![]() |
|
| Entry: PS51085 |
| General information about the entry | |
|---|---|
| Entry name | 2FE2S_FER_2 |
| Accession number | PS51085 |
| Entry type | MATRIX |
| Date | MAR-2005 (CREATED); MAR-2005 (DATA UPDATE); MAR-2013 (INFO UPDATE). |
| PROSITE Documentation | PDOC00175 |
| Associated ProRule | PRU00465 |
| Name and characterization of the entry | |
| Description | 2Fe-2S ferredoxin-type iron-sulfur binding domain profile. |
| Matrix / Profile | /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=89;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=84;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8041449; R2=0.0109195; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=614; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=431; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-40; I=-40; B1=-200; E1=-200; MI=-35; MD=-35; IM=-35; DM=-35;
A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z
/I: B1=0; BI=-35; BD=-35;
/M: M= -6,-10,-23,-11, -7, -8,-16, -2,-10, -7,-10, -2, -8, -4, -5, -8, -6, -5,-10,-18, 0, -8;
/M: SY='K'; M= -7, 0,-24, -1, 6,-22,-16, -6,-19, 11,-18, -9, 1, -8, 6, 7, -1, -1,-15,-26,-12, 5;
/M: SY='I'; M= -5,-28,-19,-33,-27, 3,-32,-27, 31,-24, 17, 13,-24,-24,-24,-23,-16, -5, 31,-22, -3,-27;
/M: SY='T'; M= -4, -3,-18, -7, -2,-14,-19,-10,-12, 1,-13, -8, -1,-14, -3, 2, 4, 12, -6,-26, -8, -3;
/M: SY='F'; M=-10,-28,-20,-33,-25, 21,-31,-22, 20,-25, 20, 11,-23,-26,-25,-19,-19, -8, 17,-13, 7,-25;
/M: M= -7, -8,-22,-11, -5, -8,-21, -9, -4, -6, -5, -3, -6,-16, -5, -6, -5, -1, -4,-18, -3, -6;
/M: SY='I'; M= -8,-13,-24,-15,-12, -7,-20,-14, 1,-13, -4, -2,-10, -8,-12,-11, -8, -4, 1,-22, -8,-14;
/I: I=-5; MD=-4;
/M: SY='N'; M= -9, 11,-24, 9, 6,-19,-10, 3,-20, 2,-21,-14, 13, -4, 3, 1, -1, -6,-22,-22,-10, 3; D=-5;
/I: I=-5; MD=-4;
/M: SY='D'; M= -6, 11,-20, 15, 3,-22, 7, -5,-23, -2,-19,-14, 7, -8, -2, -4, 1, -7,-18,-22,-15, 1; D=-5;
/I: I=-5; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4;
/M: SY='E'; M= -4, -2,-17, -1, 5,-14,-10, -4,-12, 3,-11, -6, -1, -8, 4, 3, 0, -1,-10,-17, -8, 4; D=-5;
/I: I=-5; DM=-4;
/M: SY='G'; M= -4, -3,-21, -2, -2,-18, 7,-11,-19, -6,-16,-11, -1,-11, -5, -6, 0, -4,-14,-21,-15, -4; D=-5;
/I: I=-5; DM=-4;
/M: SY='R'; M= -9, -9,-25, -9, -2,-11,-20, -2,-10, 3,-10, -4, -7,-17, 0, 5, -8, -6, -8,-18, 1, -2;
/M: SY='T'; M= -4, -3,-20, -4, 5,-16,-18,-11,-13, -3,-13,-10, -4, -8, 0, -4, 4, 8, -8,-27,-12, 2;
/M: SY='I'; M= -7,-24,-19,-29,-23, 14,-28,-19, 16,-21, 12, 8,-21,-25,-22,-18,-15, -5, 16,-14, 7,-23;
/M: SY='E'; M= -7, 8,-25, 12, 18,-23,-15, -4,-22, 2,-19,-15, 2, -5, 5, -2, 2, -2,-19,-29,-14, 11;
/M: SY='V'; M= 7,-21, 1,-25,-22, -7,-18,-24, 7,-19, 1, 0,-20,-23,-21,-20, -5, -2, 18,-27,-13,-22;
/M: SY='E'; M= -5, 5,-27, 9, 10,-26,-12, -7,-22, 0,-22,-16, 1, 8, 2, -4, 0, -5,-21,-29,-18, 4;
/M: SY='P'; M= -2, -2,-26, 2, 8,-24,-13,-11,-19, -3,-19,-14, -4, 11, -2, -8, -1, -5,-17,-28,-19, 2;
/M: SY='G'; M= -5, 6,-26, 8, -4,-28, 25, -9,-33, -8,-27,-19, 7,-15, -8, -9, 2,-11,-25,-26,-22, -6;
/M: SY='E'; M= -6, 4,-23, 6, 13,-23,-14, -6,-19, 1,-15,-10, 0, -9, 6, -2, 1, 0,-16,-28,-14, 9;
/I: I=-7; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
/M: SY='T'; M= -3, -2,-17, -7, -6,-10,-15, -9,-10, -7,-11, -6, 1,-11, -5, -7, 10, 17, -7,-26, -6, -6;
/M: SY='I'; M= -7,-29,-20,-32,-25, 5,-32,-24, 29,-26, 29, 18,-27,-27,-22,-22,-22, -7, 24,-21, -2,-25;
/M: SY='L'; M= -7,-27,-18,-29,-20, 6,-28,-19, 18,-26, 38, 19,-26,-28,-18,-18,-25, -9, 10,-20, -2,-19;
/M: SY='D'; M=-11, 19,-27, 27, 19,-29,-13, 1,-28, 2,-23,-18, 8,-10, 8, -1, 1, -6,-24,-28,-13, 13;
/M: SY='A'; M= 20,-15,-13,-21,-15, -7,-10,-18, -2,-14, -3, -4,-13,-17,-14,-17, 0, -1, 5,-18, -8,-14;
/M: SY='L'; M= 12,-21,-11,-26,-17, -4,-16,-20, 6,-21, 16, 7,-19,-21,-16,-20,-11, -6, 6,-21, -9,-17;
/M: SY='R'; M=-10, -9,-25,-10, 1,-13,-21, -4, -8, -1, -2, -1, -6,-18, 0, 8,-10, -8, -8,-23, -7, -1;
/M: SY='E'; M= -6, 3,-26, 5, 13,-23,-14, -3,-24, 11,-19,-13, 2,-12, 8, 13, -1, -7,-20,-24,-12, 9;
/M: SY='N'; M= 1, -1,-22, -6, -1,-18,-15, 0, -8, -5, -9, -5, 4,-16, 3, -6, -2, -5,-10,-26,-10, 0;
/I: I=-6; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M: SY='G'; M= -3, 1,-26, 0, -8,-27, 35,-10,-33,-10,-28,-19, 7,-16, -9,-10, 4,-11,-26,-26,-23, -9;
/M: SY='I'; M= -8,-26,-21,-30,-22, 4,-31,-21, 24,-23, 23, 14,-23,-25,-19,-19,-19, -7, 19,-20, -1,-22;
/M: SY='D'; M= -6, 7,-23, 9, 7,-20,-14, -7,-21, -2,-19,-15, 2, -4, -2, -5, 2, 1,-17,-26,-12, 2;
/I: I=-6; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
/M: SY='I'; M= -9,-23,-21,-29,-22, 9,-28,-19, 16,-22, 15, 9,-19,-21,-19,-18,-15, -2, 12,-17, 3,-21;
/M: SY='P'; M=-10, -9,-31, -4, 5,-23,-18, -9,-21, 6,-21,-12, -9, 23, -1, 5, -7, -9,-21,-26,-17, 0;
/M: SY='Y'; M= -7,-12,-23,-14,-10, -2,-14, 4,-12, -7, -9, -5, -8,-19, -7, -2, -6, -6,-10,-12, 8,-10;
/M: SY='S'; M= 4, -3,-20, -4, -5,-16, 7,-13,-18,-12,-17,-13, 1,-14, -8,-13, 9, -2,-13,-27,-17, -7;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='R'; M= -9, -5,-27, -4, 0,-20, 2, -3,-27, 5,-19,-12, -1,-18, 0, 15, -5,-11,-21,-19,-10, -2;
/I: I=-6; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M: SY='E'; M= 1, 0,-19, -1, 6,-17, -7, -3,-14, -3,-12, -7, 0,-11, 1, -5, 1, -4,-12,-23,-11, 3; D=-6;
/I: I=-6; DM=-5;
/M: SY='G'; M= 3, -9,-28,-10,-18,-29, 61,-19,-37,-19,-29,-19, 0,-18,-18,-19, 3,-16,-27,-21,-29,-18;
/I: I=-5; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4;
/M: SY='A'; M= 9, -8,-17,-12, -9,-17, -5,-15, -6,-11,-11, -6, -4,-16, -7,-13, 4, 0, -2,-26,-15, -9;
/I: I=-10; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='G'; M= 2, -7,-24, -8,-12,-24, 33,-14,-30,-11,-25,-16, 1,-17,-12, -9, 6, -7,-20,-24,-22,-13;
/M: SY='T'; M= 11, -5,-12,-11, -7,-15,-12,-16, -9,-10,-11, -7, -3,-12, -5,-11, 15, 20, -1,-29,-14, -6;
/M: SY='C'; M=-10,-17,114,-26,-28,-21,-29,-29,-30,-29,-20,-20,-18,-39,-29,-29,-10,-10,-11,-50,-30,-28;
/I: I=-8; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
/M: SY='A'; M= 3, -9,-20,-13, -8,-15,-10, -1,-12, -4, -9, -4, -6,-16, -5, -2, -1, 0, -7,-23, -8, -8;
/M: SY='V'; M= -2,-24, -7,-27,-25, -3,-23,-23, 17,-18, 7, 11,-23,-26,-22,-18,-11, -4, 28,-27,-10,-24;
/M: SY='R'; M=-11, -7,-24, -8, 0,-11,-22, -4, -6, 0, -4, 0, -5,-18, -1, 2, -9, -7, -7,-22, -3, -2;
/M: SY='V'; M= -5,-28,-16,-33,-28, 1,-32,-27, 32,-24, 16, 14,-25,-26,-24,-23,-15, -5, 34,-25, -5,-27;
/M: SY='D'; M= -8, 11,-22, 12, 6,-21,-12, -6,-17, -3,-15,-13, 9,-14, -1, -4, 1, -2,-14,-31,-15, 2;
/M: SY='G'; M= -2, 1,-27, 3, 1,-28, 23,-10,-32, -5,-26,-18, 3,-11, -5, -8, 3,-10,-25,-26,-22, -2;
/I: I=-3; MD=-2;
/M: SY='G'; M= -1, -4,-17, -4, -5,-13, 16, -8,-16, -8,-12, -9, -1, -9, -7, -8, -1, -7,-13,-12,-10, -6; D=-3;
/I: I=-3; MD=-2;
/M: M= -4, -1,-15, 0, 0, -7, -8, -4, -9, -4, -8, -6, -2, -9, -2, -5, -2, -3, -8, -9, -4, -1; D=-3;
/I: I=-3; MD=-2;
/M: M= -4, -5,-13, -4, -4, -5,-10, -6, -2, -6, -4, -3, -6, -7, -6, -7, -5, -4, -1,-11, -1, -6; D=-3;
/I: I=-3; MD=-2;
/M: SY='D'; M= -4, 6,-12, 8, 7,-13, -7, 0,-12, 0,-10, -7, 3, -5, 3, -1, 1, -2,-10,-16, -7, 4; D=-3;
/I: I=-3; MD=-2;
/M: SY='Q'; M= -3, -4,-11, -5, -1, -8, -9, -3, -4, -2, -2, -1, -4, -7, 1, -2, -3, -3, -5,-12, -4, -1; D=-3;
/I: I=-3; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2;
/M: M= -1, -5,-10, -5, -2, -4, -7, -5, -3, -5, -1, 0, -4, -7, -3, -5, -1, -1, -3,-12, -4, -3; D=-3;
/I: I=-3; DM=-2;
/M: M= -2, -3,-11, -4, -4, -1, -6, -3, -6, -7, -2, -3, -4, -9, -6, -7, -3, -3, -4,-10, -2, -5; D=-3;
/I: I=-3; DM=-2;
/M: SY='L'; M= -4, -8,-11, -7, -6, -2, -9, -8, 1, -8, 7, 2, -8,-11, -7, -6, -8, -5, 0,-11, -4, -6; D=-3;
/I: I=-3; DM=-2;
/M: SY='S'; M= 1, -1,-11, -2, -1, -8, -6, -7, -8, -4, -8, -5, -1, -5, -3, -5, 4, 2, -5,-15, -8, -2; D=-3;
/I: I=-3; DM=-2;
/M: SY='D'; M= -1, 0,-14, 1, 0, -9, -8, -5,-10, -3, -8, -7, -3, -6, -4, -5, -2, -3, -8,-11, -6, -2; D=-3;
/I: I=-3; DM=-2;
/M: SY='D'; M= -3, 3,-17, 4, 3,-15, 2, -5,-17, 0,-14,-10, 1, -6, -1, -2, -1, -6,-14,-15,-10, 1; D=-3;
/I: I=-3; DM=-2;
/M: SY='E'; M= -5, 3,-15, 5, 12,-15, -8, 0,-13, 3, -9, -7, 0, -4, 7, 1, -1, -5,-12,-15, -8, 9; D=-3;
/I: I=-3; DM=-2;
/M: SY='L'; M= -3,-10,-14,-11, -6, -4,-13, -8, 2, -5, 4, 3, -9,-12, -5, -1, -8, -4, 2,-13, -4, -7; D=-3;
/I: I=-3; DM=-2;
/M: SY='E'; M= 0, 0,-15, 1, 7,-16, -9, -5,-14, 2,-12, -9, -1, -2, 3, 0, 2, -1,-11,-17,-11, 5; D=-3;
/I: I=-3; DM=-2;
/M: SY='E'; M= -3, 1,-19, 3, 9,-18,-10, -1,-16, 2,-14, -9, -1, 1, 6, 1, -1, -5,-15,-18,-10, 7; D=-3;
/I: I=-3; DM=-2;
/M: SY='G'; M= -6, -3,-24, -5, -4,-21, 9, -9,-26, 1,-22,-13, 2,-16, -4, 2, -1, -7,-20,-22,-15, -5;
/M: M= -4, -8,-22,-10, -8, -6,-14, -8,-10, -9,-12, -9, -3, -9, -8, -9, -1, -2,-11,-14, -1, -9;
/M: SY='R'; M= -4,-16,-18,-18,-12,-12,-19,-15, -3, 0, -6, -1,-12,-20, -8, 10, -6, -2, 6,-24,-10,-12;
/I: I=-9; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
/M: SY='L'; M= -8,-19,-18,-22,-15, 0,-24,-15, 7,-18, 26, 10,-17,-22,-13,-10,-19, -7, 1,-23, -5,-15;
/M: SY='A'; M= 23, -8,-12,-13, -9,-17, 0,-17,-13,-12,-13,-11, -4,-11, -9,-16, 15, 8, -5,-27,-18, -9;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Q'; M= -5,-12,-19,-15, -4,-17,-22, -9, -2, -5, -2, 3,-10,-18, 10, -3, -6, -3, -3,-24, -9, 2;
/M: SY='T'; M= 5,-12, -9,-19,-14, -9,-19,-18, 1,-13, -2, 0,-10,-17,-11,-14, 3, 12, 6,-26,-10,-13;
/M: SY='Y'; M=-10,-14,-25,-15, -8, -5,-22, -8, -7, -3, -5, -3,-11, -6, -7, 0,-11, -6, -8,-16, 1, -9;
/M: SY='V'; M= 3,-23,-20,-24,-18, -9,-23,-23, 10,-18, 4, 4,-22, 2,-18,-20,-10, -4, 12,-25,-13,-19;
/M: SY='R'; M= -4, -5,-16, -7, -3,-17,-14,-10,-15, 0,-14, -8, -3,-14, -2, 2, 1, 2, -9,-25,-11, -3;
/M: SY='S'; M= -1, 7,-21, 9, 8,-26, -4, -6,-24, -2,-24,-16, 6, -7, 3, -6, 11, 3,-19,-31,-18, 5;
/I: I=-7; MD=-6;
/M: M= -1, -5, -6, -5, -2, -4, -9, -6, -3, -6, 0, -2, -6, -9, -5, -7, -4, -3, -1,-12, -4, -4; D=-7;
/I: I=-7; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
/M: SY='D'; M= -8, 15,-28, 21, 1,-31, 20, -8,-35, -7,-28,-22, 10,-10, -7,-12, 1,-12,-28,-30,-23, -3;
/M: SY='M'; M= -3,-18, -5,-23,-17, -6,-22,-16, 6,-16, 9, 11,-17,-23,-13,-14,-12, -5, 7,-25, -9,-16;
/M: SY='T'; M= -2, -6,-18, -7, 0,-15,-19,-11, -8, 0,-11, -7, -5,-15, -4, -1, 1, 4, -1,-27,-11, -3;
/M: SY='I'; M= -6,-29,-20,-34,-28, 3,-34,-28, 35,-25, 19, 15,-25,-25,-24,-24,-17, -6, 34,-23, -3,-28;
/M: SY='E'; M= -8, -1,-24, 1, 12,-18,-20, -3,-17, 3,-13, -9, -3,-12, 4, 3, -1, 1,-13,-25, -8, 7;
/M: SY='T'; M= -3,-14,-17,-19,-15, -5,-24,-21, 4,-15, 1, -1,-13, -9,-15,-15, 0, 15, 7,-24, -8,-16;
/M: SY='P'; M= -8,-10,-26,-10, -5,-14,-20, -6, -5,-10, -6, -3, -9, 1, -6,-10, -8, -6, -7,-26,-10, -7;
/M: SY='E'; M= -5, 0,-26, 3, 14,-22,-14, -7,-21, 1,-19,-14, -2, 4, 3, -4, 0, -4,-19,-26,-14, 7;
/M: SY='E'; M= -6, -3,-27, -1, 4,-19, -1, -4,-21, -5,-17,-11, -2, -8, -2, -7, -3, -7,-19,-20,-10, 0;
/M: M= -7, -9,-23, -9, -3,-12,-19,-11, -6, -8, -3, -1, -9, -8, -5, -6, -6, -3, -6,-24, -9, -5;
/I: E1=0; IE=-35; DE=-35;
|
| Post-processing | |
| COMPETES_HIT_WITH: PS51379; | |
| Numerical results | |
|
|
| Comments | |
|
|
| Cross-references | |
| UniProtKB/Swiss-Prot | True positive hits:ADO_BOVIN (P48034), ADO_HUMAN (Q06278), ADO_MACFA (Q5FB27), ADO_MOUSE (O54754), ADO_RABIT (P80456), ADO_RAT (Q9Z0U5), ADRX_ENCCU (Q8SV19), ADRX_YEAST (Q12184), ADXH_DROME (P37193), ADXL_BOVIN (Q05B51), ADXL_DANRE (Q08C57), ADXL_HUMAN (Q6P4F2), ADXL_MOUSE (Q9CPW2), ADXL_XENLA (Q5FWQ0), ADX_BOVIN (P00257), ADX_CHICK (P13216), ADX_HUMAN (P10109), ADX_MOUSE (P46656), ADX_PIG (P00258), ADX_RAT (P24483), ADX_SHEEP (P29330), ALDO1_ARATH (Q7G193), ALDO1_MAIZE (O23887), ALDO1_ORYSJ (Q7XH05), ALDO2_ARATH (Q7G192), ALDO2_MAIZE (O23888), ALDO2_ORYSJ (Q852M1), ALDO3_ARATH (Q7G9P4), ALDO3_ORYSJ (Q852M2), ALDO4_ARATH (Q7G191), ALDO4_ORYSJ (Q69R21), ANTDC_ACIAD (O85675), ASCD_YERPE (P68641), ASCD_YERPS (Q66DP5), BENC_ACIAD (P07771), CARAC_SPHSX (D5IGG4), CARAD_PSERE (Q8GI14), CBAB_COMTE (Q44257), CBDC_BURCE (Q51603), CDHC_PSEU3 (D7REY5), CSMI_CHLTE (O68988), CSMJ_CHLTE (O68983), DCMS_HYDPS (P19915), DCMS_OLICO (P19921), DESET_MYCTU (O05875), DHSB1_ARATH (Q8LBZ7), DHSB2_ARATH (Q8LB02), DHSB_ASHGO (Q75CI4), DHSB_BOVIN (Q3T189), DHSB_CAEBR (A8WPF0), DHSB_CAEEL (Q09545), DHSB_CANGA (Q6FWS8), DHSB_CHICK (Q9YHT2), DHSB_CHOCR (P48932), DHSB_CYACA (P48933), DHSB_DANRE (A5PL98), DHSB_DICDI (Q55CC2), DHSB_DROME (P21914), DHSB_ECOLI (P07014), DHSB_HUMAN (P21912), DHSB_MOUSE (Q9CQA3), DHSB_MYCGR (O42772), DHSB_PARDE (Q59662), DHSB_PIG (Q007T0), DHSB_PORPU (P80477), DHSB_RAT (P21913), DHSB_RECAM (P80480), DHSB_RICBR (Q1RGP3), DHSB_RICCN (Q92JJ8), DHSB_RICFE (Q4UN71), DHSB_RICPR (Q9ZEA1), DHSB_RICTY (Q68XS0), DHSB_SALTY (Q8ZQU2), DHSB_SCHPO (P21911), DHSB_UROFA (Q70KF8), DHSB_USTMA (P32420), DHSB_XENLA (Q3B8J8), DHSB_XENTR (B0BM36), DHSB_YEAST (P21801), DMPP_ACICP (Q7WTJ2), DMPP_PSEUF (P19734), FDHL_BACSU (Q795Y4), FDHL_STAA3 (Q2FEI5), FDHL_STAA8 (Q2FVV9), FDHL_STAAB (Q2YYT1), FDHL_STAAC (Q5HDP9), FDHL_STAAM (Q931G2), FDHL_STAAN (Q99RW4), FDHL_STAAR (Q6GEC4), FDHL_STAAS (Q6G711), FDHL_STAAW (Q7A057), FDHL_STAHJ (Q4L8G8), FDHL_STAS1 (Q49ZN0), FER1_ANASO (P0A3C8), FER1_ANAVT (P00254), FER1_APHFL (P00244), FER1_ARATH (O04090), FER1_CYACA (Q9TLW0), FER1_CYAPA (P17007), FER1_DUNSA (P00239), FER1_EQUAR (P00235), FER1_EQUTE (P00234), FER1_HALMA (P00217), FER1_HYONI (P84873), FER1_MAIZE (P27787), FER1_MESCR (O04683), FER1_NOSMU (P00252), FER1_NOSS1 (P0A3C7), FER1_ORYSI (A2YQD9), FER1_ORYSJ (Q0J8M2), FER1_PEA (P09911), FER1_PHYAM (P00229), FER1_PHYAN (P00230), FER1_PLEBO (Q51577), FER1_RAPSA (P14936), FER1_SOLLC (Q43517), FER1_SPIOL (P00221), FER1_SYNE7 (P0A3D2), FER1_SYNP2 (P31965), FER1_SYNP6 (P0A3D3), FER2_APHSA (P00251), FER2_ARATH (P16972), FER2_CAUCR (P37098), FER2_CYACA (P15789), FER2_DUNSA (P00240), FER2_EQUAR (P00237), FER2_EQUTE (P00236), FER2_HALMA (Q5UZ63), FER2_HYONI (P84874), FER2_NOSMU (P00249), FER2_PHYAM (P00231), FER2_PHYAN (P00232), FER2_PLEBO (P46035), FER2_RAPSA (P14937), FER2_RICBR (Q1RJ69), FER2_RICCN (Q92J08), FER2_RICFE (Q4UKL2), FER2_RICMO (Q9AKM6), FER2_RICPR (Q9ZDW6), FER2_RICRI (Q9AKH1), FER2_RICTY (Q9AKC4), FER2_SPIOL (P00224), FER2_SYNP6 (P08451), FER3_ARATH (Q9ZQG8), FER3_CYACA (P00241), FER3_MAIZE (P27788), FER3_RAPSA (P14938), FER4_ARATH (Q9FIA7), FER4_RHOCA (P0CY92), FER4_RHOCB (D5ARY7), FER5_AQUAE (P59799), FER5_MAIZE (P27789), FER5_RHOCA (P37097), FER6_MAIZE (P94044), FER6_RHOCA (P80306), FERA_ALOMA (P81372), FERB_ALOMA (P81373), FERH_ANAVT (P46046), FERH_FREDI (P28610), FERH_NOSS1 (P11053), FERN_PSEPU (P23263), FERV_ANAVT (P46047), FERX_PSEPU (P23103), FER_APHSA (P00250), FER_ARCLA (P00223), FER_ATRBE (P84872), FER_BRANA (P00227), FER_BRYMA (P07838), FER_BUCAI (P57661), FER_BUCAP (O51882), FER_BUCBP (Q89A15), FER_BUMFI (P13106), FER_CAPAA (P83527), FER_CAPAN (Q9ZTS2), FER_CHLFR (P00247), FER_CHLFU (P56408), FER_CHLRE (P07839), FER_COLES (P00222), FER_DATAR (P83520), FER_DATIN (P68163), FER_DATME (P68164), FER_DATQU (P68166), FER_DATST (P68165), FER_ECO57 (P0A9R5), FER_ECOLI (P0A9R4), FER_EUGVI (P22341), FER_GLEJA (P00233), FER_GUITH (O78510), FER_HAEIN (P44428), FER_HALP7 (P15788), FER_HALSA (P00216), FER_HORVU (P83522), FER_LEULE (P00225), FER_LYCCN (P83523), FER_MARPO (P09735), FER_MASLA (P00248), FER_MEDSA (P00220), FER_NOSMU (P00253), FER_ODOSI (P49522), FER_PALPL (P07484), FER_PANGI (P85121), FER_PERBI (P10770), FER_PHYAF (P83524), FER_PHYPA (O04166), FER_PORPU (P51320), FER_PORUM (P00242), FER_PORYE (Q1XDG7), FER_PSEAE (Q51383), FER_SAMNI (P00226), FER_SCEQU (P00238), FER_SCOJA (P83525), FER_SHIFL (P0A9R6), FER_SILPR (P04669), FER_SOLAB (P83585), FER_SOLLS (P83584), FER_SOLLY (P83583), FER_SOLNI (P83582), FER_SPIMA (P00245), FER_SPIPL (P00246), FER_SYNEL (P0A3D0), FER_SYNLI (P00255), FER_SYNY3 (P27320), FER_SYNY4 (P00243), FER_THAWE (O98450), FER_THEEB (P0A3C9), FER_THEVL (P0A3D1), FER_TOBAC (P83526), FER_TRIVA (P21149), FER_WHEAT (P00228), FRDB_ECO57 (P0AC49), FRDB_ECOL6 (P0AC48), FRDB_ECOLI (P0AC47), FRDB_HAEIN (P44893), FRDB_HELPJ (Q9ZMP1), FRDB_HELPY (O06914), FRDB_PROVU (P20921), FRDB_SHIFL (P0AC50), FRDB_WOLSU (P17596), HCNA_PSEAE (G3XD67), HCNA_PSEFL (O85226), HCRC_THAAR (O33818), HCR_ECOLI (P75824), HNDD_DESFR (Q46508), HOXU_CUPNH (P22318), IORA_BREDI (Q51697), KSHB_MYCS2 (A0R525), KSHB_MYCTU (P96853), MMOC_METCA (P22868), MOP_DESGI (Q46509), NAGAA_RALSP (O52378), NDOR_PSEPU (Q52126), NDSFS_EUBBA (Q0QLF3), NDUS1_ARATH (Q9FGI6), NDUS1_BOVIN (P15690), NDUS1_DICCI (Q2LCP5), NDUS1_DICDI (Q34312), NDUS1_DROME (Q94511), NDUS1_GORGO (Q0MQG1), NDUS1_HUMAN (P28331), NDUS1_MACFA (Q4R6K9), NDUS1_MOUSE (Q91VD9), NDUS1_NEUCR (P24918), NDUS1_PANTR (Q0MQG2), NDUS1_PONAB (P0CB67), NDUS1_PONPY (P0CB68), NDUS1_RAT (Q66HF1), NDUS1_RECAM (O21241), NDUS1_SOLTU (Q43644), NICA_PSEPK (Q88FX9), NQO3_PARDE (P29915), NQO3_THET8 (Q56223), NQRF_ACTP2 (A3MYM7), NQRF_ACTSZ (A6VLY1), NQRF_CHLCV (Q821Q3), NQRF_CHLFF (Q255Y6), NQRF_CHLMU (Q9PLI3), NQRF_CHLPN (Q9Z723), NQRF_CHLTA (Q3KKV3), NQRF_CHLTR (O84745), NQRF_HAEDU (Q7VNU4), NQRF_HAEI8 (Q4QP19), NQRF_HAEIE (A5UAX6), NQRF_HAEIG (A5UFX3), NQRF_HAEIN (O05012), NQRF_HAES1 (Q0I5Y1), NQRF_IDILO (Q5QYQ8), NQRF_KLEP7 (A6T526), NQRF_MANSM (Q65VU9), NQRF_MARMS (A6VW13), NQRF_METCA (Q605A0), NQRF_NEIG1 (Q5F6X5), NQRF_NEIM0 (A9M2A6), NQRF_NEIMA (Q9JVQ3), NQRF_NEIMB (Q9K0M8), NQRF_NEIMF (A1KSH3), NQRF_PASMU (Q9CLA6), NQRF_PHOPO (Q9LCJ1), NQRF_PSEA6 (Q15YQ1), NQRF_PSEA7 (A6V3A2), NQRF_PSEAB (Q02PF8), NQRF_PSEAE (Q9HZL1), NQRF_PSEHA (Q9LCJ4), NQRF_PSYA2 (Q4FPV2), NQRF_PSYCK (Q1Q7Z7), NQRF_SERP5 (A8GAC4), NQRF_SHEDO (Q12QK1), NQRF_VIBAL (Q56584), NQRF_VIBAN (Q75R59), NQRF_VIBC3 (A5F5Y4), NQRF_VIBCH (Q9X4Q8), NQRF_VIBHB (Q9RFV6), NQRF_VIBMA (Q9LCI9), NQRF_VIBPA (Q9LCJ0), NQRF_VIBVU (Q8DBJ1), NQRF_VIBVY (Q7MID2), NQRF_YERE8 (A1JNZ2), NQRF_YERP3 (A7FLJ3), NQRF_YERPA (Q1C4D5), NQRF_YERPE (Q8ZBZ5), NQRF_YERPN (Q1CLD8), NQRF_YERPP (A4TPL2), NQRF_YERPS (Q66E01), NUOG2_RHIME (P56914), NUOG_BLOFL (Q7VRV7), NUOG_BUCAI (P57257), NUOG_BUCAP (Q8K9Y2), NUOG_BUCBP (Q89AU1), NUOG_ECO57 (Q8XCX2), NUOG_ECOL6 (Q8FFJ9), NUOG_ECOLI (P33602), NUOG_MYCBO (P59962), NUOG_MYCTU (P95175), NUOG_PSEAE (Q9I0J6), NUOG_PSEFL (Q9KGW3), NUOG_PSEPK (Q88FH2), NUOG_PSESM (Q87ZQ4), NUOG_RICBR (Q1RKD2), NUOG_RICCN (Q92G92), NUOG_RICFE (Q4UK22), NUOG_RICPR (Q9ZCF6), NUOG_RICTY (Q68VV2), NUOG_SALTI (P0A1Y5), NUOG_SALTY (P0A1Y4), NUOG_SHEON (Q8EI34), NUOG_SHIFL (Q7UC56), NUOG_STRCO (Q9XAR0), NUOG_YERPE (Q8ZDL2), PAAE_ECOLI (P76081), PDR_BURCE (P33164), PHF1_CLOPA (P29166), PHT2_PSEPU (Q05182), POBB_PSEPS (Q52186), PUTX_PSEPU (P00259), RFBI_SALTY (P26395), TERPB_PSESP (P33007), THCC_RHOER (P43493), TMOF_PSEME (Q03304), TPDR1_COMSP (Q3C1E0), TPDR2_COMSP (Q3C1D2), TSAB1_COMTE (P94680), TSAB2_COMTE (Q9AHG2), VANB_ACIAD (O24840), VANB_PSEPU (O54037), VANB_PSES9 (P12580), VANB_PSEUH (O05617), XDH1_ARATH (Q8GUQ8), XDH2_ARATH (F4JLI5), XDHC_ECO57 (Q8X6C4), XDHC_ECOLI (Q46801), XDHE_BACSU (O32143), XDH_BOVIN (P80457), XDH_CALVI (P08793), XDH_CHICK (P47990), XDH_DICDI (Q54FB7), XDH_DROME (P10351), XDH_DROPS (P22811), XDH_DROSU (P91711), XDH_EMENI (Q12553), XDH_FELCA (Q9MYW6), XDH_HUMAN (P47989), XDH_MOUSE (Q00519), XDH_ORYSJ (Q6AUV1), XDH_RAT (P22985), XYLA_PSEPU (P21394), XYLZ_PSEPU (P23101), Y092_METJA (Q57557), Y1067_METMP (Q6LYC4), Y1309_HAEIN (P45154), Y166_BUCBP (Q89AS6), YAGT_ECO57 (Q8X6I9), YAGT_ECOLI (P77165), YCBX_ECOLI (P75863), YEAX_ECOLI (P76254), YFAE_ECOL6 (P0ABW4), YFAE_ECOLI (P0ABW3), YJGC_BACSU (O34720)False negative hits (sequences which belong to the set under consideration, but which have not been picked up by the pattern or profile): DHSB3_ARATH (Q9FJP9), ETP1_SCHPO (Q10361), FER1_AQUAE (O67065), FER2_PEA (Q7M258), FRDB_MYCTU (Q10761), MMOC_METTR (Q53563), MOM1_ARATH (Q9M658), NDUS1_ACACA (Q37373), Y177_BUCAI (P57274)`Potential' hits (partial sequences which belong to the set under consideration, but which are not hit by the pattern or profile because they are partial (fragment) sequences): FER_ANASL (P83156), FER_PORAE (P18820), FER_PORCR (P18821), HOXU_RHOOP (P22659), NDUS1_MESAU (P86203), NQRF_ALTMA (Q9LCJ3), NQRF_COLMA (Q9K3E1), NQRF_COLPS (Q9LCJ2), NQRF_SHEHA (Q9LCI8), NQRF_SHEPU (Q9LCI7)Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view]
[Clustal format, color]
[Clustal format, plain text]
[Fasta format]
|
| PDB [Detailed view] |
1A70; 1AWD; 1AYF; 1B9R; 1C4A; 1C4C; 1CJE; 1CZP; 1DOI; 1DOX; 1DOY; 1E0Z; 1E10; 1E6E; 1E7P; 1E9M; 1EWY; 1FEH; 1FFU; 1FFV; 1FIQ; 1FO4; 1FRD; 1FRR; 1FXA; 1FXI; 1GAQ; 1GPX; 1I7H; 1J7A; 1J7B; 1J7C; 1JQ4; 1KF6; 1KFY; 1KRH; 1L0V; 1L5P; 1L6U; 1L6V; 1N5W; 1N5X; 1N60; 1N61; 1N62; 1N63; 1NEK; 1NEN; 1OFF; 1OQQ; 1OQR; 1ORZ; 1PB4; 1PDX; 1PUT; 1QLB; 1QOA; 1QOB; 1QOF; 1QOG; 1QT9; 1R7S; 1RFK; 1RM6; 1ROE; 1SB3; 1SIJ; 1UWM; 1V97; 1VDV; 1VLB; 1WRI; 1WYG; 1XLN; 1XLO; 1XLP; 1XLQ; 1YJI; 1YJJ; 1YQ3; 1YQ4; 1ZOY; 1ZP0; 1ZXI; 2ACZ; 2AD0; 2B76; 2BS2; 2BS3; 2BS4; 2BT6; 2CJN; 2CJO; 2CKJ; 2E1Q; 2E3T; 2FBW; 2FUG; 2H88; 2H89; 2JQR; 2KAJ; 2PIA; 2PVG; 2PVO; 2WDQ; 2WDR; 2WDV; 2WLB; 2WP9; 2WQY; 2WS3; 2WU2; 2WU5; 2Y5C; 2YBB; 3ABV; 3AE1; 3AE2; 3AE3; 3AE4; 3AE5; 3AE6; 3AE7; 3AE8; 3AE9; 3AEA; 3AEB; 3AEC; 3AED; 3AEE; 3AEF; 3AEG; 3AM9; 3AMZ; 3AN1; 3AV8; 3AX7; 3AX9; 3B2F; 3B2G; 3B9J; 3BDJ; 3C8Y; 3CIR; 3ETR; 3EUB; 3FAH; 3FC4; 3HRD; 3I9V; 3IAM; 3IAS; 3L4P; 3LB8; 3M9S; 3NRZ; 3NS1; 3NVV; 3NVW; 3NVY; 3NVZ; 3P1M; 3P4P; 3P4Q; 3P4R; 3P4S; 3P63; 3SFD; 3SFE; 3SR6; 3UNA; 3UNC; 3UNI; 4FXC; 4HEA; |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)