Entry: PS50965

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] NERD
Accession [info] PS50965
Entry type [info] MATRIX
Date [info] MAR-2004 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); OCT-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50965
Associated ProRule [info] PRU00327

Name and characterization of the entry

Description [info] NERD domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=118;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=113;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.9821622; R2=0.0271227; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6662.18810; R2=41.72649; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=204; N_SCORE=8.5; H_SCORE=11294; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=130; N_SCORE=6.5; H_SCORE=11294; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='K'; M=  1,-12,-22,-14, -6,-15,-18,-13, -8,  3, -7, -3,-10,-11, -3,  2, -4, -4, -5,-22, -8, -5;
/M: SY='G'; M= -3, -7,-27, -6,-13,-25, 38, -4,-30,-16,-24,-15, -1,-19,-14,-16,  0,-15,-21,-24,-20,-14;
/M: SY='N'; M= -5, -5,-22,-10, -6, -3,-16, -3,-10, -6,-12, -7,  1,-19, -4, -7,  0, -3,-10,-14,  1, -5;
/M: SY='E'; M= -5,  4,-26,  6,  9,-21,-17, -9,-16,  3,-17,-12,  0,-12,  2, -4, -3, -6,-14,-18, -9,  5;
/M: SY='G'; M=  6,-10,-24,-11, -8,-18, 24,-12,-23,-15,-16,-13, -5,-17,-13,-16,  0,-12,-16,-21,-18,-10;
/M: SY='E'; M=-10,  5,-21, 12, 47,-26,-21, -2,-25,  5,-15,-13, -4, -5, 14, -3, -3,-10,-25,-30,-18, 30;
/M: SY='R'; M=-13,-11,-25,-13, -6, -3,-21, -7,-11,  5, -1, -1, -5,-21, -3, 15,-12, -8,-10,-18, -1, -6;
/M: SY='R'; M= -2, -9,-25,-11, -5,-16,-18,-12, -9,  2, -8, -4, -6,-17,  1,  4, -6, -7, -9,-14, -8, -3;
/M: SY='V'; M=  1,-23,-10,-27,-23, -2,-22,-25, 13,-17,  6,  4,-21,-25,-22,-18,-10, -2, 22,-25, -9,-23;
/M: SY='A'; M=  9, -1,-21, -6, -4,-16, -3,-10,-15, -5,-14,-10,  3,-15, -3, -7,  2, -5,-12,-23,-15, -4;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='H'; M= -7, -6,-21, -9, -5,  0,-14,  4,-14, -7,-12, -8,  1,-18, -3, -1,  0, -3,-14,-12,  4, -4; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='Y'; M= -9,-18,-20,-21,-10,  3,-23, -8, -6, -8,  2,  3,-17,-18, -4, -4,-15,-10, -9, -3,  8, -8;
/M: SY='L'; M= -7,-29,-20,-32,-22, 10,-30,-22, 23,-28, 37, 17,-27,-27,-21,-22,-24, -9, 15,-19,  0,-22;
/M: SY='E'; M= -5,  0,-26,  1, 13,-25,-17,  5,-22, 10,-19,-10,  1,-11, 12, 12,  0, -7,-19,-26,-11, 11;
/M: SY='R'; M=-11, -4,-28, -4, 11,-20,-17, -7,-19, 16,-16, -8, -2,-14,  9, 17, -8,-10,-16,-22,-11,  9;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='Y'; M= -9,-11,-17,-10, -4, -4,-22, -5, -6, -8,  5, -1,-14,-20, -8, -9,-15,-10, -6, -9,  6, -7; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='L'; M=-12,-16,-23,-15,-11,  6,-26,-13,  5,-18, 17,  5,-17,-24,-14,-12,-17, -8,  2,-17,  5,-13;
/M: SY='P'; M= -4,-10,-28, -7,  3,-24,-13,-13,-19,  0,-23,-12, -8, 29, -2, -6,  0, -2,-20,-28,-21, -2;
/M: SY='D'; M= -7, 10,-17, 15,  7,-26, -8, -2,-25, -4,-18,-13,  3,-14,  3, -8,  1, -5,-19,-31,-15,  4;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='D'; M= -9,  9,-26, 12,  8,-25, -4, -3,-24,  3,-22,-15,  7,-12,  0,  0,  1, -5,-19,-28,-15,  3; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='Y'; M= -8,-17,-10,-19,-15,  7,-23,  0, -5,-12, -6, -5,-16,-19,-11,-14,-11, -8, -8,  8, 31,-15; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='H'; M= -8,-10,-21,-10, -5, -7,-12,  5,-12, -4, -6, -3, -6,-18, -5,  1, -5, -6, -8,-20, -1, -6; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
/M: SY='I'; M= -3,-19,-20,-26,-20,  4,-25,-19, 16,-16,  8,  6,-13,-21,-17,-11,-12, -6, 14,-19, -3,-20; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='F'; M=-14,-30,-23,-34,-25, 29,-31,-19, 15,-27, 25, 10,-25,-29,-25,-20,-24,-10,  8,  0, 16,-25;
/M: SY='H'; M=-10, -3,-22, -7, -8, -4,-17, 38,-16,-12,-14, -4,  6,-21, -5, -7, -2, -6,-13,-24,  9, -8;
/M: SY='B'; M=-12, 29,-26, 28,  3,-27, -1, -2,-24, -5,-27,-21, 28,-10, -4, -9,  4, -6,-25,-36,-20, -1;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='L'; M= -5,-18,-19,-20,-17,  4,-23,-19, 11,-20, 13,  5,-16,-16,-19,-18,-12, -5, 10,-22, -5,-18; D=-11;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='R'; M= -9,-11,-21,-12, -3, -7,-22, -5, -7, -4,  0, -2, -8,-17, -4,  6, -5,  4, -5,-20, -1, -5; D=-11;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='I'; M=-11,-21,-22,-26,-20,  7,-27,-15, 17,-18, 17, 12,-15,-24,-16,-11,-18, -8, 11,-17,  3,-19; D=-11;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='P'; M= -8,-11,-21,-10, -3, -5,-17, -8, -5, -3, -9, -5, -9, 13, -5, -5, -7, -4, -9,-10,  0, -7; D=-11;
/I:         I=-11; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
/M: SY='E'; M= -4,  7,-22,  9, 12,-24, -3, -9,-21, -4,-18,-15,  3,-11,  1, -8,  3,  0,-15,-28,-18,  6; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='Q'; M= -5, -1,-25, -2,  4,-19,-17,  4,-15, -2,-14, -7,  2, -9,  8, -2,  0, -3,-16,-24, -6,  4;
/M: SY='D'; M= -8,  4,-27,  7,  4,-21,-11, -1,-24,  2,-23,-16,  4,  1, -1,  1,  1, -3,-21,-25, -8,  0;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='G'; M= -3,  8,-24,  8, -5,-25, 22,-11,-27,-11,-20,-17,  8,-16,-10,-13,  1, -7,-22,-26,-21, -7; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
/M: SY='E'; M= -6,  1,-26,  3, 12,-26, -4,  4,-26,  6,-22,-11,  1,-11, 11,  1, -1, -7,-23,-22,-10, 11; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='T'; M=  0,-11,-16,-15,-11, -5,-16,-17,  0,-14, -4, -4, -8,-16,-13,-14,  5, 14,  5,-23, -6,-12; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='F'; M= -1,-14,-18,-21,-14, 10,-19,-14, -7, -7, -4, -2, -9,-18,-13,  2, -3,  6, -2,-14,  0,-13; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='Q'; M=-10,  6,-29,  6, 26,-36,-18,  8,-22,  9,-21, -6,  6, -9, 46,  7,  1, -9,-30,-24,-13, 36;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-22,-36,-29,  1,-35,-28, 40,-26, 20, 18,-24,-24,-22,-25,-18, -7, 33,-23, -3,-28;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='H'; M= -8, -8,-25, -9, -7,-14,-15, 49,-16,-14, -9,  0, -1,-20, -1, -8, -8,-13,-15,-25,  9, -7;
/M: SY='L'; M= -7,-30,-12,-32,-26,  3,-32,-26, 27,-27, 28, 15,-27,-28,-23,-23,-21, -7, 25,-24, -4,-26;
/M: SY='V'; M= -6,-29,-18,-33,-27,  7,-32,-25, 29,-25, 24, 17,-27,-27,-24,-22,-19, -6, 30,-22, -2,-26;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-19,-33,-27,  3,-33,-27, 32,-26, 26, 16,-27,-27,-24,-23,-19, -6, 31,-24, -4,-27;
/M: SY='S'; M=  7, -2,-16, -8, -8,-14, -4, -2,-15,-11,-14,-10,  3,-15, -7,-12, 11, 10,-10,-27, -9, -8;
/M: SY='P'; M= -4, -5,-27, -3,  6,-25,-14,-10,-23,  5,-26,-17, -1, 18,  1,  4,  4,  0,-21,-29,-20,  1;
/M: SY='Y'; M=-11, -7,-18, -9, -6,-10,-12,  4,-20, -2,-17,-11, -2,-19, -4,  4, -2, -1,-17, -9,  7, -7;
/M: SY='G'; M=  2, -8,-26,-10,-13,-18, 38,-17,-29,-16,-21,-14, -3,-18,-16,-18,  0,-12,-21,-19,-21,-14;
/M: SY='I'; M= -8,-28,-21,-32,-23,  5,-33,-25, 30,-25, 24, 15,-25,-25,-22,-22,-19, -7, 25,-22, -2,-24;
/M: SY='F'; M=-16,-26,-17,-31,-26, 35,-30, -9,  9,-22, 10,  7,-22,-29,-23,-18,-20, -9,  5,  3, 32,-25;
/M: SY='V'; M= -4,-30,-16,-33,-29,  4,-32,-28, 32,-23, 15, 14,-27,-27,-27,-22,-14, -3, 40,-25, -5,-29;
/M: SY='I'; M= -7,-29,-21,-33,-27,  4,-34,-25, 33,-26, 24, 16,-26,-26,-23,-23,-20, -7, 29,-20,  1,-27;
/M: SY='E'; M= -7, 13,-28, 22, 50,-30,-17, -1,-30,  7,-21,-20,  2, -2, 15, -3,  2, -8,-28,-31,-20, 33;
/M: SY='T'; M=  1,-10,-14,-17,-13, -9,-20,-19,  3,-13, -3,  0, -8,-15, -9,-13,  8, 21,  8,-28,-10,-12;
/M: SY='K'; M= -7, -1,-29, -1,  8,-29,-19, -4,-29, 43,-28, -9,  0,-11,  9, 26, -9,-10,-19,-21, -9,  8;
/M: SY='N'; M=  0, 10,-13,  4, -5,-23, 10, -8,-25, -5,-28,-19, 19,-16, -5, -8, 14,  3,-20,-34,-21, -5;
/M: SY='Y'; M=-15,-29,-29,-34,-26, 25,-31,-16, 13,-23, 11,  5,-25,-28,-22,-20,-24,-13,  4, 23, 28,-25;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='S'; M=  2, -2,-17, -3,  0,-18,-11,  0,-14, -2,-15, -7,  1,-12,  0, -5, 10,  4, -9,-29,-10, -1; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='G'; M= -1, -7,-28, -8,-16,-28, 58,-17,-36,-14,-28,-18,  3,-18,-16,-15,  0,-17,-28,-20,-27,-16; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='T'; M= -6, -2,-24, -3, -2,-13,-12,-13,-18,  0,-18,-13, -2, -8, -5, -2,  0,  2,-15,-10, -9, -4; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='V'; M= -8,-23,-19,-25,-23,  9,-30,-20, 22,-21, 14,  9,-22,-25,-22,-20,-16, -6, 23,-16,  5,-24; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='Y'; M= -7, -9,-22,-12, -4, -5,-21, -7, -2, -8,  0, -2, -6,-17, -3, -4, -5,  0, -5,-16,  4, -5; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='V'; M= -1,-16,-20,-19,-20, -7,  3,-12, -3,-18, -7, -3,-11,-21,-18,-17, -4, -6,  5,-20, -7,-20; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='D'; M= -9, 14,-24, 16,  9,-23, -2, -3,-27,  1,-23,-18, 12,-12,  1,  0,  4, -2,-22,-27,-14,  4; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='E'; M= -1, -6,-17, -4,  7,-14,-13, -9, -9,  2, -8, -6, -7,  0, -1, -3, -2, -3, -7,-19,-11,  3; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='E'; M= -9,  5,-20,  6,  7,-11,-12,  7,-20,  5,-17,-10,  7,-11,  3,  4,  0, -5,-17,-21, -5,  5; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='G'; M=  3, -3,-23, -3, -8,-19, 21,-11,-23,-13,-15,-13, -1,-17,-11,-15,  0,-10,-18,-20,-14,-10; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='E'; M=  1,  4,-19,  5, 16,-22, -7, -7,-19,  0,-17,-13,  2, -8,  4, -5,  6,  1,-14,-26,-16, 10; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='W'; M=-15,-22,-32,-24,-16, 10,-21, -7,-12, -8, -9, -5,-19,-23, -8, -4,-20,-15,-16, 44, 19,-11; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='W'; M=-13,-15,-30,-14,-12, -2,-21,-18, -8,-13, -8, -9,-17,-20,-11,-12,-16, -9,-10, 32,  5,-10; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='R'; M=-12, -9, -9,-14,-11, -4,-16, -3,-14, -5, -6, -3, -4,-21, -6,  6, -7, -1,-11,-20, -2, -9; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='Q'; M= -9,  0,-25, -2,  3,-18,-18, -9,-15,  2,-16,-10,  0, -7,  4, -2, -3,  2,-17, -9, -8,  3; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M:         M= -1,-11,-23,-13,-12,-14, -1, -9,-12,-11,-10, -5, -8,-17, -7, -9, -3, -4,-10, -7, -8,-10; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='D'; M= -7,  2,-17,  6, -2,-13,-14, -9, -3, -1, -7, -5, -2, -5, -5, -5, -5, -5, -1,-18, -8, -4; D=-5;
/I:         I=-5; MI=-11; MD=-11; IM=-11; DM=-11;
/M: SY='G'; M= -6, -6,-21, -6, -8,-12,  4, -5,-15, -6,-12, -7, -2,-17, -4, -4, -3, -8,-11,-18, -8, -6; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='R'; M= -9, -3,-22, -5, -3,-15, -8,  5,-17,  5,-12, -6,  3,-15,  2, 10, -4, -5,-15,-19, -4, -1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='R'; M= -9,  0,-22, -5, -2,-17,-11, -5,-15,  9,-15, -8,  8,-15,  3, 18, -1, -3,-14,-23,-11, -1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='K'; M= -8, -7,-27, -8, -1,-16,-10, -9,-21,  8,-20,-11, -6, -9,  1,  4, -4, -2,-18, -3, -2,  0; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='H'; M=-10, -5,-23, -7,  1,-11,-20,  8,-12, -3,-11, -6, -1,-17, -1,  3, -1,  0, -9,-23,  1, -2;
/M: SY='G'; M=  0, -1,-24,  0,  5,-25, 10,-10,-25, -3,-20,-12,  0,-12, -1, -6,  4, -4,-19,-26,-19,  2;
/M: SY='F'; M=-12,-27,-22,-33,-25, 21,-31,-14, 21,-24, 18, 18,-22,-26,-21,-20,-20, -9, 15,-12, 10,-24;
/M: SY='P'; M=-13, -8,-33, -2,  1,-22,-17, -6,-19, -3,-19,-12,-10, 25,  4, -4, -9,-10,-24,-20, -8,  0;
/M: SY='N'; M= -6, 22,-19, 14,  0,-18, -4,  3,-21, -2,-27,-19, 33,-17,  0, -1, 15,  4,-22,-34,-13, -1;
/M: SY='P'; M= -9,-15,-27, -6, -2,-28,-19,-19,-19,-11,-27,-19,-16, 64,-11,-19, -7, -8,-23,-32,-28,-10;
/M: SY='I'; M= -9,-22,-21,-25,-21,  7,-30,-23, 21,-25, 21, 10,-20,-24,-21,-21,-16, -5, 17,-21, -1,-22;
/M: SY='H'; M= -4,-11,-24,-14, -7,-10,-15,  9,-11, -8, -4,  0, -7,-13, -6, -6, -8, -6,-10,-22, -3, -8;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-35,-20,  4,-21, 15,-19, -3, -1,-10, 44, 11, -3,-10,-26,-21,-10, 32;
/M: SY='N'; M=  5,  0,-17, -7, -7,-14,-13,-12, -2, -9,-10, -7,  6,-14,-11,-12,  2, -1,  1,-31,-17, -9;
/M: SY='R'; M=-11,  1,-18, -2,  4,-16,-17,  7,-23, 11,-21,-12,  6,-17,  3, 15, -4, -7,-20,-21,  0,  2;
/M: SY='R'; M= -7, -9,-18,-12, -7,-18, -7, -8,-24, 12,-18, -8, -4,-19, -1, 25, -6, -6,-16,-20, -9, -6;
/M: SY='H'; M=-13,  0,-25, -4,  0,-20,-18, 30,-16, -1,-13,  1,  7,-18, 14,  4, -5, -8,-18,-27, -1,  5;
/M: SY='A'; M= 18,-16,-14,-21,-14,-11,-16,-22,  8,-15, -1, -1,-14,-17,-14,-19,  2,  2, 14,-25,-13,-15;
/M: SY='R'; M= -6, -1,-26, -1,  2,-24,-17, -7,-20, 18,-19, -7,  0,-14,  6, 21, -3, -6,-14,-24,-12,  2;
/M: SY='A'; M=  2,-14,-21,-18,-10, -7,-19,-11,  1,-11,  2,  0,-11,-20, -9,-12, -8, -6,  1,-14, -5,-10;
/M: SY='L'; M=-10,-25,-21,-28,-21,  9,-29,-20, 21,-27, 37, 16,-22,-28,-20,-20,-24, -9, 12,-21, -1,-21;
/M: SY='Q'; M= -1,  0,-25,  0,  9,-25,-11, -2,-23,  8,-17,-10, -1,-12, 10,  9,  0, -6,-18,-24,-13,  9;
/M: SY='E'; M=  1, -2,-25, -1,  9,-25,  0, -7,-27,  7,-25,-16, -1,-11,  2, -1,  4, -6,-21,-18,-15,  6;
/M: SY='L'; M=-12,-28,-24,-29,-21, 12,-29,-16, 12,-20, 22,  9,-27,-28,-19,-16,-25,-11,  7,  4, 14,-20;
/M: SY='L'; M= -8,-25,-21,-28,-19,  2,-28,-19, 19,-23, 29, 16,-21,-24,-15,-16,-18, -5, 11,-22, -3,-19;
/M: SY='E'; M= -1,  0,-18,  0, 15,-26, -2, -9,-26,  3,-20,-14,  0,-12,  4, -4,  0, -9,-21,-27,-19,  9;
/M: SY='Q'; M= -9, -1,-24, -1,  2,-16,-20, -1,-15,  5,-16, -7, -1,-14,  6,  0,  0,  0,-12,-22, -3,  3;
/M: SY='N'; M=-13, 12,-26,  9, 13,-23,-14, 11,-23,  9,-19,-12, 18,-15,  9, 10, -3, -8,-25,-30,-11, 10;
/M: SY='L'; M= -7,-17,-24,-18,-13, -8,-13,-17,  7,-19,  8,  4,-15,-21,-10,-17,-12, -9,  4,-21, -6,-13;
/M: SY='P'; M= -2,-13,-29,-12, -1,-17,-19,-15,-12, -8,-13,-11,-13, 23, -7,-14, -8, -6,-16,-15,-12, -6;
/M: SY='V'; M= -8,-18, -8,-23,-18, -4,-29,-20, 13,-13,  0,  3,-13,-23,-17,-15,-12, -7, 15,-24, -5,-19;
/M: SY='I'; M= -7,-11,-24,-10,-10,-10,-19, -6,  3,-14,  3,  1,-11,-20,-11,-15,-11, -9,  2,-24, -3,-12;
/M: SY='S'; M=  0, -7, -6, -9, -4,-19,-14,-14,-14, -7,-17,-10, -4, -1, -7,-11,  8,  4, -9,-33,-19, -6;
/M: SY='V'; M= -1,-14,-15,-16,-12, -7,-22,-13,  4, -9,  3,  5,-16,-20,-11,-12,-11, -7,  6,-19, -1,-12;
/M: SY='V'; M=  9,-22,-16,-25,-23, -9,-13,-26, 13,-15,  0,  3,-20,-22,-21,-18, -6, -4, 25,-25,-13,-23;
/M: SY='V'; M= -3,-22,-13,-24,-21, -3,-21,-15, 10,-20,  1,  2,-18,-18,-20,-20, -8, -5, 15,-24, -5,-22;
/M: SY='F'; M=-15,-29,-25,-37,-28, 37,-32,-20, 17,-26, 13,  9,-22,-27,-27,-22,-21,-11, 10,  6, 20,-27;
/M: SY='N'; M= -5,  6,-13,  1, -7,-20, -4, -6,-18, -9,-17,-13,  9,-13, -8,-11,  3,  2,-15,-31,-16, -8;
/M: SY='N'; M= -5,  9,-25,  8, -2,-27, 13, -7,-28, -6,-29,-19, 15, -5, -2, -7,  9, -5,-26,-31,-23, -3;
/M: SY='K'; M= -6, -3,-29, -1,  3,-27,-11,-10,-23, 10,-23,-13, -2,  9,  5,  3, -3, -7,-22,-26,-17,  3;
/M: SY='C'; M=  2,-13, 16,-19,-15,-17,-14,-18,-12,-11,-13, -7, -9,-21,-12, -9,  1, -1, -4,-31,-17,-14;
/M:         M= -7, -8,-24, -9,  0,-11,-19,-13,-11, -4,-12, -9, -7,-11, -3, -5, -3, -1, -8,-11, -9, -1;
/M: SY='F'; M=-11,-18,-22,-20,-13, 11,-26,-17,  5,-14,  6,  2,-15,-23,-16, -5,-12, -7,  6,-18,  0,-15;
/M: SY='T'; M= -6, -9,-22,-13, -9,-13,-24,-18,  3, -2, -8, -2, -5,-10, -9, -7, -4,  5,  5,-27,-11,-10;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_11 which contains 547'085 sequence entries.


Total number of hits 1
Number of true positive hits 1
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] NERD
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
1 sequence

Y6003_BACAN (Q8KYT4)

			
		

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission