Entry: PS50968
General information about the entry
Entry nameBIOTINYL_LIPOYL
Accession numberPS50968
Entry typeMATRIX
DateMAR-2004 (CREATED); MAR-2004 (DATA UPDATE); DEC-2011 (INFO UPDATE).
PROSITE DocumentationPDOC50968
Name and characterization of the entry
DescriptionBiotinyl/lipoyl domain profile.
Matrix / Profile
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=74;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=69;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.6180778; R2=0.0116383; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=420; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=248; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-40; I=-40; B0=-300; B1=-300; E0=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M:         M= -4, -3,-23, -6, -3,-14,-12, -6,-11, -4,-14, -8,  0,-12, -4, -8,  0,  0, -8,-24, -8, -4;
/M: SY='E'; M= -8,  6,-26, 12, 18,-28,-18, -7,-20,  2,-19,-14, -2,  1, 10, -5,  0, -1,-17,-29,-17, 13;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-20,-36,-28, 23,-33,-25, 26,-27, 18, 14,-24,-27,-27,-23,-19, -7, 24,-15,  5,-28;
/M: SY='K'; M= -7, -9,-24,-11, -5,-18,-13,-15,-15, 10,-14, -7, -6,-11, -4, 10, -4,  1, -8,-24,-12, -6;
/M: SY='A'; M= 10,-12,-14,-16, -9, -5,-12,-14, -4,-13, -4,  1, -8,-16, -9,-14,  8,  5,  2,-25,-10, -9;
/M: SY='P'; M= -6,-17,-36,-10, -2,-28,-14,-20,-20,-11,-28,-19,-16, 72,-10,-19, -5, -6,-27,-30,-28,-10;
/M: SY='M'; M= -1,  1,-21,  0, -1,-17,-15, -7, -6, -7, -4,  9, -5,-14,  0,-11, -3, -2, -5,-27,-11, -1;
/M: SY='I'; M=  1,-20,-22,-23,-13, -4,-22,-19,  7,-17,  2,  3,-18, -2,-13,-19, -9, -6,  5,-22, -9,-14;
/M: SY='G'; M=  3,-11,-28,-12,-18,-27, 51,-20,-31,-19,-26,-17, -2,-14,-18,-20,  1,-15,-24,-22,-27,-18;
/M: SY='E'; M= -5, -4,-23, -2, 16,-20,-21,-12,-12,  3,-13,-10, -6, -5,  1, -4,  1,  3, -8,-29,-15,  8;
/M: SY='V'; M= -1,-16,-18,-19,-16,  1, -6,-18, -3,-18, -4, -4,-12,-21,-18,-17,  0,  0,  4,-21, -5,-17;
/M: SY='I'; M= -6,-25,-21,-28,-25,  2,-25,-20, 21,-20,  8, 10,-21,-24,-19,-20,-12, -3, 21,-12,  5,-24;
/M: SY='E'; M=  1,  1,-23,  1, 10,-24,-15,  4,-23,  9,-20,-11,  1,-10,  7,  5,  3,  0,-17,-26,-11,  8;
/I:         I=-8; MD=-21;
/M: SY='E'; M= -2,  4,-16,  8, 19,-15, -9, -2,-16,  4,-13,-11,  1, -4,  6, -1,  4, -2,-14,-17, -7, 12; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-21;
/M: SY='G'; M=  1, -4,-15, -4, -9,-16, 24,-10,-18,-10,-17,-11,  2, -8, -9,-10,  5, -5,-13,-17,-16, -9; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-21;
/M: SY='T'; M=  1, -1,-10, -3, -2,-11,  0, -9,-12, -1,-11, -7,  0, -6, -3, -3,  6,  9, -7,-15, -9, -2; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='V'; M= -4,-12,-13,-13,-12, -1,-12,-15, 10,-13,  2,  2,-11,-14,-14,-13, -7, -5, 13,-15, -5,-13; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-21;
/M: SY='A'; M=  6,-11,-12,-14, -9, -6,-12,-14,  3, -8, -1, -1,-10,-11, -9,-10, -2,  0,  6, -7, -6, -9; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-21;
/M: SY='E'; M= -4, -1,-17,  1,  9,-17, -7, -4,-17,  8,-15, -9,  0, -3,  7,  7,  2, -1,-14,-17,-10,  8; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-21;
/M: SY='W'; M=-10,-30,-31,-30,-24,  1,-24,-25,  4,-19, -7, -5,-28,-16,-20,-20,-19,-12,  3, 40,  7,-22;
/M: SY='L'; M=-10,-14,-23,-18, -9,  4,-23, -5, -2, -9,  6,  4,-11,-21, -7, -5,-12, -5, -5,-15,  6, -9;
/M: SY='V'; M=  0,-22,-16,-23,-20, -3,-25,-22, 12, -5,  0,  3,-21,-24,-20, -9, -9, -3, 26,-22, -4,-20;
/M: SY='K'; M=  1, -2,-23, -3,  8,-25,-16, -5,-22, 19,-22,-10, -2,-11,  8, 11,  1, -3,-14,-24,-12,  8;
/M: SY='A'; M=  4,-10,-20, -7, -1,-18,-18,-18, -3,-10,-11, -8,-12,  1,-10,-16,  0, -3,  4,-30,-18, -7;
/M: SY='G'; M=  0, -8,-30, -9,-19,-30, 67,-19,-39,-19,-30,-20,  3,-20,-19,-19,  0,-19,-30,-21,-30,-19;
/M: SY='D'; M= -9, 26,-27, 38, 17,-34, -2, -4,-33, -2,-27,-23, 11,-10,  4, -9,  6, -7,-26,-34,-20, 11;
/M: SY='K'; M= -4, -5,-23, -6,  1,-20,-19, -2,-16,  6,-18, -8, -4, -3,  3,  0,  2,  4,-11,-25, -8,  1;
/M: SY='V'; M= -3,-30,-14,-32,-30,  4,-32,-29, 32,-22, 12, 11,-28,-28,-29,-22,-12, -2, 44,-26, -6,-30;
/M: SY='E'; M=  1,  3,-22,  1, 13,-20,-13, -6,-21,  8,-21,-12,  4,-10,  7,  1,  6,  0,-17,-27,-14, 10;
/M: SY='E'; M= 10, -4,-22, -5, 12,-24,-15,-11,-16,  9,-16,-10, -5, -9,  6,  1,  0, -4,-11,-23,-15,  8;
/M: SY='G'; M= -7,  6,-29, 10, -9,-25, 38,-12,-36,-14,-27,-21,  6,-18,-14,-16, -1,-16,-28,-23,-20,-12;
/M: SY='E'; M=-13, 17,-29, 25, 29,-35,-17,  2,-29,  7,-22,-15,  6, -8, 25,  4,  0, -7,-28,-29,-16, 27;
/M: SY='V'; M= -2,-17,-21,-16,-10,-13,-17,-18, -2,-11, -7, -5,-15,  1,-11,-11, -3,  0,  3,-26,-13,-12;
/M: SY='I'; M= -9,-29,-21,-32,-25,  7,-33,-21, 28,-26, 28, 16,-26,-27,-21,-22,-22, -8, 23,-18,  5,-25;
/M: SY='C'; M=  5,-23, 24,-29,-24, -5,-24,-25,  1,-24,  6, -1,-22,-28,-24,-23,-11, -6, 10,-29,-14,-24;
/M: SY='V'; M= -7,-10,-24, -8,  7,-14,-27,-17,  7,-10, -2, -2,-12,-14, -6,-14, -7, -4,  9,-28,-12, -1;
/M: SY='I'; M= -6,-29,-19,-33,-27,  3,-32,-26, 33,-25, 24, 18,-27,-27,-23,-22,-19, -6, 31,-24, -4,-26;
/M: SY='E'; M= -7,  7,-27, 14, 46,-28,-17, -1,-26,  7,-20,-15,  0, -3, 20, -1,  4, -6,-26,-30,-18, 33;
/M: SY='A'; M= 22, -6,-11,-15,-11,-15,-10,-19, -7,-11,-10, -9, -4,-12,-10,-15, 14, 18,  2,-26,-15,-11;
/M: SY='M'; M=-15, 12,-25, 16, -1,-19,-15,  0, -8, -5, -3, 18, -1,-15,  0,-10,-11,-10, -9,-29, -9, -1;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='M'; M=  3,-18,-14,-24,-18, -5,-19,-14, 12,-14,  9, 22,-17,-20,-11,-15, -5,  2, 16,-25, -8,-15;
/M: SY='E'; M= -7,  2,-23,  1, 13,-17,-17, -5,-11, -3,-13, -6,  3,-12,  8, -6,  3, -2,-12,-28,-12, 10;
/M: SY='M'; M= -3, -5,-17,-15,-14, -9,-17, -2,  5,-11, -1, 13,  0,-19, -7,-11, -3,  3,  4,-28, -7,-12;
/M: SY='E'; M= -7,  1,-25,  6, 25,-23,-20, -9,-15, -1,-15,-13, -4, -1,  6, -7,  2, -1,-13,-30,-17, 15;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-21,-34,-27,  3,-34,-26, 36,-26, 25, 19,-25,-25,-22,-24,-20, -7, 30,-23, -3,-27;
/M: SY='P'; M= -6, -4,-25, -2,  9,-21,-18,-12,-17, -3,-18,-14, -4, 18, -2, -7,  3,  5,-17,-30,-19,  2;
/M: SY='A'; M= 29, -6,-10,-11, -6,-19, -2,-16,-13,-11,-18,-14, -2,-11, -6,-15, 23,  9, -2,-30,-19, -6;
/M: SY='P'; M= -8, -7,-33,  0,  8,-28,-15, -9,-22, -3,-22,-16, -9, 35,  0, -8, -5, -9,-25,-29,-21,  1;
/M: SY='V'; M=  2,-10,-19,-11, -5, -8,-18,-13, -5, -3, -8, -3,-11,-17, -6, -8, -2, -3,  3,-22, -6, -5;
/M: SY='D'; M=  5, 11,-19, 12,  4,-24, -9,-10,-21, -2,-21,-17,  6,-11, -2, -6, 12,  4,-13,-32,-17,  1;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/I:         I=-12; MD=-32;
/M: SY='T'; M= -5,-11,-17,-14, -9,-10,-23,-17, -2,  1, -7, -3,-10,-17, -9,  1,  0, 12,  9,-24, -7,-10; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='I'; M= -8,-29,-23,-35,-27,  0,-35,-27, 37,-25, 19, 16,-23,-24,-22,-22,-18, -7, 31,-23, -3,-27;
/M: SY='E'; M=  0, -8,-21, -9,  2,-18,-15, -9,-10,  2,-13, -7, -7,-15, -2,  0,  0, -1, -2,-26,-13, -1;
/M: SY='E'; M= -4, -1,-25,  1, 17,-24, -8, -5,-23,  8,-20,-12, -1,-10, 12,  1,  3, -6,-21,-23,-12, 14;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-22,-34,-27,  3,-34,-27, 36,-27, 25, 17,-26,-26,-23,-24,-20, -7, 30,-23, -3,-27;
/M:         M= -1,-13, -7,-16,-12,-10,-16, -6, -6,-12,  0,  0,-10,-22,-11,-10, -7, -6, -1,-26, -7,-12;
/M: SY='V'; M=  2,-18,-14,-20,-16,-12,-19,-14,  3, -6, -5,  0,-15,-22,-12, -7, -7, -6, 12,-23, -7,-15;
/M: SY='E'; M=-10,  8,-29, 12, 16,-29,-12, -6,-28, 13,-26,-17,  5,  4,  6,  5, -1, -6,-25,-29,-18, 10;
/I:         I=-12; MD=-32;
/M: SY='E'; M= -1,  5,-19,  6, 14,-19,-14, -7,-12, -1,-12,-11,  3,-11,  0, -6,  0, -4, -8,-28,-15,  7; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='G'; M= -1,  0,-29,  1,-14,-30, 55,-16,-38,-16,-29,-21,  5,-18,-16,-18,  1,-17,-29,-23,-28,-15;
/M: SY='D'; M= -6, 21,-24, 29, 11,-31, -8, -4,-28, -1,-23,-17,  8,-10,  6, -7,  5, -2,-21,-32,-17,  8;
/M: SY='T'; M=  0, -9,-17,-13, -5,-10,-19,-16, -4, -6, -6, -2, -8,-15, -6, -8,  4, 12,  2,-26,-10, -5;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='V'; M=  1,-28,-14,-30,-27,  0,-29,-28, 28,-22, 15, 11,-27,-27,-26,-21,-12, -3, 38,-27, -8,-27;
/M: SY='E'; M= -7,  5,-25,  9, 13,-24,-10, -2,-22, -2,-18,-13,  0, -8,  6, -6,  1, -4,-19,-27,-12,  9;
/M: SY='V'; M=  5,-15,-16,-16,-14,-11,-13,-19,  3,-11, -6, -3,-14,-20,-14,-14,  0,  0, 13,-25,-10,-14;
/M: SY='G'; M= -2, -2,-29, -1,-12,-30, 54,-16,-38,-16,-30,-21,  5,-18,-15,-17,  2,-16,-29,-24,-28,-13;
/M: SY='D'; M=-12, 16,-20, 23, 18,-32,-14, -4,-27,  2,-22,-16,  5,-11, 13, -4,  1, -4,-24,-31,-17, 15;
/M: SY='I'; M= -7,-24,-23,-23,-15, -7,-28,-22, 13,-17,  9,  6,-23,  0,-17,-18,-15, -5, 13,-26,-11,-18;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-23,-34,-25,  5,-33,-24, 33,-28, 33, 21,-26,-26,-20,-23,-24, -9, 22,-21, -1,-24;
/M: SY='A'; M= 12,-20,-11,-25,-19,  1,-10,-20, -1,-18,  1,  1,-17,-16,-19,-20, -6, -6,  5,-19, -9,-19;
/M: SY='K'; M= -8, -5,-24, -4,  4,-18,-21,-10,-16, 16,-14, -7, -6,-15,  0, 13, -6, -2, -8,-22, -6,  1;
/M: SY='I'; M= -9,-29,-25,-34,-25,  2,-34,-26, 36,-29, 27, 18,-22,-23,-20,-25,-20, -8, 22,-21, -1,-25;
/I:         E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;
Numerical results
  • UniProtKB/Swiss-Prot release number: 01, total number of sequence entries in that release: 534242.
  • Total number of hits in UniProtKB/Swiss-Prot: 207 hits in 192 different sequences
  • Number of hits on proteins that are known to belong to the set under consideration: 207 hits in 192 different sequences
  • Number of hits on proteins that could potentially belong to the set under consideration: 0 hits in 0 different sequences
  • Number of false hits (on unrelated proteins): 0 hits in 0 different sequences
  • Number of known missed hits: 0
  • Number of partial sequences which belong to the set under consideration, but which are not hit by the pattern or profile because they are partial (fragment) sequences: 5
  • Precision (true hits / (true hits + false positives)): 100.00 %
  • Recall (true hits / (true hits + false negatives)): 100.00 %
Comments
  • MATRIX_TYPE: protein_domain
  • Scaling database: UniProtKB/Swiss-Prot: reversed
  • Matrix author: N_Hulo
  • Taxonomic range: Archaebacteria, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
  • Maximum known number of repetitions of the pattern in a single protein: 3
  • FT_KEY: DOMAIN
  • FT_DESC: Biotinyl/lipoyl
  • VERSION: 1
Cross-references
UniProtKB/Swiss-ProtTrue positive hits:
2OCL_HYDTT  (D3DJ41), ACACA_BOVIN (Q9TTS3), ACACA_HUMAN (Q13085), 
ACACA_MOUSE (Q5SWU9), ACACA_RAT   (P11497), ACACA_SHEEP (Q28559), 
ACACB_HUMAN (O00763), ACAC_CHICK  (P11029), ACAC_DICDI  (Q54J08), 
ACAC_SCHPO  (P78820), ACAC_YEAST  (Q00955), ACC1_ARATH  (Q38970), 
ACC1_ORYSJ  (Q8S6N5), ACC2_ARATH  (F4I1L3), ACC2_ORYSJ  (B9FK36), 
ACOC_BACSU  (O31550), ACOC_CUPNH  (P27747), ACOC_PSEPU  (Q59695), 
BCCA_MYCBO  (P0A509), BCCA_MYCLE  (P46392), BCCA_MYCTU  (P0A508), 
BCCP1_ARATH (Q42533), BCCP2_ARATH (Q9LLC1), BCCP_BACSU  (P49786), 
BCCP_CHLMU  (Q9PKR5), BCCP_CHLPN  (Q9Z901), BCCP_CHLTR  (O84125), 
BCCP_CYACA  (O19918), BCCP_ECO57  (P0ABE0), BCCP_ECOL6  (P0ABD9), 
BCCP_ECOLI  (P0ABD8), BCCP_HAEIN  (P43874), BCCP_NOSS1  (Q06881), 
BCCP_PORPU  (P51283), BCCP_PORYE  (Q1XDK5), BCCP_PROFR  (P02904), 
BCCP_PSEAE  (P37799), BCCP_SHIFL  (P0ABE1), BCCP_SOLLC  (P05115), 
BCCP_SOYBN  (Q42783), BCCP_STRMU  (P29337), BCCP_STRP6  (Q5XAE6), 
BLAP_BACSU  (C0H419), BTB7_MYCBO  (P0A511), BTB7_MYCLE  (Q9CCH9), 
BTB7_MYCS2  (Q9XCD6), BTB7_MYCTU  (P0A510), DCOA_KLEPN  (P13187), 
DCOA_SALTI  (Q8XGX8), DCOA_SALTY  (Q03030), DUR1_LACKL  (A5H0J2), 
DUR1_YEAST  (P32528), GCDC_ACIFV  (Q9ZAA7), GCSH2_SULSO (Q97Z69), 
GCSH_BIFLO  (Q8G4Z7), GCSH_DEIRA  (Q9RTF3), GCSH_PYRAB  (Q9V0G1), 
GCSH_PYRFU  (Q8U0U0), GCSH_PYRHO  (O59049), HFA1_YEAS1  (B3LM95), 
HFA1_YEAS2  (C7GRE4), HFA1_YEAS7  (A6ZMR9), HFA1_YEAS8  (C8ZF72), 
HFA1_YEAST  (P32874), LAMA_EMENI  (P38095), MCCA_ARATH  (Q42523), 
MCCA_DICDI  (Q54KE6), MCCA_HUMAN  (Q96RQ3), MCCA_MOUSE  (Q99MR8), 
MCCA_ORYSJ  (Q2QMG2), MCCA_RAT    (Q5I0C3), MCCA_SOYBN  (Q42777), 
ODB2_BACSU  (P37942), ODB2_BOVIN  (P11181), ODB2_HUMAN  (P11182), 
ODB2_MOUSE  (P53395), ODB2_PSEAE  (Q9I1M0), ODB2_PSEPU  (P09062), 
ODO2A_ARATH (Q9FLQ4), ODO2B_ARATH (Q8H107), ODO2_AZOVI  (P20708), 
ODO2_BACSU  (P16263), ODO2_BARQU  (Q6FYD4), ODO2_BARVB  (Q8GCY1), 
ODO2_BOVIN  (P11179), ODO2_BUCAI  (P57389), ODO2_BUCAP  (Q8K9N2), 
ODO2_BUCBP  (Q89AJ6), ODO2_CUPNH  (P52993), ODO2_DICDI  (Q869Y7), 
ODO2_ECO57  (P0AFG7), ODO2_ECOLI  (P0AFG6), ODO2_HAEIN  (P45302), 
ODO2_HUMAN  (P36957), ODO2_MOUSE  (Q9D2G2), ODO2_MYCBO  (P65634), 
ODO2_MYCTU  (P65633), ODO2_PIG    (Q9N0F1), ODO2_PSEAE  (Q9I3D2), 
ODO2_RAT    (Q01205), ODO2_RICBR  (Q1RHI5), ODO2_RICCN  (Q92J43), 
ODO2_RICFE  (Q4UKI7), ODO2_RICPR  (Q9ZDY4), ODO2_RICTY  (Q68XI8), 
ODO2_SCHPO  (O94681), ODO2_STAA3  (Q2FH26), ODO2_STAA8  (Q2FYM2), 
ODO2_STAAB  (Q2YY06), ODO2_STAAC  (Q5HG07), ODO2_STAAM  (Q99U75), 
ODO2_STAAN  (Q7A5N4), ODO2_STAAR  (Q6GGZ6), ODO2_STAAS  (Q6G9E9), 
ODO2_STAAW  (Q8NWR7), ODO2_STAEQ  (Q5HPC7), ODO2_STAES  (Q8CSL9), 
ODO2_STAHJ  (Q4L6C3), ODO2_STAS1  (Q49XM4), ODO2_TAKRU  (Q90512), 
ODO2_YEAST  (P19262), ODP2_ACHLA  (P35489), ODP2_AZOVI  (P10802), 
ODP2_BACSU  (P21883), ODP2_BUCAI  (P57302), ODP2_BUCAP  (Q8K9T8), 
ODP2_BUCBP  (Q89AQ9), ODP2_CAEEL  (Q19749), ODP2_CUPNH  (Q59098), 
ODP2_DICDI  (P36413), ODP2_ECOLI  (P06959), ODP2_GEOSE  (P11961), 
ODP2_HAEIN  (P45118), ODP2_HUMAN  (P10515), ODP2_LEIXX  (Q6ABX9), 
ODP2_MOUSE  (Q8BMF4), ODP2_MYCCT  (Q49110), ODP2_MYCGE  (P47514), 
ODP2_MYCPN  (P75392), ODP2_NEUCR  (P20285), ODP2_PSEAE  (Q59638), 
ODP2_RAT    (P08461), ODP2_RHIME  (Q9R9N3), ODP2_RICBR  (Q1RJT3), 
ODP2_RICCN  (Q92HK7), ODP2_RICFE  (Q4ULG1), ODP2_RICPR  (Q9ZD20), 
ODP2_RICTY  (Q68WK6), ODP2_SCHPO  (O59816), ODP2_STAAC  (Q5HGY9), 
ODP2_STAAM  (P65635), ODP2_STAAN  (P65636), ODP2_STAAR  (Q6GHZ0), 
ODP2_STAAS  (Q6GAB9), ODP2_STAAU  (Q59821), ODP2_STAAW  (Q8NX76), 
ODP2_STAEQ  (Q5HQ74), ODP2_STAES  (Q8CT13), ODP2_YEAST  (P12695), 
ODP2_ZYMMO  (O66119), ODPB_RHIME  (Q9R9N4), ODPB_ZYMMO  (O66113), 
ODPX_BOVIN  (P22439), ODPX_HUMAN  (O00330), ODPX_MOUSE  (Q8BKZ9), 
ODPX_SCHPO  (O94709), ODPX_YEAST  (P16451), OPD21_ARATH (Q0WQF7), 
OPD22_ARATH (Q8RWN9), OPD23_ARATH (Q5M729), PCCA_CAEBR  (Q612F5), 
PCCA_CAEEL  (Q19842), PCCA_HUMAN  (P05165), PCCA_MOUSE  (Q91ZA3), 
PCCA_RAT    (P14882), PYC1_CAEEL  (O17732), PYC1_YEAST  (P11154), 
PYC2_YEAST  (P32327), PYCB_METJA  (Q58628), PYCB_METTH  (O27179), 
PYC_ASPNG   (Q9HES8), PYC_ASPTE   (O93918), PYC_ASPTN   (Q0CLK1), 
PYC_BACSU   (Q9KWU4), PYC_BOVIN   (Q29RK2), PYC_HUMAN   (P11498), 
PYC_MOUSE   (Q05920), PYC_PICAN   (Q8X1T3), PYC_PICPA   (P78992), 
PYC_RAT     (P52873), PYC_SCHPO   (Q9UUE1), YHBJ_BACSU  (O31593)
`Potential' hits (partial sequences which belong to the set under consideration, but which are not hit by the pattern or profile because they are partial (fragment) sequences):
ODO2_DELAC  (P83708), ODO2_MESAU  (P86219), ODO2_SOLTU  (P81896), 
ODP2_MESAU  (P86197), OPDX_MESAU  (P86238)
Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:

[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format]

Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]
1A6X; 1BDO; 1DCZ; 1DD2; 1FYC; 1GHJ; 1GHK; 1IYU; 1IYV; 1K67; 1K69; 1K8M; 1K8O; 1LAB; 1LAC; 1O78; 1PMR; 1QJO; 1Y8N; 1Y8O; 1Y8P; 1Z6H; 1Z7T; 2B8F; 2B8G; 2BDO; 2DN8; 2DNC; 2DNE; 2EJM; 2K7V; 2KCC; 2PNR; 2Q8I; 3BDO; 3BG3; 3CRK; 3CRL;

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)


If you would like to retrieve all the Swiss-Prot entries referenced in the DR lines of this entry (with the exception of false positive hits) , you can enter a file name. These entries will then be saved to a file under this name. (Please note that this temporary file will only be kept for 1 week.)

File name:

Format: Swiss-Prot Fasta

or