Entry: PS51088

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] TEA_2
Accession [info] PS51088
Entry type [info] MATRIX
Date [info] MAR-2005 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAR-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00479
Associated ProRule [info] PRU00505

Name and characterization of the entry

Description [info] TEA domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=66;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=61;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0354319; R2=0.0134470; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2239.66265; R2=23.25301; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=481; N_SCORE=8.5; H_SCORE=11680; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=333; N_SCORE=6.5; H_SCORE=9960; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D'; M=-17, 23,-30, 33,  3,-27,-20,-10,-10,-10,-13,-13,  7,-13, -7,-17, -7,-10,-10,-33,-13, -3;
/M: SY='G'; M= -7,-17,-26,-21,-24, 10, 33,-20,-25,-24,-15,-13, -7,-24,-27,-20, -7,-16,-19, -9, -8,-24;
/M: SY='C'; M= -6,-15, 27,-15, -3,-16,-27,-21, -8,-14, -9, -9,-18,-24,-15,-17, -7, -6,  6,-37,-20, -9;
/M: SY='D'; M=-13, 11,-33, 20, 14,-37,-17, -2,-27,  1,-26,-16,  1, 20, 19, -6, -3,-10,-30,-30,-19, 15;
/M: SY='V'; M= -3,-20,-17,-20,-17,-10,-27,-23, 10,  3, -3,  3,-20,-23,-17, -3,-10, -3, 27,-27,-10,-17;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='S'; M=  3,  4,-17,  7, 22,-24, -7, -6,-24, -3,-26,-20,  6, -6,  7, -6, 25,  9,-17,-36,-20, 15;
/M: SY='E'; M=-13, 18,-30, 28, 30,-33,-17, -4,-33, 22,-27,-19,  6, -7, 10,  8, -4,-10,-26,-29,-16, 20;
/M: SY='Y'; M=-14, -4,-30, -1, 14, -8,-24,  4,-19, 16,-16, -9, -7,-14,  6,  6,-11,-10,-19, -5, 20,  8;
/M: SY='V'; M= -3,-30,-13,-30,-27,  3,-30,-27, 27,-23, 22, 13,-30,-30,-27,-20,-16, -3, 38,-27, -7,-27;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='D'; M=-17, 37,-30, 53, 33,-37,-13,  0,-37,  3,-27,-27, 13, -7,  7, -7,  0,-10,-30,-37,-20, 20;
/M: SY='A'; M= 28,-17,-14,-24,-14, -9,-11,-20,  1,-17, 12,  1,-17,-17,-14,-20, -5, -4,  4,-20,-13,-14;
/M: SY='F'; M=-13,-23,-24,-29,-26, 40,  7,-20,-15,-26, -5, -7,-13,-26,-33,-20,-13,-14,-11, -1,  8,-26;
/M: SY='L'; M=-10,-21,-23,-21, -8, -5,-27,-11,  8,-18, 29, 14,-21,-24,  4,-11,-21,-10, -2,-20, -3, -2;
/M: SY='E'; M= -6,  0,-30,  3, 19,-33, 13, -4,-31, -1,-24,-14,  0,-10, 17, -4,  0,-14,-30,-23,-21, 18;
/M: SY='A'; M= 24,-14,-17,-20,-14, -2,-11, -5, -6,-10, -6, -6,-14,-17,-10,-16, -1, -4, -4, -2, 17,-14;
/M: SY='L'; M= -3,-19,-16,-19,-13, -1,-19,-16,  5,-23, 21,  5,-15,-23,-13,-16, -4,  1,  3,-27, -7,-13;
/M: SY='R'; M=-13,  0,-30,  3, 22,-27,-20, -4,-30, 31,-24,-13,  0,-10, 13, 34, -7,-10,-23,-23,-13, 16;
/M: SY='E'; M=  8, -9,-21, -9, 12,-14,-17,-13, -7, -9,  6, -4,-13,-13, -2,-13, -7, -7, -8,-24,-13,  5;
/M: SY='T'; M= -6,  2,-20,-11,-14,-10,-21,-14,  7,-14, -6, -3, 11,-16,-10,-14,  4, 15,  1,-30,-10,-14;
/M: SY='P'; M=-10,-13,-30,-13, -3,-20,-20,-10,-10, 12,-13, 10,-13, 17,  1,  2,-13,-10,-13,-23,-13, -3;
/M: SY='P'; M=-10,-17,-29,-14, -4,-15,-24,-17, -9,  3, -1, -2,-17, 13, -7, -3,-17,-10,-12,-23,-12, -7;
/M: SY='K'; M=-10,  7,-24, -2, -2,-18,-13,  0,-12, 15,-15,  8, 14,-16,  4,  8, -6, -7,-14,-27,-10,  1;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='T'; M= -6,-14,-16,-17,-14, -9,-24,-18, -1, -2, -6, -3,-11,-20,-11, 10,  0, 14, 12,-27,-10,-14;
/M: SY='R'; M=-13, -7,-23,-10, -3,-17,-20, -7,-23, 17,-17,-10,  0,-17,  3, 43,  0, 10,-13,-23,-10, -3;
/M: SY='K'; M=-10,  4,-30,  7, 28,-30,-20, -6,-30, 35,-26,-14,  0, -6, 14, 19, -6,-10,-24,-24,-14, 21;
/M: SY='W'; M=-13,-22,-36,-25,-15, -8,-27,-23,  0,  2,-10, -3,-19,-19, -9, -5,-22,-16, -6, 31,  5,-12;
/M: SY='G'; M=  0, -4,-24, -4, -4,-27, 19,-14,-31,  6,-30,-17,  3,-14, -4,  0,  9, -5,-21,-26,-20, -4;
/M: SY='E'; M=-10, -3,-30,  0, 30,-20,-27,-10, -3, -3, -7, -7, -7, -7,  7,-10, -7,-10,-10,-27,-13, 17;
/M: SY='R'; M=-16, -6,-30, -6,  7,-27,-20,  4,-26, 23,-20, -6,  0,-16, 28, 48, -6,-10,-24,-20,-10, 15;
/M: SY='W'; M=-11, -4,-34,-11,-17,-12, 14,-14,-26,-13,-26,-20,  5,-24,-13,-13,-11,-17,-30, 35, -5,-13;
/M: SY='E'; M= 10,  0,-23,  1, 22,-27,-13,-10,-23, 15,-20,-14, -3, -6,  7,  2,  0, -7,-17,-24,-17, 14;
/M: SY='N'; M= -4, 28,-17, 14,  0,-20,  0,  4,-20, -3,-30,-20, 45,-17,  0, -3, 19,  6,-24,-40,-20,  0;
/M: SY='F'; M=-16,-27,-23,-30,-23, 39,-30, -8,  7,-24, 22,  7,-24,-30,-24,-17,-24,-10,  1,  5, 34,-23;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='R'; M=-16, -6,-30, -6,  4,-24,-20, -4,-30, 37,-24,-10,  0,-16, 10, 55,-10,-10,-20,-20,-10,  4;
/M: SY='N'; M= -6, 25,-16,  9, -4,-16, -7, -1,-16, -4,-23,-16, 38,-16, -4, -4, 14, 18,-19,-36,-16, -4;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='L'; M=-14, -1,-24,  7, -5, -8,-23,-13, -2,-19, 21,  2,-12,-23,-13,-16,-19,-10, -5,-27, -7, -9;
/M: SY='I'; M=-14,-23,-30,-29,-19, -7,-33,-19, 21, -8,  5,  9,-13,-20, -9,  7,-16,-10, 12,-20, -4,-19;
/M: SY='A'; M= 15,-14,-14,-17,-10, -9,-11,-17, -2,-17,  5, -2,-11,-17,-10,-17,  5,  3,  0,-27,-13,-10;
/M: SY='E'; M=-10, -3,-27,  3, 33,-17,-23, -7,-13, -3,  3, -7,-10,-10,  7, -7,-10,-10,-17,-27,-13, 20;
/M: SY='Y'; M=-16,-24,-26,-24,-20, 23,-30,  5,  7,-17, 18,  7,-24,-30,-14,-14,-24,-10, -3, 12, 51,-20;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-23,-36,-30,  0,-36,-30, 43,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 37,-24, -4,-30;
/M: SY='Y'; M=-17,-13,-30,-13,-10, 10,-27, 10,-10, 10,-10, -3,-13,-23, -3,  3,-17,-10,-13, 13, 50,-10;
/M: SY='R'; M=-17, -4,-30, -4,  3,-23,-20, 30,-30, 23,-23, -7,  3,-17, 10, 35,-10,-13,-23,-23,  0,  3;
/M: SY='W'; M=-14,-24,-34,-24,-14, -3,-23,-20,-11,  0, -2, -5,-24,-23,-10, -3,-27,-17,-15, 42,  8,-10;
/M: SY='T'; M= 18, -4,-10,-14,-10,-14,-13,-20,-10,-10,-10,-10, -4,-10,-10,-14, 16, 32,  0,-26,-14,-10;
/M: SY='G'; M= -3,  7,-27,  0,-13,-27, 47,-10,-33,-13,-30,-20, 20,-20,-13,-13,  3,-13,-30,-27,-27,-13;
/M: SY='E'; M= -6,  0,-30,  3, 16,-30, 13,-10,-34, 11,-27,-17,  0,-10,  2,  2, -3,-14,-27,-23,-21,  9;
/M: SY='R'; M=-16,-13,-27,-16, -6, 10,-23,-10,-20, 17,-14, -7, -7,-20, -7, 25,-13,-10,-13,-10,  3, -6;
/M: SY='R'; M=-16, -6,-30, -6,  4,-24,-20, -4,-30, 37,-24,-10,  0,-16, 10, 55,-10,-10,-20,-20,-10,  4;
/M: SY='T'; M= -4,  0,-17, -6, -3,-17,-20,-16,-17, 12,-17,-10,  0,-10, -3,  5,  9, 28, -7,-26,-10, -3;
/M: SY='R'; M=-17, -7,-30, -7,  3,-23,-20, -3,-30, 37,-23,-10,  0,-17, 10, 57,-10,-10,-20,-20,-10,  3;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='Q'; M=-14, -4,-30, -4, 13,-33,-20,  6,-24, 17,-20, -4,  0,-14, 42, 32, -4,-10,-26,-20,-10, 25;
/M: SY='V'; M=-11,-23,-24,-26,-19, -7,-30,-19, 15, -5,  2,  6,-16,-23,-12, 10,-13, -7, 18,-23, -7,-19;
/M: SY='S'; M=  3,  4,-17,  7, 22,-24, -7, -6,-24, -3,-26,-20,  6, -6,  7, -6, 25,  9,-17,-36,-20, 15;
/M: SY='S'; M= 25, -4,-10, -7, -4,-20,  0,-14,-16,-10,-23,-16,  3,-10, -4,-14, 29, 13, -6,-33,-20, -4;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='I'; M=-10,-19,-27,-22,-12, -8,-30,-20, 12, -1, 11,  9,-16,-19, -9, -5,-19,-10,  6,-20, -4,-12;
/M: SY='Q'; M=-14, -4,-30, -4, 13,-33,-20,  6,-24, 17,-20, -4,  0,-14, 42, 32, -4,-10,-26,-20,-10, 25;
/M: SY='V'; M= -7,-23,-17,-23,-19, -7,-26,-19,  8, -2, -1,  3,-19,-26,-15, 13,-10, -4, 24,-26,-10,-19;
/M: SY='W'; M=-13,-22,-34,-22,-12, -5,-23,-20,-12,  3, -3, -4,-22,-23, -9, -2,-26,-17,-14, 37,  6, -9;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_04 which contains 544'996 sequence entries.


Total number of hits 15 in 15 different sequences
Number of true positive hits 15 in 15 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 1
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Scaling database [info] reversed
Author [info] N_Hulo
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DNA_BIND
Feature description [info] TEA
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
15 sequences

ABAA_EMENI  (P20945), EGL44_CAEEL (Q19849), SCAL_DROME  (P30052), 
TEAD1_HUMAN (P28347), TEAD1_MOUSE (P30051), TEAD2_HUMAN (Q15562), 
TEAD2_MOUSE (P48301), TEAD3_CHICK (Q90701), TEAD3_HUMAN (Q99594), 
TEAD3_MOUSE (P70210), TEAD4_CHICK (P48984), TEAD4_HUMAN (Q15561), 
TEAD4_MOUSE (Q62296), TEC1_CANAL  (Q5ANJ4), TEC1_YEAST  (P18412)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
'Partial' sequences
1 sequence

SCAL_JUNCO  (Q25214)

		
PDB
[Detailed view]
1 PDB

2HZD

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission