PROSITE entry PS50923

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	SUSHI
Accession [info]	PS50923
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2003 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50923
Associated ProRule [info]	PRU00302

Name and characterization of the entry

Description [info]

Sushi/CCP/SCR domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=61;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2641132; R2=0.0103577; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=477; N_SCORE=7.2; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=313; N_SCORE=5.5; MODE=1; TEXT='R?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M:         M= -5, -8,-53, -9, -7,-15,-14,-15, -4, -4, -8, -4, -7,-15, -8, -4, -5, -4,  0,-26,-12, -9;
/I:         I=-10,-10,-100,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10; MD=-32;
/M: SY='S';  M= -4, -1,-59,  0,  2,-19,-13, -5,-19,  1,-19,-11,  0,-11,  2, -2,  4,  0,-14,-24,-11,  1; D=-15;
/I:         I=-10,-10,-100,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
/M: SY='C';  M=-10,-20,116,-30,-30,-18,-30,-30,-29,-30,-19,-19,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-49,-29,-30;
/M: SY='P';  M= -6, -5,-58, -2,  1,-24, -6,-12,-21, -5,-22,-15, -5, 19, -4,-10,  0, -4,-21,-28,-19, -3;
/M: SY='P';  M= -5, -5,-56, -3,  4,-17,-18, -8,-15,  0,-16,-10, -5,  5, -1, -5, -3, -6,-15,-24,-11,  0;
/M: SY='P';  M= -9,-20,-53,-14, -5,-18,-22,-19, -8,-14,-11,-10,-19, 48,-12,-18,-12, -8,-15,-28,-21,-12;
/M: SY='P';  M= -8, -3,-59, -1,  2,-22,-11, -8,-19, -5,-22,-14, -3, 19, -4, -9, -3, -5,-20,-27,-16, -3;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='E';  M= -4, -1,-18,  2,  5,-15,-11, -7,-11, -3,-10, -8, -3,  1,  1, -5, -1, -3,-10,-18,-11,  2; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='I';  M= -8,-22,-23,-22,-15, -4,-26,-19, 12,-17,  7,  5,-20,  1,-16,-17,-15, -7,  8,-20, -8,-17; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='E';  M= -7, -1,-26,  1, 12,-20,-17, -6,-16, -1,-15,-11, -3,  6,  2, -5, -3, -6,-17,-24,-14,  6; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='N';  M=-10, 15,-22,  6,  0,-13, -8, 17,-18, -2,-20,-11, 26,-18,  0, -1,  1, -5,-22,-28, -6, -1; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='G';  M=  7,-10,-22,-12,-15,-20, 34,-18,-24,-15,-19,-13, -4,-15,-15,-17,  2,-10,-16,-20,-22,-15; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='R';  M= -8, -5,-23, -6, -3,-10,-16, -4,-12,  0,-11, -6, -4,-15, -1,  2, -4, -2,-10,-16,  0, -3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='I';  M= -7,-19,-21,-21,-14,  1,-24,-12,  8,-13,  5,  5,-16,-15,-11,-11,-12, -6,  7,-16,  0,-14; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M:         M= -5, -4,-21, -7, -2,-14,-17, -7, -7, -1,-10, -4, -1,-11,  0, -2, -1,  0, -6,-22, -8, -2; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M:         M= -4, -6, -4, -8, -7,-11, -9, -9,-10,-11, -8, -7, -3,-10, -7,-11,  0,  0, -8,-22, -9, -8; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='S';  M= -3, -2,-14, -3,  1,-12, -6, -1,-14,  0,-13, -8,  1, -4,  0,  0,  4,  0,-11,-18, -8,  0; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M:         M= -3, -7,-14,-10, -8, -8,-12,-10, -3, -7, -5, -3, -5, -8, -7, -7, -3,  0, -3,-18, -6, -9; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='K';  M= -5, -4,-25, -3,  2,-20,-11, -5,-18,  4,-17, -9, -2, -8,  2,  1, -1, -5,-15,-23,-10,  1;
/M: SY='N';  M= -6,  2,-21,  1, -2,-19, -5, -8,-20, -4,-17,-12,  4, -9, -4, -4,  0, -3,-17,-27,-14, -4;
/M: SY='N';  M= -5, -1,-23, -3, -1,-16, -7, -8,-17, -3,-16,-11,  2, -9, -4, -4,  2,  0,-14,-26,-12, -3;
/M: SY='Y';  M=-16,-20,-25,-23,-19, 31,-26,  2, -2,-16,  3,  0,-16,-25,-17,-12,-16, -7, -6,  9, 40,-19;
/M:         M= -5, -7,-23, -7, -2,-14,-18,-10, -9, -5,-10, -6, -6, -5, -3, -6, -2, -1, -7,-25, -9, -3;
/M: SY='Y';  M= -9,-13,-25,-13, -6,  2,-23, -3, -3,-12, -3, -3,-12,-14, -9,-12,-10, -8, -4,-13,  7, -9;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='G';  M= -5, -2,-27, -4,-10,-25, 35,-10,-31, -7,-26,-16,  5,-16,-10, -6, -1,-14,-25,-20,-21,-11; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='D';  M= -3, 10,-21, 12, 10,-24,-12,  0,-23, -2,-20,-15,  5,-10,  5, -6, 10,  6,-17,-31,-13,  7;
/M: SY='T';  M= -5, -6,-20, -9, -2,-14,-19, -9, -9,  0, -9, -4, -3,-15,  0,  1,  1,  6, -5,-25, -8, -2;
/M: SY='V';  M= -3,-27,  0,-32,-27,  0,-31,-28, 22,-25, 13,  9,-25,-28,-25,-24,-14, -5, 27,-27, -8,-27;
/M: SY='R';  M= -7,  1,-21,  0,  4,-17,-17,  1,-17,  1,-16,-10,  3,-14,  3,  6,  4,  5,-13,-28, -9,  2;
/M: SY='Y';  M=-16,-24,-23,-27,-24, 37,-30,  0,  5,-18,  5,  2,-20,-29,-21,-15,-18, -8,  0, 12, 48,-24;
/M: SY='S';  M= -3, -3,-20, -4,  3,-18,-15, -6,-15,  0,-16, -9,  0,-13,  4,  1,  8,  6,-10,-27,-10,  3;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='E';  M= -9,  6,-26,  6,  8,-22,-15,  0,-22,  7,-18,-12,  7,-10,  6,  8, -2, -6,-20,-26,-11,  6;
/M: SY='E';  M= -7,  2,-29,  6, 14,-28,-12, -5,-24,  1,-24,-16,  0, 14,  5, -5,  1, -5,-24,-28,-19,  8;
/M: SY='G';  M= -3, -7,-29, -6,-14,-24, 45,-15,-34,-14,-27,-18,  1,-15,-15,-15, -1,-16,-27,-20,-22,-14;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='Y';  M=-18,-23,-26,-26,-22, 42,-27,  5, -1,-17,  3,  0,-18,-29,-19,-13,-18,-10, -7, 18, 52,-22;
/M: SY='R';  M= -8, -9,-24, -9,  0,-13,-20, -3,-11,  4,-10, -3, -8,-15,  3,  7, -6, -4, -8,-18, -2,  0;
/M: SY='L';  M= -7,-23,-21,-26,-17,  0,-25,-17, 13,-19, 25, 15,-21,-21,-13,-14,-18, -6,  8,-21, -4,-16;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='Q';  M= -6, -6,-22, -8, -2,-15,-19, -4, -8, -1, -9, -3, -4,-13,  1,  1, -3, -2, -6,-24, -7, -2; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='G';  M= -2, -5,-27, -4, -9,-26, 40,-13,-32,-13,-25,-17,  0,-11,-12,-13,  0,-13,-25,-21,-24,-11; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='S';  M= -1,  0,-22,  2,  4,-21,-10, -7,-17, -5,-20,-13,  1,  3,  0, -8,  8,  1,-15,-30,-16,  1; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='S';  M=  0,  0,-23, -2,  0,-18, -4, -8,-19, -3,-19,-12,  2, -7, -2, -5,  3, -3,-16,-23,-14, -1; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='T';  M= -3, -6,-19, -9, -4,-11,-19, -9, -6, -6, -9, -6, -4,-15, -3, -6,  3,  7, -3,-23, -5, -4; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='I';  M= -3,-19,-21,-24,-17, -1,-24,-15, 12,-15,  8,  7,-15,-20,-11,-12, -9, -2,  9,-17,  2,-16;
/M: SY='T';  M= -6, -8,-20,-11, -4,-12,-22, -9, -7, -3, -7, -3, -7,-16,  0, -1,  0, 10, -3,-22, -5, -3;
/M: SY='C';  M=-10,-21,112,-30,-29,-18,-30,-29,-27,-30,-16,-18,-21,-39,-29,-29,-11,-10, -9,-48,-28,-29;
/M: SY='Q';  M= -7, -5,-22, -8, -4,-15,-17, -8, -6, -6, -4, -1, -3,-16,  2, -4, -3,  1, -7,-24, -8, -2;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='S';  M=  0,  0,-17,  1,  3,-16, -6, -8,-13, -2,-13, -9,  0, -2, -1, -5,  4, -1,-11,-21,-13,  1; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='N';  M= -8, 17,-23, 16,  9,-24, -6,  4,-24, -1,-23,-16, 19,-13,  3, -4,  6, -1,-23,-33,-15,  5;
/M: SY='G';  M= -2, -5,-26, -6,-11,-24, 32,-14,-28,-11,-23,-15,  1,-16,-12,-13,  1,-11,-21,-24,-22,-12;
/M: SY='Q';  M= -5, -4,-23, -6, -1,-21, -9, -5,-15,  0,-16, -7, -1,-13,  5,  1,  2,  1,-12,-25,-12,  1;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30,  0,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,  0,-20;
/I:         I=-10,-10,-100,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10; MD=-21;
/M: SY='S';  M= -1,  3,-56,  0, -2,-15,-11, -8,-15, -7,-19,-13,  7,-12, -3, -7, 17, 15, -9,-32,-13, -3; D=-10;
/I:         I=-10,-10,-100,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10; MD=-21;
/M: SY='P';  M= -2,  0,-58, -2, -3,-15,  2, -8,-15, -5,-17,-11,  4,  5, -5, -6,  2, -2,-14,-20,-14, -5; D=-10;
/I:         I=-10,-10,-100,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='P';  M= -2, -5,-55, -5,  2,-21,-13, -9,-18,  1,-19,-11, -4,  6, -1, -3,  1, -1,-15,-25,-15,  0;
/M:         M= -7,-14,-55,-14, -3,-11,-23,-15, -2, -7,  0, -1,-13, -2, -7, -9,-10, -4, -4,-23,-11, -6;
/M: SY='P';  M= -7,-16,-52,-10, -2,-25,-19,-17,-15, -9,-21,-14,-15, 53, -9,-15, -8, -7,-20,-29,-24, -9;
/M: SY='T';  M= -5, -8,-52,-10,  0,-13,-20,-10,-10,  1,-10, -5, -6,-14,  0,  1, -1,  2, -5,-23, -9, -1;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='E';  M= -9, -4,-56, -4, 11,-20,-22, -6,-12,  9,-13, -6, -4,-13,  7,  8, -5, -6,-10,-24,-10,  8;
/M: SY='K';  M=  3, -5,-53, -5,  2,-20,-13,-12,-15,  4,-15, -9, -6, -6, -1, -1, -1, -5,-10,-25,-14,  0;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_06 which contains 572'619 sequence entries.

Total number of hits	1'050 in 243 different sequences
Number of true positive hits	1'050 in 243 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	9
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	99.15 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes, Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	35
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	N_Hulo
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Sushi
Version [info]	4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

243 sequences

APOH_BOVIN  (P17690), APOH_CANLF  (P33703), APOH_HUMAN  (P02749),

APOH_MOUSE  (Q01339), APOH_PANTR  (Q95LB0), APOH_RAT(P26644), 
APOR_PIG(Q03472), C1RA_MOUSE  (Q8CG16), C1RB_MOUSE  (Q8CFG9), 
C1R_HUMAN   (P00736), C1R_MACFA   (Q4R577), C1R_PANTR   (Q5R1W3), 
C1R_PONAB   (Q5R544), C1S_BOVIN   (Q0VCX1), C1S_HUMAN   (P09871), 
C1S_PIG (Q69DK8), C1S_RAT (Q6P6T1), C4BPA_BOVIN (Q28065), 
C4BPA_HUMAN (P04003), C4BPA_MOUSE (P08607), C4BPA_RAT   (Q63514), 
C4BPB_BOVIN (Q28066), C4BPB_HUMAN (P20851), C4BPB_RAT   (Q63515), 
CASP_MESAU  (P15156), CCPH_SHV21  (Q01016), CFAB_BOVIN  (P81187), 
CFAB_GORGO  (Q864V9), CFAB_HUMAN  (P00751), CFAB_MOUSE  (P04186), 
CFAB_PANTR  (Q864W0), CFAB_PIG(Q03710), CFAB_PONPY  (Q864W1), 
CFAH_BOVIN  (Q28085), CFAH_HUMAN  (P08603), CFAH_MOUSE  (P06909), 
CFBL_CHICK  (P81475), CFC_TACTR   (P28175), CO2_BOVIN   (Q3SYW2), 
CO2_GORGO   (Q863A0), CO2_HUMAN   (P06681), CO2_MOUSE   (P21180), 
CO2_PANTR   (Q8SQ74), CO2_PONPY   (Q8SQ75), CO6_BOVIN   (Q29RU4), 
CO6_HUMAN   (P13671), CO6_PANTR   (P61134), CO6_PONPY   (P61135), 
CO6_RAT (Q811M5), CO7_BOVIN   (Q29RQ1), CO7_HUMAN   (P10643), 
CO7_PIG (Q9TUQ3), CO7_PONAB   (Q5RAD0), CR1L_HUMAN  (Q2VPA4), 
CR1L_MOUSE  (Q64735), CR1L_RAT(Q63135), CR1_HUMAN   (P17927), 
CR2_HUMAN   (P20023), CR2_MOUSE   (P19070), CS1A_MOUSE  (Q8CG14), 
CS1B_MOUSE  (Q8CFG8), CSMD1_HUMAN (Q96PZ7), CSMD1_MOUSE (Q923L3), 
CSMD2_HUMAN (Q7Z408), CSMD3_HUMAN (Q7Z407), CSMD3_MOUSE (Q80T79), 
CSPG2_BOVIN (P81282), CSPG2_CHICK (Q90953), CSPG2_HUMAN (P13611), 
CSPG2_MOUSE (Q62059), CSPG2_RAT   (Q9ERB4), CTX_SEPES   (B2DCR8), 
DAF1_MOUSE  (Q61475), DAF2_MOUSE  (Q61476), DAF_CAVPO   (Q60401), 
DAF_HUMAN   (P08174), DAF_PONPY   (P49457), F13B_HUMAN  (P05160), 
F13B_MOUSE  (Q07968), FBLN7_HUMAN (Q53RD9), FBLN7_MOUSE (Q501P1), 
FHR1_HUMAN  (Q03591), FHR2_HUMAN  (P36980), FHR3_HUMAN  (Q02985), 
FHR4_HUMAN  (Q92496), FHR5_HUMAN  (Q9BXR6), GABR1_HUMAN (Q9UBS5), 
GABR1_MOUSE (Q9WV18), GABR1_RAT   (Q9Z0U4), GLTX_GLYTI  (A0A1U9VX91), 
HIG_DROME   (Q09101), HPT_ATEGE   (P50417), HPT_BOVIN   (Q2TBU0), 
HPT_CANLF   (P19006), HPT_CAPIB   (B6E141), HPT_CEREL   (B6D985), 
HPT_HUMAN   (P00738), HPT_MESAU   (O35086), HPT_MOUSE   (Q61646), 
HPT_MUSCR   (Q60574), HPT_MUSSA   (Q62558), HPT_PAPHA   (Q5VAN1), 
HPT_PIG (Q8SPS7), HPT_PONAB   (Q5R5F6), HPT_RABIT   (P19007), 
HPT_RAT (P06866), I15RA_HUMAN (Q13261), I15RA_MOUSE (Q60819), 
IL2RA_BOVIN (P12342), IL2RA_CANLF (O62802), IL2RA_FELCA (P41690), 
IL2RA_HUMAN (P01589), IL2RA_MACMU (Q5MNY4), IL2RA_MOUSE (P01590), 
IL2RA_PANTR (Q38IC8), IL2RA_PIG   (O02733), IL2RA_RAT   (P26897), 
IL2RA_SHEEP (P26898), LEV9_CAEEL  (Q22328), LFC_CARRO   (Q26422), 
LYAM1_BOVIN (P98131), LYAM1_HUMAN (P14151), LYAM1_MACMU (Q95198), 
LYAM1_MOUSE (P18337), LYAM1_PANTR (Q95237), LYAM1_PAPHA (Q28768), 
LYAM1_PONPY (Q95235), LYAM1_RAT   (P30836), LYAM2_BOVIN (P98107), 
LYAM2_CANLF (P33730), LYAM2_HORSE (Q95LG1), LYAM2_HUMAN (P16581), 
LYAM2_MOUSE (Q00690), LYAM2_PIG   (P98110), LYAM2_RABIT (P27113), 
LYAM2_RAT   (P98105), LYAM3_BOVIN (P42201), LYAM3_HUMAN (P16109), 
LYAM3_MOUSE (Q01102), LYAM3_RAT   (P98106), LYAM3_SHEEP (P98109), 
MASP1_HUMAN (P48740), MASP1_MOUSE (P98064), MASP1_RAT   (Q8CHN8), 
MASP2_HUMAN (O00187), MASP2_MOUSE (Q91WP0), MASP2_RAT   (Q9JJS8), 
MCP_BOVIN   (Q6VE48), MCP_CALJA   (Q8HYX8), MCP_CAVPO   (P70105), 
MCP_CHLAE   (P79138), MCP_HUMAN   (P15529), MCP_MOUSE   (O88174), 
MCP_PIG (O02839), MCP_PONAB   (Q5R4D0), MCP_RAT (Q9Z0M4), 
MCP_SAGMY   (O19124), MCP_SAGOE   (O62837), MCP_SAISC   (O62685), 
MESH_BOMMO  (H9JIQ1), MESH_DROME  (Q0KHY3), MODSP_DROME (Q9VER6), 
NCAN_HUMAN  (O14594), NCAN_MOUSE  (P55066), NCAN_PANTR  (Q5IS41), 
NCAN_RAT(P55067), ORF4_HHV8P  (Q2HRD4), PAMR1_BOVIN (Q5E9P5), 
PAMR1_HUMAN (Q6UXH9), PAMR1_MOUSE (Q8BU25), PAMR1_PONAB (Q5RDI1), 
PAMR1_XENTR (Q6DIV5), PAPP1_HUMAN (Q13219), PAPP1_MOUSE (Q8R4K8), 
PAPP2_HUMAN (Q9BXP8), PERT_CANLF  (Q8HYB7), PERT_HUMAN  (P07202), 
PERT_MOUSE  (P35419), PERT_PIG(P09933), PERT_RAT(P14650), 
PG190_MONPV (P0DTN2), PG190_VACC0 (P24084), PG190_VACCA (O57254), 
PG190_VACCC (P21115), PG190_VACCL (P24083), PG190_VACCT (Q9JF44), 
PG190_VACCW (Q01227), PGCA_BOVIN  (P13608), PGCA_CANLF  (Q28343), 
PGCA_CHICK  (P07898), PGCA_HUMAN  (P16112), PGCA_MOUSE  (Q61282), 
PGCA_RAT(P07897), PGCB_BOVIN  (Q28062), PGCB_HUMAN  (Q96GW7), 
PGCB_MOUSE  (Q61361), PGCB_RAT(P55068), SE6L1_HUMAN (Q9BYH1), 
SE6L1_MOUSE (Q6P1D5), SE6L2_BOVIN (Q29RN8), SE6L2_HUMAN (Q6UXD5), 
SE6L2_MOUSE (Q4V9Z5), SEZ6_BOVIN  (A0JNA2), SEZ6_HUMAN  (Q53EL9), 
SEZ6_MOUSE  (Q7TSK2), SEZ6_XENLA  (Q6AX42), SNED1_HUMAN (Q8TER0), 
SNED1_MOUSE (Q70E20), SNED1_RAT   (Q5ZQU0), SRCR1_PATPE (F7J220), 
SRPX2_BOVIN (Q5EA25), SRPX2_HUMAN (O60687), SRPX2_MOUSE (Q8R054), 
SRPX2_RAT   (B5DF94), SRPX2_XENLA (Q6GP28), SRPX_HUMAN  (P78539), 
SRPX_MOUSE  (Q9R0M3), SRPX_RAT(Q63769), SUSD1_HUMAN (Q6UWL2), 
SUSD2_HUMAN (Q9UGT4), SUSD2_MOUSE (Q9DBX3), SUSD3_HUMAN (Q96L08), 
SUSD3_MOUSE (Q9D176), SUSD4_DANRE (E7FEC4), SUSD4_HUMAN (Q5VX71), 
SUSD4_MOUSE (Q8BH32), SUSD4_PONAB (Q5R8M2), SUSD5_HUMAN (O60279), 
SUSD6_HUMAN (Q92537), SUSD6_MOUSE (Q8BGE4), SVEP1_DANRE (A0A1D5NSM8), 
SVEP1_HUMAN (Q4LDE5), SVEP1_MOUSE (A2AVA0), SVEP1_RAT   (P0C6B8), 
VB05_VACC8  (P24284), VCP_VACCC   (P68639), VCP_VACCW   (P68638), 
VGE3_EHV2   (Q66608), YMS5_CAEEL  (P34501), YQU3_CAEEL  (Q09550), 
ZP3R_CAVPO  (O08569), ZP3R_MOUSE  (Q60736), ZP3R_RAT(Q7TSY4)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences

9 sequences

C1RL_HUMAN  (Q9NZP8), C1RL_MOUSE  (Q3UZ09), C1RL_RAT(Q6IE64),

CD248_HUMAN (Q9HCU0), CD248_MOUSE (Q91V98), DIG1_CAEEL  (Q09165), 
HPARI_HELPZ (A0A3P7XL18), HPTR_HUMAN  (P00739), HPTR_PANTR  (Q28801)

» more

PDB
[Detailed view]

215 PDB

1C1Z; 1CKL; 1E5G; 1ELV; 1G4F; 1G4G; 1GHQ; 1GKG; 1GKN; 1GPZ; 1H03; 1H04; 1H2P; 1H2Q; 1HAQ; 1HCC; 1HFH; 1HFI; 1LY2; 1M11; 1MD7; 1MD8; 1NTJ; 1NTL; 1NWV; 1OJV; 1OJW; 1OJY; 1OK1; 1OK2; 1OK3; 1OK9; 1PPQ; 1Q3X; 1QUB; 1SRZ; 1SS2; 1UOT; 1UPN; 1VVC; 1VVD; 1VVE; 1W2R; 1W2S; 1Z92; 1ZJK; 2A55; 2ATY; 2B5I; 2BZM; 2C8I; 2EHF; 2ERJ; 2ERS; 2G7I; 2GSX; 2IC4; 2JGW; 2JGX; 2KMS; 2MCY; 2MCZ; 2O39; 2OK5; 2PSM; 2Q7Z; 2QFG; 2QFH; 2QY0; 2QZD; 2QZF; 2QZH; 2RLP; 2RLQ; 2UWN; 2V8E; 2W80; 2W81; 2WII; 2XQW; 2XRB; 2XRD; 2XWB; 2XWJ; 2YBY; 2YRA; 2Z3Q; 2Z3R; 3ERB; 3GAU; 3GAV; 3GAW; 3GOV; 3HRZ; 3HS0; 3INB; 3IU3; 3IYP; 3J24; 3KXV; 3KZJ; 3L89; 3NFP; 3O8E; 3OED; 3OXU; 3R62; 3RJ3; 3SW0; 3T5O; 3TVJ; 3ZD1; 3ZD2; 4A5W; 4AQB; 4AYD; 4AYE; 4AYI; 4AYM; 4B2R; 4B2S; 4C16; 4CSY; 4DJZ; 4E0S; 4F4O; 4GS7; 4IGD; 4J1Y; 4J38; 4JHS; 4K12; 4KKD; 4LOS; 4LOT; 4MUC; 4ONT; 4WJG; 4ZH1; 5FO8; 5FO9; 5FOA; 5HYP; 5HYT; 5HYU; 5HZP; 5I0Q; 5JPM; 5NBQ; 5O32; 5O35; 6ATG; 6EYI; 6EYJ; 6EYK; 6H03; 6H04; 6HKC; 6ILJ; 6ILK; 6LA5; 6V06; 6V08; 6V09; 6VWU; 6XSD; 6XST; 6XZ6; 6YIO; 6ZH1; 7C7Q; 7C7S; 7C9W; 7DO4; 7EB2; 7F9W; 7JIK; 7JTN; 7JTQ; 7KG4; 7NOZ; 7NYC; 7NYD; 7PQO; 7UFG; 7VY5; 7VY6; 7WKI; 7Y5N; 7Y5Q; 7ZJM; 7ZMZ; 8A7D; 8A7E; 8ACF; 8ACI; 8B0F; 8B0G; 8B0H; 8B8R; 8CI3; 8CJV; 8D8O; 8ENU; 8EOK; 8GMN; 8HGG; 8HGH; 8Q5R; 8QK3; 8SL1; 8SM0; 8TGT; 8TYP; 8XS3
» more