Due to maintenance work, this service will not be available Thursday August 21st between 7am and 8am CEST.
Entry: PS51155

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] CHIT_BIND_RR_2
Accession [info] PS51155
Entry type [info] MATRIX
Date [info] OCT-2005 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00206
Associated ProRule [info] PRU00497

Name and characterization of the entry

Description [info] Chitin-binding type R&R domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=68;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=63;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1725450; R2=0.0164134; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2553.83069; R2=17.64550; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=386; N_SCORE=8.5; H_SCORE=8289; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=317; N_SCORE=7.4; H_SCORE=7742; MODE=1; TEXT='R?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D'; M= -7,  3,-27,  8,  5,-22,-10, -7,-21, -4,-18,-14, -1,  3, -3, -8, -3, -8,-18,-28,-16,  0;
/M: SY='G'; M= -3, -2,-27,  0, -4,-24, 16, -8,-26,-10,-21,-15,  0,-10, -8,-10, -2,-11,-21,-22,-17, -7;
/M: SY='S'; M= -2, -1,-23, -1,  2,-22, -3, -5,-21, -4,-21,-14,  3, -2,  0, -7,  9,  1,-18,-29,-15,  0;
/M: SY='Y'; M=-18,-20,-27,-22,-19, 32,-28,  7, -1,-12,  1, -1,-18,-27,-15, -9,-18,-10, -7, 18, 55,-19;
/M: SY='E'; M=  0,  2,-22,  1,  4,-21,-13, -3,-18,  4,-18,-11,  2,-13,  2,  1,  4,  0,-13,-27,-12,  2;
/M: SY='F'; M=-16,-23,-23,-28,-23, 45,-26, -3, -1,-20,  4,  0,-17,-27,-23,-15,-16, -8, -4,  8, 37,-22;
/M: SY='G'; M=  3, -1,-22, -3, -2,-23, 10, -7,-23, -6,-21,-13,  4,-15, -2, -6,  6, -5,-17,-26,-18, -3;
/M: SY='Y'; M=-15,-20,-26,-22,-20, 31,-26,  7, -1,-15,  1, -1,-18,-28,-16,-13,-16, -9, -6, 18, 54,-20;
/M: SY='E'; M= -5,  2,-25,  4, 17,-23,-12,  2,-21,  0,-16,-11,  0,-11,  9, -2,  2, -5,-19,-27,-12, 13;
/M: SY='T'; M=  3,-13,-17,-17,-13,-11,-15,-20,  2,-13, -2, -2,-11,-16,-12,-13,  1, 10,  8,-26,-12,-13;
/M: SY='E'; M= -3,  5,-25,  8, 10,-28, -6, -5,-24,  0,-24,-16,  4,  1,  5, -5,  4, -4,-21,-29,-19,  7;
/M: SY='D'; M=-14, 36,-26, 42, 11,-29, -9,  6,-30, -1,-27,-23, 26,-13,  0, -6,  3, -6,-27,-36,-15,  5;
/M: SY='G'; M= -2, -5,-27, -4, -8,-26, 25,-10,-27,-12,-24,-16, -1, -8, -9,-14,  1,-11,-21,-24,-20, -9;
/M: SY='I'; M= -6,-11,-24,-15, -8,-12,-18,-11,  1,-10, -4,  0, -6,-13, -2,-10, -4, -2, -3,-24, -8, -7;
/M: SY='S'; M= -5, -3,-23, -5, -5,-14, -4, -2,-20, -2,-19,-11,  2,-16, -3,  2,  3,  0,-15,-23, -7, -5;
/M: SY='R'; M= -4, -5,-25, -6, -1,-20, -4,  0,-21,  2,-17, -9, -1,-16,  5,  9, -2, -7,-17,-21,-10,  0;
/M: SY='E'; M= -7,  2,-25,  3, 13,-16,-16, -1,-18,  0,-15,-11,  0,-13,  4, -3, -1, -5,-17,-20, -6,  8;
/M: SY='E'; M= -3,  0,-23,  1, 18,-20,-16, -2,-17, -1,-15,-10, -1,-10, 10, -4,  4, -1,-16,-27,-12, 13;
/M: SY='K'; M= -8, -5,-25, -5,  4,-14,-16, -3,-18,  6,-16, -7, -3,-13,  4,  6, -3, -5,-14,-20, -5,  3;
/M: SY='G'; M=  0, -2,-25, -1, -8,-24, 25,-12,-30, -8,-23,-17,  2,-16, -9, -7,  3, -8,-21,-24,-21, -9;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='Y'; M= -8, -9,-17, -9, -4, -3,-17,  5, -4, -3, -4,  0, -7,-15,  1, -1, -7, -4, -3, -9,  9, -3; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='E'; M= -5, -5,-17, -3,  4, -9,-13, -5, -5, -4, -1, -3, -6, -7, -1, -6, -6, -5, -6,-14, -6,  1; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='E'; M= -7,  5,-19,  7,  8,-17,-11, -1,-15,  4,-14, -8,  3, -9,  2, -1, -1, -4,-12,-19, -7,  5; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='E'; M= -4,  5,-22,  4,  9,-21,-11, -1,-19,  5,-17,-10,  7, -9,  8,  7,  1, -5,-18,-25,-13,  7; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='D'; M= -7,  6,-26, 10,  7,-25,-14,  0,-23,  3,-21,-14,  3, -2,  3,  1,  0, -4,-19,-29,-13,  4;
/M: SY='G'; M= -1, -4,-26, -7,-14,-25, 43,-16,-30,-15,-26,-17,  6,-18,-14,-16,  4,-11,-24,-24,-25,-14;
/M: SY='D'; M= -6, 10,-23, 11,  3,-24,-11, -6,-20,  0,-19,-14,  6, -9, -1, -4,  3,  1,-15,-30,-15,  1;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='D'; M= -4, 10,-17, 13,  7,-19, -5,  1,-17, -2,-16,-12,  6,  0,  1, -6,  2, -3,-15,-21,-12,  4; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='G'; M= -4, -5,-13, -6, -6, -8,  1,-10, -6,-10, -2, -3, -3,-12, -7,-10, -4, -5, -6,-13, -8, -7; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='V'; M=  3, -8,-12,-11, -7, -8,-14,-11,  0, -5, -6, -3, -6,-14, -8, -5,  2,  3,  7,-21, -8, -8; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='V'; M= -1,-22,-16,-25,-21, -5,-27,-24, 18,-12,  4,  6,-20,-23,-18,-13, -7,  3, 28,-26, -8,-21;
/M: SY='R'; M= -8, -4,-23, -6,  1,-17,-19,  3,-15,  6,-14, -4, -2,-15,  7,  9, -1,  0,-11,-23, -4,  3;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='S'; M=  0, -4, -9, -6, -1,-14, -9, -9,-18, -8,-20,-13,  0,-15, -2, -8, 13,  5,-12,-26,-11, -1;
/M: SY='Y'; M=-19,-20,-28,-22,-20, 35,-29, 12,  0,-13,  1,  0,-19,-29,-14,-12,-18, -9, -8, 23, 66,-20;
/M: SY='S'; M=  1, -4,-19, -4, -2,-19,  6, -9,-23, -5,-24,-15,  3,-14, -2, -4, 16,  4,-15,-28,-14, -2;
/M: SY='Y'; M=-14,-24,-27,-26,-22, 25,-27, -1,  1,-17,  3,  0,-22,-28,-16,-14,-20,-11, -4, 26, 43,-20;
/M: SY='I'; M= -7,-19,-21,-22,-17, -5,-27,-18, 13,-14,  5,  6,-16,-17,-12,-12, -9,  1, 13,-22, -4,-16;
/M: SY='D'; M= -6, 15,-24, 19,  5,-27,  2, -2,-27, -5,-21,-16,  9,-13, -1, -8,  3, -5,-21,-31,-17,  2;
/M: SY='P'; M= -1, -7,-31, -1,  4,-28,-13,-13,-21, -7,-25,-18, -9, 42, -6,-15, -2, -6,-23,-29,-24, -4;
/M: SY='D'; M=-12, 29,-26, 38, 17,-30,-11, -1,-31,  1,-25,-22, 14,-11,  2, -6,  2, -6,-24,-33,-17,  9;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='G'; M=  0, -6,-28, -7,-18,-29, 61,-18,-38,-18,-29,-20,  3,-19,-18,-18,  2,-16,-29,-22,-29,-18;
/M: SY='R'; M=-10, -3,-25, -4,  3,-18,-21, -2,-14,  9,-15, -6, -1,-15,  5, 10, -4, -4,-10,-24, -7,  3;
/M:         M= -9,-11,-25,-11, -4,-14,-19, -9, -7, -3, -6, -1,-10, -8, -3, -1, -8, -3, -5,-22, -6, -5;
/M: SY='R'; M=-13,-15,-25,-16, -9, -3,-25,  2, -5,  0, -6,  0,-11,-22, -2, 13,-11, -8, -2,-13, 10, -9;
/M: SY='T'; M= -5, -9,-19,-12, -6,-11,-20,-13, -5, -5, -8, -5, -6,-16, -6, -3,  2, 11,  1,-25, -9, -6;
/M: SY='V'; M= -3,-25,-14,-28,-26,  1,-29,-26, 24,-19,  9,  8,-23,-26,-24,-18, -9,  2, 35,-26, -6,-25;
/M: SY='E'; M=-10,  6,-24,  5,  7,-17,-16,  7,-21,  3,-19,-11,  6,-14,  6,  3,  2, -1,-18,-25, -4,  5;
/M: SY='Y'; M=-19,-20,-29,-21,-20, 31,-30, 16,  1,-11,  2,  1,-20,-30,-12,-11,-20,-10, -8, 26, 73,-20;
/M: SY='V'; M= -2,-14,-18,-18,-13, -6,-22,-16,  5,-12, -2, -1,-12,-19,-13,-12, -2,  8, 11,-21, -4,-14;
/M: SY='A'; M= 38,-10, -8,-19,-11,-18, -3,-20, -8,-11,-10,-10,-10,-12,-11,-19, 11,  4,  3,-23,-19,-11;
/M: SY='D'; M=-13, 34,-28, 46, 12,-34,  0, -2,-35, -2,-28,-25, 18,-12, -2, -9,  2, -8,-27,-35,-19,  4;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='E'; M= -6,  4,-27,  8, 19,-27, -9,  5,-27,  7,-21,-14,  2, -7,  8,  1, -1, -9,-23,-27,-14, 12;
/M: SY='N'; M= -7,  7,-22,  1, -2,-13, -6, -1,-18, -2,-17,-11, 14,-17, -3, -1,  3,  1,-17,-27,-11, -3;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-19,-30, 68,-20,-40,-18,-30,-20,  0,-20,-19,-19,  0,-20,-30,-20,-30,-19;
/M: SY='F'; M=-20,-25,-24,-31,-25, 56,-30, -2,  0,-21,  5,  0,-20,-30,-26,-15,-19,-10, -5, 18, 52,-25;
/M: SY='R'; M=-14, -5,-27, -6,  4,-22,-20, 13,-19, 11,-15, -4,  0,-17, 16, 24, -6,-10,-17,-23, -5,  8;
/M: SY='P'; M= 10,-18,-23,-19,-11,-18,-18,-20,  0,-14,-10, -6,-17, 17,-12,-20, -4, -4,  1,-26,-18,-14;
/M: SY='E'; M= -6, -8,-21, -7,  1,-16,-22, -6, -4, -4, -7, -3, -8,-17,  0, -4, -3, -2,  1,-27, -9,  0;
/M: SY='G'; M= -2,-11,-23,-12,-11,-16,  3,-17, -7,-14,-11, -6, -8,-15,-12,-16, -1, -6, -2,-25,-15,-13;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='N'; M= -4,  4,-16,  3,  4,-15, -7,  2,-14,  2,-14, -7,  5, -8,  4,  1,  2, -2,-12,-19, -8,  3; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='D'; M= -3,  7,-23,  8,  4,-23,-11, -7,-18, -2,-17,-13,  4, -5, -1, -6,  2, -2,-15,-29,-15,  0;
/M: SY='H'; M= -2,  0,-21, -4, -2,-14,-13,  8,-12, -7,-14, -8,  6,-14, -3, -7,  1, -3,-11,-28, -7, -4;
/M: SY='L'; M= -5,-16,-22,-19,-11, -5,-21,-12,  3,-13,  8,  4,-14,-21, -8, -9,-11, -4,  1,-18, -2,-10;
/M: SY='P'; M= -9,-17,-38, -8,  2,-30,-19,-17,-21, -7,-29,-19,-17, 77, -8,-16, -9,-10,-29,-29,-28, -8;
/M: SY='T'; M=  2, -8,-21,-11, -5,-15,-10,-14, -6, -9, -8, -6, -6,-14, -5,-11,  0,  3, -4,-23,-10, -6;
/M: SY='P'; M=  3,-11,-23,-12, -6,-18,-12,-13,-10, -8,-13, -9, -9,  6, -8,-12,  0,  0, -7,-25,-14, -9;
/M: SY='P'; M= -3,-10,-29, -7, -2,-22,-12,-12,-15, -8,-19,-12,-10, 28, -8,-14, -4, -5,-16,-27,-18, -7;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 82 in 81 different sequences
Number of true positive hits 82 in 81 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 1
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 2
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Chitin-binding type R&R
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
81 sequences

CU01_ANOGA  (Q17015), CU02_HOMAM  (P81386), CU02_LONON  (P85196), 
CU03_HOMAM  (P81387), CU03_LONON  (P85197), CU04_HOMAM  (P81388), 
CU05_HOMAM  (P81389), CU07_LOCMI  (P11733), CU08_LOCMI  (P11734), 
CU109_IXORI (P84251), CU12_HYACE  (P45589), CU14A_LIMPO (P83354), 
CU14B_LIMPO (P83355), CU14_MANSE  (P13229), CU15_MANSE  (Q94984), 
CU168_IXORI (P84252), CU16_MANSE  (Q25504), CU17_BOMMO  (O02387), 
CU18A_LOCMI (P83994), CU18B_LOCMI (P83995), CU198_LOCMI (P82166), 
CU19_ARADI  (P80515), CU19_LOCMI  (P45583), CU1A_HOMAM  (P81384), 
CU1B_HOMAM  (P81385), CU20_MANSE  (Q8T635), CU20_TENMO  (P26967), 
CU21_LOCMI  (P81225), CU22_BOMMO  (O02388), CU22_TENMO  (P26968), 
CU24_ARADI  (P80516), CU26_ARADI  (P80517), CU27_MANSE  (Q8T4J9), 
CU30_BOMMO  (Q08738), CU36A_MANSE (Q8T634), CU36_MANSE  (Q8MUC5), 
CU55_ARADI  (P80518), CU57_ARADI  (P80519), CU66_HYACE  (P45590), 
CUA1A_TENMO (P80681), CUA2B_TENMO (P80682), CUA3A_TENMO (P80683), 
CUC11_CANPG (P81589), CUD1_SCHGR  (Q7M4F4), CUD2_SCHGR  (Q7M4F3), 
CUD3_SCHGR  (Q7M4E9), CUD4_LOCMI  (P21799), CUD4_SCHGR  (Q7M4F1), 
CUD5_LOCMI  (P56561), CUD5_SCHGR  (P56562), CUD6_SCHGR  (Q7M4E8), 
CUD8_SCHGR  (Q7M4F2), CUD9_SCHGR  (Q7M4F0), CULP1_HELAM (O02443), 
CUO6_BLACR  (P82119), CUO7_BLACR  (P82120), CUO8_BLACR  (P82121), 
CUP1_SARBU  (P14485), CUP4_SARBU  (P14486), CUP7_DROME  (P27779), 
CUP8_DROME  (P27780), CUPA1_CANPG (P81575), CUPA2_CANPG (P81576), 
CUPA3_CANPG (P81577), CUPA4_CANPG (P81578), CUPA5_CANPG (P81579), 
CUPP_DROME  (P14484), CUPP_DROPS  (P16369), LCP1_DROME  (P02839), 
LCP1_DROMI  (P91627), LCP2A_DROME (Q7JZV0), LCP2_DROME  (P07187), 
LCP2_DROMI  (P91629), LCP34_DROMI (Q01774), LCP3_DROME  (P07188), 
LCP4_DROME  (P07189), LCP5_DROME  (P92192), LCP8_DROME  (P92201), 
LCP9_DROME  (P82384), MBN_DROME   (P52302), RESIL_DROME (Q9V7U0)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
'Partial' sequences
1 sequence

CUP6_SARBU  (P14487)

		

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission