Due to maintenance work, this service will be unavailable from
Mon Nov 11 17:30 until
Tue Nov 12 09:00
CET.
Apologies for the inconvenience.
PROSITE entry PS50990
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | PEPTIDASE_C39 |
| Accession [info] | PS50990 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-MAY-2004 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50990 |
| Associated ProRule [info] | PRU00362 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Peptidase family C39 domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=121; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=116; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.5794134; R2=0.0133220; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6752.6582031; R2=2.4905064; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=250; H_SCORE=7375; N_SCORE=9.9; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-5; H_SCORE=6740; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B0=-1000; B1=-1000; E0=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='Q'; M=-11, 0,-28, -1, 11,-28,-17, 6,-17, 7,-16, 1, 2,-12, 32, 10, -3, -9,-22,-23,-10, 21; /I: I=-7; MD=-14; /M: SY='A'; M= 4, -7,-17,-10, -5,-14, -9, -9, -9, -8, -7, -3, -5,-13, -6, -9, -1, -1, -5,-24,-12, -6; D=-7; /I: I=-7; MD=-14; /M: SY='E'; M= -2, 11,-20, 11, 12,-24, -9, -3,-21, 2,-21,-14, 10,-10, 8, 0, 10, 2,-18,-30,-16, 10; D=-7; /I: I=-7; MD=-14; /M: SY='N'; M= -2, 0,-22, -3, 3,-19, -8, 1,-13, -4,-15, -8, 4, -7, 2, -7, 1, -5,-14,-25,-12, 1; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='T'; M= -2, -3,-19, -6, -3,-14,-14, -6, -8, -5, -8, -5, -1,-11, -2, -5, -1, 2, -6,-22, -9, -3; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='D'; M=-12, 26,-25, 36, 20,-29, -7, 2,-29, 0,-22,-21, 14, -9, 3, -6, 1, -7,-25,-32,-16, 11; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='C'; M= -4,-13, 31,-16,-13,-18,-17,-15,-19,-16,-16,-13,-10,-11,-12,-17, -2, -4,-12,-30,-18,-13; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='G'; M= 1,-14,-25,-15,-16,-16, 25,-19,-21,-18,-12,-11,-10,-16,-16,-18, -6,-12,-17, -2,-15,-16; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='L'; M= -2,-26,-19,-28,-20, 5,-26,-21, 17,-24, 29, 14,-25,-22,-19,-19,-20, -7, 13,-20, -4,-20; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='A'; M= 15, -4, -3, -8, -1,-19,-12,-14,-13, -9,-11,-11, -5,-14, -5,-14, 3, -2, -6,-27,-16, -3; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='C'; M= 6,-16, 49,-22,-20,-17,-15,-24,-17,-21,-14,-13,-14,-25,-21,-23, 0, -3, -3,-36,-23,-21; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='L'; M= -8,-27,-18,-31,-22, 10,-30,-20, 22,-26, 30, 17,-24,-26,-19,-21,-22, -8, 13,-17, 3,-22; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='A'; M= 4,-13,-13,-17,-10,-11,-17,-14, -2,-11, -3, -2,-10,-18, -6,-10, 1, 1, 2,-25,-10, -9; /M: SY='M'; M= -6,-17,-19,-23,-15, -1,-20, -5, 7,-12, 9, 23,-15,-20, -4,-10,-10, -4, 2,-16, 2,-10; /M: SY='I'; M= -1,-26,-21,-31,-23, 2,-29,-21, 25,-25, 25, 16,-23,-24,-19,-22,-18, -8, 19,-21, -3,-22; /M: SY='A'; M= 15,-15, -5,-21,-15, -8,-12,-17, -4,-17, 3, -2,-14,-19,-14,-19, -1, 0, 0,-23,-10,-15; /M: SY='R'; M=-10, 3,-26, 0, 2,-23,-10, 2,-24, 12,-22,-10, 9,-16, 10, 19, -1, -6,-21,-24,-10, 4; /M: SY='Y'; M=-15,-13,-21,-15,-12, 8,-24, 20, -7,-12, -2, 0,-10,-25, -5, -9,-14,-10,-12, -4, 31,-11; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='Y'; M=-18,-19,-26,-21,-17, 25,-25, 22, -6,-18, 4, 3,-13,-27,-14,-12,-18,-12,-10, 1, 36,-17; /M: SY='G'; M= -7, 3,-28, 1, -7,-27, 27, -5,-31, -6,-24,-15, 9,-18, -6, -5, -2,-14,-26,-25,-20, -7; /M: SY='I'; M= -9,-15,-20,-19,-14, -5,-25,-11, 7, -9, 4, 4,-10,-22,-11, -6,-12, -5, 5,-22, -1,-14; /M: SY='P'; M= 2, 0,-25, 0, 4,-24,-13, -9,-21, 3,-23,-15, -1, 8, 1, -4, 3, -1,-18,-24,-16, 2; /M: SY='V'; M= -1,-21,-12,-26,-20, 7,-23,-20, 11,-20, 8, 4,-17,-23,-20,-19, -9, -3, 13,-19, -1,-20; /M: SY='S'; M= -2, 8,-20, 8, 2,-22, -6, -7,-23, -4,-25,-18, 10, -5, -2, -3, 14, 7,-17,-31,-18, -1; /M: SY='P'; M= -5,-16,-26,-15, -7,-14,-22,-14, -3, -6, -2, -2,-14, 3, -7, -4,-11, -7, -4,-24,-11,-10; /M: SY='E'; M= -5, 9,-24, 12, 17,-22,-12, -3,-22, -1,-19,-15, 4, -8, 4, -6, 3, -3,-19,-28,-14, 10; /M: SY='E'; M= -5, -2,-22, -2, 8,-19,-18, -6,-15, 3,-14, -8, -3,-13, 8, 1, 0, -2,-12,-22, -8, 8; /M: SY='L'; M= -8,-30,-21,-33,-24, 9,-32,-24, 27,-28, 34, 18,-26,-27,-22,-22,-24, -9, 19,-20, 0,-24; /M: SY='R'; M= -9, -9,-26,-10, 0,-18,-20, -6,-15, 11,-13, -5, -5,-15, 8, 24, -5, -6,-12,-21, -7, 2; /M: SY='H'; M= -4, 4,-25, 5, 10,-24,-12, 13,-24, 4,-19,-11, 5,-13, 8, 5, -1, -8,-21,-27,-10, 8; /M: SY='Q'; M= -3, -5,-25, -7, -1,-20, -7,-10,-13, -1,-10, -4, -4,-14, 2, -2, -5, -8,-13,-23,-13, 0; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='L'; M= -1,-18,-14,-21,-15, 4,-23,-14, 5,-16, 10, 5,-16,-21,-15,-15,-10, -2, 6,-18, 0,-15; D=-7; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='G'; M= -2, -1,-23, -2, -2,-22, 5, -7,-22, -6,-22,-15, 3, 3, -6, -9, 1, -5,-20,-26,-18, -5; D=-7; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='L'; M= -6,-16,-21,-17,-11, -1,-22,-15, 3,-15, 9, 2,-15,-17,-12,-12,-12, -2, 2, -9, -2,-12; D=-7; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='S'; M= -1, 0,-19, 2, 1,-19, -4, -9,-15, -8,-15,-11, -1, -4, -3,-10, 6, 1,-11,-26,-16, -2; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='R'; M= -6, -2,-24, -2, 2,-21,-11, -5,-20, 4,-16, -9, 0, -9, 3, 7, 0, -3,-16,-26,-12, 1; /M: SY='D'; M= -3, 7,-22, 8, 6,-26, 0, -2,-25, -3,-21,-15, 8,-12, 3, -5, 4, -5,-21,-29,-17, 4; /M: SY='G'; M= -1, -4,-26, -5, -9,-24, 24,-13,-27, -6,-23,-15, 2,-14, -8, -5, 1, -9,-20,-23,-20, -9; /M: SY='L'; M= -6,-18,-19,-21,-14, 1,-24,-17, 7,-18, 12, 5,-15,-16,-14,-16, -9, 0, 4,-22, -4,-15; /M: SY='S'; M= 0, 2,-13, -1, -4,-17, -6,-10,-17, -9,-19,-15, 7,-11, -5, -8, 16, 11,-12,-32,-15, -5; /M: SY='L'; M= -4,-15,-22,-15, -9, -4,-22,-17, 3,-14, 5, 0,-14,-11,-12,-14,-10, -4, 2,-23, -7,-11; /M: M= -4, -6,-23, -7, 0,-13,-17, -8,-13, -2,-10, -7, -4, -7, -2, -3, -3, -2,-12,-24, -9, -2; /M: SY='E'; M= -3, -1,-24, -1, 2,-16, -9, -6,-13, -8, -7, -5, -3,-15, 1, -9, -4, -7,-14,-21, -7, 1; /M: SY='L'; M=-10,-29,-15,-33,-24, 10,-31,-22, 21,-27, 28, 16,-26,-27,-21,-22,-24,-10, 13,-14, 2,-24; /M: M= -3,-11,-19,-11, -3,-16,-13,-13,-11, -5, -7, -6, -9,-12, -5, -4, -4, -3, -6,-26,-14, -5; /M: SY='R'; M= -8, 0,-24, 1, 8,-21,-16, -2,-19, 7,-14, -9, 2,-15, 8, 12, -3, -6,-17,-24,-10, 7; /M: SY='A'; M= 12,-19,-13,-26,-18, -3,-16,-20, 5,-19, 6, 3,-16,-19,-16,-20, -6, -3, 6,-16, -5,-18; /M: SY='A'; M= 27,-12,-14,-19,-11, -9, -3,-18, -8,-13, -5, -7, -9,-15,-12,-18, 4, -2, -2,-20,-14,-11; /M: SY='E'; M= -4, 4,-26, 5, 16,-27,-12, -3,-25, 13,-21,-12, 3,-10, 12, 11, 0, -7,-21,-26,-15, 14; /M: SY='R'; M= -8, -3,-24, -3, 4,-20,-15, -2,-20, 9,-17, -9, -1,-15, 8, 12, -3, -5,-17,-18, -7, 4; /M: SY='L'; M= 1,-21,-21,-26,-18, 7,-22,-12, 8,-20, 13, 7,-17,-22,-16,-18,-14, -8, 5,-12, 4,-17; /M: SY='G'; M= -3, -1,-28, -1,-11,-29, 46,-12,-36,-12,-29,-19, 7,-18,-11,-13, 2,-15,-29,-24,-25,-11; /M: SY='L'; M=-10,-29,-19,-32,-23, 19,-30,-20, 19,-27, 34, 17,-27,-29,-23,-20,-24, -9, 14,-15, 5,-23; /M: SY='K'; M= -5, 3,-24, 3, 6,-23,-12, -4,-23, 10,-22,-13, 3,-13, 4, 8, 3, -1,-16,-25,-13, 4; /M: SY='A'; M= 13,-13, -5,-20,-15, -8,-14,-20, -2,-16, -4, -4,-11,-16,-14,-18, 4, 6, 5,-26,-13,-15; /M: SY='R'; M=-10, 0,-27, -1, 9,-24,-16, 2,-26, 20,-23,-11, 4,-12, 12, 25, -3, -6,-21,-24,-11, 9; /M: SY='A'; M= 4,-15,-19,-19,-12, -6,-16,-13, 1,-14, 1, 0,-12,-17,-11,-13, -4, -1, 3,-22, -6,-12; /M: SY='V'; M= -6,-21,-17,-23,-19, 5,-26,-14, 10,-13, 3, 4,-19,-23,-17,-12,-11, -3, 15,-16, 7,-20; /M: SY='R'; M=-11, 4,-27, 4, 12,-27,-17, 3,-27, 21,-24,-11, 6,-12, 14, 22, -2, -7,-22,-26,-11, 12; /M: SY='V'; M= 1,-17,-16,-21,-13, -8,-17,-17, 1,-12, 1, 1,-13,-18, -8,-10, -6, -3, 3,-22, -9,-11; /M: SY='D'; M= -4, 5,-24, 9, 4,-26, -7, -9,-24, -3,-26,-18, 3, 8, -2, -8, 9, 4,-19,-32,-20, 0; /M: SY='F'; M= -5,-18,-22,-20,-13, 6,-21,-18, -1,-12, 4, 1,-16,-16,-16,-12,-13, -7, 0,-11, -2,-14; /M: SY='E'; M= -2, 6,-23, 6, 9,-22,-11, -7,-20, 1,-18,-13, 5,-10, 3, -4, 3, -3,-17,-25,-14, 6; /M: SY='E'; M= -6, 2,-25, 2, 10,-23,-13, -3,-22, 7,-19,-11, 3,-10, 7, 10, 0, -5,-18,-27,-14, 8; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='L'; M=-11,-24,-24,-27,-18, 7,-26,-17, 16,-23, 22, 12,-20,-24,-17,-18,-20,-10, 8,-17, 2,-18; /M: SY='N'; M= -3, 2,-23, -1, 0,-19, -6, -3,-19, -3,-19,-13, 7, -8, -1, -3, 4, -1,-17,-27,-12, -2; /M: SY='Q'; M= -8, -2,-26, -2, 7,-24,-17, -5,-19, 6,-17, -8, -1, -1, 11, 7, -1, -1,-18,-26,-14, 7; /M: SY='L'; M= -7,-17,-24,-20,-13, -2,-25,-14, 5,-14, 9, 5,-16,-20,-11,-13,-14, -5, 2,-12, -1,-12; /M: SY='P'; M= -6,-11,-27,-10, -3,-18,-20,-11, -9, -3,-11, -4,-10, 10, 0, -5, -7, -6,-12,-24,-12, -3; /M: SY='L'; M= -7,-22,-15,-25,-18, 5,-25,-18, 9,-22, 26, 11,-21,-25,-17,-17,-18, -3, 5,-20, -1,-17; /M: SY='P'; M=-10,-18,-38, -8, 0,-29,-20,-19,-19, -8,-27,-18,-18, 77,-10,-17,-10,-10,-27,-30,-28, -9; /M: SY='A'; M= 18,-19, -1,-26,-18, -3,-16,-21, 1,-18, 3, -1,-17,-21,-18,-21, -5, -4, 6,-20, -9,-18; /M: SY='I'; M= -6,-29,-23,-35,-26, 4,-33,-26, 34,-27, 25, 18,-24,-24,-21,-24,-20, -8, 26,-21, -2,-26; /M: SY='L'; M= 6,-23,-14,-28,-20, 1,-23,-23, 15,-22, 17, 7,-21,-23,-19,-21,-12, -5, 15,-22, -7,-20; /M: SY='H'; M=-11,-12,-26,-12, -4, -2,-23, 3, -7,-10, -1, -2,-10,-17, -6, -6,-12, -9, -8,-14, 3, -6; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='L'; M= -5,-14,-12,-16,-12, 5,-16,-11, 7,-13, 13, 6,-14,-16,-10,-10,-13, -6, 4, -3, 3,-11; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10; /M: SY='W'; M=-10, 2,-22, 4, 2,-12, -8, -5,-18, 1,-16,-13, 0,-11, -1, 0, -8, -9,-18, 13, -2, 1; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='D'; M= -8, 12,-23, 14, 7,-22, -6, -2,-23, 5,-21,-14, 11,-10, 2, 3, 0, -5,-19,-26,-13, 4; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='N'; M= -9, 5,-27, 5, 1,-20, 5, -6,-23, -5,-18,-12, 6,-15, 2, -7, -3,-11,-22,-23,-13, 1; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='G'; M= -6, 5,-25, 4, -2,-26, 12, -5,-27, -3,-23,-15, 10,-15, 0, -4, 1, -9,-23,-27,-18, -1; /M: SY='H'; M= -8, -2,-25, -3, 0,-22, -9, 42,-25, -5,-20, -6, 5,-17, 8, 1, 0, -9,-23,-27, 1, 2; /M: SY='F'; M=-12,-27,-20,-33,-25, 36,-27,-17, 0,-23, 4, -2,-22,-21,-26,-20,-19,-11, -4, 16, 22,-24; /M: SY='V'; M= -1,-25,-15,-29,-24, 3,-22,-24, 16,-21, 8, 6,-22,-25,-22,-20,-12, -6, 21,-18, -3,-24; /M: SY='V'; M= -5,-29,-16,-32,-27, 2,-32,-28, 31,-25, 21, 14,-27,-27,-25,-23,-17, -4, 34,-25, -5,-27; /M: SY='L'; M= -3,-27,-16,-30,-23, 3,-29,-24, 23,-25, 27, 14,-25,-26,-21,-21,-19, -6, 21,-23, -4,-23; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='Y'; M= -3, -7,-24, -8, -2, -9,-11, -7,-10, -6,-10, -8, -7,-16, -6, -8, -4, -5, -9,-11, 1, -5; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='K'; M= -4, 1,-25, 1, 5,-24, -5, -7,-24, 11,-21,-12, 3,-14, 2, 9, -1, -7,-18,-25,-15, 3; /M: SY='V'; M= -1,-12,-17,-16,-12, -9,-20,-17, 4,-12, -1, 1,-11,-17,-12,-14, -6, -2, 6,-23, -7,-14; /M: SY='D'; M= -7, 11,-24, 13, 9,-24, -9, -5,-24, 3,-22,-16, 9, -9, 1, 0, 4, 1,-19,-30,-15, 4; /M: SY='K'; M= -4, 7,-26, 7, 6,-27, 2, -5,-28, 10,-26,-16, 8,-13, 1, 4, 1, -7,-22,-27,-17, 3; /M: SY='N'; M= -7, 12,-26, 12, 7,-27, 0, -3,-26, 3,-24,-16, 13,-11, 3, 0, 2, -7,-23,-30,-18, 4; /M: SY='R'; M=-10, 0,-26, -1, 4,-20,-13, 3,-22, 9,-19, -9, 3,-15, 9, 11, -2, -6,-19,-21, -7, 5; /M: SY='V'; M= -2,-25,-17,-29,-24, 9,-26,-20, 15,-21, 11, 6,-23,-25,-22,-20,-14, -5, 17,-10, 6,-23; /M: SY='L'; M= -6,-18,-20,-21,-14, 1,-25,-13, 5,-13, 11, 5,-15,-22,-12, -9,-11, 1, 5,-18, 1,-14; /M: SY='I'; M= -5,-28,-18,-33,-27, 2,-32,-27, 32,-26, 19, 14,-24,-25,-23,-24,-16, -5, 29,-23, -4,-27; /M: SY='M'; M= 0,-15,-21,-18,-10, -8,-18, -7, 2,-12, 4, 5,-12,-20, 0,-11, -7, -5, -1,-18, 0, -6; /M: SY='D'; M=-15, 21,-24, 30, 10,-22,-15, -2,-25, -2,-19,-18, 8,-15, -1, -4, -2, -7,-19,-31,-12, 4; /M: SY='P'; M= -3,-17,-34,-10, -1,-26,-17,-19,-17,-10,-25,-17,-17, 66, -9,-19, -5, -6,-23,-30,-27, -9; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='A'; M= 7, 1,-21, 1, 4,-24, -1,-10,-21, -3,-19,-14, 1,-10, 0, -9, 7, -1,-15,-27,-18, 2; /M: M= -7, -3,-25, -4, -3,-17, -4, -7,-13, -6,-12, -6, -1,-16, -5, -7, -4, -7,-10,-25,-12, -5; /M: SY='G'; M= 0, -7,-25, -8, -8,-24, 23,-14,-25, -7,-20,-13, -1,-15, -7, -8, 1,-10,-19,-24,-21, -8; /M: SY='P'; M= -6,-11,-25,-10, -1,-17,-21,-14,-11, 0,-13, -8, -9, 7, -3, 0, -6, -4,-10,-25,-14, -4; /M: SY='V'; M= -7,-13,-19,-14, -4,-10,-24,-10, -1, -6, -2, -1,-11,-19, -3, -3, -7, -3, 1,-22, -4, -5; /M: SY='R'; M= -6,-10,-23,-13, -5,-13,-21,-12,-10, 7,-10, -4, -7,-17, -3, 10, -5, 0, -5,-17, -7, -5; /M: SY='L'; M=-10,-26,-21,-28,-19, 6,-30,-16, 19,-22, 25, 16,-24,-26,-16,-17,-22, -9, 12,-15, 5,-19; /M: SY='S'; M= -1, 4,-21, 5, 1,-23, -7,-11,-22, -4,-27,-19, 7, 7, -3, -7, 16, 9,-17,-34,-20, -2; /M: SY='L'; M=-10,-14,-25,-15, -7, -5,-24, -7, -2, -6, 2, 0,-11,-13, -4, -2,-12, -6, -5,-17, 1, -7; /M: SY='E'; M= -1, 10,-23, 13, 16,-25,-12, -4,-22, 0,-19,-16, 5,-10, 7, -6, 6, -2,-19,-28,-16, 11; /M: SY='E'; M= -7, 7,-26, 13, 31,-27,-15, -3,-25, 5,-19,-16, 0, -5, 12, 0, 2, -5,-22,-29,-17, 21; /M: SY='F'; M=-13,-29,-21,-35,-25, 40,-28,-21, 11,-29, 24, 9,-24,-27,-29,-21,-22,-10, 7, -7, 12,-25; /M: SY='E'; M= -3, -1,-24, -1, 13,-17,-12, -7,-16, 0, -9, -7, -2,-12, 3, -5, -2, -6,-15,-25,-12, 8; /M: SY='E'; M= 2, 5,-23, 6, 11,-26,-11, -5,-23, 8,-22,-14, 4, -8, 6, 1, 5, -1,-18,-28,-16, 8; /M: SY='R'; M= -9, -4,-20, -6, 1,-17,-16, 2,-14, -2, -9, -5, -1,-17, 2, 4, -5, -6,-13,-27, -9, 0; /M: SY='W'; M=-15,-27,-33,-30,-23, 22,-24,-14, -6,-18, -6, -7,-24,-25,-19,-17,-23,-15,-12, 57, 32,-20; /M: SY='S'; M= 1, 0,-18, -2, -3,-18, -9,-10,-15, -8,-17,-12, 2, -9, -3, -8, 13, 12, -9,-31,-14, -4; /M: SY='G'; M= -5, 0,-28, -1, -6,-24, 32,-10,-30, -9,-25,-17, 6,-18, -9, -9, 1,-13,-26,-22,-19, -8; /M: SY='Y'; M=-10,-13,-23,-13, -4, -7,-22,-10, -2, -4, -3, -1,-12,-19, -6, -2,-10, -5, -1,-18, 1, -6; /M: SY='I'; M= 3,-23,-18,-28,-21, 0,-22,-22, 16,-22, 14, 8,-20,-22,-19,-22,-13, -6, 13,-17, -4,-21; /M: SY='L'; M= -8,-25,-21,-29,-20, 6,-29,-22, 19,-24, 20, 12,-22,-24,-18,-21,-19, -8, 13,-13, 0,-20; /M: SY='L'; M= -9,-19,-17,-21,-11, 6,-25,-17, 4,-16, 15, 5,-18,-23,-13,-12,-13, -3, 3,-20, -2,-12; /M: SY='V'; M= -5,-24,-11,-27,-20, 3,-27,-20, 12,-19, 11, 6,-22,-22,-20,-15,-14, -6, 16,-22, -4,-21; /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 39 in 39 different sequences |
| Number of true positive hits | 39 in 39 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Archaea, Bacteriophages, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | V_Lesaux |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Peptidase C39 |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
39 sequences
COMA_STRPN (Q03727), COMA_STRR6 (P59653), CVAB_ECOLX (P22520), CYAB_BORP1 (P0DKX6), CYAB_BORPE (P0DKX5), HLYB3_ECOLX (Q47258), HLYBC_ECOLX (P10089), HLYBP_ECOLX (P08716), HLYB_ECO57 (Q46717), HLYB_ECOL6 (Q8FDZ8), HLYB_PROVU (P11599), LAGD_LACLL (P59852), LCN3_LACLL (P37608), LCNCL_LACLA (Q9CJB8), LCNC_LACLL (Q00564), LKB13_MANHA (Q93FH2), LKB14_MANHA (P0C087), LKB16_MANHA (Q93FH3), LKB1A_MANHA (P16532), LKB1B_MANHA (Q93FH6), LKB2A_MANHA (Q93FH0), LKB2B_MANHA (Q93FG6), LKTB7_MANHA (P0C086), LKTB_BIBTR (Q933E0), LKTB_MANGL (Q933I3), LKTB_PASSP (P55122), LTXB_AGGAC (P23702), MCHF_ECOLX (Q9EXN5), MESD_LEUME (Q10418), PAXB_PASAE (Q9RCG7), PEDD_PEDAC (P36497), RTX1B_ACTPL (P26760), RTX3B_ACTPL (Q04473), SUNT_BACSU (P68579), SUNT_BPSPB (P68580), Y049_METTM (Q50770), Y1463_METTH (Q50500), Y390_MYCGE (Q49430), Y571_MYCPN (P75207)» more
|
| PDB [Detailed view] |
6 PDB
3ZUA; 7SGR; 8DCK; 8HF4; 8HF5; 8K7A |