PROSITE entry PS50920
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | SOLCAR |
Accession [info] | PS50920 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-AUG-2003 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC00189 |
Associated ProRule [info] | PRU00282 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Solute carrier (Solcar) repeat profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=91; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=91; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4543622; R2=0.0214531; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=282; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=156; N_SCORE=5.8; MODE=1; TEXT='RR'; /DEFAULT: B0=-100; E0=-100; M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: M= -5, -7,-25, -3, -2,-20,-13,-13,-13, -1,-11, -6, -9, -2, -6, -1, -7, -8, -7,-26,-16, -6; /M: SY='N'; M= -6, 5,-23, 2, -1,-22, -1, -6,-24, 5,-24,-14, 8,-15, 2, 3, 5, 2,-19,-24,-10, 0; /M: SY='F'; M= -6,-18,-23,-23,-19, 11,-16,-16, 2,-20, 2, -2,-12,-17,-19,-18,-11, -8, -1, -5, 4,-19; /M: SY='L'; M= -5,-26,-21,-28,-20, 4,-20,-20, 13,-25, 25, 13,-24,-18,-19,-20,-20, -9, 8,-20, -5,-20; /M: SY='L'; M= -4,-18, -2,-23,-19, 0,-24,-17, 5,-18, 9, 2,-14,-25,-17,-17,-12, -6, 4,-22, -2,-19; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='S'; M= 3, -3, 0, -6, -6,-20, -9, 0,-22, -4,-18,-12, -1,-16, -5, -4, 4, 2,-12,-28,-12, -7; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='G'; M= -3,-18,-25,-21,-19, 0, 17,-19,-14,-21, -5, -6,-10,-22,-18,-19, -9,-14,-12,-14,-10,-18; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='V'; M= 0,-19, -4,-22,-18, 3,-20,-19, 8,-19, 11, 4,-18,-22,-19,-16, -7, 1, 14,-21, -6,-18; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='A'; M= 21,-13,-18,-19,-16,-14, 14,-21,-12,-16,-12, -9, -8,-16,-16,-20, 4, -6, -4,-20,-18,-16; /M: SY='G'; M= 14, -9,-20,-13,-14,-22, 29,-19,-23,-16,-18,-14, -4,-16,-14,-18, 7, -4,-14,-23,-23,-14; /M: SY='A'; M= 12,-17,-10,-24,-18, -3, -5,-14, -3,-16, 0, 6,-15,-20,-15,-18, -6, -7, 1,-16, -5,-17; /M: SY='V'; M= -3,-21,-19,-24,-22, -7, -7,-22, 10,-20, 4, 6,-17,-23,-20,-19, -7, -2, 15,-25,-12,-22; /M: SY='A'; M= 38, -8,-11,-16, -9,-20, 3,-19,-13,-11,-14,-12, -6,-11, -9,-18, 14, 5, -3,-23,-20, -9; /M: SY='G'; M= -1, -5,-16, -6, -6,-24, 22,-18,-26,-14,-20,-16, -2,-16,-12,-17, 1, -6,-19,-26,-23,-10; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='A'; M= 9,-13,-16,-17,-10, -1, -2,-16, -7,-15, -3, -5,-11,-16,-14,-16, -1, -4, -2,-17, -9,-12; D=-9; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='V'; M= -3,-21, -5,-26,-21, 10,-24,-21, 12,-20, 11, 5,-18,-22,-21,-18,-11, -1, 14,-17, -2,-21; D=-9; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='S'; M= 8, -4, 2, -8, -7,-12, -1,-12,-12, -9,-13,-10, -1,-10, -7,-10, 12, 11, -5,-21,-13, -7; D=-9; /I: I=-9; MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19; /M: SY='V'; M= 3, -5,-13, -7, -8, -8,-14, -4, -4, -5, -6, -4, -7,-13, -8, -8, 0, 3, 4,-17, -2, -9; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='F'; M= -6,-21, 4,-30,-24, 17,-27,-23, 7,-23, 3, 0,-17,-24,-25,-21, -9, 0, 10,-18, 0,-24; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='V'; M= 8,-22,-17,-28,-22, 5,-16,-23, 13,-20, 7, 4,-18,-20,-21,-21, -8, -5, 16,-17, -5,-22; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='V'; M= 4,-12,-14,-15,-16,-10, -4,-19, 0,-15, -5, -4, -8,-19,-16,-15, 4, 5, 10,-27,-14,-16; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='Y'; M= -1,-11, -8,-16,-11, -1,-18, -2, -8,-11, -7, -1, -9,-18, -4,-11, -1, 2, -4,-17, 3, -8; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='L'; M= 5,-20,-16,-26,-18, 2,-21,-18, 10,-19, 17, 13,-19,-21,-15,-18,-10, 1, 9,-20, -5,-17; /M: SY='D'; M=-16, 33,-30, 49, 37,-36,-14, 0,-36, 4,-26,-26, 12, -6, 8, -6, 0,-10,-30,-36,-20, 22; /M: SY='V'; M= -2,-19,-16,-23,-19, 4,-24,-19, 8,-15, 4, 2,-16,-22,-18,-12, -4, 7, 14,-20, 0,-19; /M: SY='V'; M= 14,-24,-11,-28,-24, -6,-22,-27, 20,-18, 5, 5,-24,-24,-24,-21, -5, -1, 35,-27,-12,-24; /M: SY='K'; M=-11, -6,-28, -6, 3,-23,-22,-11,-22, 36,-19, -6, -5,-15, 5, 28,-11, -9,-12,-21, -9, 3; /M: SY='T'; M= -3,-12, -5,-18,-17, -8,-23,-21, 3,-14, -3, -3, -9,-20,-15,-11, 3, 16, 12,-31,-11,-17; /M: SY='R'; M=-16,-11,-28,-11, -2,-19,-21, -4,-22, 22,-14, -6, -4,-20, 9, 51,-11, -9,-13,-21, -9, 0; /M: SY='L'; M=-11,-27,-21,-33,-23, 15,-28,-15, 21,-24, 31, 30,-24,-26,-16,-18,-24,-10, 11,-16, 4,-20; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='Q'; M= -3, -3,-23, -8, 3,-24,-18, -2, -5, -1,-10, 3, 0,-12, 25, -2, -1, -3,-12,-21, -9, 13; D=-6; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='A'; M= 9,-11,-12,-15,-11, -8, -6,-13, 2, -6, 0, 3,-10,-12, -9, -9, -4, -4, 6,-15, -9,-10; D=-6; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='Q'; M= -9, 10,-20, 16, 14,-25,-12, 2,-18, 2,-13, -8, 3, -8, 20, -1, 0, -6,-19,-21,-10, 17; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='N'; M= 0, 5,-14, 3, 7,-16, -1, 2,-16, -3,-16,-11, 9, -8, 1, -5, 8, 2,-14,-22,-11, 4; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='G'; M= -3, 2,-18, 3, -4,-18, 12, 0,-21, -5,-16, -8, 2,-12, -4, -4, 0, -8,-15,-19,-12, -5; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='Q'; M= -7, -2,-20, -1, 9,-19,-13, 5,-15, 11,-14, -2, -2, 0, 14, 6, -5, -7,-16,-15, -6, 11; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='G'; M= -3,-10,-15,-13,-13, -9, 4,-13, -1,-10, -4, -2, -6,-12,-10, -7, -4, -4, 1,-14, -9,-13; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='A'; M= 13, 2,-11, 1, -2,-16, -4,-10, -9, -7,-13,-10, 1, -8, -4,-11, 11, 3, -4,-22,-13, -4; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='A'; M= 4, 2,-15, 0, 0,-17, -3, -6,-14, 1,-12, -8, 3,-10, 2, -3, 4, -2,-11,-20,-12, 1; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='P'; M= -8, -5,-26, -5, 5,-22,-17, -8,-14, 2,-18, -9, -3, 18, 7, 0, -3, -2,-18,-23,-15, 4; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='P'; M=-11,-12,-28,-10, -2,-20,-12, -8,-16, 6,-17, -5, -8, 13, 2, 13, -8, -9,-17,-20,-14, -3; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='E'; M= -7, -1,-22, 1, 13,-22, -1, -3,-22, 11,-17, -9, 0, -8, 11, 11, -3, -9,-19,-16,-12, 11; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='Y'; M=-18,-19,-27,-20,-19, 32,-28, 15, 0,-11, 1, 0,-18,-28,-12,-10,-18, -9, -8, 26, 70,-19; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='K'; M= -5, -4,-23, -6, 1,-21,-17,-11,-21, 20,-20,-10, -2, -4, 2, 20, -1, 5,-13,-21,-11, 0; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='G'; M= -2, 5,-23, -1,-11,-23, 37,-10,-29,-12,-27,-18, 17,-17,-11,-12, 6, -7,-25,-26,-23,-11; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='V'; M= -4,-17,-16,-22,-19, 1,-20,-22, 12,-19, 5, 3,-13,-19,-18,-17, -3, 10, 15,-22, -5,-19; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='F'; M=-10,-23,-22,-26,-21, 18,-12,-17, 2,-23, 10, 2,-18,-17,-23,-18,-16,-10, 0, -9, 6,-22; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='B'; M=-12, 26,-26, 26, 4,-28, 2, 11,-31, -2,-28,-20, 26,-16, -1, -1, 4, -7,-28,-35,-16, 1; /M: SY='C'; M= 6,-13, 40,-18,-15,-20, -7,-23,-22,-19,-18,-16,-11,-24,-18,-21, 1, -3, -8,-36,-24,-16; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='V'; M= -4,-26,-21,-30,-25, 6,-22,-21, 16,-21, 10, 9,-24,-26,-22,-20,-16, -8, 18, -7, 3,-24; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='R'; M= -7,-12,-18,-13, -9, -6,-18,-12, -8, -2,-10, -6, -6, -9, -7, 9, 1, 5, -1,-21, -8,-10; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='K'; M= -9, -5,-27, -7, 5,-24,-22, -8,-14, 15,-16, -5, -2,-12, 14, 14, -3, -1,-13,-23,-10, 8; /M: SY='I'; M= -7,-24,-23,-33,-25, -1,-33,-24, 33,-23, 16, 20,-19,-21,-17,-23,-14, 0, 25,-23, -3,-24; /M: SY='L'; M= 2,-25,-17,-27,-20, 7,-24,-20, 11,-21, 16, 6,-24,-19,-21,-19,-14, -5, 14,-17, 0,-21; /M: SY='K'; M=-11, -2,-27, -4, 6,-26,-20, -6,-26, 31,-23, -8, 0,-12, 15, 31, -4, -1,-19,-21,-10, 9; /M: SY='E'; M= -5, 7,-23, 8, 19,-21,-15, -4,-23, 5,-21,-16, 5, -9, 6, 2, 7, 3,-19,-27,-11, 12; /M: SY='E'; M=-12, 11,-29, 20, 38,-29,-19, 7,-26, 4,-16,-14, 1, -7, 18, -2, -3,-11,-27,-29,-14, 28; /M: SY='G'; M= 1, -9,-29, -9,-19,-29, 65,-19,-39,-19,-30,-20, 1,-19,-19,-19, 3,-17,-29,-21,-29,-19; /M: SY='F'; M=-11,-28,-22,-29,-21, 19,-28,-22, 9,-24, 15, 5,-25, -7,-26,-20,-19, -8, 8,-16, 0,-23; /M: SY='R'; M=-11, -8,-26,-10, -3,-13,-19,-10,-18, 9,-13, -8, -3, -5, -2, 17, -6, -3,-15,-23,-10, -4; /M: SY='G'; M= 14, -7,-19,-11,-12,-23, 25,-18,-25,-11,-22,-15, -1,-14,-12,-15, 10, 1,-15,-24,-22,-12; /M: SY='F'; M=-12,-28,-19,-32,-24, 30,-30,-21, 14,-28, 28, 11,-24,-28,-27,-20,-21, -5, 10,-12, 8,-24; /M: SY='W'; M=-15,-28,-34,-30,-24, 26,-25, -5, -8,-16, -6, -8,-26,-29,-17,-15,-25,-16,-15, 65, 49,-21; /M: SY='K'; M=-11, -2,-28, -3, 8,-28,-19, -5,-27, 34,-25, -9, 1,-12, 16, 31, -4, -5,-20,-22,-11, 11; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='F'; M= -7,-20, -9,-26,-21, 16,-24,-20, 2,-23, 12, 1,-17,-26,-23,-18,-14, -1, 2, -8, 2,-20; /M: SY='T'; M= 2,-12,-18,-18,-15, -3,-17,-19, -1,-15, -6, -6, -7,-13,-15,-16, 2, 8, 2,-15, -8,-15; /M: SY='P'; M= 12,-15,-24,-13, -6,-23,-12,-20,-13,-11,-20,-14,-14, 36,-10,-19, 3, -2,-11,-28,-24,-10; /M: SY='T'; M= -5, 0,-19, -6, -9,-13, -6, -8,-14, -6,-14,-10, 8,-18, -7, 1, 7, 9,-10,-27,-10, -9; /M: SY='L'; M= -9,-29,-21,-32,-25, 11,-30,-21, 21,-24, 22, 15,-27,-28,-22,-20,-22, -9, 19, -6, 6,-24; /M: SY='L'; M= -2,-21,-23,-25,-15, -5,-20,-14, 12,-18, 16, 12,-18,-21, -5,-16,-15, -9, 3,-16, 0,-12; /M: SY='R'; M=-14,-10,-29,-11, -5,-21, 0, -5,-28, 17,-20, -7, -2,-19, 3, 41, -9,-12,-20,-20,-14, -5; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='Q'; M= -4,-11,-22,-15, -8, -9,-21, -6, 4,-10, 1, 3, -7,-18, 5,-10, -6, -5, -2,-16, 3, -3; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='V'; M= 2,-20,-14,-25,-23, -8, -1,-24, 4,-22, -5, -2,-13,-21,-21,-23, -5, -8, 7,-23,-13,-23; /M: SY='P'; M= -4,-17,-23,-18,-12,-12,-21,-18, 4,-15, -5, 3,-13, 11,-10,-17, -1, 4, 1,-28,-14,-13; /M: SY='Y'; M=-12,-10,-27,-12,-12, 0,-18, -1, -6, -9, -6, -3, -8,-22, -7, -9,-12, -7, -8, -1, 14,-11; /M: SY='N'; M= 1, 3,-19, -5, -6,-20, -2, -9,-17, -4,-18,-11, 10,-16, 0, -1, 7, 8,-13,-27,-16, -3; /M: SY='A'; M= 26,-14, -2,-22,-15,-14,-10,-20, -3,-14, -3, -2,-14,-17,-13,-19, 3, 1, 7,-25,-16,-14; /M: SY='L'; M= 1,-24, -9,-30,-23, 3,-26,-23, 16,-23, 17, 11,-21,-24,-20,-21,-14, -4, 16,-22, -5,-22; /M: SY='R'; M=-11, -6,-25, -8, 1,-16,-21, -2,-13, 12,-13, -2, -3,-17, 9, 18, -6, -5,-10,-19, -3, 4; /M: SY='F'; M=-17,-31,-23,-37,-27, 52,-30,-21, 6,-29, 19, 5,-24,-29,-32,-21,-24,-12, 2, 11, 21,-27; /M: SY='G'; M= 7,-19,-19,-23,-23, -3, 8,-23, -4,-20, -7, -5,-14,-22,-23,-21, -5, -9, 5,-18,-12,-23; /M: SY='V'; M= -8,-24, 1,-30,-24, 11,-28,-23, 11,-24, 9, 7,-19,-26,-23,-21,-11, -2, 13,-22, -2,-24; /M: SY='Y'; M=-18,-21,-27,-24,-20, 34,-29, 6, 1,-12, 4, 4,-19,-28,-15,-10,-20,-10, -6, 16, 54,-20; /M: SY='D'; M=-12, 27,-26, 39, 29,-32,-14, -3,-32, 1,-24,-24, 10, -7, 6, -7, 5, -1,-25,-35,-19, 17; /M: SY='Q'; M= -6, -7,-21, -8, 4,-13,-20, -9,-11, -1,-10, -5, -6,-15, 7, 1, 2, 4, -7,-25, -9, 5; /M: SY='L'; M= -2,-22,-17,-26,-20, 6,-24,-17, 14,-20, 15, 13,-20,-23,-17,-17,-11, -1, 14,-19, 1,-19; /M: SY='K'; M= -8, -4,-25, -5, 1,-19,-19,-10,-19, 26,-22, -8, -1,-15, 4, 18, -5, -6,-10,-22, -9, 2; /M: SY='K'; M= -4, 3,-26, 1, 9,-27, -2, -7,-23, 10,-22,-12, 5,-13, 8, 3, -1, -9,-19,-25,-17, 9; /M: SY='Y'; M= -2,-19,-24,-23,-13, 8,-21, -4, -2,-14, 4, 4,-16,-21,-11,-11,-14,-10, -4, 0, 12,-13; /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 1'459 in 496 different sequences |
Number of true positive hits | 1'459 in 496 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 1 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 99.93 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Eukaryotic viruses |
Maximum number of repetitions [info] | 3 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | CJA_Sigrist |
Feature key [info] | REPEAT |
Feature description [info] | Solcar |
Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
496 sequences
ADNT1_ARATH (O04619), ADT1_ANOGA (Q27238), ADT1_ARATH (P31167), ADT1_BOVIN (P02722), ADT1_GOSHI (O22342), ADT1_HUMAN (P12235), ADT1_MAIZE (P04709), ADT1_MOUSE (P48962), ADT1_RABIT (O46373), ADT1_RAT(Q05962), ADT1_SOLTU (P25083), ADT1_WHEAT (Q41629), ADT1_YEAST (P04710), ADT2_ANOGA (Q7PQV7), ADT2_ARATH (P40941), ADT2_BOVIN (Q8SQH5), ADT2_HUMAN (P05141), ADT2_MAIZE (P12857), ADT2_MOUSE (P51881), ADT2_PONAB (Q5R5A1), ADT2_RAT(Q09073), ADT2_SOLTU (P27081), ADT2_TACAC (Q000K2), ADT2_WHEAT (Q41630), ADT2_YEAST (P18239), ADT3_ARATH (O49447), ADT3_BOVIN (P32007), ADT3_HUMAN (P12236), ADT3_PIG(Q6QRN9), ADT3_YEAST (P18238), ADT4_ARATH (Q8LB08), ADT4_BOVIN (Q2YDD9), ADT4_HUMAN (Q9H0C2), ADT4_MACFA (Q4R8M0), ADT4_MOUSE (Q3V132), ADT5_ARATH (Q9FM86), ADT_CHLRE (P27080), ADT_DICDI (O97470), ADT_DROME (Q26365), ADT_KLULA (P49382), ADT_NEUCR (P02723), ADT_ORYSJ (P31691), ADT_PARKE (P31692), ADT_SCHPO (Q09188), ADT_THET4 (G2QNH0), AGC1_EREGS (Q75AH6), AGC1_YEAST (Q12482), ALT9_ALTAL (A0A3G9HRV8), ANT1_EREGS (Q75A82), ANT1_YEAST (Q06497), ARG13_NEUCR (Q01356), BAC1_ARATH (Q84UC7), BAC2_ARATH (Q9CA93), BMCP_DROME (Q7K566), BRT1_ARATH (Q9SUV1), BRTL1_ARATH (Q9LJX5), BRTL2_ARATH (Q9C9R4), BRTL3_ARATH (Q9LV81), BT1_MAIZE (P29518), CMC1_CAEEL (Q21153), CMC1_YEAST (D6W196), CMC1_YEASX (P0CI40), CMC2_CAEEL (Q20799), CMC3_CAEBR (Q628Z2), CMC3_CAEEL (Q19529), CMC_DICDI (Q54RB9), CMC_DROME (Q9VA73), COAC1_ARATH (F4HW79), COAC1_MAIZE (K7VYZ9), COAC2_ARATH (F4JU70), COAC2_MAIZE (B4F8I5), COLT_DROME (Q9VQG4), CRC1_YEAST (Q12289), CTPA_ASPNA (G3YC86), CTPB_ASPNA (G3YD89), CTPC_ASPNA (G3YAF3), CTPD_ASPNA (G3YFS7), CTPE_ASPNA (G3XP90), CTPF_ASPNA (G3Y1Q5), DIC1_CANGA (Q6FTN2), DIC1_YEAST (Q06143), DIC_CAEEL (G5EE96), DIC_HUMAN (Q9UBX3), DIC_MOUSE (Q9QZD8), DIC_RAT (O89035), DIF1_CAEEL (Q27257), DTC_ARATH (Q9C5M0), EAAC_ARATH (O65023), FDB19_FUSPC (K3VFR5), FLX1_YEAST (P40464), FOLT1_ARATH (Q7XA87), FUM11_GIBM7 (Q8J2Q9), GDC_BOVIN (Q01888), GDC_HUMAN (P16260), GDC_MOUSE (Q8C0K5), GDC_RAT (P16261), GGC1_YEAST (P38988), GHC1_BOVIN (Q08DK4), GHC1_HUMAN (Q9H936), GHC1_MOUSE (Q9D6M3), GHC1_PONAB (Q5RD81), GHC1_RAT(A0A0G2K5L2), GHC2_HUMAN (Q9H1K4), GHC2_MOUSE (Q9DB41), GHC2_RAT(Q505J6), KMCP1_HUMAN (Q5SVS4), KMCP1_MACFA (Q8HXE3), KMCP1_MOUSE (Q9CR58), KMCP1_RAT (Q5PQM9), KMCP1_XENLA (Q6GQ22), KMCP1_XENTR (Q5XGI1), LEU5_YEAST (P38702), M2OM_BOVIN (P22292), M2OM_CAEEL (P90992), M2OM_DICDI (Q54PY7), M2OM_HUMAN (Q02978), M2OM_MOUSE (Q9CR62), M2OM_NEUCR (P0C582), M2OM_PIG(F1RFX9), M2OM_RAT(P97700), MAPC1_ARATH (Q9FLS8), MAPC2_ARATH (Q9FI43), MAPC3_ARATH (Q9LY28), MCAR_MIMIV (Q5UPV8), MCAT_ARATH (Q93XM7), MCAT_HUMAN (O43772), MCAT_MACFA (Q8HXY2), MCAT_MOUSE (Q9Z2Z6), MCAT_RAT(P97521), MCFA_DICDI (Q54EV4), MCFB_DICDI (Q54MZ4), MCFC_DICDI (B0G159), MCFD_DICDI (Q55E85), MCFE_DICDI (Q55E45), MCFG_DICDI (Q54BM3), MCFI_DICDI (Q86I81), MCFJ_DICDI (Q54VX4), MCFL_DICDI (Q54W11), MCFM_DICDI (Q54QN2), MCFN_DICDI (Q54BF6), MCFP_DICDI (Q54DU1), MCFR_DICDI (Q54QI8), MCFS_DICDI (Q54FE6), MCFU_DICDI (Q54S10), MCFV_DICDI (Q551X6), MCFW_DICDI (Q54FU9), MCFX_DICDI (Q86AV5), MCFY_DICDI (Q86HN8), MCFZ_DICDI (Q54B67), MFL1_ARATH (Q9FHX2), MFN2A_XENLA (Q6GLJ0), MFN2B_XENLA (Q68F18), MFRN1_BOVIN (Q3ZBJ8), MFRN1_DANRE (Q287T7), MFRN1_HUMAN (Q9NYZ2), MFRN1_MOUSE (Q920G8), MFRN1_RAT (Q66H23), MFRN2_DANRE (Q7T292), MFRN2_HUMAN (Q96A46), MFRN2_MOUSE (Q8R0Z5), MFRN_CAEBR (Q620A6), MFRN_CAEEL (Q23125), MFRN_DICDI (Q55DY8), MFRN_DROME (Q9VAY3), MME1_DROME (Q9VM51), MME1_YEAST (Q03829), MNCP_OXYFA (P15798), MNCP_OXYTR (Q27151), MPCP1_ARATH (Q7DNC3), MPCP2_ARATH (Q9M2Z8), MPCP3_ARATH (Q9FMU6), MPCP_CAEEL (P40614), MPCP_CHOFU (O61703), MPCP_SCHPO (Q9P7V8), MPCP_YEAST (P23641), MRS3_YEAST (P10566), MRS4_YEAST (P23500), MTCH1_HUMAN (Q9NZJ7), MTCH1_MOUSE (Q791T5), MTCH2_BOVIN (Q9N285), MTCH2_HUMAN (Q9Y6C9), MTCH2_MOUSE (Q791V5), MTCH2_PONAB (Q5R5M0), MTM1_ARATH (Q944H5), MTM1_YEAST (P53320), MTT1_USTMD (A0A0U2IR85), NDT1_ARATH (O22261), NDT2_ARATH (Q8RWA5), OAC1_SCHPO (Q9UTN1), OAC1_YEAST (P32332), ODC1_YEAST (Q03028), ODC2_YEAST (Q99297), ODC_BOVIN (A0JN87), ODC_DICDI (Q55GE2), ODC_HUMAN (Q9BQT8), ODC_MOUSE (Q8BZ09), ODC_PONAB (Q5RFB7), ODC_RAT (Q99JD3), ODC_SCHPO (Q9P3T7), ORNT1_HUMAN (Q9Y619), ORNT1_MOUSE (Q9WVD5), ORNT1_RAT (A0A0G2K309), ORNT2_HUMAN (Q9BXI2), ORT1_YEAST (Q12375), PET8_EREGS (O60029), PET8_YEAST (P38921), PIC2_YEAST (P40035), PM34_DICDI (Q76P23), PM34_HUMAN (O43808), PM34_MOUSE (O70579), PM47A_CANBO (P21245), PM47B_CANBO (Q00319), PNC1_ARATH (Q9MA90), PNC1_SOYBN (B6ZJZ9), PNC2_ARATH (Q8VZS0), PUMP1_ARATH (O81845), PUMP2_ARATH (Q9ZWG1), PUMP3_ARATH (Q9XI74), PUMP4_ARATH (Q9SB52), PUMP5_ARATH (Q9SJY5), PUMP6_ARATH (Q9FY68), PXN_ARATH (O04200), RIM2_DROME (Q9VQ37), RIM2_YEAST (P38127), S238A_DANRE (Q08CI8), S238B_DANRE (P0CAT2), S246A_XENLA (Q6INQ6), S246B_XENLA (Q63ZR7), S247A_DANRE (Q1ECW7), S247B_DANRE (A4QNX2), S2512_HUMAN (O75746), S2512_MOUSE (Q8BH59), S2512_PONAB (Q5RBC8), S2512_RAT (F1LX07), S2513_HUMAN (Q9UJS0), S2513_MACFA (Q8HXW2), S2513_MOUSE (Q9QXX4), S2513_RAT (F1LZW6), S2529_BOVIN (Q08DK7), S2529_HUMAN (Q8N8R3), S2529_MOUSE (Q8BL03), S2529_RAT (Q5HZE0), S2532_CRIGR (Q6IZB5), S2532_HUMAN (Q9H2D1), S2532_MACFA (Q95J75), S2532_MOUSE (Q8BMG8), S2533_BOVIN (Q1LZB3), S2533_DANRE (Q6P036), S2533_HUMAN (Q9BSK2), S2533_MOUSE (Q3TZX3), S2534_BOVIN (Q3SZK0), S2534_DANRE (Q6PH61), S2534_HUMAN (Q6PIV7), S2534_MOUSE (A2ADF7), S2534_RAT (Q5XIF9), S2535_BOVIN (Q58DS3), S2535_DANRE (A3KPP4), S2535_HUMAN (Q3KQZ1), S2535_MOUSE (Q5SWT3), S2536_CHICK (Q5ZKP7), S2536_DANRE (Q6DG32), S2536_HUMAN (Q96CQ1), S2536_MOUSE (Q922G0), S2538_AJECN (A6RAY2), S2538_ASPCL (A1CIF6), S2538_ASPFC (B0Y4J4), S2538_ASPFU (Q4WQC5), S2538_ASPNC (A2Q9F0), S2538_ASPOR (Q2UU67), S2538_ASPTN (Q0CT66), S2538_BOTFB (A6S8E0), S2538_BOVIN (Q5EAC0), S2538_CANAL (Q59KC4), S2538_CANGA (Q6FR88), S2538_CHAGB (Q2H608), S2538_COCIM (Q1DRJ3), S2538_DEBHA (Q6BH02), S2538_EMENI (Q5B717), S2538_EREGS (Q74Z23), S2538_HUMAN (Q96DW6), S2538_KLULA (Q6CNY8), S2538_LACBS (B0DK57), S2538_MOUSE (Q91XD8), S2538_NEOFI (A1CWA4), S2538_NEUCR (Q96U08), S2538_PICGU (A5D9W9), S2538_PICST (A3M019), S2538_PYRO7 (A4RPU0), S2538_PYRTR (B2VSU4), S2538_RAT (Q499U1), S2538_SCHPO (Q9P6N6), S2538_SCLS1 (A7F9Y3), S2538_SHEEP (B2MVX9), S2538_USTMA (Q4PDL5), S2538_VANPO (A7TIQ0), S2538_XENLA (Q6DE75), S2538_XENTR (Q6DJ08), S2538_YARLI (Q6C6I3), S2538_YEAS1 (B3LH09), S2538_YEAS7 (A6ZXL1), S2538_YEAST (Q07534), S2539_BOVIN (Q17QI7), S2539_DANRE (Q7SXW0), S2539_HUMAN (Q9BZJ4), S2539_MOUSE (Q9D8K8), S2539_RAT (Q4V8K4), S2540_BOVIN (Q0VCH6), S2540_DANRE (Q6DHC3), S2540_DICDI (Q552L9), S2540_HUMAN (Q8TBP6), S2540_MOUSE (Q8BGP6), S2540_RAT (Q498U3), S2540_XENLA (Q6DFK2), S2540_XENTR (Q6P316), S2541_BOVIN (Q0II44), S2541_HUMAN (Q8N5S1), S2541_MOUSE (Q8BVN7), S2541_RAT (B8ZHC9), S2542_DANRE (Q0P483), S2542_HUMAN (Q86VD7), S2542_MOUSE (Q8R0Y8), S2542_RAT (P0C546), S2542_XENLA (Q5PQ27), S2542_XENTR (Q05AQ3), S2543_DANRE (Q5U3V7), S2543_HUMAN (Q8WUT9), S2543_MOUSE (A2A3V2), S2544_HUMAN (Q96H78), S2544_MOUSE (Q8BGF9), S2544_PONAB (Q5RD67), S2545_HUMAN (Q8N413), S2545_MOUSE (Q8CFJ7), S2546_CHICK (Q5ZIG3), S2546_DANRE (Q6DGU5), S2546_HUMAN (Q96AG3), S2546_MOUSE (Q9CQS4), S2546_RAT (Q5EB62), S2546_XENTR (A4IIC3), S2547_HUMAN (Q6Q0C1), S2547_MOUSE (Q6IS41), S2547_RAT (Q6J329), S2548_BOVIN (Q3MHI3), S2548_DANRE (Q6DHS9), S2548_HUMAN (Q6ZT89), S2548_MOUSE (Q8BW66), S2551_HUMAN (Q9H1U9), S2551_MOUSE (Q5HZI9), S2551_RAT (Q52KK3), S2552_HUMAN (Q3SY17), S2553_HUMAN (Q5H9E4), S25A3_BOVIN (P12234), S25A3_HUMAN (Q00325), S25A3_MOUSE (Q8VEM8), S25A3_PONAB (Q5R7W2), S25A3_RAT (P16036), SAMC1_ARATH (Q94AG6), SAMC2_ARATH (F4HT41), SAMC_BOVIN (A6QR09), SAMC_DANRE (Q4V9P0), SAMC_DROME (Q9VBN7), SAMC_HUMAN (Q70HW3), SAMC_MOUSE (Q5U680), SAMC_XENLA (Q641C8), SAMC_XENTR (Q6GLA2), SCM1A_XENLA (Q7ZY36), SCM1B_XENLA (Q7T0U6), SCM2A_DANRE (Q6NYZ6), SCM2B_DANRE (A2CEQ0), SCMC1_BOVIN (A5PJZ1), SCMC1_DANRE (Q66L49), SCMC1_HUMAN (Q6NUK1), SCMC1_MOUSE (Q8BMD8), SCMC1_RABIT (O18757), SCMC1_XENTR (Q5XHA0), SCMC2_BOVIN (Q0V7M4), SCMC2_HUMAN (Q6KCM7), SCMC2_MOUSE (A2ASZ8), SCMC2_RAT (Q8K3P6), SCMC2_XENLA (Q7ZYD5), SCMC2_XENTR (Q5XH95), SCMC3_HUMAN (Q9BV35), SCMC3_MOUSE (Q6GQS1), SFC1_ARATH (Q9M038), SFC1_YEAST (P33303), SHAWN_DROME (Q9VWG0), TAAC_ARATH (Q9M024), TDPC1_ARATH (Q8RXZ9), TDPC1_MAIZE (B4FIJ0), TDPC2_ARATH (Q9FI73), TDPC2_MAIZE (A0A1D6N272), TPC1_AJECN (A6RF73), TPC1_ASPFU (Q4X022), TPC1_ASPNC (A2R5A0), TPC1_ASPOR (Q2UCW8), TPC1_ASPTN (Q0CEN9), TPC1_BOTFB (A6SL61), TPC1_CANAL (Q59Q36), TPC1_CANGA (Q6FTE5), TPC1_CHAGB (Q2HFL6), TPC1_COCIM (Q1E7P0), TPC1_DEBHA (Q6BPW0), TPC1_EMENI (Q5AVW1), TPC1_EREGS (Q75EP3), TPC1_KLULA (Q6CQR3), TPC1_LODEL (A5DX39), TPC1_NEOFI (A1DI57), TPC1_NEUCR (Q7S2H8), TPC1_PHANO (Q0UUH1), TPC1_PICGU (A5DIS9), TPC1_PICST (A3LVX1), TPC1_PYRO7 (A4RF23), TPC1_SCLS1 (A7ER02), TPC1_VANPO (A7TDX5), TPC1_YARLI (Q6C107), TPC1_YEAS7 (A6ZV78), TPC1_YEAST (P53257), TPC_BOVIN (Q29RM1), TPC_DICDI (Q54VS7), TPC_HUMAN (Q9HC21), TPC_MACFA (Q5IS35), TPC_MOUSE (Q9DAM5), TPC_PONAB (Q5NVC1), TPC_RAT (Q6AYL0), TXTPA_DANRE (Q6PGY3), TXTPB_DANRE (F1R4U0), TXTP_BOVIN (P79110), TXTP_CAEEL (P34519), TXTP_HUMAN (P53007), TXTP_MOUSE (Q8JZU2), TXTP_RAT(P32089), TXTP_YEAST (P38152), UCP1_BOVIN (P10861), UCP1_CANLF (Q9GMZ1), UCP1_DICGR (Q8K404), UCP1_HUMAN (P25874), UCP1_MESAU (P04575), UCP1_MOUSE (P12242), UCP1_OCHDA (A0PC02), UCP1_PHOSU (Q9ER18), UCP1_RABIT (P14271), UCP1_RAT(P04633), UCP1_SHEEP (W5PSH7), UCP1_SUNMU (Q18P97), UCP2_BOVIN (Q3SZI5), UCP2_CANLF (Q9N2J1), UCP2_CYPCA (Q9W725), UCP2_DANRE (Q9W720), UCP2_HUMAN (P55851), UCP2_MOUSE (P70406), UCP2_PIG(O97562), UCP2_PONAB (Q5R5A8), UCP2_RAT(P56500), UCP3_BOVIN (O77792), UCP3_CANLF (Q9N2I9), UCP3_HUMAN (P55916), UCP3_MOUSE (P56501), UCP3_PIG(O97649), UCP3_RAT(P56499), UCP4C_DROME (Q9VMK1), UCP4_HUMAN (O95847), UCP4_MOUSE (Q9D6D0), UCP5_HUMAN (O95258), UCP5_MOUSE (Q9Z2B2), UCPA_DICDI (Q55BF4), UCPB_DICDI (B0G143), UGO1_SCHPO (Q9UTF8), Y2148_TRIVH (P0CH61), YAD8_SCHPO (Q09834), YB8B_SCHPO (O59674), YBC9_SCHPO (O13660), YBT5_SCHPO (O94502), YD1K_SCHPO (Q10248), YDE9_SCHPO (Q10442), YE08_SCHPO (O13805), YEA6_YEAST (P39953), YETC_SCHPO (O14281), YFG5_SCHPO (O13844), YFL5_YEAS1 (B3LUQ6), YFL5_YEAS6 (B5VI70), YFL5_YEAS7 (A7A285), YFL5_YEAST (P43617), YG04_SCHPO (O94370), YG1D_SCHPO (P78763), YH66_SCHPO (Q9P7X9), YHM2_YEAST (Q04013), YHMB_SCHPO (O94344), YIA6_YEAST (P40556), YID3_SCHPO (Q9UTD6), YIKC_SCHPO (Q8TFH2), YJE9_SCHPO (O74439), YKQ9_SCHPO (Q9P6L7), YMC1_YEAST (P32331), YMC2_YEAST (P38087), YP011_YEAST (Q12251), YQ51_CAEEL (Q09461), YQ73_SCHPO (Q76PC3)» more
|
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
1 sequence
UGO1_YEAST (Q03327) |
PDB [Detailed view] |
12 PDB
1OKC; 2C3E; 2LCK; 4C9G; 4C9H; 4C9J; 4C9Q; 6GCI; 8G8W; 8HBV; 8HBW; 8J1N |