Entry: PS51154

General information about the entry
Entry name MACRO
Accession number PS51154
Entry type MATRIX
Date OCT-2005 (CREATED); OCT-2005 (DATA UPDATE); MAR-2013 (INFO UPDATE).
PROSITE Documentation PDOC51154
Associated ProRule PRU00490
Name and characterization of the entry
DescriptionMacro domain profile.
Matrix / Profile 
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=183;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=178;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6459429; R2=0.0154919; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=378; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=249; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M:         M= -4, -6,-21, -8, -4,-13,-17, -9,-10, -3,-12, -7, -4,-11, -4, -4, -2, -1, -7,-21, -9, -5;
/M:         M= -4, -5,-20, -7, -1,-14,-12,-11,-13, -2,-13, -8, -3,-11, -4, -3, -1, -3,-10,-24,-10, -3;
/M:         M= -5, -8,-23, -9, -5,-15,-15,-10, -8, -3, -9, -3, -6,-10, -3, -4, -3, -2, -6,-25,-10, -5;
/M:         M= -3,-14,-14,-17,-14, -1,-15,-13, -6,-12, -5, -3,-11,-16,-13,-12, -5, -3, -3,-17,  0,-14;
/M:         M= -8, -5,-25, -7, -1,-11,-17, -7,-14, -1,-13, -7, -4,-13, -3,  0, -3, -1,-12,-11, -4, -3;
/M:         M= -9, -7,-19, -8, -4,-12,-16, -1,-11, -7, -9, -4, -4,-14, -4, -7, -6, -5,-10,-23, -6, -5;
/M:         M= -7, -5,-22, -6, -6,-10,-15, -6, -9, -8, -8, -3, -3,-14, -4, -8, -3, -3, -7,-22, -5, -6;
/M:         M= -3, -4,-20, -7, -3,-12,-14, -7,-13, -3,-11, -7,  0,-11, -3, -5, -1, -1,-12,-25,-10, -4;
/M:         M= -5, -8,-22,-10, -4,-13,-15, -7, -7, -7, -9, -4, -5, -8, -3, -8, -3, -4, -8,-23, -6, -5;
/M:         M= -5, -9,-24,-10, -6,-13,-11,-13, -7, -8, -6, -4, -6,-10, -7, -7, -5, -4, -7,-23,-10, -8;
/M: SY='N'; M= -3, -1,-22, -5, -6,-16,  1, -6,-17, -7,-15, -7,  4,-14, -5, -7,  0, -4,-16,-23,-13, -6;
/M:         M= -5, -7,-20, -8, -6,-13,-11,-11, -8, -7, -7, -2, -4,-13, -6, -8, -2, -1, -6,-26,-11, -7;
/M: SY='R'; M= -7, -2,-21, -7, -1,-19,-15, -8,-12,  5,-14, -4,  2,-13,  1,  6, -2, -1,-11,-26,-12, -1;
/M: SY='I'; M= -7,-28,-21,-33,-26,  9,-32,-24, 29,-26, 22, 15,-24,-25,-22,-23,-18, -6, 24,-19,  1,-26;
/M: SY='S'; M= -4, -5,-16, -7, -1,-16,-17, -4,-14,  0,-15, -8, -3,-16,  0,  1,  3,  2, -7,-27, -8, -2;
/M: SY='V'; M= -7,-21,-18,-23,-15,  4,-27,-17, 13,-19, 12,  6,-19,-23,-16,-16,-11, -2, 14,-19,  2,-17;
/M: SY='V'; M= -7,-22,-19,-26,-20,  2,-26,-15,  8,-16,  1,  3,-18,-22,-16,-15,-12, -4,  9, -3,  4,-19;
/M: SY='R'; M= -7, -2,-23, -3,  3,-21,-16, -4,-18, 10,-18, -7,  1,-14,  9, 11,  0, -3,-14,-24,-10,  5;
/M: SY='G'; M=  1, -8,-26, -8,-16,-28, 54,-18,-35,-17,-26,-18,  0,-19,-17,-17,  0,-16,-26,-22,-27,-17;
/M: SY='D'; M=-17, 41,-27, 54, 15,-36, -8,  0,-36,  0,-29,-27, 21, -9,  1, -8,  1, -9,-29,-38,-19,  8;
/M: SY='I'; M= -9,-29,-25,-35,-25,  5,-35,-25, 34,-27, 26, 18,-23,-23,-20,-24,-22, -9, 21,-19,  1,-25;
/M: SY='T'; M= -3, -9,-15,-14, -8, -2,-21,-17, -6,-11, -1, -4, -8,-15,-11,-10,  1, 14, -2,-22, -6, -9;
/M: SY='E'; M= -5,  6,-23,  6,  8,-23,-15, -1,-22,  8,-20,-12,  4,-11,  6,  4,  3,  0,-17,-27,-11,  6;
/I:         I=-3; MD=-14;
/M: SY='L'; M= -2,-18,-21,-18, -8, -7,-22,-11,  2,-15,  7,  3,-16,-11, -7,-14,-11, -7, -1,-19, -6, -8; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='E'; M= -6,  1,-25,  2,  8,-24, -6, -7,-24,  6,-19,-13,  1, -8,  3,  3, -2, -6,-20,-24,-15,  5;
/M: SY='V'; M=  4,-13, -9,-17,-14, -8,-17,-18, -1,-14, -6, -4,-11,-15,-15,-16,  0,  4,  7,-27,-12,-15;
/M: SY='D'; M=-11, 22,-25, 29, 13,-27,-13,  1,-27,  0,-22,-18,  9,-10,  2, -6,  0, -6,-21,-31,-13,  7;
/M: SY='A'; M= 19,-17,-10,-23,-18, -9,-14,-21,  4,-15, -2,  0,-16,-18,-16,-19,  0,  0, 13,-21,-12,-17;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-24,-36,-28,  5,-35,-26, 37,-27, 23, 19,-24,-24,-21,-25,-21, -9, 27,-18,  0,-27;
/M: SY='V'; M=  6,-26,-11,-28,-25, -4,-25,-28, 22,-19,  7,  7,-25,-26,-25,-20, -7,  0, 37,-28,-11,-26;
/M: SY='N'; M=-11, 24,-22, 12, -1,-19, -7, 27,-19, -4,-24,-13, 40,-20,  1, -2,  5, -4,-25,-36, -9, -2;
/M: SY='A'; M= 22,-10,-10,-15, -9,-20, -1,-19,-16,-12,-18,-14, -8,  4,-11,-18, 10,  3, -9,-27,-21,-11;
/M: SY='A'; M= 20,-12,  2,-19,-14,-15,-11,-21, -5,-15, -8, -7,-11,-17,-14,-19,  4,  2,  4,-26,-17,-15;
/M: SY='N'; M= -7, 27,-21, 13, -1,-20,  0,  4,-20, -2,-27,-18, 41,-16, -1, -2, 10,  1,-25,-36,-18, -1;
/M: SY='S'; M= -1, -1, -6, -3,  3,-22,-11,-11,-21, -3,-21,-15,  1, -7, -2, -5,  7,  1,-16,-31,-19,  0;
/M: SY='N'; M= -7,  6,-21,  4, -1,-14,-13, -2,-17, -3,-16,-11,  8,-16, -1, -1,  3,  1,-13,-26, -8, -2;
/M: SY='L'; M= -8,-19,-19,-21,-18,  2, -6,-12, -2,-22, 14,  8,-16,-25,-16,-17,-16,-11, -4,-18, -4,-17;
/M:         M= -3, -9,-21,-12, -6, -9,-18, -8, -7, -6, -4, -2, -6,-17, -4, -4, -3,  0, -5,-21, -5, -6;
/M: SY='M'; M= -9,-15,-27,-17,-13, -9, -2,  0,-10,-14, -3,  6,-11,-14, -9,-12,-14,-14,-13, -8, -4,-12;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='G'; M= -3, -6,-26, -5,-11,-26, 36,-11,-32,-10,-25,-15,  0,-17,-12,-11, -1,-15,-23,-23,-21,-12;
/M: SY='G'; M=  3, -5,-25, -6,-10,-26, 35,-15,-31, -9,-26,-17,  1,-16,-11,-11,  4,-11,-23,-23,-23,-11;
/M: SY='G'; M=  0, -7,-22, -7,-14,-29, 49,-18,-36,-16,-28,-19,  0,-16,-15,-17,  0,-15,-27,-23,-28,-15;
/M: SY='V'; M= -5,-28,-17,-32,-27,  4,-32,-26, 30,-25, 18, 13,-25,-26,-24,-23,-15, -4, 31,-24, -4,-27;
/M: SY='A'; M= 17,  7, -8,  5, -3,-23, -3,-13,-21, -8,-20,-17,  4,-13, -7,-14, 10, -1,-12,-30,-20, -5;
/M: SY='G'; M=  1, -5,-23, -7, -8,-18,  5,-12,-18, -5,-12, -9, -2,-18, -7, -6, -3, -7,-14,-20,-12, -8;
/M: SY='A'; M= 24, -9,-14,-15, -6,-19, -8,-15, -9, -7,-10, -6, -7,-12, -2,-12,  6, -1, -3,-23,-16, -4;
/M: SY='I'; M=-12,-29,-24,-36,-27, 18,-34,-23, 30,-29, 24, 15,-22,-25,-24,-25,-21, -9, 18,-14,  6,-27;
/M: SY='H'; M= -7, -7,-24, -8, -3, -9,-19, 14,-16, -2, -9, -4, -4,-17, -2,  1, -6, -7,-12,-22,  1, -4;
/M: SY='R'; M= -7, -1,-22, -2,  6,-24,-16, -4,-23, 16,-19,-10,  0,-14,  8, 19, -3, -5,-16,-25,-13,  6;
/M: SY='A'; M=  8,-11,-19,-15, -7,-11,-14,-11,-13,  5,-11, -6, -8,-16, -4,  5, -3, -4, -6,-17, -5, -7;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M: SY='A'; M= 21,-11,-13,-17,-12,-15,  6,-16,-16,-12,-13,-11, -8,-13,-11,-17,  3, -5, -9,-18,-14,-12;
/M: SY='G'; M=  1, -9,-28,-10,-18,-27, 59,-18,-36,-19,-27,-18, -1,-19,-18,-19,  0,-18,-27,-20,-27,-18;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='P'; M= -3, -7,-19, -6, -1,-14,-11, -9,-13, -1,-16,-10, -7, 16, -2, -5, -3, -4,-13,-14,-10, -3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='E'; M= -2, -2,-14, -1,  5,-12, -8, -6, -8, -1, -7, -4, -3, -5,  3, -3, -2, -3, -7,-15, -8,  4; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M: SY='L'; M= -3,-10,-10,-11, -6,  1,-12, -7,  3, -8,  7,  4, -9,-12, -4, -7, -7, -3,  1, -9,  1, -5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='E'; M= -2, -1,-11,  0,  6,-14,-11, -4,-10,  3, -8, -5, -2, -8,  5,  1, -1, -3, -8,-16, -8,  6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='E'; M= -6,  0,-15,  3, 12,-14,-12, -3,-13,  4, -9, -7, -2, -7,  5,  3, -3, -3,-11,-15, -8,  8; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='E'; M= -3, -4,-14, -2,  8,-10,-11, -4,-10, -2, -7, -6, -5, -6,  1, -5, -1, -3,-10,-15, -6,  4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='C'; M= -5, -6, 12, -8, -7, -9,-14, -9,-10, -7, -7, -5, -6,-16, -8, -7, -4, -2, -4,-21, -9, -7; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='E'; M= -3,  2,-17,  3,  8,-15,-11, -3,-13,  4,-11, -8,  1, -8,  3,  5, -1, -4,-11,-19, -9,  5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='E'; M= -8,  1,-18,  2,  5,-12,-15, -2,-10,  0, -7, -5, -1,-10,  2,  1, -3, -2,-10,-17, -3,  3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='L'; M= -4,-10,-16,-11, -5, -5,-16, -6,  0, -4,  2,  1, -8,-14, -4, -2, -7, -4,  0,-14,  0, -5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='R'; M= -2, -8,-10,-10, -4, -8,-11, -7, -8,  0, -3, -1, -7,-13, -1,  1, -5, -4, -5,-14, -5, -3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='K'; M= -6,  1,-18,  0,  4,-15, -8, -4,-15,  8,-13, -7,  2, -8,  4,  7, -2, -4,-12,-14, -8,  3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='N'; M= -4,  0,-16, -1,  0,-13, -6, -2,-12,  0,-11, -6,  2, -9,  0,  0, -2, -5,-10,-17, -7, -1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='G'; M= -2, -1,-20, -2, -3,-19,  7, -7,-19,  2,-17,-10,  3,-11, -2,  1,  0, -7,-14,-19,-14, -3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='E'; M= -3, -3,-20, -2,  2,-18, -3, -7,-18,  0,-17,-11, -1,  0, -1, -2,  0, -3,-15,-20,-12, -1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='L'; M= -5,-17,  5,-20,-14, -5,-22,-16,  4,-16,  7,  2,-16,-20,-14,-15,-12, -6,  6,-23, -8,-15; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='P'; M= -5, -4,-23, -2,  3,-21,-11, -9,-18,  2,-17,-11, -4,  8,  1,  1, -2, -2,-16,-23,-15,  1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='T'; M= -1,-14,-16,-17,-13, -6,-20,-17,  4,-13,  0, -1,-13, -7,-13,-13, -2,  9,  7,-23, -8,-14; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='G'; M=  0, -8,-27, -8,-16,-27, 57,-18,-35,-16,-27,-18,  1,-18,-16,-16,  1,-16,-27,-20,-27,-16; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='E'; M= -6,  9,-21, 10, 15,-23, -9, -4,-22,  3,-19,-13,  6, -9,  5, -3,  4, -1,-19,-28,-15, 10; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='A'; M= 14,-17, -4,-23,-18, -7,-14,-21,  3,-16, -2, -1,-15,-19,-17,-19, -2,  0, 11,-19,-10,-17; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='V'; M= -2,-17,-17,-21,-14, -3,-23,-16,  5, -8,  1,  2,-15,-20,-11, -7, -9, -4,  8,-16, -2,-14; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='V'; M= -3,-23,-19,-27,-21,  0,-27,-22, 20,-18, 12, 10,-20,-20,-19,-18,-13, -4, 22,-24, -6,-21; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='T'; M=  2, -9,-14,-16,-13, -7,-19,-19, -1,-14, -2, -4, -8,-15,-12,-14,  7, 24,  5,-24, -8,-13;
/M: SY='E'; M= -6,  1,-25,  4,  8,-25, -8, -8,-25,  3,-24,-16,  1,  4,  2,  0,  3, -2,-21,-29,-18,  4;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='G'; M=  8,-10,-19,-12,-13,-21, 20,-15,-21,-14,-17,-12, -5,-13,-12,-15,  2, -6,-14,-21,-19,-13; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='Y'; M= -9, -8,-21, -9,-11, -3,  3, -1,-18,-13,-14, -9, -4,-19,-11,-12, -5, -9,-16,-12,  4,-12; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='N'; M= -6,  9,-21,  6,  2,-20, -4, -3,-22,  3,-21,-14, 13,-13,  2,  3,  3, -4,-20,-27,-14,  1; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='L'; M= -7,-18,-15,-20,-14,  3,-22,-12,  8,-19, 24,  9,-16,-23,-13,-12,-17, -6,  4,-19, -2,-14; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='P'; M= -5, -3,-22,  0,  1,-22,-12,-10,-17, -3,-18,-13, -4, 19, -3, -7, -2, -4,-17,-25,-17, -3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-8;
/M: SY='A'; M= 10, -6,  5,-11, -9,-13, -5,-10,-13, -9,-12, -9, -4,-13, -8,-11,  4,  0, -7,-21,-12, -9; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
/M: SY='R'; M= -9, -4,-24, -3,  3,-21,-15, -2,-20, 19,-18, -7, -1, -8,  7, 21, -6, -7,-15,-20, -9,  4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-8;
/M: SY='Y'; M=-13,-15,-26,-17,-12, 12,-22,  8, -9, -7, -5, -3,-11,-22, -9, -5,-14,-10,-11,  7, 26,-11; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-8;
/M: SY='I'; M= -6,-28,-19,-32,-27,  0,-32,-28, 32,-24, 16, 13,-24,-23,-24,-23,-16, -6, 32,-23, -5,-27;
/M: SY='I'; M= -6,-25,-25,-32,-24,  7,-30,-21, 27,-24, 15, 11,-19,-23,-19,-23,-17, -8, 17,-13,  7,-24;
/M: SY='H'; M=-16,  2,-23, -1, -2,-16,-18, 66,-25, -8,-18, -3, 12,-20,  8, -1, -7,-15,-26,-27, 13,  0;
/M: SY='V'; M=  6,-17, -9,-23,-18, -3,-19,-21,  5,-18,  6,  2,-16,-21,-17,-18, -4,  7, 10,-22, -8,-17;
/M: SY='V'; M= -1,-23,-18,-24,-21, -3,-26,-21, 17,-19,  6,  6,-23,-14,-21,-19,-11, -4, 24,-25, -8,-23;
/M: SY='G'; M=  3, -9,-19,-13,-15,-18, 21,-19,-20,-16,-16,-12, -3,-17,-15,-17,  4,  2,-12,-22,-19,-15;
/M: SY='P'; M= -7,-15,-33,-10, -1,-26,-17,-15,-17, -4,-23,-12,-15, 51, -4,-12, -7, -7,-22,-28,-23, -6;
/M: SY='R'; M= -9, -4,-25, -5,  0,-17,-19, -6,-11,  4,-14, -6, -1,-13,  4,  5, -4, -5,-10,-21, -6,  0;
/M: SY='W'; M= -6,-14,-26,-17,-13, -3,-14, -5,-10, -9,-10, -4,-12,-19, -8, -9,-11, -9,-10,  9,  8,-11;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M:         M= -6, -7,-22, -9, -7,-12, -4, -8,-15, -5,-15, -9, -2,-10, -6, -1, -2, -5,-14,-12, -7, -7; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M:         M= -5, -2,-21, -2, -4,-16, -2, -8,-16, -4,-15,-10, -1,-11, -3, -3, -1, -4,-13,-17,-11, -4; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='G'; M= -4, -5,-20, -5, -4,-14,  4, -2,-16, -2,-13, -6, -3,-10, -3, -3, -3, -7,-13,-14, -6, -4; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='S'; M=  0, -3,-14, -5, -3,-10, -5, -5,-10, -4,-11, -7,  0, -5, -3, -5,  1, -2, -8,-13, -6, -3; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='E'; M= -7,  2,-21,  3,  6,-18,-10,  1,-19,  3,-17,-10,  1, -4,  4,  0, -2, -5,-17,-20, -7,  4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-12;
/M: SY='E'; M=  0,  2,-22,  1,  4,-22, -9, -4,-17, -1,-17,-10,  3, -9,  4, -3,  3, -2,-14,-26,-14,  3; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-12;
/M: SY='E'; M=  0,  0,-13,  0,  5,-22, -9, -9,-20, -1,-17,-12,  0,-10,  0, -3,  4, -1,-14,-28,-16,  2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-12;
/M: SY='E'; M= -5, -9,-25, -8,  2,-11,-20, -7,-10, -4,-10, -6, -9, -4, -2, -6, -6, -5,-11,-17, -1, -2;
/M: SY='E'; M= -4,  8,-24, 11, 18,-27,-13, -3,-23,  6,-20,-14,  4, -9, 12,  0,  2, -5,-21,-27,-14, 15;
/M: SY='A'; M=  1,-10,-20,-13, -8,-12,-17,-13, -4, -8,  0, -1, -8,-16, -4, -9, -6, -3, -5,-19, -8, -7;
/M: SY='L'; M= -8,-27,-17,-29,-22,  5,-30,-22, 23,-27, 34, 17,-26,-27,-20,-21,-23, -8, 17,-22, -2,-22;
/M: SY='E'; M= -3, -4,-22, -5,  6,-17,-16, -4,-17,  5,-13, -8, -3,-14,  3,  5, -2, -3,-13,-21, -6,  3;
/M: SY='N'; M= -1,  5,-21,  3,  4,-21,-10, -3,-21,  4,-20,-13,  8,-13,  2,  4,  6,  0,-16,-28,-13,  3;
/M: SY='C'; M= 11,-13, 20,-19,-17,-17, -6,-20,-15,-18,-13,-10,-11,-22,-17,-21,  2, -2, -4,-31,-19,-17;
/M: SY='Y'; M=-13,-22,-24,-25,-22, 17,-30, -4, 11,-17, 10,  7,-20,-26,-16,-15,-16, -4,  6,  2, 33,-21;
/M: SY='R'; M=-11, -5,-26, -5,  5,-18,-18, -4,-20, 14,-14, -8, -3,-16,  7, 23, -5, -5,-16,-20, -6,  4;
/M: SY='N'; M=  2,  7,-19,  2,  4,-22, -8, -4,-20,  2,-21,-14, 12,-11,  3,  1,  8,  0,-17,-30,-16,  3;
/M: SY='C'; M=  3,-19, 15,-24,-20, -9,-21,-21,  0,-20, -1, -2,-16,-23,-18,-21, -3, -2,  7,-31,-14,-19;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='L'; M= -8,-24,-17,-27,-19, 13,-25,-17, 13,-22, 29, 14,-22,-25,-18,-15,-21, -8,  8,-16,  2,-18; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='E'; M= -2,  3,-20,  4, 10,-19,-12, -2,-19,  5,-15,-11,  2,-11,  4,  3, -1, -5,-16,-20, -9,  7; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M: SY='L'; M= -6,-11,-19,-12, -4, -7,-19, -6,  0, -6,  6,  4,-11,-15, -5, -6,-10, -4, -2,-18, -3, -5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='A'; M= 16,-11, -2,-16,-10,-11, -9,-14, -7, -9, -7, -5, -9,-14,-10,-12,  2, -2,  0,-21,-12,-10; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='E'; M= -2, -1,-21, -2,  4,-14,-14, -7,-12,  0, -9, -7, -1,-11,  0,  0, -3, -4,-10,-21, -9,  1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='E'; M= -6,  8,-22, 12, 17,-26,-13, -5,-23,  7,-20,-15,  3, -7,  5,  1,  0, -7,-19,-28,-16, 10; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='H'; M= -9, -1,-19, -3, -1,-14,-16,  3,-15, -1,-10, -6,  3,-17, -2,  1, -6, -8,-14,-26, -6, -3;
/M: SY='G'; M= -4,  1,-23,  0, -2,-27, 16, -9,-29,  0,-26,-16,  7,-12, -4, -3,  1,-10,-24,-26,-21, -3;
/M: SY='I'; M= -7,-18,-15,-22,-17, -2,-25,-18, 10,-18,  8,  5,-16,-23,-15,-16,-13, -6,  8,-19, -3,-17;
/M: SY='R'; M= -6, -1,-23, -2,  3,-20,-12, -8,-21,  9,-19,-11,  1,-12,  2, 11,  2,  3,-14,-25,-12,  1;
/M: SY='S'; M=  1, -2,-12, -4, -2,-17, -9,-10,-17, -4,-22,-14,  4,-12, -2, -5, 20, 15, -9,-32,-14, -2;
/M: SY='I'; M= -5,-28,-21,-33,-26,  2,-33,-25, 32,-25, 22, 15,-24,-24,-22,-23,-18, -7, 28,-23, -3,-26;
/M: SY='A'; M= 22,-10,-13,-16,-10,-16, -5,-13, -9,-12,-10, -8, -8,-15, -7,-16,  5, -1, -2,-21,-13, -9;
/M: SY='F'; M=-12,-26,-20,-33,-25, 29,-30,-19, 16,-26, 18, 13,-21,-26,-24,-20,-18, -6, 11,-10, 10,-24;
/M: SY='P'; M= -8,-19,-25,-11, -3,-28,-19,-20,-20,-12,-28,-19,-18, 71,-11,-20, -7, -8,-26,-32,-29,-11;
/M: SY='A'; M=  7,-13, -8,-17,-11,-15,-13,-16, -9, -8, -4, -3,-12,-13, -9, -8, -4, -4, -4,-25,-14,-11;
/M: SY='I'; M= -9,-28,-25,-34,-25,  3,-34,-24, 35,-28, 26, 19,-22,-23,-19,-24,-20, -9, 22,-21, -1,-24;
/M: SY='G'; M=  5, -4,-16, -6,-11,-23, 27,-13,-28,-15,-27,-18,  6,-15,-11,-15, 15, -2,-19,-29,-23,-11;
/M: SY='T'; M= 11, -6,  5,-14,-11,-14,-13,-18,-14,-13,-14,-12, -4,-15,-11,-15, 15, 21, -3,-31,-15,-11;
/M: SY='G'; M=  1,-10,-29,-10,-18,-27, 59,-16,-36,-19,-27,-18, -1,-20,-18,-19,  0,-18,-26,-21,-26,-18;
/M: SY='I'; M= -6,-19,-19,-24,-19, -4,-24,-19, 16,-18,  8,  8,-13,-20,-14,-16,-12, -6, 12,-23, -6,-18;
/M: SY='F'; M= -8,-13,-24,-15,-15, 14, -6, -8,-12,-14, -5, -6,-10,-22,-18,-11,-11,-10,-11, -5, 13,-16;
/I:         I=-3; MD=-15;
/M: SY='G'; M=  1, -8,-25, -9,-13,-26, 41,-15,-32,-11,-25,-16,  0,-17,-11,-11,  1,-14,-24,-21,-24,-12; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='F'; M=-10,-24,-19,-27,-22, 22,-20,-16,  4,-21, 10,  3,-20,-26,-23,-17,-16, -8,  5, -5, 13,-22;
/M: SY='P'; M=-10, -2,-33,  6,  5,-29,-15,-12,-24, -5,-29,-21, -6, 42, -4,-12, -2, -7,-27,-26,-23, -2;
/M: SY='W'; M= -8,-21,-31,-22,-13, -5,-22,-19, -6, -8, -7, -6,-19, -6,-11,-10,-17,-12,-10, 18,  0,-12;
/M: SY='E'; M= -7, 10,-26, 14, 15,-26, -9, -3,-25,  3,-20,-16,  5, -8,  5, -1,  0, -7,-22,-28,-15,  9;
/M: SY='E'; M= -6, -1,-24,  1,  7,-22,-15, -8,-15,  2,-13, -8, -3,-11,  2,  1, -3, -5,-11,-27,-13,  3;
/M: SY='A'; M= 13,-16, -6,-21,-16, -8,-14,-22,  1,-15, -5, -4,-13,-19,-17,-17,  4,  4, 12,-27,-13,-17;
/M: SY='A'; M= 14,-10,-13,-15, -3,-14,-14,-16,-10, -4, -7, -7,-10,-15, -6, -7,  0, -1, -3,-22,-14, -5;
/M: SY='Q'; M= -8, -1,-27,  1,  9,-26,-14,  1,-22,  6,-20,-11,  0, -4, 10,  8, -2, -7,-20,-26,-13,  8;
/M: SY='I'; M=  2,-21,-18,-26,-19, -4,-25,-22, 19,-20, 10,  7,-16,-20,-16,-20, -8, -1, 17,-24, -7,-19;
/M: SY='L'; M=  3,-23,-17,-30,-21,  1,-23,-20, 17,-21, 18, 16,-20,-22,-16,-20,-15, -7, 13,-18, -4,-19;
/M: SY='L'; M= -6,-13,-17,-15, -8, -7,-22,-15,  3,-13,  6,  1,-11,-21, -9,-11,-10, -6,  2,-22, -7, -9;
/M: SY='E'; M= -4,  3,-24,  5, 12,-23,-12, -4,-23,  8,-19,-12,  1,-11,  7,  5,  2, -3,-18,-26,-13,  9;
/M: SY='A'; M= 11, -6,-14,-11, -4,-13,-12,-12,-10, -9,-10, -9, -5,-14, -8,-11,  7,  9, -2,-26,-12, -6;
/M: SY='V'; M= -3,-22,-15,-26,-22,  2,-23,-22, 16,-21, 11,  8,-20,-24,-21,-19,-12, -3, 18,-22, -5,-22;
/M: SY='R'; M= -4, -7,-20, -9, -2,-16,-10, -9,-18,  2,-14, -9, -4,-15, -1,  7, -2, -4,-12,-22,-12, -3;
/M: SY='E'; M= -4,  7,-22,  8, 10,-25,-10, -6,-23,  4,-20,-15,  5, -8,  3,  0,  2, -3,-19,-29,-17,  6;
/M: SY='F'; M=-13,-19,-19,-23,-16, 20,-22, -7, -5,-16,  1,  0,-15,-23,-17,-11,-14, -8, -5, -1, 13,-16;
/I:         I=-1; MD=-7;
/M: SY='L'; M= -3,-10,-14,-10, -7, -4,-15, -9, -2,-10,  5,  1, -9,-13, -7, -8, -8, -5, -2,-18, -5, -8; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-7;
/M: SY='E'; M= -5, -3,-18, -2,  4,-14,-11, -6,-11,  1,-10, -6, -3, -6,  1, -1, -3, -4, -9,-16, -9,  2; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-7;
/M: SY='K'; M= -5,  1,-17,  1,  6,-16,-12, -4,-13,  7,-14, -7,  1, -7,  6,  5,  1, -1,-11,-18, -9,  6; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-7;
/M: SY='H'; M= -5,  0,-14, -1, -1,-10, -7,  9,-11, -3,-10, -5,  4, -8,  0, -2, -1, -3,-11,-14, -2, -2; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
/M: SY='S'; M=  3, -3,-11, -5, -3,-11, -5, -7, -8, -3,-10, -6, -1, -6, -2, -4,  5,  3, -5,-16, -9, -3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-7;
/M: SY='I'; M= -4,-10,-15,-11, -7, -4,-15,-12,  6,-10,  4,  2, -9, -8, -8,-10, -7, -3,  4,-16, -5, -8; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-7;
/M: SY='E'; M= -4, -1,-15, -1,  2,-13,-11, -6,-10,  2,-10, -6, -2, -8, -1,  1, -2, -3, -7,-16, -7,  0; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-7;
/M: SY='E'; M= -8,  2,-20,  4,  9,-15,-14,  1,-15,  3,-11, -8,  1,-10,  3,  3, -2, -3,-13,-21, -7,  5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-7;
/M: SY='V'; M= -3,-23,-14,-27,-23,  4,-26,-22, 24,-18, 11, 11,-20,-21,-20,-18,-12, -3, 27,-19, -2,-22; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-7;
/M: SY='I'; M= -6,-15,-18,-18,-14, -2,-22,-10,  9, -9,  3,  4,-12,-18,-11, -6,-10, -4,  9,-15,  3,-15; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-7;
/M: SY='F'; M=-10,-25,-17,-29,-23, 24,-27,-19, 18,-23, 18,  9,-20,-23,-23,-18,-17, -7, 15, -9,  9,-23; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-7;
/M: SY='V'; M= -5,-18, -3,-21,-20,  2,-23,-14,  9,-15,  3,  2,-15,-24,-19,-14, -9, -3, 16,-19,  0,-20; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-7;
/M: SY='V'; M= -2, -9, -3,-11,-12, -6,-17,-14, -2,-14, -4, -4, -8,-15,-14,-14, -3,  1,  3,-24, -9,-14; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-7;
/M: SY='F'; M=-11,-13,-16,-18,-16, 15,-20, -8, -2,-12, -1, -2, -9,-20,-15, -8,-11, -5, -3, -5, 13,-16; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-7;
/M: SY='D'; M= -6, 11,-20, 13,  4,-21,-10, -6,-18, -4,-17,-14,  7, -9,  0, -6,  5,  3,-14,-29,-14,  2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-7;
/M: SY='E'; M= -8,  6,-24, 10, 11,-22,-12, -1,-20, -1,-18,-13,  2, -2,  4, -4,  1, -3,-18,-26,-12,  6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-7;
/M: SY='E'; M= -6,  4,-23,  5, 12,-21,-13, -1,-18,  4,-17,-11,  3, -8,  6,  2,  1, -4,-17,-24,-11,  8; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-7;
/M: SY='D'; M= -6,  6,-21,  7,  1,-18,-13, -5,-15, -5,-14, -9,  2, -9, -3, -5,  2,  3,-11,-26,-11, -2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-7;
/M: SY='Y'; M= -3,-14,-17,-17,-11, -1,-21,-12,  0,-11,  0, -1,-12,-17,-11,-11, -8, -4,  0,-14,  3,-12; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-7;
/M: SY='E'; M= -4,  1,-23,  2,  6,-22,-11, -6,-19,  1,-18,-11,  1, -8,  5, -2,  2, -3,-16,-26,-14,  5;
/M: SY='I'; M= -1,-19,-21,-23,-15, -5,-24,-18, 14,-17, 10,  7,-17,-20,-13,-16,-11, -4, 12,-22, -5,-16;
/M: SY='Y'; M=-15,-24,-23,-28,-22, 29,-28, -3,  6,-19,  9,  6,-21,-27,-19,-16,-19, -9,  0,  7, 36,-22;
/M: SY='E'; M= -6, -3,-24, -2,  7,-20,-18, -5,-14,  4,-10, -6, -3,-14,  7,  4, -3, -5,-12,-25, -9,  6;
/M: SY='E'; M= -4,  4,-23,  4, 10,-25,-13, -5,-23,  8,-21,-13,  4, -6,  7,  5,  1, -4,-20,-27,-15,  8;
/M: SY='A'; M=  5,-10,-14,-13, -4,-10,-15,-13, -7, -9, -4, -4, -9,-16, -7,-12,  0,  0, -3,-23, -9, -6;
/M: SY='L'; M= -8,-24,-16,-28,-19, 10,-25,-16, 11,-21, 19, 14,-21,-25,-15,-16,-17, -7,  7,-16,  1,-17;
/M: SY='Q'; M=  1, -2,-24, -3,  4,-24,-11, -8,-16,  1,-19,-10, -1, -1,  5, -4,  3, -2,-15,-26,-15,  4;
/M: SY='B'; M= -6,  1,-23,  0, -1,-17,-13, -8,-14,  0,-13, -9,  1,-13, -2, -2, -1, -1,-11,-26,-11, -2;
/M: SY='Y'; M= -6,-16,-22,-18,-13, -1,-19, -3, -5, -9, -4, -1,-13,-20, -8, -4, -8, -5, -3, -9,  9,-12;
/M: SY='F'; M= -3,-13,-16,-15, -9,  4,-19,-15, -4,-15, -2, -4,-10,-18,-13,-13, -3, -1, -1,-19, -4,-11;
/I:         MD=0;
/M: D=0;
/I:         I=0; E1=0; MI=0; IE=0; DE=0;
Numerical results
  • UniProtKB/Swiss-Prot release number: 2013_05, total number of sequence entries in that release: 540052.
  • Total number of hits in UniProtKB/Swiss-Prot: 240 hits in 233 different sequences
  • Number of hits on proteins that are known to belong to the set under consideration: 240 hits in 233 different sequences
  • Number of hits on proteins that could potentially belong to the set under consideration: 0 hits in 0 different sequences
  • Number of false hits (on unrelated proteins): 0 hits in 0 different sequences
  • Number of known missed hits: 2
  • Number of partial sequences which belong to the set under consideration, but which are not hit by the pattern or profile because they are partial (fragment) sequences: 0
  • Precision (true hits / (true hits + false positives)): 100.00 %
  • Recall (true hits / (true hits + false negatives)): 99.17 %
Comments
  • MATRIX_TYPE: protein_domain
  • Scaling database: UniProtKB/Swiss-Prot: reversed
  • Matrix author: PS_Langendijk_Genevaux
  • Taxonomic range: Archaea, Bacteriophages, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses
  • Maximum known number of repetitions of the pattern in a single protein: 3
  • FT_KEY: DOMAIN
  • FT_DESC: Macro
  • VERSION: 1
Cross-references
UniProtKB/Swiss-Prot True positive hits:
BH140_ARATH (Q9M041), CHD1L_BOVIN (Q3B7N1), CHD1L_DANRE (Q7ZU90), 
CHD1L_HUMAN (Q86WJ1), CHD1L_MOUSE (Q9CXF7), GDAP2_BOVIN (Q2KIX2), 
GDAP2_DANRE (Q66HX8), GDAP2_DICDI (Q54PT1), GDAP2_DROME (Q7JUR6), 
GDAP2_DROPS (Q292F9), GDAP2_HUMAN (Q9NXN4), GDAP2_MACFA (Q4R678), 
GDAP2_MOUSE (Q9DBL2), GDAP2_NEMVE (A7T167), GDAP2_RAT   (Q66H63), 
GDAP2_XENLA (Q5XGM5), GDAP2_XENTR (Q5CZL1), H2AW_HUMAN  (Q9P0M6), 
H2AW_MOUSE  (Q8CCK0), H2AY_CHICK  (O93327), H2AY_HUMAN  (O75367), 
H2AY_MOUSE  (Q9QZQ8), H2AY_RAT    (Q02874), MACD1_BOVIN (Q2KHU5), 
MACD1_HUMAN (Q9BQ69), MACD1_MOUSE (Q922B1), MACD1_RAT   (Q8K4G6), 
MACD2_HUMAN (A1Z1Q3), MACD2_MOUSE (Q3UYG8), MACD2_XENLA (Q6PAV8), 
OARD1_BOVIN (Q1LZ74), OARD1_HUMAN (Q9Y530), OARD1_MOUSE (Q8R5F3), 
PAR14_HUMAN (Q460N5), PAR14_MOUSE (Q2EMV9), PAR15_HUMAN (Q460N3), 
PARP9_HUMAN (Q8IXQ6), PARP9_MOUSE (Q8CAS9), POA1_AJECN  (A6QXU0), 
POA1_ASPFU  (Q4WRE8), POA1_ASPOR  (Q2UQY2), POA1_CANAL  (Q5A1V3), 
POA1_CANGA  (Q6FXN3), POA1_DEBHA  (Q6BPN4), POA1_LODEL  (A5E287), 
POA1_NEOFI  (A1D1B7), POA1_PHANO  (Q0UHC0), POA1_PICGU  (A5DR03), 
POA1_PICST  (A3LZD1), POA1_VANPO  (A7TJY9), POA1_YARLI  (Q6CHN5), 
POA1_YEAS7  (A6ZKW8), POA1_YEAST  (P38218), POLN_AHEV   (Q6QLN1), 
POLN_AURAV  (Q86924), POLN_BFV    (P87515), POLN_CHIK3  (Q5XXP4), 
POLN_CHIKS  (Q8JUX6), POLN_EEEV1  (Q306W6), POLN_EEEV8  (Q306W8), 
POLN_EEEVF  (Q4QXJ8), POLN_EEVV3  (P36327), POLN_EEVVC  (Q8V294), 
POLN_EEVVM  (Q9WJC7), POLN_EEVVP  (P36328), POLN_EEVVT  (P27282), 
POLN_GETV   (Q5Y389), POLN_HEVBU  (P29324), POLN_HEVCH  (Q81862), 
POLN_HEVCT  (Q9IVZ9), POLN_HEVHY  (Q9WC28), POLN_HEVME  (Q03495), 
POLN_HEVMG  (Q6J8G2), POLN_HEVMY  (Q04610), POLN_HEVPA  (P33424), 
POLN_HEVUS  (Q9YLR1), POLN_MAYAB  (Q8QZ73), POLN_ONNVG  (P13886), 
POLN_ONNVI  (O90370), POLN_ONNVS  (O90368), POLN_RRVN   (P13887), 
POLN_RRVT   (P13888), POLN_RUBVB  (Q6X2U4), POLN_RUBVC  (Q6X2U2), 
POLN_RUBVD  (Q9J6K9), POLN_RUBVM  (Q86500), POLN_RUBVN  (Q8BCR0), 
POLN_RUBVO  (Q99IE7), POLN_RUBVR  (O40955), POLN_RUBVT  (P13889), 
POLN_RUBVV  (Q99IE5), POLN_SAGV   (Q9JGL0), POLN_SFV    (P08411), 
POLN_SINDO  (P27283), POLN_SINDV  (P03317), POLN_SLDV   (Q8QL53), 
POLN_SPDV   (Q8JJX1), POLN_WEEV   (P13896), R1AB_BC133  (P0C6W1), 
R1AB_BC279  (P0C6V9), R1AB_BC512  (P0C6W0), R1AB_BCHK3  (P0C6W2), 
R1AB_BCHK4  (P0C6W3), R1AB_BCHK5  (P0C6W4), R1AB_BCHK9  (P0C6W5), 
R1AB_BCRP3  (P0C6W6), R1AB_BEV    (P0C6V7), R1AB_BRV1   (P0C6V8), 
R1AB_CVBEN  (P0C6W7), R1AB_CVBLU  (P0C6W8), R1AB_CVBM   (P0C6W9), 
R1AB_CVBQ   (P0C6X0), R1AB_CVH22  (P0C6X1), R1AB_CVHN1  (P0C6X2), 
R1AB_CVHN2  (P0C6X3), R1AB_CVHN5  (P0C6X4), R1AB_CVHNL  (P0C6X5), 
R1AB_CVHOC  (P0C6X6), R1AB_CVHSA  (P0C6X7), R1AB_CVM2   (P0C6X8), 
R1AB_CVMA5  (P0C6X9), R1AB_CVMJH  (P0C6Y0), R1AB_CVPPU  (P0C6Y5), 
R1AB_FIPV   (Q98VG9), R1AB_IBVB   (P0C6Y1), R1AB_IBVBC  (P0C6Y2), 
R1AB_IBVM   (P0C6Y3), R1AB_PEDV7  (P0C6Y4), R1AB_WBV24  (Q008X6), 
R1A_BC133   (P0C6F7), R1A_BC279   (P0C6F5), R1A_BC512   (P0C6F6), 
R1A_BCHK3   (P0C6F8), R1A_BCHK4   (P0C6T4), R1A_BCHK5   (P0C6T5), 
R1A_BCHK9   (P0C6T6), R1A_BCRP3   (P0C6T7), R1A_BEV     (P0C6F3), 
R1A_BRV1    (P0C6F4), R1A_CVBEN   (P0C6T8), R1A_CVBLU   (P0C6T9), 
R1A_CVBM    (P0C6U0), R1A_CVBQ    (P0C6U1), R1A_CVH22   (P0C6U2), 
R1A_CVHN1   (P0C6U3), R1A_CVHN2   (P0C6U4), R1A_CVHN5   (P0C6U5), 
R1A_CVHNL   (P0C6U6), R1A_CVHOC   (P0C6U7), R1A_CVHSA   (P0C6U8), 
R1A_CVM2    (P0C6U9), R1A_CVMA5   (P0C6V0), R1A_CVMJH   (P0C6V1), 
R1A_CVPPU   (P0C6V2), R1A_IBVB    (P0C6V3), R1A_IBVBC   (P0C6V4), 
R1A_IBVM    (P0C6V5), R1A_PEDV7   (P0C6V6), R1A_WBV24   (Q008X5), 
Y06D_BPT4   (P13309), Y1105_THEAC (Q9HJ67), Y1111_PYRAE (Q8ZXT3), 
Y1168_STRP8 (Q8P0X2), Y1216_STRP1 (Q99ZI6), Y1252_SULAC (Q4J9D2), 
Y1513_PYRHO (O59182), Y1521_ARCFU (O28751), Y1536_PYRFU (Q8U0P9), 
Y1614_METAC (Q8TQD0), Y1648_AERPE (Q9YBE9), Y177_METMA  (Q8Q0F9), 
Y1890_PYRKO (Q5JER1), Y1899_MYCTU (O07733), Y189_ACISE  (Q93SX7), 
Y189_STRGR  (Q9KHE2), Y189_STRNO  (Q9EYI6), Y189_TREMD  (Q93RG0), 
Y1934_MYCBO (Q7TZB9), Y1951_FUSNN (Q8RHQ2), Y2219_CHLTE (Q8KAE4), 
Y2288_DEIRA (Q9RS39), Y2383_SULTO (Q96XY5), Y2748_LISMF (Q71W03), 
Y2759_LISMO (Q8Y3S3), Y2899_SULSO (Q97UU4), Y2902_LISIN (Q926Y8), 
Y302_STAAS  (Q6GCE6), Y302_STAAW  (Q8NYB7), Y314_STAAN  (P67344), 
Y3184_XANCP (Q8P5Z8), Y322_STAAR  (Q6GJZ1), Y325_STAAM  (P67343), 
Y3295_LEPIC (Q72M93), Y3343_XANAC (Q8PHB6), Y334_RALSO  (Q8Y2K1), 
Y3408_LACPL (Q88SK6), Y3693_PSEAE (Q9HXU7), Y396_STAAC  (Q5HIW9), 
Y4103_VIBPA (Q87JZ5), Y4133_LEPIN (Q8EYT0), Y508_THEMA  (Q9WYX8), 
Y6450_STRCO (Q9ZBG3), Y656_PYRAB  (Q9V0Y3), Y719_THEVO  (Q97AU0), 
Y7730_RHILO (Q985D2), Y856_STRP3  (P0DC28), Y856_STRPQ  (P0DC29), 
Y919_STRP6  (Q5XC09), Y987_AQUAE  (O67112), Y995_THETN  (Q8RB30), 
YGB2_CUPNE  (Q44020), YMDB1_PANVC (E1SDF1), YMDB2_PANVC (E1PL40), 
YMDB_CITK8  (A8AI35), YMDB_CITRI  (D2TT52), YMDB_CROS8  (A7MG20), 
YMDB_CROTZ  (C9Y0V8), YMDB_ECO57  (P0A8D8), YMDB_ECOL6  (P0A8D7), 
YMDB_ECOLI  (P0A8D6), YMDB_ENT38  (A4W960), YMDB_ENTCC  (D5CE05), 
YMDB_ESCF3  (B7LT90), YMDB_KLEP3  (B5XXK9), YMDB_KLEVT  (D3RKJ0), 
YMDB_SALA4  (B5F961), YMDB_SALG2  (B5RBF3), YMDB_SALNS  (B4T2X8), 
YMDB_SALTI  (P67342), YMDB_SALTY  (P67341), YMDB_SHIDS  (Q32E73), 
YMDB_SHIF8  (Q0T5Z6), YMX7_YEAST  (Q04299)
False negative hits (sequences which belong to the set under consideration, but which have not been picked up by the pattern or profile):
POA1_ASPCL  (A1CNH7), POA1_CHAGB  (Q2GV19)
Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:

[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format]

Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]		 1HJZ; 1NJR; 1SPV; 1TXZ; 1TY8; 1VHU; 1YD9; 1ZR3; 1ZR5; 2ACF; 2BFQ; 2BFR; 2EEE; 2FAV; 2FXK; 2L8R; 2LGR; 2VRI; 2X47; 2XD7; 3EJF; 3EJG; 3EKE; 3ETI; 3EW5; 3EWO; 3EWP; 3EWQ; 3EWR; 3GPG; 3GPO; 3GPQ; 3GQE; 3GQO; 3IID; 3IIF; 3JZT; 3Q6Z; 3Q71; 3V2B; 3VFQ; 4ABK; 4ABL; 4D86; 4GUA; 4IQY;

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)

If you would like to retrieve all the Swiss-Prot entries referenced in the DR lines of this entry (with the exception of false positive hits) , you can enter a file name. These entries will then be saved to a file under this name. (Please note that this temporary file will only be kept for 1 week.)

File name:

Format: Swiss-Prot Fasta

or