PROSITE entry PS51020
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | SPONDIN |
| Accession [info] | PS51020 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-SEP-2004 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51020 |
| Associated ProRule [info] | PRU00364 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Spondin domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=192; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=187; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9993305; R2=0.0142158; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=458; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=317; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='P'; M= -4,-14,-26,-12, -5,-19,-16,-18, -5,-11,-14, -9,-13, 19,-10,-16, -5, -5, -3,-29,-20,-10; /M: SY='D'; M= -8, 4,-24, 9, 2,-21,-14,-10,-11, -7, -7, -7, -3,-16, 0,-10, -5, -7, -8,-28,-13, 1; /M: SY='R'; M= -1, -5,-21, -5, 2,-19,-13,-11,-17, 3,-13,-10, -4,-11, 0, 7, 2, 3,-10,-26,-14, 0; /M: SY='E'; M= -8, 1,-25, 1, 5,-19,-12, -9,-10, -7,-11, -1, -2, -3, -2,-11, -3, -1,-11,-28,-15, 1; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='C'; M= -4,-10, 57,-19,-19,-16,-23,-24,-21,-20,-17,-16, -9,-25,-19,-20, 6, 17, -6,-41,-21,-19; /M: SY='A'; M= 45,-12,-11,-21,-11,-18, -2,-20, -8,-12, -5, -8,-12,-12,-11,-20, 7, -1, 1,-20,-18,-11; /M: SY='C'; M=-12,-12, 53,-14,-13,-24,-25,-21,-29,-15,-23,-20,-13, -9,-17,-13, -9,-10,-17,-41,-26,-16; /M: SY='D'; M= -6, 14,-26, 22, 4,-31, 12, -8,-34, -5,-28,-23, 8, -9, -4, -6, 6, -7,-25,-32,-22, -1; /M: SY='T'; M= -3, -6,-21, -6, 10,-15,-22,-14, -9, -8, -4, -8, -8, -2, -3,-11, 0, 11, -9,-27,-13, 3; /M: SY='A'; M= 47,-10,-11,-19,-11,-21, 4,-20,-12,-11,-11,-11, -9,-11,-11,-20, 9, -1, -2,-20,-21,-11; /M: SY='K'; M= -9, -3,-27, -3, 6,-27,-20,-10,-24, 37,-25, -8, -2,-13, 9, 26, -7, -7,-14,-22,-11, 7; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='R'; M=-10, -1,-26, 2, 13,-23,-16, -5,-24, 13,-21,-14, 2,-12, 8, 24, 3, -3,-18,-28,-14, 8; /M: SY='L'; M= -8,-29,-20,-33,-25, 8,-32,-23, 28,-27, 32, 19,-27,-27,-22,-22,-23, -8, 22,-21, -1,-24; /M: SY='T'; M= -1,-10,-12,-16,-13, -7,-24,-23, 4,-13, -3, -3,-10,-16,-15,-14, 8, 28, 15,-30,-10,-14; /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28, 68,-30,-20, 3,-30, 17, 3,-22,-30,-37,-20,-22,-10, 2, 5, 25,-28; /M: SY='T'; M= -9, -3,-23, -4, 8, -8,-23, 3,-12, -5,-10, -8, -4,-12, 0, -7, 1, 11,-11,-18, 8, 2; /M: SY='G'; M= -2, -9,-28,-10,-17,-27, 54,-18,-37,-15,-27,-18, 0,-19,-16,-11, 1,-14,-27,-21,-27,-17; /M: SY='K'; M=-11, -4,-27, -8, -2,-16,-22, 0, -7, 7, -9, -1, 1,-18, 7, 3, -9, -9,-10,-20, 0, 1; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='S'; M= 11, -1,-10, -4, -4,-17, -5,-14,-16,-10,-23,-16, 6,-10, -4,-11, 32, 26, -6,-36,-17, -4; /M: SY='Q'; M=-13, 0,-30, 1, 17,-30,-18, 3,-25, 16,-22, -9, 3, -7, 28, 25, -3, -9,-26,-24,-13, 21; /M: SY='N'; M= -6, 9,-22, 3, 10,-22,-15, 3,-21, 6,-20,-12, 12,-11, 9, 2, 6, 8,-19,-29,-12, 9; /M: SY='T'; M= 13,-10,-12,-18,-12, -9,-16,-20, -3,-14, 3, -3,-10,-14,-12,-15, 6, 21, 2,-25,-11,-12; /M: SY='H'; M=-20,-12,-25,-16,-13, 25,-24, 42,-17,-19, -7, -1, -3,-24,-13, -9,-14,-15,-16,-12, 23,-13; /M: SY='P'; M=-11,-22,-41,-13, -3,-26,-20,-21,-20,-11,-29,-20,-22, 79,-11,-20,-13,-12,-30,-13,-24,-11; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='D'; M=-18, 27,-30, 38, 15,-35,-15, 28,-33, -1,-25,-16, 13,-13, 14, -3, -3,-13,-30,-33, -8, 13; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-25,-22, 42,-30, 10, 0,-15, 2, 0,-20,-30,-17,-12,-20,-10, -8, 25, 68,-22; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='L'; M= -4,-10,-14,-11,-10, 2,-16,-13, 0,-16, 12, 1,-10,-17,-12,-13, -5, 2, 0,-19, -4,-10; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='Y'; M= -8,-11,-21,-14, -8, 14,-17, -3, -7, -8, -3, -5, -8,-18,-10, -6,-11, -8,-10, 10, 19, -9; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='R'; M=-15, -4,-29, -2, 2,-22,-12, -5,-25, 17,-20,-11, 1,-17, 4, 38, -6,-10,-18,-23,-13, 0; /M: SY='W'; M=-15,-23,-40,-19,-10,-13,-21,-12,-21, -7,-23,-16,-22, 26, -9, -6,-19,-16,-27, 28, -1,-12; /M: SY='P'; M= -2,-15,-28,-13, -4,-19,-14,-16,-14, -8,-10,-10,-14, 23, -8, -6, -7, -4,-15,-25,-19, -8; /M: SY='A'; M= 21, 1,-11,-10, -9,-16, -8,-16,-11, -9,-13,-11, 4,-11, -9,-13, 14, 20, -4,-27,-16, -9; /M: SY='H'; M=-15, -2,-30, -2, 9,-29,-20, 37,-25, 8,-20, -2, 3,-15, 33, 20, -5,-13,-28,-23, 0, 18; /M: SY='W'; M=-19,-37,-40,-39,-29, 28,-23,-27,-11,-23, -6,-11,-34,-30,-25,-20,-34,-23,-19, 98, 27,-23; /M: SY='S'; M= 7, -2, -6, -4, -5,-20, 3,-13,-21,-12,-27,-19, 6,-12, -5,-12, 31, 19,-11,-37,-20, -5; /M: SY='D'; M= 3, 6,-25, 12, 12,-29,-11,-10,-25, 3,-25,-19, 0, 9, 0, -7, 5, -4,-20,-30,-20, 5; /M: SY='L'; M= -7,-27,-19,-30,-23, 4,-30,-23, 25,-25, 30, 18,-25,-26,-20,-20,-20, -3, 21,-23, -3,-23; /M: SY='I'; M=-10,-29,-26,-36,-26, 3,-36,-25, 39,-29, 30, 22,-23,-23,-19,-26,-23,-10, 22,-20, 0,-26; /M: SY='G'; M= 0,-11,-29,-11,-21,-28, 64,-21,-36,-20,-28,-18, -2,-21,-21,-20, -1,-19,-25,-21,-29,-21; /M: SY='A'; M= 25,-15,-13,-20,-15,-15, -5,-20, -3,-10, -8, -6,-13,-17,-14,-12, 4, -1, 9,-24,-17,-15; /M: SY='T'; M= 12, -1,-10, -7, -6,-16, -8,-16,-14,-10,-19,-14, 3,-10, -6,-11, 27, 29, -4,-33,-16, -6; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='S'; M= 4, 8,-13, 5, 2,-20, -3, -8,-20, -7,-27,-19, 16,-11, 0, -8, 31, 18,-13,-39,-19, 1; /M: SY='S'; M= 4, -3,-17, -4, 1,-20, -7, -1,-19, -1,-21,-13, 2,-13, 0, -2, 16, 6,-11,-31,-13, 0; /M: SY='D'; M=-12, 37,-25, 41, 13,-31, -7, 2,-30, 0,-29,-24, 29,-13, 4, -6, 8, -3,-27,-39,-19, 8; /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21, 34,-30, 17, 0,-12, 1, 0,-20,-30,-12,-11,-20,-10, -9, 28, 76,-21; /M: SY='H'; M= -4, -8,-21,-10, -6,-17,-16, 13,-16, -1,-16, -7, 0,-17, 0, 12, 4, 0, -8,-28, -6, -6; /M: SY='L'; M=-13,-28,-21,-32,-23, 24,-29,-14, 16,-25, 31, 20,-25,-28,-20,-18,-25,-10, 7, -9, 14,-21; /M: SY='W'; M=-20,-38,-48,-38,-29, 12,-21,-26,-18,-19,-18,-18,-38,-30,-19,-19,-38,-28,-28,141, 34,-20; /M: SY='Q'; M= -5, 0,-27, 1, 20,-29,-11, 6,-25, 7,-20,-10, 0,-10, 21, 7, 0, -7,-24,-24,-13, 20; /M: SY='Y'; M=-12,-12,-29,-12, -5, -3,-13, -1, -9, -1,-11, -6,-10,-19, -5, -4,-10,-10,-12, -4, 20, -7; /M: SY='G'; M= -4, -1,-26, -7,-16,-22, 38,-11,-25,-15,-20, -7, 9,-20,-13,-14, -2,-14,-23,-24,-22,-14; /M: SY='G'; M= -1, -1,-26, 1, 11,-29, 12, 1,-29, -5,-24,-14, 2,-11, 9, -7, 5, -9,-26,-26,-18, 10; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='Y'; M=-12,-19,-26,-20,-15, 3,-26, -8, 2,-11, -1, -1,-16, -3,-12, -8,-12, -1, -3, -8, 15,-16; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='A'; M= 30,-13,-14,-18,-10,-19, -7,-20, -7,-11,-12,-10,-12, 1,-12,-19, 8, 1, 2,-25,-20,-12; /M: SY='S'; M= 6, -4,-10, -7, -7,-15, -9,-15,-10,-11,-19,-13, 2,-13, -7,-11, 28, 25, 1,-36,-16, -7; /M: SY='E'; M= -4, 13,-23, 13, 14,-23,-13, -3,-18, 4,-16, -7, 9,-12, 3, -4, -1, -7,-16,-30,-16, 8; /M: SY='G'; M= 6,-10,-27,-11,-19,-29, 61,-20,-36,-19,-27,-19, -1,-19,-19,-20, 1,-17,-26,-20,-29,-19; /M: SY='M'; M= -7,-27,-16,-31,-25, 9,-27,-18, 22,-20, 21, 26,-26,-27,-20,-17,-18, -6, 26,-21, -1,-22; /M: SY='R'; M=-13, -3,-30, -3, 7,-27,-20, -7,-30, 43,-27,-10, 0,-13, 10, 44,-10,-10,-20,-20,-10, 7; /M: SY='E'; M= -9, 11,-27, 17, 29,-33,-16, 3,-25, 5,-21,-11, 4, -7, 28, 0, 4, -7,-26,-29,-16, 28; /M: SY='F'; M=-11,-29,-18,-34,-27, 33,-31,-22, 17,-26, 18, 8,-25,-29,-30,-20,-19, -7, 19, -9, 12,-27; /M: SY='A'; M= 44,-10,-10,-19,-10,-19, -1,-20, -9,-10,-11,-10, -9,-11,-10,-19, 12, 2, 1,-22,-20,-10; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='H'; M=-15,-15,-31,-15, -8,-10,-20, 17,-19, -4,-12, -6,-10,-22, 1, 5,-14,-14,-20, 14, 10, -4; /M: SY='G'; M= 2,-11,-21,-12,-20,-29, 61,-21,-38,-20,-29,-20, -2,-21,-20,-21, 0,-19,-27,-22,-30,-20; /M: SY='S'; M= 5, 1,-17, 0, 10,-20, -8, -8,-19, -3,-20,-15, 5,-11, 3, -2, 17, 6,-14,-33,-18, 6; /M: SY='T'; M= 8, -9,-18,-12, -8,-18,-15,-20,-12,-10,-16,-12, -8, 17,-10,-15, 10, 19, -7,-28,-18,-10; /M: SY='W'; M=-11,-15,-27,-15,-14, -7,-21,-14,-11, -2,-12, -9,-15,-23,-10, 9,-13, -8, -4, 14, 3,-13; /M: SY='K'; M= 1, -6,-21, -8, -4,-16,-18,-15,-11, 4, -5, -3, -8,-10, -5, -2, -4, 4, -7,-24,-11, -5; /M: SY='L'; M= -6,-27,-19,-29,-19, 7,-27,-17, 18,-25, 41, 25,-27,-27,-16,-18,-26, -9, 9,-20, -1,-18; /M: SY='E'; M=-10, 4,-27, 10, 33,-23,-21, -3,-15, 2,-11, -4, -4, -7, 10, -5, -5, -9,-15,-29,-15, 21; /M: SY='K'; M= -3, 4,-22, 2, 11,-24,-13, -6,-24, 16,-24,-15, 8,-11, 6, 13, 7, 2,-18,-28,-15, 8; /M: SY='E'; M=-11, 15,-29, 23, 52,-30,-18, 1,-30, 8,-22,-21, 7, -2, 17, -1, 1, -9,-30,-32,-20, 34; /M: SY='I'; M= 3,-25,-22,-33,-23, 2,-27,-24, 26,-24, 18, 14,-20,-21,-18,-24,-15, -7, 18,-19, -3,-23; /M: SY='R'; M=-12, -2,-29, 0, 14,-26,-11, -5,-30, 25,-24,-14, 1,-12, 9, 31, -4, -9,-22,-23,-14, 9; /M: SY='E'; M= 11, 2,-22, 1, 19,-26,-13, -7,-17, 0,-15,-11, -1, -8, 12, -8, 3, -6,-16,-25,-17, 15; /M: SY='Q'; M= 7, 6,-22, -1, 5,-28,-10, -2,-19, 11,-21, -9, 10,-12, 18, 4, 3, -5,-20,-24,-15, 12; /M: SY='G'; M= 1, -8,-23,-10,-11,-20, 25,-14,-27,-11,-23,-15, 0,-16, -7, -9, 7, -3,-19,-23,-19, -9; /M: SY='E'; M= -9, 14,-28, 19, 24,-32,-15, 0,-28, 8,-24,-16, 7, -4, 17, 3, 2, -7,-26,-30,-17, 20; /M: SY='K'; M=-10, 6,-26, 8, 13,-25,-17, -1,-24, 18,-22,-13, 6,-13, 6, 16, -4, -8,-17,-27,-13, 8; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='I'; M= -6,-21,-21,-24,-18, -7,-18,-19, 16,-19, 11, 9,-18,-22, -9,-17,-13, -8, 13,-21, -7,-15; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5; /M: SY='R'; M=-10,-11,-22,-13, -4,-14,-20, -6, 1, 2, -4, 2, -6,-14, 9, 13, -8, -7, -2,-16, -5, 0; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='R'; M= -5, -3,-20, -4, 1,-21,-13, -8,-24, 16,-25,-14, 4,-13, 4, 23, 12, 8,-14,-28,-14, 1; /M: SY='V'; M= 4,-16,-12,-22,-19, -7,-23,-24, 11,-16, 0, 2,-14,-19,-18,-17, 4, 17, 21,-28,-10,-19; /M: SY='Y'; M=-13,-13,-28,-16,-13, -3,-21, 2, 1,-10, 1, 3, -9,-21,-10,-10,-16,-12, -3,-18, 5,-13; /M: SY='A'; M= 7, -8,-23,-11, -9,-19, -9,-17, -3, -8,-10, -3, -7, -7, -8,-14, -2, -6, -3,-24,-15,-10; /M: SY='Q'; M= -2, -8,-24, -9, 5,-22,-20, -9, -9, 11,-11, 1, -8,-13, 12, 4, -7, -8, -7,-22,-10, 8; /M: SY='W'; M= -1,-26,-27,-30,-21, 20,-20,-20, -7,-19, -7, -8,-23,-12,-23,-19,-16,-12, -8, 29, 13,-20; /M: SY='P'; M= 0, -9,-24, -7, -2,-24, -2,-12,-24, 1,-26,-16, -2, 10, -3, 5, 8, -1,-19,-28,-21, -5; /M: SY='A'; M= 17,-12,-19,-19,-16,-18, 12,-19,-10,-15,-10, -3, -8,-15,-13,-19, 3, -2, -5,-21,-18,-15; /M: SY='P'; M= -8,-25,-35,-22,-14,-10,-18,-20, -7,-17, -9, -8,-23, 23,-15,-20,-18,-13,-15, 7, -5,-16; /M: SY='A'; M= 9,-11,-24,-14, -4,-15, -6, -9,-17, -8,-17,-12,-10,-15, 3,-11, 1, -6,-16, 7, -1, 0; /M: SY='Y'; M=-13,-23,-29,-24,-17, 3,-28,-11, 7,-12, -2, 3,-19, 1,-13,-10,-16, -9, 1,-10, 12,-19; /M: SY='P'; M= -9,-21,-33,-14, -5,-21,-21,-19,-12,-11,-15,-12,-19, 53,-11,-14,-11, -8,-17,-28,-23,-12; /M: SY='N'; M= -4, 17,-19, 9, 0,-20, -5, 0,-19, 3,-24,-11, 26,-16, 1, 2, 11, 2,-19,-34,-17, 0; /M: SY='V'; M= -2,-19,-20,-22,-24,-12, 6,-25, 3,-20, -5, -2,-14,-23,-23,-20, -5, -3, 12,-25,-16,-24; /M: SY='T'; M= -3, -4,-19,-12, -7, -7,-18,-12,-12, -1,-12, -8, 1,-15, -4, 5, 4, 11, -8,-23, -7, -6; /M: SY='G'; M= 14, -9,-23,-12,-14,-27, 43,-18,-30,-15,-24,-16, -2,-16,-12,-18, 5,-12,-21,-21,-26,-13; /M: SY='Q'; M= 0, 0,-23, -5, 1,-24,-15, 4,-20, 7,-20, -9, 4, -7, 9, 6, 2, 2,-18,-25,-10, 4; /M: SY='T'; M= 5, -6,-15,-11, -8,-15,-16,-19,-11,-11,-15,-12, -5, 5,-10,-13, 15, 28, -3,-31,-16,-10; /M: SY='S'; M= 0, -7,-15, -9, -2, -8,-12,-11,-11, -9,-11, -4, -2,-14, -4, -9, 15, 10, -6,-29,-11, -2; /M: SY='A'; M= 33, -6,-10,-14, -8,-18, -4,-18,-12,-10,-14,-12, -4,-10, -8,-16, 17, 14, -2,-26,-18, -8; /M: SY='E'; M= -7, 10,-25, 13, 28,-27,-15, -2,-22, 7,-21,-16, 8, -8, 13, 0, 4, -4,-21,-31,-18, 21; /M: SY='F'; M= -7,-28,-17,-34,-26, 39,-27,-22, 10,-26, 15, 5,-23,-28,-31,-20,-16, -7, 14, -8, 10,-26; /M: SY='R'; M=-10, -7,-25, -6, 9,-12,-14, -7,-21, 6,-14,-11, -3,-15, 2, 19, -2, -6,-15,-24,-11, 4; /M: SY='V'; M= 1,-29,-12,-30,-28, 1,-29,-28, 27,-21, 15, 11,-29,-29,-28,-20,-12, -2, 42,-28, -9,-28; /M: SY='D'; M=-17, 33,-28, 44, 13,-30,-13, 11,-33, -2,-25,-21, 16,-12, 5, -7, 0, -7,-27,-34,-12, 9; /M: SY='P'; M= -6,-10,-28, -7, 0,-24,-14,-11,-23, 6,-26,-16, -5, 21, 0, 14, 3, -2,-20,-28,-20, -3; /M: SY='R'; M=-11, -5,-24, -9, -5,-13,-20, -5, -9, 6,-13, -6, 3,-19, -2, 16, -5, -3, -6,-24, -6, -6; /M: SY='H'; M=-18, -1,-29, -1, 0,-20,-19, 80,-29, -4,-21, -3, 9,-19, 9, 9, -7,-16,-27,-29, 13, 0; /M: SY='H'; M=-10, -3,-26, -1, 0,-21,-14, 52,-26,-10,-24, -9, 6, -2, 4, -6, 5, -7,-24,-33, 2, -1; /M: SY='L'; M=-11,-24,-22,-26,-15, 8,-27,-14, 11,-18, 30, 19,-23,-25,-10,-12,-24,-10, 3,-17, 1,-12; /M: SY='V'; M= -4,-29,-16,-32,-28, 1,-31,-26, 32,-22, 17, 18,-27,-27,-24,-21,-15, -4, 38,-26, -6,-27; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26, 49,-30,-20, 10,-30, 26, 9,-24,-30,-31,-20,-24,-10, 5, -3, 17,-26; /M: SY='V'; M= 11,-23,-15,-28,-21, -4,-21,-21, 17,-19, 14, 13,-22,-22,-18,-20,-10, -4, 21,-23, -9,-20; /M: SY='T'; M= 9,-11,-10,-15,-13,-11,-15,-20, 0,-13, -9, -7, -8,-16,-13,-14, 15, 20, 13,-31,-14,-13; /M: SY='R'; M=-13,-12,-26,-16, -6,-14,-20, -2, -8, 17, -5, 21, -9,-18, 6, 25,-14,-10, -7,-20, -6, -2; /M: SY='I'; M=-12,-29,-25,-37,-27, 17,-34,-24, 32,-28, 24, 18,-22,-24,-23,-24,-22,-10, 20,-15, 5,-27; /M: SY='G'; M= -5, -5,-24, -2, -9,-21, 11,-18,-13,-14,-14,-10, -7,-19,-16,-17, -4,-11, -2,-27,-20,-12; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='F'; M=-12,-17,-14,-27,-24, 24,-27,-19, 12,-23, 4, 2, -7,-26,-25,-19,-13, -7, 9,-16, 4,-24; /M: SY='V'; M= -2,-30,-13,-31,-29, 1,-31,-29, 31,-22, 15, 12,-29,-29,-28,-21,-13, -2, 44,-28, -8,-29; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='V'; M= -4,-30,-16,-32,-28, 2,-32,-28, 31,-24, 21, 14,-28,-28,-26,-22,-16, -4, 37,-26, -6,-28; /M: SY='D'; M= 1, 17,-17, 22, 5,-26, -6, -9,-25, -6,-26,-21, 11,-10, -2,-11, 20, 11,-15,-37,-19, 1; /M: SY='G'; M= 6, -3,-20, -5,-11,-25, 33,-15,-29,-14,-28,-19, 6,-15,-11,-15, 17, 0,-20,-29,-25,-11; /M: SY='L'; M=-11,-25,-21,-25,-11, 13,-29,-18, 11,-24, 34, 12,-25,-26,-18,-17,-24,-10, 5,-18, 1,-14; /M: SY='D'; M=-15, 35,-28, 44, 30,-33,-12, 2,-33, 3,-27,-25, 20, -8, 7, -5, 2, -8,-30,-37,-20, 18; /M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21, 9,-30,-21, 21,-29, 48, 19,-30,-30,-21,-20,-29, -9, 12,-21, -1,-21; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='L'; M= -8, -5,-21, -4, 4,-11,-23,-13, -5,-10, 6, -2,-10,-16, -4, -8, -6, 5, -4,-27,-10, 0; /M: SY='G'; M= -5, -7,-29, -5, -2,-27, 19,-13,-31, -1,-27,-17, -2, -3, -5, 2, 1, -9,-25,-24,-23, -5; /M: SY='D'; M=-12, 30,-27, 34, 10,-31, 7, -2,-33, -1,-29,-24, 24,-14, -2, -7, 2, -9,-30,-34,-22, 4; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='C'; M= -6,-12, 71,-18,-18,-12,-18,-18,-18,-18,-12,-12,-12,-24,-18,-18, -6, -6, -6,-29,-18,-18; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='S'; M= -3, -3,-19, -6, -4,-20, -3, -3,-23, -1,-22,-13, 3,-14, 0, 5, 13, 12,-15,-29,-13, -3; /M: SY='W'; M=-19,-39,-49,-39,-30, 9,-17,-30,-21,-20,-20,-20,-39,-30,-20,-20,-39,-30,-30,144, 28,-20; /M: SY='M'; M= -6,-16,-22,-19,-11,-11,-24,-16, 3, 5, 1, 8,-14,-19, -7, 4,-13, -6, 6,-22, -7,-10; /M: SY='E'; M=-11, 13,-30, 22, 46,-33,-19, 2,-29, 9,-21,-17, 2, -3, 26, 1, 0,-10,-30,-29,-18, 36; /M: SY='E'; M= -7, 5,-24, 4, 16,-26,-15, -2,-24, 12,-23,-13, 8,-10, 15, 13, 6, 2,-21,-28,-15, 15; /M: SY='V'; M= 1,-16,-19,-19,-13,-11,-22,-18, 3, 3, -2, 6,-15,-19,-10, -1, -9, -3, 11,-23, -9,-12; /M: SY='T'; M= 2, -5,-15, -5, -9,-14,-18,-19, 0,-12, -8, -7, -8,-17,-13,-15, 6, 11, 11,-31,-14,-11; /M: SY='L'; M=-10,-22,-21,-25,-17, 12,-26,-13, 9,-19, 14, 10,-17,-24,-12,-14,-14, -7, 6,-17, 3,-14; /M: SY='D'; M=-16, 40,-28, 51, 24,-34,-10, 2,-34, 2,-28,-26, 23,-10, 4, -6, 2, -8,-30,-38,-20, 14; /M: SY='L'; M=-10,-26,-21,-26,-13, 6,-29,-18, 16,-26, 44, 16,-27,-27,-16,-18,-27,-10, 6,-21, -2,-15; /M: SY='Y'; M=-17,-14,-29,-14,-14, 13,-27, 11, -2,-13, -4, -2,-14,-15, -9,-12,-15,-11, -9, 3, 37,-15; /M: SY='P'; M=-10,-18,-39, -9, 2,-31,-20,-17,-20, -8,-29,-18,-18, 81, -4,-17, -9,-10,-30,-29,-28, -6; /M: SY='W'; M=-18,-31,-37,-32,-26, 17,-24,-11, -8,-19, -6, -8,-30,-29,-19,-17,-29,-20,-14, 75, 32,-21; /M: SY='D'; M=-19, 44,-31, 63, 18,-39,-11, -2,-38, -1,-30,-29, 16, -1, -1,-11, -1,-10,-30,-39,-21, 8; /M: SY='A'; M= 39,-13,-13,-20,-11,-19, -5,-21, -7,-11,-10, -9,-13, -3,-12,-20, 6, -1, 3,-22,-20,-12; /M: SY='G'; M= -2, -5,-30, -3,-16,-31, 63,-18,-40,-18,-30,-21, 2,-19,-18,-19, 0,-19,-30,-22,-29,-17; /M: SY='T'; M= 0, -3,-10,-12,-12, -9,-21,-21, -6,-11, -8, -8, -3,-12,-12,-11, 17, 46, 4,-30,-10,-12; /M: SY='D'; M=-18, 43,-28, 61, 16,-36,-12, -3,-34, -2,-26,-26, 16,-12, -3,-11, -1, -9,-23,-39,-19, 6; /M: SY='S'; M= 6, 2,-12, 1, 0,-20, -2, -8,-21, -6,-29,-19, 13,-12, 1, -2, 33, 16,-12,-38,-19, 0; /M: SY='G'; M= -2,-10,-30,-10,-18,-29, 62,-18,-39,-16,-29,-19, 0,-20,-17,-12, -1,-19,-29,-20,-28,-18; /M: SY='F'; M=-12,-28,-26,-32,-23, 22,-30,-24, 13,-24, 4, 2,-21, 0,-26,-23,-16, -9, 8,-13, 3,-25; /M: SY='T'; M= 2, 0,-10, -8, -8,-12,-15,-18,-12,-10,-15,-12, 2,-10, -8,-10, 25, 43, -2,-32,-12, -8; /M: SY='Y'; M=-17,-22,-25,-25,-22, 44,-27, 3, -2,-17, 1, -2,-17,-28,-20,-14,-15, -7, -6, 17, 53,-22; /M: SY='S'; M= -1, -4,-17, -6, 4,-15,-13, -8, -9, -7,-12, 1, -1,-11, 1, -9, 13, 12, -6,-31,-13, 2; /M: SY='S'; M= 10, -2,-12, -3, -2,-16, -3, -8,-18,-10,-26,-18, 6,-12, -2,-11, 33, 16, -9,-32,-11, -2; /M: SY='P'; M= -1,-17,-33,-10, -1,-28,-15,-19,-19,-10,-28,-19,-16, 67, -9,-19, -2, -6,-24,-30,-28, -9; /M: SY='N'; M=-10, 38,-21, 27, 4,-24, -2, 6,-24, -1,-30,-22, 48,-17, 0, -3, 11, 0,-28,-40,-20, 2; /M: SY='F'; M= -9, -7,-25, -8, -2, 4,-18,-10,-17, -3,-15,-10, -6,-17, 0, -5, -3, -6,-16, -4, 1, 1; /M: SY='P'; M= 1,-11,-31, -6, 9,-27,-16, -6,-21, -6,-23,-16,-11, 42, -3,-14, -3, -8,-24,-28,-22, 0; /M: SY='T'; M= -3, -1,-15, -8, -5,-15,-19,-14,-13, -4,-13, -9, 0,-11, 2, 0, 15, 35, -6,-28,-10, -2; /M: SY='I'; M= -3,-14,-22,-19, -9,-12,-26,-18, 15,-14, 0, 4,-10,-16, -3,-16, -4, -2, 11,-25, -9, -8; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='P'; M=-12,-11,-32, -8, 6,-23,-21, -4,-20, 2,-21, -8, -8, 21, 21, 5, -6,-10,-26,-21,-13, 12; /M: SY='D'; M=-13, 20,-30, 32, 29,-28, -7, 0,-32, 1,-23,-22, 6, -9, 6, -7, -2,-11,-28,-27,-12, 17; /M: SY='R'; M= -8, -4,-21, -5, -6,-17,-21,-14,-11, 7,-14, -8, -4,-12, -6, 9, -2, 5, 0,-28,-12, -7; /M: SY='I'; M= -8,-22,-23,-26,-24, -4,-32,-23, 32,-22, 13, 18,-19,-22,-18,-23,-16, -7, 27,-24, -4,-24; /M: SY='R'; M=-12, -7,-22,-11, -7, -7,-22, 4,-17, 5,-13, -7, -3,-18, -1, 20, -1, 12,-12,-16, 8, -7; /M: SY='R'; M=-14, -9,-32, -6, 8,-23,-12, -7,-26, 9,-21,-11, -7, 4, 6, 21, -9,-12,-24,-15,-15, 4; /M: SY='I'; M= -4,-27,-24,-35,-26, 0,-32,-25, 35,-25, 20, 21,-21,-21,-18,-25,-18, -8, 25,-21, -3,-25; /M: SY='T'; M= -3, -3,-16, -9, -6,-15,-19,-16,-15, -1,-16,-12, -1, -2, -6, 1, 13, 32, -7,-29,-12, -7; /M: SY='S'; M= 10, -3,-12, -7, -6,-17, -1,-13,-15,-11,-20,-10, 3,-12, -4,-12, 25, 18, -7,-33,-17, -5; /M: SY='Q'; M= -9, 0,-23, 0, 0,-18,-16, 2,-14, 2, -9, -1, 2,-17, 6, 3, -2, -5,-14,-28, -9, 2; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='Y'; M= -9, -8,-25,-10,-10, 8,-19, 10,-14, -9,-13, -8, -4,-12, -9, -9, -5, -6,-14, -9, 19,-11; /M: SY='P'; M= -6,-20,-36,-12, -2,-26,-20,-20,-16,-12,-22,-16,-20, 73,-11,-20,-10, -9,-24,-28,-27,-11; /M: SY='N'; M= -1, 6,-21, 1, 7,-22, -4, -3,-18, -1,-18, -9, 12,-13, 8, -4, 7, -2,-19,-29,-17, 7; /M: SY='H'; M= -8, 17,-23, 21, 5,-25,-11, 25,-28, -6,-24,-16, 14,-13, 1, -7, 7, -1,-22,-35, -7, 2; /M: SY='P'; M=-10,-21,-38,-12, -2,-26,-21,-20,-16,-12,-23,-16,-21, 79,-11,-20,-12,-10,-26,-29,-27,-11; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 9 in 9 different sequences |
| Number of true positive hits | 9 in 9 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Spondin |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
9 sequences
SPON1_BOVIN (Q9GLX9), SPON1_CHICK (Q9W770), SPON1_HUMAN (Q9HCB6), SPON1_MOUSE (Q8VCC9), SPON1_RAT (P35446), SPON1_XENLA (P35447), SPON2_HUMAN (Q9BUD6), SPON2_MOUSE (Q8BMS2), SPON2_RAT (Q9WV75)» more
|
| PDB [Detailed view] |
2 PDB
3D34; 3Q13 |