Entry: PS50950

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] ZF_THAP
Accession [info] PS50950
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JAN-2004 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50950
Associated ProRule [info] PRU00309

Name and characterization of the entry

Description [info] Zinc finger THAP-type profile
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=82;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=82;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9798009; R2=0.0128936; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2675.00000; R2=21.17500; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=623; N_SCORE=10.0; H_SCORE=14194; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=274; N_SCORE=5.5; H_SCORE=8456; MODE=1; TEXT='R?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,  0,-20,  0, 20,-10, 20, 60,-20,-20,  0,-10,-20,-10, 10,-20,  0,-10;
/M: SY='P'; M= -4,-16,-30,-12, -5,-24,-13,-19,-16, -3,-22,-13,-14, 36, -9, -7, -6, -5,-15,-27,-22,-10;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='R'; M=  0, -4,-20, -8, -6,-15, -2, -7,-19,  2,-16,-10,  1,-15, -2,  6,  2,  3,-13,-17, -6, -5; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='Y'; M=-10, -9,-10,-13,-10,  3,-18,  3,-10, -7, -9, -5, -2,-18, -8,  1, -2, -1, -8,-16,  4,-10; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='A'; M= 18,-10, 17,-17,-12,-19,-11,-20,-16,-10,-17,-13, -8,-18,-12,-15,  9,  1, -3,-32,-21,-12;
/M: SY='A'; M= 17,-20,-15,-27,-20,  6,-17,-20,  6,-17,  1, -1,-18,-20,-20,-20, -4, -3, 13,-14,  0,-20;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='P'; M=  0,-18,-25,-20,-12,-12,-21,-17,  5, -7, -6, -2,-14,  8,-10,-10, -9, -7,  1,-19, -8,-14; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='G'; M= -7, 10,-17,  9, -7,-25, 25, -1,-31,-11,-26,-18, 15,-18, -9,-12,  1,-12,-26,-28,-20, -9; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='K'; M= -2, -8,-17, -9, -1,-17,-11,-11,-19,  3,-16,-11, -6, -9, -3,  1,  0, -2,-14,-22, -9, -3;
/M: SY='N'; M= -2,  8,-18, -1, -6,-13,-10,  3,-14, -5,-19,-12, 18,-18, -4, -3,  9,  8,-12,-28, -7, -6;
/M: SY='R'; M=-12, -4,-24, -9, -8, -7,-13, -6,-17,  7,-16, -9,  3,-20, -5, 17, -5, -2,-11,-19, -2, -8;
/M: SY='S'; M= -5,  0,-10,  0, -6, -9,-14, -4,-17, -8,-19,-14,  0,-17, -5, -7, 12, 11,-11,-22,  5, -7;
/M: SY='T'; M= -7,  0,-21,  0, -7,-18, -5, -5,-16, -5,-14,-10,  0,-17, -8, -3,  1,  3, -8,-29,-12, -8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='R'; M= -9, -8, -9, -9, -3,-18, -9,  0,-17,  2,-14, -6, -4, -9,  5, 12, -5, -8,-13,-19,-10, -1; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='D'; M= -6, 12,-19, 13,  7,-19,-11,  9,-17, -3,-13,-10,  9,-11,  5, -4,  0, -2,-16,-24, -8,  5; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='R'; M= -8, -6,-26, -5,  2,-24,-10, -8,-21, 14,-23,-11, -2,  3,  6, 15, -1, -6,-18,-22,-14,  2; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='G'; M=  0,  1,-22,  0, -6,-24, 19,-10,-27, -4,-25,-17,  7, -9, -7, -4,  6, -6,-21,-25,-21, -7; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='L'; M= -9,-25,-22,-28,-19,  0,-29,-18, 18,-15, 24, 20,-22,-25,-14, -9,-21, -9, 14,-21, -3,-18;
/M: SY='S'; M=  3, -1,-18, -3, -1,-22, -3,  5,-22, -4,-24,-13,  5,-12,  3, -5, 17,  9,-15,-31,-12,  0;
/M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28, 63,-30,-20,  5,-30, 20,  5,-22,-30,-35,-20,-22,-10,  2,  3, 23,-28;
/M: SY='F'; M=-19,-19,-26,-24,-19, 33,-28, 24, -5,-21,  0,  2,-10,-26,-18,-13,-17,-13, -9, -3, 31,-19;
/M: SY='R'; M= -4, -8,-25,-10, -2,-21,-17,  1,-20, 13,-18, -8, -4,-10,  5, 24, -4, -4,-13,-23,-10, -1;
/M: SY='F'; M=-18,-30,-19,-39,-30, 69,-30,-21,  4,-29, 12,  2,-21,-30,-38,-20,-20, -9,  5,  5, 25,-30;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='K'; M=-11,  0,-28,  1,  5,-26,-20, -5,-26, 28,-24,-10, -1, -4,  4, 18, -6, -3,-18,-24,-10,  4;
/M: SY='D'; M=-16, 21, -4, 31, 15,-33,-17, -4,-34,  0,-25,-22,  6,-15,  4, -1, -3,-10,-25,-36,-20,  9;
/M: SY='P'; M=  0, -2,-27, -5, -1,-24,-13,-12,-20,  2,-25,-16,  2, 25, -4, -3, -1, -2,-21,-28,-21, -5;
/M: SY='E'; M= -2, -2,-28,  0,  6,-24,-19,-13, -8, -2,-14, -9, -5,  2,  1,-10, -3, -7,-11,-27,-15,  2;
/M: SY='R'; M=-13,-14,-24,-15, -6, -7,-23,-10,-11,  8, -3, -1,-10,-20, -1, 22,-11, -4, -7,-19, -5, -5;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='R'; M=-10,-15, -7,-18,-10, -5,-21, -3,-15, -1, -2, -3,-10,-23, -7, 17,-12, -9, -9,-20, -5,-10; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='R'; M=-10, -4,-28, -4,  8,-25,-15, -6,-25, 25,-20, -8, -2,-14, 13, 26, -6, -8,-19,-22,-12,  9;
/M: SY='L'; M= -6,-10,-25, -9, -1,-13,-23,-15, -4,  2,  6,  1,-12,-17, -5, -3,-15, -9, -5,-22, -8, -3;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='L'; M= -9,-12,-23,-10, -3,-10,-26, -8,  2, -7,  6,  3,-14,-20, -9, -8,-14, -9,  4,-26, -6, -6;
/M: SY='E'; M= -1, -3,-26, -2, 17,-24,-17, -5,-22, 14,-15,-10, -4,-11, 12, 17, -4, -8,-18,-23,-14, 13;
/M: SY='N'; M=  5,  5,-17, -7,-10,  3, -8, -7,-12,-11,-13,-12, 16,-19,-12,-11,  5, -1,-12,-23, -8,-10;
/M: SY='C'; M= -5,-22, 31,-27,-26, -9,-20,-24, -1,-22,  0,  3,-21,-30,-23,-22,-10, -4, 12,-34,-16,-25;
/M: SY='R'; M= -8, -1,-26, -3,  2,-27,  0,  4,-28,  9,-25,-11,  6,-15, 12, 16,  2, -7,-24,-25,-13,  5;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='R'; M= -9, -8,-23,-10, -6,-13,-10, -3,-19, 11,-15, -8, -1,-19,  0, 32, -6, -8,-12,-16, -5, -6; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='A'; M=  2, -7, -7, -8, -7,-15,-15, -7,-12, -8,-10, -8, -6, -9, -8,-10,  2,  1, -5,-27,-12, -8; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='D'; M= -7, 14,-24, 19,  7,-25, -5, -6,-24, -3,-18,-17,  7, -4, -2, -5,  0, -7,-20,-29,-17,  2; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='V'; M= -1,-11,-16,-10, -2,-11,-15,-11, -2, -4, -4, -2,-11,  0, -3, -3, -5, -4,  1,-18,-10, -3; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='S'; M= -1,  6,-10,  7,  5,-13, -3, -2,-14,  0,-15,-11,  8, -6,  2,  1, 11,  3,-10,-20,-10,  3; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='W'; M=-13,-22,-21,-25,-20,  7,-22,-22,-14,-12,-13,-12,-21,-25,-17,-10,-22,-17,-15, 45,  9,-17;
/M: SY='I'; M= -8,-13,-24,-13, -6,-12,-24,-11,  4, -9, -2,  4,-13,-11, -1,-11, -8, -6,  2,-22, -4, -5;
/M: SY='P'; M= -9,-19,-35,-12, -4,-24,-15,-19,-16, -9,-18,-13,-18, 55,-11,-16,-12,-11,-23,-27,-24,-11;
/M: SY='G'; M= -1, -6,-20, -9,-11,-12,  9, -6,-20,-12,-16,-11,  2,-17,-11,-11,  6,  1,-15,-25,-12,-11;
/M: SY='K'; M= -7,  2,-26,  2, 10,-26,-16, -9,-26, 26,-28,-14,  4, -3,  6, 13,  1, -1,-19,-26,-14,  8;
/M: SY='H'; M=-11,  2,-29,  1, -3,-17,  1,  6,-23, -4,-18,-12,  6,-19,  0, -5, -7,-13,-24,-10, -1, -2;
/M: SY='S'; M= -1, -7,-23, -6, -3,-16,-14,  0,-16, -7,-15,-10, -5,  1, -1, -6,  2, -1,-15,-22, -4, -4;
/M: SY='V'; M= -1,-17, -8,-22,-15,  1,-21,-17, -2,-11, -6, -3,-12,-21,-10, -5, -3, -4,  3,-21, -6,-13;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-22,-33,-25,  8,-32,-23, 29,-27, 31, 21,-26,-26,-21,-22,-23, -9, 21,-20,  0,-24;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='S'; M= 14,  0,-13, -1, -3,-20, -4,-13,-14,-11,-22,-16,  4,-11, -4,-14, 25, 11, -6,-34,-18, -4;
/M: SY='R'; M=-12, -1,-25,  2,  6,-19,-21, -9,-17, 11, -9, -8, -4,-15,  0, 13, -8, -4,-11,-26,-11,  2;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='E'; M= -6, 11,-25, 12, 13,-29, -9, -4,-26,  9,-23,-15,  8,-11, 11,  5,  2, -3,-22,-28,-16, 12;
/M: SY='P'; M= -6,  5,-29, 12,  9,-29, -9,-11,-27,  1,-25,-19, -1, 15, -2, -4, -2, -6,-24,-29,-21,  2;
/M: SY='S'; M=  1,  8,-21, 12, 14,-26, -3, -8,-26,  0,-25,-19,  6, -9,  2, -6, 15,  4,-18,-33,-19,  8;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='C'; M=-11,  2, 18,  4, -7,-15,-19,-12,-19,-13,-15,-10, -5,-21, -8,-15, -4, -7,-10,-32,-14, -7; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='F'; M=-15,-29,-23,-36,-26, 40,-29,-22, 12,-27, 14,  5,-22,-25,-28,-21,-22,-11,  5, 11, 17,-25; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='D'; M= -9, 13,-15, 17, 13,-26, -7, -5,-26,  4,-22,-14,  7,-11,  2, -3,  0, -7,-21,-30,-17,  8; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='R'; M= -5, -7, -9, -9, -6,-16, -3, -9,-15, -3,-13, -8, -2,-14,  0,  5,  3, -1,-10,-21,-12, -4; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='T'; M= -4, -5,-15, -8, -5, -2,-13, -8, -7, -9, -8, -7,  0,-14, -6, -5,  7,  8, -6,-20, -2, -6; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='A'; M=  2, -8,-13,-12,-10, -5, -3,-11,-16, -7,-16,-11, -4,-10,-10,-10,  0, -5,-13, -7, -4,-10; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='K'; M= -8,  2,-24, -2, -1,-19, -5, -4,-15,  8,-19, -8,  8, -7,  4,  2, -4, -8,-17,-18, -7,  1; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='R'; M=-13, -5,-25, -9, -5,-15,-11, -3,-17, 13,-15, -4,  3,-18,  2, 29, -7, -7,-14,-19, -6, -4; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='R'; M=-15, -6,-26, -6, -2,-18,-21, -2,-19, 14,-13, -7, -2,-17,  2, 32, -7, -2,-13,-23, -8, -3;
/M: SY='R'; M=-12,-11,-24,-12, -5,-13,-22, -8,-15, 15, -8, -4, -7,-19,  0, 28, -9, -1, -8,-19, -4, -5;
/M: SY='L'; M= -9,-28,-19,-28,-19,  8,-29,-20, 18,-28, 45, 18,-28,-28,-19,-19,-26, -5,  9,-21, -1,-19;
/M: SY='K'; M=-11, -6,-26, -9, -3,-17,-22, -7,-11, 19,-16, -4, -2,-18,  3, 17, -9, -8, -7,-19, -3, -1;
/M: SY='P'; M=  2, -3,-25, -2,  5,-26, -7,-12,-21,  1,-22,-13, -5, 11,  1, -7,  2, -2,-18,-27,-20,  2;
/M: SY='G'; M= -7, 10,-24,  7, -4,-23, 16, -8,-23, -9,-22,-13, 14,-17, -8,-11,  2, -7,-19,-30,-21, -6;
/M: SY='A'; M= 37,-11,-13,-18, -8,-20, -5,-17,-10, -6,-10, -8,-10,-12, -5,-11,  7, -1, -1,-21,-18, -7;
/M: SY='V'; M= -2,-28,-13,-30,-28,  0,-31,-29, 29,-21, 13, 11,-27,-27,-27,-21,-11,  1, 41,-28, -8,-28;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='T'; M=  0, -4,  0,-11,-10, -6,-16,-18,-14,-13,-15,-13,  0,-14,-11,-12, 20, 32, -4,-31,-11,-10;
/M: SY='I'; M= -8,-27,-26,-30,-22, -3,-33,-25, 28,-20, 17, 13,-22,-14,-18,-20,-19, -8, 19,-22, -5,-23;
/M: SY='F'; M=-15,-16,-21,-23,-18, 32,-23, -3, -7,-14, -3, -4, -7,-26,-20, -3,-10, -7, -5, -7, 16,-18;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_09 which contains 546'439 sequence entries.


Total number of hits 45 in 45 different sequences
Number of true positive hits 45 in 45 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] ZN_FING
Feature description [info] THAP-type
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
45 sequences

CDC14_CAEEL (P81299), CTBP1_CAEEL (Q20595), LI15B_CAEEL (Q27395), 
LIN36_CAEEL (P34427), P52K_HUMAN  (O43422), P52K_MOUSE  (Q9CUX1), 
PELET_DROME (Q7M3K2), THA10_HUMAN (Q9P2Z0), THA10_PONAB (Q5NVM3), 
THA11_BOVIN (A5PKF5), THA11_DANRE (Q6TGZ4), THA11_HUMAN (Q96EK4), 
THA11_MOUSE (Q9JJD0), THA11_XENLA (Q6IR68), THA11_XENTR (A4IGQ8), 
THAP1_BOVIN (Q3T0G1), THAP1_DANRE (Q1JPT7), THAP1_HUMAN (Q9NVV9), 
THAP1_MACFA (Q4R3Q6), THAP1_MOUSE (Q8CHW1), THAP1_PONAB (Q5RCE4), 
THAP1_RAT   (Q5U208), THAP1_SALSA (B5XCB8), THAP1_XENTR (Q6DIN8), 
THAP2_HUMAN (Q9H0W7), THAP2_MOUSE (Q9D305), THAP3_BOVIN (Q0P5B4), 
THAP3_HUMAN (Q8WTV1), THAP3_MOUSE (Q8BJ25), THAP4_BOVIN (Q2TBI2), 
THAP4_HUMAN (Q8WY91), THAP4_MOUSE (Q6P3Z3), THAP4_RAT   (Q642B6), 
THAP5_BOVIN (Q1RMM0), THAP5_CHICK (Q5ZHN5), THAP5_HUMAN (Q7Z6K1), 
THAP5_MACFA (Q4R7M0), THAP5_XENLA (Q0IHI7), THAP6_HUMAN (Q8TBB0), 
THAP7_HUMAN (Q9BT49), THAP7_MOUSE (Q8VCZ3), THAP8_HUMAN (Q8NA92), 
THAP9_HUMAN (Q9H5L6), THP1A_XENLA (Q5U560), THP1B_XENLA (Q6DDT6)
» More

PDB
[Detailed view]
7 PDB

2D8R; 2JM3; 2JTG; 2KO0; 2L1G; 2LAU; 3KDE

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission