Entry: PS50957

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] JOSEPHIN
Accession [info] PS50957
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JAN-2004 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); OCT-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50957
Associated ProRule [info] PRU00331

Name and characterization of the entry

Description [info] Josephin domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=180;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=175;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2190399; R2=0.0123688; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=11325.00138; R2=41.65917; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=508; N_SCORE=8.5; H_SCORE=32488; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=347; N_SCORE=6.5; H_SCORE=25739; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='P'; M=-10,-14,-33,-10,  6,-22,-20,-11,-11, -6,-14,  2,-16, 42, -1,-13,-11,-10,-19,-27,-20,  0;
/M: SY='P'; M= -8, -5,-30,  2, 16,-26,-16,  6,-24, -5,-26,-17, -4, 28,  3, -9,  3, -6,-26,-32,-17,  7;
/M: SY='S'; M=  0, -2,-21, -2,  3,-28,  3, -8,-25,  4,-28,-14,  4,-12, 11,  0, 16,  2,-19,-29,-18,  7;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-27,-38,-30,  0,-38,-30, 47,-28, 18, 18,-22,-22,-22,-28,-18, -8, 33,-22, -2,-30;
/M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-25,-23, 44,-30,  9,  0,-15,  3,  0,-20,-30,-18,-13,-20,-10, -7, 25, 66,-23;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5,  5,-25,-20, -5,-30, 39,-25,-10,  0,-15, 10, 51,-10,-10,-20,-20,-10,  5;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='R'; M=-14, -3,-27, -2, 15,-21,-20, -3,-27, 18,-18,-13,  0,-13, 10, 38, -3, -1,-20,-24,-13,  9;
/M: SY='R'; M=-11,-17,-26,-17,-13,-12,  1,-13,-14, -6,  3, -2,-11,-24, -9, 12,-15,-13,-12,-20,-12,-13;
/M: SY='E'; M= -6,  4,-25,  7, 26,-28,-15, 15,-25,  1,-23,-13,  4, -8, 21, -1,  9, -3,-25,-31,-12, 23;
/M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22, 24,-30,-20, 16,-30, 42, 16,-28,-30,-24,-20,-28,-10,  8,-14,  6,-22;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='A'; M= 30,-14,-15,-20,-14,-16,  5,-20, -9,-16, -1, -6,-12,-16,-14,-20,  1, -5, -3,-20,-18,-14;
/M: SY='L'; M= -8,-22,-21,-22,-11, -5,-27,-14, 11,-17, 24, 13,-22,-25,  0,-12,-18, -8,  6,-22, -4, -5;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='C'; M= 22,-15, 51,-25,-19,-20,-14,-25,-19,-19,-15,-15,-15,-24,-19,-25,  1, -5, -5,-34,-25,-19;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='L'; M= -6,-30,-16,-30,-24,  6,-30,-24, 24,-26, 35, 16,-30,-30,-24,-20,-23, -6, 25,-24, -4,-24;
/M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26, 49,-30,-20,  9,-30, 28,  9,-24,-30,-31,-20,-24,-10,  4, -3, 17,-26;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='D'; M=-10, 17,-30, 27, 10,-34, 23, -9,-38, -7,-28,-24,  8,-13, -5,-13,  0,-14,-30,-30,-24,  2;
/M: SY='E'; M= -6,  0,-28,  4, 22,-30,-16, -5,-25, 11,-26,-15, -1,  9, 16,  2,  4, -4,-24,-28,-18, 18;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='D'; M= -9, 26,-15, 29,  7,-18, -4,  2,-18,  0,-17,-15, 19, -8,  0, -4,  2, -4,-17,-22,-11,  4; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='Y'; M= 11,-18,-19,-23,-16,  2,-16, -6,  3,-13,  8,  9,-18,-20,-10,-16,-10, -6,  1, -6, 14,-14;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='S'; M=  6,  0,-10, -4, -4,-16, -8,-14,-16,-10,-22,-16,  6,-10, -4,-10, 32, 32, -6,-36,-16, -4;
/M: SY='K'; M=-12, -7,-33, -5,  7,-30,-20, -7,-26, 23,-26,-11, -5, 15, 13, 21, -8,-10,-24,-23,-15,  8;
/M: SY='E'; M= -5,  1,-21,  8, 22,-21,-19,-10,-13, -2,-14,-13, -5,-11,  1, -8,  4, -3, -5,-32,-17, 12;
/M: SY='E'; M=  6,  3,-19,  3, 22,-22,-13, -9,-21, -1,-18,-16,  0, -6,  5, -7, 14, 10,-15,-30,-18, 13;
/M: SY='L'; M=  0,-27,-18,-28,-18,  5,-25,-20, 15,-27, 40, 15,-27,-27,-18,-20,-23, -8,  8,-20, -3,-18;
/M: SY='D'; M= -8, 24,-23, 27, 11,-31, -7,  1,-27, -1,-28,-19, 21,-12, 12, -4, 13,  0,-25,-36,-18, 11;
/M: SY='E'; M= -2, 12,-21, 19, 26,-27, -9, -5,-27, -1,-26,-22,  8, -6,  7, -6, 19,  4,-21,-36,-20, 16;
/M: SY='I'; M=-12,-28,-30,-37,-28,  5,-38,-22, 42,-27, 17, 17,-20,-22,-18,-27,-20,-10, 24,-12, 13,-28;
/M: SY='C'; M= 16,-17, 31,-27,-21,  0,-16,-23,-15,-21, -9,-11,-15,-24,-23,-23, -3, -5, -3,-24,-13,-21;
/M: SY='H'; M=-11,  2,-27,  2, 16,-26,-20, 24,-25,  8,-20, -7,  3,-11, 19,  6, -1, -3,-24,-26, -4, 16;
/M: SY='R'; M=-12, -4,-27, -5,  6,-26,-20, -2,-24, 22,-20, -7,  0,-14, 20, 33, -3, -1,-20,-22,-10, 11;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='D'; M=  3, 14,-19, 18, 14,-26,-10, -9,-24, -3,-21,-19,  6, -8,  1,-10, 13,  7,-16,-33,-18,  7;
/M: SY='P'; M= -8, -8,-31, -2, 14,-26,-20,-15,-21, -5,-23,-18,-11, 46, -2,-13, -1,  2,-24,-30,-23,  4;
/M: SY='N'; M=-13, 26,-26, 24, 20,-26,-10,  4,-28,  7,-26,-20, 27,-13,  7,  9,  2, -6,-28,-34,-18, 13;
/M: SY='D'; M= -7, 19,-21, 20, 18,-25,-11, -4,-25, -1,-23,-20, 15, -9,  3, -6, 12,  9,-21,-35,-18, 11;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='W'; M= -9,-18,-19,-20,-15, -2,-17,-11,  2, -4, -1,  9,-16,-18, -7,  3,-14, -8,  4, 10,  1,-11; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='L'; M= -5,-22,-13,-22,-17,  5,-22,-17, 17,-20, 28, 13,-22,-22,-17,-15,-18, -5, 15,-17, -2,-17; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='N'; M= -5, 13,-15,  5,  0,-15, -8, -3,-15,  8,-18,-11, 20,-11,  0,  4,  5,  8,-14,-23,-11,  0; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='P'; M=-13,-17,-37,-10,  0,-27,-20,-15,-23,  1,-27,-17,-15, 60, -5,  5,-10,-10,-27,-27,-25, -7;
/M: SY='H'; M=-17, -5,-27, -8, -5,-15,-20, 73,-16,-10, -9, 16,  2,-20,  7, -3,-13,-17,-19,-27, 15, -3;
/M: SY='R'; M=-18, -6,-30, -6,  2,-22,-20, 18,-30, 26,-22, -8,  2,-18, 10, 48,-10,-12,-22,-22, -4,  2;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='M'; M= -7,  2,-15, -4, -3,-10, -9,  0, -5,  7, -6, 10,  6,-11,  2,  3, -5, -5, -7,-17, -6, -1; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='S'; M= 19, -3,-10, -7, -5,-18, -4,-15,-15,-10,-21,-15,  3,-10, -5,-13, 28, 20, -5,-33,-18, -5;
/M: SY='M'; M=-12,-19,-29,-20, -2, -5,-26,-14,  6,-13,  8, 11,-19,-18, -5,-15,-19,-13, -3,  4, -1, -4;
/M: SY='L'; M= -5,-19,-22,-22,-20, -6, -2,-22,  2,-23, 12,  3,-14,-22,-18,-20,-10, -1,  0,-22,-10,-20;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='T'; M= -5, -6,-16,-12,-15, -4,-15,-14, -1,-10, -8, -6, -2,-19,-13,-10, -4,  4,  3,  2, -4,-13; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='G'; M=  0, -5,-19, -8,-13,-19, 32,-16,-24,-13,-19,-13,  0,-13,-13,-13,  5,  3,-16,-19,-19,-13; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='N'; M= -5, 29,-17, 15,  0,-20,  0,  5,-20, -3,-30,-20, 46,-17,  0, -3, 18,  5,-25,-40,-20,  0;
/M: SY='Y'; M=-17,-12,-30, -9,  2, 14,-27, 15, -8, -5, -5, -5,-15,-22, -2, -7,-15,-10,-15, 14, 53, -4;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='V'; M= -5,-27,-15,-27,-27,  8,-30,-16, 22,-17,  7,  7,-27,-30,-25,-17,-13, -3, 34,-14, 15,-27;
/M: SY='N'; M=-13, 26,-23, 12,  0,-20, -5,  7,-23,  8,-27,-17, 44,-20,  3, 19,  5, -3,-27,-35,-17,  0;
/M: SY='V'; M=  0,-22,-10,-25,-25, -3,-27,-27, 19,-17,  5,  5,-22,-25,-25,-17, -2, 14, 36,-30,-10,-25;
/M: SY='I'; M=-13,-28,-25,-38,-28, 22,-33,-21, 30,-26, 17, 22,-20,-23,-22,-23,-20,-10, 18,-12,  8,-26;
/M: SY='M'; M=-10,-25,-22,-32,-22,  3,-27,-11, 26,-19, 28, 41,-23,-23, -9,-17,-23,-10, 14,-20,  0,-17;
/M: SY='A'; M= 13, -7,-19,-13, -3,-16,-14, -6,-11, -5,-11, -6, -7,-13,  9, -8,  5,  6,-10,-14,  0,  2;
/M: SY='A'; M= 34, -7,-15,-15, -2,-25, -5,-12,-13, -5,-13, -7, -7,-10,  9,-12,  7, -3, -8,-20,-17,  4;
/M: SY='L'; M=-10,-27,-25,-25,-15, -1,-27,-20,  9,-25, 28,  9,-27,  3,-17,-20,-25,-10, -1,-23, -8,-17;
/M: SY='Q'; M= -5,  2,-25,  4, 22,-33,-15,  3,-22,  5,-23, -9,  3, -8, 36,  3, 11, -2,-25,-27,-15, 29;
/M: SY='G'; M= -2, -6,-26, -8,-12,-28, 38,-15,-31,-13,-24,-15,  0,-16, -5,-13,  4, -4,-24,-22,-23, -9;
/M: SY='R'; M=-12,  4,-26, -1,  1,-19,-16, -5,-19, 19,-15, -8, 11,-18,  2, 20, -8, -7,-18,-25,-11,  1;
/M: SY='G'; M= -4, -5,-26,-11,-17,-20, 34,-10,-20,-14,-16,  2,  4,-20,-11,-14, -4,-14,-19,-23,-20,-14;
/M: SY='D'; M=-15,  1, -5,  5, -5,-12,-23, -6,-18, -2, -9,-10, -7,-22, -8, -7,-13,-10,-14,-20,  4, -7;
/M: SY='E'; M=  2, 16,-23, 23, 25,-29,-10, -5,-27,  0,-23,-21,  6, -6,  5, -8, 10, -2,-21,-33,-20, 15;
/M: SY='A'; M= 29,-11,-10,-17,-11,-16, -6,-19, -5,-12,-12, -9, -8,-14,-11,-17, 14,  5,  7,-27,-18,-11;
/M: SY='V'; M=  0,-25,-15,-25,-27, -8, -3,-27, 11,-20, -1,  2,-22,-27,-27,-20, -7, -5, 28,-27,-15,-27;
/M: SY='W'; M=-20,-37,-42,-40,-30, 29,-23,-27,-15,-23,-12,-15,-35,-30,-25,-20,-35,-25,-22,112, 30,-23;
/M: SY='W'; M=-20,-28,-33,-32,-24, 34,-24,  0,-13,-22, -7, -7,-22,-28,-23,-16,-25,-19,-17, 54, 28,-20;
/M: SY='D'; M=-12, 36,-25, 51, 15,-35, -7, -3,-35, -3,-30,-27, 17,-10,  0,-10, 11, -2,-25,-40,-20,  7;
/M: SY='R'; M=-13,-11,-30,-14, -4,-19,-25,-12, -8, 22,-13, -2, -5,-16,  2, 27,-13,-10, -6,-20, -7, -4;
/M: SY='R'; M=-17, -7,-30, -7,  5,-25,-20,  3,-27, 25,-20, -7,  0,-17, 24, 54, -7,-10,-23,-20,-10, 11;
/M: SY='R'; M=-13,-19,-25,-21,-14,-11,-27,-14,  2,  5, -4,  1,-12,-23, -7, 26,-12, -7,  9,-23, -8,-14;
/M: SY='D'; M=-12,  4,-32, 11, -5,-25, -4,-16,-12,-14,-16,-13, -2,  2,-11,-19, -7,-12,-14,-29,-18,-10;
/M: SY='A'; M=  9,-16,-16,-17,-11,-12,-14,-19, -1,-15, -4, -5,-14, -2,-13,-17,  4,  2,  4,-29,-16,-13;
/M: SY='N'; M= -2,  9,-20,  3, -4,-22, 11, 11,-26, -9,-28,-17, 22,-16, -2, -8, 16,  0,-23,-34,-16, -4;
/M: SY='A'; M= 12,-12,  7,-16,-10,-19,-14,-16, -9,-12,-13, -8,-10,-19, -3,-14,  7,  1,  1,-31,-18, -7;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,  6,-34,-24, 32,-30, 38, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 18,-20,  0,-24;
/M: SY='B'; M= 10, 12,-21,  9,  3,-27, -7, -9,-23, 10,-23,-16, 10,-12, -1, -1,  3, -5,-16,-27,-17,  1;
/M: SY='L'; M= -7,-30,-17,-30,-23,  7,-30,-23, 23,-27, 39, 17,-30,-30,-23,-20,-25, -7, 21,-23, -3,-23;
/M: SY='W'; M=-10, -5,-30, -1, -6,-15,-15,-17,-22,-11,-23,-20, -9,  2, -9,-14, -2,  1,-21, 16, -6, -7;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='T'; M= -4,  3,-13, -3, -3,-13,-12, -5, -5, -3,-10, -4,  7,-12,  4, -3,  4,  8, -3,-22, -9,  0; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='L'; M= -6,-30,-18,-32,-25,  5,-32,-25, 28,-26, 30, 16,-28,-28,-24,-22,-21, -6, 28,-24, -4,-25;
/M: SY='M'; M=-12,-15,-23,-18,  0,  6,-23, -7,  3,-11, 13, 22,-16,-18, -4,-11,-16,-10, -2,-18, -1, -1;
/M: SY='G'; M= -3,-15,-27,-15,-20,-19, 43,-20,-24,-23, -8, -9, -8,-23,-20,-20, -8,-17,-19,-20,-22,-20;
/M: SY='F'; M=-14,-30,-25,-38,-28, 30,-35,-25, 27,-30, 22, 13,-22,-25,-27,-25,-22,-10, 16, -9, 11,-28;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-23,-35,-27,  3,-35,-27, 38,-28, 26, 18,-25,-25,-22,-25,-21, -8, 28,-22, -2,-27;
/M: SY='L'; M=-13,-28,-20,-33,-23, 27,-28,-16, 15,-26, 33, 23,-25,-28,-21,-18,-25,-10,  7,-12,  8,-21;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='V'; M= -1,-22,-14,-22,-18, -2,-22,-21, 13,-21, 14,  6,-19,-25,-18,-17, -4,  2, 19,-29, -9,-18;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='S'; M=  9, -5,-15, -4,  9,-19,-11,-13,-11, -7,-16,-13, -4,-11, -2,-11, 15,  5, -2,-32,-18,  3;
/M: SY='Y'; M= -9, -9,-28, -7,  0,-13,-19,  0,-17,  5,-20, -9, -7,  2,  7, -1, -1, -4,-19,-12,  9,  1;
/M: SY='M'; M=-10,-16,-23,-18, -7,-13,-24, -6,  1, -2,  6, 13,-14,-21,  9,  7,-13, -8,  0,-22, -6,  0;
/M: SY='R'; M= -8,-11,  7,-13,-10,-10,-17, -5,-21, -3,-19,-13, -5,-23, -5,  8,  5,  0,-13,-23,  0,-10;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-28,-28,-22,  2, -8,-22,  0,-26, 20,  4,-26,-28,-20,-20,-26,-16, -6, 14,  0,-20;
/M: SY='G'; M= -5,-10,-30,-10,-15,-27, 45,-15,-37, -6,-27,-17,  0,-20,-12,  5, -3,-17,-27,-20,-25,-15;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='I'; M=-10,-21,-24,-21,-15,  0,-25,-12, 13,-17,  8,  5,-18,  3,-12,-17,-16, -8,  2,-10,  7,-17; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='L'; M=-12, -1,-20,  5, -5, -2,-19, -4, -3,-13, 10, -1, -9,-19, -9,-12,-14, -8, -6,-14,  7, -8; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='P'; M= -5,-10,-23, -9, -3,-18,-16,-14, -7,  1,-16, -8, -7, 18, -4, -6, -1, -3, -9,-22,-14, -5; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='L'; M= -8,-24,-19,-27,-19,  5,-27,-19, 24,-24, 32, 16,-21,-21,-16,-19,-21, -8, 13,-16,  0,-19; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='P'; M=-10,-22,  8,-19,-12,-19,-25,-23,-15,-19,-12,-12,-22, 31,-17,-23,-14,-10,-17,-33,-24,-17;
/M: SY='F'; M=-14,-13,-26,-20,-18, 13,-20,-14, -2,-20,  8, -2, -6,-27,-18,-15,-19,-11,-10, 13,  5,-16;
/M: SY='R'; M=-18, -9,-30, -9, -3, -8,-23, 19,-22, 17,-17, -6, -4,-21,  5, 29,-13,-12,-19, -8, 19, -3;
/M: SY='R'; M=-10, -7,-24, -8,  0,-20,-16, -5,-20, 21,-18, -1, -1,-15,  6, 31, -2, -4,-13,-24,-10,  1;
/M: SY='R'; M=-15, -3,-30,  0, 20,-27,-20,  2,-28, 21,-20,-11,  0,-13, 23, 39, -5,-10,-25,-23,-13, 19;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='V'; M= -9,-30,-18,-35,-28, 23,-32,-26, 24,-26, 18, 11,-25,-28,-29,-22,-18, -6, 26,-16,  4,-28;
/M: SY='C'; M= 14,-13, 16,-21,-18,-13,-17,-24, -6,-16, -8, -8,-13,-20,-18,-19,  5, 12,  8,-31,-17,-18;
/M: SY='V'; M= -3,-30,-13,-30,-27,  3,-30,-27, 27,-23, 23, 13,-30,-30,-27,-20,-17, -3, 37,-27, -7,-27;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='K'; M=-12,  0,-30,  2, 20,-30,-20, -3,-28, 32,-25,-10,  0,-10, 21, 27, -6,-10,-24,-22,-12, 20;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-18,-32,-26,  4,-32,-26, 30,-26, 29, 16,-28,-28,-24,-22,-21, -6, 29,-24, -4,-26;
/M: SY='G'; M= -7, 18,-26, 14, -6,-28, 31, -6,-33, -9,-30,-22, 25,-18, -9,-11,  4,-11,-30,-31,-25, -8;
/M: SY='G'; M= -3, -7,-30, -7,-12,-30, 45,-17,-37, -1,-30,-17,  0,-17,-12, -6, -3,-17,-27,-20,-25,-12;
/M: SY='A'; M=  7,-13,-19,-17, -8,-18,-18,-14,  4,-10, -7,  0,-10,-16,  5,-12,  3, -1,  5,-25,-12, -2;
/M: SY='W'; M=-20,-29,-39,-29,-25, 21,-25, -3, -9,-15, -9, -9,-29,-30,-15,-15,-29,-19,-19, 86, 57,-20;
/M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-25,-23, 44,-30,  9,  0,-15,  3,  0,-20,-30,-18,-13,-20,-10, -7, 25, 66,-23;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='D'; M=-17, 47,-27, 56, 15,-35, -7,  3,-35,  0,-30,-27, 31,-13,  0, -7,  3, -7,-30,-40,-20,  7;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='K'; M=-12,  2,-27,  6,  4,-21,-21,-11,-18, 18, -8, -6, -4,-15,  0,  8,-13,-10,-14,-24, -9,  2;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='R'; M= -9, -9,-21,-12, -7,-15,-22,-13,-13, 13,-13, -6, -6,-17, -3, 22, -2,  8, -1,-25,-10, -7;
/M: SY='G'; M=  5,-13,-21,-15, -8,-16,  6,-15, -7,-12, -7,  4,-12,-17,-10,-15, -4, -9, -1,-24,-17, -9;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='E'; M=-10,  6,-30, 13, 44,-32,-20,  0,-28, 16,-22,-14,  0, -4, 26,  7, -2,-10,-28,-26,-16, 35;
/M: SY='L'; M= -2,-27, -2,-30,-22,  0,-23,-24, -1,-25, 15,  0,-27,-28,-20,-22,-22,-12, -3,  9, -2,-20;
/M: SY='I'; M=-12,-30,-25,-37,-27, 19,-35,-25, 30,-30, 28, 16,-23,-25,-24,-25,-23,-10, 18,-14,  6,-27;
/M: SY='G'; M= -1, -7,-25, -7,-11,-25, 33,-13,-33, -7,-28,-18,  3,-17, -9,  0,  9, -7,-23,-25,-23,-11;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='D'; M= -7, 16,-19, 22,  2,-22,  7, -7,-24, -6,-19,-17,  7, -9, -6, -9,  3,  0,-17,-23,-15, -2; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='E'; M= -9, 15,-22, 24, 36,-24,-13,  0,-24,  5,-17,-17,  4, -2, 11, -2,  0, -7,-22,-24,-15, 23; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='D'; M=-12, 32,-26, 45, 16,-36,-10,  0,-33,  0,-28,-23, 15,-10,  9, -7,  8, -4,-26,-37,-18, 13;
/M: SY='E'; M= -6,  2,-25,  4, 21,-26, -5, -7,-25, -1,-19,-14,  0, -8, 11, -5,  5,  5,-22,-27,-17, 16;
/M: SY='F'; M=-11,-27,-19,-29,-25, 23,-30,-13, 15,-21, 15,  8,-26,-30,-24,-17,-18, -6, 18, -5, 23,-25;
/M: SY='R'; M=-16,-19,-26,-19, -9, -7,-24, -9, -8,  4, 10,  3,-13,-24, -3, 31,-19,-10, -7,-20, -6, -9;
/M: SY='A'; M= 10, -3,-21, -6,  3,-24,  3,-15,-23,  3,-20,-14, -3,-10, -3, -5,  4,  1,-15,-23,-18,  0;
/M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27, 61,-30,-20,  5,-30, 21,  5,-23,-30,-35,-20,-23,-10,  3,  2, 22,-27;
/M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23, 29,-30,-20, 15,-30, 39, 15,-27,-30,-25,-20,-27,-10,  7,-12,  8,-23;
/M: SY='A'; M=  8, -2,-21, -1, -3,-18,-14,-14,-12, -1, -2, -6, -8,-15, -7, -8, -7, -7, -7,-24,-13, -5;
/M: SY='A'; M= 16, -7,-18,-13, -4,-17,-12,  1,-13, -6,-12, -6, -6,-13,  6,-10,  4,  3,-10,-17, -2,  0;
/M: SY='Q'; M= -2,  6,-25,  0,  7,-29,-13, 23,-20,  1,-20, -6, 12,-14, 26,  1,  2, -8,-25,-26, -8, 16;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='Q'; M=  2, -4,-23, -5,  7,-29,-13, -1,-20,  7,-20, -8,  0,-12, 26, 13,  8, -2,-19,-24,-14, 16;
/M: SY='Q'; M= -8,-11,-26,-13, -2,-22, -4, -4,-10, -7, -2,  9, -9,-18, 19, -5, -9,-12,-16,-20,-10,  8;
/M: SY='D'; M=-12, 19,-30, 29, 22,-34, -1, -5,-35,  9,-27,-22,  7, -9,  4, -1, -2,-12,-28,-30,-20, 13;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='G'; M= -4, -6,-18,-10,-15,-10,  8,-13, -6,-15, -4, -4,  1,-21,-15,-13, -5, -7, -3,-23,-14,-15; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='C'; M=-14,-19, 26,-25,-23, -2,-30,  4, -6,-21, -7, -4,-15,-30,-16,-20,-15,-12, -5,-19, 14,-23;
/M: SY='E'; M= -3,  3,-25,  9, 28,-27,  3, -7,-29, -1,-25,-20,  3, -7,  7, -7, 11, -4,-25,-31,-22, 17;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-21,-33,-24,  6,-33,-24, 30,-28, 35, 18,-27,-27,-22,-23,-24, -8, 22,-22, -2,-24;
/M: SY='F'; M=-14,-30,-22,-36,-26, 38,-32,-22, 17,-30, 27, 11,-24,-28,-29,-22,-24,-10, 10, -7, 13,-26;
/M: SY='L'; M= -9,-32,-23,-32,-25,  7,-28,-25, 15,-25, 25,  9,-32,-30,-23,-20,-27,-11, 13, 11,  3,-23;
/M: SY='V'; M= -2,-16,-12,-20,-24, -4,-24,-22, 20,-16,  2,  4,-12,-28,-24,-16, -6,  0, 34,-32,-12,-24;
/M: SY='V'; M= -6,-22,-19,-22,-16, -5,-27,-21, 10, -4, 13,  8,-22,-25,-16, -6,-17, -6, 17,-24, -6,-16;
/M: SY='P'; M= -7, -3,-31,  3, -4,-28,  6,-17,-27,-11,-27,-20, -5, 27,-11,-17, -1, -2,-25,-29,-25,-10;
/M: SY='E'; M=-15, 13,-30, 22, 25,-21,-19,  2,-27, 10,-21,-17,  2,-10,  7,  0, -6,-10,-24,-19,  1, 15;
/M: SY='E'; M=-10,  5,-25,  6, 26,-17,-19, -3,-14, -3, -3, -9,  4,-12,  5, -5, -6, -8,-19,-29,-15, 16;
/M: SY='P'; M=  7,-19,-18,-19,-15,-14,-20,-24,  2,-14, -8, -5,-19, 10,-17,-18, -1,  5, 10,-28,-17,-17;
/M: SY='D'; M=-14, 33,-28, 42, 31,-32,-12,  2,-32,  4,-26,-24, 20, -8,  7, -4,  2, -8,-30,-36,-20, 19;
/M: SY='C'; M=  2, -9, 39,-13, -1,-26,-20,-15,-24,-11,-18,-14,-11,-21,  0,-15, -2, -8,-15,-35,-22,  0;
/M: SY='E'; M= -2, -5,-25, -4, 12,-18,-19, 11,-17,  1, -6, -5, -6,-13,  3, -3, -8,-10,-15,-25, -6,  7;
/M: SY='P'; M=  7,  0,-27,  2,  1,-31,  3,-11,-24, -6,-23,-15, -4,  8,  4,-12,  1, -9,-22,-25,-22,  1;
/M: SY='D'; M= -9,  4,  2,  8, -2,-21,-17,-13,-21, -5,-13,-13, -2,-19, -8, -9, -1, -4,-13,-35,-16, -5;
/M: SY='W'; M=  1,-17,-30,-19, -8,-14,-13,-14,-18, -8,-20,-13,-15,-17,  7,-10, -7,-11,-21, 40,  1,  1;
/M: SY='L'; M= -8,-15,-22,-15, -6,-10,-21, -9, -4, -8,  9,  3,-11,-21,  3,  5, -7, -4, -6,-24, -8, -3;
/M: SY='N'; M= -2,  5,-20, -4, -4,-14,-13, -4, -7, -9, -3, -4, 13,-19,  2, -7, -2,  0,-13,-28,-12, -1;
/M: SY='Q'; M=-14,  5,-27,  7,  4,-18,-20,  3,-20,  4,-16, -9,  0,-16, 14,  8, -2,  0,-19,-16,  6,  7;
/M: SY='M'; M= -8,-20,-23,-22,-16, -6,-19,-12, -1, -6, -5, 10,-16,-22, -7,  2, -9, -6,  2,  1, -3,-12;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_11 which contains 547'085 sequence entries.


Total number of hits 18 in 18 different sequences
Number of true positive hits 18 in 18 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Josephin
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
18 sequences

ATX3H_ARATH (Q9M391), ATX3L_HUMAN (Q9H3M9), ATX3_CAEBR  (Q60XN1), 
ATX3_CAEEL  (O17850), ATX3_CHICK  (Q9W689), ATX3_HUMAN  (P54252), 
ATX3_MOUSE  (Q9CVD2), ATX3_ORYSJ  (Q8LQ36), ATX3_RAT    (O35815), 
JOS1_BOVIN  (Q5EAE5), JOS1_HUMAN  (Q15040), JOS1_MOUSE  (Q9DBJ6), 
JOS1_PONAB  (Q5R739), JOS1_RAT    (Q5BJY4), JOS2_HUMAN  (Q8TAC2), 
JOS2_MOUSE  (Q9CR30), JOSL_ARATH  (O82391), JOSL_DROME  (Q9W422)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission