PROSITE entry PS51096

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	PTS_EIIA_TYPE_4
Accession [info]	PS51096
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-APR-2005 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00528
Associated ProRule [info]	PRU00419

Name and characterization of the entry

Description [info]

PTS_EIIA type-4 domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=125;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=120;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0162551; R2=0.0188352; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6478.1601562; R2=5.5788145; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=345; H_SCORE=8403; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=239; H_SCORE=7811; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='M';  M= -7, -9,-22,-14, -8,-11,-14, -4, -2, -1, -1, 21, -7,-14,  1, -1, -8, -3, -4,-24, -7, -4;
/M: SY='V';  M= -7,-21,-17,-25,-19, -5,-29,-20, 16,-13,  6,  8,-18,-19,-15,-11,-13, -5, 17,-23, -4,-19;
/M: SY='G';  M=  1, -3,-26, -5, -7,-25, 26, -5,-30, -5,-25,-15,  4,-16, -7, -8,  1,-12,-24,-22,-17, -7;
/M: SY='I';  M= -5,-28,-22,-35,-27,  6,-32,-26, 30,-26, 18, 13,-23,-24,-22,-24,-18, -8, 23,-15,  1,-26;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-20,-33,-27,  4,-33,-26, 33,-26, 22, 16,-26,-26,-24,-23,-18, -6, 32,-22, -2,-27;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-22,-35,-27,  6,-34,-27, 35,-28, 26, 17,-25,-26,-23,-24,-21, -8, 27,-21, -1,-27;
/M: SY='V';  M=  8,-21,-11,-25,-22, -7,-18,-24, 14,-19,  4,  4,-18,-22,-20,-20, -4,  0, 21,-26,-12,-21;
/M: SY='S';  M= 14, -4, -9, -9, -8,-18,  2,-15,-17,-12,-20,-14,  1,-12, -7,-14, 22, 16, -7,-31,-19, -7;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='G';  M=  3, -6,-24, -6,-13,-26, 42,-17,-31,-16,-27,-19,  2,-15,-14,-17,  9, -9,-22,-26,-26,-13;
/M: SY='E';  M= -7,  3,-27,  3,  5,-21,-10,  0,-23,  5,-20,-13,  4, -8,  2,  3, -3, -7,-20,-21,-10,  2;
/M: SY='F';  M= -6,-15,-21,-18,-12, 10,-19,-10, -4,-13,  3,  0,-11,-20,-13,-10, -9, -5, -4,-13,  3,-12;
/M: SY='A';  M= 21,-13,-14,-20,-15,-14, -7,-21, -2,-16, -3, -5,-11,-13,-14,-19,  4,  4,  3,-23,-15,-15;
/M: SY='A';  M= 15, -4,-17, -6,  4,-23, -6,-11,-17, -2,-17,-12, -3,-11,  1, -7,  8,  0,-11,-26,-17,  2;
/M: SY='G';  M=  3,  0,-23,  1,  9,-27, 10,-10,-27, -4,-23,-17,  1,-10,  2, -8,  8, -3,-21,-27,-21,  5;
/M: SY='L';  M= -3,-18,-21,-21,-17, -4, -4,-17,  2,-20,  6,  6,-13,-21,-15,-18, -6, -6,  1,-22, -8,-16;
/M: SY='L';  M= -4,-19,-20,-23,-14, -6,-25,-14,  9,-10, 11, 11,-18,-21, -8, -8,-14, -6,  9,-21, -4,-12;
/M: SY='Q';  M=  2,  1,-21, -1,  2,-22,-12, -4,-15,  2,-17, -9,  2,-14,  5, -2,  4, -2,-10,-27,-13,  3;
/M: SY='S';  M=  8,  2,-13,  1,  6,-22, -7, -9,-19, -5,-20,-15,  3,-11,  1, -8, 15,  6,-12,-32,-18,  3;
/M: SY='L';  M=  3,-23,-13,-27,-21, -1,-21,-22, 14,-21, 17, 10,-22,-24,-19,-20,-12, -3, 17,-23, -6,-21;
/M: SY='E';  M=  6, -4,-19, -5,  8,-20,-14, -9,-11, -4,-11, -8, -5,-12,  1, -9,  1, -3, -7,-26,-14,  4;
/M: SY='M';  M= -8, -6,-22,-13, -8,-11,-14,  4, -3, -4, -3, 15,  0,-19,  1, -3, -8, -7, -7,-25, -6, -5;
/M: SY='I';  M= -9,-17,-26,-20, -6, -8,-28,-16, 11,-10,  5,  6,-14,-18, -1, -8,-13, -8,  5,-21, -5, -5;
/M: SY='L';  M= -1,-23,-16,-28,-20,  6,-24,-15, 14,-20, 18, 17,-21,-24,-17,-18,-15, -5, 12,-18,  1,-19;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='G';  M=  3,-11,-23,-13,-17,-21, 36,-19,-25,-17,-15,-11, -5,-20,-16,-17, -3,-13,-19,-21,-22,-16;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='E';  M= -7,  4,-28,  7, 11,-28, -1, -6,-28,  6,-25,-16,  2,  0,  3,  0, -1, -9,-24,-27,-18,  7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='Q';  M= -8,  4,-24,  5,  8,-24,-16, -4,-15, -1,-13, -7,  1,-13, 14, -2, -1, -4,-16,-26,-12, 10;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E';  M= -2,  0,-22,  1,  9,-19,-17, -9,-13, -2,-14,-11, -3, -7, -2, -8,  1, -1, -7,-28,-13,  3;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='N';  M= -7,  6,-25,  2,  1,-21,-11,  0,-17,  0,-20,-11, 11, -5,  3, -2,  0, -5,-19,-29,-13,  1;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='V';  M= -6,-27,-14,-32,-27,  9,-30,-25, 23,-24, 16, 11,-24,-26,-25,-22,-15, -4, 25,-20, -1,-27;
/M: SY='E';  M=  0, -7,-21, -9,  2,-18,-17, -5, -9, -4,-11, -6, -5,-13,  1, -4,  0,  1, -7,-24, -9,  0;
/M: SY='A';  M= 14,-12,-16,-18,-13, -7,-10,-16, -5,-14, -9, -7,-10,-12,-13,-17,  3,  4,  0,-17, -7,-14;
/M: SY='V';  M=  0,-26,-15,-31,-25,  4,-27,-24, 23,-23, 12, 10,-21,-24,-22,-22,-12, -5, 24,-21, -3,-25;
/M: SY='D';  M= -3, 12,-17, 15, -1,-28, 10,-10,-29, -9,-26,-21,  8,-10, -8,-13,  6, -4,-22,-32,-22, -5;
/M: SY='F';  M= -6,-22,-20,-28,-23, 13, -4,-18,  1,-23,  8, 10,-17,-24,-22,-19,-15,-11,  1,-14, -2,-21;
/M: SY='P';  M= -8,-13,-25,-13, -8,-10,-20,-12, -5,-11, -5, -2,-12,  3, -8,-12, -7,  1, -7,-18, -5,-10;
/M: SY='P';  M= -5, -7,-27, -3,  2,-19,-18,-14,-11, -8,-10, -9,-10, 13, -7,-11, -7, -7,-13,-27,-17, -4;
/M: SY='D';  M= -9, 18,-26, 24, 10,-30,  7, -5,-32, -4,-26,-21, 10,-12, -2, -9,  4, -4,-25,-32,-20,  4;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E';  M= -7,  5,-25,  8, 12,-24, -5, -5,-18, -3,-14, -6,  0,-12,  4, -7, -2, -8,-16,-28,-16,  8;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='S';  M= -3,  7,-22,  8,  2,-24,  5, -9,-26, -6,-25,-18,  9, -8, -3, -7, 11,  2,-20,-31,-20, -1;
/M: SY='I';  M= -2,-19,-23,-21,-15, -7,-24,-21,  9,-18,  3,  3,-17, -1,-15,-19, -9, -2,  7,-24,-10,-17;
/M: SY='D';  M= -6,  8,-27, 12,  8,-28,  9, -7,-29, -3,-23,-17,  5,-11,  0, -8,  1, -9,-24,-27,-18,  4;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='D';  M= -5,  8,-21,  9,  6,-22,-13, -9,-18, -3,-15,-11,  2,-10,  3, -6,  6,  9,-13,-29,-14,  4; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='L';  M= -6,-14,-18,-16,-15,  3,-22,-15,  5,-17,  8,  3,-12,-21,-15,-14, -7, -2,  5,-21, -2,-15; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='L';  M= -4,-15,-22,-18, -8, -1,-19,-12, -1,-10,  1,  1,-11,-16, -8, -7, -7, -4, -2,-18, -1, -9;
/M: SY='E';  M= -1,  4,-24,  6, 12,-25,-11, -7,-19,  0,-17,-12,  0, -7,  5, -3,  1, -3,-16,-27,-16,  8;
/M: SY='K';  M= -7, -2,-25, -2,  8,-22,-18, -2,-20, 16,-17, -6, -1,-13, 10, 13, -5, -7,-17,-22, -9,  8;
/M: SY='I';  M= -6,-27,-21,-33,-25,  9,-31,-21, 27,-24, 19, 16,-23,-25,-21,-22,-18, -7, 22,-16,  5,-25;
/M: SY='Q';  M= -5, -3,-20, -5,  2,-18,-17, -6,-11,  2,-11, -3, -1,-15,  4,  1, -3, -4, -9,-26,-11,  2;
/M: SY='E';  M=  2,  8,-22,  9, 14,-26,-12, -4,-22,  3,-19,-14,  4,-10,  8, -1,  5, -1,-18,-28,-16, 11;
/M: SY='A';  M= 15,-12,-18,-17, -9,-10,-14,-14, -4, -7, -5, -4,-11,-16, -7,-10, -1, -2,  0,-17, -6, -9;
/M: SY='I';  M= -5,-28,-20,-33,-26,  4,-31,-24, 30,-25, 23, 17,-24,-25,-21,-23,-18, -7, 25,-21, -2,-25;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='E';  M=  0,  5,-17,  5,  8,-18, -8,  0,-16,  3,-13, -9,  4, -9,  3,  0,  1, -3,-13,-21,-10,  5; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='E';  M= -4,  2,-21,  2, 11,-21,-11, -3,-20,  9,-17,-10,  2, -9,  8,  8,  2, -2,-16,-22,-12,  9; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='V';  M= -2,-16,-15,-19,-13, -1,-21,-16,  7,-14,  7,  4,-14,-19,-13,-13, -8, -2,  9,-20, -5,-13; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='D';  M= -9, 16,-27, 19,  5,-25, -8, -4,-24, -2,-23,-17, 10, -7, -1, -8,  0, -6,-22,-26,-14,  1;
/M: SY='S';  M= -2,  2,-20,  1,  4,-21, -9, -8,-19, -5,-19,-13,  4, -2,  1, -8,  8,  5,-16,-30,-17,  2;
/M: SY='G';  M= -3,  5,-22,  6,  4,-24,  7, -7,-26, -5,-22,-17,  5,-12, -3, -9,  2, -7,-21,-27,-18,  0;
/M: SY='D';  M=-10, 19,-26, 25, 21,-30,-12,  1,-29,  8,-25,-19, 11,-10,  8,  3,  1, -8,-25,-32,-17, 14;
/M: SY='G';  M= -4, -1,-29,  1,  3,-30, 29, -8,-34, -7,-26,-18,  2,-12, -3,-10,  0,-14,-28,-24,-23,  0;
/M: SY='V';  M=  0,-26,-15,-29,-25,  2,-26,-26, 21,-21, 11,  7,-23,-25,-24,-20,-11, -1, 29,-21, -6,-25;
/M: SY='L';  M= -5,-28,-21,-32,-23,  6,-30,-23, 26,-26, 30, 16,-25,-26,-21,-22,-21, -7, 19,-20,  0,-23;
/M: SY='I';  M= -6,-28,-14,-34,-27, 11,-32,-26, 26,-26, 16, 12,-23,-26,-25,-23,-16, -5, 25,-20,  0,-27;
/M: SY='L';  M=-11,-29,-20,-32,-23, 24,-29,-19, 16,-28, 35, 18,-26,-28,-23,-20,-25,-10,  9,-14,  6,-22;
/M: SY='T';  M=  2,-15, -8,-21,-19, -1,-21,-20,  5,-15, -1,  0,-14,-20,-18,-16,  2, 16, 15,-24, -5,-19;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='L';  M= -9,-27,-22,-32,-22,  5,-30,-18, 26,-24, 33, 28,-24,-25,-16,-20,-23, -8, 15,-20,  0,-20;
/M: SY='G';  M= -7,-20,-27,-22,-21,  2, 12,-18,-14,-20, -5, -6,-14,-22,-20,-18,-13,-15,-12, -1, -3,-20;
/M: SY='G';  M=  4, -6,-19, -6,-12,-25, 37,-16,-31,-16,-29,-20,  4,-16,-12,-16, 17, -3,-21,-29,-25,-12;
/M: SY='G';  M= 13,-13,-22,-16,-16,-20, 30,-20,-20,-18,-11,-10, -8,-18,-16,-20, -1,-11,-14,-21,-22,-16;
/M: SY='T';  M=  2, -5,-15,-10, -6,-13,-15,-16, -9, -7,-12, -9, -2,-12, -7, -7, 14, 21, -1,-30,-13, -7;
/M: SY='P';  M= -8,-18,-29,-15, -6,-17,-21,-15, -6,-12,-10, -2,-18, 36, -9,-16, -9, -5,-11,-26,-16,-10;
/M: SY='F';  M= -7, -7,-10,-16,-16, 13,-17,-11, -7,-17, -7, -7,  1,-23,-17,-14, -1,  0, -7,-16,  3,-15;
/M: SY='N';  M= -3, 12,-20,  1, -4,-18, -3, -2,-17, -3,-20,-13, 22,-17, -2, -1,  5,  0,-18,-29,-14, -3;
/M: SY='E';  M=  0, -3,-22, -3,  7,-20,-18,-11,-10,  0,-10, -7, -5,-11,  3, -4, -1, -1, -7,-27,-13,  4;
/M: SY='A';  M= 18,-14,-12,-21,-13, -9,-12,-16, -1,-13, -1,  3,-12,-16,-11,-15,  1,  1,  4,-22,-11,-12;
/M: SY='A';  M=  8,-16,-15,-21,-15, -6,-17,-17,  6,-16,  4,  2,-12,-19,-13,-16, -2, -1,  8,-24, -9,-15;
/M: SY='R';  M= -6, -9,-23,-11, -3,-13,-17,-11, -8, -1, -5, -2, -6,-13, -1,  3, -3, -1, -7,-25,-10, -3;
/M: SY='L';  M= -6, -9,-22, -8,  1, -9,-23,-12, -3, -9,  4, -1,-12,-17, -5, -9,-11, -7, -3,-22, -6, -3;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='M';  M=  0,-16,-16,-21,-13,  0,-19,-13,  8,-15,  9, 11,-14,-18,-11,-14, -8, -4,  7,-19, -4,-12; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='M';  M= -1,-11,-16,-13, -8, -3,-11, -8,  0,-11,  3,  4, -9,-13, -7,-10, -5, -2, -1,-16, -3, -8; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-22;
/M: SY='E';  M= -7, 13,-23, 17, 18,-26, -6, -1,-26,  5,-22,-16,  9, -8,  7,  0,  3, -5,-22,-28,-16, 12; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-22;
/M: SY='R';  M= -9, -1,-26, -2,  2,-19,-13,  1,-19,  6,-17, -9,  1,-12,  2,  7, -4, -5,-16,-24, -7,  1;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='P';  M= -8,  4,-30, 11, 16,-30, -9, -9,-27,  0,-26,-20, -1, 18,  2, -7,  1, -5,-26,-31,-22,  7;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='N';  M= -8,  9,-22,  7,  5,-22, -8,  1,-22, 10,-21,-11, 11,-11,  5, 11,  0, -5,-19,-25,-12,  4; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='V';  M= -5,-26,-14,-30,-26,  3,-30,-23, 23,-21, 12, 11,-23,-26,-22,-20,-13, -2, 27,-21, -2,-25;
/M: SY='E';  M= -8, -1,-26,  2, 10,-17,-18, -2,-20,  5,-15,-11, -2, -9,  3,  7, -5, -8,-17,-23, -9,  5;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='V';  M= -5,-27,-15,-31,-26,  1,-31,-25, 27,-23, 18, 13,-24,-26,-23,-20,-15, -3, 29,-25, -5,-25;
/M: SY='I';  M= -5,-28,-17,-33,-27,  2,-33,-26, 32,-25, 18, 14,-24,-25,-23,-24,-16, -6, 29,-23, -3,-27;
/M: SY='S';  M=  9,  5,-16,  4,  3,-21, -7,-11,-19, -7,-20,-16,  5, -8, -3,-11, 15, 12,-12,-31,-17,  0;
/M: SY='G';  M=  4, -5,-25, -9,-16,-25, 43,-15,-28,-15,-23,-13,  4,-19,-15,-16,  1,-14,-22,-23,-25,-15;
/M: SY='V';  M=  1,-22,-15,-25,-19, -5,-23,-21, 12,-18,  8,  9,-21,-11,-17,-18, -9,  0, 15,-25, -9,-19;
/M: SY='N';  M= -7, 14,-15,  3, -7, -9, -9, -2,-12, -8,-16,-12, 26,-20, -6, -7,  8,  6,-15,-31,-10, -7;
/M: SY='L';  M= -4,-22,-17,-26,-20,  3,-27,-21, 16,-23, 25, 12,-21,-24,-19,-18,-14,  4, 15,-23, -3,-20;
/M: SY='P';  M=  4,-11,-28, -8,  4,-26,-12,-15,-18, -7,-21,-15,-11, 35, -3,-14,  0, -4,-20,-28,-23, -2;
/M: SY='M';  M= -2,-19,-20,-25,-18, -5,-11, -9,  9,-16, 13, 25,-16,-21, -9,-15,-12, -7,  5,-21, -5,-14;
/M: SY='L';  M=  9,-23,-15,-27,-20, -2,-21,-22, 15,-21, 19,  9,-23,-23,-19,-20,-12, -3, 17,-22, -8,-20;
/M: SY='L';  M= -7,-26,-21,-29,-19,  3,-29,-20, 22,-24, 28, 16,-24,-25,-17,-20,-21, -8, 15,-21, -2,-19;
/M: SY='E';  M= -3,  4,-25,  7, 24,-23,-16, -5,-21,  4,-17,-14,  1, -7,  8,  0,  2, -4,-19,-28,-16, 16;
/M: SY='A';  M= 18,-16,-15,-22,-14, -9,-11,-19,  1,-15,  2,  1,-14,-17,-12,-18, -1, -1,  6,-20,-11,-13;
/M: SY='V';  M=  6,-19,-17,-24,-19,  0,-12,-19,  5,-19,  6,  4,-16,-21,-18,-19, -6, -3,  9,-20, -6,-19;
/I:         I=-3; MD=-14;
/M: SY='M';  M= -5, -9,-15,-12, -9, -4,-16,-10, -3, -8,  0,  3, -7,-17, -8, -3, -5, -1,  0,-21, -6, -9; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-14;
/M: SY='E';  M= -1, -3,-16, -3,  4,-14,-13, -6,-11,  0, -9, -5, -3,-12,  1, -2,  0, -2, -8,-20, -8,  2; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-14;
/M: SY='R';  M= -1, -8,-18,-10, -2,-15,-13, -6,-12,  8,-11, -5, -3,-12,  3, 18, -3, -4, -8,-17, -9, -1; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='D';  M= -4,  0,-12,  1,  0, -9, -8, -3, -7, -5, -5, -4, -1, -9, -1, -6, -1, -2, -7,-15, -4, -1; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-14;
/M: SY='E';  M= -4,  2,-19,  4,  6,-16,-12, -8,-11, -4, -8, -7, -2, -5, -1, -7, -1, -3,-10,-23,-12,  2; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-14;
/M: SY='G';  M=  0,  3,-22,  1, -1,-22, 14, -7,-24, -7,-22,-14,  7,-14, -4, -9,  5, -5,-20,-26,-18, -3; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-14;
/M: SY='A';  M=  2, -9,-21,-11, -5,-14,-13,-10, -6, -8, -3,  1, -8,-12, -2, -9, -3, -3, -6,-23, -9, -4;
/M: SY='S';  M= -2, 10,-20, 11,  3,-23, -4, -7,-22, -7,-24,-18, 11, -5, -2,-10, 14,  6,-17,-34,-18,  0;
/M: SY='L';  M= -7,-24,-21,-27,-19,  8,-26,-19, 14,-20, 21, 11,-20,-23,-18,-16,-17, -6,  9,-19,  0,-18;
/M: SY='E';  M= -4, 11,-25, 16, 19,-27,-13, -1,-25,  3,-21,-16,  4, -5,  8, -3,  3, -4,-22,-29,-15, 13;
/M: SY='E';  M=  0,  7,-24, 11, 25,-28,-13, -5,-23,  3,-19,-15,  1, -7, 12, -4,  5, -2,-20,-28,-17, 18;
/M: SY='I';  M= -4,-27,-19,-32,-24,  7,-30,-24, 25,-25, 22, 13,-23,-25,-21,-22,-18, -7, 20,-19, -1,-24;
/M: SY='V';  M=  3,-18,-17,-21,-14, -7,-22,-16,  5,-10,  2,  2,-16,-17,-11,-11, -8, -4,  9,-20, -4,-14;
/M: SY='E';  M=  3,  5,-21,  5, 12,-24,-12, -6,-20,  2,-18,-13,  2,-10,  6, -3,  4, -2,-16,-27,-16,  9;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='E';  M= -3,  2,-20,  0,  7,-20,-14, -2,-15,  1,-15, -8,  3,-13,  5, -3,  1, -1,-13,-27,-11,  5; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='I';  M= 11,-21,-17,-27,-19, -6,-20,-22, 15,-19,  8,  5,-17,-19,-15,-20, -7, -3, 15,-22, -9,-18;
/M: SY='L';  M= -5,-14,-21,-16, -8, -8,-22,-12,  1, -7,  2,  2,-12,-17, -6, -7, -9, -4,  1,-22, -5, -8;
/M: SY='E';  M= -2,  5,-24,  8, 24,-25,-15, -5,-23,  7,-20,-15,  1, -7, 10,  0,  2, -4,-20,-26,-15, 17;
/M: SY='A';  M=  7, -4,-14, -9, -3,-18, -9,-13,-12, -5,-12, -8, -3,-14, -4, -9,  3,  0, -8,-26,-14, -4;
/M: SY='G';  M=  6, -7,-21,-10,-10,-21, 22,-15,-25, -9,-22,-15, -2,-14, -9,-12,  4, -7,-18,-22,-19,-10;
/M: SY='R';  M= -7, -6,-25, -6,  1,-20,-17, -3,-21, 15,-19, -9, -3,-11,  4, 19, -4, -5,-15,-21, -7,  0;
/M: SY='E';  M= -7,  5,-26,  8, 17,-27,-14, -5,-24,  9,-22,-14,  3, -5, 11,  4,  3, -2,-21,-28,-15, 14;
/M: SY='G';  M=  2, -7,-21, -9,-10,-16, 13,-11,-20,-11,-16,-11, -3,-16, -8,-11,  2, -5,-15,-21,-12,-10;
/M: SY='I';  M= -6,-27,-17,-32,-25,  1,-32,-25, 29,-25, 18, 13,-23,-25,-22,-23,-17, -7, 26,-21, -3,-25;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_02 which contains 571'282 sequence entries.

Total number of hits	18 in 18 different sequences
Number of true positive hits	18 in 18 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	V_Lesaux
Taxonomic range [info]	Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	1
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	PTS EIIA type-4
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

18 sequences

DGAR_SALT1  (D0ZLR9), DHAM1_LISIN (Q927E4), DHAM2_LISIN (Q92ET9),

DHAM_ECOLI  (P37349), DHAM_KLEM8  (A0A0H3H456), DHAM_LACLA  (Q9CIV6), 
DHAM_PANAM  (D4GL26), DHAM_PROSM  (P0DN88), LEVR_BACSU  (P23914), 
PTFA_BACSU  (P26379), PTNAB_ECO57 (P69799), PTNAB_ECOL6 (P69798), 
PTNAB_ECOLI (P69797), PTNAB_SHIFL (P69800), PTNAB_STRP6 (Q5XAF5), 
PTRA_KLEPN  (P37080), PTRA_LACCA  (Q9RGG5), YADI_ECOLI  (P36881)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

7 PDB

1PDO; 1VRC; 1VSQ; 2JZN; 2JZO; 3CR3; 3CT6