DTX4_MOUSE  (Q6PDK8), 
DTX_DROME   (Q23985), HUWE1_HUMAN (Q7Z6Z7), HUWE1_MOUSE (Q7TMY8), 
PAR11_HUMAN (Q9NR21), PAR11_MOUSE (Q8CFF0), PAR12_HUMAN (Q9H0J9), 
PAR12_MOUSE (Q8BZ20), PAR14_HUMAN (Q460N5), PAR14_MOUSE (Q2EMV9), 
PARPT_HUMAN (Q7Z3E1), PARPT_MOUSE (Q8C1B2), R146A_BOVIN (E1B7X3), 
R146B_BOVIN (Q3T139), RCD1_ARATH  (Q8RY59), RN146_AILME (D2H0Y8), 
RN146_DANRE (Q7ZUK0), RN146_HUMAN (Q9NTX7), RN146_MACFA (Q2PFU6), 
RN146_MOUSE (Q9CZW6), RN146_PONAB (Q5REL3), RN146_RAT   (Q5XIK5), 
RN146_SALSA (C0HBT3), RN146_XENLA (Q6GQD5), RN146_XENTR (Q66JE4), 
SRO1_ARATH  (O82289), TRIPC_BOVIN (E1B7Q7), TRIPC_DANRE (F1RCR6), 
TRIPC_HUMAN (Q14669), TRIPC_MOUSE (G5E870), TRIPC_RAT   (F1LP64), 
TRIPC_XENTR (B4F6W9), YWZ6_CAEEL  (Q11096), ZCCHV_HUMAN (Q7Z2W4), 
ZCCHV_MOUSE (Q3UPF5), ZCCHV_RAT   (Q8K3Y6)
» More

PDB
[Detailed view]
6 PDB

1UJR; 1X4R; 2A90; 2DK6; 2RSF; 3V3L

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission