PROSITE entry PS51075
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | MH1 |
| Accession [info] | PS51075 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-FEB-2005 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51075 |
| Associated ProRule [info] | PRU00438 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | MAD homology domain 1 (MH1) profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=127; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=122; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6078949; R2=0.0129209; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9167.3613281; R2=4.6977000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=457; H_SCORE=11314; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=302; H_SCORE=10586; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='Q'; M= 4, -6,-23, -8, 0,-26, -6, -9,-21, 4,-21,-11, -3, -4, 9, 4, 5, 0,-17,-24,-16, 4; /M: SY='V'; M= 2,-15,-18,-22,-17, -7,-22, -7, 9,-17, 5, 9,-12,-18,-12,-16, -5, 5, 10,-25, -4,-16; /M: SY='V'; M= 9,-22,-12,-25,-21, -5,-20,-22, 16,-17, 7, 11,-21,-23,-19,-18, -5, 0, 26,-27,-11,-20; /M: SY='E'; M= -3, 0,-27, 2, 19,-28, -9, 3,-27, 12,-22,-12, 0,-10, 13, 9, -2,-11,-23,-24,-14, 15; /M: SY='R'; M=-15,-12,-15,-11, -1,-16,-23, -6,-21, 13,-17,-10, -8,-12, 0, 26,-10, -9,-14,-20, -5, -3; /M: SY='L'; M= -4,-27, -5,-29,-21, 4,-27,-22, 14,-27, 34, 13,-27,-29,-21,-21,-23, -8, 12,-24, -6,-21; /M: SY='L'; M=-10,-27,-27,-28,-20, 0,-18,-19, 4,-20, 15, 9,-26,-26,-12,-16,-23,-14, 0, 14, 2,-15; /M: SY='A'; M= 3,-11,-11,-13, -6,-16, -4,-13,-17, -2,-15,-10,-10,-19, -9, -3, -4, -8, -8,-20, -9, -9; /M: SY='Y'; M=-10,-17,-28,-14, -7, -7,-14, -9,-11, -8, -9, -8,-15, -8, -8, -5, -9, -8,-11, -3, 5, -9; /M: SY='R'; M=-12, -4,-28, -4, 8,-25,-10, -5,-28, 19,-22,-12, 0,-14, 10, 30, -4, -5,-21,-22,-14, 7; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='T'; M= -3, -9,-15,-14, -9, -6,-18,-15, 5, -7, 2, 1, -7,-12, -7, -8, -1, 9, 4,-19, -5, -9; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='C'; M= -5,-11, 1,-12, -9, -8,-14,-12, -3, -9, -3, -3, -8, -4, -8, -6, -3, -2, -3,-19,-10,-10; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10; /M: SY='T'; M= 0, 3, -8, 2, -3,-10, -9,-10, -7, -6,-10, -8, 1, -8, -5, -7, 11, 14, 0,-22, -9, -4; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='Q'; M=-11,-12,-27,-10, 5,-18,-24, -7, -9, 0, 3, 1,-13, -7, 11, 2,-13,-10,-14,-22, -9, 7; /M: SY='G'; M= -5, 6,-23, -2,-13,-19, 22, -9,-19,-13,-19,-13, 18,-22,-13,-12, 0, -9,-17,-29,-21,-13; /M: SY='D'; M= -4, 14,-25, 18, 6,-25, -6, -9,-23, -7,-18,-17, 7, -3, -5,-12, 1, -2,-20,-31,-19, 0; /M: SY='E'; M= -6, -1,-26, -3, 4,-22, 0, -8,-16, -3,-15, -9, 4,-14, 3, -6, 0, -7,-17,-27,-16, 3; /M: SY='D'; M=-11, 20,-23, 27, 14,-24,-17, -8,-23, -4,-15,-17, 6,-10, -2, -9, 4, 10,-17,-33,-15, 6; /M: SY='E'; M= -9, 7,-26, 13, 29,-25,-17, -5,-21, 3,-19,-16, 2, -7, 9, 1, 4, -5,-19,-31,-17, 18; /M: SY='E'; M= -8, 2,-28, 5, 16,-22,-18, 8,-25, 13,-20,-11, 0,-12, 12, 11, -5,-10,-22,-20, -2, 12; /M: SY='W'; M=-17,-20,-33,-20, -2, 16,-23,-15,-18, -9,-11,-13,-19,-21,-12, -4,-20,-16,-20, 40, 12, -4; /M: SY='A'; M= 15, -4, -3, -9,-11,-15,-12,-16, -7,-14, -3, -7, -4,-19,-13,-17, -2, -4, -2,-28,-16,-12; /M: SY='R'; M=-11, -5,-29, -3, 12,-25,-10, -6,-25, 17,-17, -9, -3,-14, 10, 19, -8,-11,-21,-22,-13, 10; /M: SY='K'; M= 0, -4,-25, -7, 2,-24,-16,-10,-25, 29,-22,-10, -2,-12, 5, 27, -4, -3,-15,-21,-12, 2; /M: SY='A'; M= 17,-16,-13,-20,-14,-11,-14,-19, 1,-10, -2, -3,-14,-19,-13, -8, 2, 0, 12,-25,-14,-14; /M: SY='V'; M= -6,-20, -4,-28,-24, 4,-30,-26, 15,-22, 4, 3,-16,-22,-23,-21, -5, 9, 18,-24, -4,-24; /M: SY='Y'; M=-16, -7,-29, -5, 3, -8,-25, 7, -9, -2, -4, -3, -7,-18, 0, 7,-13,-11,-12,-15, 9, -2; /M: SY='S'; M= 0, -9,-17,-10, -6, -6,-11, 2,-15,-10,-13, -9, 0,-17, -5, -2, 11, 3,-10,-27, -6, -6; /M: SY='L'; M= -9,-29,-20,-31,-22, 7,-30,-20, 24,-27, 39, 22,-28,-28,-19,-20,-26, -9, 17,-21, -1,-21; /M: SY='V'; M= -5,-27,-19,-28,-23, 2,-24,-22, 14,-21, 14, 11,-26,-27,-19,-18,-15, -6, 18, -4, -2,-20; /M: SY='R'; M=-14, 1,-29, -1, 5,-25,-18, -4,-29, 37,-26,-11, 7,-15, 9, 41, -8, -9,-21,-22,-11, 5; /M: SY='K'; M=-10,-10,-28,-11, -5,-21,-13,-14,-15, 21,-18, -5, -6,-16, -2, 18,-10,-10, -7,-21,-11, -5; /M: SY='L'; M= -5,-25,-22,-29,-19, 8,-28,-21, 16,-19, 23, 11,-21,-23,-18,-17,-20, -9, 9,-17, 0,-19; /M: SY='K'; M=-11, 7,-30, 11, 18,-31,-19, -8,-31, 39,-29,-14, 2, -9, 10, 22, -8,-10,-22,-24,-12, 14; /M: SY='E'; M= -5, 14,-28, 18, 21,-29,-13, -5,-27, 10,-25,-19, 8, 3, 5, -1, -1, -8,-25,-30,-19, 12; /M: SY='K'; M=-12, -4,-30, -4, 9,-24,-23, 1,-20, 27,-21, -6, -1,-12, 7, 19,-10,-11,-16,-22, -7, 6; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='B'; M= -6, 14, -7, 13, 5,-24,-12, -5,-21, -6,-17,-15, 12,-17, 1, -9, 2, -4,-19,-34,-18, 3; /M: SY='L'; M= -9,-22,-19,-25,-16, 7,-27,-16, 11,-20, 23, 14,-21,-24,-10,-14,-16, -2, 7,-19, 0,-13; /M: SY='E'; M=-13, 21,-30, 33, 44,-34,-17, 1,-32, 7,-23,-21, 6, -4, 18, -2, 0,-10,-30,-32,-19, 31; /M: SY='V'; M= 3, -4,-18, -7, -7,-12,-18,-16, 2,-13, 0, -3, -6,-18,-12,-15, -3, 0, 6,-28,-13,-10; /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-34,-25, 24,-31,-22, 20,-29, 33, 14,-26,-29,-26,-21,-24, -9, 14,-14, 6,-25; /M: SY='Y'; M=-14,-18,-27,-18, -4, 2,-29, -6, 6,-11, 11, 4,-17,-21, -7, -5,-18,-10, -2,-10, 14, -8; /M: SY='K'; M= -5, 9,-26, 12, 12,-29,-16, -6,-27, 19,-23,-14, 3,-10, 10, 12, -1, -4,-20,-26,-14, 11; /M: SY='A'; M= 41,-11,-10,-19,-11,-18, -3,-20, -7,-11,-10, -9,-10,-12,-11,-19, 11, 2, 4,-23,-19,-11; /M: SY='V'; M= -2,-30,-13,-31,-29, 1,-31,-29, 32,-22, 14, 12,-29,-29,-28,-21,-13, -2, 44,-28, -8,-29; /M: SY='E'; M= -6, -5,-22, -5, 14,-14,-22,-10, -6, -6, -3, -1, -7,-10, 1, -9, 0, 5, -7,-28,-11, 7; /M: SY='S'; M= 3, 0,-17, 0, 6,-26, -7, -5,-21, 1,-28,-14, 7,-10, 15, -1, 25, 10,-16,-33,-17, 11; /M: SY='R'; M=-11, 3,-30, 5, 2,-30, 4, -6,-31, 11,-27,-15, 6, -7, 5, 12, -4,-12,-26,-25,-18, 2; /M: SY='G'; M= -3, -4,-29, -1,-12,-29, 40,-18,-34,-15,-28,-20, 0, -4,-15,-18, 1,-10,-27,-25,-27,-14; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='G'; M= -3, -6,-13, -7, -7,-11, 4,-10,-10, 0,-10, -5, -3,-11, -6, 2, -1, 0, -3,-14, -9, -7; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='Q'; M= -2, -3,-25, -1, 5,-24,-18,-11,-10, -1,-16, -8, -5, -1, 6, -7, 0, -5, -9,-27,-15, 4; /M: SY='P'; M= -2, -8,-28, -6, 4,-21,-16, -9,-21, 9,-23,-14, -7, 13, 0, 4, -2, -5,-19,-21, -9, 0; /M: SY='T'; M= -2, -2,-17, -7, -6,-17, -9,-15,-19, 1,-19,-13, 2,-12, -4, 4, 14, 24, -9,-28,-13, -6; /M: SY='K'; M= -1, -9,-30, -8, -3,-28, 7,-15,-28, 11,-27,-15, -5, 5, -4, 6, -5,-12,-22,-22,-20, -5; /M: SY='C'; M= -9,-17,103,-27,-27,-19,-29,-29,-27,-27,-19,-19,-17,-36,-27,-27, -6, -2, -9,-47,-27,-27; /M: SY='V'; M= 3,-23, -1,-27,-23, -6,-25,-25, 16,-22, 5, 4,-19,-24,-21,-22, -5, -2, 22,-29,-11,-23; /M: SY='T'; M= -6,-19, -3,-20,-15, -9,-25,-22, -2,-19, 3, -3,-19, 1,-18,-19, -8, 7, 0,-30,-14,-18; /M: SY='I'; M= 0,-26,-22,-30,-25, -4,-19,-26, 23,-25, 15, 10,-21,-23,-21,-24,-14, -8, 20,-22, -8,-25; /M: SY='P'; M=-12,-16,-37, -9, -1,-23,-21, 0,-19, -8,-25,-14,-15, 56, -2,-14,-10,-11,-28,-22,-11, -6; /I: I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10; /M: SY='R'; M= 0, 1,-17, 2, -1,-18, 0, -6,-20, 4,-16,-12, 2,-11, -1, 12, 3, -3,-13,-19,-13, -2; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='R'; M= -5, -2,-16, -2, 5,-10,-12, -2,-14, 6,-14, -9, -1,-10, 2, 8, 4, 4,-11,-14, 0, 2; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='N'; M= -3, 6,-15, 3, -4, -9, -9, -5, -5, -9, 2, -4, 8,-15, -6, -8, -5, -4, -8,-21, -9, -5; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='D'; M= -3, 24,-20, 26, 6,-25, -5, -2,-25, 0,-23,-19, 19,-12, 0, -1, 7, -2,-20,-31,-17, 2; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='G'; M= 8,-10,-21,-11,-13,-22, 29,-18,-23, -7,-19,-12, -5,-16,-13,-11, 0,-11,-13,-19,-21,-13; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='R'; M=-12, -1,-24, -1, 2,-15,-17, -5,-16, 3, -6, -7, 2,-19, 1, 18, -5, -6,-14,-27,-12, 0; /M: SY='L'; M= -9,-21,-24,-21, -9, -3,-28,-19, 10,-21, 22, 7,-21, -8,-13,-18,-17, -3, 2,-23, -7,-12; /M: SY='Q'; M=-11, 3,-31, 7, 15,-33,-10, -4,-28, 13,-25,-13, 0, 1, 18, 9, -4,-11,-27,-25,-17, 16; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='I'; M= -5,-19,-16,-22,-16, -4,-25,-17, 16,-15, 13, 13,-18,-20, -8,-14,-10, 1, 16,-22, -5,-13; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='A'; M= 3,-13,-24,-17,-13,-13, -4, -1, -4,-14, -9, -3, -7,-18, -5,-15, -3, -8, -7,-16, 0,-11; /M: SY='G'; M= -6, 1,-28, 3, -7,-28, 29, 5,-35, -8,-28,-17, 5,-17, -7,-10, 2,-13,-27,-26,-17, -8; /M: SY='R'; M=-14, -3,-26, -6, 0,-20,-16, 12,-22, 13,-18, -4, 7,-18, 11, 35, -3, -7,-19,-25, -8, 2; /M: SY='K'; M= -9,-13,-27,-12, -5, -8,-21,-13,-13, 9,-18, -8,-11, 3, -7, 1, -7, -6, -9,-17, -2, -7; /M: SY='G'; M= 1,-13,-25,-15,-16,-19, 26,-18,-19,-17,-12, -4, -8, -9,-15,-18, -4, -9,-16,-22,-20,-16; /M: SY='L'; M=-11,-13,-23,-11,-10, -2,-22, -2, -6,-14, 4, -1,-11,-14,-11, -6,-10, -7, -5,-24, -3,-12; /M: SY='P'; M= -5,-20,-32,-17, -7,-11,-19,-18,-12,-13,-17, -7,-19, 51,-13,-19,-10, -9,-18,-23,-18,-13; /M: SY='H'; M=-15, -3,-29, -6, -3,-18,-21, 42,-13,-11,-11, -1, 5, -7, 5, -7,-10,-13,-20,-28, 3, -3; /M: SY='V'; M= -6,-28,-16,-29,-25, 7,-29,-18, 22,-21, 22, 17,-28,-29,-21,-18,-18, -5, 26,-19, 5,-24; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='L'; M= -8,-26, -5,-28,-22, 3,-26,-22, 12,-23, 19, 7,-25,-26,-20,-19,-21, -9, 11, -4, -2,-21; D=-13; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='Y'; M=-12,-20, 9,-24,-22, 16,-26, -6, -1,-18, 2, -1,-19,-28,-19,-16,-15, -8, 0, -3, 25,-22; D=-13; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='C'; M= -1,-14, 39,-19,-19,-14, -2,-20,-18,-20, -9,-10,-12,-24,-19,-20, -6, -9, -8,-28,-19,-19; D=-13; /I: I=-13; MI=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='R'; M=-16, -6,-30, -6, 5,-25,-20, -2,-29, 34,-23, -9, 0,-16, 15, 52, -9,-10,-21,-20,-10, 7; /M: SY='L'; M= -2,-28,-19,-31,-22, 3,-29,-24, 24,-26, 31, 15,-26,-26,-21,-22,-20, -7, 19,-22, -4,-22; /M: SY='W'; M=-20,-36,-38,-40,-30, 39,-24,-26,-12,-24, -8,-12,-32,-30,-28,-20,-32,-22,-18, 92, 30,-24; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='W'; M=-20,-37,-40,-40,-30, 34,-23,-27,-13,-23,-10,-13,-33,-30,-27,-20,-33,-23,-20,103, 30,-23; /M: SY='P'; M= -7, -9,-33, -5, 1,-28,-15,-15,-21, -2,-30,-19, -6, 54, -5,-11, -2, -5,-26,-31,-25, -5; /M: SY='D'; M=-14, 21, -9, 31, 15,-30,-17, -8,-28, 0,-23,-21, 4,-14, -2, -8, -3, -9,-18,-37,-19, 6; /M: SY='L'; M= -9,-29,-20,-31,-22, 7,-30,-20, 24,-27, 40, 23,-28,-28,-19,-20,-26, -9, 16,-21, -1,-21; /M: SY='Q'; M= -7, -2,-22, -5, 4,-24,-18, -5,-20, 11,-19, -8, 1,-12, 17, 17, 6, 11,-16,-25,-11, 9; /M: SY='H'; M= -9, -2,-23, 1, -3,-14,-18, 11,-15, -1,-13, -6, -2,-18, -3, -3, -2, -5, -9,-24, 3, -4; /M: SY='D'; M= -6, 19,-25, 21, 20,-29,-11, 8,-26, 1,-24,-17, 16,-10, 11, -4, 6, -5,-26,-33,-16, 15; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='S'; M= 4, -8,-12,-10, -8,-11,-12, -4, -6, -5,-10, -5, -4,-14, -6, 0, 7, 6, 3,-24, -9, -8; D=-12; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='E'; M=-10, 4,-28, 9, 37,-29,-20, 0,-26, 10,-19,-13, 0, -6, 25, 10, 1, -4,-26,-26,-16, 31; /M: SY='L'; M= -8,-27,-19,-29,-21, 6,-30,-22, 22,-27, 36, 16,-26,-27,-20,-20,-22, -3, 16,-22, -2,-21; /M: SY='R'; M=-11, -4,-26, -5, 7,-22,-21, -9,-22, 26,-20, -9, -3,-14, 5, 29, -5, -1,-13,-23,-11, 4; /M: SY='R'; M= 3, -2,-24, -6, -1,-22,-11, 2,-21, 4,-23,-13, 4, 2, 0, 7, 2, -4,-18,-27,-15, -3; /M: SY='L'; M= -9,-30,-22,-33,-24, 6,-33,-24, 31,-29, 36, 19,-27,-27,-21,-23,-25, -9, 21,-21, -1,-24; /M: SY='P'; M=-10, -6,-16, 0, -4,-22,-19,-15,-17, -8,-16,-14, -9, 14, -9, -7, -6, -6,-14,-32,-20, -9; /M: SY='C'; M= -5,-12, 3,-15,-13,-16,-11, -7,-18,-16,-19,-12, -7,-21, -6,-15, 3, -1,-13,-13, -9,-10; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='R'; M=-14, 0,-30, 4, 25,-26,-20, 8,-29, 19,-21,-12, 1,-11, 18, 28, -5,-11,-25,-25,-11, 20; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='H'; M=-12,-11, -4,-15,-13, 11,-20, 22,-16,-17,-10, -5, -4,-21,-12,-11, -5, -4,-12,-19, 9,-13; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='A'; M= 10,-10,-22,-11, -6,-18, -1,-12,-17, -3,-18,-12, -8, 7, -7,-10, 1, -5,-14,-17,-10, -8; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='F'; M= -8,-17,-21,-23,-18, 26,-13,-12,-11,-14, -5, -7,-11,-23,-20, -7, -6, -2, -7, -4, 14,-18; /M: SY='D'; M= -5, 11,-22, 15, 3,-24, -9,-10,-16, -2,-18,-14, 4,-16, -7, -8, -1, -6, -7,-31,-17, -2; /M: SY='A'; M= 7, -7,-19,-12, -5,-18,-14, -3, -8, -4,-12, 0, -3,-13, 3, -7, 6, 4, -6,-26, -9, -2; /M: SY='D'; M=-15, 12,-30, 15, 4,-26,-18, 5,-22, 7,-22,-13, 9, -6, 1, 6, -6,-10,-20,-30,-11, 0; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='G'; M= -3, -1,-24, -2, -2,-25, 7, -9,-24, -2,-27,-16, 5, 6, 0, -6, 6, -4,-22,-27,-20, -2; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='D'; M=-14, 16,-29, 23, 18,-27,-16, -3,-26, 6,-19,-17, 8, -3, 4, 3, -4, -9,-24,-31,-17, 10; /M: SY='M'; M= -3, -3,-22,-11, -5,-10,-18, -5, 0, -9, -2, 3, 1,-17, 1,-10, -5, -2, -7,-21, -2, -3; /M: SY='V'; M= -2,-27,-14,-30,-28, -1,-31,-29, 29,-21, 10, 10,-25,-26,-26,-21, -8, 4, 40,-28, -8,-28; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='C'; M= -8,-26, 35,-32,-28, -5,-32,-28, 8,-28, 9, 2,-24,-32,-26,-26,-16, -8, 14,-34,-14,-28; /M: SY='N'; M=-10, 36,-21, 18, 2,-22, -2, 10,-20, 1,-29,-18, 53,-19, 7, 1, 9, -1,-30,-38,-19, 4; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='Y'; M=-20,-18,-30,-18,-18, 25,-29, 28, -3,-10, -2, 0,-17,-29, -8, -9,-19,-11,-12, 24, 74,-18; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='Y'; M=-19,-23,-30,-25,-22, 29,-28, 10, 0,-13, 1, 4,-22,-29,-13,-12,-22,-12, -9, 35, 63,-20; /M: SY='S'; M= 4, 5,-19, 3, 11,-23, -7, -6,-23, 4,-25,-17, 10,-10, 4, 4, 16, 4,-17,-32,-18, 7; /M: SY='R'; M=-17,-22,-30,-25,-15, 3,-26,-14, -4, -2, 0, 0,-14,-24, -9, 19,-19,-12, -5, 2, 2,-14; /M: SY='V'; M= -6,-28,-20,-28,-22, 1,-28,-23, 16,-20, 16, 9,-28,-28,-17,-17,-19, -7, 21, -5, -2,-19; /M: SY='I'; M= -9,-14, -1,-16, 1,-16,-30,-17, 4,-14, -4, -2,-13,-18, -3,-16,-10, -9, 1,-29,-13, -3; /M: SY='G'; M= 1, -5,-24, -6, -1,-21, 3,-11,-20, -7,-17,-13, 0, -2, -5, -4, 3, -5,-18,-27,-20, -4; /M: SY='P'; M= -3,-10,-29, -9, -3,-22,-17,-16,-16, -3,-18,-13, -9, 37, -8,-11, -5, -2,-19,-28,-21, -8; /M: SY='E'; M= -8, -5,-23, -3, 16,-18,-22, -9,-11, 7,-10, -3, -8,-12, 3, 4, -4, -2, -5,-27,-13, 9; /M: SY='T'; M= -3,-12, -4,-15, -6,-11,-21,-18, -1,-17, -1, -4, -9,-18, -9,-16, 3, 5, 0,-31,-12, -9; /M: SY='P'; M= -6, -6,-27, -5, 0,-24,-17,-12,-15, 0,-23,-13, -3, 24, 0, -6, 1, 0,-16,-30,-20, -2; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 43 in 43 different sequences |
| Number of true positive hits | 43 in 43 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | MH1 |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
43 sequences
DAF3_CAEEL (Q95QI7), DAF8_CAEEL (Q21733), MAD_DROME (P42003), SMA2_CAEEL (Q02330), SMA3_CAEEL (P45896), SMA4_CAEEL (P45897), SMAD1_BOVIN (Q1JQA2), SMAD1_COTJA (Q9I962), SMAD1_DANRE (Q9I8V2), SMAD1_HUMAN (Q15797), SMAD1_MOUSE (P70340), SMAD1_RAT (P97588), SMAD2_BOVIN (Q1W668), SMAD2_DANRE (Q9I9P9), SMAD2_HUMAN (Q15796), SMAD2_MOUSE (Q62432), SMAD2_PONAB (Q5R7C0), SMAD2_RAT (O70436), SMAD3_CHICK (P84023), SMAD3_HUMAN (P84022), SMAD3_MOUSE (Q8BUN5), SMAD3_PIG (P84024), SMAD3_RAT (P84025), SMAD4_BOVIN (Q1HE26), SMAD4_HUMAN (Q13485), SMAD4_MOUSE (P97471), SMAD4_PIG (Q9GKQ9), SMAD4_RAT (O70437), SMAD5_CHICK (Q56I99), SMAD5_DANRE (Q9W7E7), SMAD5_HUMAN (Q99717), SMAD5_MOUSE (P97454), SMAD5_PONAB (Q5R6H7), SMAD5_RAT (Q9R1V3), SMAD6_CHICK (Q9W734), SMAD6_HUMAN (O43541), SMAD6_MOUSE (O35182), SMAD7_HUMAN (O15105), SMAD7_MOUSE (O35253), SMAD7_RAT (O88406), SMAD9_HUMAN (O15198), SMAD9_MOUSE (Q9JIW5), SMAD9_RAT (O54835)» more
|
| PDB [Detailed view] |
17 PDB
1MHD; 1OZJ; 3KMP; 3QSV; 5MEY; 5MEZ; 5MF0; 5OD6; 5ODG; 5X6G; 5X6H; 5X6M; 6FZS; 6FZT; 6TBZ; 6TCE; 6ZMN » more |