Entry: PS51151

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] NAC_AB
Accession [info] PS51151
Entry type [info] MATRIX
Date [info] OCT-2005 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); FEB-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51151
Associated ProRule [info] PRU00507

Name and characterization of the entry

Description [info] NAC A/B domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=66;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=61;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6092148; R2=0.0166524; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2348.27004; R2=19.94093; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=414; N_SCORE=8.5; H_SCORE=9639; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=294; N_SCORE=6.5; H_SCORE=8423; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='P'; M=  2, -7,-24, -6, -3,-23, -5,-15,-18, -6,-22,-14, -5, 17, -7,-12,  6,  2,-15,-29,-21, -6;
/M: SY='R'; M= -4, -9,-23,-11, -5,-18,-13,-11,-13,  9,-14, -4, -5,-14, -2, 11, -4, -3, -6,-24,-12, -5;
/M: SY='D'; M= -9, 21,-26, 25, 12,-31,  0,  0,-30,  1,-26,-18, 14,-12,  6, -5,  4, -8,-26,-32,-18,  9;
/M: SY='E'; M= -9,  4,-27, 10, 19,-22,-18, -7,-18, -2,-15, -9, -3,  6,  2, -9, -3, -6,-17,-30,-17, 10;
/M: SY='K'; M=-11, -2,-28, -2,  7,-26,-19, -8,-28, 38,-26,-11,  0,-10,  8, 34, -6, -6,-19,-22,-11,  7;
/M: SY='K'; M=-11,  3,-29,  4,  9,-30,-18, -1,-29, 34,-26,-10,  3,-12, 15, 27, -7,-10,-22,-22,-10, 11;
/M: SY='L'; M=  1,-21,-18,-26,-18,  0,-22,-16, 14,-21, 23, 17,-20,-23,-14,-18,-15, -5, 10,-21, -3,-17;
/M: SY='Q'; M=-11, -2,-27, -4, 11,-25,-19,  8,-18, 10,-15,  0,  1,-13, 23, 17, -4, -8,-20,-24, -9, 15;
/M: SY='K'; M=  0, -3,-24, -4,  7,-23,-14, -7,-21, 18,-19,-10, -1,-13,  7, 15, -3, -7,-16,-22,-12,  6;
/M: SY='M'; M=  8,-14,-18,-19, -9,-12,-18,-13,  3,-10,  4,  9,-14,-16, -1,-12, -5,  0,  4,-22,-10, -6;
/M: SY='L'; M= -9,-26,-21,-30,-21,  5,-27,-15, 23,-23, 35, 32,-25,-25,-13,-17,-24, -8, 13,-21, -1,-18;
/M: SY='K'; M= -3, -5,-26, -6,  2,-26,  0, -7,-25, 15,-23, -8, -2,-14,  4, 10, -3,-10,-18,-22,-14,  2;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='K'; M= -7,  1,-24,  0,  7,-24,-13, -5,-24, 26,-22, -9,  2,-10, 10, 22, -4, -5,-17,-19,-10,  8; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-34,-25, 10,-32,-22, 29,-27, 32, 22,-25,-26,-20,-22,-24, -9, 18,-18,  2,-24;
/M: SY='G'; M= -8, 10,-29, 11,  1,-30, 15, -5,-33,  4,-29,-18, 11,-12, -3, -1, -1,-12,-27,-27,-20, -1;
/M: SY='L'; M=  1,-23,-13,-25,-19, -4,-20,-19, 11,-19, 15, 13,-22,-21,-16,-18,-12, -4, 14,-25, -9,-18;
/M: SY='E'; M= -6,  2,-26,  3, 21,-27,-18, -5,-23, 18,-20, -9, -1, -8, 16, 10, -1, -4,-19,-25,-14, 18;
/M: SY='E'; M= -9,  5,-29,  9, 18,-27,-17, -1,-24,  4,-23,-16,  2, 13,  8, -2, -1, -5,-25,-28,-16, 12;
/M: SY='I'; M= -9,-28,-22,-33,-24,  8,-32,-23, 30,-25, 24, 19,-24,-25,-21,-22,-20, -8, 23,-20,  0,-24;
/M: SY='E'; M= -7,  5,-28, 12, 13,-29, -5,-10,-28,  0,-27,-20,  1, 13,  0, -7,  3, -4,-25,-31,-22,  5;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='G'; M=  0, 11,-21, 11, -3,-24, 22, -8,-26, -8,-22,-17, 12,-13, -8,-11,  3, -9,-21,-23,-20, -5; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='V'; M=  5,-26,-18,-32,-26, -2,-28,-28, 29,-22, 10, 10,-23,-23,-23,-24,-10, -4, 33,-24, -7,-26;
/M: SY='E'; M= -3,  4,-23,  7, 16,-22,-15, -3,-19, -2,-16,-13, -1,-10,  4, -7,  3,  0,-14,-28,-14, 10;
/M: SY='E'; M=-13,  3,-30,  9, 37,-25,-20,  0,-29, 19,-20,-16, -1, -7, 15, 19, -4,-10,-26,-24,-12, 25;
/M: SY='V'; M=  7,-26, -8,-29,-26, -2,-26,-28, 21,-20,  7,  6,-25,-26,-26,-21, -8, -2, 35,-27,-10,-26;
/M: SY='T'; M= -2, -2,-14, -9, -6,-13,-19,-14, -1, -9, -9, -6,  3,-17, -8,-10,  3, 10,  2,-30,-13, -8;
/M: SY='I'; M=-11,-28,-25,-37,-27, 13,-33,-21, 32,-26, 22, 25,-21,-23,-19,-23,-21,-10, 20,-16,  4,-25;
/M: SY='R'; M=-13,-12,-26,-14, -3,  1,-24, -7,-13, 12,-11, -3, -8,-18, -5, 14,-12, -9, -9,-14,  3, -4;
/M: SY='R'; M=-10,-11,-25,-12, -4,-14,-18,-11,-13, 12, -5, -1, -8,-18,  1, 15,-11, -5,-10,-20, -8, -2;
/M: SY='K'; M=  0,  1,-25,  3, 10,-27,-10,-10,-24, 14,-23,-14, -1, -2,  3,  4, -1, -5,-18,-26,-17,  6;
/M: SY='D'; M=-14, 28,-28, 37, 12,-33, -4, -3,-35,  6,-29,-23, 15,-12,  2,  2,  1, -8,-27,-33,-19,  7;
/I:         I=-5; MD=-25;
/M: SY='G'; M= -3,  4,-19,  4, -6,-21, 28, -8,-25, -7,-21,-14,  8,-12, -7, -9,  3, -9,-20,-19,-18, -6; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='K'; M= -4, -3,-22, -6,  2,-18,-16, -7,-13,  5,-13, -6,  0,-13, -1,  0,  2,  4, -9,-27,-11,  0;
/M: SY='V'; M= -7,-14,-17,-14, -5, -8,-26,-16,  6,-11,  4,  1,-14,-20,-11,-10, -9, -4,  9,-26, -8, -9;
/M: SY='L'; M=-12,-27,-22,-31,-24, 19,-31,-16, 20,-25, 25, 15,-24,-27,-21,-20,-21, -7, 12,-10, 14,-23;
/M: SY='V'; M= -4,-13,-20,-17,-14, -8,-23,  2,  6,-13, -4,  2, -8,-22,-10,-10, -6, -4, 10,-25, -1,-14;
/M: SY='F'; M=-13,-30,-23,-38,-30, 37,-33,-25, 21,-28, 13,  9,-22,-26,-30,-23,-20, -9, 16, -2, 13,-29;
/M: SY='E'; M= -2,  9,-22,  8, 10,-24,-13, -7,-21,  8,-22,-15,  8,-10,  2,  2,  4, -1,-15,-30,-17,  5;
/M: SY='N'; M= -5, 14,-22, 10,  9,-25, -9,  0,-23,  8,-25,-14, 20,-13,  9,  7,  8, -1,-22,-32,-16,  9;
/M: SY='P'; M= -2,-20,-34,-13, -3,-27,-18,-21,-15,-11,-25,-17,-20, 69,-11,-20, -8, -8,-21,-29,-27,-11;
/M: SY='E'; M= -3,  4,-23,  5, 12,-24,-15, -8,-20,  9,-19,-12,  1,-10,  3,  1,  2,  1,-13,-28,-14,  7;
/M: SY='V'; M=  1,-29,-12,-30,-29,  0,-29,-29, 29,-21, 12, 10,-29,-29,-28,-21,-11, -1, 45,-28, -9,-29;
/M: SY='Y'; M= -9, -7,-25,-10, -4, -6,-22,  6, -7, -6, -9, -1, -6,-18, 10, -6, -4, -1,-12, -9, 17,  1;
/M: SY='R'; M= -1,-14,-13,-18,-12,-13,-13,-17, -8,  0, -8, -3,-11,-20,-10,  1, -7, -5,  0,-23,-12,-12;
/I:         I=-5; MD=-25;
/M: SY='M'; M=  2,-14,-15,-20,-15, -6,-16,-14,  8,-15,  1, 11,-10,-17, -9,-15,  4,  6,  9,-26, -8,-13; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-25;
/M: SY='P'; M= -6, -7,-25, -3,  3,-20,-18,-13,-11, -1,-14, -9, -9, 13, -4, -6, -4, -4,-10,-27,-16, -2; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='A'; M= 13, -6,-20,-11, -6,-23,  9, -8,-19, -9,-17, -8, -2,-12, -2,-11,  6, -3,-14,-24,-17, -5;
/M: SY='S'; M=  1,  3,-15, -1,  0,-24, -3, -8,-20, -5,-23,-13,  8, -9,  5, -7, 14,  7,-17,-31,-18,  2;
/M: SY='N'; M= -8, 17,-26, 13,  7,-27, 10,  0,-29,  2,-28,-19, 22,-15,  1, -2,  3, -9,-28,-31,-20,  4;
/M: SY='T'; M= -1, -5,-12, -9, -4,-15,-18,-12,-11, -7,-10, -7, -3,-13,  0, -7, 11, 21, -4,-29,-11, -2;
/M: SY='Y'; M=-16,-20,-26,-22,-16, 27,-28, -2, -1,-10,  3,  0,-17,-22,-15,-10,-17, -7, -6,  7, 39,-17;
/M: SY='V'; M= -1,-22,-19,-26,-19, -3,-26,-21, 18,-18,  7,  8,-19,-19,-13,-18, -9, -1, 20,-23, -5,-17;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='V'; M= -5,-30,-18,-34,-29,  5,-33,-28, 34,-25, 17, 14,-26,-27,-26,-23,-16, -5, 37,-24, -4,-29;
/M: SY='F'; M= -6,-15,-18,-21,-17, 17,-22,-11, -1,-18,  0, -3,-10,-19,-18,-15, -2,  7,  1,-13,  9,-17;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-18,-30, 66,-19,-39,-19,-30,-19,  0,-20,-17,-19,  0,-20,-30,-20,-29,-17;
/M: SY='D'; M= -9, 13,-27, 17, 16,-27,-15, -5,-23,  7,-22,-16,  7, -5,  4, -2, -1, -5,-20,-29,-15, 10;
/M: SY='A'; M=  8,-12,-22,-15, -7,-11,-13,-11, -8,-11,-10, -6,-10,  6, -8,-15, -3, -5, -8,-21,-10, -9;
/M: SY='K'; M= -6,  0,-21,  1, 11,-26,-16, -9,-21, 15,-20,-10, -2,-12,  9,  8, -2, -3,-14,-26,-14,  9;
/M: SY='E'; M= -6, -4,-22, -2, 11,-16,-20, -8,-10, -3,-10, -9, -5, -9, -1, -4, -1, -1, -6,-28,-13,  5;
/M: SY='E'; M=-10,  4,-29,  9, 23,-27,-19, -6,-26, 21,-23,-15,  1, -5,  9, 15, -5, -9,-21,-26,-15, 15;
/M: SY='D'; M= -8, 12,-25, 19, 14,-26,-15, -7,-24,  1,-22,-18,  4,  0,  2, -6,  3, -1,-19,-31,-16,  7;
/M: SY='M'; M= -3,-17,-22,-22,-14, -8,-23,-16,  9, -9,  8, 13,-14,-13, -9,-10,-12, -4,  5,-23, -7,-13;
/M: SY='S'; M=  4,  2,-18,  0,  4,-20, -9,-10,-16, -4,-16,-13,  3,-12,  0, -6, 11,  7,-11,-30,-16,  2;
/M: SY='E'; M=  1,  2,-22,  3, 17,-22,-12, -3,-19, -3,-15,-12,  0, -9,  8, -7,  5, -1,-17,-27,-14, 12;
/M: SY='E'; M= -5, -9,-24,-10,  2,-16,-15,-12, -7, -5, -3, -2, -8,-10,  0, -6, -5, -4, -9,-25,-12,  0;
/M: SY='I'; M=  0,-15,-23,-16, -8,-12,-22,-17,  3,-10,  0,  0,-13, -6, -8,-13, -6, -2,  2,-24, -9, -9;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_03 which contains 542'782 sequence entries.


Total number of hits 130 in 130 different sequences
Number of true positive hits 130 in 130 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] N_Hulo
Taxonomic range [info] Archaea, Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] NAC-A/B
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
130 sequences

BT3L4_BOVIN (Q2KIY7), BT3L4_CHICK (Q5ZJG3), BT3L4_DANRE (Q6PC91), 
BT3L4_HUMAN (Q96K17), BT3L4_MOUSE (Q9CQH7), BT3L4_PONAB (Q5RC59), 
BT3L4_XENLA (Q4KLF5), BT3L4_XENTR (Q5M8V0), BTF3_CAEEL  (Q18885), 
BTF3_HUMAN  (P20290), BTF3_MOUSE  (Q64152), NACA1_ARATH (Q9LHG9), 
NACA2_ARATH (Q94JX9), NACA2_HUMAN (Q9H009), NACA3_ARATH (Q6ICZ8), 
NACA4_ARATH (Q9SZY1), NACA5_ARATH (Q8LGC6), NACAD_HUMAN (O15069), 
NACAD_MOUSE (Q5SWP3), NACAM_HUMAN (E9PAV3), NACAM_MOUSE (P70670), 
NACA_AJECN  (A6R641), NACA_ASHGO  (Q756T5), NACA_ASPCL  (A1CMF8), 
NACA_ASPFU  (Q4WD81), NACA_ASPNC  (A2R4V1), NACA_ASPOR  (Q2U955), 
NACA_ASPTN  (P0C2C7), NACA_BABDI  (Q45FF9), NACA_BOTFB  (A6SB28), 
NACA_BOVIN  (Q5E9A1), NACA_CAEBR  (Q61UX1), NACA_CAEEL  (Q86S66), 
NACA_CANAL  (Q5ANP2), NACA_CANGA  (Q6FJD5), NACA_CHAGB  (Q2H4Z2), 
NACA_CHILA  (Q6QN10), NACA_COCIM  (Q1DHR3), NACA_CRYNB  (P0CP07), 
NACA_CRYNJ  (P0CP06), NACA_DANRE  (Q8JIU7), NACA_DEBHA  (Q6BSN9), 
NACA_DICDI  (Q54U07), NACA_DROME  (Q94518), NACA_EMENI  (Q5AYK0), 
NACA_ENCCU  (Q8SWB5), NACA_GIBZE  (Q4I2J8), NACA_HUMAN  (Q13765), 
NACA_KLULA  (Q6CWG6), NACA_LODEL  (A5DXK7), NACA_MAGO7  (A4RC89), 
NACA_MOUSE  (Q60817), NACA_NEOFI  (A1DLM0), NACA_NEUCR  (Q7SI17), 
NACA_ORENI  (Q8AWF2), NACA_PHANO  (Q0UKB5), NACA_PICGU  (A5DGN9), 
NACA_PICST  (A3GHD3), NACA_PINTA  (Q9M612), NACA_PONAB  (Q5R9I9), 
NACA_SCHPO  (P87147), NACA_SCLS1  (A7EIZ1), NACA_USTMA  (Q4P341), 
NACA_VANPO  (A7TG43), NACA_XENLA  (Q6IP73), NACA_XENTR  (Q68F90), 
NACA_YARLI  (Q6CDH0), NACA_YEAS7  (A6ZT99), NACA_YEAST  (P38879), 
NACB1_YEAS7 (A6ZWL1), NACB1_YEAST (Q02642), NACB2_YEAS7 (A6ZYK4), 
NACB2_YEAST (P40314), NACB_AJECN  (A6R5Z3), NACB_ASHGO  (Q751F1), 
NACB_ASPCL  (A1CMP1), NACB_ASPFU  (Q4WCX4), NACB_ASPNC  (A2R091), 
NACB_ASPOR  (Q2U6N1), NACB_ASPTN  (Q0CGL5), NACB_BOTFB  (A6S6B0), 
NACB_CANAL  (Q59TU0), NACB_CANGA  (Q6FKD1), NACB_CHAGB  (Q2H4X9), 
NACB_COCIM  (Q1DI23), NACB_CRYNB  (P0CP09), NACB_CRYNJ  (P0CP08), 
NACB_DEBHA  (Q6BLV1), NACB_DICDI  (Q54TR8), NACB_EMENI  (Q5ASI4), 
NACB_GIBZE  (Q4I283), NACB_KLULA  (Q6CR46), NACB_LODEL  (A5DT59), 
NACB_MAGO7  (A4RC23), NACB_NEOFI  (A1DL98), NACB_NEUCR  (Q7SDU4), 
NACB_PHANO  (Q0ULD0), NACB_PICGU  (A5DF06), NACB_PICST  (A3GHR2), 
NACB_SCHPO  (Q92371), NACB_SCLS1  (A7F9B8), NACB_USTMA  (Q4P9Y9), 
NACB_YARLI  (Q6C2F3), NACP1_HUMAN (Q9BZK3), NAC_AERPE   (Q9YFQ1), 
NAC_ARCFU   (O30024), NAC_HALMA   (Q5V5C9), NAC_HALSA   (Q9HS36), 
NAC_META3   (A6UVF4), NAC_METAC   (Q8TSA1), NAC_METJA   (Q57728), 
NAC_METKA   (Q8TWS7), NAC_METM5   (A4FZP7), NAC_METM6   (A9A807), 
NAC_METM7   (A6VIT0), NAC_METMA   (Q8PVF0), NAC_METMP   (Q6M0I0), 
NAC_METTH   (O26279), NAC_METTM   (P0C0K9), NAC_METVS   (A6URS6), 
NAC_NATPD   (Q3IUB3), NAC_PICTO   (Q6L1N3), NAC_PYRAB   (Q9V0Z2), 
NAC_PYRFU   (Q8U0P1), NAC_PYRHO   (O59193), NAC_SULAC   (Q4J6D8), 
NAC_SULTO   (Q96YI2), NAC_THEAC   (Q9HI94), NAC_THEKO   (Q5JGB7), 
NAC_THEVO   (Q97CI3)
» More

PDB
[Detailed view]
4 PDB

1TR8; 3LKX; 3MCB; 3MCE

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission