Entry: PS50928

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] ABC_TM1
Accession [info] PS50928
Entry type [info] MATRIX
Date [info] NOV-2003 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00364
Associated ProRule [info] PRU00441

Name and characterization of the entry

Description [info] ABC transporter integral membrane type-1 domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=196;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=191;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4184906; R2=0.0217733; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7908.34197; R2=49.73316; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=280; N_SCORE=8.5; H_SCORE=19496; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=188; N_SCORE=6.5; H_SCORE=17208; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='L'; M= -4,-24,-19,-29,-22, 13,-25,-20, 15,-24, 21, 10,-21,-24,-21,-20,-16, -4, 11,-15,  2,-21;
/M:         M= -7,-19,-27,-21,-14, -5,-13,-16, -7, -9, -4, -3,-16,-12,-11, -6,-14,-10, -7, -2, -4,-13;
/M: SY='N'; M= -5,  2,-22, -6, -8,-11,-11, -6, -8, -7,-11, -7,  9,-18, -6, -6, -2, -2, -9,-22, -9, -8;
/M: SY='T'; M=  4,  0,-11, -6, -6,-14,-10,-13,-14,-10,-18,-13,  4,-11, -6,-10, 25, 32, -5,-33,-14, -6;
/M: SY='L'; M= -6,-27,-19,-31,-23, 11,-28,-22, 20,-26, 28, 14,-25,-26,-22,-21,-20, -6, 16,-18,  0,-22;
/M: SY='L'; M= -6,-19,-23,-21,-12, -1,-21,-16,  4,-13,  6,  3,-16,-20,-11,-11,-12, -5,  3,-12,  0,-12;
/M: SY='I'; M= -8,-25,-21,-29,-22,  7,-29,-19, 19,-21, 18, 12,-22,-25,-18,-17,-17, -6, 16,-15,  4,-21;
/M: SY='A'; M= 16,-10,-12,-16,-13,-13, -3,-19, -7,-14,-10, -7, -7,-15,-12,-16, 10,  9,  2,-26,-15,-13;
/M: SY='L'; M=  0,-23,-17,-28,-22,  6,-19,-23, 12,-23, 13,  6,-20,-23,-22,-20,-11, -3, 13,-19, -4,-22;
/M: SY='I'; M=  0,-21,-18,-26,-20, -1,-15,-22,  9,-21,  8,  4,-18,-20,-18,-20,-10, -4,  9,-19, -6,-20;
/M: SY='A'; M= 15,-10,-13,-14,-12,-15, -1,-18,-10,-13,-13,-10, -6,-14,-11,-15, 11,  7,  0,-27,-16,-12;
/M: SY='V'; M=  2,-18,-15,-24,-19,  1,-20,-21,  8,-18,  6,  4,-16,-20,-18,-17, -3,  7, 12,-21, -5,-18;
/M: SY='I'; M=  0,-24,-18,-28,-21,  3,-22,-23, 15,-22, 14,  7,-21,-18,-21,-21,-12, -4, 15,-21, -6,-22;
/M: SY='L'; M= -6,-26,-20,-31,-24,  8,-25,-23, 20,-26, 21, 11,-22,-23,-22,-22,-17, -7, 14,-18, -2,-23;
/M: SY='A'; M= 13, -7,-12,-12, -9,-19,  4,-15,-15,-12,-17,-11, -3,-14, -7,-14, 11,  4, -8,-27,-18, -8;
/M: SY='L'; M= -3,-22,-16,-27,-21,  4,-24,-21, 14,-22, 15,  9,-19,-23,-20,-19,-11,  0, 14,-19, -3,-21;
/M: SY='I'; M= -1,-25,-19,-28,-21,  3,-24,-23, 15,-22, 13,  7,-22,-14,-21,-21,-13, -4, 15,-21, -6,-22;
/M: SY='I'; M= -7,-28,-19,-33,-25, 10,-30,-24, 24,-26, 23, 14,-23,-25,-23,-23,-19, -7, 19,-18,  0,-25;
/M: SY='G'; M= 12, -9,-20,-11,-15,-25, 38,-18,-28,-16,-24,-17, -2,-15,-15,-18,  7, -8,-18,-23,-25,-15;
/M: SY='I'; M= -4,-23,-18,-28,-22,  6,-26,-21, 16,-22, 15,  9,-19,-23,-19,-20,-11,  0, 15,-19,  0,-21;
/M: SY='L'; M= -3,-22,-22,-24,-17, -2,-18,-20,  3,-20,  5,  2,-19,  0,-18,-20,-12, -6,  1,-20, -9,-18;
/M: SY='L'; M=  2,-22,-17,-27,-20,  3,-20,-21, 12,-22, 17,  8,-20,-23,-19,-20,-12, -4, 11,-19, -4,-20;
/M: SY='G'; M= 24,-10,-18,-15,-14,-23, 27,-20,-21,-15,-18,-14, -5,-15,-14,-19,  6, -7,-12,-21,-23,-14;
/M: SY='Y'; M= -8,-24,-22,-28,-22, 13,-27,-14, 14,-21, 13,  8,-21,-25,-19,-18,-17, -6, 10, -4, 16,-22;
/M: SY='L'; M=  3,-22,-19,-27,-20,  3,-17,-18,  8,-20, 11,  6,-19,-22,-18,-19,-12, -6,  7,-13,  0,-19;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M: SY='L'; M=  1,-19,-17,-23,-16,  1,-19,-17,  6,-16, 11,  7,-16,-21,-14,-12, -9, -3,  6,-19, -5,-15; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M: SY='A'; M= 11, -5,-17,-10, -9,-15,  1,-12,-13,-10,-13, -9, -1,-15, -8,-11,  5,  0, -7,-22,-14, -9; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M: SY='R'; M= -9, -9,-22,-10, -3, -7,-17, -3,-12,  4, -9, -5, -5,-17,  0, 13, -5, -4,-10,-14,  0, -3; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
/M: SY='R'; M= -6,-10,-20,-12, -7, -3,-13, -6, -9, -2, -6, -3, -7,-11, -5,  1, -6, -5, -8,-12,  0, -7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='N'; M= -7,  1,-24,  0, -2,-18, -2, -5,-21,  0,-20,-13,  6, -9, -3,  2,  0, -5,-18,-24,-12, -3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M:         M= -7,-12,-24,-14,-10, -3, -7,-13,-14, -5,-12, -8, -6,-11,-11, -2, -5, -6,-11,-16, -7,-11; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='R'; M= -9,-17,-28,-18,-10, -8,-20,-14,-11,  1,-10, -6,-13, -7, -7,  6,-12, -8,-10, -3, -3,-10;
/M: SY='L'; M= -3,-21,-23,-24,-20,  0, -5,-19,  0,-20,  4,  1,-16,-21,-19,-17,-12, -8,  1,-13, -5,-20;
/M: SY='R'; M= -8,  6,-25,  9,  5,-23,-12, -5,-25, 10,-21,-14,  4,-14,  4, 15, -1, -5,-18,-25,-12,  3;
/M: SY='R'; M= -4, -3,-24, -6, -3,-16, -9, -7,-18,  3,-17,-10,  1,-14, -1,  5, -1, -3,-14,-18, -9, -3;
/M: SY='L'; M= -3,-23,-21,-27,-21,  7,-22,-21, 11,-21, 12,  5,-20,-19,-20,-19,-13, -5, 10,-13, -1,-21;
/M: SY='L'; M= -3,-25,-19,-29,-22,  9,-24,-21, 16,-23, 17, 10,-21,-24,-21,-20,-15, -6, 13,-15,  1,-22;
/M: SY='R'; M= -9, -7,-23,-10, -5, -9,-16, -7,-11, -1, -6, -1, -4,-18, -2,  6, -5, -3, -9,-21, -6, -4;
/M:         M= -1,-16,-21,-20,-14, -5,-14,-17, -3,-12, -4, -2,-12,-10,-13, -9, -4,  0, -1,-18, -8,-14;
/M: SY='L'; M= -5,-24,-19,-29,-22, 10,-24,-19, 15,-23, 16,  9,-21,-25,-20,-20,-15, -6, 11,-13,  6,-22;
/M: SY='V'; M= -2,-21,-17,-26,-21,  5,-23,-20, 13,-21, 10,  7,-17,-22,-19,-19, -8,  0, 14,-20, -2,-21;
/M: SY='L'; M= -8, -7,-22, -8, -5, -3,-21,-11, -1,-13,  2,  0, -8,-19, -9,-13, -8, -3, -2,-20, -3, -7;
/M: SY='I'; M= -1,-23,-18,-28,-22,  6,-24,-22, 16,-23, 16,  9,-20,-23,-20,-20,-12, -3, 14,-18, -2,-21;
/M: SY='P'; M= -6,-21,-25,-22,-15, -3,-16,-20, -1,-19, -1, -1,-17,  9,-17,-19,-11, -5, -4,-20,-10,-17;
/M: SY='M'; M= -9,-17,-23,-20,-13,  0,-21, -8, -1, -8,  4,  6,-13,-22, -6,  1,-12, -7, -3,-11,  3,-10;
/M: SY='A'; M=  8,-13,-17,-18,-14, -9, -4,-17, -4,-15, -7, -2, -8,-16,-12,-16,  3,  0,  0,-20,-12,-13;
/M: SY='I'; M= -6,-24,-19,-30,-24,  8,-30,-23, 22,-23, 16, 13,-20,-23,-21,-21,-13,  1, 20,-20, -1,-23;
/M: SY='P'; M= -7,-16,-35, -8, -1,-28,-16,-18,-20,-10,-29,-19,-15, 71, -9,-18, -3, -6,-27,-31,-28, -9;
/M:         M=  0,-11,-21,-13, -9,-10, -9,-14, -8,-13, -9, -6, -8, -7,-10,-14,  0,  0, -6,-23,-11,-10;
/M: SY='I'; M= -7,-25,-20,-29,-22, 12,-28,-20, 17,-23, 16, 10,-21,-24,-20,-19,-15, -5, 15,-16,  2,-21;
/M: SY='V'; M=  3,-25,-18,-29,-23, -1,-23,-24, 17,-21,  9,  7,-23,-22,-21,-21,-11, -4, 21,-14, -6,-22;
/M: SY='L'; M= -6,-22,-21,-25,-18,  4,-24,-17, 10,-18, 12,  7,-19,-23,-13,-14,-13, -4,  8,-12,  1,-16;
/M: SY='A'; M= 10,-17,-19,-22,-18,-10,  3,-20, -3,-19,  0, -1,-13,-18,-16,-20, -4, -6,  1,-21,-13,-18;
/M: SY='I'; M= -8,-25,-22,-29,-21, 11,-27,-19, 16,-22, 16, 10,-21,-17,-20,-20,-17, -6, 11,-15,  4,-22;
/M: SY='I'; M= -1,-23,-22,-26,-19,  1,-17,-21,  8,-21,  8,  4,-19,-12,-19,-20,-12, -6,  6,-17, -5,-20;
/M: SY='L'; M= -8,-27,-24,-31,-23, 12,-23,-21, 10,-24, 15,  7,-24,-26,-20,-20,-21,-10,  6,  8,  6,-21;
/M: SY='I'; M= -7,-21,-22,-25,-18,  8,-24,-13,  9,-16,  9,  7,-17,-23,-14,-13,-13, -5,  7,-11,  9,-17;
/M: SY='F'; M= -5,-19,-22,-23,-17,  7,-21,-15,  4,-17,  6,  3,-16,-19,-15,-15,-12, -5,  2, -8,  5,-16;
/M: SY='L'; M= -4,-25,-22,-28,-22,  5,-20,-21, 13,-22, 14,  9,-21,-23,-19,-20,-16, -7, 11,-11, -1,-21;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='F'; M=-11,-26,-20,-31,-24, 30,-26,-17, 10,-25, 19,  9,-22,-27,-25,-19,-19, -7,  7, -6, 13,-23; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='G'; M=  1, -4,-22, -6, -7,-20,  8,-11,-19, -8,-19,-12,  1, -8, -7, -8,  3, -5,-15,-25,-17, -8; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M:         M= -4, -7,-21, -8, -4,-12,-13, -9, -9, -4,-11, -6, -5,  0, -4, -5, -2, -2, -8,-19, -9, -5; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M:         M= -5, -7,-17, -9, -6, -4,-13, -7, -3, -7, -1, -1, -6,-13, -5, -6, -6, -4, -4,-13, -3, -6; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='G'; M= -4,-11,-17,-12,-12, -3,  4,-11, -6,-13, -1, -2, -8,-13,-12,-12, -7, -7, -6,-10, -5,-12; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='G'; M= -3, -6,-17, -6, -6,-11,  6, -8,-11, -6, -9, -6, -3, -6, -6, -6, -3, -7,-10,-11, -9, -7; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='I'; M= -4,-13,-14,-15,-11,  1,-13,-11,  6,-11,  6,  3,-12,-11, -9,-10, -9, -5,  4, -2,  0,-11; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2;
/M: SY='L'; M= -4, -9,-14,-10, -8, -1, -6, -9, -2,-10,  1, -1, -8, -7, -9, -9, -7, -4, -3, -7, -3, -9; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M:         M= -2, -7,-13, -9, -7, -3, -6, -9, -3, -8, -2, -2, -6, -8, -7, -8, -3, -2, -3, -9, -4, -7; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='B'; M= -4,  3,-15,  3, -1,-12, -4, -5,-10, -4,-10, -8,  3, -6, -3, -5,  1, -2, -9,-17, -9, -2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M:         M= -4, -9,-17,-10, -7, -6,-11, -9, -3, -9, -1, -2, -7, -7, -7, -7, -6, -3, -4,-15, -6, -8; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='L'; M= -5,-12,-18,-14,-11, -1,-12,-11,  1,-12,  3,  1,-10,-13,-10,-11, -8, -4, -1,-12, -2,-11; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='Y'; M= -8, -6,-22, -7, -7, -4,-12, -6, -9, -8, -7, -6, -3,-13, -7, -7, -5, -4,-10,-10,  1, -8; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='S'; M=  3, -3,-21, -6, -7,-19,  7, -5,-21,-10,-21,-14,  3, -9, -7,-10,  9,  2,-16,-26,-15, -8;
/M: SY='L'; M= -8,-20,-23,-23,-14,  6,-23,-14,  4,-17, 10,  6,-18,-18,-14,-13,-15, -6,  1, -9,  3,-14;
/M: SY='I'; M= -5,-20,-23,-24,-17,  3,-21,-19,  4,-18,  4,  1,-17,-16,-16,-17,-12, -4,  2, -5,  0,-17;
/M: SY='A'; M=  8,-10,-17,-15,-13,-13, -3,-17, -8,-15, -6, -6, -7,-12,-12,-16,  0, -1, -5,-22,-14,-13;
/M: SY='V'; M=  2,-19,-21,-21,-16,-10,-15,-21,  4,-16,  1,  1,-17, -5,-15,-18, -7, -4,  5,-24,-12,-17;
/M: SY='I'; M=  0,-23,-18,-29,-23, -1,-24,-23, 21,-21, 10,  9,-19,-22,-19,-21,-10, -3, 21,-20, -4,-23;
/M: SY='I'; M= -6,-27,-20,-32,-24,  9,-28,-23, 22,-25, 22, 13,-23,-25,-21,-22,-19, -7, 16,-15,  0,-23;
/M: SY='A'; M= 15,-16,-14,-21,-17,-11, -7,-22,  1,-16, -3, -2,-13,-15,-16,-19,  1,  2,  7,-24,-14,-17;
/M: SY='L'; M= -8,-19,-21,-21,-16,  2,-24, -8, 10,-20, 16, 11,-16,-23,-13,-16,-15, -7,  5,-19,  3,-15;
/M: SY='V'; M=  7,-15,-15,-20,-17, -7,-10,-21,  2,-17, -3, -2,-11,-18,-16,-18,  2,  5,  8,-24,-11,-17;
/M: SY='L'; M= -7,-27,-23,-31,-23, 10,-27,-20, 13,-23, 15,  8,-24,-25,-20,-20,-20, -9,  9,  4,  6,-22;
/M: SY='M'; M= -6,-16,-21,-20,-15,  0,-17,-12, -1,-13, -1,  1,-12,-15,-12,-11, -9, -4, -1,-15, -1,-14;
/M: SY='S'; M=  0, -9,-18,-13,-11, -8, -5,-11,-11,-12,-11, -7, -4,-16, -9,-13,  2,  1, -8,-17, -6,-10;
/M: SY='L'; M= -2,-22,-20,-27,-20,  5,-19,-20,  7,-21,  9,  5,-19,-23,-18,-19,-11, -3,  6, -6,  0,-19;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='P'; M=  6,-16,-26,-15,-10,-18, -2,-20,-16,-14,-18,-13,-13, 24,-13,-19, -3, -7,-15,-21,-20,-13;
/M: SY='F'; M=-12,-21,-24,-24,-19, 20,-22,-10,  1,-18,  2,  1,-17,-18,-18,-15,-14, -7, -2,  0, 19,-19;
/M: SY='I'; M= -1,-16,-18,-22,-18, -1,-19,-15,  9,-17,  4,  6,-12,-20,-14,-17, -7, -2,  8,-19, -2,-17;
/M: SY='V'; M=  6,-18,-16,-24,-19, -2,-18,-18,  8,-17,  4,  6,-15,-19,-15,-17, -4,  1, 11,-20, -4,-18;
/M: SY='R'; M=-11,-16,-25,-17, -6, -3,-23,-12, -4, -4,  1,  0,-12,-20, -6,  6,-13, -8, -4,-13, -2, -7;
/M: SY='I'; M= -5,-19,-21,-24,-19,  0,-24,-17, 15,-19, 11,  9,-15,-18,-15,-18,-11, -2, 11,-22, -3,-18;
/M: SY='I'; M= -5,-22,-17,-27,-21,  8,-26,-18, 13,-19, 12, 10,-19,-23,-18,-16,-11,  0, 13,-17,  2,-20;
/M: SY='R'; M=-10,-12,-24,-14, -5, -9,-21, -6,-11,  4, -5, -2, -8,-20, -1, 19, -9, -5, -8,-18, -2, -6;
/M: SY='A'; M= 12, -2,-19, -5, -3,-22,  4,-12,-18, -8,-18,-13,  1,-10, -4,-12, 10,  1,-12,-27,-19, -4;
/M: SY='A'; M=  9,-11,-20,-15,-11,-11,  8,-14,-15,-13,-13, -9, -6,-16,-11,-14,  3, -5,-10,-19,-11,-11;
/M: SY='L'; M= -8,-27,-20,-31,-23, 14,-29,-20, 20,-24, 24, 17,-23,-26,-21,-20,-20, -7, 15,-15,  4,-22;
/M: SY='Q'; M= -6, -4,-24, -5,  4,-18,-18, -7,-11,  1, -6, -3, -4,-15,  6,  3, -6, -6,-11,-24,-10,  4;
/M: SY='S'; M=  5,  3,-19,  0,  4,-23, -3, -8,-20, -2,-20,-14,  5,-11,  3, -4, 11,  3,-15,-29,-17,  3;
/M: SY='I'; M= -5,-26,-19,-30,-23,  1,-31,-24, 27,-22, 16, 13,-22,-24,-20,-21,-14, -4, 26,-23, -4,-23;
/M: SY='P'; M=-10,  0,-31,  6,  3,-26,-15,-10,-21, -3,-21,-15, -4, 26, -4, -8, -5, -8,-22,-30,-20, -3;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='K'; M= -7, -3,-27, -2,  6,-23,-16, -6,-21, 10,-19,-10, -2, -2,  6, 10, -2, -5,-17,-24,-13,  5;
/M: SY='D'; M= -6, 11,-25, 16, 15,-27, -3, -5,-27, -1,-23,-18,  6, -8,  3, -5,  5, -4,-23,-30,-18,  8;
/M: SY='Y'; M=-12,-22,-24,-24,-15, 11,-28, -6,  8,-17, 15,  8,-20,-23, -8,-13,-19, -9,  0, -6, 18,-13;
/M: SY='I'; M= -9,-16,-23,-17, -9, -2,-26,-12,  7,-11,  3,  3,-16,-20,-10, -9,-12, -6,  7,-15,  3,-11;
/M: SY='E'; M=-10,  7,-28, 13, 33,-25,-19, -2,-24,  8,-17,-14,  1, -7, 12,  4, -2, -8,-23,-27,-15, 22;
/M: SY='A'; M= 32,-11,-12,-19,-12,-14, -5,-18, -7,-12, -7, -7, -9,-13,-11,-18,  8,  3,  2,-22,-15,-11;
/M: SY='A'; M= 36,-10,-10,-18,-10,-18,  1,-18,-11,-12,-11, -9, -8,-12,-10,-19, 10,  1, -2,-22,-18,-10;
/M: SY='R'; M= -9, -8,-26, -9,  0,-16,-19, -4,-16, 12,-11, -5, -5,-17,  5, 22, -8, -7,-13,-18, -5,  0;
/M: SY='A'; M= 10,-12,-16,-17,-14,-11,-13,-18,  4,-16, -1,  0, -9,-17,-12,-18,  2,  2,  7,-26,-12,-14;
/M: SY='L'; M=-12, -2,-23,  1, -5, -9,-21,-10, -6, -9,  7,  1, -9,-20, -8, -9,-14, -8, -6,-24, -5, -7;
/M: SY='G'; M=  0, -9,-29, -9,-18,-29, 63,-18,-38,-18,-29,-19,  1,-20,-18,-17,  0,-18,-29,-20,-28,-18;
/M: SY='A'; M= 18,-16,-10,-22,-15, -8,-12,-17, -1,-15,  4,  2,-15,-18,-13,-18, -4, -4,  3,-20,-10,-14;
/M: SY='S'; M=  0,  2,-19, -1, -4,-21,  4,-10,-23, -5,-26,-17,  9, -7, -4, -5, 18, 10,-17,-32,-19, -5;
/M: SY='R'; M= -8, -5,-28, -4,  4,-19,-14, -7,-22,  5,-20,-13, -4,  1,  0,  7, -4, -6,-19,-18,-11,  0;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='W'; M=-10,-23,-28,-26,-19, 11,-18,-18, -6,-15, -2, -4,-19,-21,-16,-10,-17,-11, -8, 26,  9,-17; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='Q'; M= -9, -4,-27, -5,  5,-22,-16,  1,-20, 10,-17, -6, -2,-15, 18, 16, -3, -6,-19,-18, -6, 10;
/M: SY='V'; M= -2,-18,-19,-23,-16, -7,-25,-19, 11,-12,  3,  5,-14,-19,-11, -9, -6,  3, 12,-23, -6,-15;
/M: SY='F'; M=-12,-28,-22,-34,-25, 30,-30,-18, 15,-25, 19, 12,-22,-27,-25,-20,-21, -9, 10, -4, 13,-24;
/M: SY='F'; M=-13,-20,-26,-24,-16,  9,-23,-14, -8, -5, -2, -3,-15,-24,-12,  8,-15, -8, -6,  7,  7,-14;
/M: SY='R'; M=-12, -5,-26, -6,  0,-15,-18,  4,-22, 15,-17, -8,  0,-17,  4, 21, -6, -6,-17,-18, -1,  0;
/M: SY='I'; M= -7,-22,-22,-25,-21, -4,-29, -4, 21,-20,  7, 10,-17,-23,-16,-19,-13, -8, 21,-24,  1,-21;
/M: SY='V'; M= -1,-19,-18,-24,-18, -4,-25,-21, 15,-17,  7,  6,-16,-20,-15,-17, -7,  4, 16,-23, -5,-18;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-21,-31,-23, 14,-29,-21, 19,-27, 33, 16,-26,-28,-21,-20,-25, -9, 12,-13,  3,-22;
/M: SY='P'; M=-11,-18,-38,-10,  0,-28,-20,-17,-21, -4,-28,-18,-17, 71, -7, -9,-10,-10,-27,-28,-26, -8;
/M: SY='M'; M= -5, -5,-21,-10, -6,-11,-15, -4, -3,-11,  2,  3,  0,-18,  0, -9, -6, -5, -8,-24, -7, -3;
/M: SY='A'; M= 15,-17,-13,-23,-16, -9,-15,-20,  6,-18,  5,  3,-14,-18,-14,-19, -1,  0,  9,-24,-12,-15;
/M: SY='L'; M= -5,-19,-22,-22,-14, -2,-22,-15,  2, -7,  8,  7,-15,-21,-10, -2,-13, -6,  2,-15, -3,-13;
/M: SY='P'; M= -7,-14,-31,-11, -4,-21,-15,-15,-15, -6,-19,-13,-11, 34, -7, -7, -5, -6,-18,-26,-20, -8;
/M: SY='A'; M=  2,-12,-23,-14,-11,-16, -2,-15,-11,-12,-14, -9, -8,  0,-11,-14,  0, -3, -8,-23,-14,-12;
/M: SY='I'; M= -5,-26,-21,-31,-24,  4,-30,-23, 26,-24, 20, 15,-21,-23,-19,-22,-16, -5, 20,-20, -1,-23;
/M: SY='I'; M= -1,-24,-19,-29,-22,  6,-25,-22, 17,-22, 16, 10,-20,-23,-19,-20,-13, -4, 16,-18, -2,-21;
/M: SY='T'; M=  6,-12,-17,-16,-12,-10,-14,-18, -4,-13, -9, -7, -9, -4,-13,-15,  5,  9,  1,-25,-12,-13;
/M: SY='A'; M=  5,-14,-20,-17,-15,-13,  2,-17, -7,-16, -7, -5, -9,-14,-13,-17, -1, -4, -3,-22,-14,-15;
/M: SY='L'; M=  2,-21,-16,-26,-20,  5,-18,-20,  8,-21, 10,  5,-18,-22,-19,-19, -9, -2,  9,-17, -3,-19;
/M: SY='V'; M= -2,-19,-20,-23,-19, -5,-14,-20,  7,-17,  5,  4,-14,-20,-16,-14, -8, -1,  8,-22, -9,-18;
/M: SY='L'; M= -9,-19,-21,-24,-19, 10,-24,-15, 11,-21, 17,  9,-14,-24,-17,-17,-15, -5,  5,-16,  3,-18;
/M: SY='S'; M=  3, -5,-16, -8, -5,-16, -9,-11,-10, -8,-11, -7, -2,-16, -3, -8,  5,  3, -6,-27,-13, -4;
/M: SY='F'; M= -8,-26,-19,-32,-24, 28,-26,-21, 11,-24, 13,  7,-20,-25,-25,-20,-15, -5,  9, -6,  9,-24;
/M: SY='V'; M=  2,-18,-20,-22,-17,-10,-10,-21,  7,-18,  1,  3,-14,-15,-16,-19, -5, -3,  8,-24,-12,-18;
/M:         M= -4, -9,-23,-12, -9, -7, -7, -9,-12,-10, -9, -6, -4,-17, -8, -6, -3, -4,-10,-15, -5, -9;
/M: SY='A'; M= 10,-12,-14,-18,-13,-10,-12,-16,  0,-15, -1, -1, -8,-17,-11,-16,  3,  3,  3,-25,-12,-12;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-25,-34,-25, 15,-28,-23, 16,-25, 17, 11,-26,-26,-22,-21,-23,-11, 10, 10,  8,-23;
/M: SY='N'; M= -3,  0,-23, -4, -5,-19,  2, -9,-19, -1,-16, -9,  5,-17, -3, -2,  0, -4,-16,-25,-15, -4;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='E'; M=  0,  3,-20,  3,  4,-17,-11, -9,-14, -8,-12,-11,  0,-13, -4,-11,  3,  1,-10,-26,-13,  0;
/M: SY='F'; M= -6,-20,-18,-25,-17, 22,-24,-17,  4,-20,  6,  1,-16,-22,-21,-17, -8,  0,  6,-10,  9,-18;
/M: SY='A'; M=  5,-11,-18,-13,-12,-10,-10,-18, -1,-15, -4, -3, -9,-14,-13,-17,  1,  1,  3,-25,-12,-13;
/M: SY='I'; M=  0,-20,-20,-24,-17, -2,-21,-20, 10,-18,  7,  4,-17,-19,-15,-18, -9, -1, 10,-16, -5,-17;
/M: SY='A'; M=  4,-15,-21,-16, -5,-12,-17,-18, -1,-14, -2, -3,-14, -3,-11,-16, -4, -2,  1,-25,-14, -9;
/M:         M= -2,-12,-20,-14, -8, -3,-13,-11, -4,-13, -2, -2, -9,-18, -8,-12, -1, -1, -4,-18, -2, -8;
/M: SY='I'; M= -6,-25,-19,-31,-24, 14,-28,-21, 18,-23, 16, 12,-22,-25,-21,-19,-15, -4, 17,-15,  4,-23;
/M: SY='L'; M= -9,-28,-20,-32,-24, 18,-30,-21, 21,-26, 24, 15,-24,-26,-23,-21,-20, -7, 16,-15,  4,-24;
/M: SY='G'; M=  4, -6,-21,-10,-12,-19, 18,-16,-20,-14,-17,-12,  0,-16,-12,-14,  6,  1,-14,-24,-18,-12;
/I:         I=-4; MD=-7;
/M:         M= -2,-10,-22,-13,-12, -9,  0,-13,-11,-12, -9, -7, -6,-15,-10,-10, -4, -5, -9,-11, -7,-11; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-7;
/M: SY='G'; M= -2, -4,-25, -3, -5,-22, 11,-12,-22, -9,-21,-14,  0,  2, -7,-11,  2, -6,-19,-24,-19, -7; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-7;
/M: SY='G'; M= -2, -2,-23, -3, -6,-20, 12,-11,-19, -8,-17,-12,  0,-11, -8,-10,  0, -7,-14,-22,-16, -7; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-7;
/M: SY='P'; M= -3, -5,-17, -5, -2,-11, -9, -8, -9, -4,-10, -6, -4,  5, -2, -6, -2, -2, -9,-16, -9, -3; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-7;
/M:         M= -2, -4,-15, -6, -4,-10, -4, -7, -8, -5, -8, -4, -2, -3, -3, -6, -1, -2, -8,-15, -7, -4; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
/M: SY='T'; M=  0, -3,-13, -6, -5,-10, -7,-11, -8, -7, -9, -6, -2, -6, -6, -8,  7, 12, -4,-21,-10, -6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-7;
/M: SY='L'; M= -8,-27,-23,-31,-23,  6,-28,-21, 20,-24, 24, 14,-25,-25,-19,-20,-22, -8, 13, -6,  2,-21; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-7;
/M: SY='G'; M=  4, -8,-24, -9,-10,-24, 24,-17,-25,-14,-23,-16, -3, -2,-11,-16,  5, -5,-19,-25,-24,-12;
/M: SY='T'; M= -5, -9,-21,-11, -7, -9,-19,-11, -3, -8, -2, -1, -8,-17, -5, -7, -4,  1, -1,-22, -5, -7;
/M: SY='L'; M= -6,-18,-22,-21,-14,  2,-20,-11,  4,-15, 11,  9,-16,-22,-10,-12,-14, -7,  1,-12,  4,-13;
/M: SY='I'; M= -6,-26,-21,-31,-23,  5,-29,-21, 25,-24, 23, 17,-22,-24,-18,-21,-18, -6, 18,-19,  0,-22;
/M: SY='Y'; M= -6,-15,-23,-19,-15,  8,-20, -7, -1,-12, -1, -1,-12,-22,-11,-10, -9, -5, -2, -3, 16,-14;
/M: SY='Q'; M= -5,  5,-23,  5,  5,-20,-12, -4,-18,  0,-17,-11,  5,-13,  6,  0,  3, -1,-16,-25,-11,  5;
/M: SY='A'; M=  8, -9,-19,-13, -8,-10, -6,-11,-10,-10, -8, -5, -6,-16, -5,-11,  1, -2, -7,-18, -6, -7;
/M: SY='I'; M= -2,-16,-21,-20,-14, -3,-19,-14,  3,-11,  1,  3,-12,-20, -9, -9, -7, -3,  3,-17, -2,-12;
/M:         M= -5, -5,-22, -8, -5, -7,-10, -8,-13, -7,-11, -7, -2,-16, -4, -5, -1, -2,-11,-20, -5, -5;
/M:         M= -3, -5,-22, -7, -3,-12,-12, -7,-12, -5,-10, -6, -2,-15, -1, -4, -1, -2,-10,-21, -6, -2;
/M:         M= -4, -9,-23,-11, -8, -9, -8, -9,-11, -8, -8, -5, -5,-15, -6, -4, -4, -5,-10,-18, -5, -8;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='D'; M= -6,  5,-22,  6,  0,-15, -8, -6,-17, -6,-15,-11,  4,-13, -3, -6,  0, -3,-14,-24, -9, -2; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='S'; M= -3, -2,-17, -3, -4, -9,-10, -7, -9, -6, -8, -6, -1,-11, -4, -6,  1,  1, -7,-19, -6, -5; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='S'; M= -1, -1,-15, -2, -2, -9, -6, -5, -9, -5, -9, -7,  0, -4, -3, -6,  1,  0, -8,-15, -6, -3; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M: SY='W'; M=-11,-21,-24,-23,-17, 13,-21,-10,  1,-15,  2,  2,-19,-16,-13,-13,-17,-10, -4, 17, 17,-15; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='G'; M= -2, -6,-26, -5, -4,-19,  8,-11,-22, -9,-21,-15, -3, -1, -7,-11, -1, -8,-21,-11,-15, -6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='I'; M= -2,-17,-20,-20,-13, -3,-20,-14,  4,-13,  4,  3,-15,-17,-11,-13, -8, -2,  4,-17, -1,-13;
/M: SY='V'; M=  6,-19,-18,-24,-19, -2,-15,-19,  7,-18,  6,  4,-17,-20,-16,-18, -7, -4,  9,-17, -4,-18;
/M: SY='A'; M=  4,-16,-17,-21,-15, -2,-16,-15,  3,-16,  3,  4,-12,-19,-11,-16, -4, -1,  3,-18, -4,-13;
/M: SY='A'; M= 20,-15,-15,-22,-15, -7,-10,-20, -1,-15, -3, -3,-13,-14,-15,-19,  0,  0,  4,-18,-10,-15;
/M: SY='A'; M=  4,-19,-20,-22,-16, -7,-13,-19,  3,-18,  2,  2,-16, -9,-15,-19, -7, -4,  3,-21, -9,-17;
/M: SY='A'; M= 15,-11,-16,-16,-14,-15,  5,-19,-10,-15,-10, -8, -7,-16,-13,-17,  7,  2, -3,-24,-16,-13;
/M: SY='L'; M= -4,-25,-18,-29,-23,  6,-27,-22, 19,-23, 20, 12,-22,-25,-21,-20,-15, -2, 18,-19, -2,-22;
/M: SY='I'; M= -3,-26,-18,-31,-24,  5,-27,-23, 21,-23, 18, 13,-22,-23,-20,-21,-15, -5, 19,-19, -2,-23;
/M: SY='L'; M= -6,-23,-20,-28,-21,  9,-25,-16, 16,-22, 18, 12,-20,-24,-17,-19,-16, -5, 11,-15,  7,-20;
/M: SY='L'; M= -1,-23,-17,-28,-22,  7,-21,-21, 12,-22, 13,  8,-19,-23,-20,-20,-11, -2, 13,-17, -2,-21;
/M: SY='I'; M=  0,-25,-17,-29,-23,  3,-25,-23, 19,-24, 19, 11,-22,-24,-20,-21,-14, -5, 18,-21, -4,-22;
/M: SY='I'; M= -4,-23,-20,-27,-20,  1,-25,-22, 14,-21, 11,  8,-20, -9,-19,-20,-13, -3, 11,-21, -6,-20;
/M: SY='V'; M=  2,-14,-13,-19,-17, -7,-15,-19,  4,-17, -2, -1,-10,-18,-16,-17,  0,  4,  9,-26,-10,-17;
/M: SY='L'; M= -5,-25,-19,-29,-22,  9,-25,-21, 16,-24, 22, 12,-22,-25,-20,-20,-17, -6, 13,-17,  0,-21;
/M: SY='I'; M=  3,-22,-17,-26,-21, -4,-19,-23, 14,-21,  9,  5,-18,-19,-19,-21, -8, -3, 14,-23, -9,-21;
/M: SY='L'; M= -3,-25,-18,-29,-22,  9,-24,-22, 16,-23, 17, 10,-21,-24,-21,-20,-14, -5, 15,-18, -1,-22;
/M: SY='N'; M= -5,  0,-20, -4, -7, -4,-13, -9, -9,-11, -9, -8,  3,-18, -9,-11,  1,  1, -8,-22, -5, -8;
/M: SY='L'; M= -4,-23,-21,-27,-20,  8,-23,-17, 11,-20, 16,  8,-20,-23,-17,-16,-16, -6,  8,-13,  2,-19;
/M: SY='L'; M= -5,-26,-20,-31,-23,  8,-27,-23, 20,-25, 22, 12,-23,-25,-21,-21,-17, -6, 16,-17,  0,-23;
/M:         M=  0,-15,-20,-19,-14, -2,-10,-13, -2,-15, -1,  0,-11,-20,-10,-13, -5, -4, -1,-16, -1,-13;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 503 in 487 different sequences
Number of true positive hits 503 in 487 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] window20
Author [info] V_Lesaux
Taxonomic range [info] Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 2
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
487 sequences

AAPM_RHIL3  (Q52814), AAPQ_RHIL3  (Q52813), AGLF_RHIME  (Q9Z3R6), 
AGLG_RHIME  (Q9Z3R7), AMIC_STRPN  (P0A4M7), AMIC_STRR6  (P0A4M8), 
AMID_STRPN  (P0A4M9), AMID_STRR6  (P0A4N0), AMYC_BACSU  (O34518), 
AMYC_THETU  (P37729), AMYD_BACSU  (O34706), AMYD_THETU  (P37730), 
ANTRP_HALVD (D4GSY8), APPB_BACSU  (P42062), APPC_BACSU  (P42063), 
ARAP_BACHD  (Q9KEF0), ARAP_BACSU  (P94529), ARAQ_BACHD  (Q9KEE9), 
ARAQ_BACSU  (P94530), ARTM_ECO57  (P0AE32), ARTM_ECOL6  (P0AE31), 
ARTM_ECOLI  (P0AE30), ARTM_HAEIN  (P45089), ARTM_SHIFL  (P0AE33), 
ARTQ_BACSU  (P54536), ARTQ_ECOL6  (P0AE35), ARTQ_ECOLI  (P0AE34), 
ARTQ_HAEIN  (P45090), ARTQ_SHIFL  (P0AE36), BZTB_RHOCB  (Q52664), 
BZTC_RHOCB  (Q52665), CMPB_SYNE7  (Q55106), CMPB_SYNP6  (Q5MZ55), 
CMPB_SYNY3  (Q55461), CYST_ANTFO  (Q85AI0), CYST_CHLAT  (A2CI71), 
CYST_CHLVU  (P56343), CYST_ECOLI  (P16701), CYST_HELSJ  (Q2EEX6), 
CYST_MARPO  (P26246), CYST_MESVI  (Q9MUL9), CYST_NEPOL  (Q9TKU8), 
CYST_PROWI  (Q9TJR4), CYST_SALTY  (P41032), CYST_SYNE7  (P27367), 
CYST_SYNY3  (Q01895), CYST_ZYGCR  (Q32RF7), CYSW_ECOL6  (P0AEB1), 
CYSW_ECOLI  (P0AEB0), CYSW_SYNE7  (P27370), CYSW_SYNY3  (P74547), 
DDPB_ECOLI  (P77308), DDPC_ECOLI  (P77463), DPPB_BACPE  (P94311), 
DPPB_BACSU  (P26903), DPPB_ECO57  (P0AEG0), DPPB_ECOL6  (P0AEF9), 
DPPB_ECOLI  (P0AEF8), DPPB_HAEIN  (P45096), DPPC_BACPE  (P94312), 
DPPC_BACSU  (P26904), DPPC_ECO57  (P0AEG3), DPPC_ECOL6  (P0AEG2), 
DPPC_ECOLI  (P0AEG1), DPPC_HAEIN  (P51000), FBPB1_HAEIN (Q57341), 
FBPB2_HAEIN (P71338), FBPB_ACTPL  (Q44123), FBPB_ECOLI  (P75681), 
FBPB_SERMA  (P21409), GANP_BACSU  (O32261), GANQ_BACSU  (O07011), 
GBUB_LISM4  (Q9RR45), GLNM_BACSU  (O34671), GLNP_BACSU  (O34606), 
GLNP_ECO57  (P0AEQ8), GLNP_ECOL6  (P0AEQ7), GLNP_ECOLI  (P0AEQ6), 
GLNP_RICBR  (Q1RHC0), GLNP_RICCN  (Q92J96), GLNP_RICFE  (Q4UKC4), 
GLNP_RICPR  (P41083), GLNP_RICTY  (Q68XN8), GLNP_SHIFL  (P0AEQ9), 
GLTJ_ECOL6  (P0AER4), GLTJ_ECOLI  (P0AER3), GLTK_ECO57  (P0AER7), 
GLTK_ECOL6  (P0AER6), GLTK_ECOLI  (P0AER5), GLUC_COREF  (Q8RQL5), 
GLUC_CORGL  (P48244), GLUD_COREF  (Q8RQL4), GLUD_CORGL  (P48245), 
GSIC_ECO57  (Q8X6V7), GSIC_ECOK1  (A1A970), GSIC_ECOL5  (Q0TJL7), 
GSIC_ECOL6  (Q8FJK9), GSIC_ECOLI  (P75798), GSIC_ECOUT  (Q1RE94), 
GSIC_PECAS  (Q6D3B1), GSIC_SALCH  (Q57RB0), GSIC_SALPA  (Q5PGP5), 
GSIC_SALTI  (Q8Z862), GSIC_SALTY  (Q8ZQM2), GSIC_SHIBS  (Q323W3), 
GSIC_SHIDS  (Q32IB7), GSIC_SHIF8  (Q0T6D1), GSIC_SHIFL  (Q83S26), 
GSIC_SHISS  (Q3Z3V2), GSID_ECO57  (Q8X6V6), GSID_ECOK1  (A1A971), 
GSID_ECOL5  (Q0TJL6), GSID_ECOL6  (Q8FJK8), GSID_ECOLI  (P75799), 
GSID_ECOUT  (Q1RE93), GSID_PECAS  (Q6D3B2), GSID_SALCH  (Q57RA9), 
GSID_SALPA  (Q5PGP6), GSID_SALTI  (Q8XF88), GSID_SALTY  (Q7CQV4), 
GSID_SHIBS  (Q323W2), GSID_SHIDS  (Q32IB8), GSID_SHIF8  (P0C2L2), 
GSID_SHIFL  (Q83S25), GSID_SHISS  (Q3Z3V1), HISM_ECO57  (P0AEU5), 
HISM_ECOL6  (P0AEU4), HISM_ECOLI  (P0AEU3), HISM_SALTI  (P0A2I8), 
HISM_SALTY  (P0A2I7), HISM_SHIFL  (P0AEU6), HISQ_ECOLI  (P52094), 
HISQ_SALTI  (P0A2J0), HISQ_SALTY  (P0A2I9), HTXC_PSEST  (O69062), 
HTXE_PSEST  (O69064), LACF_RHIRD  (P29823), LACG_RHIRD  (P29824), 
LPLB_BACSU  (P39128), LPLC_BACSU  (P39129), MALC_STRPN  (P0A4N1), 
MALC_STRR6  (P0A4N2), MALD_STRPN  (P0A4N3), MALD_STRR6  (P0A4N4), 
MALF_ECO57  (Q7A937), MALF_ECOL6  (Q8FB38), MALF_ECOLI  (P02916), 
MALF_ENTAE  (P18812), MALF_PHOLL  (Q7N984), MALF_SALTI  (Q8Z1U2), 
MALF_SALTY  (P26467), MALF_SHIFL  (Q83P81), MALF_THELN  (O51924), 
MALF_VIBCH  (Q9KL06), MALF_VIBPA  (Q87GB7), MALF_VIBVU  (Q8D3U8), 
MALF_VIBVY  (Q7MFC2), MALF_YERPE  (Q74RF9), MALG_ECO57  (P68185), 
MALG_ECOL6  (P68184), MALG_ECOLI  (P68183), MALG_ENTAE  (P18814), 
MALG_PHOLL  (Q7N983), MALG_SALTI  (Q8Z1U3), MALG_SALTY  (P26468), 
MALG_SHIFL  (P68186), MALG_THELN  (Q7LYX6), MALG_VIBCH  (Q9KL07), 
MALG_VIBPA  (Q87GB8), MALG_VIBVU  (Q8D3U7), MALG_VIBVY  (Q7MFC1), 
MALG_YERPE  (Q74RF8), MDXF_BACSU  (O06990), MDXG_BACSU  (O06991), 
METI_ECO57  (Q8X800), METI_ECOLI  (P31547), METI_HAEIN  (P46492), 
METI_PASMU  (Q9CK96), METI_SALTI  (Q8Z991), METI_SALTY  (Q8ZRN0), 
METI_VIBCH  (Q9KTJ6), METI_YERPE  (Q8ZH39), METP_BACSU  (O32168), 
MOBDP_HALVD (D4GQ17), MODB_AZOVI  (P37731), MODB_ECO57  (P0AF02), 
MODB_ECOLI  (P0AF01), MODB_HAEIN  (P45322), MODB_MYCBO  (P0A625), 
MODB_MYCTO  (P9WG12), MODB_MYCTU  (P9WG13), MODB_RHOCA  (Q08382), 
MSMF_STRMU  (Q00750), MSMG_STRMU  (Q00751), NIFC_CLOPA  (P18795), 
NIKB_ECOLI  (P33591), NIKC_ECO57  (P0AFB0), NIKC_ECOLI  (P0AFA9), 
NOCM_AGRT5  (P35113), NOCQ_AGRT5  (P35118), NRTB_PHOLA  (Q51881), 
NRTB_SYNE7  (P38044), NRTB_SYNY3  (P73451), OCCM_RHIML  (P72296), 
OCCM_RHIRD  (P35114), OCCQ_AGRT4  (P0A4N6), OCCQ_RHIML  (P72295), 
OCCQ_RHIRD  (P0A4N5), OPPB2_STAA3 (Q2FH55), OPPB2_STAA8 (Q2FYQ5), 
OPPB2_STAAB (Q2YXY7), OPPB2_STAAC (Q5HG38), OPPB2_STAAM (Q99UA0), 
OPPB2_STAAN (Q7A5Q6), OPPB2_STAAR (Q6GH25), OPPB2_STAAS (Q6G9H8), 
OPPB2_STAAW (Q8NWT4), OPPB_BACSU  (P24138), OPPB_ECO57  (P0AFH4), 
OPPB_ECOL6  (P0AFH3), OPPB_ECOLI  (P0AFH2), OPPB_HAEIN  (P45054), 
OPPB_LACLA  (P0A4N7), OPPB_LACLS  (P0A4N8), OPPB_MYCGE  (P47323), 
OPPB_MYCPN  (P75554), OPPB_SALTY  (P08005), OPPB_SHIFL  (P0AFH5), 
OPPC2_STAA3 (Q2FH56), OPPC2_STAA8 (Q2FYQ6), OPPC2_STAAB (Q2YXY8), 
OPPC2_STAAC (Q5HG39), OPPC2_STAAM (Q99UA1), OPPC2_STAAN (Q7A5Q7), 
OPPC2_STAAR (Q6GH26), OPPC2_STAAS (Q6G9H9), OPPC2_STAAW (Q7A0Y0), 
OPPC_BACSU  (P24139), OPPC_ECO57  (P0AFH7), OPPC_ECOLI  (P0AFH6), 
OPPC_HAEIN  (P45053), OPPC_LACLA  (P0A4N9), OPPC_LACLS  (P0A4P0), 
OPPC_MYCGE  (P47324), OPPC_MYCPN  (P75553), OPPC_SALTY  (P08006), 
OPUAB_BACSU (P46921), OPUBB_BACSU (Q45461), OPUBD_BACSU (P39775), 
OPUCB_BACSU (O34878), OPUCB_LISM4 (G2JZ43), OPUCB_LISMN (Q9KHT8), 
OPUCD_BACSU (O34742), OPUCD_LISM4 (G2JZ41), OPUCD_LISMN (Q9KHT6), 
P69_MYCGE   (P47533), P69_MYCHR   (P15362), P69_MYCPN   (P75369), 
PATM_VIBHA  (P52625), PHNE_ECOLI  (P16683), PHNE_MYCS2  (A0QQ68), 
PHNU_SALCH  (Q57SD7), PHNU_SALPA  (Q5PFQ6), PHNU_SALTI  (Q8Z8W9), 
PHNU_SALTY  (P96064), PHNV_SALCH  (Q57SD8), PHNV_SALPA  (Q5PFQ5), 
PHNV_SALTI  (Q8Z8X0), PHNV_SALTY  (P96065), POTB_ECOLI  (P0AFK4), 
POTB_HAEIN  (P45170), POTB_MYCGE  (P47289), POTB_MYCPN  (P75058), 
POTB_SALTI  (P0A2J8), POTB_SALTS  (E1WF94), POTB_SALTY  (P0CL49), 
POTB_SHIFL  (P0AFK5), POTC_ECO57  (P0AFK8), POTC_ECOL6  (P0AFK7), 
POTC_ECOLI  (P0AFK6), POTC_HAEIN  (P45169), POTC_MYCGE  (P47290), 
POTC_MYCPN  (P75057), POTC_SHIFL  (Q83RR7), POTH_ECOLI  (P31135), 
POTI_ECOL6  (P0AFL2), POTI_ECOLI  (P0AFL1), PROW_ECOLI  (P14176), 
PROW_SALTY  (P17327), PSTA1_MYCTO (P9WG10), PSTA1_MYCTU (P9WG11), 
PSTA2_MYCBO (P0A627), PSTA2_MYCTO (P9WG08), PSTA2_MYCTU (P9WG09), 
PSTA_ECOLI  (P07654), PSTA_HAEIN  (P45190), PSTA_METJA  (Q58419), 
PSTA_MYCGE  (P47651), PSTA_MYCLE  (Q50097), PSTA_MYCPN  (P75185), 
PSTA_PASMU  (Q9CNJ6), PSTA_RHILO  (Q98FL4), PSTA_XYLFA  (Q9PBK1), 
PSTA_XYLFT  (Q87C89), PSTA_YERPE  (P58655), PSTC1_MYCBO (P0A629), 
PSTC1_MYCTO (P9WG06), PSTC1_MYCTU (P9WG07), PSTC2_MYCBO (P0A631), 
PSTC2_MYCTO (P9WG04), PSTC2_MYCTU (P9WG05), PSTC_ECO57  (P0AGH9), 
PSTC_ECOLI  (P0AGH8), PSTC_HAEIN  (P45191), PSTC_METJA  (Q58420), 
PSTC_MYCLE  (Q50098), PSTC_PASMU  (Q9CNJ5), PSTC_RHILO  (Q98FL3), 
PSTC_SHIFL  (P0AGI0), PSTC_XYLFA  (Q9PBK2), PSTC_XYLFT  (Q87C90), 
PTXC_PSEST  (O69053), SAPB_ECO57  (P0AGH4), SAPB_ECOLI  (P0AGH3), 
SAPB_HAEIN  (P45286), SAPB_SALTI  (P0A2J4), SAPB_SALTY  (P0A2J3), 
SAPC_ECOL6  (P0AGH6), SAPC_ECOLI  (P0AGH5), SAPC_HAEIN  (P45287), 
SAPC_SALTI  (P0A2J6), SAPC_SALTY  (P0A2J5), SAPC_SHIFL  (P0AGH7), 
SSUC_BACSU  (P40401), SSUC_ECOLI  (P75851), SUGA_MYCTO  (P9WG02), 
SUGA_MYCTU  (P9WG03), SUGB_MYCTO  (P9WG00), SUGB_MYCTU  (P9WG01), 
SULP1_CHLRE (Q8RVC7), SULP2_CHLRE (Q6QJE2), TAUC_ECOLI  (Q47539), 
TCYB_BACSU  (P42200), TCYL_BACSU  (O34315), TCYM_BACSU  (O34931), 
THIP_BRUA2  (Q2YLW7), THIP_BRUAB  (Q57BC3), THIP_BRUME  (Q8YJ03), 
THIP_BRUSU  (Q8FYV0), THIP_ECOLI  (P31549), THIP_HAEIN  (P44985), 
UGPA_AGRT5  (Q7CRU3), UGPA_BRUA2  (Q2YKR6), UGPA_BRUAB  (Q578E7), 
UGPA_BRUME  (Q8YCA8), UGPA_BRUSU  (Q8FW09), UGPA_ECO57  (Q7AA80), 
UGPA_ECOK1  (A1AGY3), UGPA_ECOL5  (Q0TC08), UGPA_ECOL6  (Q8FCQ0), 
UGPA_ECOLI  (P10905), UGPA_ECOUT  (Q1R5H6), UGPA_PECAS  (Q6CZ32), 
UGPA_RHIME  (Q92WD8), UGPA_SALCH  (Q57IS1), UGPA_SALPA  (Q5PJK9), 
UGPA_SALTI  (Q8Z247), UGPA_SALTY  (Q8ZLF2), UGPA_SHIDS  (Q32AT4), 
UGPA_SHIF8  (Q0SZM0), UGPA_SHIFL  (Q83PU6), UGPA_YERE8  (A1JID8), 
UGPA_YERPA  (Q1CBH4), UGPA_YERPE  (Q7CKV6), UGPA_YERPN  (Q1CNC8), 
UGPA_YERPS  (Q66FU6), UGPE_AGRT5  (Q8UB30), UGPE_BRUA2  (Q2YKR7), 
UGPE_BRUAB  (Q578E8), UGPE_BRUME  (Q8YCB0), UGPE_BRUSU  (Q8FW08), 
UGPE_ECO57  (Q8X4P0), UGPE_ECOK1  (A1AGY2), UGPE_ECOL5  (Q0TC09), 
UGPE_ECOL6  (Q8FCQ1), UGPE_ECOLI  (P10906), UGPE_ECOUT  (Q1R5H7), 
UGPE_PECAS  (Q6CZ33), UGPE_RHIME  (Q92WD7), UGPE_SALCH  (Q57IS2), 
UGPE_SALPA  (Q5PJL0), UGPE_SALTI  (Q8Z246), UGPE_SALTY  (Q8ZLF3), 
UGPE_SHIDS  (Q32AT5), UGPE_SHIF8  (Q0SZM1), UGPE_SHIFL  (Q83PU7), 
UGPE_YERE8  (A1JID9), UGPE_YERPA  (Q1CBH3), UGPE_YERPE  (Q7CKV5), 
UGPE_YERPN  (Q1CNC7), UGPE_YERPS  (Q66FU5), WTPB_ARCFU  (O30143), 
WTPB_METJA  (Q58763), WTPB_PYRAB  (Q9V2C1), WTPB_PYRFU  (Q8U4K4), 
WTPB_PYRHO  (O57893), WTPB_THEKO  (Q5JEB3), Y1031_BRUAB (Q8VQK4), 
Y1032_BRUAB (Q8VQK5), Y1038_PYRHO (O58759), Y1050_BRUA2 (Q2YJK1), 
Y1051_BRUA2 (Q2YJK0), Y1079_HAEIN (P45023), Y1092_BRUSU (Q8FUX0), 
Y1093_BRUSU (Q8FUW9), Y1215_PYRHO (O58968), Y1216_PYRHO (O58967), 
Y1282_MYCTO (P9WFZ8), Y1282_MYCTU (P9WFZ9), Y1283_MYCTO (P9WFZ6), 
Y1283_MYCTU (P9WFZ7), Y1313_MYCBO (P66965), Y1314_MYCBO (P66967), 
Y135_MYCPN  (P75263), Y136_MYCPN  (P75262), Y1475_HAEIN (Q57380), 
Y188_MYCGE  (P47434), Y189_MYCGE  (P47435), Y207_BRUME  (Q8YDG8), 
Y209_BRUME  (Q8YDG7), Y2550_BRUO2 (A5VU89), Y2551_BRUO2 (A5VU90), 
Y2783_BRUAB (Q578M9), Y2990_BRUA2 (Q2YL00), Y3094_BRUAB (Q577J7), 
Y3107_BRUME (Q8YDR8), Y3315_BRUA2 (Q2YK65), Y3407_BRUSU (Q8FWN9), 
Y3408_BRUSU (Q8FWN8), Y3424_BRUAB (Q576D9), Y355_HAEIN  (Q57306), 
Y3648_BRUA2 (Q2YJB4), Y3749_BRUSU (Q8FVS6), Y3860_BRUME (Q8YBN9), 
Y3861_BRUME (Q8YBN8), Y413_METJA  (Q57856), Y4188_BRUSU (Q8FUN2), 
Y4FN_RHISN  (P55452), Y4OQ_RHISN  (P55602), Y4OR_RHISN  (P55603), 
Y4TF_RHISN  (P55660), Y4TG_RHISN  (P55661), Y4TP_RHISN  (Q53191), 
Y4TQ_RHISN  (Q53192), YCJO_ECOLI  (P0AFR7), YCJO_SHIFL  (P0AFR8), 
YCJP_ECOLI  (P77716), YCKA_BACSU  (P42399), YDCU_ECOLI  (P77156), 
YDCV_ECOLI  (P0AFR9), YDCV_SHIFL  (P0AFS0), YECS_ECOL6  (P0AFT3), 
YECS_ECOLI  (P0AFT2), YECS_SHIFL  (P0AFT4), YEHW_ECOLI  (P33359), 
YEHY_ECOLI  (P33361), YEJB_ECO57  (P0AFU1), YEJB_ECOLI  (P0AFU0), 
YEJE_ECOLI  (P33915), YESP_BACSU  (O31519), YESQ_BACSU  (O31520), 
YHDX_ECOLI  (P45767), YHDY_ECOLI  (P45768), YJ16_PYRHO  (O58760), 
YNJC_ECOLI  (P76224), YOE1_STRAT  (Q53683), YOR1_CALSR  (P40979), 
YOR2_CALSR  (P40980), YQGH_BACSU  (P46339), YQGI_BACSU  (P46340), 
YTCP_BACSU  (P53561), YTEP_BACSU  (C0SPB3), YTLD_BACSU  (O34649), 
YURM_BACSU  (O32154), YURN_BACSU  (O32155), YVGM_BACSU  (O32209), 
YXEN_BACSU  (P54953)
» More

PDB
[Detailed view]
17 PDB

2ONK; 2R6G; 3DHW; 3FH6; 3PUV; 3PUW; 3PUX; 3PUY; 3PUZ; 3PV0; 3RLF; 3TUI; 3TUJ; 3TUZ; 4JBW; 4KHZ; 4KI0
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission