Entry: PS51155

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] CHIT_BIND_RR_2
Accession [info] PS51155
Entry type [info] MATRIX
Date [info] OCT-2005 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00206
Associated ProRule [info] PRU00497

Name and characterization of the entry

Description [info] Chitin-binding type R&R domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=68;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=63;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1725450; R2=0.0164134; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2553.83069; R2=17.64550; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=386; N_SCORE=8.5; H_SCORE=8289; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=317; N_SCORE=7.4; H_SCORE=7742; MODE=1; TEXT='R?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D'; M= -7,  3,-27,  8,  5,-22,-10, -7,-21, -4,-18,-14, -1,  3, -3, -8, -3, -8,-18,-28,-16,  0;
/M: SY='G'; M= -3, -2,-27,  0, -4,-24, 16, -8,-26,-10,-21,-15,  0,-10, -8,-10, -2,-11,-21,-22,-17, -7;
/M: SY='S'; M= -2, -1,-23, -1,  2,-22, -3, -5,-21, -4,-21,-14,  3, -2,  0, -7,  9,  1,-18,-29,-15,  0;
/M: SY='Y'; M=-18,-20,-27,-22,-19, 32,-28,  7, -1,-12,  1, -1,-18,-27,-15, -9,-18,-10, -7, 18, 55,-19;
/M: SY='E'; M=  0,  2,-22,  1,  4,-21,-13, -3,-18,  4,-18,-11,  2,-13,  2,  1,  4,  0,-13,-27,-12,  2;
/M: SY='F'; M=-16,-23,-23,-28,-23, 45,-26, -3, -1,-20,  4,  0,-17,-27,-23,-15,-16, -8, -4,  8, 37,-22;
/M: SY='G'; M=  3, -1,-22, -3, -2,-23, 10, -7,-23, -6,-21,-13,  4,-15, -2, -6,  6, -5,-17,-26,-18, -3;
/M: SY='Y'; M=-15,-20,-26,-22,-20, 31,-26,  7, -1,-15,  1, -1,-18,-28,-16,-13,-16, -9, -6, 18, 54,-20;
/M: SY='E'; M= -5,  2,-25,  4, 17,-23,-12,  2,-21,  0,-16,-11,  0,-11,  9, -2,  2, -5,-19,-27,-12, 13;
/M: SY='T'; M=  3,-13,-17,-17,-13,-11,-15,-20,  2,-13, -2, -2,-11,-16,-12,-13,  1, 10,  8,-26,-12,-13;
/M: SY='E'; M= -3,  5,-25,  8, 10,-28, -6, -5,-24,  0,-24,-16,  4,  1,  5, -5,  4, -4,-21,-29,-19,  7;
/M: SY='D'; M=-14, 36,-26, 42, 11,-29, -9,  6,-30, -1,-27,-23, 26,-13,  0, -6,  3, -6,-27,-36,-15,  5;
/M: SY='G'; M= -2, -5,-27, -4, -8,-26, 25,-10,-27,-12,-24,-16, -1, -8, -9,-14,  1,-11,-21,-24,-20, -9;
/M: SY='I'; M= -6,-11,-24,-15, -8,-12,-18,-11,  1,-10, -4,  0, -6,-13, -2,-10, -4, -2, -3,-24, -8, -7;
/M: SY='S'; M= -5, -3,-23, -5, -5,-14, -4, -2,-20, -2,-19,-11,  2,-16, -3,  2,  3,  0,-15,-23, -7, -5;
/M: SY='R'; M= -4, -5,-25, -6, -1,-20, -4,  0,-21,  2,-17, -9, -1,-16,  5,  9, -2, -7,-17,-21,-10,  0;
/M: SY='E'; M= -7,  2,-25,  3, 13,-16,-16, -1,-18,  0,-15,-11,  0,-13,  4, -3, -1, -5,-17,-20, -6,  8;
/M: SY='E'; M= -3,  0,-23,  1, 18,-20,-16, -2,-17, -1,-15,-10, -1,-10, 10, -4,  4, -1,-16,-27,-12, 13;
/M: SY='K'; M= -8, -5,-25, -5,  4,-14,-16, -3,-18,  6,-16, -7, -3,-13,  4,  6, -3, -5,-14,-20, -5,  3;
/M: SY='G'; M=  0, -2,-25, -1, -8,-24, 25,-12,-30, -8,-23,-17,  2,-16, -9, -7,  3, -8,-21,-24,-21, -9;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='Y'; M= -8, -9,-17, -9, -4, -3,-17,  5, -4, -3, -4,  0, -7,-15,  1, -1, -7, -4, -3, -9,  9, -3; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='E'; M= -5, -5,-17, -3,  4, -9,-13, -5, -5, -4, -1, -3, -6, -7, -1, -6, -6, -5, -6,-14, -6,  1; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='E'; M= -7,  5,-19,  7,  8,-17,-11, -1,-15,  4,-14, -8,  3, -9,  2, -1, -1, -4,-12,-19, -7,  5; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='E'; M= -4,  5,-22,  4,  9,-21,-11, -1,-19,  5,-17,-10,  7, -9,  8,  7,  1, -5,-18,-25,-13,  7; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='D'; M= -7,  6,-26, 10,  7,-25,-14,  0,-23,  3,-21,-14,  3, -2,  3,  1,  0, -4,-19,-29,-13,  4;
/M: SY='G'; M= -1, -4,-26, -7,-14,-25, 43,-16,-30,-15,-26,-17,  6,-18,-14,-16,  4,-11,-24,-24,-25,-14;
/M: SY='D'; M= -6, 10,-23, 11,  3,-24,-11, -6,-20,  0,-19,-14,  6, -9, -1, -4,  3,  1,-15,-30,-15,  1;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='D'; M= -4, 10,-17, 13,  7,-19, -5,  1,-17, -2,-16,-12,  6,  0,  1, -6,  2, -3,-15,-21,-12,  4; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='G'; M= -4, -5,-13, -6, -6, -8,  1,-10, -6,-10, -2, -3, -3,-12, -7,-10, -4, -5, -6,-13, -8, -7; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='V'; M=  3, -8,-12,-11, -7, -8,-14,-11,  0, -5, -6, -3, -6,-14, -8, -5,  2,  3,  7,-21, -8, -8; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='V'; M= -1,-22,-16,-25,-21, -5,-27,-24, 18,-12,  4,  6,-20,-23,-18,-13, -7,  3, 28,-26, -8,-21;
/M: SY='R'; M= -8, -4,-23, -6,  1,-17,-19,  3,-15,  6,-14, -4, -2,-15,  7,  9, -1,  0,-11,-23, -4,  3;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='S'; M=  0, -4, -9, -6, -1,-14, -9, -9,-18, -8,-20,-13,  0,-15, -2, -8, 13,  5,-12,-26,-11, -1;
/M: SY='Y'; M=-19,-20,-28,-22,-20, 35,-29, 12,  0,-13,  1,  0,-19,-29,-14,-12,-18, -9, -8, 23, 66,-20;
/M: SY='S'; M=  1, -4,-19, -4, -2,-19,  6, -9,-23, -5,-24,-15,  3,-14, -2, -4, 16,  4,-15,-28,-14, -2;
/M: SY='Y'; M=-14,-24,-27,-26,-22, 25,-27, -1,  1,-17,  3,  0,-22,-28,-16,-14,-20,-11, -4, 26, 43,-20;
/M: SY='I'; M= -7,-19,-21,-22,-17, -5,-27,-18, 13,-14,  5,  6,-16,-17,-12,-12, -9,  1, 13,-22, -4,-16;
/M: SY='D'; M= -6, 15,-24, 19,  5,-27,  2, -2,-27, -5,-21,-16,  9,-13, -1, -8,  3, -5,-21,-31,-17,  2;
/M: SY='P'; M= -1, -7,-31, -1,  4,-28,-13,-13,-21, -7,-25,-18, -9, 42, -6,-15, -2, -6,-23,-29,-24, -4;
/M: SY='D'; M=-12, 29,-26, 38, 17,-30,-11, -1,-31,  1,-25,-22, 14,-11,  2, -6,  2, -6,-24,-33,-17,  9;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='G'; M=  0, -6,-28, -7,-18,-29, 61,-18,-38,-18,-29,-20,  3,-19,-18,-18,  2,-16,-29,-22,-29,-18;
/M: SY='R'; M=-10, -3,-25, -4,  3,-18,-21, -2,-14,  9,-15, -6, -1,-15,  5, 10, -4, -4,-10,-24, -7,  3;
/M:         M= -9,-11,-25,-11, -4,-14,-19, -9, -7, -3, -6, -1,-10, -8, -3, -1, -8, -3, -5,-22, -6, -5;
/M: SY='R'; M=-13,-15,-25,-16, -9, -3,-25,  2, -5,  0, -6,  0,-11,-22, -2, 13,-11, -8, -2,-13, 10, -9;
/M: SY='T'; M= -5, -9,-19,-12, -6,-11,-20,-13, -5, -5, -8, -5, -6,-16, -6, -3,  2, 11,  1,-25, -9, -6;
/M: SY='V'; M= -3,-25,-14,-28,-26,  1,-29,-26, 24,-19,  9,  8,-23,-26,-24,-18, -9,  2, 35,-26, -6,-25;
/M: SY='E'; M=-10,  6,-24,  5,  7,-17,-16,  7,-21,  3,-19,-11,  6,-14,  6,  3,  2, -1,-18,-25, -4,  5;
/M: SY='Y'; M=-19,-20,-29,-21,-20, 31,-30, 16,  1,-11,  2,  1,-20,-30,-12,-11,-20,-10, -8, 26, 73,-20;
/M: SY='V'; M= -2,-14,-18,-18,-13, -6,-22,-16,  5,-12, -2, -1,-12,-19,-13,-12, -2,  8, 11,-21, -4,-14;
/M: SY='A'; M= 38,-10, -8,-19,-11,-18, -3,-20, -8,-11,-10,-10,-10,-12,-11,-19, 11,  4,  3,-23,-19,-11;
/M: SY='D'; M=-13, 34,-28, 46, 12,-34,  0, -2,-35, -2,-28,-25, 18,-12, -2, -9,  2, -8,-27,-35,-19,  4;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='E'; M= -6,  4,-27,  8, 19,-27, -9,  5,-27,  7,-21,-14,  2, -7,  8,  1, -1, -9,-23,-27,-14, 12;
/M: SY='N'; M= -7,  7,-22,  1, -2,-13, -6, -1,-18, -2,-17,-11, 14,-17, -3, -1,  3,  1,-17,-27,-11, -3;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-19,-30, 68,-20,-40,-18,-30,-20,  0,-20,-19,-19,  0,-20,-30,-20,-30,-19;
/M: SY='F'; M=-20,-25,-24,-31,-25, 56,-30, -2,  0,-21,  5,  0,-20,-30,-26,-15,-19,-10, -5, 18, 52,-25;
/M: SY='R'; M=-14, -5,-27, -6,  4,-22,-20, 13,-19, 11,-15, -4,  0,-17, 16, 24, -6,-10,-17,-23, -5,  8;
/M: SY='P'; M= 10,-18,-23,-19,-11,-18,-18,-20,  0,-14,-10, -6,-17, 17,-12,-20, -4, -4,  1,-26,-18,-14;
/M: SY='E'; M= -6, -8,-21, -7,  1,-16,-22, -6, -4, -4, -7, -3, -8,-17,  0, -4, -3, -2,  1,-27, -9,  0;
/M: SY='G'; M= -2,-11,-23,-12,-11,-16,  3,-17, -7,-14,-11, -6, -8,-15,-12,-16, -1, -6, -2,-25,-15,-13;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='N'; M= -4,  4,-16,  3,  4,-15, -7,  2,-14,  2,-14, -7,  5, -8,  4,  1,  2, -2,-12,-19, -8,  3; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='D'; M= -3,  7,-23,  8,  4,-23,-11, -7,-18, -2,-17,-13,  4, -5, -1, -6,  2, -2,-15,-29,-15,  0;
/M: SY='H'; M= -2,  0,-21, -4, -2,-14,-13,  8,-12, -7,-14, -8,  6,-14, -3, -7,  1, -3,-11,-28, -7, -4;
/M: SY='L'; M= -5,-16,-22,-19,-11, -5,-21,-12,  3,-13,  8,  4,-14,-21, -8, -9,-11, -4,  1,-18, -2,-10;
/M: SY='P'; M= -9,-17,-38, -8,  2,-30,-19,-17,-21, -7,-29,-19,-17, 77, -8,-16, -9,-10,-29,-29,-28, -8;
/M: SY='T'; M=  2, -8,-21,-11, -5,-15,-10,-14, -6, -9, -8, -6, -6,-14, -5,-11,  0,  3, -4,-23,-10, -6;
/M: SY='P'; M=  3,-11,-23,-12, -6,-18,-12,-13,-10, -8,-13, -9, -9,  6, -8,-12,  0,  0, -7,-25,-14, -9;
/M: SY='P'; M= -3,-10,-29, -7, -2,-22,-12,-12,-15, -8,-19,-12,-10, 28, -8,-14, -4, -5,-16,-27,-18, -7;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_09 which contains 546'439 sequence entries.


Total number of hits 82 in 81 different sequences
Number of true positive hits 82 in 81 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 1
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 2
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Chitin-binding type R&R
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
81 sequences

CU01_ANOGA  (Q17015), CU02_HOMAM  (P81386), CU02_LONON  (P85196), 
CU03_HOMAM  (P81387), CU03_LONON  (P85197), CU04_HOMAM  (P81388), 
CU05_HOMAM  (P81389), CU07_LOCMI  (P11733), CU08_LOCMI  (P11734), 
CU109_IXORI (P84251), CU12_HYACE  (P45589), CU14A_LIMPO (P83354), 
CU14B_LIMPO (P83355), CU14_MANSE  (P13229), CU15_MANSE  (Q94984), 
CU168_IXORI (P84252), CU16_MANSE  (Q25504), CU17_BOMMO  (O02387), 
CU18A_LOCMI (P83994), CU18B_LOCMI (P83995), CU198_LOCMI (P82166), 
CU19_ARADI  (P80515), CU19_LOCMI  (P45583), CU1A_HOMAM  (P81384), 
CU1B_HOMAM  (P81385), CU20_MANSE  (Q8T635), CU20_TENMO  (P26967), 
CU21_LOCMI  (P81225), CU22_BOMMO  (O02388), CU22_TENMO  (P26968), 
CU24_ARADI  (P80516), CU26_ARADI  (P80517), CU27_MANSE  (Q8T4J9), 
CU30_BOMMO  (Q08738), CU36A_MANSE (Q8T634), CU36_MANSE  (Q8MUC5), 
CU55_ARADI  (P80518), CU57_ARADI  (P80519), CU66_HYACE  (P45590), 
CUA1A_TENMO (P80681), CUA2B_TENMO (P80682), CUA3A_TENMO (P80683), 
CUC11_CANPG (P81589), CUD1_SCHGR  (Q7M4F4), CUD2_SCHGR  (Q7M4F3), 
CUD3_SCHGR  (Q7M4E9), CUD4_LOCMI  (P21799), CUD4_SCHGR  (Q7M4F1), 
CUD5_LOCMI  (P56561), CUD5_SCHGR  (P56562), CUD6_SCHGR  (Q7M4E8), 
CUD8_SCHGR  (Q7M4F2), CUD9_SCHGR  (Q7M4F0), CULP1_HELAM (O02443), 
CUO6_BLACR  (P82119), CUO7_BLACR  (P82120), CUO8_BLACR  (P82121), 
CUP1_SARBU  (P14485), CUP4_SARBU  (P14486), CUP7_DROME  (P27779), 
CUP8_DROME  (P27780), CUPA1_CANPG (P81575), CUPA2_CANPG (P81576), 
CUPA3_CANPG (P81577), CUPA4_CANPG (P81578), CUPA5_CANPG (P81579), 
CUPP_DROME  (P14484), CUPP_DROPS  (P16369), LCP1_DROME  (P02839), 
LCP1_DROMI  (P91627), LCP2A_DROME (Q7JZV0), LCP2_DROME  (P07187), 
LCP2_DROMI  (P91629), LCP34_DROMI (Q01774), LCP3_DROME  (P07188), 
LCP4_DROME  (P07189), LCP5_DROME  (P92192), LCP8_DROME  (P92201), 
LCP9_DROME  (P82384), MBN_DROME   (P52302), RESIL_DROME (Q9V7U0)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
'Partial' sequences
1 sequence

CUP6_SARBU  (P14487)

		

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission