Entry: PS51113

General information about the entry

Entry name [info] ZF_BTK
Accession [info] PS51113
Entry type [info] MATRIX
Date [info] APR-2005 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAY-2015 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51113
Associated ProRule [info] PRU00432

Name and characterization of the entry

Description [info] Zinc finger Btk-type profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4293971; R2=0.0121034; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=941.38397; R2=16.69449; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=543; N_SCORE=9.0; H_SCORE=8621; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=337; N_SCORE=6.5; H_SCORE=6551; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='T'; M= -2,  0,-21, -3,  0,-22,-13,-10,-17, -6,-23,-15,  4, 12,  3, -9, 14, 15,-17,-32,-18,  0;
/M: SY='N'; M=-11, 13,-28,  9, -4,-23, -1,  7,-18, -9,-23,-14, 20, -4, -5,-10, -1, -9,-23,-32,-15, -6;
/M: SY='R'; M=-12,-18,-26,-19, -9, -8,-26,-14, -1,  4, 10,  5,-14,-22, -5, 13,-19,-10, -2,-20, -5, -9;
/M: SY='L'; M= -6,-24,-17,-26,-19,  2,-24,-15, 16,-21, 27, 23,-23,-25,-14,-16,-16, -5, 13,-24, -4,-16;
/M: SY='Q'; M=  1,-12,-23,-14, -9,-15, -7, -8, -5,-10,-11, -3, -8,-18,  4,-11,  0, -5, -5,-17, -3, -3;
/M: SY='K'; M= -4, -9,-24,-11, -4, -5,-17, -8,-19, 14,-18, -9, -5,-16, -2, 13, -3, -4,-13,-13,  3, -4;
/M: SY='Y'; M=-19,-21,-12,-24,-22, 30,-30, 10, -3,-15, -1, -2,-20,-31,-16,-13,-19,-10, -9, 19, 62,-22;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='P'; M= -8,-18,-36, -9,  0,-29,-18,-19,-20,-10,-30,-20,-16, 78, -9,-19, -4, -6,-28,-31,-29, -9;
/M: SY='G'; M=  0, -8, -5, -9,-13,-26, 30,-18,-33,-11,-29,-19,  0,-19,-13,-13,  7, -8,-21,-29,-25,-13;
/M: SY='F'; M=  3,-25,-15,-31,-24, 26,-23,-23,  8,-23, 11,  3,-22,-25,-28,-20,-12, -5, 15,-12,  4,-24;
/M: SY='W'; M=-20,-32,-32,-37,-29, 48,-26,-19, -7,-24, -2, -7,-27,-30,-29,-19,-27,-17,-12, 65, 36,-25;
/M: SY='V'; M= -6,-18,-19,-20,-15, -8,-24,-17,  5, -7,  1,  1,-12,-21,-11,  4, -4,  3, 11,-26, -9,-15;
/M: SY='D'; M= -6, 21,-24, 25,  2,-30, 16, -7,-33, -8,-30,-24, 17,-14, -6,-11, 11, -5,-25,-34,-23, -2;
/M: SY='G'; M=  1,  0,-28,  2, -9,-30, 39,-16,-35, -7,-28,-19,  2,-16,-12,-12,  0,-15,-25,-23,-25,-11;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-25, -3,  3,-15,-16, -5,-23, 20,-23,-10,  6,-15,  8, 18, -2, -5,-19,-21, -8,  6;
/M: SY='W'; M=-20,-32,-39,-33,-26, 26,-25,-11,-10,-18, -9,-10,-30,-30,-19,-16,-30,-20,-19, 89, 48,-21;
/M: SY='T'; M= -1,-11,-16,-13, -7,-10,-16,-13, -4,-15,  4, -1, -7,-18, -2,-12,  7,  9, -3,-29,-10, -4;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Q'; M= -9, -6,-26, -6,  2,-24, -8, 10,-22,  4,-16, -5, -1,-16, 14,  8, -2, -9,-20,-24, -8,  7;
/M: SY='Q'; M=-10, -1,-30,  0, 18,-35, -8,  4,-25,  9,-21, -6,  0,-11, 39, 12, -1,-11,-29,-21,-14, 27;
/M: SY='T'; M=  5, -5,-14,-10, -6,-14,-14,-16,-11, -4,-10, -9, -3,-13, -6, -7, 13, 21, -4,-29,-12, -6;
/M: SY='E'; M=  1,  5, -7,  8, 17,-27, -3,-10,-29, -5,-22,-20,  0,-11,  0,-11,  5, -6,-21,-32,-22,  8;
/M: SY='K'; M=-12,  0,-30,  3, 20,-28,-20, -5,-30, 35,-25,-12,  0,-10, 12, 32, -8,-10,-22,-22,-12, 15;
/M: SY='N'; M=  2, 11,-15, -1, -6,-14, -9, -7,-12, -8,-13,-12, 19,-16, -6, -9, 12, 15,-11,-33,-15, -6;
/M: SY='A'; M= 25, -6,-13,-14,-10,-19,  5,-19,-16,-11,-15,-13, -4,-11,-10,-16, 15, 12, -6,-25,-19,-10;
/M: SY='P'; M= -5,-19,-27,-19, -7, -7,-20,-13, -6,-12, -4,  2,-17, 19, -4,-14,-11, -9,-12,-20,-10, -7;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='K'; M= -9,  7,-25, 10, 13,-28,-16, -5,-27, 16,-24,-14,  4,-10, 13, 14,  3,  1,-20,-27,-14, 12;
/M: SY='K'; M= -3,-13,-27,-14, -4,-19,-21,-15, -9, 12,-10, -4,-10, -2, -3,  8,-11, -9, -8,-21,-11, -5;
/M: SY='T'; M= -1,-18, -2,-24,-20, -2,-22,-19, -4,-18, -1, -5,-18,-24,-17,-18, -7,  6,  1, -1,  2,-19;
/M: SY='E'; M= -4,  1,-23, -2, 10,-18,-16,  5,-18,  0,-10, -9,  3,-14,  3,  4, -1, -1,-16,-27,-10,  5;
/M: SY='S'; M=  8,  6,-17,  3, -2,-19, -7,  4,-17,-10,-15,-12,  8,-15, -3,-11, 10,  0,-13,-32,-13, -3;
/M: SY='R'; M= -8,-16,-29,-18,-12, -2, -9,-10,-21,  4,-16,-10,-11,-21, -8, 12,-13,-13,-17, 11,  7,-11;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2015_07 which contains 548'872 sequence entries.


Total number of hits 23 in 23 different sequences
Number of true positive hits 23 in 23 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] PS_Langendijk_Genevaux
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] ZN_FING
Feature description [info] Btk-type
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
23 sequences

BMX_HUMAN   (P51813), BMX_MOUSE   (P97504), BTKL_DROME  (P08630), 
BTK_CHICK   (Q8JH64), BTK_HUMAN   (Q06187), BTK_MOUSE   (P35991), 
GAP1_DROME  (P48423), ITK_HUMAN   (Q08881), ITK_MOUSE   (Q03526), 
RAS4B_HUMAN (C9J798), RASA2_HUMAN (Q15283), RASA2_MOUSE (P58069), 
RASA2_RAT   (Q63713), RASA3_BOVIN (Q28013), RASA3_HUMAN (Q14644), 
RASA3_MOUSE (Q60790), RASA3_RAT   (Q9QYJ2), RASL1_HUMAN (O95294), 
RASL1_MOUSE (Q9Z268), RASL2_HUMAN (O43374), RASL2_MOUSE (Q6PFQ7), 
TEC_HUMAN   (P42680), TEC_MOUSE   (P24604)
» More

PDB
[Detailed view]
7 PDB

1B55; 1BTK; 1BWN; 2E6I; 2LUL; 2YS2; 2Z0P

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission