To improve security and privacy, we are moving our web pages and services from HTTP to HTTPS.
To give users of web services time to transition to HTTPS, we will support separate HTTP and HTTPS services until the end of 2017.
From January 2018 most HTTP traffic will be automatically redirected to HTTPS. [more...]
View this page in https
Entry: PS51155

General information about the entry

Entry name [info] CHIT_BIND_RR_2
Accession [info] PS51155
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-OCT-2005 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-SEP-2017 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC00206
Associated ProRule [info] PRU00497

Name and characterization of the entry

Description [info] Chitin-binding type R&R domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=68;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=63;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1725450; R2=0.0164134; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=386; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=319; N_SCORE=7.4; MODE=1; TEXT='R?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D'; M= -7,  3,-27,  8,  5,-22,-10, -7,-21, -4,-18,-14, -1,  3, -3, -8, -3, -8,-18,-28,-16,  0;
/M: SY='G'; M= -3, -2,-27,  0, -4,-24, 16, -8,-26,-10,-21,-15,  0,-10, -8,-10, -2,-11,-21,-22,-17, -7;
/M: SY='S'; M= -2, -1,-23, -1,  2,-22, -3, -5,-21, -4,-21,-14,  3, -2,  0, -7,  9,  1,-18,-29,-15,  0;
/M: SY='Y'; M=-18,-20,-27,-22,-19, 32,-28,  7, -1,-12,  1, -1,-18,-27,-15, -9,-18,-10, -7, 18, 55,-19;
/M: SY='E'; M=  0,  2,-22,  1,  4,-21,-13, -3,-18,  4,-18,-11,  2,-13,  2,  1,  4,  0,-13,-27,-12,  2;
/M: SY='F'; M=-16,-23,-23,-28,-23, 45,-26, -3, -1,-20,  4,  0,-17,-27,-23,-15,-16, -8, -4,  8, 37,-22;
/M: SY='G'; M=  3, -1,-22, -3, -2,-23, 10, -7,-23, -6,-21,-13,  4,-15, -2, -6,  6, -5,-17,-26,-18, -3;
/M: SY='Y'; M=-15,-20,-26,-22,-20, 31,-26,  7, -1,-15,  1, -1,-18,-28,-16,-13,-16, -9, -6, 18, 54,-20;
/M: SY='E'; M= -5,  2,-25,  4, 17,-23,-12,  2,-21,  0,-16,-11,  0,-11,  9, -2,  2, -5,-19,-27,-12, 13;
/M: SY='T'; M=  3,-13,-17,-17,-13,-11,-15,-20,  2,-13, -2, -2,-11,-16,-12,-13,  1, 10,  8,-26,-12,-13;
/M: SY='E'; M= -3,  5,-25,  8, 10,-28, -6, -5,-24,  0,-24,-16,  4,  1,  5, -5,  4, -4,-21,-29,-19,  7;
/M: SY='D'; M=-14, 36,-26, 42, 11,-29, -9,  6,-30, -1,-27,-23, 26,-13,  0, -6,  3, -6,-27,-36,-15,  5;
/M: SY='G'; M= -2, -5,-27, -4, -8,-26, 25,-10,-27,-12,-24,-16, -1, -8, -9,-14,  1,-11,-21,-24,-20, -9;
/M: SY='I'; M= -6,-11,-24,-15, -8,-12,-18,-11,  1,-10, -4,  0, -6,-13, -2,-10, -4, -2, -3,-24, -8, -7;
/M: SY='S'; M= -5, -3,-23, -5, -5,-14, -4, -2,-20, -2,-19,-11,  2,-16, -3,  2,  3,  0,-15,-23, -7, -5;
/M: SY='R'; M= -4, -5,-25, -6, -1,-20, -4,  0,-21,  2,-17, -9, -1,-16,  5,  9, -2, -7,-17,-21,-10,  0;
/M: SY='E'; M= -7,  2,-25,  3, 13,-16,-16, -1,-18,  0,-15,-11,  0,-13,  4, -3, -1, -5,-17,-20, -6,  8;
/M: SY='E'; M= -3,  0,-23,  1, 18,-20,-16, -2,-17, -1,-15,-10, -1,-10, 10, -4,  4, -1,-16,-27,-12, 13;
/M: SY='K'; M= -8, -5,-25, -5,  4,-14,-16, -3,-18,  6,-16, -7, -3,-13,  4,  6, -3, -5,-14,-20, -5,  3;
/M: SY='G'; M=  0, -2,-25, -1, -8,-24, 25,-12,-30, -8,-23,-17,  2,-16, -9, -7,  3, -8,-21,-24,-21, -9;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='Y'; M= -8, -9,-17, -9, -4, -3,-17,  5, -4, -3, -4,  0, -7,-15,  1, -1, -7, -4, -3, -9,  9, -3; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='E'; M= -5, -5,-17, -3,  4, -9,-13, -5, -5, -4, -1, -3, -6, -7, -1, -6, -6, -5, -6,-14, -6,  1; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='E'; M= -7,  5,-19,  7,  8,-17,-11, -1,-15,  4,-14, -8,  3, -9,  2, -1, -1, -4,-12,-19, -7,  5; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='E'; M= -4,  5,-22,  4,  9,-21,-11, -1,-19,  5,-17,-10,  7, -9,  8,  7,  1, -5,-18,-25,-13,  7; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='D'; M= -7,  6,-26, 10,  7,-25,-14,  0,-23,  3,-21,-14,  3, -2,  3,  1,  0, -4,-19,-29,-13,  4;
/M: SY='G'; M= -1, -4,-26, -7,-14,-25, 43,-16,-30,-15,-26,-17,  6,-18,-14,-16,  4,-11,-24,-24,-25,-14;
/M: SY='D'; M= -6, 10,-23, 11,  3,-24,-11, -6,-20,  0,-19,-14,  6, -9, -1, -4,  3,  1,-15,-30,-15,  1;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='D'; M= -4, 10,-17, 13,  7,-19, -5,  1,-17, -2,-16,-12,  6,  0,  1, -6,  2, -3,-15,-21,-12,  4; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='G'; M= -4, -5,-13, -6, -6, -8,  1,-10, -6,-10, -2, -3, -3,-12, -7,-10, -4, -5, -6,-13, -8, -7; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='V'; M=  3, -8,-12,-11, -7, -8,-14,-11,  0, -5, -6, -3, -6,-14, -8, -5,  2,  3,  7,-21, -8, -8; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='V'; M= -1,-22,-16,-25,-21, -5,-27,-24, 18,-12,  4,  6,-20,-23,-18,-13, -7,  3, 28,-26, -8,-21;
/M: SY='R'; M= -8, -4,-23, -6,  1,-17,-19,  3,-15,  6,-14, -4, -2,-15,  7,  9, -1,  0,-11,-23, -4,  3;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='S'; M=  0, -4, -9, -6, -1,-14, -9, -9,-18, -8,-20,-13,  0,-15, -2, -8, 13,  5,-12,-26,-11, -1;
/M: SY='Y'; M=-19,-20,-28,-22,-20, 35,-29, 12,  0,-13,  1,  0,-19,-29,-14,-12,-18, -9, -8, 23, 66,-20;
/M: SY='S'; M=  1, -4,-19, -4, -2,-19,  6, -9,-23, -5,-24,-15,  3,-14, -2, -4, 16,  4,-15,-28,-14, -2;
/M: SY='Y'; M=-14,-24,-27,-26,-22, 25,-27, -1,  1,-17,  3,  0,-22,-28,-16,-14,-20,-11, -4, 26, 43,-20;
/M: SY='I'; M= -7,-19,-21,-22,-17, -5,-27,-18, 13,-14,  5,  6,-16,-17,-12,-12, -9,  1, 13,-22, -4,-16;
/M: SY='D'; M= -6, 15,-24, 19,  5,-27,  2, -2,-27, -5,-21,-16,  9,-13, -1, -8,  3, -5,-21,-31,-17,  2;
/M: SY='P'; M= -1, -7,-31, -1,  4,-28,-13,-13,-21, -7,-25,-18, -9, 42, -6,-15, -2, -6,-23,-29,-24, -4;
/M: SY='D'; M=-12, 29,-26, 38, 17,-30,-11, -1,-31,  1,-25,-22, 14,-11,  2, -6,  2, -6,-24,-33,-17,  9;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='G'; M=  0, -6,-28, -7,-18,-29, 61,-18,-38,-18,-29,-20,  3,-19,-18,-18,  2,-16,-29,-22,-29,-18;
/M: SY='R'; M=-10, -3,-25, -4,  3,-18,-21, -2,-14,  9,-15, -6, -1,-15,  5, 10, -4, -4,-10,-24, -7,  3;
/M:         M= -9,-11,-25,-11, -4,-14,-19, -9, -7, -3, -6, -1,-10, -8, -3, -1, -8, -3, -5,-22, -6, -5;
/M: SY='R'; M=-13,-15,-25,-16, -9, -3,-25,  2, -5,  0, -6,  0,-11,-22, -2, 13,-11, -8, -2,-13, 10, -9;
/M: SY='T'; M= -5, -9,-19,-12, -6,-11,-20,-13, -5, -5, -8, -5, -6,-16, -6, -3,  2, 11,  1,-25, -9, -6;
/M: SY='V'; M= -3,-25,-14,-28,-26,  1,-29,-26, 24,-19,  9,  8,-23,-26,-24,-18, -9,  2, 35,-26, -6,-25;
/M: SY='E'; M=-10,  6,-24,  5,  7,-17,-16,  7,-21,  3,-19,-11,  6,-14,  6,  3,  2, -1,-18,-25, -4,  5;
/M: SY='Y'; M=-19,-20,-29,-21,-20, 31,-30, 16,  1,-11,  2,  1,-20,-30,-12,-11,-20,-10, -8, 26, 73,-20;
/M: SY='V'; M= -2,-14,-18,-18,-13, -6,-22,-16,  5,-12, -2, -1,-12,-19,-13,-12, -2,  8, 11,-21, -4,-14;
/M: SY='A'; M= 38,-10, -8,-19,-11,-18, -3,-20, -8,-11,-10,-10,-10,-12,-11,-19, 11,  4,  3,-23,-19,-11;
/M: SY='D'; M=-13, 34,-28, 46, 12,-34,  0, -2,-35, -2,-28,-25, 18,-12, -2, -9,  2, -8,-27,-35,-19,  4;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='E'; M= -6,  4,-27,  8, 19,-27, -9,  5,-27,  7,-21,-14,  2, -7,  8,  1, -1, -9,-23,-27,-14, 12;
/M: SY='N'; M= -7,  7,-22,  1, -2,-13, -6, -1,-18, -2,-17,-11, 14,-17, -3, -1,  3,  1,-17,-27,-11, -3;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-19,-30, 68,-20,-40,-18,-30,-20,  0,-20,-19,-19,  0,-20,-30,-20,-30,-19;
/M: SY='F'; M=-20,-25,-24,-31,-25, 56,-30, -2,  0,-21,  5,  0,-20,-30,-26,-15,-19,-10, -5, 18, 52,-25;
/M: SY='R'; M=-14, -5,-27, -6,  4,-22,-20, 13,-19, 11,-15, -4,  0,-17, 16, 24, -6,-10,-17,-23, -5,  8;
/M: SY='P'; M= 10,-18,-23,-19,-11,-18,-18,-20,  0,-14,-10, -6,-17, 17,-12,-20, -4, -4,  1,-26,-18,-14;
/M: SY='E'; M= -6, -8,-21, -7,  1,-16,-22, -6, -4, -4, -7, -3, -8,-17,  0, -4, -3, -2,  1,-27, -9,  0;
/M: SY='G'; M= -2,-11,-23,-12,-11,-16,  3,-17, -7,-14,-11, -6, -8,-15,-12,-16, -1, -6, -2,-25,-15,-13;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='N'; M= -4,  4,-16,  3,  4,-15, -7,  2,-14,  2,-14, -7,  5, -8,  4,  1,  2, -2,-12,-19, -8,  3; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='D'; M= -3,  7,-23,  8,  4,-23,-11, -7,-18, -2,-17,-13,  4, -5, -1, -6,  2, -2,-15,-29,-15,  0;
/M: SY='H'; M= -2,  0,-21, -4, -2,-14,-13,  8,-12, -7,-14, -8,  6,-14, -3, -7,  1, -3,-11,-28, -7, -4;
/M: SY='L'; M= -5,-16,-22,-19,-11, -5,-21,-12,  3,-13,  8,  4,-14,-21, -8, -9,-11, -4,  1,-18, -2,-10;
/M: SY='P'; M= -9,-17,-38, -8,  2,-30,-19,-17,-21, -7,-29,-19,-17, 77, -8,-16, -9,-10,-29,-29,-28, -8;
/M: SY='T'; M=  2, -8,-21,-11, -5,-15,-10,-14, -6, -9, -8, -6, -6,-14, -5,-11,  0,  3, -4,-23,-10, -6;
/M: SY='P'; M=  3,-11,-23,-12, -6,-18,-12,-13,-10, -8,-13, -9, -9,  6, -8,-12,  0,  0, -7,-25,-14, -9;
/M: SY='P'; M= -3,-10,-29, -7, -2,-22,-12,-12,-15, -8,-19,-12,-10, 28, -8,-14, -4, -5,-16,-27,-18, -7;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2017_09 which contains 555'594 sequence entries.


Total number of hits 82 in 81 different sequences
Number of true positive hits 82 in 81 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 1
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 2
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Chitin-binding type R&R
Version [info] 4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
81 sequences

CU01_ANOGA  (Q17015    ), CU02_HOMAM  (P81386    ), CU02_LONON  (P85196    ), 
CU03_HOMAM  (P81387    ), CU03_LONON  (P85197    ), CU04_HOMAM  (P81388    ), 
CU05_HOMAM  (P81389    ), CU07_LOCMI  (P11733    ), CU08_LOCMI  (P11734    ), 
CU109_IXORI (P84251    ), CU12_HYACE  (P45589    ), CU14A_LIMPO (P83354    ), 
CU14B_LIMPO (P83355    ), CU14_MANSE  (P13229    ), CU15_MANSE  (Q94984    ), 
CU168_IXORI (P84252    ), CU16_MANSE  (Q25504    ), CU17_BOMMO  (O02387    ), 
CU18A_LOCMI (P83994    ), CU18B_LOCMI (P83995    ), CU198_LOCMI (P82166    ), 
CU19_ARADI  (P80515    ), CU19_LOCMI  (P45583    ), CU1A_HOMAM  (P81384    ), 
CU1B_HOMAM  (P81385    ), CU20_MANSE  (Q8T635    ), CU20_TENMO  (P26967    ), 
CU21_LOCMI  (P81225    ), CU22_BOMMO  (O02388    ), CU22_TENMO  (P26968    ), 
CU24_ARADI  (P80516    ), CU26_ARADI  (P80517    ), CU27_MANSE  (Q8T4J9    ), 
CU30_BOMMO  (Q08738    ), CU36A_MANSE (Q8T634    ), CU36_MANSE  (Q8MUC5    ), 
CU55_ARADI  (P80518    ), CU57_ARADI  (P80519    ), CU66_HYACE  (P45590    ), 
CUA1A_TENMO (P80681    ), CUA2B_TENMO (P80682    ), CUA3A_TENMO (P80683    ), 
CUC11_CANPG (P81589    ), CUD1_SCHGR  (Q7M4F4    ), CUD2_SCHGR  (Q7M4F3    ), 
CUD3_SCHGR  (Q7M4E9    ), CUD4_LOCMI  (P21799    ), CUD4_SCHGR  (Q7M4F1    ), 
CUD5_LOCMI  (P56561    ), CUD5_SCHGR  (P56562    ), CUD6_SCHGR  (Q7M4E8    ), 
CUD8_SCHGR  (Q7M4F2    ), CUD9_SCHGR  (Q7M4F0    ), CULP1_HELAM (O02443    ), 
CUO6_BLACR  (P82119    ), CUO7_BLACR  (P82120    ), CUO8_BLACR  (P82121    ), 
CUP1_NEOBL  (P14485    ), CUP4_NEOBL  (P14486    ), CUP7_DROME  (P27779    ), 
CUP8_DROME  (P27780    ), CUPA1_CANPG (P81575    ), CUPA2_CANPG (P81576    ), 
CUPA3_CANPG (P81577    ), CUPA4_CANPG (P81578    ), CUPA5_CANPG (P81579    ), 
CUPP_DROME  (P14484    ), CUPP_DROPS  (P16369    ), LCP1_DROME  (P02839    ), 
LCP1_DROMI  (P91627    ), LCP2A_DROME (Q7JZV0    ), LCP2_DROME  (P07187    ), 
LCP2_DROMI  (P91629    ), LCP34_DROMI (Q01774    ), LCP3_DROME  (P07188    ), 
LCP4_DROME  (P07189    ), LCP5_DROME  (P92192    ), LCP8_DROME  (P92201    ), 
LCP9_DROME  (P82384    ), MBN_DROME   (P52302    ), RESIL_DROME (Q9V7U0    )
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
'Partial' sequences
1 sequence

CUP6_NEOBL  (P14487    )

		

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission