PROSITE entry PS50922
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | TLC |
| Accession [info] | PS50922 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-AUG-2003 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50922 |
| Associated ProRule [info] | PRU00205 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | TLC domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=202; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=197; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.1675694; R2=0.0199184; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=12106.2138672; R2=7.1294498; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=243; H_SCORE=13839; N_SCORE=8.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=168; H_SCORE=13304; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: B0=-30; E0=-30; M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='K'; M= -1,-13,-20,-16, -9, -9,-19,-16, -4, 1, -6, -3, -9,-17, -8, 1, -2, 0, 1,-23, -8, -9; /M: SY='K'; M=-12, -3,-25, -2, -4, -7,-22, -8,-16, 12,-15, -9, -5,-18, -5, 10, -7, -2, -8,-16, 3, -5; /M: SY='R'; M= -7,-15,-16,-20,-13, 5,-18,-14,-17, -3,-13,-10, -9,-21,-11, 11, -4, -1,-11, -3, -1,-12; /M: SY='M'; M=-10,-12,-25,-18,-15, 1,-15,-14, -5, -4, -4, 2, -7,-23,-13, -6,-14,-10, -4, -2, -1,-13; /M: SY='E'; M=-10, -1,-25, -1, 14,-18,-18, -5,-13, 2,-10, -7, 2,-13, 5, 9, -2, -5,-14,-28,-13, 8; /M: SY='W'; M= -4,-25,-26,-28,-21, 8,-18,-23, -5,-20, -6, -8,-21,-23,-18,-18,-11, -8, -5, 35, 6,-17; /M: SY='S'; M= 4, 3,-18, 0, -5,-14, -4, 2,-18,-12,-15,-12, 6,-16, -6,-12, 8, -1,-13,-29,-11, -6; /M: SY='N'; M= 2, 12,-21, 0, -5,-17, -7, 1,-17, -5,-21,-14, 21,-17, -1, -7, 5, 2,-20,-15,-11, -3; /M: SY='R'; M=-16,-13,-27,-13, -3,-14,-23, 5,-16, 10, -2, 0, -7,-21, 5, 30,-15,-11,-13,-21, -4, -2; /M: SY='L'; M= 0,-20, -4,-23,-19, -6,-13,-20, 2,-21, 12, 5,-18,-24,-18,-19, -9, -1, 5,-26,-11,-18; /M: SY='V'; M= -2,-26,-15,-30,-26, 12,-28,-26, 19,-22, 12, 7,-23,-26,-26,-20,-11, 1, 27,-21, -2,-26; /M: SY='S'; M= 1, -8,-14,-10, -8, 6, -9, -9,-14,-14,-19,-14, 1,-16, -9,-12, 22, 11, -8,-23, 0, -8; /M: SY='T'; M= -4,-10,-17,-14,-13, 4,-10,-11,-10,-15, -7, -8, -6,-18,-13,-13, 7, 14, -6,-17, 5,-13; /M: SY='V'; M= 1,-24,-15,-29,-24, 7,-26,-25, 18,-21, 13, 7,-22,-24,-24,-20, -9, 2, 25,-22, -4,-24; /M: SY='H'; M=-14, -3,-28, -4, 3,-17,-19, 51,-22, -5,-18, -2, 3,-17, 20, 0, -4,-12,-25,-22, 11, 9; /M: SY='A'; M= 31, -5,-10,-10, -5,-20, 0,-15,-15,-10,-20,-15, 0,-10, -5,-15, 24, 10, -5,-30,-20, -5; /M: SY='I'; M= -5,-16,-11,-23,-15, -7,-30,-24, 16,-18, 3, 3,-13,-18,-15,-19, -4, 10, 16,-27, -8,-17; /M: SY='I'; M= -4,-25,-18,-31,-25, 8,-29,-23, 23,-22, 16, 14,-22,-24,-22,-20,-13, -1, 23,-21, -2,-24; /M: SY='A'; M= 15,-12,-16,-17,-11,-11,-11,-11, -8,-15, -3, -6, -9,-16, -9,-16, 5, 5, -4,-15, -9,-10; /M: SY='G'; M= 8,-12,-20,-15,-16,-19, 17,-20,-12,-17,-16,-10, -5,-17,-15,-19, 7, -2, -4,-26,-20,-16; /M: SY='L'; M= -6,-20, -2,-25,-21, 1,-24,-23, 7,-23, 12, 3,-18,-24,-21,-20, -9, 7, 9,-25, -7,-21; /M: SY='W'; M= 1,-22,-24,-25,-18, 7,-18,-14, -4,-18, 2, -4,-20,-23,-15,-17,-12, -8, -7, 22, 14,-16; /M: SY='A'; M= 15,-15,-18,-20,-17,-15, 7,-21, -5,-18, -6, -5,-10,-18,-16,-20, 1, -5, 1,-23,-17,-17; /M: SY='Y'; M=-10,-22,-21,-26,-21, 15,-29,-14, 13,-21, 16, 7,-19,-24,-18,-17,-14, 3, 8, -9, 17,-21; /M: SY='L'; M= -3,-21,-20,-25,-19, 5,-26,-13, 12,-20, 16, 7,-19,-23,-15,-18,-12, 0, 8,-13, 11,-19; /M: SY='C'; M= -7,-12, 12,-18,-16, 2,-12,-18,-13,-19,-13,-11, -5,-25,-20,-18, 0, -4, -5,-27,-11,-17; /M: SY='L'; M= -9,-12,-21,-10, -3, 0,-24,-15, 1,-14, 10, 0,-14,-21,-11,-10,-11, -6, 1,-23, -6, -7; /M: M=-10,-13,-14,-15, -8,-17,-21,-16,-14, -4,-15,-10,-12, -1, -4, -5, -9, -5,-13, -9,-11, -7; /M: SY='Y'; M=-10, -6,-27, -3, 3,-11,-21, -6, -8, -7,-12, -8, -8,-16, 2,-10, -5, -7,-10, -4, 5, 1; /M: SY='C'; M= -7,-10, 2,-15,-16, -1,-22,-18, -1,-20, 2, -3, -7,-24,-18,-17, -4, 2, 2,-29, -9,-17; /I: I=-4; MD=-8; /M: SY='S'; M= -6, 4,-21, 4, -2,-12,-12, -6,-18, -3,-21,-15, 6, -2, -4, -6, 9, 6,-16,-25, -6, -4; D=-4; /I: I=-4; MD=-8; /M: SY='E'; M= 4, 4, -2, 1, 6,-23,-11, -7,-20, 1,-18,-13, 3,-12, 4, -5, 3, -4,-15,-26,-16, 5; D=-4; /I: I=-4; MD=-8; /M: SY='F'; M= -9,-15,-19,-17, -8, 11,-19,-12, -2,-13, 2, 3,-13, 3,-12,-12,-10, -2, -5,-12, -1,-10; D=-4; /I: I=-4; MD=-8; /M: SY='L'; M= -6,-10,-16, -9,-10, -6,-18,-13, 4,-12, 7, 6,-14, -5,-11,-13,-10, -2, 5,-21, -8,-11; D=-4; /I: I=-4; MD=-8; /M: SY='F'; M= -7,-11, 1,-13, -7, 4,-19, -9, -2, -8, -3, -3,-11,-16,-10, -9, -8, -5, 1,-11, 3, -9; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8; /M: SY='D'; M= -6, 5,-28, 11, 6,-21,-14, 1,-24, -6,-22,-18, -1, -1, -2,-11, -1, -5,-22,-12, -6, 1; /M: SY='P'; M= -9,-15,-29,-13, -5,-16,-26,-19, 1, -4, -5, -2,-15, 10, -9,-10,-13, -9, -2,-25,-13, -9; /M: SY='L'; M= 1,-10,-23,-11, -5,-12,-22, -4, 3,-16, 6, 2,-11,-17, -8,-16,-10, -9, 1,-25, -6, -8; /M: SY='N'; M=-10, 3,-22, -1, -4, -8,-16, 4,-13, -8,-11, -7, 8,-18, -1, -4, 1, 1,-14,-26, -5, -3; /M: SY='G'; M= 0, -6,-24, -5, -8,-17, 2,-12,-18, -6,-16,-12, -6, -7, -9,-11, 0, -4,-13,-21, -9,-10; /M: SY='Y'; M=-12,-16,-29,-18,-10, -6,-18, -3, -7, -8, -8, 6,-15, -7, 4, -9,-12, -6,-14, 8, 13, -4; /M: SY='S'; M= -1, 0,-17, -3, 0,-20,-12, 0,-20, -1,-22,-12, 5,-11, 5, 0, 19, 17,-12,-32,-11, 2; /M: SY='Y'; M= -4,-12,-24,-17,-14, -2,-17, 8, -8, -8, -8, 0, -7,-22, -8, -3,-10,-10, -7, -2, 9,-12; /M: SY='L'; M= -5,-19,-24,-19,-11, -8,-21,-17, -4, -5, 2, -1,-18,-21, -7, -6,-13, -8, -3, 0, -3, -8; /M: SY='S'; M= 1, -4, -7, -5, -6,-18, -5,-11,-17,-12,-11,-10, -4,-18, -3,-13, 4, 0,-12,-27,-12, -5; /M: SY='K'; M= -4, -9,-26, -9, -1,-14, -6, -8,-18, 3,-18, -6, -7,-15, -1, -3, -2, -7,-16, -3, -1, -2; /M: SY='F'; M= -7, -3,-22, -1, -5, 3,-18,-10,-12,-12, -3, -7, -5,-19, -8, -9, -5, -6,-10,-19, -3, -5; /M: SY='I'; M=-11,-24,-23,-26,-19, 8,-31, -6, 17,-21, 15, 10,-21,-26,-17,-18,-18, -9, 14,-14, 13,-20; /M: SY='Y'; M=-12,-22,-23,-28,-23, 13,-29, -6, 17,-16, 9, 18,-19,-24,-14,-16,-15, -3, 11, -5, 25,-20; /M: SY='A'; M= 7,-13, -3,-20,-15,-16,-10,-18, -5,-14, -7, 0,-10,-18, -8,-17, 0, 3, 0,-26,-15,-12; /M: SY='F'; M=-13,-26,-21,-33,-24, 38,-28,-21, 7,-26, 14, 3,-19,-26,-27,-20,-16, -3, 3, 0, 13,-24; /M: SY='S'; M= 16, -4,-13, -9, -3,-17, -6,-12,-15, -9,-19,-13, 1,-11, 1,-11, 22, 13, -8,-29,-15, -1; /M: SY='L'; M= 11,-21,-17,-27,-18, -4,-21,-23, 13,-21, 17, 7,-19,-20,-17,-21, -9, 0, 13,-22, -8,-18; /M: SY='G'; M= 3,-10,-26,-10,-14,-26, 40,-19,-29,-17,-26,-18, -2, -7,-15,-19, 6,-10,-22,-24,-26,-15; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-29,-23,-21, 37,-30, 11, -1,-14, 0, -1,-20,-24,-16,-12,-20,-10, -9, 23, 66,-21; /M: SY='F'; M=-19,-29,-25,-36,-27, 55,-28,-13, 0,-24, 6, 5,-22,-29,-29,-17,-22,-12, -4, 26, 34,-25; /M: SY='I'; M=-10,-27,-22,-34,-26, 16,-32,-24, 26,-26, 19, 14,-21,-24,-23,-22,-17, -3, 19,-16, 4,-25; /M: SY='Y'; M=-12,-18,-29,-20,-17, 14,-24, 23, -8,-14, -6, -2,-14,-25,-10,-12,-17,-14,-13, 20, 41,-16; /M: SY='D'; M=-11, 32,-27, 45, 18,-33,-11, -1,-32, -1,-26,-24, 12,-10, 4, -9, 3, -7,-25,-33,-15, 11; /M: SY='L'; M=-10,-14,-22,-19,-18, 5,-17,-18, 7,-23, 14, 4,-10,-23,-18,-18,-13, -3, 2,-20, -3,-19; /M: SY='I'; M= -3,-23,-23,-26,-21, 7,-26,-16, 13,-18, 1, 2,-20,-10,-19,-20,-11, -5, 11,-11, 11,-22; /M: SY='A'; M= 4, 0, -6, 0, -1,-19,-16,-12,-11,-10,-10, -5, -6,-15, -7,-16, -4, -7, -7,-27,-12, -5; /M: SY='L'; M= -6,-24, -3,-30,-23, 3,-29,-22, 16,-24, 17, 12,-21,-25,-20,-21,-15, -2, 14,-24, -5,-22; /M: SY='F'; M=-11,-22,-19,-25,-22, 16,-27, 7, 7,-18, 3, 7,-18,-27,-20,-14,-14, -8, 14,-14, 16,-22; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='F'; M=-15,-26,-24,-29,-21, 29,-28,-10, 5,-20, 11, 7,-24,-28,-20,-16,-21,-11, 2, 14, 27,-20; /M: M= -9, -2,-24, -3, -6, -7,-15, 0,-15,-10,-18,-11, 0,-19, -2, -9, -1, -5,-14, -3, -1, -3; /M: SY='K'; M=-12, 7,-23, 8, 12,-30,-18, 7,-28, 15,-26,-13, 6, -2, 11, 6, -5,-10,-26,-28,-13, 10; /M: SY='T'; M= -8,-12,-21,-16, -9,-11,-25, -6, 0, -6, 0, 2, -9,-18, -2, -4, -5, 6, 2,-25, -5, -7; /M: SY='F'; M=-10,-14,-20,-18,-10, 7,-24,-14, -7, -6, 3, -1,-11,-19, -8, 0, -7, 6, -5,-16, 1, -8; /I: I=-2; MD=-4; /M: SY='R'; M= -8,-10,-18,-11, -7, -6, -5, -8,-15, 5,-13, -7, -4,-16, -5, 17, -2, -5, -7,-16, -7, -7; D=-2; /I: I=-2; MD=-4; /M: SY='E'; M= 0, 1,-16, 1, 3,-15,-10, -7,-10, 3,-11, -7, 0, -8, 0, 2, 1, -3, -7,-18, -9, 0; D=-2; /I: I=-2; MD=-4; /M: SY='D'; M= -3, 7,-13, 10, 5,-16, 1, -4,-16, -3,-14,-11, 4, -6, 1, -5, 6, 2,-12,-18,-11, 3; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4; /M: SY='S'; M= -4, -1,-22, -2, -4,-12, 3,-14,-16,-13,-17,-13, 3,-15,-10,-14, 7, 1,-12,-27,-14, -7; /M: SY='I'; M=-11,-25,-31,-28,-22, 0,-11,-22, 4,-19, 0, 0,-17,-16,-18,-14,-18,-14, -2, 1, -3,-22; /M: SY='E'; M=-10, -7,-24, -3, 3, -9,-13,-12,-10, -8, -4, -6,-10,-18, -6, -7, -9, -9, -5,-24,-11, -1; /M: SY='Y'; M=-11,-12,-22,-17,-13, 9,-21, -1, -1,-10, 4, 8, -7,-23, -6, -8,-11, -6, -6,-10, 16,-10; /M: SY='V'; M= 2,-25,-15,-28,-22, -1,-24,-22, 20,-21, 18, 14,-24,-25,-20,-19,-12, -3, 25,-25, -8,-21; /M: SY='V'; M= -6,-27,-17,-30,-27, 14,-21,-26, 17,-24, 10, 6,-23,-27,-28,-21,-13, -4, 24,-19, -1,-27; /M: SY='H'; M=-19, -1,-30, -1, 0,-18,-21, 90,-28, -9,-19, 0, 8,-20, 12, 0,-10,-19,-29,-26, 22, 1; /M: SY='H'; M= -7, -4,-27, -6, -4,-19,-18, 71,-22,-11,-16, 0, 5,-18, 5, -5, -7,-16,-21,-28, 12, -4; /M: SY='I'; M= -1,-26,-20,-32,-26, 14,-22,-25, 18,-24, 11, 7,-20,-24,-25,-23,-13, -7, 18,-15, 0,-26; /M: SY='L'; M= 10,-20,-14,-26,-19, 3,-19,-19, 8,-18, 12, 9,-19,-21,-17,-18, -8, 0, 12,-20, -6,-17; /M: SY='A'; M= 15, -8,-14,-13, -9,-13, -9, -6, -8,-11,-12, -4, -3,-13, -5,-14, 14, 8, -3,-25, -8, -8; /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-34,-25, 11,-31,-19, 27,-25, 28, 26,-24,-25,-18,-21,-22, -9, 18,-18, 2,-22; /M: SY='F'; M= -9,-26,-21,-29,-24, 28,-17,-17, 4,-25, 15, 4,-21,-28,-26,-19,-18,-10, 3, -6, 13,-24; /M: SY='V'; M= 8,-19,-17,-22,-21, -6, -2,-16, 0,-19, -1, -1,-16,-23,-21,-19, -6, -7, 10,-22,-11,-21; /M: SY='F'; M=-13,-29,-11,-38,-29, 25,-34,-25, 22,-30, 17, 10,-21,-27,-27,-25,-21,-10, 14,-13, 7,-29; /M: SY='V'; M= -3,-21,-18,-27,-21, 12,-24,-22, 12,-22, 6, 3,-15,-21,-21,-20, -4, 4, 13,-20, -1,-21; /M: SY='A'; M= 1,-17,-22,-19,-14, -3, -6,-19, -6,-19, -2, -5,-12, -4,-16,-18, -3, -1, -6,-21,-11,-16; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='S'; M= 14, -7,-15,-10, -9,-19, 13,-15,-18,-14,-17,-13, -1,-14, -9,-15, 16, 3,-10,-27,-19, -9; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='Y'; M= -3,-21,-19,-23,-19, 7,-24, -8, 11,-16, 6, 4,-19,-24,-15,-16,-10, -4, 11, -7, 20,-19; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='F'; M= -3,-21,-19,-27,-19, 10,-25,-20, 10,-16, 10, 5,-16,-21,-18,-10,-11, -1, 10,-16, 0,-19; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='Y'; M= -7,-14,-10,-16,-14, -1,-17,-12, -9,-15,-12,-10, -9,-11,-14,-15, -4, -4, -8, -3, 1,-14; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='K'; M=-11, -6,-28, -8, -5,-13, -9, -4,-18, 7,-15, -8, -2,-19, 3, 7,-11,-11,-20, 0, 2, -1; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='R'; M=-13,-13,-25,-13, -3,-10,-22, -8,-12, 11, -1, 0, -9,-19, 4, 22,-14,-10,-11,-17, -5, -1; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='T'; M= 0, -7,-15,-14, -9, 4,-14,-10, -8,-11, -9, -1, -1,-16, -5,-10, 7, 8, -6,-20, -4, -6; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='G'; M= -9,-13,-25,-13,-12,-13, 5, -2,-15, -7, -9, -4, -8,-21, -4, 0, -9,-12,-12,-15, -3, -9; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='Y'; M= -3,-14,-21,-16,-13, 1, -9, -2, -8,-11, -3, -3,-10,-20,-12,-10, -6, -7, -6,-14, 5,-13; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='G'; M= -7,-10,-29, -9,-10,-10, 26, -5,-25,-13,-18,-13, -6,-20,-11,-14, -6,-15,-23, -5, 6,-12; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='I'; M= -1,-13,-24,-13,-12,-12,-11,-19, 2,-19, 2, -1,-11, -6,-13,-19, -7, -7, -2,-24,-13,-15; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='V'; M= 2,-21,-14,-26,-22, 15,-23,-19, 9,-17, 3, 1,-19,-23,-23,-17, -6, 3, 18,-13, 6,-22; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='L'; M= -7,-20, -6,-24,-19, 0,-24,-21, 6,-21, 13, 3,-19,-22,-17,-18,-13, 2, 5, -6, -2,-18; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='L'; M= 1,-19,-17,-24,-18, 1,-23,-15, 10,-18, 14, 10,-18,-21,-15,-16, -9, 5, 10,-18, 3,-17; /M: SY='L'; M= -4,-25,-22,-28,-18, 2,-24,-18, 10,-21, 24, 13,-25,-25,-13,-17,-21, -7, 4, -1, 0,-15; /M: SY='L'; M= -7,-26,-18,-27,-19, 5,-26,-18, 17,-25, 34, 18,-25,-27,-17,-18,-19, -5, 12,-23, -3,-18; /M: SY='A'; M= 3,-14,-22,-17, -9,-11,-16, 1, -7,-10, -5, 1,-12,-18, -6,-11, -6, -7, -4, -6, -3, -8; /M: SY='E'; M=-12, 10,-30, 19, 45,-24,-20, 3,-27, 7,-19,-18, -1, -5, 16, -2, -2,-10,-28,-23, -7, 30; /M: SY='V'; M= 5,-24,-17,-29,-22, 0,-24,-22, 19,-19, 12, 12,-21,-22,-17,-19,-11, -5, 21,-21, -6,-20; /M: SY='S'; M= 6, -2,-11, -4, -4,-17, -6, -8,-16,-11,-24,-16, 6,-12, -3,-10, 31, 22, -6,-37,-16, -4; /M: SY='T'; M= -2, 10,-15, 5, 2,-19,-12,-10,-18, -6,-20,-15, 11,-11, 0, -7, 19, 25,-12,-34,-15, 1; /M: SY='P'; M=-10,-25,-32,-22,-13,-10,-27,-23, 5,-19, -5, -3,-22, 35,-17,-22,-15, -9, -4,-24,-15,-18; /M: SY='F'; M=-18,-30,-21,-39,-29, 68,-31,-21, 5,-30, 15, 3,-21,-29,-37,-21,-21,-10, 3, 5, 25,-29; /M: SY='F'; M=-10,-27,-18,-30,-23, 24,-29,-20, 14,-25, 24, 9,-24,-28,-25,-19,-18, -2, 14,-14, 8,-23; /M: SY='H'; M=-12, 6, 2, 0, -1,-20,-17, 28,-26, -7,-22,-12, 13,-20, -1, -5, -1, -4,-22,-35, -7, -3; /M: SY='I'; M= -9,-27,-23,-32,-24, 3,-33,-25, 30,-28, 29, 16,-23,-24,-19,-23,-20, -3, 19,-21, -1,-24; /M: SY='R'; M= -7, -5,-25, -6, -4,-22, 2, 5,-29, 6,-23,-13, 5,-18, 1, 24, 2, -7,-21,-25,-13, -4; /M: SY='W'; M=-12,-13,-31,-13, -3,-10,-15, -8,-18, 6,-17, -6,-12,-18, -1, 6,-12,-11,-18, 17, 6, -2; /M: SY='M'; M=-13,-26,-25,-34,-25, 18,-31,-13, 25,-22, 18, 26,-21,-23,-16,-19,-21,-10, 13, -9, 14,-22; /M: SY='L'; M= -5,-25,-18,-27,-18, 9,-24,-17, 13,-25, 33, 18,-23,-26,-17,-18,-19, -7, 7,-20, -1,-17; /M: SY='H'; M=-14, 4,-28, 7, 1,-19,-21, 8,-17, 8,-13, -7, 0,-16, 0, 2,-10, -9,-15,-23, 0, -1; /M: SY='Y'; M=-12, -8,-27,-12, -2, -3,-25, -8, -2, 0, -6, -1, -3,-17, -1, -4,-11, -9, -8,-15, 4, -2; /M: SY='S'; M= 5, -6, -3,-13,-12,-11,-14,-13, -5,-14,-13, -9, 0,-18,-10,-15, 10, 8, -2,-28, -8,-12; /M: SY='G'; M= -5, 7,-27, 4, -7,-27, 28,-10,-32, 0,-29,-18, 15,-17, -8, -5, 1,-10,-27,-26,-22, -7; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='Y'; M= -5,-13,-22,-14, -6, -3,-16, -4, -8, -3, -4, -2,-11,-16, 5, 2,-10, -9,-11, 7, 8, -1; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='Q'; M= -4, -1,-17, -2, 5,-20,-12, -4,-15, 11,-16, -6, 0, -2, 13, 6, 4, 3,-13,-17, -9, 9; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='G'; M= -4, 4,-23, 6, -4,-19, 7, 1,-23, -8,-18, -9, 3,-15, -6, -7, 0, -9,-17,-25,-12, -5; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='T'; M= -4, -2,-18, -3, 0,-14,-17,-12, -7, -7, -7, -5, -2,-12, -4, -9, 6, 10, -4,-28,-11, -3; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='K'; M= -5, -8,-24, -7, -1,-17, -4,-12,-18, 6,-11, -7, -5,-16, -3, 1, -3, -6,-14,-22, -9, -2; /M: SY='L'; M= -6,-26,-21,-30,-20, 19,-26,-20, 7,-22, 27, 9,-24,-27,-21,-17,-23,-10, 3, -6, 5,-19; /M: SY='Y'; M= -5, -5,-22, -9, -7, 1,-15, 12,-12, -8,-14, -7, 2,-20, 0, -8, 2, -3,-15,-10, 18, -5; /M: SY='K'; M= -9, -8,-26, -9, -4,-14,-19,-10,-13, 7,-10, -1, -8,-16, 1, 1, -8, -3,-12, -6, -1, -1; /M: SY='V'; M= 1,-21,-21,-24,-18, -9,-22,-24, 13,-11, 4, 5,-19,-15,-17,-14,-11, -6, 16,-24,-10,-19; /M: SY='N'; M= 9, 10,-16, -1, -7,-19, 0, -6,-14, -5,-20,-14, 21,-17, -6, -6, 9, 0,-12,-31,-19, -7; /M: SY='G'; M= -8, 0,-25, -2, -8, -6, 11,-11,-25, -8,-21,-15, 5,-18,-11, -9, 0, -9,-20,-20,-11, -9; /M: SY='Y'; M= -4,-18,-22,-21,-15, 5,-24, -9, 5,-10, -2, 2,-15,-22, -7,-11, -8, -5, 6, -9, 13,-12; /M: SY='L'; M= -4,-27, -8,-31,-23, -1,-23,-24, 11,-26, 18, 6,-24,-26,-20,-23,-21,-11, 5, -8, -4,-22; /M: SY='F'; M=-13,-15,-22,-23,-19, 21,-22,-12, 4,-21, 15, 7, -8,-27,-19,-15,-18, -9, -4, -6, 6,-17; /M: SY='L'; M= 6,-18,-18,-25,-17, 4,-19,-17, 9,-20, 15, 9,-14,-21,-15,-19,-10, -5, 5,-19, -4,-16; /M: SY='I'; M= -5,-25,-18,-28,-24, 1,-25,-25, 22,-24, 21, 11,-23,-25,-22,-21,-15, -1, 22,-24, -6,-24; /M: SY='T'; M= -3,-10,-19,-15,-12,-11, -9, -5, -4,-16, -5, 2, -4,-16, -8,-14, 5, 8, -3,-28, -8,-11; /M: SY='F'; M=-19,-29,-28,-35,-26, 47,-27,-14, -3,-22, 2, 2,-23,-28,-24,-17,-23,-14, -8, 36, 31,-22; /M: SY='I'; M= -8,-26,-18,-32,-26, 17,-31,-25, 21,-25, 18, 10,-22,-26,-26,-21,-15, 0, 21,-18, 2,-26; /M: SY='L'; M= -8,-25, 10,-26,-22, -4,-29,-14, 6,-24, 13, 5,-24,-26,-22,-20,-17, -8, 12,-31, -9,-23; /M: SY='F'; M= 3,-22, 9,-29,-24, 12,-17,-24, -3,-23, 1, -4,-19,-27,-27,-22, -9, -7, 6,-19, -6,-24; /M: SY='R'; M=-19,-10,-29,-10, 0,-20,-19, 0,-30, 28,-20,-10, 0,-20, 10, 66, -8, -9,-20,-21,-10, 0; /M: SY='I'; M= -7,-27,-22,-31,-25, 0,-22,-23, 24,-25, 23, 18,-23,-25,-20,-22,-19, -9, 20,-22, -5,-24; /M: SY='L'; M= 4,-24,-20,-29,-21, 3,-19,-23, 13,-23, 14, 6,-20,-17,-20,-22,-13, -7, 11,-19, -6,-21; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='L'; M= -9,-23, -7,-24,-18, -1,-24,-18, -1,-20, 5, -2,-22,-14,-17,-18,-15, -5, -1, -3, 1,-18; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='Y'; M= -9,-14,-24,-17,-12, 3, -3, -9,-10,-14, -6, -3, -9,-20, -4,-11, -7, -6,-12, -9, 4, -8; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='P'; M= -6,-24,-31,-25,-16, 1,-23,-19, 2,-17, -7, -5,-20, 12,-16,-20,-15,-11, -7, 5, 3,-18; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='F'; M=-16,-22,-21,-29,-22, 44,-27, -4, 0,-23, 7, 1,-15,-25,-25,-16,-15, -5, -2, 1, 26,-22; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='L'; M= -5,-21, -6,-25,-18, 6,-20,-17, 0,-21, 10, 4,-18,-24,-16,-17,-11, -6, -1, -6, -1,-16; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='F'; M= -1,-21,-17,-27,-22, 13,-23,-23, 7,-19, 1, -1,-18,-21,-22,-18, -7, 4, 12, -1, 2,-21; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='Y'; M=-10,-19,-26,-20,-18, 0, -6,-10, -5,-10, -1, 1,-17,-24,-13,-11,-16,-12, -6, 7, 13,-16; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='W'; M= -8,-19,-23,-21,-17, 3,-20, -9, -6,-16,-10, -7,-16,-12,-16,-15, -7, -2, -3, 10, 3,-16; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='T'; M= 2,-12, 0,-19,-15, 4,-16,-16, -6,-15, -7, -2, -8,-18,-15,-15, 6, 11, 1,-24, -7,-14; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='W'; M= -4,-21,-24,-24,-20, 7, -7,-16, -7,-19, 2, -4,-18,-23,-18,-17,-14, -8, -8, 15, 8,-18; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='V'; M= 0,-16, -5,-19,-13, -5,-19,-14, 1,-16, -2, -2,-12,-20, -8,-15, -1, -1, 3,-22, -4,-11; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='H'; M= -4, -1,-23, -4, -2,-10, -6, 19,-18, -7,-15, -9, 3,-17, -2, -8, -2, -5,-18,-15, 9, -4; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='Y'; M= -7,-14,-25,-15,-13, 4,-22,-12, 0,-16, 6, 0,-15,-21, -9,-15,-15,-10, -5, 3, 9,-11; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='B'; M= -3, 5,-23, 4, -5,-19, -5, 2,-14, -9,-10, -8, 5,-17, -6, -8, -4, -9,-13,-26,-11, -7; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='Q'; M= -6, -4,-13, -8, -1,-24,-18, 4,-14, -4,-17, -6, 1, -4, 12, -3, -4, -8,-18,-26,-12, 4; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='M'; M= -2,-15,-20,-17,-11, -9,-18, -1, 2, -9, 1, 6,-12, -7, -7, -4,-10, -7, 2,-20, -5,-11; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='T'; M= -6, -4, -5, -8, -1,-14,-20, -3,-10, -4,-10, -6, -3,-12, -4, -6, 1, 9, -6,-25, -7, -3; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='N'; M= -4, -2,-14, -7, -6, -4,-11, -7, -6,-10, -7, -5, 5,-16, -3, -8, 5, 2, -5,-23, -7, -4; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='V'; M= -4, -7,-19, -6, -7,-17, -8,-12, -3,-10,-10, -4, -7, -9, -2,-11, -1, -4, 1,-23,-13, -5; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='F'; M= -3,-14, -2,-19,-12, 14,-17,-14, -7, -7, 0, -3,-11,-17,-15, -8,-10, -6, -3, -9, 1,-12; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='P'; M= -8, -9,-23, -5, 4,-17,-16, -1,-12, -1,-13, -7, -9, 22, -2, -6, -8, -8,-14,-20,-11, -1; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='W'; M=-11,-10, -9, -9,-10, -6,-16,-14,-11, -9, -2, -7,-14,-18,-10,-10,-16,-11,-11, 15, 0, -9; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='P'; M= -1,-13,-21,-14,-10, -8, -6, -5, -4,-13, -8, -4, -8, 7,-10,-14, -6, -8, -7,-15, -7,-12; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='S'; M= 1,-10,-14,-11, -7, -1,-10, -1, -8,-12, -5, -5, -5, -3, -8,-10, 2, -1, -7,-17, -4, -7; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='W'; M= -1, -4,-11, -8, -7, 3, -6, -7, -7, -7, -8, -7, 0,-10, -7, -7, 2, 2, -7, 4, 0, -6; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5; /M: SY='F'; M=-14,-21,-10,-26,-20, 15,-29,-12, 2,-16, 9, 2,-17,-26,-17, -8,-15, -3, 0, -9, 15,-20; /M: SY='F'; M= -1,-21,-18,-29,-21, 31,-21,-16, 2,-21, 5, 4,-15,-22,-22,-18, -8, -5, 2, -7, 11,-20; /M: SY='L'; M= -6,-20,-13,-26,-21, 10,-27,-16, 11,-22, 16, 6,-17,-26,-19,-18,-14, -2, 8,-16, 6,-21; /M: SY='L'; M= -8,-14,-20,-19,-15, 3,-23,-16, 7,-13, 10, 4, -8,-23,-15,-11,-11, -5, 5,-23, -4,-15; /M: SY='A'; M= 15, -5,-14,-14,-12,-13, -4,-17, -8,-13, -6, -7, -2,-15,-12,-15, 6, 12, -2,-25,-15,-12; /M: SY='I'; M= 3,-25,-22,-31,-22, -1,-23,-22, 17,-21, 16, 13,-23,-22,-16,-21,-17, -9, 13, -5, -3,-20; /M: SY='A'; M= 9, -6,-19,-10, -9,-16, 0,-14,-12,-14, -9, -9, 0, -6,-10,-15, 3, -2,-11,-28,-18,-10; /M: SY='L'; M= -6,-21,-22,-22,-14, -3,-23,-12, 5,-14, 10, 9,-18,-11,-11, -9,-12, -5, 2,-19, -1,-14; /M: SY='L'; M= 0,-18, -9,-23,-18, 3,-10,-18, -3,-20, 4, 3,-14,-22,-17,-17, -5, -1, 1,-21, -7,-17; /M: SY='L'; M= -3,-25,-19,-28,-19, 5,-27,-21, 16,-26, 37, 14,-25,-26,-18,-20,-21, -3, 9,-21, -3,-19; /M: SY='A'; M= 1, -1,-22, -2, -2,-19,-15, -9,-12, -5, -9, -8, -1, -7, 0, -3, -3, -3,-11,-27,-15, -2; /M: SY='V'; M= -5,-22, -4,-25,-18, -8,-27,-20, 9,-16, 9, 6,-21,-26,-11,-10,-13, -7, 14,-26, -9,-16; /M: SY='L'; M= -4,-23,-19,-28,-20, 0,-25,-18, 17,-20, 23, 21,-22,-18,-15,-18,-16, -3, 13,-23, -5,-18; /M: SY='H'; M=-11, 6,-23, -3, -4, -8,-15, 17,-12, -9,-16, -6, 17,-19, 3, -6, 1, -5,-17,-27, -3, -1; /M: SY='I'; M= -8,-25,-25,-29,-20, -1,-29,-21, 23,-25, 21, 15,-21,-12,-16,-22,-17, -7, 12,-23, -5,-20; /M: SY='F'; M=-17,-19,-24,-22,-20, 30,-28, -9, 6,-21, 12, 6,-18,-26,-21,-17,-20,-10, 0, -1, 26,-21; /M: SY='W'; M=-18,-34,-45,-34,-27, 9,-13,-20,-19,-18,-18,-17,-33,-29,-18,-18,-33,-26,-27,112, 32,-20; /M: SY='F'; M=-13,-25,-21,-30,-23, 37,-26,-21, -1,-20, 4, -2,-19,-26,-27,-15,-14, -3, 2, 7, 14,-22; /M: SY='Y'; M= -7,-17,-15,-19,-15, 6,-18, -3, -8,-17, -7, -7,-12,-23,-13,-14, -2, -3, -5, -2, 9,-14; /M: SY='K'; M=-11,-15,-25,-15, -6,-12,-25,-15, -5, 12, 3, 3,-13,-20, -4, 11,-17, -9, -3,-21, -6, -6; /M: SY='I'; M= -7,-18,-23,-24,-18, -4,-25,-16, 19,-14, 11, 18,-12,-20,-10,-14,-12, -6, 11,-24, -5,-16; /M: SY='F'; M= -9,-19, 1,-25,-21, 16,-26,-18, 0,-22, 2, -2,-14,-24,-21,-19, -6, 5, 1,-16, 6,-21; /M: SY='R'; M=-13, -2,-28, 0, 1,-26, -9, 1,-25, 12,-20, -9, 0,-17, 9, 24, -6,-11,-17,-24,-12, 3; /M: SY='M'; M= 2,-13,-20,-17,-12,-15, 1,-11, -5,-10, -4, 10,-10,-18, -3,-11, -3, -6, -3,-23,-13, -8; /M: SY='L'; M= -7, -6,-23, -5, -9,-11,-15,-12, -1,-14, 7, 5, -9,-19, -9,-11,-10, -7, -3,-26, -9,-10; /M: SY='R'; M=-13,-19,-11,-22,-14, -3,-27,-13, -4, -4, -2, 0,-13,-24, -6, 13,-13, -9, 0,-21, -5,-11; /M: SY='R'; M=-15, -6,-14, -6, -7,-11,-13, 1,-26, 5,-20,-12, -5,-22, -5, 7,-12,-13,-20, -8, 3, -8; /M: SY='R'; M=-12,-12,-28,-11, -1,-20,-21, -9,-18, 9,-12, -7, -8, 4, 4, 20, -9, -3,-17,-23,-13, -1; /M: SY='L'; M= -3,-18,-19,-19, -3, 5,-24,-17, 4,-17, 14, 3,-19,-21,-14,-15,-13, -7, 6,-20, -5, -8; /M: SY='H'; M=-14, 6,-25, 10, 3,-15,-15, 14,-26, 0,-21,-13, 6,-16, 5, 9, 1, -7,-21,-26, -4, 3; /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 80 in 80 different sequences |
| Number of true positive hits | 80 in 80 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | TLC |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
80 sequences
ALT7_ALTAL (G1UJF5), ASC1_SOLLC (Q9M6A3), ASCL1_ORYSJ (Q6EUN0), ASCL2_ORYSJ (Q6YWS8), ASCL3_ORYSJ (Q84QC0), ASCL_SOLLC (Q8W4Y5), CERS1_HUMAN (P27544), CERS1_MOUSE (P27545), CERS2_BOVIN (Q3ZBF8), CERS2_HUMAN (Q96G23), CERS2_MOUSE (Q924Z4), CERS3_HUMAN (Q8IU89), CERS3_MOUSE (Q1A3B0), CERS4_BOVIN (Q5E9R6), CERS4_HUMAN (Q9HA82), CERS4_MOUSE (Q9D6J1), CERS5_HUMAN (Q8N5B7), CERS5_MOUSE (Q9D6K9), CERS6_HUMAN (Q6ZMG9), CERS6_MOUSE (Q8C172), CLN8_CANLF (Q5JZQ7), CLN8_HUMAN (Q9UBY8), CLN8_MOUSE (Q9QUK3), CLN8_RAT(Q6AYM9), FLD1_CAEEL (G5EF48), FUM17_GIBM7 (W7LKY5), FUM18_GIBM7 (Q8J2Q2), HYL1_CAEEL (G5ED45), HYL2_CAEEL (Q7Z139), LAC1_SCHPO (O59735), LAC1_YEAS7 (A6ZZV7), LAC1_YEAST (P28496), LAG1_SCHPO (P78970), LAG1_YEAS7 (A6ZSP9), LAG1_YEAST (P38703), LAGR1_CAEEL (Q9XWE9), LOH1_ARATH (Q9LDF2), LOH2_ARATH (Q9LJK3), LOH3_ARATH (Q6NQI8), STKLT_ARATH (P0DKL0), TDA4_YEAST (P47153), TLC3A_HUMAN (Q8TBR7), TLC3A_MOUSE (Q5ND56), TLC3B_HUMAN (Q71RH2), TLC3B_MOUSE (Q7TNV1), TLC4A_DICDI (Q550T0), TLC4A_XENLA (Q6GLX2), TLC4B_DANRE (Q5XIY2), TLC4B_DICDI (Q550S9), TLC4B_XENLA (Q6PGS5), TLC4C_DICDI (Q55BP8), TLCD1_CHICK (F1NZP5), TLCD1_HUMAN (Q96CP7), TLCD1_MOUSE (Q99JT6), TLCD1_RAT (Q5U2T1), TLCD2_DANRE (A8WGS4), TLCD2_HUMAN (A6NGC4), TLCD2_MOUSE (Q8VC26), TLCD4_HUMAN (Q96MV1), TLCD4_MOUSE (Q8CGF5), TLCD4_XENTR (Q6P4N1), TLCD5_BOVIN (Q0VD42), TLCD5_DANRE (Q1LXV8), TLCD5_HUMAN (Q6ZRR5), TLCD5_MOUSE (Q3TYE7), TR1L1_HUMAN (Q8N609), TR1L1_MOUSE (Q8QZR0), TR1L1_XENLA (Q6DED0), TRAM1_BOVIN (Q9GKZ4), TRAM1_CANLF (Q01685), TRAM1_HUMAN (Q15629), TRAM1_MOUSE (Q91V04), TRAM1_PONAB (Q5R7Z3), TRAM1_RAT (Q5XI41), TRAM2_HUMAN (Q15035), TRAM2_MOUSE (Q924Z5), Y5285_ARATH (Q8GYK7), YF22_SCHPO (O13752), YL438_MIMIV (Q5UQN8), YP114_YEAST (Q06107)» more
|
| PDB [Detailed view] |
2 PDB
8IZD; 8IZF |