PROSITE entry PS50965
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | NERD |
| Accession [info] | PS50965 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-MAR-2004 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50965 |
| Associated ProRule [info] | PRU00327 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | NERD domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=118; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=113; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.9821622; R2=0.0271227; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=204; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=130; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='K'; M= 1,-12,-22,-14, -6,-15,-18,-13, -8, 3, -7, -3,-10,-11, -3, 2, -4, -4, -5,-22, -8, -5; /M: SY='G'; M= -3, -7,-27, -6,-13,-25, 38, -4,-30,-16,-24,-15, -1,-19,-14,-16, 0,-15,-21,-24,-20,-14; /M: SY='N'; M= -5, -5,-22,-10, -6, -3,-16, -3,-10, -6,-12, -7, 1,-19, -4, -7, 0, -3,-10,-14, 1, -5; /M: SY='E'; M= -5, 4,-26, 6, 9,-21,-17, -9,-16, 3,-17,-12, 0,-12, 2, -4, -3, -6,-14,-18, -9, 5; /M: SY='G'; M= 6,-10,-24,-11, -8,-18, 24,-12,-23,-15,-16,-13, -5,-17,-13,-16, 0,-12,-16,-21,-18,-10; /M: SY='E'; M=-10, 5,-21, 12, 47,-26,-21, -2,-25, 5,-15,-13, -4, -5, 14, -3, -3,-10,-25,-30,-18, 30; /M: SY='R'; M=-13,-11,-25,-13, -6, -3,-21, -7,-11, 5, -1, -1, -5,-21, -3, 15,-12, -8,-10,-18, -1, -6; /M: SY='R'; M= -2, -9,-25,-11, -5,-16,-18,-12, -9, 2, -8, -4, -6,-17, 1, 4, -6, -7, -9,-14, -8, -3; /M: SY='V'; M= 1,-23,-10,-27,-23, -2,-22,-25, 13,-17, 6, 4,-21,-25,-22,-18,-10, -2, 22,-25, -9,-23; /M: SY='A'; M= 9, -1,-21, -6, -4,-16, -3,-10,-15, -5,-14,-10, 3,-15, -3, -7, 2, -5,-12,-23,-15, -4; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='H'; M= -7, -6,-21, -9, -5, 0,-14, 4,-14, -7,-12, -8, 1,-18, -3, -1, 0, -3,-14,-12, 4, -4; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='Y'; M= -9,-18,-20,-21,-10, 3,-23, -8, -6, -8, 2, 3,-17,-18, -4, -4,-15,-10, -9, -3, 8, -8; /M: SY='L'; M= -7,-29,-20,-32,-22, 10,-30,-22, 23,-28, 37, 17,-27,-27,-21,-22,-24, -9, 15,-19, 0,-22; /M: SY='E'; M= -5, 0,-26, 1, 13,-25,-17, 5,-22, 10,-19,-10, 1,-11, 12, 12, 0, -7,-19,-26,-11, 11; /M: SY='R'; M=-11, -4,-28, -4, 11,-20,-17, -7,-19, 16,-16, -8, -2,-14, 9, 17, -8,-10,-16,-22,-11, 9; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='Y'; M= -9,-11,-17,-10, -4, -4,-22, -5, -6, -8, 5, -1,-14,-20, -8, -9,-15,-10, -6, -9, 6, -7; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='L'; M=-12,-16,-23,-15,-11, 6,-26,-13, 5,-18, 17, 5,-17,-24,-14,-12,-17, -8, 2,-17, 5,-13; /M: SY='P'; M= -4,-10,-28, -7, 3,-24,-13,-13,-19, 0,-23,-12, -8, 29, -2, -6, 0, -2,-20,-28,-21, -2; /M: SY='D'; M= -7, 10,-17, 15, 7,-26, -8, -2,-25, -4,-18,-13, 3,-14, 3, -8, 1, -5,-19,-31,-15, 4; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='D'; M= -9, 9,-26, 12, 8,-25, -4, -3,-24, 3,-22,-15, 7,-12, 0, 0, 1, -5,-19,-28,-15, 3; D=-12; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='Y'; M= -8,-17,-10,-19,-15, 7,-23, 0, -5,-12, -6, -5,-16,-19,-11,-14,-11, -8, -8, 8, 31,-15; D=-12; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='H'; M= -8,-10,-21,-10, -5, -7,-12, 5,-12, -4, -6, -3, -6,-18, -5, 1, -5, -6, -8,-20, -1, -6; D=-12; /I: I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; /M: SY='I'; M= -3,-19,-20,-26,-20, 4,-25,-19, 16,-16, 8, 6,-13,-21,-17,-11,-12, -6, 14,-19, -3,-20; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='F'; M=-14,-30,-23,-34,-25, 29,-31,-19, 15,-27, 25, 10,-25,-29,-25,-20,-24,-10, 8, 0, 16,-25; /M: SY='H'; M=-10, -3,-22, -7, -8, -4,-17, 38,-16,-12,-14, -4, 6,-21, -5, -7, -2, -6,-13,-24, 9, -8; /M: SY='B'; M=-12, 29,-26, 28, 3,-27, -1, -2,-24, -5,-27,-21, 28,-10, -4, -9, 4, -6,-25,-36,-20, -1; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='L'; M= -5,-18,-19,-20,-17, 4,-23,-19, 11,-20, 13, 5,-16,-16,-19,-18,-12, -5, 10,-22, -5,-18; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='R'; M= -9,-11,-21,-12, -3, -7,-22, -5, -7, -4, 0, -2, -8,-17, -4, 6, -5, 4, -5,-20, -1, -5; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='I'; M=-11,-21,-22,-26,-20, 7,-27,-15, 17,-18, 17, 12,-15,-24,-16,-11,-18, -8, 11,-17, 3,-19; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='P'; M= -8,-11,-21,-10, -3, -5,-17, -8, -5, -3, -9, -5, -9, 13, -5, -5, -7, -4, -9,-10, 0, -7; D=-11; /I: I=-11; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23; /M: SY='E'; M= -4, 7,-22, 9, 12,-24, -3, -9,-21, -4,-18,-15, 3,-11, 1, -8, 3, 0,-15,-28,-18, 6; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='Q'; M= -5, -1,-25, -2, 4,-19,-17, 4,-15, -2,-14, -7, 2, -9, 8, -2, 0, -3,-16,-24, -6, 4; /M: SY='D'; M= -8, 4,-27, 7, 4,-21,-11, -1,-24, 2,-23,-16, 4, 1, -1, 1, 1, -3,-21,-25, -8, 0; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='G'; M= -3, 8,-24, 8, -5,-25, 22,-11,-27,-11,-20,-17, 8,-16,-10,-13, 1, -7,-22,-26,-21, -7; D=-12; /I: I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; /M: SY='E'; M= -6, 1,-26, 3, 12,-26, -4, 4,-26, 6,-22,-11, 1,-11, 11, 1, -1, -7,-23,-22,-10, 11; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='T'; M= 0,-11,-16,-15,-11, -5,-16,-17, 0,-14, -4, -4, -8,-16,-13,-14, 5, 14, 5,-23, -6,-12; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='F'; M= -1,-14,-18,-21,-14, 10,-19,-14, -7, -7, -4, -2, -9,-18,-13, 2, -3, 6, -2,-14, 0,-13; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='Q'; M=-10, 6,-29, 6, 26,-36,-18, 8,-22, 9,-21, -6, 6, -9, 46, 7, 1, -9,-30,-24,-13, 36; /M: SY='I'; M= -7,-30,-22,-36,-29, 1,-35,-28, 40,-26, 20, 18,-24,-24,-22,-25,-18, -7, 33,-23, -3,-28; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='H'; M= -8, -8,-25, -9, -7,-14,-15, 49,-16,-14, -9, 0, -1,-20, -1, -8, -8,-13,-15,-25, 9, -7; /M: SY='L'; M= -7,-30,-12,-32,-26, 3,-32,-26, 27,-27, 28, 15,-27,-28,-23,-23,-21, -7, 25,-24, -4,-26; /M: SY='V'; M= -6,-29,-18,-33,-27, 7,-32,-25, 29,-25, 24, 17,-27,-27,-24,-22,-19, -6, 30,-22, -2,-26; /M: SY='I'; M= -6,-30,-19,-33,-27, 3,-33,-27, 32,-26, 26, 16,-27,-27,-24,-23,-19, -6, 31,-24, -4,-27; /M: SY='S'; M= 7, -2,-16, -8, -8,-14, -4, -2,-15,-11,-14,-10, 3,-15, -7,-12, 11, 10,-10,-27, -9, -8; /M: SY='P'; M= -4, -5,-27, -3, 6,-25,-14,-10,-23, 5,-26,-17, -1, 18, 1, 4, 4, 0,-21,-29,-20, 1; /M: SY='Y'; M=-11, -7,-18, -9, -6,-10,-12, 4,-20, -2,-17,-11, -2,-19, -4, 4, -2, -1,-17, -9, 7, -7; /M: SY='G'; M= 2, -8,-26,-10,-13,-18, 38,-17,-29,-16,-21,-14, -3,-18,-16,-18, 0,-12,-21,-19,-21,-14; /M: SY='I'; M= -8,-28,-21,-32,-23, 5,-33,-25, 30,-25, 24, 15,-25,-25,-22,-22,-19, -7, 25,-22, -2,-24; /M: SY='F'; M=-16,-26,-17,-31,-26, 35,-30, -9, 9,-22, 10, 7,-22,-29,-23,-18,-20, -9, 5, 3, 32,-25; /M: SY='V'; M= -4,-30,-16,-33,-29, 4,-32,-28, 32,-23, 15, 14,-27,-27,-27,-22,-14, -3, 40,-25, -5,-29; /M: SY='I'; M= -7,-29,-21,-33,-27, 4,-34,-25, 33,-26, 24, 16,-26,-26,-23,-23,-20, -7, 29,-20, 1,-27; /M: SY='E'; M= -7, 13,-28, 22, 50,-30,-17, -1,-30, 7,-21,-20, 2, -2, 15, -3, 2, -8,-28,-31,-20, 33; /M: SY='T'; M= 1,-10,-14,-17,-13, -9,-20,-19, 3,-13, -3, 0, -8,-15, -9,-13, 8, 21, 8,-28,-10,-12; /M: SY='K'; M= -7, -1,-29, -1, 8,-29,-19, -4,-29, 43,-28, -9, 0,-11, 9, 26, -9,-10,-19,-21, -9, 8; /M: SY='N'; M= 0, 10,-13, 4, -5,-23, 10, -8,-25, -5,-28,-19, 19,-16, -5, -8, 14, 3,-20,-34,-21, -5; /M: SY='Y'; M=-15,-29,-29,-34,-26, 25,-31,-16, 13,-23, 11, 5,-25,-28,-22,-20,-24,-13, 4, 23, 28,-25; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='S'; M= 2, -2,-17, -3, 0,-18,-11, 0,-14, -2,-15, -7, 1,-12, 0, -5, 10, 4, -9,-29,-10, -1; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='G'; M= -1, -7,-28, -8,-16,-28, 58,-17,-36,-14,-28,-18, 3,-18,-16,-15, 0,-17,-28,-20,-27,-16; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='T'; M= -6, -2,-24, -3, -2,-13,-12,-13,-18, 0,-18,-13, -2, -8, -5, -2, 0, 2,-15,-10, -9, -4; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='V'; M= -8,-23,-19,-25,-23, 9,-30,-20, 22,-21, 14, 9,-22,-25,-22,-20,-16, -6, 23,-16, 5,-24; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='Y'; M= -7, -9,-22,-12, -4, -5,-21, -7, -2, -8, 0, -2, -6,-17, -3, -4, -5, 0, -5,-16, 4, -5; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='V'; M= -1,-16,-20,-19,-20, -7, 3,-12, -3,-18, -7, -3,-11,-21,-18,-17, -4, -6, 5,-20, -7,-20; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='D'; M= -9, 14,-24, 16, 9,-23, -2, -3,-27, 1,-23,-18, 12,-12, 1, 0, 4, -2,-22,-27,-14, 4; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='E'; M= -1, -6,-17, -4, 7,-14,-13, -9, -9, 2, -8, -6, -7, 0, -1, -3, -2, -3, -7,-19,-11, 3; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='E'; M= -9, 5,-20, 6, 7,-11,-12, 7,-20, 5,-17,-10, 7,-11, 3, 4, 0, -5,-17,-21, -5, 5; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='G'; M= 3, -3,-23, -3, -8,-19, 21,-11,-23,-13,-15,-13, -1,-17,-11,-15, 0,-10,-18,-20,-14,-10; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='E'; M= 1, 4,-19, 5, 16,-22, -7, -7,-19, 0,-17,-13, 2, -8, 4, -5, 6, 1,-14,-26,-16, 10; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='W'; M=-15,-22,-32,-24,-16, 10,-21, -7,-12, -8, -9, -5,-19,-23, -8, -4,-20,-15,-16, 44, 19,-11; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='W'; M=-13,-15,-30,-14,-12, -2,-21,-18, -8,-13, -8, -9,-17,-20,-11,-12,-16, -9,-10, 32, 5,-10; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='R'; M=-12, -9, -9,-14,-11, -4,-16, -3,-14, -5, -6, -3, -4,-21, -6, 6, -7, -1,-11,-20, -2, -9; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='Q'; M= -9, 0,-25, -2, 3,-18,-18, -9,-15, 2,-16,-10, 0, -7, 4, -2, -3, 2,-17, -9, -8, 3; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: M= -1,-11,-23,-13,-12,-14, -1, -9,-12,-11,-10, -5, -8,-17, -7, -9, -3, -4,-10, -7, -8,-10; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='D'; M= -7, 2,-17, 6, -2,-13,-14, -9, -3, -1, -7, -5, -2, -5, -5, -5, -5, -5, -1,-18, -8, -4; D=-5; /I: I=-5; MI=-11; MD=-11; IM=-11; DM=-11; /M: SY='G'; M= -6, -6,-21, -6, -8,-12, 4, -5,-15, -6,-12, -7, -2,-17, -4, -4, -3, -8,-11,-18, -8, -6; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='R'; M= -9, -3,-22, -5, -3,-15, -8, 5,-17, 5,-12, -6, 3,-15, 2, 10, -4, -5,-15,-19, -4, -1; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='R'; M= -9, 0,-22, -5, -2,-17,-11, -5,-15, 9,-15, -8, 8,-15, 3, 18, -1, -3,-14,-23,-11, -1; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='K'; M= -8, -7,-27, -8, -1,-16,-10, -9,-21, 8,-20,-11, -6, -9, 1, 4, -4, -2,-18, -3, -2, 0; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='H'; M=-10, -5,-23, -7, 1,-11,-20, 8,-12, -3,-11, -6, -1,-17, -1, 3, -1, 0, -9,-23, 1, -2; /M: SY='G'; M= 0, -1,-24, 0, 5,-25, 10,-10,-25, -3,-20,-12, 0,-12, -1, -6, 4, -4,-19,-26,-19, 2; /M: SY='F'; M=-12,-27,-22,-33,-25, 21,-31,-14, 21,-24, 18, 18,-22,-26,-21,-20,-20, -9, 15,-12, 10,-24; /M: SY='P'; M=-13, -8,-33, -2, 1,-22,-17, -6,-19, -3,-19,-12,-10, 25, 4, -4, -9,-10,-24,-20, -8, 0; /M: SY='N'; M= -6, 22,-19, 14, 0,-18, -4, 3,-21, -2,-27,-19, 33,-17, 0, -1, 15, 4,-22,-34,-13, -1; /M: SY='P'; M= -9,-15,-27, -6, -2,-28,-19,-19,-19,-11,-27,-19,-16, 64,-11,-19, -7, -8,-23,-32,-28,-10; /M: SY='I'; M= -9,-22,-21,-25,-21, 7,-30,-23, 21,-25, 21, 10,-20,-24,-21,-21,-16, -5, 17,-21, -1,-22; /M: SY='H'; M= -4,-11,-24,-14, -7,-10,-15, 9,-11, -8, -4, 0, -7,-13, -6, -6, -8, -6,-10,-22, -3, -8; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-35,-20, 4,-21, 15,-19, -3, -1,-10, 44, 11, -3,-10,-26,-21,-10, 32; /M: SY='N'; M= 5, 0,-17, -7, -7,-14,-13,-12, -2, -9,-10, -7, 6,-14,-11,-12, 2, -1, 1,-31,-17, -9; /M: SY='R'; M=-11, 1,-18, -2, 4,-16,-17, 7,-23, 11,-21,-12, 6,-17, 3, 15, -4, -7,-20,-21, 0, 2; /M: SY='R'; M= -7, -9,-18,-12, -7,-18, -7, -8,-24, 12,-18, -8, -4,-19, -1, 25, -6, -6,-16,-20, -9, -6; /M: SY='H'; M=-13, 0,-25, -4, 0,-20,-18, 30,-16, -1,-13, 1, 7,-18, 14, 4, -5, -8,-18,-27, -1, 5; /M: SY='A'; M= 18,-16,-14,-21,-14,-11,-16,-22, 8,-15, -1, -1,-14,-17,-14,-19, 2, 2, 14,-25,-13,-15; /M: SY='R'; M= -6, -1,-26, -1, 2,-24,-17, -7,-20, 18,-19, -7, 0,-14, 6, 21, -3, -6,-14,-24,-12, 2; /M: SY='A'; M= 2,-14,-21,-18,-10, -7,-19,-11, 1,-11, 2, 0,-11,-20, -9,-12, -8, -6, 1,-14, -5,-10; /M: SY='L'; M=-10,-25,-21,-28,-21, 9,-29,-20, 21,-27, 37, 16,-22,-28,-20,-20,-24, -9, 12,-21, -1,-21; /M: SY='Q'; M= -1, 0,-25, 0, 9,-25,-11, -2,-23, 8,-17,-10, -1,-12, 10, 9, 0, -6,-18,-24,-13, 9; /M: SY='E'; M= 1, -2,-25, -1, 9,-25, 0, -7,-27, 7,-25,-16, -1,-11, 2, -1, 4, -6,-21,-18,-15, 6; /M: SY='L'; M=-12,-28,-24,-29,-21, 12,-29,-16, 12,-20, 22, 9,-27,-28,-19,-16,-25,-11, 7, 4, 14,-20; /M: SY='L'; M= -8,-25,-21,-28,-19, 2,-28,-19, 19,-23, 29, 16,-21,-24,-15,-16,-18, -5, 11,-22, -3,-19; /M: SY='E'; M= -1, 0,-18, 0, 15,-26, -2, -9,-26, 3,-20,-14, 0,-12, 4, -4, 0, -9,-21,-27,-19, 9; /M: SY='Q'; M= -9, -1,-24, -1, 2,-16,-20, -1,-15, 5,-16, -7, -1,-14, 6, 0, 0, 0,-12,-22, -3, 3; /M: SY='N'; M=-13, 12,-26, 9, 13,-23,-14, 11,-23, 9,-19,-12, 18,-15, 9, 10, -3, -8,-25,-30,-11, 10; /M: SY='L'; M= -7,-17,-24,-18,-13, -8,-13,-17, 7,-19, 8, 4,-15,-21,-10,-17,-12, -9, 4,-21, -6,-13; /M: SY='P'; M= -2,-13,-29,-12, -1,-17,-19,-15,-12, -8,-13,-11,-13, 23, -7,-14, -8, -6,-16,-15,-12, -6; /M: SY='V'; M= -8,-18, -8,-23,-18, -4,-29,-20, 13,-13, 0, 3,-13,-23,-17,-15,-12, -7, 15,-24, -5,-19; /M: SY='I'; M= -7,-11,-24,-10,-10,-10,-19, -6, 3,-14, 3, 1,-11,-20,-11,-15,-11, -9, 2,-24, -3,-12; /M: SY='S'; M= 0, -7, -6, -9, -4,-19,-14,-14,-14, -7,-17,-10, -4, -1, -7,-11, 8, 4, -9,-33,-19, -6; /M: SY='V'; M= -1,-14,-15,-16,-12, -7,-22,-13, 4, -9, 3, 5,-16,-20,-11,-12,-11, -7, 6,-19, -1,-12; /M: SY='V'; M= 9,-22,-16,-25,-23, -9,-13,-26, 13,-15, 0, 3,-20,-22,-21,-18, -6, -4, 25,-25,-13,-23; /M: SY='V'; M= -3,-22,-13,-24,-21, -3,-21,-15, 10,-20, 1, 2,-18,-18,-20,-20, -8, -5, 15,-24, -5,-22; /M: SY='F'; M=-15,-29,-25,-37,-28, 37,-32,-20, 17,-26, 13, 9,-22,-27,-27,-22,-21,-11, 10, 6, 20,-27; /M: SY='N'; M= -5, 6,-13, 1, -7,-20, -4, -6,-18, -9,-17,-13, 9,-13, -8,-11, 3, 2,-15,-31,-16, -8; /M: SY='N'; M= -5, 9,-25, 8, -2,-27, 13, -7,-28, -6,-29,-19, 15, -5, -2, -7, 9, -5,-26,-31,-23, -3; /M: SY='K'; M= -6, -3,-29, -1, 3,-27,-11,-10,-23, 10,-23,-13, -2, 9, 5, 3, -3, -7,-22,-26,-17, 3; /M: SY='C'; M= 2,-13, 16,-19,-15,-17,-14,-18,-12,-11,-13, -7, -9,-21,-12, -9, 1, -1, -4,-31,-17,-14; /M: M= -7, -8,-24, -9, 0,-11,-19,-13,-11, -4,-12, -9, -7,-11, -3, -5, -3, -1, -8,-11, -9, -1; /M: SY='F'; M=-11,-18,-22,-20,-13, 11,-26,-17, 5,-14, 6, 2,-15,-23,-16, -5,-12, -7, 6,-18, 0,-15; /M: SY='T'; M= -6, -9,-22,-13, -9,-13,-24,-18, 3, -2, -8, -2, -5,-10, -9, -7, -4, 5, 5,-27,-11,-10; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 2 in 2 different sequences |
| Number of true positive hits | 2 in 2 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | NERD |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
2 sequences
PGLW_STRCO (O86560), Y6003_BACAN (Q8KYT4)
|