Entry: PS50933

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] CHRD
Accession [info] PS50933
Entry type [info] MATRIX
Date [info] OCT-2003 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50933
Associated ProRule [info] PRU00230

Name and characterization of the entry

Description [info] CHRD domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=125;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=125;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1507907; R2=0.0263320; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5822.51361; R2=16.48639; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=242; N_SCORE=8.5; H_SCORE=9482; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=112; N_SCORE=5.1000; H_SCORE=7603; MODE=1; TEXT='RR';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='S'; M= -2, -8,-15,-12, -7, -9, -9,-10,-13, -8,-13, -7, -2,-17, -5, -5,  3,  1,-10,-21, -6, -7;
/M: SY='S'; M= -2, -6,-11, -8,-10, -9,-12, -9,-13, -9,-13, -7, -5,-18,-10, -6,  4,  4, -4,-25, -7,-11;
/M: SY='E'; M= -2,  1,-20, -1, 12,-19,-17, -9,-16,  1,-12,-10,  0,-10,  5, -3,  6, 10,-13,-28,-13,  8;
/M: SY='H'; M= -6, -2,-22, -2,  3,-16,-20,  5,-10,-10, -7, -5, -2,-14,  1,-10,  1,  4,-10,-28, -6,  0;
/M: SY='F'; M=-15,-24,-22,-29,-19, 43,-27,-12,  1,-22, 12,  4,-19,-26,-22,-16,-17, -9, -2,  0, 22,-18;
/M: SY='A'; M=  5,-14,-18,-15,-11,-12, -9,-18, -6,-11,-11, -7,-10, -8,-10,-13,  4,  0,  1,-27,-15,-11;
/M: SY='A'; M= 38,-12,-11,-19,-12,-17, -5,-20, -5,-12, -9, -8,-10,-12,-11,-19, 10,  2,  5,-23,-18,-12;
/M: SY='L'; M= -6,-21,-23,-20, -9, -6,-25,-17,  7,-17, 17,  6,-20,-10, -9,-13,-15, -7,  1,-23, -8,-10;
/M: SY='L'; M=-11,-27,-14,-28,-19,  7,-29,-12, 14,-29, 42, 17,-27,-30,-18,-19,-28,-11,  6,-22,  0,-19;
/M: SY='T'; M=  0, -2,-16, -8, -4,-13,-13,-13,-15, -4,-15,-12, -1,-12, -5, -4, 14, 27, -7,-25, -7, -5;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='G'; M= 12, -7,-20, -9, -9,-22, 21,-14,-22,-10,-21,-15, -1, -3,-10,-11,  5, -7,-17,-21,-22,-10; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='E'; M= -4, -1,-24,  2, 12,-25, -5, -5,-21,  3,-19,-12, -2,  7, 10,  0,  0, -7,-20,-21,-16, 10; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='N'; M=  0,  1,-11, -1,  3, -8, -7, -4, -7, -2, -4, -5,  4, -8, -1, -1,  2,  2, -7,-16, -8,  1; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='V'; M= -1, -6, -3, -6,  0, -9,-12, -4, -4, -3, -4, -3, -6,-10, -4, -5, -2, -3,  1,-17, -7, -3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='T'; M= -2, -7,-13, -8, -4,-10,-13,-11, -4, -5, -7, -2, -6,  0, -5, -7,  3,  7,  0,-21,-10, -5; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='D'; M= -7,  6,-23, 12,  6,-20, -8,  0,-19, -4,-18,-13, -1, 12,  0, -9, -3, -8,-19,-19, -9,  1; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='P'; M= -1,-13,-20,-11, -7,-15,-15,-17, -6,-10,-14, -9,-13, 27,-11,-14,  0,  3, -4,-24,-17,-11; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='W'; M= -5, -6,-20, -5, -6,-12,-15, -6,-10, -7,-11, -8, -8,-10, -2, -9, -4,  0, -7,  2, -3, -4; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='N'; M= -9,  2,-25, -1,  2,-19,-10,  7,-19,  0,-17, -9,  9,-12,  8,  3,  0, -6,-21,-25, -7,  3;
/M: SY='T'; M= -1,  0,-21, -1,  0,-21, -9,-13,-18, -8,-19,-15,  1,  7, -4,-12, 10, 13,-15,-31,-18, -3;
/M: SY='G'; M= -5, -8,-28, -7, -5,-27, 19, -9,-28, -6,-25,-14, -3, -5, -4, -6, -1,-10,-22,-24,-20, -6;
/M: SY='A'; M= 20, -7,-16,-12, -8,-22, 10,-16,-18, -8,-19,-13, -3,-13, -6,-13, 12,  1, -9,-25,-20, -7;
/M: SY='S'; M=  1,-10,-17,-12,-14,-12,  4,-17, -9,-12,-16,-10, -3,-20,-14,-13,  9,  1,  2,-29,-16,-14;
/M: SY='G'; M=  3,-12,-27,-12,-20,-24, 54,-19,-32,-19,-25,-17, -3,-20,-19,-19, -1,-17,-22,-18,-22,-20;
/M: SY='V'; M=  0,-13,-16,-14,-13, -8,-19,-12,  4,-14,  2,  4,-12,-20,-12,-12, -1,  2, 10,-29, -9,-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='A'; M= 42,-12,-10,-21,-13,-17, -5,-21, -5,-11, -7, -7,-12,-13,-13,-20,  8,  2,  6,-22,-18,-13;
/M: SY='W'; M= -8,-16,-27,-18, -6,-10,-21,-14, -6,  1, -6,  2,-15,-18, -4,  3,-14, -8, -5,  5, -3, -6;
/M: SY='L'; M=  5,-24,-15,-29,-21,  9,-22,-20, 12,-21, 17, 12,-23,-24,-20,-19,-13, -5, 15,-18, -3,-20;
/M: SY='T'; M= -4, -2,-19, -7, -3,-13,-16, -2,-15, -2,-16,-10,  3,-14, -1,  6,  9, 13,-10,-25, -5, -4;
/M: SY='F'; M=-13,-28,-19,-34,-25, 38,-30,-21, 12,-28, 26,  9,-24,-28,-28,-20,-21, -6,  8, -8, 12,-25;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='S'; M= -1,  0,-12, -2, -5,-10, -4, -9, -7,-10, -8, -7,  3,-11, -6, -9,  8,  8, -5,-22,-10, -6; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='D'; M=-13,  8,-23,  9, -4,-12,-12,  1,-15, -9, -6, -8,  5,-19, -8, -6, -7, -6,-12,-27, -8, -6; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='E'; M= -4,  3,-21,  1,  5,-21,-14, -1,-17,  1,-16,-10,  5, -8,  5,  0,  5,  4,-15,-28,-13,  4; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='R'; M=-10,  6,-26,  7,  6,-17,-11, -1,-25,  5,-17,-13,  6,-15,  0, 11, -3, -6,-20,-25,-11,  2;
/M: SY='N'; M= -5,  6, -9,  5, -4,-25,  5,-11,-29, -2,-27,-19,  8,-16, -6, -3,  8,  0,-20,-32,-20, -5;
/M: SY='N'; M= -4, 12,-17,  4, -2,-17, -8,  2,-19, -1,-24,-16, 23,-15, -1,  1, 16, 11,-17,-33,-11, -2;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-21,-31,-22,  8,-31,-21, 24,-28, 42, 22,-28,-28,-19,-21,-27, -9, 15,-21, -1,-21;
/M: SY='H'; M= -8, -1,-23, -3, -2,-14,-17, 32,-16, -9,-12, -5,  3,-18,  0, -4, -2, -6,-14,-27,  4, -4;
/M: SY='F'; M=-18,-27,-25,-31,-25, 46,-29, -5,  2,-21,  6,  1,-22,-30,-25,-16,-21,-11, -2, 23, 46,-25;
/M: SY='S'; M=  3, -2,-20, -5,  5,-22,-12, -7,-12, -4,-16, -9,  3,-12, 10, -4, 11,  4,-12,-29,-14,  7;
/M: SY='I'; M= -6,-28,-19,-32,-26,  5,-31,-26, 29,-25, 20, 13,-24,-26,-23,-22,-15, -5, 29,-23, -3,-26;
/M: SY='T'; M= -7,-13,-20,-16, -7, -3,-24, -8,  2,-12,  1,  3,-10,-18, -8, -9, -3,  5,  2,-22, -1, -9;
/M: SY='Y'; M=-10,-20,-22,-23,-17, 11,-25, -1,  0,-17,  6,  2,-17,-24,-13,-13,-13, -3,  0, -3, 15,-15;
/M: SY='R'; M= -3,  0,-23, -2,  7,-23,-13, -5,-21, 10,-22,-13,  5, -8,  8, 15,  4, -3,-17,-28,-16,  6;
/M: SY='G'; M= -7, -6,-29, -8,-14,-21, 31, -4,-31,-10,-26,-16,  4,-21,-10, -4, -2,-14,-26,-12,-12,-13;
/M: SY='L'; M= -6,-24,-18,-27,-21,  1,-28,-22, 19,-21, 22, 11,-22,-25,-19,-15,-14,  0, 19,-24, -5,-21;
/M: SY='S'; M= -3, -2,-23, -3, -6,-13,  0,-13,-17,-13,-16,-14,  2,-12, -9,-14,  4, -4,-15,-17,-13, -7;
/M: SY='R'; M= -4, -5,-25, -5,  1,-24,  3,-11,-28,  8,-25,-15,  0, -7, -1, 12,  3, -3,-20,-25,-18, -1;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='P'; M= -2, -7,-22, -4,  8,-20,-14, -7,-14,  2,-15, -9, -7, 15,  6,  2, -3, -6,-15,-20,-15,  5; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='D'; M= -4,  5,-15,  9,  7,-15, -8, -7,-11, -2,-10, -9, -1, -9, -3, -4,  0, -2, -5,-20,-11,  2; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='P'; M=  2, -9,-19, -8, -1,-17,-11,-11,-10, -6,-12, -8, -9, 25, -1,-10,  0, -1,-12,-19,-15, -3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='V'; M= -2,-13,-13,-16,-13, -5,-18,-17,  7,-13,  3,  1,-10,-16,-12, -9,  2,  9, 11,-24, -8,-13; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='R'; M= -5,-14,-22,-14, -8,-12,-13, -4, -9, -5, -3,  0, -9,-10, -5,  6, -5, -5, -7,-24, -9, -8; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='I'; M=  0,-27,-20,-30,-23, -2,-29,-26, 25,-23, 18, 11,-25,-17,-21,-23,-15, -6, 24,-24, -7,-24;
/M: SY='Q'; M= -9, -1,-25, -3,  5,-21,-16, 11,-21,  7,-18, -7,  4,-15, 15, 15,  0, -4,-20,-23, -4,  8;
/M: SY='F'; M=-13,-29,-22,-36,-26, 27,-32,-22, 23,-29, 27, 16,-24,-27,-25,-22,-23,-10, 14,-12,  8,-25;
/M: SY='H'; M= -7, -5,-22, -4,  7,-13,-20, 11,-12, -7,-10, -6, -4,-15,  4, -6,  1,  0,-10,-24,  1,  4;
/M: SY='D'; M= -8,  1,-25,  5, -5,-18, -6, -8,-11,-14, -1, -3, -4,-18, -7,-15, -9, -9,-11,-26,-12, -7;
/M: SY='P'; M= -2, -8,-26, -6,  2,-21,-14,-15,-13, -2,-13, -9, -9,  6, -3, -8, -5, -5,-12,-26,-16, -2;
/M: SY='E'; M=  3,  3,-24,  4, 10,-21,-10,  1,-20, -5,-16,-14,  1, -2,  0,-10,  1, -5,-18,-26,-11,  3;
/M: SY='E'; M= -9,  4,-28,  5, 13,-29,  2, -5,-30,  8,-24,-15,  4,-12,  9,  9, -1, -9,-26,-25,-18, 10;
/M: SY='N'; M= -6,  0,-24, -3, -2,-22, -6, -8,-19,  2,-21,-11,  7, -5,  2,  3,  3, -1,-17,-28,-17, -1;
/M:         M= -6,-12,-24,-15,-10,-16, -5,-14, -5, -8, -8, -3, -7,-17, -8, -8, -5, -2, -3,-24,-12,-11;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='L'; M= -7, -7,-21,-10, -3,-10,-20,-11, -2, -2,  4,  0, -4,-19, -6,  0,-11, -6, -3,-24, -9, -5; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='F'; M= -7,-11,-21,-15, -9,  5,-13, -9, -6, -7, -5, -2, -5,-18, -9, -2, -5, -5, -6,-14,  1,-10; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='R'; M= -5, -7,-21, -7,  3,-11, -7, -8,-16,  4,-11, -8, -4,-13, -1, 11, -4, -7,-12,-17,-10,  0; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='H'; M= -4,  5,-18,  3,  1,-16, -7, 15,-15, -6,-15, -8,  9,-14, -2, -6,  2, -3,-11,-26, -7, -2; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='E'; M= -4, -9,-20, -8,  3,-15,-17, -9, -6,  2, -6, -3, -9, -1,  3,  0, -7, -6, -6,-18,-10,  2; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='L'; M= -7,-18,-19,-18,-13, -2,-17,-13, 10,-16, 12,  6,-15, -7,-10,-14,-14, -7,  4,-14, -2,-13; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='D'; M= -5,  4,-20,  7,  5,-14, -8,  0,-18, -1,-14,-11,  0,-12,  1,  1, -1, -6,-13,-19, -6,  2; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='T'; M= -5, -1,-19, -2, -2, -9,-20,-14, -5, -9, -5, -7, -3,-17, -9,-11, -1,  5,  0,-28,-10, -6;
/M: SY='H'; M=-10,-14,-21,-17,-11, -1,-22,  6, -4,-12,  4,  5, -9,-21, -5, -3, -8, -2, -4,-22,  1, -9;
/M: SY='K'; M= -1, -6,-23, -7,  1,-22,-12,-12,-19,  8,-21,-12, -2, -3,  0,  8,  5,  3,-13,-26,-15, -1;
/M: SY='P'; M=  3,-17,-23,-18,-10,-15,-18,-16, -3, -9, -3, -1,-15,  5, -8, -7, -8, -6, -3,-25,-15,-10;
/M: SY='T'; M= -5,-15,-20,-17,-12, -6,-16,-14, -2,-12, -4, -1,-12,-10, -8,-10, -1,  2,  0,-23, -6,-11;
/M: SY='E'; M= -6, -2,-24, -1, 17,-10,-18,  1,-18, -4,-14,-11, -1, -8,  6, -6,  1, -4,-19,-22, -6, 11;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='K'; M= -3,  6,-22,  3,  7,-22,-12, -5,-19,  8,-19,-11,  8, -1,  4,  3,  1, -1,-18,-25,-15,  5; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='G'; M=  0, -5,-19, -6, -5,-13, 10,-10,-16, -4,-13, -8, -2,-11, -5, -5, -2, -9,-12,-14,-12, -5; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='D'; M= -7,  4,-15,  5, -3, -9, -4, -1,-12, -7,-10, -7,  2,-12, -4, -7, -2, -3, -7,-18, -6, -4; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='N'; M= -4,  4,-16,  5,  2,-17, -1,  1,-16, -6,-14,-10,  6, -6,  0, -6,  5,  0,-14,-23,-11,  1; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='Q'; M= -8,  0,-24,  0, -1,-19, -5, -6,-16, -3,-12, -4,  0,-17,  3, -3, -3, -6,-14,-24,-10,  0;
/M: SY='V'; M=  2,-23,-19,-28,-21,  9,-23,-16,  9,-22,  8,  4,-19,-23,-20,-20,-11, -6, 10,-10,  1,-20;
/M: SY='C'; M=  1,-13, 18,-16, -4,-19,-23,-17,-11,-11, -7, -7,-14,-21, -5,-14, -7, -8, -6,-31,-17, -5;
/M: SY='G'; M= -3, -3,-29, -2, -3,-29, 45,-14,-36,-10,-28,-20,  4,-16,-10,-13,  0,-16,-30,-23,-27, -7;
/M: SY='V'; M= -5,-18,-19,-18,-10, -4,-23,-18,  7,-13,  2,  3,-16,-15,-13,-11, -4, -2, 12,-27, -9,-12;
/M: SY='W'; M=-10,-29,-14,-31,-25,  9,-19,-25, -2,-24,  3, -4,-27,-29,-24,-20,-21,-13, -1, 26,  4,-23;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='R'; M= -9,-11,-29, -9, -1,-20, -7,-12,-23,  9,-20,-12, -7, -8, -2, 14, -6, -9,-17,-13,-13, -3;
/M: SY='B'; M= -8, 15,-24, 14,  7,-26,-11, -4,-26,  9,-26,-18, 15, -7,  2,  7,  5,  1,-21,-32,-17,  4;
/M: SY='L'; M=  1,-24,-16,-27,-21,  0,-25,-22, 17,-22, 22, 12,-23,-25,-19,-19,-13, -1, 20,-24, -7,-20;
/M: SY='P'; M= -1,  0,-23, -1,  0,-20, -6,-11,-20, -8,-24,-17,  4, 11, -4,-12, 10,  4,-19,-30,-19, -3;
/M: SY='R'; M=  3, -9,-21,-12, -6,-17,-15,-13,-11,  3,-13, -8, -4, -9, -4,  6,  1, -2, -5,-26,-14, -7;
/M: SY='E'; M= -7,  3,-26,  5,  9,-24,-16,  4,-22,  6,-16,-10,  2, -9,  8,  7, -3, -8,-20,-27,-12,  7;
/M: SY='E'; M= -9,  0,-23, -1,  7,-15,-19,  4, -9, -6, -8, -3,  1,-15,  3, -7, -2, -3,-11,-26, -5,  4;
/M: SY='L'; M= -5,-23,-20,-26,-17, -1,-26,-17, 15,-18, 25, 18,-22,-23,-11,-15,-19, -6, 10,-21, -4,-14;
/M: SY='R'; M=-15, -5,-29, -4,  6,-22,-22, 17,-20,  8,-12, -3, -1,-17, 15, 21,-10,-12,-19,-23, -4,  7;
/M: SY='M'; M= -5,-14,-25,-16, -5,-11,-18, -8, -6, -7, -3,  2,-12,-18,  1, -7, -7, -7, -9, -4, -3, -2;
/M: SY='L'; M= -9,-28,-20,-29,-20,  8,-29,-19, 20,-28, 43, 21,-27,-28,-18,-19,-26, -6, 10,-21, -1,-19;
/M: SY='R'; M= -4, -7,-23, -9, -4,-12,-12, -8, -9, -4, -4, -2, -6,-18, -5,  2, -6, -7, -7,-21, -6, -6;
/M: SY='Q'; M=  1, -1,-24,  0,  6,-26,-14, -5,-16,  3,-14, -3, -4, -6, 14,  0, -1, -6,-16,-24,-14, 10;
/M: SY='G'; M= -2,  6,-27,  7, -4,-30, 37,-12,-35,-12,-28,-21,  9,-16,-10,-15,  3,-13,-28,-27,-26, -7;
/M: SY='E'; M= -6,  0,-25,  0, 15,-23,-18,  6,-19,  6,-15, -8,  1,-12, 13,  4,  0, -5,-18,-27,-11, 14;
/M: SY='L'; M= -8,-29,-14,-31,-23, 10,-29,-23, 15,-27, 32, 12,-28,-29,-22,-21,-25,-10, 11,-10,  0,-22;
/M: SY='Y'; M=-13,-15,-27,-17,-11,  7,-18, 12, -9,-10, -2, -1,-10,-23, -6, -2,-14,-12,-11, -7, 19,-11;
/M: SY='V'; M= -3,-28,-17,-31,-25,  7,-29,-24, 25,-24, 23, 15,-27,-27,-24,-21,-17, -5, 27,-22, -3,-25;
/M: SY='N'; M=  0,  6,-17, -1, -3,-17,-10, -6,-10, -4,-17, -8, 15,-17, -2, -4,  9,  4, -7,-33,-16, -3;
/M: SY='L'; M= -2,-27,-17,-29,-23,  3,-27,-19, 21,-21, 23, 17,-26,-27,-20,-19,-17, -6, 23,-21,  0,-22;
/M: SY='H'; M=  0, -4,-21, -4,  5,-19,-17, 12,-13, -7,-10, -5, -4,-14,  3, -8,  0, -2, -9,-28, -7,  3;
/M: SY='T'; M=  2, -6,-15,-14,-12, -9,-18,-20, -9,-12,-12,-11, -5,-12,-10,-13, 14, 33, -2,-12, -7,-11;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='K'; M=  3, -3,-22, -5,  4,-25, -9, -9,-22, 18,-21,-10, -2,-10,  8, 13,  0, -4,-15,-20,-13,  6; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='Q'; M=  4,  3,-22,  1,  4,-26, -3, -3,-21, -2,-18,-11,  2,-12,  7, -6,  4, -2,-18,-26,-15,  5;
/M: SY='H'; M=-12, -4,-27, -7, -3,-13,-12, 19,-20, -4,-16, -6,  3,-19,  9,  4, -4,-10,-22,-13,  3,  2;
/M: SY='P'; M= -5,-10,-31, -7,  5,-26,-17, -8,-24,  8,-25,-15, -8, 28,  0,  8, -5, -8,-22,-26,-19, -1;
/M: SY='E'; M= -9,  2,-28,  5, 10,-28, -3, -1,-29,  3,-24,-15,  2, -5,  7,  6,  1, -6,-24,-27,-16,  7;
/M: SY='G'; M= -4,-11,-19,-11,-11,-20, 21,-16,-22,-16,-12,-11, -4,-16,-12,-13, -4,-12,-19,-25,-21,-12;
/M: SY='E'; M= -4,  1,-26,  7, 27,-24,-17, -6,-21,  3,-12,-13, -4, -4,  9,  1, -2, -8,-20,-27,-17, 17;
/M: SY='I'; M= -8,-26,-23,-30,-22,  0,-31,-22, 28,-21, 21, 18,-21,-23,-17,-19,-18, -7, 20,-22, -3,-21;
/M: SY='R'; M= -8, -4,-25, -5,  4,-23,-14,  3,-24, 11,-22,-11,  3,-16, 14, 28,  2, -5,-20,-19,-10,  7;
/M: SY='G'; M= -2, -7,-30, -6,-17,-30, 60,-18,-39,-16,-29,-20,  1,-19,-17,-14, -1,-19,-29,-21,-28,-17;
/M: SY='R'; M=-14, -5,-29, -7,  1,-18,-20, 10,-21, 11,-19, -6,  0,-12, 13, 15, -8,-10,-21,-14, -2,  6;
/M: SY='I'; M= -3,-29,-19,-33,-27,  1,-32,-27, 33,-25, 21, 15,-25,-25,-23,-24,-17, -6, 32,-24, -5,-27;
/M: SY='V'; M=  0,-17,-20,-20,-15,-10,-17, -8,  3,-11,  2,  2,-13,-21,-12, -8, -8, -4,  6,-24, -7,-15;
/M: SY='K'; M= -3, -7,-24, -9, -4,-16,-16,-12,-14,  9,-17, -9, -3, -8, -3,  4, -1, -1,-11,-17, -7, -4;
/M: SY='R'; M= -9,-16,-24,-18,-11, -9,-24,  3, -3, -5, -1,  2,-12,-17, -5,  6,-11, -6,  0,-21,  0,-11;
/M: SY='K'; M= -5, -5,-25, -7, -1,-22,-14,-13,-20, 11,-20,-11, -2,  3, -2,  9, -1,  3,-16,-25,-15, -3;
/M: SY='A'; M=  8,-12,-17,-15,-11,-11,-11,-11, -7, -6,-11, -7, -9,-18, -6, -8,  5,  3,  1,-19, -2, -9;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 24 in 6 different sequences
Number of true positive hits 24 in 6 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 4
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] CHRD
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
6 sequences

CHRD_DANRE  (O57472), CHRD_HUMAN  (Q9H2X0), CHRD_MOUSE  (Q9Z0E2), 
CHRD_RAT    (Q63148), CHRD_XENLA  (Q91713), SOG_DROME   (Q24025)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission