PROSITE entry PS50957
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | JOSEPHIN |
| Accession [info] | PS50957 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JAN-2004 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50957 |
| Associated ProRule [info] | PRU00331 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Josephin domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=180; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=175; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2190399; R2=0.0123688; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=508; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=347; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='P'; M=-10,-14,-33,-10, 6,-22,-20,-11,-11, -6,-14, 2,-16, 42, -1,-13,-11,-10,-19,-27,-20, 0; /M: SY='P'; M= -8, -5,-30, 2, 16,-26,-16, 6,-24, -5,-26,-17, -4, 28, 3, -9, 3, -6,-26,-32,-17, 7; /M: SY='S'; M= 0, -2,-21, -2, 3,-28, 3, -8,-25, 4,-28,-14, 4,-12, 11, 0, 16, 2,-19,-29,-18, 7; /M: SY='I'; M= -8,-30,-27,-38,-30, 0,-38,-30, 47,-28, 18, 18,-22,-22,-22,-28,-18, -8, 33,-22, -2,-30; /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-25,-23, 44,-30, 9, 0,-15, 3, 0,-20,-30,-18,-13,-20,-10, -7, 25, 66,-23; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5, 5,-25,-20, -5,-30, 39,-25,-10, 0,-15, 10, 51,-10,-10,-20,-20,-10, 5; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='R'; M=-14, -3,-27, -2, 15,-21,-20, -3,-27, 18,-18,-13, 0,-13, 10, 38, -3, -1,-20,-24,-13, 9; /M: SY='R'; M=-11,-17,-26,-17,-13,-12, 1,-13,-14, -6, 3, -2,-11,-24, -9, 12,-15,-13,-12,-20,-12,-13; /M: SY='E'; M= -6, 4,-25, 7, 26,-28,-15, 15,-25, 1,-23,-13, 4, -8, 21, -1, 9, -3,-25,-31,-12, 23; /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22, 24,-30,-20, 16,-30, 42, 16,-28,-30,-24,-20,-28,-10, 8,-14, 6,-22; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='A'; M= 30,-14,-15,-20,-14,-16, 5,-20, -9,-16, -1, -6,-12,-16,-14,-20, 1, -5, -3,-20,-18,-14; /M: SY='L'; M= -8,-22,-21,-22,-11, -5,-27,-14, 11,-17, 24, 13,-22,-25, 0,-12,-18, -8, 6,-22, -4, -5; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='C'; M= 22,-15, 51,-25,-19,-20,-14,-25,-19,-19,-15,-15,-15,-24,-19,-25, 1, -5, -5,-34,-25,-19; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='L'; M= -6,-30,-16,-30,-24, 6,-30,-24, 24,-26, 35, 16,-30,-30,-24,-20,-23, -6, 25,-24, -4,-24; /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26, 49,-30,-20, 9,-30, 28, 9,-24,-30,-31,-20,-24,-10, 4, -3, 17,-26; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='D'; M=-10, 17,-30, 27, 10,-34, 23, -9,-38, -7,-28,-24, 8,-13, -5,-13, 0,-14,-30,-30,-24, 2; /M: SY='E'; M= -6, 0,-28, 4, 22,-30,-16, -5,-25, 11,-26,-15, -1, 9, 16, 2, 4, -4,-24,-28,-18, 18; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='D'; M= -9, 26,-15, 29, 7,-18, -4, 2,-18, 0,-17,-15, 19, -8, 0, -4, 2, -4,-17,-22,-11, 4; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='Y'; M= 11,-18,-19,-23,-16, 2,-16, -6, 3,-13, 8, 9,-18,-20,-10,-16,-10, -6, 1, -6, 14,-14; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='S'; M= 6, 0,-10, -4, -4,-16, -8,-14,-16,-10,-22,-16, 6,-10, -4,-10, 32, 32, -6,-36,-16, -4; /M: SY='K'; M=-12, -7,-33, -5, 7,-30,-20, -7,-26, 23,-26,-11, -5, 15, 13, 21, -8,-10,-24,-23,-15, 8; /M: SY='E'; M= -5, 1,-21, 8, 22,-21,-19,-10,-13, -2,-14,-13, -5,-11, 1, -8, 4, -3, -5,-32,-17, 12; /M: SY='E'; M= 6, 3,-19, 3, 22,-22,-13, -9,-21, -1,-18,-16, 0, -6, 5, -7, 14, 10,-15,-30,-18, 13; /M: SY='L'; M= 0,-27,-18,-28,-18, 5,-25,-20, 15,-27, 40, 15,-27,-27,-18,-20,-23, -8, 8,-20, -3,-18; /M: SY='D'; M= -8, 24,-23, 27, 11,-31, -7, 1,-27, -1,-28,-19, 21,-12, 12, -4, 13, 0,-25,-36,-18, 11; /M: SY='E'; M= -2, 12,-21, 19, 26,-27, -9, -5,-27, -1,-26,-22, 8, -6, 7, -6, 19, 4,-21,-36,-20, 16; /M: SY='I'; M=-12,-28,-30,-37,-28, 5,-38,-22, 42,-27, 17, 17,-20,-22,-18,-27,-20,-10, 24,-12, 13,-28; /M: SY='C'; M= 16,-17, 31,-27,-21, 0,-16,-23,-15,-21, -9,-11,-15,-24,-23,-23, -3, -5, -3,-24,-13,-21; /M: SY='H'; M=-11, 2,-27, 2, 16,-26,-20, 24,-25, 8,-20, -7, 3,-11, 19, 6, -1, -3,-24,-26, -4, 16; /M: SY='R'; M=-12, -4,-27, -5, 6,-26,-20, -2,-24, 22,-20, -7, 0,-14, 20, 33, -3, -1,-20,-22,-10, 11; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='D'; M= 3, 14,-19, 18, 14,-26,-10, -9,-24, -3,-21,-19, 6, -8, 1,-10, 13, 7,-16,-33,-18, 7; /M: SY='P'; M= -8, -8,-31, -2, 14,-26,-20,-15,-21, -5,-23,-18,-11, 46, -2,-13, -1, 2,-24,-30,-23, 4; /M: SY='N'; M=-13, 26,-26, 24, 20,-26,-10, 4,-28, 7,-26,-20, 27,-13, 7, 9, 2, -6,-28,-34,-18, 13; /M: SY='D'; M= -7, 19,-21, 20, 18,-25,-11, -4,-25, -1,-23,-20, 15, -9, 3, -6, 12, 9,-21,-35,-18, 11; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='W'; M= -9,-18,-19,-20,-15, -2,-17,-11, 2, -4, -1, 9,-16,-18, -7, 3,-14, -8, 4, 10, 1,-11; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='L'; M= -5,-22,-13,-22,-17, 5,-22,-17, 17,-20, 28, 13,-22,-22,-17,-15,-18, -5, 15,-17, -2,-17; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='N'; M= -5, 13,-15, 5, 0,-15, -8, -3,-15, 8,-18,-11, 20,-11, 0, 4, 5, 8,-14,-23,-11, 0; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='P'; M=-13,-17,-37,-10, 0,-27,-20,-15,-23, 1,-27,-17,-15, 60, -5, 5,-10,-10,-27,-27,-25, -7; /M: SY='H'; M=-17, -5,-27, -8, -5,-15,-20, 73,-16,-10, -9, 16, 2,-20, 7, -3,-13,-17,-19,-27, 15, -3; /M: SY='R'; M=-18, -6,-30, -6, 2,-22,-20, 18,-30, 26,-22, -8, 2,-18, 10, 48,-10,-12,-22,-22, -4, 2; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='M'; M= -7, 2,-15, -4, -3,-10, -9, 0, -5, 7, -6, 10, 6,-11, 2, 3, -5, -5, -7,-17, -6, -1; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='S'; M= 19, -3,-10, -7, -5,-18, -4,-15,-15,-10,-21,-15, 3,-10, -5,-13, 28, 20, -5,-33,-18, -5; /M: SY='M'; M=-12,-19,-29,-20, -2, -5,-26,-14, 6,-13, 8, 11,-19,-18, -5,-15,-19,-13, -3, 4, -1, -4; /M: SY='L'; M= -5,-19,-22,-22,-20, -6, -2,-22, 2,-23, 12, 3,-14,-22,-18,-20,-10, -1, 0,-22,-10,-20; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='T'; M= -5, -6,-16,-12,-15, -4,-15,-14, -1,-10, -8, -6, -2,-19,-13,-10, -4, 4, 3, 2, -4,-13; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='G'; M= 0, -5,-19, -8,-13,-19, 32,-16,-24,-13,-19,-13, 0,-13,-13,-13, 5, 3,-16,-19,-19,-13; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='N'; M= -5, 29,-17, 15, 0,-20, 0, 5,-20, -3,-30,-20, 46,-17, 0, -3, 18, 5,-25,-40,-20, 0; /M: SY='Y'; M=-17,-12,-30, -9, 2, 14,-27, 15, -8, -5, -5, -5,-15,-22, -2, -7,-15,-10,-15, 14, 53, -4; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='V'; M= -5,-27,-15,-27,-27, 8,-30,-16, 22,-17, 7, 7,-27,-30,-25,-17,-13, -3, 34,-14, 15,-27; /M: SY='N'; M=-13, 26,-23, 12, 0,-20, -5, 7,-23, 8,-27,-17, 44,-20, 3, 19, 5, -3,-27,-35,-17, 0; /M: SY='V'; M= 0,-22,-10,-25,-25, -3,-27,-27, 19,-17, 5, 5,-22,-25,-25,-17, -2, 14, 36,-30,-10,-25; /M: SY='I'; M=-13,-28,-25,-38,-28, 22,-33,-21, 30,-26, 17, 22,-20,-23,-22,-23,-20,-10, 18,-12, 8,-26; /M: SY='M'; M=-10,-25,-22,-32,-22, 3,-27,-11, 26,-19, 28, 41,-23,-23, -9,-17,-23,-10, 14,-20, 0,-17; /M: SY='A'; M= 13, -7,-19,-13, -3,-16,-14, -6,-11, -5,-11, -6, -7,-13, 9, -8, 5, 6,-10,-14, 0, 2; /M: SY='A'; M= 34, -7,-15,-15, -2,-25, -5,-12,-13, -5,-13, -7, -7,-10, 9,-12, 7, -3, -8,-20,-17, 4; /M: SY='L'; M=-10,-27,-25,-25,-15, -1,-27,-20, 9,-25, 28, 9,-27, 3,-17,-20,-25,-10, -1,-23, -8,-17; /M: SY='Q'; M= -5, 2,-25, 4, 22,-33,-15, 3,-22, 5,-23, -9, 3, -8, 36, 3, 11, -2,-25,-27,-15, 29; /M: SY='G'; M= -2, -6,-26, -8,-12,-28, 38,-15,-31,-13,-24,-15, 0,-16, -5,-13, 4, -4,-24,-22,-23, -9; /M: SY='R'; M=-12, 4,-26, -1, 1,-19,-16, -5,-19, 19,-15, -8, 11,-18, 2, 20, -8, -7,-18,-25,-11, 1; /M: SY='G'; M= -4, -5,-26,-11,-17,-20, 34,-10,-20,-14,-16, 2, 4,-20,-11,-14, -4,-14,-19,-23,-20,-14; /M: SY='D'; M=-15, 1, -5, 5, -5,-12,-23, -6,-18, -2, -9,-10, -7,-22, -8, -7,-13,-10,-14,-20, 4, -7; /M: SY='E'; M= 2, 16,-23, 23, 25,-29,-10, -5,-27, 0,-23,-21, 6, -6, 5, -8, 10, -2,-21,-33,-20, 15; /M: SY='A'; M= 29,-11,-10,-17,-11,-16, -6,-19, -5,-12,-12, -9, -8,-14,-11,-17, 14, 5, 7,-27,-18,-11; /M: SY='V'; M= 0,-25,-15,-25,-27, -8, -3,-27, 11,-20, -1, 2,-22,-27,-27,-20, -7, -5, 28,-27,-15,-27; /M: SY='W'; M=-20,-37,-42,-40,-30, 29,-23,-27,-15,-23,-12,-15,-35,-30,-25,-20,-35,-25,-22,112, 30,-23; /M: SY='W'; M=-20,-28,-33,-32,-24, 34,-24, 0,-13,-22, -7, -7,-22,-28,-23,-16,-25,-19,-17, 54, 28,-20; /M: SY='D'; M=-12, 36,-25, 51, 15,-35, -7, -3,-35, -3,-30,-27, 17,-10, 0,-10, 11, -2,-25,-40,-20, 7; /M: SY='R'; M=-13,-11,-30,-14, -4,-19,-25,-12, -8, 22,-13, -2, -5,-16, 2, 27,-13,-10, -6,-20, -7, -4; /M: SY='R'; M=-17, -7,-30, -7, 5,-25,-20, 3,-27, 25,-20, -7, 0,-17, 24, 54, -7,-10,-23,-20,-10, 11; /M: SY='R'; M=-13,-19,-25,-21,-14,-11,-27,-14, 2, 5, -4, 1,-12,-23, -7, 26,-12, -7, 9,-23, -8,-14; /M: SY='D'; M=-12, 4,-32, 11, -5,-25, -4,-16,-12,-14,-16,-13, -2, 2,-11,-19, -7,-12,-14,-29,-18,-10; /M: SY='A'; M= 9,-16,-16,-17,-11,-12,-14,-19, -1,-15, -4, -5,-14, -2,-13,-17, 4, 2, 4,-29,-16,-13; /M: SY='N'; M= -2, 9,-20, 3, -4,-22, 11, 11,-26, -9,-28,-17, 22,-16, -2, -8, 16, 0,-23,-34,-16, -4; /M: SY='A'; M= 12,-12, 7,-16,-10,-19,-14,-16, -9,-12,-13, -8,-10,-19, -3,-14, 7, 1, 1,-31,-18, -7; /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24, 6,-34,-24, 32,-30, 38, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 18,-20, 0,-24; /M: SY='B'; M= 10, 12,-21, 9, 3,-27, -7, -9,-23, 10,-23,-16, 10,-12, -1, -1, 3, -5,-16,-27,-17, 1; /M: SY='L'; M= -7,-30,-17,-30,-23, 7,-30,-23, 23,-27, 39, 17,-30,-30,-23,-20,-25, -7, 21,-23, -3,-23; /M: SY='W'; M=-10, -5,-30, -1, -6,-15,-15,-17,-22,-11,-23,-20, -9, 2, -9,-14, -2, 1,-21, 16, -6, -7; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='T'; M= -4, 3,-13, -3, -3,-13,-12, -5, -5, -3,-10, -4, 7,-12, 4, -3, 4, 8, -3,-22, -9, 0; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='L'; M= -6,-30,-18,-32,-25, 5,-32,-25, 28,-26, 30, 16,-28,-28,-24,-22,-21, -6, 28,-24, -4,-25; /M: SY='M'; M=-12,-15,-23,-18, 0, 6,-23, -7, 3,-11, 13, 22,-16,-18, -4,-11,-16,-10, -2,-18, -1, -1; /M: SY='G'; M= -3,-15,-27,-15,-20,-19, 43,-20,-24,-23, -8, -9, -8,-23,-20,-20, -8,-17,-19,-20,-22,-20; /M: SY='F'; M=-14,-30,-25,-38,-28, 30,-35,-25, 27,-30, 22, 13,-22,-25,-27,-25,-22,-10, 16, -9, 11,-28; /M: SY='I'; M= -8,-30,-23,-35,-27, 3,-35,-27, 38,-28, 26, 18,-25,-25,-22,-25,-21, -8, 28,-22, -2,-27; /M: SY='L'; M=-13,-28,-20,-33,-23, 27,-28,-16, 15,-26, 33, 23,-25,-28,-21,-18,-25,-10, 7,-12, 8,-21; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='V'; M= -1,-22,-14,-22,-18, -2,-22,-21, 13,-21, 14, 6,-19,-25,-18,-17, -4, 2, 19,-29, -9,-18; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='S'; M= 9, -5,-15, -4, 9,-19,-11,-13,-11, -7,-16,-13, -4,-11, -2,-11, 15, 5, -2,-32,-18, 3; /M: SY='Y'; M= -9, -9,-28, -7, 0,-13,-19, 0,-17, 5,-20, -9, -7, 2, 7, -1, -1, -4,-19,-12, 9, 1; /M: SY='M'; M=-10,-16,-23,-18, -7,-13,-24, -6, 1, -2, 6, 13,-14,-21, 9, 7,-13, -8, 0,-22, -6, 0; /M: SY='R'; M= -8,-11, 7,-13,-10,-10,-17, -5,-21, -3,-19,-13, -5,-23, -5, 8, 5, 0,-13,-23, 0,-10; /M: SY='L'; M=-10,-28,-28,-28,-22, 2, -8,-22, 0,-26, 20, 4,-26,-28,-20,-20,-26,-16, -6, 14, 0,-20; /M: SY='G'; M= -5,-10,-30,-10,-15,-27, 45,-15,-37, -6,-27,-17, 0,-20,-12, 5, -3,-17,-27,-20,-25,-15; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='I'; M=-10,-21,-24,-21,-15, 0,-25,-12, 13,-17, 8, 5,-18, 3,-12,-17,-16, -8, 2,-10, 7,-17; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='L'; M=-12, -1,-20, 5, -5, -2,-19, -4, -3,-13, 10, -1, -9,-19, -9,-12,-14, -8, -6,-14, 7, -8; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='P'; M= -5,-10,-23, -9, -3,-18,-16,-14, -7, 1,-16, -8, -7, 18, -4, -6, -1, -3, -9,-22,-14, -5; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='L'; M= -8,-24,-19,-27,-19, 5,-27,-19, 24,-24, 32, 16,-21,-21,-16,-19,-21, -8, 13,-16, 0,-19; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='P'; M=-10,-22, 8,-19,-12,-19,-25,-23,-15,-19,-12,-12,-22, 31,-17,-23,-14,-10,-17,-33,-24,-17; /M: SY='F'; M=-14,-13,-26,-20,-18, 13,-20,-14, -2,-20, 8, -2, -6,-27,-18,-15,-19,-11,-10, 13, 5,-16; /M: SY='R'; M=-18, -9,-30, -9, -3, -8,-23, 19,-22, 17,-17, -6, -4,-21, 5, 29,-13,-12,-19, -8, 19, -3; /M: SY='R'; M=-10, -7,-24, -8, 0,-20,-16, -5,-20, 21,-18, -1, -1,-15, 6, 31, -2, -4,-13,-24,-10, 1; /M: SY='R'; M=-15, -3,-30, 0, 20,-27,-20, 2,-28, 21,-20,-11, 0,-13, 23, 39, -5,-10,-25,-23,-13, 19; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='V'; M= -9,-30,-18,-35,-28, 23,-32,-26, 24,-26, 18, 11,-25,-28,-29,-22,-18, -6, 26,-16, 4,-28; /M: SY='C'; M= 14,-13, 16,-21,-18,-13,-17,-24, -6,-16, -8, -8,-13,-20,-18,-19, 5, 12, 8,-31,-17,-18; /M: SY='V'; M= -3,-30,-13,-30,-27, 3,-30,-27, 27,-23, 23, 13,-30,-30,-27,-20,-17, -3, 37,-27, -7,-27; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='K'; M=-12, 0,-30, 2, 20,-30,-20, -3,-28, 32,-25,-10, 0,-10, 21, 27, -6,-10,-24,-22,-12, 20; /M: SY='I'; M= -6,-30,-18,-32,-26, 4,-32,-26, 30,-26, 29, 16,-28,-28,-24,-22,-21, -6, 29,-24, -4,-26; /M: SY='G'; M= -7, 18,-26, 14, -6,-28, 31, -6,-33, -9,-30,-22, 25,-18, -9,-11, 4,-11,-30,-31,-25, -8; /M: SY='G'; M= -3, -7,-30, -7,-12,-30, 45,-17,-37, -1,-30,-17, 0,-17,-12, -6, -3,-17,-27,-20,-25,-12; /M: SY='A'; M= 7,-13,-19,-17, -8,-18,-18,-14, 4,-10, -7, 0,-10,-16, 5,-12, 3, -1, 5,-25,-12, -2; /M: SY='W'; M=-20,-29,-39,-29,-25, 21,-25, -3, -9,-15, -9, -9,-29,-30,-15,-15,-29,-19,-19, 86, 57,-20; /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-25,-23, 44,-30, 9, 0,-15, 3, 0,-20,-30,-18,-13,-20,-10, -7, 25, 66,-23; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='D'; M=-17, 47,-27, 56, 15,-35, -7, 3,-35, 0,-30,-27, 31,-13, 0, -7, 3, -7,-30,-40,-20, 7; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='K'; M=-12, 2,-27, 6, 4,-21,-21,-11,-18, 18, -8, -6, -4,-15, 0, 8,-13,-10,-14,-24, -9, 2; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='R'; M= -9, -9,-21,-12, -7,-15,-22,-13,-13, 13,-13, -6, -6,-17, -3, 22, -2, 8, -1,-25,-10, -7; /M: SY='G'; M= 5,-13,-21,-15, -8,-16, 6,-15, -7,-12, -7, 4,-12,-17,-10,-15, -4, -9, -1,-24,-17, -9; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='E'; M=-10, 6,-30, 13, 44,-32,-20, 0,-28, 16,-22,-14, 0, -4, 26, 7, -2,-10,-28,-26,-16, 35; /M: SY='L'; M= -2,-27, -2,-30,-22, 0,-23,-24, -1,-25, 15, 0,-27,-28,-20,-22,-22,-12, -3, 9, -2,-20; /M: SY='I'; M=-12,-30,-25,-37,-27, 19,-35,-25, 30,-30, 28, 16,-23,-25,-24,-25,-23,-10, 18,-14, 6,-27; /M: SY='G'; M= -1, -7,-25, -7,-11,-25, 33,-13,-33, -7,-28,-18, 3,-17, -9, 0, 9, -7,-23,-25,-23,-11; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='D'; M= -7, 16,-19, 22, 2,-22, 7, -7,-24, -6,-19,-17, 7, -9, -6, -9, 3, 0,-17,-23,-15, -2; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='E'; M= -9, 15,-22, 24, 36,-24,-13, 0,-24, 5,-17,-17, 4, -2, 11, -2, 0, -7,-22,-24,-15, 23; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='D'; M=-12, 32,-26, 45, 16,-36,-10, 0,-33, 0,-28,-23, 15,-10, 9, -7, 8, -4,-26,-37,-18, 13; /M: SY='E'; M= -6, 2,-25, 4, 21,-26, -5, -7,-25, -1,-19,-14, 0, -8, 11, -5, 5, 5,-22,-27,-17, 16; /M: SY='F'; M=-11,-27,-19,-29,-25, 23,-30,-13, 15,-21, 15, 8,-26,-30,-24,-17,-18, -6, 18, -5, 23,-25; /M: SY='R'; M=-16,-19,-26,-19, -9, -7,-24, -9, -8, 4, 10, 3,-13,-24, -3, 31,-19,-10, -7,-20, -6, -9; /M: SY='A'; M= 10, -3,-21, -6, 3,-24, 3,-15,-23, 3,-20,-14, -3,-10, -3, -5, 4, 1,-15,-23,-18, 0; /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27, 61,-30,-20, 5,-30, 21, 5,-23,-30,-35,-20,-23,-10, 3, 2, 22,-27; /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23, 29,-30,-20, 15,-30, 39, 15,-27,-30,-25,-20,-27,-10, 7,-12, 8,-23; /M: SY='A'; M= 8, -2,-21, -1, -3,-18,-14,-14,-12, -1, -2, -6, -8,-15, -7, -8, -7, -7, -7,-24,-13, -5; /M: SY='A'; M= 16, -7,-18,-13, -4,-17,-12, 1,-13, -6,-12, -6, -6,-13, 6,-10, 4, 3,-10,-17, -2, 0; /M: SY='Q'; M= -2, 6,-25, 0, 7,-29,-13, 23,-20, 1,-20, -6, 12,-14, 26, 1, 2, -8,-25,-26, -8, 16; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='Q'; M= 2, -4,-23, -5, 7,-29,-13, -1,-20, 7,-20, -8, 0,-12, 26, 13, 8, -2,-19,-24,-14, 16; /M: SY='Q'; M= -8,-11,-26,-13, -2,-22, -4, -4,-10, -7, -2, 9, -9,-18, 19, -5, -9,-12,-16,-20,-10, 8; /M: SY='D'; M=-12, 19,-30, 29, 22,-34, -1, -5,-35, 9,-27,-22, 7, -9, 4, -1, -2,-12,-28,-30,-20, 13; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='G'; M= -4, -6,-18,-10,-15,-10, 8,-13, -6,-15, -4, -4, 1,-21,-15,-13, -5, -7, -3,-23,-14,-15; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='C'; M=-14,-19, 26,-25,-23, -2,-30, 4, -6,-21, -7, -4,-15,-30,-16,-20,-15,-12, -5,-19, 14,-23; /M: SY='E'; M= -3, 3,-25, 9, 28,-27, 3, -7,-29, -1,-25,-20, 3, -7, 7, -7, 11, -4,-25,-31,-22, 17; /M: SY='L'; M= -8,-30,-21,-33,-24, 6,-33,-24, 30,-28, 35, 18,-27,-27,-22,-23,-24, -8, 22,-22, -2,-24; /M: SY='F'; M=-14,-30,-22,-36,-26, 38,-32,-22, 17,-30, 27, 11,-24,-28,-29,-22,-24,-10, 10, -7, 13,-26; /M: SY='L'; M= -9,-32,-23,-32,-25, 7,-28,-25, 15,-25, 25, 9,-32,-30,-23,-20,-27,-11, 13, 11, 3,-23; /M: SY='V'; M= -2,-16,-12,-20,-24, -4,-24,-22, 20,-16, 2, 4,-12,-28,-24,-16, -6, 0, 34,-32,-12,-24; /M: SY='V'; M= -6,-22,-19,-22,-16, -5,-27,-21, 10, -4, 13, 8,-22,-25,-16, -6,-17, -6, 17,-24, -6,-16; /M: SY='P'; M= -7, -3,-31, 3, -4,-28, 6,-17,-27,-11,-27,-20, -5, 27,-11,-17, -1, -2,-25,-29,-25,-10; /M: SY='E'; M=-15, 13,-30, 22, 25,-21,-19, 2,-27, 10,-21,-17, 2,-10, 7, 0, -6,-10,-24,-19, 1, 15; /M: SY='E'; M=-10, 5,-25, 6, 26,-17,-19, -3,-14, -3, -3, -9, 4,-12, 5, -5, -6, -8,-19,-29,-15, 16; /M: SY='P'; M= 7,-19,-18,-19,-15,-14,-20,-24, 2,-14, -8, -5,-19, 10,-17,-18, -1, 5, 10,-28,-17,-17; /M: SY='D'; M=-14, 33,-28, 42, 31,-32,-12, 2,-32, 4,-26,-24, 20, -8, 7, -4, 2, -8,-30,-36,-20, 19; /M: SY='C'; M= 2, -9, 39,-13, -1,-26,-20,-15,-24,-11,-18,-14,-11,-21, 0,-15, -2, -8,-15,-35,-22, 0; /M: SY='E'; M= -2, -5,-25, -4, 12,-18,-19, 11,-17, 1, -6, -5, -6,-13, 3, -3, -8,-10,-15,-25, -6, 7; /M: SY='P'; M= 7, 0,-27, 2, 1,-31, 3,-11,-24, -6,-23,-15, -4, 8, 4,-12, 1, -9,-22,-25,-22, 1; /M: SY='D'; M= -9, 4, 2, 8, -2,-21,-17,-13,-21, -5,-13,-13, -2,-19, -8, -9, -1, -4,-13,-35,-16, -5; /M: SY='W'; M= 1,-17,-30,-19, -8,-14,-13,-14,-18, -8,-20,-13,-15,-17, 7,-10, -7,-11,-21, 40, 1, 1; /M: SY='L'; M= -8,-15,-22,-15, -6,-10,-21, -9, -4, -8, 9, 3,-11,-21, 3, 5, -7, -4, -6,-24, -8, -3; /M: SY='N'; M= -2, 5,-20, -4, -4,-14,-13, -4, -7, -9, -3, -4, 13,-19, 2, -7, -2, 0,-13,-28,-12, -1; /M: SY='Q'; M=-14, 5,-27, 7, 4,-18,-20, 3,-20, 4,-16, -9, 0,-16, 14, 8, -2, 0,-19,-16, 6, 7; /M: SY='M'; M= -8,-20,-23,-22,-16, -6,-19,-12, -1, -6, -5, 10,-16,-22, -7, 2, -9, -6, 2, 1, -3,-12; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 18 in 18 different sequences |
| Number of true positive hits | 18 in 18 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Josephin |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
18 sequences
ATX3H_ARATH (Q9M391), ATX3L_HUMAN (Q9H3M9), ATX3_CAEBR (Q60XN1), ATX3_CAEEL (O17850), ATX3_CHICK (Q9W689), ATX3_HUMAN (P54252), ATX3_MOUSE (Q9CVD2), ATX3_ORYSJ (Q8LQ36), ATX3_RAT(O35815), JOS1_BOVIN (Q5EAE5), JOS1_HUMAN (Q15040), JOS1_MOUSE (Q9DBJ6), JOS1_PONAB (Q5R739), JOS1_RAT(Q5BJY4), JOS2_HUMAN (Q8TAC2), JOS2_MOUSE (Q9CR30), JOSL_ARATH (O82391), JOSL_DROME (Q9W422)» more
|
| PDB [Detailed view] |
6 PDB
1YZB; 2AGA; 2DOS; 2JRI; 3O65; 6PGV |