Entry: PS51088

General information about the entry
Entry name TEA_2
Accession number PS51088
Entry type MATRIX
Date MAR-2005 (CREATED); MAR-2005 (DATA UPDATE); APR-2013 (INFO UPDATE).
PROSITE Documentation PDOC00479
Associated ProRule PRU00505
Name and characterization of the entry
DescriptionTEA domain profile.
Matrix / Profile 
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=66;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=61;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0354319; R2=0.0134470; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=481; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=333; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D'; M=-17, 23,-30, 33,  3,-27,-20,-10,-10,-10,-13,-13,  7,-13, -7,-17, -7,-10,-10,-33,-13, -3;
/M: SY='G'; M= -7,-17,-26,-21,-24, 10, 33,-20,-25,-24,-15,-13, -7,-24,-27,-20, -7,-16,-19, -9, -8,-24;
/M: SY='C'; M= -6,-15, 27,-15, -3,-16,-27,-21, -8,-14, -9, -9,-18,-24,-15,-17, -7, -6,  6,-37,-20, -9;
/M: SY='D'; M=-13, 11,-33, 20, 14,-37,-17, -2,-27,  1,-26,-16,  1, 20, 19, -6, -3,-10,-30,-30,-19, 15;
/M: SY='V'; M= -3,-20,-17,-20,-17,-10,-27,-23, 10,  3, -3,  3,-20,-23,-17, -3,-10, -3, 27,-27,-10,-17;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='S'; M=  3,  4,-17,  7, 22,-24, -7, -6,-24, -3,-26,-20,  6, -6,  7, -6, 25,  9,-17,-36,-20, 15;
/M: SY='E'; M=-13, 18,-30, 28, 30,-33,-17, -4,-33, 22,-27,-19,  6, -7, 10,  8, -4,-10,-26,-29,-16, 20;
/M: SY='Y'; M=-14, -4,-30, -1, 14, -8,-24,  4,-19, 16,-16, -9, -7,-14,  6,  6,-11,-10,-19, -5, 20,  8;
/M: SY='V'; M= -3,-30,-13,-30,-27,  3,-30,-27, 27,-23, 22, 13,-30,-30,-27,-20,-16, -3, 38,-27, -7,-27;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='D'; M=-17, 37,-30, 53, 33,-37,-13,  0,-37,  3,-27,-27, 13, -7,  7, -7,  0,-10,-30,-37,-20, 20;
/M: SY='A'; M= 28,-17,-14,-24,-14, -9,-11,-20,  1,-17, 12,  1,-17,-17,-14,-20, -5, -4,  4,-20,-13,-14;
/M: SY='F'; M=-13,-23,-24,-29,-26, 40,  7,-20,-15,-26, -5, -7,-13,-26,-33,-20,-13,-14,-11, -1,  8,-26;
/M: SY='L'; M=-10,-21,-23,-21, -8, -5,-27,-11,  8,-18, 29, 14,-21,-24,  4,-11,-21,-10, -2,-20, -3, -2;
/M: SY='E'; M= -6,  0,-30,  3, 19,-33, 13, -4,-31, -1,-24,-14,  0,-10, 17, -4,  0,-14,-30,-23,-21, 18;
/M: SY='A'; M= 24,-14,-17,-20,-14, -2,-11, -5, -6,-10, -6, -6,-14,-17,-10,-16, -1, -4, -4, -2, 17,-14;
/M: SY='L'; M= -3,-19,-16,-19,-13, -1,-19,-16,  5,-23, 21,  5,-15,-23,-13,-16, -4,  1,  3,-27, -7,-13;
/M: SY='R'; M=-13,  0,-30,  3, 22,-27,-20, -4,-30, 31,-24,-13,  0,-10, 13, 34, -7,-10,-23,-23,-13, 16;
/M: SY='E'; M=  8, -9,-21, -9, 12,-14,-17,-13, -7, -9,  6, -4,-13,-13, -2,-13, -7, -7, -8,-24,-13,  5;
/M: SY='T'; M= -6,  2,-20,-11,-14,-10,-21,-14,  7,-14, -6, -3, 11,-16,-10,-14,  4, 15,  1,-30,-10,-14;
/M: SY='P'; M=-10,-13,-30,-13, -3,-20,-20,-10,-10, 12,-13, 10,-13, 17,  1,  2,-13,-10,-13,-23,-13, -3;
/M: SY='P'; M=-10,-17,-29,-14, -4,-15,-24,-17, -9,  3, -1, -2,-17, 13, -7, -3,-17,-10,-12,-23,-12, -7;
/M: SY='K'; M=-10,  7,-24, -2, -2,-18,-13,  0,-12, 15,-15,  8, 14,-16,  4,  8, -6, -7,-14,-27,-10,  1;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='T'; M= -6,-14,-16,-17,-14, -9,-24,-18, -1, -2, -6, -3,-11,-20,-11, 10,  0, 14, 12,-27,-10,-14;
/M: SY='R'; M=-13, -7,-23,-10, -3,-17,-20, -7,-23, 17,-17,-10,  0,-17,  3, 43,  0, 10,-13,-23,-10, -3;
/M: SY='K'; M=-10,  4,-30,  7, 28,-30,-20, -6,-30, 35,-26,-14,  0, -6, 14, 19, -6,-10,-24,-24,-14, 21;
/M: SY='W'; M=-13,-22,-36,-25,-15, -8,-27,-23,  0,  2,-10, -3,-19,-19, -9, -5,-22,-16, -6, 31,  5,-12;
/M: SY='G'; M=  0, -4,-24, -4, -4,-27, 19,-14,-31,  6,-30,-17,  3,-14, -4,  0,  9, -5,-21,-26,-20, -4;
/M: SY='E'; M=-10, -3,-30,  0, 30,-20,-27,-10, -3, -3, -7, -7, -7, -7,  7,-10, -7,-10,-10,-27,-13, 17;
/M: SY='R'; M=-16, -6,-30, -6,  7,-27,-20,  4,-26, 23,-20, -6,  0,-16, 28, 48, -6,-10,-24,-20,-10, 15;
/M: SY='W'; M=-11, -4,-34,-11,-17,-12, 14,-14,-26,-13,-26,-20,  5,-24,-13,-13,-11,-17,-30, 35, -5,-13;
/M: SY='E'; M= 10,  0,-23,  1, 22,-27,-13,-10,-23, 15,-20,-14, -3, -6,  7,  2,  0, -7,-17,-24,-17, 14;
/M: SY='N'; M= -4, 28,-17, 14,  0,-20,  0,  4,-20, -3,-30,-20, 45,-17,  0, -3, 19,  6,-24,-40,-20,  0;
/M: SY='F'; M=-16,-27,-23,-30,-23, 39,-30, -8,  7,-24, 22,  7,-24,-30,-24,-17,-24,-10,  1,  5, 34,-23;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='R'; M=-16, -6,-30, -6,  4,-24,-20, -4,-30, 37,-24,-10,  0,-16, 10, 55,-10,-10,-20,-20,-10,  4;
/M: SY='N'; M= -6, 25,-16,  9, -4,-16, -7, -1,-16, -4,-23,-16, 38,-16, -4, -4, 14, 18,-19,-36,-16, -4;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='L'; M=-14, -1,-24,  7, -5, -8,-23,-13, -2,-19, 21,  2,-12,-23,-13,-16,-19,-10, -5,-27, -7, -9;
/M: SY='I'; M=-14,-23,-30,-29,-19, -7,-33,-19, 21, -8,  5,  9,-13,-20, -9,  7,-16,-10, 12,-20, -4,-19;
/M: SY='A'; M= 15,-14,-14,-17,-10, -9,-11,-17, -2,-17,  5, -2,-11,-17,-10,-17,  5,  3,  0,-27,-13,-10;
/M: SY='E'; M=-10, -3,-27,  3, 33,-17,-23, -7,-13, -3,  3, -7,-10,-10,  7, -7,-10,-10,-17,-27,-13, 20;
/M: SY='Y'; M=-16,-24,-26,-24,-20, 23,-30,  5,  7,-17, 18,  7,-24,-30,-14,-14,-24,-10, -3, 12, 51,-20;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-23,-36,-30,  0,-36,-30, 43,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 37,-24, -4,-30;
/M: SY='Y'; M=-17,-13,-30,-13,-10, 10,-27, 10,-10, 10,-10, -3,-13,-23, -3,  3,-17,-10,-13, 13, 50,-10;
/M: SY='R'; M=-17, -4,-30, -4,  3,-23,-20, 30,-30, 23,-23, -7,  3,-17, 10, 35,-10,-13,-23,-23,  0,  3;
/M: SY='W'; M=-14,-24,-34,-24,-14, -3,-23,-20,-11,  0, -2, -5,-24,-23,-10, -3,-27,-17,-15, 42,  8,-10;
/M: SY='T'; M= 18, -4,-10,-14,-10,-14,-13,-20,-10,-10,-10,-10, -4,-10,-10,-14, 16, 32,  0,-26,-14,-10;
/M: SY='G'; M= -3,  7,-27,  0,-13,-27, 47,-10,-33,-13,-30,-20, 20,-20,-13,-13,  3,-13,-30,-27,-27,-13;
/M: SY='E'; M= -6,  0,-30,  3, 16,-30, 13,-10,-34, 11,-27,-17,  0,-10,  2,  2, -3,-14,-27,-23,-21,  9;
/M: SY='R'; M=-16,-13,-27,-16, -6, 10,-23,-10,-20, 17,-14, -7, -7,-20, -7, 25,-13,-10,-13,-10,  3, -6;
/M: SY='R'; M=-16, -6,-30, -6,  4,-24,-20, -4,-30, 37,-24,-10,  0,-16, 10, 55,-10,-10,-20,-20,-10,  4;
/M: SY='T'; M= -4,  0,-17, -6, -3,-17,-20,-16,-17, 12,-17,-10,  0,-10, -3,  5,  9, 28, -7,-26,-10, -3;
/M: SY='R'; M=-17, -7,-30, -7,  3,-23,-20, -3,-30, 37,-23,-10,  0,-17, 10, 57,-10,-10,-20,-20,-10,  3;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='Q'; M=-14, -4,-30, -4, 13,-33,-20,  6,-24, 17,-20, -4,  0,-14, 42, 32, -4,-10,-26,-20,-10, 25;
/M: SY='V'; M=-11,-23,-24,-26,-19, -7,-30,-19, 15, -5,  2,  6,-16,-23,-12, 10,-13, -7, 18,-23, -7,-19;
/M: SY='S'; M=  3,  4,-17,  7, 22,-24, -7, -6,-24, -3,-26,-20,  6, -6,  7, -6, 25,  9,-17,-36,-20, 15;
/M: SY='S'; M= 25, -4,-10, -7, -4,-20,  0,-14,-16,-10,-23,-16,  3,-10, -4,-14, 29, 13, -6,-33,-20, -4;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='I'; M=-10,-19,-27,-22,-12, -8,-30,-20, 12, -1, 11,  9,-16,-19, -9, -5,-19,-10,  6,-20, -4,-12;
/M: SY='Q'; M=-14, -4,-30, -4, 13,-33,-20,  6,-24, 17,-20, -4,  0,-14, 42, 32, -4,-10,-26,-20,-10, 25;
/M: SY='V'; M= -7,-23,-17,-23,-19, -7,-26,-19,  8, -2, -1,  3,-19,-26,-15, 13,-10, -4, 24,-26,-10,-19;
/M: SY='W'; M=-13,-22,-34,-22,-12, -5,-23,-20,-12,  3, -3, -4,-22,-23, -9, -2,-26,-17,-14, 37,  6, -9;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
Numerical results
  • UniProtKB/Swiss-Prot release number: 2013_06, total number of sequence entries in that release: 540261.
  • Total number of hits in UniProtKB/Swiss-Prot: 14 hits in 14 different sequences
  • Number of hits on proteins that are known to belong to the set under consideration: 14 hits in 14 different sequences
  • Number of hits on proteins that could potentially belong to the set under consideration: 0 hits in 0 different sequences
  • Number of false hits (on unrelated proteins): 0 hits in 0 different sequences
  • Number of known missed hits: 0
  • Number of partial sequences which belong to the set under consideration, but which are not hit by the pattern or profile because they are partial (fragment) sequences: 1
  • Precision (true hits / (true hits + false positives)): 100.00 %
  • Recall (true hits / (true hits + false negatives)): 100.00 %
Comments
  • Scaling database: UniProtKB/Swiss-Prot: reversed
  • Matrix author: N_Hulo
  • Taxonomic range: Eukaryotes
  • Maximum known number of repetitions of the pattern in a single protein: 1
  • FT_KEY: DNA_BIND
  • FT_DESC: TEA
  • VERSION: 1
Cross-references
UniProtKB/Swiss-Prot True positive hits:
ABAA_EMENI  (P20945), EGL44_CAEEL (Q19849), SCAL_DROME  (P30052), 
TEAD1_HUMAN (P28347), TEAD1_MOUSE (P30051), TEAD2_HUMAN (Q15562), 
TEAD2_MOUSE (P48301), TEAD3_CHICK (Q90701), TEAD3_HUMAN (Q99594), 
TEAD3_MOUSE (P70210), TEAD4_CHICK (P48984), TEAD4_HUMAN (Q15561), 
TEAD4_MOUSE (Q62296), TEC1_YEAST  (P18412)
`Potential' hits (partial sequences which belong to the set under consideration, but which are not hit by the pattern or profile because they are partial (fragment) sequences):
SCAL_JUNCO  (Q25214)
Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:

[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format]

Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]		 2HZD;

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)

If you would like to retrieve all the Swiss-Prot entries referenced in the DR lines of this entry (with the exception of false positive hits) , you can enter a file name. These entries will then be saved to a file under this name. (Please note that this temporary file will only be kept for 1 week.)

File name:

Format: Swiss-Prot Fasta

or