PROSITE entry PS50978

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	NEAT
Accession [info]	PS50978
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-APR-2004 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50978
Associated ProRule [info]	PRU00337

Name and characterization of the entry

Description [info]

NEAT domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=127;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=122;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5864270; R2=0.0229177; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=259; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=132; N_SCORE=5.6; MODE=1; TEXT='RR';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='L';  M= -9,-13,-20,-14,-10, -4,-23,-14,  4,-17, 21,  7,-13,-23, -9,-12,-14, -1, -1,-24, -6,-10;
/M: SY='K';  M=  3, -2,-23, -4,  3,-22,-11,-11,-16,  5,-13, -9, -1,-13,  1,  3, -2, -4,-12,-24,-14,  1;
/M: SY='D';  M= -6, 26,-25, 29,  7,-30,  6, -5,-31, -4,-26,-22, 19,-13, -4,-10,  4, -5,-25,-33,-21,  1;
/M: SY='G';  M= -5,  0,-29,  2,-10,-29, 37, -9,-35,-11,-28,-19,  5,-11,-12,-13,  0,-13,-28,-25,-24,-12;
/M: SY='T';  M= -6,-13,-22,-18, -9, -8,-23,-19,  4,-14,  0, -2,-10,-16, -9,-11, -1,  8,  2,-17, -6,-10;
/M: SY='Y';  M=-17,-15,-30,-14, -9, 12,-23, 14, -8, -5, -6, -3,-14,-25,  0, -3,-15,-11,-15, 15, 53, -8;
/M: SY='T';  M= -5,  3,-21,  1,  5,-19,-17, -8,-17, -4,-18,-13,  2,  0,  4, -7, 10, 17,-15,-27,-10,  4;
/M: SY='I';  M= -1,-28,-21,-33,-26,  0,-31,-27, 32,-26, 21, 14,-23,-23,-21,-24,-17, -7, 27,-22, -4,-26;
/M: SY='B';  M=-13, 26,-27, 25, 12,-29,-11,  8,-28,  8,-28,-18, 25, -9,  8,  2,  1, -7,-28,-33,-16,  9;
/M: SY='F';  M=-12, -9,-20,-20,-19, 36,-20, -7, -4,-18, -3, -5,  1,-26,-23,-13,-10, -6, -7, -5, 18,-19;
/M: SY='D';  M= -8,  5,-22,  7,  5,-24,-18, -7,-17,  7,-18,-10,  2,-14,  7,  4,  2,  2,-10,-29,-13,  6;
/M: SY='V';  M=  5,-24,-12,-28,-24,  1,-23,-23, 18,-18,  9, 12,-23,-24,-22,-18, -8,  0, 29,-24, -8,-23;
/M: SY='Y';  M=-10,-15,-22,-17,-11,  6,-23, -7, -1,-10,  7,  2,-11,-23, -7, -8,-11, -6, -4,-12, 10, -9;
/M: SY='K';  M=-14,  3,-29,  3,  7,-19,-20, 15,-25, 20,-22, -9,  3,-15,  9, 15, -9,-11,-22,-17,  7,  6;
/M: SY='D';  M= -2,  9,-23, 13,  3,-22,-11,-10,-17, -1,-17,-14,  0,-13, -5, -8,  1, -3, -9,-27,-12, -2;
/M: SY='N';  M= -7, 19,-25, 19,  6,-28, 12, -4,-30, -2,-29,-21, 22,-14, -2, -6,  7, -6,-27,-33,-22,  2;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='N';  M= -4, 12,-19,  9,  5,-21, -6, -6,-20, -5,-20,-16, 15,-13,  1, -7, 13, 10,-17,-33,-17,  3;
/M: SY='B';  M= -5, 15,-22, 14, 10,-22,-14, -7,-17, -1,-19,-15, 13,-12, -1, -6,  6,  4,-14,-33,-16,  4;
/M: SY='E';  M= -3,  4,-23,  6, 11,-26, 11, -9,-29, -4,-26,-19,  7,-11,  0, -5, 11, -1,-23,-30,-21,  5;
/M: SY='E';  M= -3,  2,-20, -2,  6,-18,-16, -7,-11, -2,-12, -5,  4,-13,  6, -4,  5,  5, -9,-29,-14,  6;
/M: SY='S';  M=  2,  4,-15,  5, -1,-13, -5, -6,-20,-10,-26,-19, 10,-13, -3,-10, 27, 12,-13,-33,-11, -2;
/M: SY='M';  M= -9,-17,-21,-22,-14, -1,-21,  2, 11,-11,  7, 30,-15,-20, -4,-11,-11, -6,  6,-18,  7,-10;
/M: SY='A';  M= 15,-12,-16,-19,-11,-12,-10,  2, -3,-11, -1, 13, -9,-16, -4,-13, -1, -4, -1,-24, -8, -8;
/M: SY='N';  M=-16, 15,-27, 14,  6,-18,-14,  3,-25,  7,-21,-15, 16,-17,  7, 16, -3, -8,-24,-25, -7,  5;
/M: SY='D';  M= -5,  8,-25,  9, -1,-22,  6,-10,-29,  6,-26,-17,  9,-14, -5, -2,  2, -7,-21,-26,-16, -2;
/M: SY='Y';  M=  1,-16,-21,-19,-16, 14,-20,  2, -3,-12, -5, -4,-15,-23,-12,-13, -5, -4, -4,  6, 37,-16;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-20,-32,-25, 18,-30,-23, 19,-25, 20, 12,-23,-26,-24,-20,-18, -3, 16,-11,  4,-24;
/M: SY='B';  M= -6, 16,-23, 16,  6,-26, -1, -4,-23, -1,-23,-14, 15,-14,  1, -5,  4, -5,-19,-32,-18,  4;
/M: SY='K';  M=-14, 12,-30, 15, 15,-29,-17, 18,-31, 21,-27,-13,  9,-12,  9, 12, -6,-12,-26,-28, -7, 11;
/M: SY='P';  M=-11, -9,-33, -5, -1,-25,-20,-15,-18, -2,-24,-15, -8, 43, -6, -4, -6, -3,-22,-29,-22, -7;
/M: SY='A';  M= 28,-11,-12,-18,-12,-12, -2,-18, -8,-12,-10, -6, -8,-13,-11,-17, 10,  4,  1,-22,-15,-11;
/M: SY='K';  M=-11, -1,-25, -2, -2,-17,-21,-10,-16,  9,-14, -9, -3,-15,  1,  7, -4,  5,-12,-14, -3, -1;
/M: SY='L';  M= -8,-28,-19,-30,-24,  9,-31,-22, 23,-25, 27, 14,-26,-27,-23,-20,-19, -4, 21,-19,  2,-24;
/M: SY='K';  M= -7, -8,-24, -9,  0,-11,-24,-13, -4,  3, -9, -4, -9,-15, -5, -1, -7, -3, -1,-20, -4, -3;
/M: SY='V';  M= -6,-22,-19,-25,-19,  1,-30,-22, 19,-13,  5,  6,-20,-23,-19,-15,-11, -2, 25,-21,  0,-20;
/M: SY='E';  M= -8,  2,-24,  0, 11,-20,-19, -8,-15,  9,-13, -8,  3,-12,  5,  3, -2,  0,-15,-27,-12,  8;
/M: SY='N';  M= -6, 19,-25, 15,  0,-27, 11, -4,-29,  4,-29,-19, 24,-16, -3, -2,  2, -8,-26,-30,-21, -2;
/M: SY='G';  M= -5,  9,-27,  9, -8,-29, 35,-12,-35, -9,-29,-20, 12,-17,-11,-12,  2,-11,-28,-27,-24, -9;
/M: SY='K';  M= -9,  1,-28,  2,  9,-30, -9, -7,-26, 25,-25,-10,  1,-12, 12, 13, -5,-10,-20,-23,-14, 10;
/M: SY='T';  M= -1, -5,-20, -9, -5,-15,-17,-13,-13, -1,-15, -9, -3,  3, -5, -6,  6, 14,-10,-25,-10, -6;
/M: SY='Y';  M=-12,-15,-24,-17,-10, 12,-27, -1,  1,-11,  2,  2,-15,-22,-10,-11,-10,  1, -2, -1, 31,-12;
/M: SY='V';  M= -6,-26,-17,-27,-21,  6,-29,-19, 21,-19, 16, 16,-25,-26,-20,-17,-16, -5, 26,-21,  0,-21;
/M: SY='T';  M= -3, -4,-21, -5,  7,-15,-20, -7,-10, -5,-12, -8, -5,-12,  5, -7,  6, 10, -8,-22, -4,  6;
/M: SY='L';  M= -4,-26,-18,-29,-21,  3,-26,-19, 21,-23, 28, 20,-24,-25,-17,-19,-18, -6, 17,-23, -4,-20;
/M: SY='T';  M= -5, -1,-20, -4, -4,-16,-10,-12,-15, -2,-13, -7, -3,-13, -4, -6,  5, 16, -8,-24, -8, -4;
/M: SY='F';  M=-11,-28,-20,-34,-26, 28,-31,-23, 19,-27, 21, 10,-23,-27,-27,-21,-19, -5, 16,-12,  8,-26;
/M: SY='N';  M= -7, 22,-19,  9, -1,-19, -8,  0,-20,  5,-25,-16, 34,-16,  0,  5, 10,  9,-21,-34,-16, -1;
/M: SY='N';  M= -7, 11,-23,  9,  4,-24,  2,  7,-26, -6,-24,-16, 14,-14,  1, -7,  8,  3,-22,-32,-14,  2;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='S';  M=  6, -3,-18, -6, -7,-11, -1, -9,-16,-11,-15,-12,  0,-16, -6,-12, 10,  3,-12,-21, -6, -7;
/M: SY='S';  M=  1,  4,-21,  4,  8,-26,  0, -1,-25,  0,-26,-16,  8,-11,  8, -3, 14,  0,-20,-31,-17,  8;
/M: SY='W';  M=-17,-25,-27,-30,-24, 38,-26,-13, -6,-20, -2, -6,-21,-27,-24,-16,-18, -4, -9, 39, 35,-22;
/M: SY='W';  M=-13,-31,-30,-35,-26,  9,-27,-22, 14,-23, 14, 13,-29,-26,-18,-20,-27,-15,  5, 30,  9,-22;
/M: SY='K';  M= -7,  0,-25, -3,  4,-24,-15,-11,-20, 20,-21, -9,  2,-11,  4, 10, -1,  4,-15,-24,-12,  4;
/M: SY='D';  M= -8, 19,-25, 22, 11,-27, -5, -6,-27,  3,-24,-19, 14,-12, -1, -4,  3, -2,-21,-32,-18,  5;
/M: SY='F';  M=-15,-27,-21,-33,-25, 40,-29,-10,  9,-25, 18, 12,-21,-28,-26,-18,-21,-10,  5, -4, 19,-24;
/M: SY='K';  M= -5, -2,-26, -2, 11,-23,-16, -6,-21, 12,-21,-12,  1,-12, 10, 12,  1, -5,-18,-19,-12,  9;
/M: SY='V';  M= -7,-26,-19,-30,-27,  7,-32,-23, 27,-22, 12, 10,-23,-25,-23,-21,-13,  0, 29,-18,  5,-27;
/M: SY='E';  M=-10, -3,-24, -2,  8, -7,-20, -4,-16, -2,-12,-10, -5,-11,  1, -3,  0,  3,-15,-17,  4,  3;
/M: SY='S';  M=  0, -8,-20,-10, -4,-18, -6,-15, -7, -7,-12, -6, -6,-17, -5,-10,  2, -2,  0,-27,-16, -5;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='N';  M= -7, 25,-23, 21,  3,-26,  3, -1,-26,  3,-27,-20, 28,-15, -2, -2,  5, -5,-25,-32,-19,  1; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='G';  M= -2,  1,-24,  0,-12,-25, 46,-12,-31,-13,-25,-17,  8,-16,-13,-14,  1,-14,-25,-20,-24,-13; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='E';  M= -4,  2,-19,  0,  7,-16,-12, -5,-15,  6,-15, -9,  3,-10,  4,  1,  1,  3,-12,-20, -7,  5; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='W';  M= -6, -3,-19, -3, -2, -2,-13, -8,-12, -1, -8, -8, -7,-12, -6, -4, -8, -5,-11,  6,  3, -3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='M';  M= -3,-10,-16,-11, -6,-11,-11, -5, -5, -3,  0,  1, -8,-14, -1, -2, -7, -4, -2,-17, -6, -4; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='D';  M= -5, 11,-22, 14,  5,-24, -9, -5,-23,  6,-22,-16,  8,  2,  0,  5,  1, -5,-19,-26,-16,  1; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='V';  M=  6,-13,-17,-14,-12,-12,-15,-17,  0, -6, -6, -1,-14,-19,-13,-11, -4, -2, 11,-23, -9,-13;
/M: SY='E';  M= -7, -1,-22, -1, 13,-20,-20, -8,-15,  5,-13, -9, -1,-12,  8,  3,  2,  5,-11,-28,-13, 10;
/M: SY='V';  M= -3,-23,-15,-25,-20, -3,-29,-25, 20,-16, 10,  7,-22,-24,-21,-16,-10,  2, 29,-27, -8,-21;
/M: SY='V';  M=  4,-25,-13,-28,-26, -4,-21,-28, 22,-20,  6,  6,-24,-25,-25,-21, -7,  0, 36,-27,-11,-26;
/M: SY='S';  M=  4,  4,-15,  4, 10,-22, -5, -7,-21, -5,-27,-18, 10, -9,  6, -7, 29, 14,-15,-37,-19,  8;
/M: SY='E';  M=-10, -2,-28,  2, 12,-16,-17, -4,-20, 11,-18,-12, -5, -8,  2,  2, -6, -5,-17,-16,  1,  6;
/M: SY='D';  M=-15, 39,-25, 44, 10,-25, -7,  1,-30, -2,-28,-24, 29,-14, -2, -8,  4, -5,-27,-37,-17,  4;
/M: SY='P';  M= -3, -8,-27, -8,  1,-22,-15,-16,-15,  4,-19,-11, -7, 11, -3, -4, -1,  1,-13,-26,-16, -3;
/M: SY='D';  M=  1, 18,-23, 21, 13,-28,-10, -7,-24,  3,-21,-18,  9,-11,  0, -6,  2, -6,-17,-31,-18,  6;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='N';  M=  4, 10,-16,  3,  3,-19,  0, -4,-18,  5,-20,-12, 16,-11,  0,  0,  5, -3,-16,-23,-15,  1; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='D';  M=-10, 22,-19, 23,  3,-18, -2,  1,-20, -4,-18,-15, 19,-13, -3, -6,  2, -4,-19,-25, -9,  0; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='T';  M= -6,  4,-20,  3,  0,-14,-16, -1,-18, -5,-18,-14,  4, -7, -3, -8, 10, 16,-13,-26, -2, -3;
/M: SY='R';  M= -8,-12,-28,-15, -5,-18,-21, -9,-14, 17,-13, -5, -5,-18,  2, 37, -9, -9, -9,-20, -9, -5;
/M: SY='T';  M= -6,-12,-19,-16,-13, -6,-24,-15,  0, -2, -7, -3,-10,-18,-10, -3,  0, 12,  7,-20,  1,-13;
/M: SY='I';  M= -5,-24,-20,-27,-19, -2,-29,-24, 25,-23, 16, 11,-21,-23,-18,-21,-12, -4, 23,-26, -6,-21;
/M: SY='R';  M=-10, -1,-27, -1, 12,-23,-18, -6,-23, 20,-21,-12,  3,-12,  8, 24, -1, -3,-17,-25,-13,  8;
/M: SY='F';  M=-17,-28,-20,-36,-28, 61,-29,-16,  4,-26, 10,  5,-21,-29,-33,-18,-19, -9,  5,  6, 29,-28;
/M: SY='P';  M= -6, -2,-31,  2, 19,-28,-18,-11,-24,  7,-25,-17, -5, 28,  3, -4, -3, -5,-25,-28,-21,  9;
/M: SY='V';  M= -5,-29,-17,-31,-28,  3,-31,-24, 30,-22, 16, 16,-27,-27,-24,-21,-15, -4, 36,-23, -1,-27;
/M: SY='P';  M= -1, -9,-26, -6,  5,-23,-15,-15,-13, -7,-22,-14, -6, 23, -3,-13,  7,  0,-15,-31,-20, -1;
/M: SY='D';  M= -9, 20,-25, 22,  8,-26,-11, -5,-22, -2,-25,-19, 17, -1, -1, -7,  7,  0,-21,-36,-19,  2;
/M: SY='L';  M= -9,-12,-26, -9,-10,-13, -4,-16, -7,-16,  8,  0,-13,-16,-11,-15,-15,-12, -9,-23,-12,-11;
/M: SY='B';  M= -1, 20,-20, 20,  3,-23, -9, -6,-23, -2,-22,-18, 14,-12, -3, -8,  8,  6,-17,-30,-13,  0;
/M: SY='A';  M= 10, -3,-18, -6, -2,-22, -7,-12,-17,  0,-15,-10, -2,-12,  2, -2,  8,  5,-11,-25,-15,  0;
/M: SY='D';  M=-11, 10,-27, 16, 10,-27,-17,-10,-19,  6,-22,-15,  2,  1, -1, -3, -3, -7,-15,-31,-17,  3;
/M: SY='I';  M= -9,-21,-23,-24,-20,  0,-31,-21, 22,-19, 19, 11,-20,-23,-17,-18,-18, -5, 17,-20,  1,-21;
/M: SY='D';  M= -8,  8,-24, 10,  4,-21,-12, -8,-19,  6,-17,-12,  4,-15, -3, -1, -4, -5,-13,-26,-10,  0;
/M: SY='A';  M= 13,-13,-16,-19,-16,-12,-11,-13,  3,-16, -3, -2, -8,-18,-14,-17,  1,  0,  9,-26,-12,-16;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='K';  M= -6, -7,-23, -8, -2,-14,-15, -6,-12, 10,-15, -6, -5,-15, -2,  3, -3, -3, -6,-19, -1, -3; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='V';  M=  0,-19,-17,-24,-20, -6,-19,-22, 14,-19,  5,  6,-15,-21,-17,-19, -2,  5, 18,-27, -9,-20;
/M: SY='H';  M= -9, -2,-25, -2, -4, -6,-17, 18,-18, -5,-15, -8,  1,-12, -4, -6, -4, -8,-17,-20,  7, -6;
/M: SY='V';  M= -4,-27,-16,-30,-27,  1,-31,-25, 29,-21, 13, 14,-25,-26,-23,-20,-12, -1, 35,-24, -2,-27;
/M:         M= -6, -9,-22, -8, -2,-12,-17,-10, -5, -7, -5, -3, -9,-17, -1, -9, -3, -1, -3,-21, -3, -2;
/M: SY='V';  M= -4,-26,-21,-29,-24, -3,-29,-22, 25,-19,  8, 13,-24,-12,-20,-21,-13, -5, 26,-22, -4,-24;
/M: SY='P';  M= -7, -1,-26,  3,  0,-16,-11, -8,-14, -8,-12,  1, -6,  6, -4,-13, -5, -8,-14,-27,-14, -3;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='G';  M= -2,  3,-18,  5,  4,-14,  7, -8,-18, -6,-14,-12,  2,-10, -5, -9,  0, -7,-13,-18,-13,  0; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='R';  M= -9,  0,-20, -1, -2,-15, -6, -2,-15,  9,-13, -2,  4, -6,  1, 14, -5, -7,-14,-18,-10, -2; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='D';  M= -6,  2,-17,  4,  3,-14, -7, -7, -7, -2, -9, -7,  1, -3, -3, -6, -3, -6, -7,-18,-10, -1; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='V';  M= -3, -7,-10, -8, -7, -6, -7, -3,  2, -7, -2,  3, -6,-13, -7, -7, -4, -4,  7,-16, -6, -7; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='E';  M= -2,  1,-12,  2, 11,-14, -4, -2,-12,  0,-11, -7,  1, -4,  9, -1,  5,  1,-11,-14, -9, 10; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='N';  M= -7,  9,-25,  7,  0,-21,  0, -6,-25,  4,-24,-13, 11,-10, -1,  1,  0, -7,-22,-27,-16, -1;
/M: SY='I';  M= -3,-17,-21,-21,-19,  6,-25,-17, 12,-19,  6,  3,-15,-21,-18,-19, -8,  0, 10,-15,  6,-20;
/M: SY='N';  M= -7,  6,-22,  3, -4,-17,-12,-11, -6, -9,-11, -8,  8,-17, -8,-11,  0, -1, -5,-31,-14, -7;
/M: SY='Y';  M=-15,-13,-27,-15,-15, 15,-24,  8, -2,-12,  1, -2,-11,-21,-10,-11,-14, -7,-10,  6, 44,-16;
/M: SY='D';  M=-13, 19,-25, 21,  9,-25,-15,  7,-26,  6,-21,-15, 14,-14,  2,  4, -1, -2,-22,-32,-11,  5;
/M: SY='H';  M=-13, -5,-27, -8, -8, -9, -5, 24,-20, -3,-14, -3,  2,-21, -3, -2,-10,-14,-20,-17,  8, -7;
/M: SY='D';  M=-13,  8,-29, 13,  7,-23,-11,  0,-24,  0,-18,-11,  3,-15,  6, -2, -6,-11,-23,-13, -9,  6;
/M: SY='Y';  M= -7,-12,-21,-16,-14,  2,-19, -4, -5, -7, -7, -4,-12,-21, -8, -9, -4,  7, -2, -5, 23,-13;
/M: SY='T';  M= -8, -8,-21,-11, -8, -1,-22, -4, -7, -7, -1, -2, -6,-19, -5, -7, -6,  2, -6,-18,  2, -7;
/M: SY='V';  M=  0,-12,-18,-17,-11, -4,-22,-18,  3, -8, -4, -1, -9,-17,-10,-10, -3,  4,  7,-22, -7,-11;
/M: SY='R';  M=-12, -6,-26, -6,  1,-15,-22, -1,-17,  9, -8, -3, -4,-17, 10, 15, -8, -4,-15,-21, -5,  4;
/M: SY='L';  M= -9,-28,-21,-28,-21,  7,-29,-19, 17,-23, 21, 10,-27,-15,-21,-20,-20, -7, 15,-18,  3,-23;
/M: SY='E';  M= -6, -2,-25, -2,  5,-15,-21,-12, -8,  1,-12, -7, -4,-13, -1, -3, -2, -3, -7,-25,-10,  1;
/M: SY='F';  M=-13, -9,-23,-12,-11, 14,-19,-10, -4,-13,  2,  3, -8,-21,-15,-12,-12, -6, -6,-13,  6,-12;
/M: SY='D';  M=-11, 22,-24, 23, 10,-21,-12, -2,-24, -1,-19,-17, 17,-14,  2, -2,  1, -4,-22,-31,-14,  6;
/M: SY='D';  M=-11,  3,-26,  5,  5,-16,-14,-10,-17, -6,-12,-10, -2,  2, -5,-10, -4, -2,-17,-27,-14,  0;
/M: SY='S';  M=  3, -1,-22,  0, -1,-22, -9,-15,-15, -7,-19,-14, -2,  5, -7,-13,  6,  3,-11,-30,-19, -5;
/M: SY='S';  M= -2,  0,-23, -1, -3,-19,-13,-14,-15, -4,-21,-14,  2, -2, -5, -9,  9,  5,-12,-21,-14, -5;
/M: SY='T';  M=  1, -3,-20, -7, -9,-10,-17,-15, -3,-11, -5, -5, -2,-12,-11,-14, -1,  2, -2,-26,-11,-11;
/M: SY='T';  M= -6, -7,-20,-11, -9,-12,-21,-12, -2,  1, -8, -2, -4,-19, -4, -3, -2,  4,  3,-24, -5, -7;
/M: SY='E';  M=  1, -3,-22,  0,  7,-20,-17,-13,-13, -1,-10,-10, -7, -3, -4, -8, -2, -2, -8,-28,-16,  1;
/M: SY='S';  M= -1, -1,-22, -1, -2,-21,-12,-13,-10, -3,-15, -9, -1, -9, -4, -9,  2, -1, -5,-29,-15, -4;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_05 which contains 572'214 sequence entries.

Total number of hits	85 in 53 different sequences
Number of true positive hits	85 in 53 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	3
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	NEAT
Version [info]	4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

53 sequences

HBP1_LISMO  (Q8Y585), HBP2_LISMO  (Q7AP54), ISDA_STAA1  (A7X148),

ISDA_STAA2  (A6U0U7), ISDA_STAA3  (Q2FHV1), ISDA_STAA8  (Q2FZE9), 
ISDA_STAA9  (A5IS16), ISDA_STAAB  (Q2YX95), ISDA_STAAC  (Q5HGV4), 
ISDA_STAAE  (A6QG31), ISDA_STAAM  (Q99UX4), ISDA_STAAN  (Q7A655), 
ISDA_STAAR  (Q6GHV6), ISDA_STAAS  (Q6GA85), ISDA_STAAT  (A8Z1R0), 
ISDA_STAAU  (P0C1S5), ISDA_STAAW  (Q7A152), ISDB_STAA1  (A7X146), 
ISDB_STAA2  (A6U0U6), ISDB_STAA3  (Q2FHV2), ISDB_STAA8  (Q2FZF0), 
ISDB_STAA9  (A5IS15), ISDB_STAAB  (Q2YX96), ISDB_STAAC  (Q5HGV5), 
ISDB_STAAE  (A6QG30), ISDB_STAAM  (Q99UX5), ISDB_STAAN  (Q7A656), 
ISDB_STAAR  (Q6GHV7), ISDB_STAAS  (Q6GA86), ISDB_STAAT  (P0C7J5), 
ISDB_STAAW  (Q8NX66), ISDC_STAA1  (A7X149), ISDC_STAA2  (A6U0U8), 
ISDC_STAA3  (Q2FHV0), ISDC_STAA8  (Q8KQR1), ISDC_STAA9  (A5IS17), 
ISDC_STAAB  (Q2YX94), ISDC_STAAC  (Q5HGV3), ISDC_STAAE  (A6QG32), 
ISDC_STAAM  (Q99UX3), ISDC_STAAN  (Q7A654), ISDC_STAAR  (Q6GHV5), 
ISDC_STAAS  (Q6GA84), ISDC_STAAT  (A8Z1R1), ISDC_STAAW  (Q7A151), 
ISDH_STAA3  (Q2FG07), ISDH_STAA8  (Q2FXJ2), ISDH_STAAB  (Q2YTF7), 
ISDH_STAAC  (Q5HF43), ISDH_STAAM  (Q931P4), ISDH_STAAN  (Q99TD3), 
ISDH_STAAS  (Q6G8J7), ISDH_STAAW  (Q8NW39)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

41 PDB

2E7D; 2H3K; 2ITE; 2ITF; 2K78; 2MOQ; 2O1A; 2O6P; 2Z6F; 3OVU; 3QUG; 3QUH; 3QZL; 3QZM; 3QZN; 3QZO; 3QZP; 3RTL; 3RUR; 3S48; 3SZK; 3VTM; 3VUA; 4FC3; 4IJ2; 4MYP; 4NLA; 4WJG; 4XS0; 5D1Q; 5D1X; 5D1Z; 5VMM; 6P9H; 6TB2; 7PCF; 7PCH; 7PCQ; 7W81; 7XLD; 7XLI
» more