Due to maintenance work, this service will be unavailable from
Mon Nov 11 17:30 until
Tue Nov 12 09:00
CET.
Apologies for the inconvenience.
PROSITE entry PS50933
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | CHRD |
| Accession [info] | PS50933 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-OCT-2003 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50933 |
| Associated ProRule [info] | PRU00230 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | CHRD domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=125; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=125; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1507907; R2=0.0263320; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=242; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=113; N_SCORE=5.1000; MODE=1; TEXT='RR'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='S'; M= -2, -8,-15,-12, -7, -9, -9,-10,-13, -8,-13, -7, -2,-17, -5, -5, 3, 1,-10,-21, -6, -7; /M: SY='S'; M= -2, -6,-11, -8,-10, -9,-12, -9,-13, -9,-13, -7, -5,-18,-10, -6, 4, 4, -4,-25, -7,-11; /M: SY='E'; M= -2, 1,-20, -1, 12,-19,-17, -9,-16, 1,-12,-10, 0,-10, 5, -3, 6, 10,-13,-28,-13, 8; /M: SY='H'; M= -6, -2,-22, -2, 3,-16,-20, 5,-10,-10, -7, -5, -2,-14, 1,-10, 1, 4,-10,-28, -6, 0; /M: SY='F'; M=-15,-24,-22,-29,-19, 43,-27,-12, 1,-22, 12, 4,-19,-26,-22,-16,-17, -9, -2, 0, 22,-18; /M: SY='A'; M= 5,-14,-18,-15,-11,-12, -9,-18, -6,-11,-11, -7,-10, -8,-10,-13, 4, 0, 1,-27,-15,-11; /M: SY='A'; M= 38,-12,-11,-19,-12,-17, -5,-20, -5,-12, -9, -8,-10,-12,-11,-19, 10, 2, 5,-23,-18,-12; /M: SY='L'; M= -6,-21,-23,-20, -9, -6,-25,-17, 7,-17, 17, 6,-20,-10, -9,-13,-15, -7, 1,-23, -8,-10; /M: SY='L'; M=-11,-27,-14,-28,-19, 7,-29,-12, 14,-29, 42, 17,-27,-30,-18,-19,-28,-11, 6,-22, 0,-19; /M: SY='T'; M= 0, -2,-16, -8, -4,-13,-13,-13,-15, -4,-15,-12, -1,-12, -5, -4, 14, 27, -7,-25, -7, -5; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='G'; M= 12, -7,-20, -9, -9,-22, 21,-14,-22,-10,-21,-15, -1, -3,-10,-11, 5, -7,-17,-21,-22,-10; D=-6; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='E'; M= -4, -1,-24, 2, 12,-25, -5, -5,-21, 3,-19,-12, -2, 7, 10, 0, 0, -7,-20,-21,-16, 10; D=-6; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='N'; M= 0, 1,-11, -1, 3, -8, -7, -4, -7, -2, -4, -5, 4, -8, -1, -1, 2, 2, -7,-16, -8, 1; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='V'; M= -1, -6, -3, -6, 0, -9,-12, -4, -4, -3, -4, -3, -6,-10, -4, -5, -2, -3, 1,-17, -7, -3; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='T'; M= -2, -7,-13, -8, -4,-10,-13,-11, -4, -5, -7, -2, -6, 0, -5, -7, 3, 7, 0,-21,-10, -5; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='D'; M= -7, 6,-23, 12, 6,-20, -8, 0,-19, -4,-18,-13, -1, 12, 0, -9, -3, -8,-19,-19, -9, 1; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='P'; M= -1,-13,-20,-11, -7,-15,-15,-17, -6,-10,-14, -9,-13, 27,-11,-14, 0, 3, -4,-24,-17,-11; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='W'; M= -5, -6,-20, -5, -6,-12,-15, -6,-10, -7,-11, -8, -8,-10, -2, -9, -4, 0, -7, 2, -3, -4; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='N'; M= -9, 2,-25, -1, 2,-19,-10, 7,-19, 0,-17, -9, 9,-12, 8, 3, 0, -6,-21,-25, -7, 3; /M: SY='T'; M= -1, 0,-21, -1, 0,-21, -9,-13,-18, -8,-19,-15, 1, 7, -4,-12, 10, 13,-15,-31,-18, -3; /M: SY='G'; M= -5, -8,-28, -7, -5,-27, 19, -9,-28, -6,-25,-14, -3, -5, -4, -6, -1,-10,-22,-24,-20, -6; /M: SY='A'; M= 20, -7,-16,-12, -8,-22, 10,-16,-18, -8,-19,-13, -3,-13, -6,-13, 12, 1, -9,-25,-20, -7; /M: SY='S'; M= 1,-10,-17,-12,-14,-12, 4,-17, -9,-12,-16,-10, -3,-20,-14,-13, 9, 1, 2,-29,-16,-14; /M: SY='G'; M= 3,-12,-27,-12,-20,-24, 54,-19,-32,-19,-25,-17, -3,-20,-19,-19, -1,-17,-22,-18,-22,-20; /M: SY='V'; M= 0,-13,-16,-14,-13, -8,-19,-12, 4,-14, 2, 4,-12,-20,-12,-12, -1, 2, 10,-29, -9,-13; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='A'; M= 42,-12,-10,-21,-13,-17, -5,-21, -5,-11, -7, -7,-12,-13,-13,-20, 8, 2, 6,-22,-18,-13; /M: SY='W'; M= -8,-16,-27,-18, -6,-10,-21,-14, -6, 1, -6, 2,-15,-18, -4, 3,-14, -8, -5, 5, -3, -6; /M: SY='L'; M= 5,-24,-15,-29,-21, 9,-22,-20, 12,-21, 17, 12,-23,-24,-20,-19,-13, -5, 15,-18, -3,-20; /M: SY='T'; M= -4, -2,-19, -7, -3,-13,-16, -2,-15, -2,-16,-10, 3,-14, -1, 6, 9, 13,-10,-25, -5, -4; /M: SY='F'; M=-13,-28,-19,-34,-25, 38,-30,-21, 12,-28, 26, 9,-24,-28,-28,-20,-21, -6, 8, -8, 12,-25; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='S'; M= -1, 0,-12, -2, -5,-10, -4, -9, -7,-10, -8, -7, 3,-11, -6, -9, 8, 8, -5,-22,-10, -6; D=-12; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='D'; M=-13, 8,-23, 9, -4,-12,-12, 1,-15, -9, -6, -8, 5,-19, -8, -6, -7, -6,-12,-27, -8, -6; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='E'; M= -4, 3,-21, 1, 5,-21,-14, -1,-17, 1,-16,-10, 5, -8, 5, 0, 5, 4,-15,-28,-13, 4; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='R'; M=-10, 6,-26, 7, 6,-17,-11, -1,-25, 5,-17,-13, 6,-15, 0, 11, -3, -6,-20,-25,-11, 2; /M: SY='N'; M= -5, 6, -9, 5, -4,-25, 5,-11,-29, -2,-27,-19, 8,-16, -6, -3, 8, 0,-20,-32,-20, -5; /M: SY='N'; M= -4, 12,-17, 4, -2,-17, -8, 2,-19, -1,-24,-16, 23,-15, -1, 1, 16, 11,-17,-33,-11, -2; /M: SY='L'; M= -9,-29,-21,-31,-22, 8,-31,-21, 24,-28, 42, 22,-28,-28,-19,-21,-27, -9, 15,-21, -1,-21; /M: SY='H'; M= -8, -1,-23, -3, -2,-14,-17, 32,-16, -9,-12, -5, 3,-18, 0, -4, -2, -6,-14,-27, 4, -4; /M: SY='F'; M=-18,-27,-25,-31,-25, 46,-29, -5, 2,-21, 6, 1,-22,-30,-25,-16,-21,-11, -2, 23, 46,-25; /M: SY='S'; M= 3, -2,-20, -5, 5,-22,-12, -7,-12, -4,-16, -9, 3,-12, 10, -4, 11, 4,-12,-29,-14, 7; /M: SY='I'; M= -6,-28,-19,-32,-26, 5,-31,-26, 29,-25, 20, 13,-24,-26,-23,-22,-15, -5, 29,-23, -3,-26; /M: SY='T'; M= -7,-13,-20,-16, -7, -3,-24, -8, 2,-12, 1, 3,-10,-18, -8, -9, -3, 5, 2,-22, -1, -9; /M: SY='Y'; M=-10,-20,-22,-23,-17, 11,-25, -1, 0,-17, 6, 2,-17,-24,-13,-13,-13, -3, 0, -3, 15,-15; /M: SY='R'; M= -3, 0,-23, -2, 7,-23,-13, -5,-21, 10,-22,-13, 5, -8, 8, 15, 4, -3,-17,-28,-16, 6; /M: SY='G'; M= -7, -6,-29, -8,-14,-21, 31, -4,-31,-10,-26,-16, 4,-21,-10, -4, -2,-14,-26,-12,-12,-13; /M: SY='L'; M= -6,-24,-18,-27,-21, 1,-28,-22, 19,-21, 22, 11,-22,-25,-19,-15,-14, 0, 19,-24, -5,-21; /M: SY='S'; M= -3, -2,-23, -3, -6,-13, 0,-13,-17,-13,-16,-14, 2,-12, -9,-14, 4, -4,-15,-17,-13, -7; /M: SY='R'; M= -4, -5,-25, -5, 1,-24, 3,-11,-28, 8,-25,-15, 0, -7, -1, 12, 3, -3,-20,-25,-18, -1; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='P'; M= -2, -7,-22, -4, 8,-20,-14, -7,-14, 2,-15, -9, -7, 15, 6, 2, -3, -6,-15,-20,-15, 5; D=-6; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='D'; M= -4, 5,-15, 9, 7,-15, -8, -7,-11, -2,-10, -9, -1, -9, -3, -4, 0, -2, -5,-20,-11, 2; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='P'; M= 2, -9,-19, -8, -1,-17,-11,-11,-10, -6,-12, -8, -9, 25, -1,-10, 0, -1,-12,-19,-15, -3; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='V'; M= -2,-13,-13,-16,-13, -5,-18,-17, 7,-13, 3, 1,-10,-16,-12, -9, 2, 9, 11,-24, -8,-13; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='R'; M= -5,-14,-22,-14, -8,-12,-13, -4, -9, -5, -3, 0, -9,-10, -5, 6, -5, -5, -7,-24, -9, -8; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='I'; M= 0,-27,-20,-30,-23, -2,-29,-26, 25,-23, 18, 11,-25,-17,-21,-23,-15, -6, 24,-24, -7,-24; /M: SY='Q'; M= -9, -1,-25, -3, 5,-21,-16, 11,-21, 7,-18, -7, 4,-15, 15, 15, 0, -4,-20,-23, -4, 8; /M: SY='F'; M=-13,-29,-22,-36,-26, 27,-32,-22, 23,-29, 27, 16,-24,-27,-25,-22,-23,-10, 14,-12, 8,-25; /M: SY='H'; M= -7, -5,-22, -4, 7,-13,-20, 11,-12, -7,-10, -6, -4,-15, 4, -6, 1, 0,-10,-24, 1, 4; /M: SY='D'; M= -8, 1,-25, 5, -5,-18, -6, -8,-11,-14, -1, -3, -4,-18, -7,-15, -9, -9,-11,-26,-12, -7; /M: SY='P'; M= -2, -8,-26, -6, 2,-21,-14,-15,-13, -2,-13, -9, -9, 6, -3, -8, -5, -5,-12,-26,-16, -2; /M: SY='E'; M= 3, 3,-24, 4, 10,-21,-10, 1,-20, -5,-16,-14, 1, -2, 0,-10, 1, -5,-18,-26,-11, 3; /M: SY='E'; M= -9, 4,-28, 5, 13,-29, 2, -5,-30, 8,-24,-15, 4,-12, 9, 9, -1, -9,-26,-25,-18, 10; /M: SY='N'; M= -6, 0,-24, -3, -2,-22, -6, -8,-19, 2,-21,-11, 7, -5, 2, 3, 3, -1,-17,-28,-17, -1; /M: M= -6,-12,-24,-15,-10,-16, -5,-14, -5, -8, -8, -3, -7,-17, -8, -8, -5, -2, -3,-24,-12,-11; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='L'; M= -7, -7,-21,-10, -3,-10,-20,-11, -2, -2, 4, 0, -4,-19, -6, 0,-11, -6, -3,-24, -9, -5; D=-8; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='F'; M= -7,-11,-21,-15, -9, 5,-13, -9, -6, -7, -5, -2, -5,-18, -9, -2, -5, -5, -6,-14, 1,-10; D=-8; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='R'; M= -5, -7,-21, -7, 3,-11, -7, -8,-16, 4,-11, -8, -4,-13, -1, 11, -4, -7,-12,-17,-10, 0; D=-8; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='H'; M= -4, 5,-18, 3, 1,-16, -7, 15,-15, -6,-15, -8, 9,-14, -2, -6, 2, -3,-11,-26, -7, -2; D=-8; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='E'; M= -4, -9,-20, -8, 3,-15,-17, -9, -6, 2, -6, -3, -9, -1, 3, 0, -7, -6, -6,-18,-10, 2; D=-8; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='L'; M= -7,-18,-19,-18,-13, -2,-17,-13, 10,-16, 12, 6,-15, -7,-10,-14,-14, -7, 4,-14, -2,-13; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='D'; M= -5, 4,-20, 7, 5,-14, -8, 0,-18, -1,-14,-11, 0,-12, 1, 1, -1, -6,-13,-19, -6, 2; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='T'; M= -5, -1,-19, -2, -2, -9,-20,-14, -5, -9, -5, -7, -3,-17, -9,-11, -1, 5, 0,-28,-10, -6; /M: SY='H'; M=-10,-14,-21,-17,-11, -1,-22, 6, -4,-12, 4, 5, -9,-21, -5, -3, -8, -2, -4,-22, 1, -9; /M: SY='K'; M= -1, -6,-23, -7, 1,-22,-12,-12,-19, 8,-21,-12, -2, -3, 0, 8, 5, 3,-13,-26,-15, -1; /M: SY='P'; M= 3,-17,-23,-18,-10,-15,-18,-16, -3, -9, -3, -1,-15, 5, -8, -7, -8, -6, -3,-25,-15,-10; /M: SY='T'; M= -5,-15,-20,-17,-12, -6,-16,-14, -2,-12, -4, -1,-12,-10, -8,-10, -1, 2, 0,-23, -6,-11; /M: SY='E'; M= -6, -2,-24, -1, 17,-10,-18, 1,-18, -4,-14,-11, -1, -8, 6, -6, 1, -4,-19,-22, -6, 11; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='K'; M= -3, 6,-22, 3, 7,-22,-12, -5,-19, 8,-19,-11, 8, -1, 4, 3, 1, -1,-18,-25,-15, 5; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='G'; M= 0, -5,-19, -6, -5,-13, 10,-10,-16, -4,-13, -8, -2,-11, -5, -5, -2, -9,-12,-14,-12, -5; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='D'; M= -7, 4,-15, 5, -3, -9, -4, -1,-12, -7,-10, -7, 2,-12, -4, -7, -2, -3, -7,-18, -6, -4; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='N'; M= -4, 4,-16, 5, 2,-17, -1, 1,-16, -6,-14,-10, 6, -6, 0, -6, 5, 0,-14,-23,-11, 1; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='Q'; M= -8, 0,-24, 0, -1,-19, -5, -6,-16, -3,-12, -4, 0,-17, 3, -3, -3, -6,-14,-24,-10, 0; /M: SY='V'; M= 2,-23,-19,-28,-21, 9,-23,-16, 9,-22, 8, 4,-19,-23,-20,-20,-11, -6, 10,-10, 1,-20; /M: SY='C'; M= 1,-13, 18,-16, -4,-19,-23,-17,-11,-11, -7, -7,-14,-21, -5,-14, -7, -8, -6,-31,-17, -5; /M: SY='G'; M= -3, -3,-29, -2, -3,-29, 45,-14,-36,-10,-28,-20, 4,-16,-10,-13, 0,-16,-30,-23,-27, -7; /M: SY='V'; M= -5,-18,-19,-18,-10, -4,-23,-18, 7,-13, 2, 3,-16,-15,-13,-11, -4, -2, 12,-27, -9,-12; /M: SY='W'; M=-10,-29,-14,-31,-25, 9,-19,-25, -2,-24, 3, -4,-27,-29,-24,-20,-21,-13, -1, 26, 4,-23; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='R'; M= -9,-11,-29, -9, -1,-20, -7,-12,-23, 9,-20,-12, -7, -8, -2, 14, -6, -9,-17,-13,-13, -3; /M: SY='B'; M= -8, 15,-24, 14, 7,-26,-11, -4,-26, 9,-26,-18, 15, -7, 2, 7, 5, 1,-21,-32,-17, 4; /M: SY='L'; M= 1,-24,-16,-27,-21, 0,-25,-22, 17,-22, 22, 12,-23,-25,-19,-19,-13, -1, 20,-24, -7,-20; /M: SY='P'; M= -1, 0,-23, -1, 0,-20, -6,-11,-20, -8,-24,-17, 4, 11, -4,-12, 10, 4,-19,-30,-19, -3; /M: SY='R'; M= 3, -9,-21,-12, -6,-17,-15,-13,-11, 3,-13, -8, -4, -9, -4, 6, 1, -2, -5,-26,-14, -7; /M: SY='E'; M= -7, 3,-26, 5, 9,-24,-16, 4,-22, 6,-16,-10, 2, -9, 8, 7, -3, -8,-20,-27,-12, 7; /M: SY='E'; M= -9, 0,-23, -1, 7,-15,-19, 4, -9, -6, -8, -3, 1,-15, 3, -7, -2, -3,-11,-26, -5, 4; /M: SY='L'; M= -5,-23,-20,-26,-17, -1,-26,-17, 15,-18, 25, 18,-22,-23,-11,-15,-19, -6, 10,-21, -4,-14; /M: SY='R'; M=-15, -5,-29, -4, 6,-22,-22, 17,-20, 8,-12, -3, -1,-17, 15, 21,-10,-12,-19,-23, -4, 7; /M: SY='M'; M= -5,-14,-25,-16, -5,-11,-18, -8, -6, -7, -3, 2,-12,-18, 1, -7, -7, -7, -9, -4, -3, -2; /M: SY='L'; M= -9,-28,-20,-29,-20, 8,-29,-19, 20,-28, 43, 21,-27,-28,-18,-19,-26, -6, 10,-21, -1,-19; /M: SY='R'; M= -4, -7,-23, -9, -4,-12,-12, -8, -9, -4, -4, -2, -6,-18, -5, 2, -6, -7, -7,-21, -6, -6; /M: SY='Q'; M= 1, -1,-24, 0, 6,-26,-14, -5,-16, 3,-14, -3, -4, -6, 14, 0, -1, -6,-16,-24,-14, 10; /M: SY='G'; M= -2, 6,-27, 7, -4,-30, 37,-12,-35,-12,-28,-21, 9,-16,-10,-15, 3,-13,-28,-27,-26, -7; /M: SY='E'; M= -6, 0,-25, 0, 15,-23,-18, 6,-19, 6,-15, -8, 1,-12, 13, 4, 0, -5,-18,-27,-11, 14; /M: SY='L'; M= -8,-29,-14,-31,-23, 10,-29,-23, 15,-27, 32, 12,-28,-29,-22,-21,-25,-10, 11,-10, 0,-22; /M: SY='Y'; M=-13,-15,-27,-17,-11, 7,-18, 12, -9,-10, -2, -1,-10,-23, -6, -2,-14,-12,-11, -7, 19,-11; /M: SY='V'; M= -3,-28,-17,-31,-25, 7,-29,-24, 25,-24, 23, 15,-27,-27,-24,-21,-17, -5, 27,-22, -3,-25; /M: SY='N'; M= 0, 6,-17, -1, -3,-17,-10, -6,-10, -4,-17, -8, 15,-17, -2, -4, 9, 4, -7,-33,-16, -3; /M: SY='L'; M= -2,-27,-17,-29,-23, 3,-27,-19, 21,-21, 23, 17,-26,-27,-20,-19,-17, -6, 23,-21, 0,-22; /M: SY='H'; M= 0, -4,-21, -4, 5,-19,-17, 12,-13, -7,-10, -5, -4,-14, 3, -8, 0, -2, -9,-28, -7, 3; /M: SY='T'; M= 2, -6,-15,-14,-12, -9,-18,-20, -9,-12,-12,-11, -5,-12,-10,-13, 14, 33, -2,-12, -7,-11; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='K'; M= 3, -3,-22, -5, 4,-25, -9, -9,-22, 18,-21,-10, -2,-10, 8, 13, 0, -4,-15,-20,-13, 6; D=-13; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='Q'; M= 4, 3,-22, 1, 4,-26, -3, -3,-21, -2,-18,-11, 2,-12, 7, -6, 4, -2,-18,-26,-15, 5; /M: SY='H'; M=-12, -4,-27, -7, -3,-13,-12, 19,-20, -4,-16, -6, 3,-19, 9, 4, -4,-10,-22,-13, 3, 2; /M: SY='P'; M= -5,-10,-31, -7, 5,-26,-17, -8,-24, 8,-25,-15, -8, 28, 0, 8, -5, -8,-22,-26,-19, -1; /M: SY='E'; M= -9, 2,-28, 5, 10,-28, -3, -1,-29, 3,-24,-15, 2, -5, 7, 6, 1, -6,-24,-27,-16, 7; /M: SY='G'; M= -4,-11,-19,-11,-11,-20, 21,-16,-22,-16,-12,-11, -4,-16,-12,-13, -4,-12,-19,-25,-21,-12; /M: SY='E'; M= -4, 1,-26, 7, 27,-24,-17, -6,-21, 3,-12,-13, -4, -4, 9, 1, -2, -8,-20,-27,-17, 17; /M: SY='I'; M= -8,-26,-23,-30,-22, 0,-31,-22, 28,-21, 21, 18,-21,-23,-17,-19,-18, -7, 20,-22, -3,-21; /M: SY='R'; M= -8, -4,-25, -5, 4,-23,-14, 3,-24, 11,-22,-11, 3,-16, 14, 28, 2, -5,-20,-19,-10, 7; /M: SY='G'; M= -2, -7,-30, -6,-17,-30, 60,-18,-39,-16,-29,-20, 1,-19,-17,-14, -1,-19,-29,-21,-28,-17; /M: SY='R'; M=-14, -5,-29, -7, 1,-18,-20, 10,-21, 11,-19, -6, 0,-12, 13, 15, -8,-10,-21,-14, -2, 6; /M: SY='I'; M= -3,-29,-19,-33,-27, 1,-32,-27, 33,-25, 21, 15,-25,-25,-23,-24,-17, -6, 32,-24, -5,-27; /M: SY='V'; M= 0,-17,-20,-20,-15,-10,-17, -8, 3,-11, 2, 2,-13,-21,-12, -8, -8, -4, 6,-24, -7,-15; /M: SY='K'; M= -3, -7,-24, -9, -4,-16,-16,-12,-14, 9,-17, -9, -3, -8, -3, 4, -1, -1,-11,-17, -7, -4; /M: SY='R'; M= -9,-16,-24,-18,-11, -9,-24, 3, -3, -5, -1, 2,-12,-17, -5, 6,-11, -6, 0,-21, 0,-11; /M: SY='K'; M= -5, -5,-25, -7, -1,-22,-14,-13,-20, 11,-20,-11, -2, 3, -2, 9, -1, 3,-16,-25,-15, -3; /M: SY='A'; M= 8,-12,-17,-15,-11,-11,-11,-11, -7, -6,-11, -7, -9,-18, -6, -8, 5, 3, 1,-19, -2, -9; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 24 in 6 different sequences |
| Number of true positive hits | 24 in 6 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 4 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | CHRD |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
6 sequences
CHRD_DANRE (O57472), CHRD_HUMAN (Q9H2X0), CHRD_MOUSE (Q9Z0E2), CHRD_RAT(Q63148), CHRD_XENLA (Q91713), SOG_DROME (Q24025)» more
|