Due to maintenance work, this service will be unavailable from
Mon Nov 11 17:30 until
Tue Nov 12 09:00
CET.
Apologies for the inconvenience.
PROSITE entry PS51155
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | CHIT_BIND_RR_2 |
| Accession [info] | PS51155 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-OCT-2005 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00206 |
| Associated ProRule [info] | PRU00497 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Chitin-binding type R&R domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=68; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=63; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1725450; R2=0.0164134; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=386; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=319; N_SCORE=7.4; MODE=1; TEXT='R?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='D'; M= -7, 3,-27, 8, 5,-22,-10, -7,-21, -4,-18,-14, -1, 3, -3, -8, -3, -8,-18,-28,-16, 0; /M: SY='G'; M= -3, -2,-27, 0, -4,-24, 16, -8,-26,-10,-21,-15, 0,-10, -8,-10, -2,-11,-21,-22,-17, -7; /M: SY='S'; M= -2, -1,-23, -1, 2,-22, -3, -5,-21, -4,-21,-14, 3, -2, 0, -7, 9, 1,-18,-29,-15, 0; /M: SY='Y'; M=-18,-20,-27,-22,-19, 32,-28, 7, -1,-12, 1, -1,-18,-27,-15, -9,-18,-10, -7, 18, 55,-19; /M: SY='E'; M= 0, 2,-22, 1, 4,-21,-13, -3,-18, 4,-18,-11, 2,-13, 2, 1, 4, 0,-13,-27,-12, 2; /M: SY='F'; M=-16,-23,-23,-28,-23, 45,-26, -3, -1,-20, 4, 0,-17,-27,-23,-15,-16, -8, -4, 8, 37,-22; /M: SY='G'; M= 3, -1,-22, -3, -2,-23, 10, -7,-23, -6,-21,-13, 4,-15, -2, -6, 6, -5,-17,-26,-18, -3; /M: SY='Y'; M=-15,-20,-26,-22,-20, 31,-26, 7, -1,-15, 1, -1,-18,-28,-16,-13,-16, -9, -6, 18, 54,-20; /M: SY='E'; M= -5, 2,-25, 4, 17,-23,-12, 2,-21, 0,-16,-11, 0,-11, 9, -2, 2, -5,-19,-27,-12, 13; /M: SY='T'; M= 3,-13,-17,-17,-13,-11,-15,-20, 2,-13, -2, -2,-11,-16,-12,-13, 1, 10, 8,-26,-12,-13; /M: SY='E'; M= -3, 5,-25, 8, 10,-28, -6, -5,-24, 0,-24,-16, 4, 1, 5, -5, 4, -4,-21,-29,-19, 7; /M: SY='D'; M=-14, 36,-26, 42, 11,-29, -9, 6,-30, -1,-27,-23, 26,-13, 0, -6, 3, -6,-27,-36,-15, 5; /M: SY='G'; M= -2, -5,-27, -4, -8,-26, 25,-10,-27,-12,-24,-16, -1, -8, -9,-14, 1,-11,-21,-24,-20, -9; /M: SY='I'; M= -6,-11,-24,-15, -8,-12,-18,-11, 1,-10, -4, 0, -6,-13, -2,-10, -4, -2, -3,-24, -8, -7; /M: SY='S'; M= -5, -3,-23, -5, -5,-14, -4, -2,-20, -2,-19,-11, 2,-16, -3, 2, 3, 0,-15,-23, -7, -5; /M: SY='R'; M= -4, -5,-25, -6, -1,-20, -4, 0,-21, 2,-17, -9, -1,-16, 5, 9, -2, -7,-17,-21,-10, 0; /M: SY='E'; M= -7, 2,-25, 3, 13,-16,-16, -1,-18, 0,-15,-11, 0,-13, 4, -3, -1, -5,-17,-20, -6, 8; /M: SY='E'; M= -3, 0,-23, 1, 18,-20,-16, -2,-17, -1,-15,-10, -1,-10, 10, -4, 4, -1,-16,-27,-12, 13; /M: SY='K'; M= -8, -5,-25, -5, 4,-14,-16, -3,-18, 6,-16, -7, -3,-13, 4, 6, -3, -5,-14,-20, -5, 3; /M: SY='G'; M= 0, -2,-25, -1, -8,-24, 25,-12,-30, -8,-23,-17, 2,-16, -9, -7, 3, -8,-21,-24,-21, -9; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='Y'; M= -8, -9,-17, -9, -4, -3,-17, 5, -4, -3, -4, 0, -7,-15, 1, -1, -7, -4, -3, -9, 9, -3; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='E'; M= -5, -5,-17, -3, 4, -9,-13, -5, -5, -4, -1, -3, -6, -7, -1, -6, -6, -5, -6,-14, -6, 1; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='E'; M= -7, 5,-19, 7, 8,-17,-11, -1,-15, 4,-14, -8, 3, -9, 2, -1, -1, -4,-12,-19, -7, 5; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='E'; M= -4, 5,-22, 4, 9,-21,-11, -1,-19, 5,-17,-10, 7, -9, 8, 7, 1, -5,-18,-25,-13, 7; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='D'; M= -7, 6,-26, 10, 7,-25,-14, 0,-23, 3,-21,-14, 3, -2, 3, 1, 0, -4,-19,-29,-13, 4; /M: SY='G'; M= -1, -4,-26, -7,-14,-25, 43,-16,-30,-15,-26,-17, 6,-18,-14,-16, 4,-11,-24,-24,-25,-14; /M: SY='D'; M= -6, 10,-23, 11, 3,-24,-11, -6,-20, 0,-19,-14, 6, -9, -1, -4, 3, 1,-15,-30,-15, 1; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='D'; M= -4, 10,-17, 13, 7,-19, -5, 1,-17, -2,-16,-12, 6, 0, 1, -6, 2, -3,-15,-21,-12, 4; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='G'; M= -4, -5,-13, -6, -6, -8, 1,-10, -6,-10, -2, -3, -3,-12, -7,-10, -4, -5, -6,-13, -8, -7; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='V'; M= 3, -8,-12,-11, -7, -8,-14,-11, 0, -5, -6, -3, -6,-14, -8, -5, 2, 3, 7,-21, -8, -8; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='V'; M= -1,-22,-16,-25,-21, -5,-27,-24, 18,-12, 4, 6,-20,-23,-18,-13, -7, 3, 28,-26, -8,-21; /M: SY='R'; M= -8, -4,-23, -6, 1,-17,-19, 3,-15, 6,-14, -4, -2,-15, 7, 9, -1, 0,-11,-23, -4, 3; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='S'; M= 0, -4, -9, -6, -1,-14, -9, -9,-18, -8,-20,-13, 0,-15, -2, -8, 13, 5,-12,-26,-11, -1; /M: SY='Y'; M=-19,-20,-28,-22,-20, 35,-29, 12, 0,-13, 1, 0,-19,-29,-14,-12,-18, -9, -8, 23, 66,-20; /M: SY='S'; M= 1, -4,-19, -4, -2,-19, 6, -9,-23, -5,-24,-15, 3,-14, -2, -4, 16, 4,-15,-28,-14, -2; /M: SY='Y'; M=-14,-24,-27,-26,-22, 25,-27, -1, 1,-17, 3, 0,-22,-28,-16,-14,-20,-11, -4, 26, 43,-20; /M: SY='I'; M= -7,-19,-21,-22,-17, -5,-27,-18, 13,-14, 5, 6,-16,-17,-12,-12, -9, 1, 13,-22, -4,-16; /M: SY='D'; M= -6, 15,-24, 19, 5,-27, 2, -2,-27, -5,-21,-16, 9,-13, -1, -8, 3, -5,-21,-31,-17, 2; /M: SY='P'; M= -1, -7,-31, -1, 4,-28,-13,-13,-21, -7,-25,-18, -9, 42, -6,-15, -2, -6,-23,-29,-24, -4; /M: SY='D'; M=-12, 29,-26, 38, 17,-30,-11, -1,-31, 1,-25,-22, 14,-11, 2, -6, 2, -6,-24,-33,-17, 9; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='G'; M= 0, -6,-28, -7,-18,-29, 61,-18,-38,-18,-29,-20, 3,-19,-18,-18, 2,-16,-29,-22,-29,-18; /M: SY='R'; M=-10, -3,-25, -4, 3,-18,-21, -2,-14, 9,-15, -6, -1,-15, 5, 10, -4, -4,-10,-24, -7, 3; /M: M= -9,-11,-25,-11, -4,-14,-19, -9, -7, -3, -6, -1,-10, -8, -3, -1, -8, -3, -5,-22, -6, -5; /M: SY='R'; M=-13,-15,-25,-16, -9, -3,-25, 2, -5, 0, -6, 0,-11,-22, -2, 13,-11, -8, -2,-13, 10, -9; /M: SY='T'; M= -5, -9,-19,-12, -6,-11,-20,-13, -5, -5, -8, -5, -6,-16, -6, -3, 2, 11, 1,-25, -9, -6; /M: SY='V'; M= -3,-25,-14,-28,-26, 1,-29,-26, 24,-19, 9, 8,-23,-26,-24,-18, -9, 2, 35,-26, -6,-25; /M: SY='E'; M=-10, 6,-24, 5, 7,-17,-16, 7,-21, 3,-19,-11, 6,-14, 6, 3, 2, -1,-18,-25, -4, 5; /M: SY='Y'; M=-19,-20,-29,-21,-20, 31,-30, 16, 1,-11, 2, 1,-20,-30,-12,-11,-20,-10, -8, 26, 73,-20; /M: SY='V'; M= -2,-14,-18,-18,-13, -6,-22,-16, 5,-12, -2, -1,-12,-19,-13,-12, -2, 8, 11,-21, -4,-14; /M: SY='A'; M= 38,-10, -8,-19,-11,-18, -3,-20, -8,-11,-10,-10,-10,-12,-11,-19, 11, 4, 3,-23,-19,-11; /M: SY='D'; M=-13, 34,-28, 46, 12,-34, 0, -2,-35, -2,-28,-25, 18,-12, -2, -9, 2, -8,-27,-35,-19, 4; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='E'; M= -6, 4,-27, 8, 19,-27, -9, 5,-27, 7,-21,-14, 2, -7, 8, 1, -1, -9,-23,-27,-14, 12; /M: SY='N'; M= -7, 7,-22, 1, -2,-13, -6, -1,-18, -2,-17,-11, 14,-17, -3, -1, 3, 1,-17,-27,-11, -3; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-19,-30, 68,-20,-40,-18,-30,-20, 0,-20,-19,-19, 0,-20,-30,-20,-30,-19; /M: SY='F'; M=-20,-25,-24,-31,-25, 56,-30, -2, 0,-21, 5, 0,-20,-30,-26,-15,-19,-10, -5, 18, 52,-25; /M: SY='R'; M=-14, -5,-27, -6, 4,-22,-20, 13,-19, 11,-15, -4, 0,-17, 16, 24, -6,-10,-17,-23, -5, 8; /M: SY='P'; M= 10,-18,-23,-19,-11,-18,-18,-20, 0,-14,-10, -6,-17, 17,-12,-20, -4, -4, 1,-26,-18,-14; /M: SY='E'; M= -6, -8,-21, -7, 1,-16,-22, -6, -4, -4, -7, -3, -8,-17, 0, -4, -3, -2, 1,-27, -9, 0; /M: SY='G'; M= -2,-11,-23,-12,-11,-16, 3,-17, -7,-14,-11, -6, -8,-15,-12,-16, -1, -6, -2,-25,-15,-13; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='N'; M= -4, 4,-16, 3, 4,-15, -7, 2,-14, 2,-14, -7, 5, -8, 4, 1, 2, -2,-12,-19, -8, 3; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='D'; M= -3, 7,-23, 8, 4,-23,-11, -7,-18, -2,-17,-13, 4, -5, -1, -6, 2, -2,-15,-29,-15, 0; /M: SY='H'; M= -2, 0,-21, -4, -2,-14,-13, 8,-12, -7,-14, -8, 6,-14, -3, -7, 1, -3,-11,-28, -7, -4; /M: SY='L'; M= -5,-16,-22,-19,-11, -5,-21,-12, 3,-13, 8, 4,-14,-21, -8, -9,-11, -4, 1,-18, -2,-10; /M: SY='P'; M= -9,-17,-38, -8, 2,-30,-19,-17,-21, -7,-29,-19,-17, 77, -8,-16, -9,-10,-29,-29,-28, -8; /M: SY='T'; M= 2, -8,-21,-11, -5,-15,-10,-14, -6, -9, -8, -6, -6,-14, -5,-11, 0, 3, -4,-23,-10, -6; /M: SY='P'; M= 3,-11,-23,-12, -6,-18,-12,-13,-10, -8,-13, -9, -9, 6, -8,-12, 0, 0, -7,-25,-14, -9; /M: SY='P'; M= -3,-10,-29, -7, -2,-22,-12,-12,-15, -8,-19,-12,-10, 28, -8,-14, -4, -5,-16,-27,-18, -7; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 84 in 83 different sequences |
| Number of true positive hits | 84 in 83 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 1 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 2 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Chitin-binding type R&R |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
83 sequences
CU01_ANOGA (Q17015), CU02_HOMAM (P81386), CU02_LONON (P85196), CU03_HOMAM (P81387), CU03_LONON (P85197), CU04_HOMAM (P81388), CU05_HOMAM (P81389), CU07_LOCMI (P11733), CU08_LOCMI (P11734), CU109_IXORI (P84251), CU12_HYACE (P45589), CU14A_LIMPO (P83354), CU14B_LIMPO (P83355), CU14_MANSE (P13229), CU15_MANSE (Q94984), CU168_IXORI (P84252), CU16_MANSE (Q25504), CU17_BOMMO (O02387), CU18A_LOCMI (P83994), CU18B_LOCMI (P83995), CU198_LOCMI (P82166), CU19_ARADI (P80515), CU19_LOCMI (P45583), CU1A_HOMAM (P81384), CU1B_HOMAM (P81385), CU20_MANSE (Q8T635), CU20_TENMO (P26967), CU21_LOCMI (P81225), CU22_BOMMO (O02388), CU22_TENMO (P26968), CU24_ARADI (P80516), CU26_ARADI (P80517), CU27_MANSE (Q8T4J9), CU30_BOMMO (Q08738), CU36A_MANSE (Q8T634), CU36_MANSE (Q8MUC5), CU55_ARADI (P80518), CU57_ARADI (P80519), CU66_HYACE (P45590), CUA1A_TENMO (P80681), CUA2B_TENMO (P80682), CUA3A_TENMO (P80683), CUC11_CANPG (P81589), CUD1_SCHGR (Q7M4F4), CUD2_SCHGR (Q7M4F3), CUD3_SCHGR (Q7M4E9), CUD4_LOCMI (P21799), CUD4_SCHGR (Q7M4F1), CUD5_LOCMI (P56561), CUD5_SCHGR (P56562), CUD6_SCHGR (Q7M4E8), CUD8_SCHGR (Q7M4F2), CUD9_SCHGR (Q7M4F0), CUO6_BLACR (P82119), CUO7_BLACR (P82120), CUO8_BLACR (P82121), CUP1_SARBU (P14485), CUP4_SARBU (P14486), CUP7_DROME (P27779), CUP8_DROME (P27780), CUPA1_CANPG (P81575), CUPA2_CANPG (P81576), CUPA3_CANPG (P81577), CUPA4_CANPG (P81578), CUPA5_CANPG (P81579), CUPP_DROME (P14484), CUPP_DROPS (P16369), LCP1_DROME (P02839), LCP1_DROMI (P91627), LCP1_HELAM (O02443), LCP2A_DROME (Q7JZV0), LCP2_DROME (P07187), LCP2_DROMI (P91629), LCP34_DROMI (Q01774), LCP3_DROME (P07188), LCP4_DROME (P07189), LCP51_DROME (C0HL62), LCP52_DROME (C0HL63), LCP81_DROME (C0HL64), LCP82_DROME (C0HL65), LCP9_DROME (P82384), MBN_DROME (P52302), RESIL_DROME (Q9V7U0)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot 'Partial' sequences |
1 sequence
CUP6_SARBU (P14487) |