Entry: PS51163

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] YRDC
Accession [info] PS51163
Entry type [info] MATRIX
Date [info] NOV-2005 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAR-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00883
Associated ProRule [info] PRU00518

Name and characterization of the entry

Description [info] YrdC-like domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=186;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=181;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.3022302; R2=0.0090932; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5079.39459; R2=45.18108; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=902; N_SCORE=8.5; H_SCORE=40863; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=682; N_SCORE=6.5; H_SCORE=35893; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-6; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='A'; M=  4, -2,-20,  2,  4,-19, -9,-10,-12,  3,-10, -6, -5,  2,  3, -2,  1, -1,-10,-25,-13,  2;
/M: SY='D'; M=  2,  2,-18,  6,  5,-18,-10,-10,-15,  2,-10, -6, -2, -8,  5,  3,  0, -6,-12,-21,-12,  3;
/M: SY='A'; M=  8,  1,-19,  2,  2,-15, -7,-13, -4, -1, -4, -2, -1,-10,  0,-10,  2,  2, -4,-29,-14,  0;
/M: SY='I'; M=  0,-14,-15,-21,-18, 10,-16,-17, 25,-14, 19,  8,-11,-27,-16,-17, -9,  1, 20,-23,  6,-18;
/M: SY='E'; M=  5, -1,-19,  2, 13,-20,-12, -5,-15,  8,-12, -1, -2,  0, 11,  2,  0, -5,-14,-26,-15, 11;
/M: SY='Q'; M=  5, -3,-15,  1, 13,-22,-13, -9,-15,  7, -9,  0, -7, -1, 17,  6, -3, -5,-14,-22,-13, 14;
/M: SY='A'; M= 19, -7,-20,-11,-11, -7, -8,-21, 15, -9,  3,  7, -5,-19, -5,-15,  1,  7, 17,-37,-18,-11;
/M: SY='V'; M= 12,-12,-20,-14,-13,  1,-15,-21, 12, -7,  2,  3, -9,-21, -7, -8, -2,  4, 18,-28, -8,-13;
/M: SY='E'; M=  6,  3,-18,  9, 15,-23,-12, -8,-18,  8,-12, -4, -1, -4, 12,  3,  3, -4,-15,-25,-16, 13;
/M: SY='I'; M=  5,-11,-19,-13,-10, -2,-14,-13, 13, -8,  9,  8, -9,-20, -6,-11, -6,  1, 12,-25, -3,-10;
/M: SY='I'; M= -5,-14, -8,-20,-17, 13,-18,-14, 31,-18, 31, 16,-14,-31,-20,-21,-16,  1, 21,-24, 16,-17;
/M: SY='R'; M=  1, -1,-21,  2,  9,-16,-13,-10,-18, 14,-14,  5, -2, -4, 10, 16, -2,-10,-14,-21,-10,  8;
/M: SY='Q'; M=  8,  4,-19,  6,  8,-23, -5,-12,-16,  6,-15, -4,  4, -6, 12,  3,  3, -3,-16,-27,-20,  8;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='G'; M=  0,  3,-35, -4,-15,-30, 67,-28,-12, -8,-18,-19,  2,-10,-17,-19,  0,-18,-28,  3,-29,-16;
/M: SY='G'; M=  4, -1,-29, -4,  2,-22, 22,-16,-14,  6,-16, -5, -1, -5,  1, -6,  1,-10,-22,-10,-20,  1;
/M: SY='I'; M=  2,-17,-15,-24,-22,  4,-18,-18, 36,-17, 18,  8,-11,-26,-20,-20,-11,  4, 29,-29,  4,-22;
/M: SY='I'; M=  6,-16,-18,-23,-24,  3,-15,-23, 37,-17, 13,  6,-11,-31,-21,-18, -9,  4, 34,-28, -1,-24;
/M: SY='V'; M= 20, -9,-25,-13,-14, -8, -5,-22, 20,-10,  2,  6, -5,-21, -8,-15,  1,  6, 21,-36,-19,-14;
/M: SY='F'; M= -8,-21,-20,-27,-25, 25,-23,-19, 24,-16, 21,  2,-15,-32,-21,-15,-13, -3, 25,-10, 20,-25;
/M: SY='P'; M= -7,-15,-30, -8, 11,-33, -8,  2,-27, 15,-27,-26,-22, 82,  0, -6, -7, -2,-35,-27,-18,  2;
/M: SY='T'; M=  7,  1,-23, -8,-19,-20, -1,-21, -3,-10, -4, -5,  8, -4, -5,-26, 15, 32,  1,-37,-13,-12;
/M: SY='D'; M=  1, 21,-15, 41, 17,-34,-14,-13,-21,  3, -3,-13,  0, -8, -3,-12, -2, -9,-13,-29,-10, 10;
/M: SY='T'; M=  9, -2,-24,-10,-19,-19,  1,-22,  1,-10, -5, -5,  5, -6, -7,-25, 14, 30,  4,-35,-14,-14;
/M: SY='I'; M=  4,-10,-22,-15,-22, -3,  7,-26, 16,-14,  2, -5,-10,-26,-21,-14, -5,  0, 13,-17, -4,-22;
/M: SY='Y'; M=-32,-29,-50,-18,-21, 35,-27, -6, -8, -9, 22,-14,-33,-14,-13, -3,-16,-10,  6, 35, 67,-22;
/M: SY='G'; M=  6, -4,-37, -9,-11,-24, 32,  1, -6, -9,-14, -5, -1, -8, -8,-15,  1, -9,-15,-18,-24,-11;
/M: SY='L'; M= -7,-13, -7,-18,-16, 19,-19,-14, 27,-19, 33, 15,-16,-31,-20,-20,-17, -1, 17,-20, 21,-16;
/M: SY='A'; M= 12, -8,-23,-13,-14,-10, 12,-21,  8, -8, -2,  2, -5,-20,-12,-14, -1, -1,  5,-23,-19,-15;
/M: SY='C'; M=  2,-10, 50,-15, -2,-21,-13,-33, -5,-15, -4, -7, -5,-20,-10,-16, -2, -1, -2,-30,-38, -6;
/M: SY='D'; M=  0, 18,-23, 29,  0,-22,-10, -7,-17, -2, -7,-11, 10,-13, -3, -5,  1, -2,-13,-35, -9, -3;
/M: SY='A'; M= 13, -6,-15, -7, -3,-18, -4,-15,  0, -4, -5, -1, -6,  0, -3,-14,  2,  5,  0,-35,-23, -6;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='Y'; M= -4, -5,-19, -5, -7, -1, -9,-10, -7, -1,  0, -1, -3,-11, -2,  0, -2, -1, -5,-14,  2, -6; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='N'; M=  1, 20,-10, 14, -1,-14, -5, -9, -8,  0,-12, -7, 29,-15, -4,-10,  4,  4,-13,-39,-21, -3; D=-10;
/I:         I=-10; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
/M: SY='P'; M= -1, -1,-17,  4, 12,-21, -9, -3,-17,  9,-14, -9, -4, 18,  4, -2, -1, -5,-18,-22,-13,  8; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='E'; M=  6,  4,-17, 10, 13,-22,-10, -7,-17,  7,-11, -4, -1, -2,  8,  1,  2, -6,-13,-26,-16, 10; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='A'; M= 25, -2,-25, -4, -4,-15,  3,-19, -1, -3, -9,  2, -1,-11,  3,-10,  9,  8,  4,-36,-29, -4; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='I'; M=  5,-16,-11,-20,-20,  3,-20,-22, 31,-16, 12,  5,-12,-31,-20,-15, -8,  5, 31,-28,  1,-21; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='E'; M=  5,  2,-15,  7, 20,-25,-11, -9,-19, 10,-12, -4, -3,  0, 16,  4, -1, -8,-18,-21,-16, 18; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='R'; M= -2, -7,-19, -3,  2,-14,-15,-10,-20, 12,-15,  4, -6, -6, 17, 34, -5,-14,-13,-16, -8,  5;
/M: SY='I'; M= -3,-15,-11,-23,-20,  9,-16,-17, 38,-19, 27, 14,-11,-30,-20,-22,-14,  1, 26,-26,  9,-20;
/M: SY='Y'; M=-20,-24,-30,-19,-19, 28,-24,-15,-11, -5,  8, -8,-23,-22, -3, 19,-13,-18,  3, 17, 33,-17;
/M: SY='Q'; M=  5, -2,-16,  2, 12,-20,-13, -8,-16,  8,-11, -1, -4, -4, 14,  8,  1, -6,-12,-24,-14, 11;
/M: SY='I'; M=  1,-15,-19,-20,-16,  3,-14,-14, 17,-10, 11,  8,-10,-23, -7, -4, -8, -3, 15,-21,  0,-14;
/M: SY='K'; M= -1, -2,-28, -1, 16, -9,-11,-19,-19, 35,-18, 18, -2,  7,  2, 15, -1,-10,-18,-19, -8,  8;
/M: SY='G'; M=  2,  2,-26, -1,  0,-21, 12,-13,-15,  5,-16, -3,  5, -8,  7,  6, -2,-10,-20,-17,-19,  1;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='R'; M=-10,-18,-20,-10,-10, -6,-20,-10,-23,  6,-13,  0,-19,-11, 22, 62,-11,-25, -7, -3,  3, -2;
/M: SY='P'; M=  0,  0,-25, 10, 11,-34, -6, -3,-25,  6,-20,-24,-10, 39,  3, -7,  0, -2,-26,-29,-18,  4;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='K'; M=  0, -5,-16, -2,  3,-10,-10, -8,-10,  5, -8, -6, -6,  5,  3,  4,  0, -3, -9,-18, -8,  1; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='D'; M=  3, 12,-24, 13,  1,-21, -3, -7,-14,  2,-12, -7, 12, -7, -3,-11,  5,  2,-14,-34,-17, -2;
/M: SY='K'; M= -3,  2,-30,  0, 10,-14,-11,  2,-18, 21,-17, 12,  6,  2,  2,  6, -2, -8,-20,-27,-10,  5;
/M: SY='P'; M= -5,-14,-28, -8,  8,-34, -9,  9,-24,  7,-25,-28,-19, 76,  2, -8, -6,  0,-32,-32,-20,  1;
/M: SY='F'; M=-11,-16,-14,-23,-20, 36,-20,-14, 16,-15, 28,  6,-13,-31,-22,-17,-15, -5, 11,-13, 23,-20;
/M: SY='I'; M= 14, -8,-24,-14,-12,-12, -3,-17, 15, -8, -1,  1, -1,-10, -5,-17,  4,  9, 11,-35,-20,-12;
/M: SY='I'; M=  0,-16, -9,-21,-19,  9,-21,-19, 29,-17, 20,  8,-13,-31,-19,-16,-12,  3, 25,-25,  8,-19;
/M: SY='M'; M= -5,-17, -8,-24,-11, -2,-21, 14,  9, -7, 16, 23, -8,-27,-14,-12,-15, -5,  2,-25,  0,-12;
/M: SY='C'; M= -2,-15, 15,-21,-16, -2,-13,-27, 15,-17,  7, -2,-10,-29,-20,-16, -9, -2, 13,-22,-12,-18;
/M: SY='S'; M=  4, -5,-24, -2, -1,-18, -3, -6,-15,  2,-15, -6, -6,  2,  3,  4,  6, -2,-12,-24,-16, -3;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='D'; M=  0, 20,-21, 31,  3,-25, -4,-16,-21, -1,-13,-19,  9,-12, -7,-10,  9,  1,-16,-26,-13, -4; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='I'; M=  0,-12,-17,-15,-12,  5,-17,-13, 12, -9, 11,  4,-11,-15,-12,-12, -8,  1,  9,-24,  3,-13;
/M: SY='E'; M=  3,  3,-15, 11, 16,-19,-13,-10,-17,  5, -8, -9, -3, -7,  6, -4,  5, -4,-14,-21,-11, 11;
/M: SY='Q'; M=  6,  2,-21,  8, 11,-24,-13, -2,-15,  3, -8, -4, -4, -7, 13, -3,  0, -2,-14,-23,-12, 11;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='I'; M=  6,-13,-14,-18,-15,  2,-14,-17, 24,-12, 13, 10,-10,-25,-12,-12, -8,  1, 21,-25, -1,-15; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='E'; M=  1, -5,-17, -2,  5,-12, -5,-11,-12,  4, -8, -1, -7, -7,  3,  3, -1, -8,-10,-10, -8,  3; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='E'; M=  2,  1,-15,  5, 13,-21,-11, -6,-17,  7,-11, -4, -1, -1,  8,  1,  0, -6,-15,-21,-14, 10; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='Y'; M=-17,-22,-21,-22,-21, 24,-23,-13, 12,-16, 22, -1,-21,-28,-18,-13,-15, -6, 15,  5, 32,-21;
/M: SY='A'; M= 14, -5, -4, -9, -7,-13, -9,-21,  3, -8, -4, -1, -3,-14, -6,-14,  4,  8,  7,-36,-23, -8;
/M: SY='E'; M=  0, -5,-20,  0,  9,-18,-15,  1,-13,  3, -7, -2, -8, -4,  8,  1, -1, -6,-11,-20, -7,  8;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='I'; M=  0, -4,-15, -5, -7, -7, -8,-11,  3, -4, -2, -4, -2, -6, -8, -7, -4,  0,  2,-21, -5, -8; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='P'; M=  3,  0,-24,  3, -4,-20, -6,-14, -5, -2, -8,-10, -4,  4, -5,-10, -1,  2, -5,-28,-12, -6;
/M: SY='N'; M=  2,  5,-22,  4,  3,-18, -6, -6,-13,  4,-13, -8,  9,  1, -2, -8,  4,  1,-15,-32,-17, -1;
/M: SY='E'; M=  1, -3,-15,  2,  7,-18,-14, -8, -8,  0, -3, -5, -7, -1,  3, -5, -3, -3, -8,-24, -7,  5;
/M: SY='A'; M=  7,-10,-19,-11, -5, -2,-11,-17,  4, -6,  3,  1,-10,-15, -3,-11, -3, -1,  5,-18, -6, -6;
/M: SY='E'; M= -4, -7,-17, -4,  7, -6,-19, -6,-12,  2, -2, -4, -9, -8,  3, -1, -5, -9, -8,-11,  1,  5;
/M: SY='R'; M=  2, -8,-19, -4,  7,-14,-12,-14,-16, 11,-12,  2, -9, -4, 10, 15, -3,-12,-11,-13,-11,  6;
/M: SY='L'; M= -4,-12, -9,-13, -5,  7,-17,-13,  9, -8, 17, 11,-14,-21, -8,-10,-12, -4,  4,-15, 10, -5;
/M: SY='I'; M=  9,-10,-16,-14,-12,  0,-13,-13, 16, -9, 14, 14, -9,-24,-11,-15, -6,  5, 14,-30, -2,-12;
/M: SY='E'; M=  2,  0,-15,  1,  9,-13,-14, -9, -9,  6, -1,  6, -2, -7,  2, -5, -2, -1, -9,-26, -6,  7;
/M: SY='Q'; M=  5, -4,-17, -2,  5,-17,-11,-10,-12,  6, -9,  2, -4, -7,  8,  6,  0, -4, -8,-24,-14,  4;
/M: SY='F'; M= -9,-11,-21,-15,-17, 26,-18,-10, -2,-10,  9, -9, -6,-25,-18,-12, -2, -5,  1,-13, 11,-19;
/M: SY='W'; M=-22,-27,-20,-24, -9,  6, -6,-26,-13,-10, -5,-13,-34,-14, -8, -6,-13,-17,-13, 68, 23,-10;
/M: SY='P'; M= -5,-12,-25, -3, 11,-36, -9,  4,-26,  9,-24,-29,-21, 74,  2, -7, -7, -3,-32,-28,-19,  3;
/M: SY='G'; M=  2, -3,-31, -8,-13,-22, 44,-21, -9, -6,-13, -9, -4,-11, -9, -6, -1,-15,-19, -3,-21,-12;
/M: SY='P'; M= -3,-15,-30, -7,  7,-35, -6,  3,-23,  8,-25,-30,-23, 82,  0,-10, -6,  1,-31,-31,-21, -1;
/M: SY='L'; M= -9,-17,-16,-20,-19, 16,-19,-14, 28,-17, 29, 11,-16,-29,-19,-19,-15,  0, 21,-15, 23,-19;
/M: SY='T'; M=  9, -4,-20,-11,-19,-12,-16,-21,  7,-11,  0, -1,  2,-11, -8,-22, 12, 33, 14,-40, -7,-14;
/M: SY='I'; M= -8,-18,-12,-26,-22, 26,-20,-18, 27,-17, 26,  7,-13,-32,-22,-19,-14, -3, 20,-17, 16,-22;
/M: SY='I'; M=  2,-17,-16,-25,-24,  6,-17,-20, 41,-18, 20, 10,-11,-33,-22,-19,-12,  3, 34,-27,  5,-24;
/M: SY='L'; M= -1, -9, -8,-10, -8,  6,-17,-16,  9,-10, 15,  7,-12,-22,-11,-10, -9,  0,  8,-22,  7, -9;
/M: SY='P'; M= -3, -5,-23,  0, 11,-23,-12, -5,-21, 14,-18,-11, -9, 31,  5,  4, -3, -5,-22,-24,-13,  6;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
/M: SY='A'; M=  6, -3,-16, -1,  0,-13, -9,-14, -9,  4, -8,  2, -4, -3,  5,  5,  2,  1, -4,-24,-12,  0; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='K'; M=  2,  2,-17,  1,  0,-11, -5,-10, -8,  3, -8, -1,  3, -8, -2, -2,  3, -1, -8,-25,-11, -2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='D'; M=  1,  3,-20,  8,  8,-22, -2, -7,-16,  5,-11, -9, -3,  7,  1, -5,  0, -5,-16,-21,-13,  4; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M:         M=  0, -5,-16, -5, -2,-12, -9, -8, -4, -1, -5, -3, -5, -3, -3, -5, -2, -1, -5,-22, -8, -3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='I'; M= -1,-13, -9,-16,-11,  0,-14,-13, 15,-11, 11,  3,-12,-13,-13,-12, -8,  1, 11,-23,  1,-13; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='P'; M=  2, -5,-20, -2,  1,-21, -9, -5,-13,  2,-14,-14, -7, 24, -3, -7,  3,  5,-14,-30,-16, -4; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='P'; M=  0,  0,-18,  5,  6,-20, -8, -9,-16,  5,-12,-10, -5, 10,  2,  1,  0, -4,-16,-21,-12,  2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='I'; M=  0, -6,-16, -7, -6, -3, -7,-14,  2, -5,  2, -1, -5,-15, -8, -9, -2, -1,  1,-16, -2, -8; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='I'; M=  3,-11,-17,-15,-16,  2,-15,-16, 21,-11, 11,  6, -8,-23,-13,-11, -7,  2, 18,-25,  1,-16; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='T'; M=  7, -2,-22, -6, -8,-12, -9, -3, -3, -5, -5,  0,  3, -8, -3,-11,  7, 11, -1,-35,-13, -7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='P'; M=  4, -6,-25, -5,  1,-24,  2, -8,-13,  3,-16,-14, -8, 29,  1, -9,  1,  3,-18,-27,-19, -2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='G'; M=  1,  5,-28,  1, -7,-20, 26,-18,-12,  1,-16, -9,  7, -9, -8, -7,  3, -7,-19,-14,-20, -9; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M:         M= -1, -4,-14, -6, -5, -8, -5,-14, -4, -2, -3, -1, -3,-10,  0,  0, -1, -1, -6,-19, -6, -5; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='D'; M=  0,  8,-25, 10,  2,-21,  7,-14,-17,  6,-15, -9,  5,  0, -2, -3,  1, -7,-19,-21,-17, -1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='T'; M=  4, -3,-20, -9, -9,-11,-15,-14, -6, -2, -6, -2,  4, -5,  0,-11, 11, 20, -2,-32, -9, -6;
/M: SY='I'; M=  2,-18,-14,-25,-21,  5,-20,-20, 35,-16, 16,  7,-11,-31,-18,-17,-11,  3, 31,-26,  3,-21;
/M: SY='G'; M= 11,  0,-35, -6,-13,-23, 47,-25, -7, -6,-15,-10,  0,-11,-11,-16,  4, -9,-16,-10,-29,-13;
/M: SY='I'; M= -2,-19,-16,-28,-26, 16,-21,-21, 34,-17, 19,  5,-12,-34,-23,-18,-12,  0, 31,-21,  9,-26;
/M: SY='R'; M= -5,-19,-21,-15,-11, -7,-17, -5,-17,  8, -9,  9,-15,-17, 16, 51,-11,-22, -6, -8, -2, -5;
/M: SY='I'; M= -3,-17,  0,-25,-18,  4,-21,-15, 29,-16, 21, 13,-11,-32,-20,-17,-15,  0, 22,-25,  2,-19;
/M: SY='P'; M= -5,-15,-28, -8,  7,-34, -9,  5,-24,  8,-27,-33,-21, 85, -1,-11, -5,  3,-32,-33,-21, -2;
/M: SY='D'; M= -2, 11,-29, 21, -1,-16, -6,-13,-17, -1, -6,-12,  4,-12, -4, -6,  1, -3,-10,-22, -2, -5;
/M: SY='H'; M= -3,  3,-16, -1, -3,-21, -9, 19,-12, -8,-10, -2,  9, -9, -6,-14,  3,  0,-16,-37,-17, -5;
/M: SY='P'; M= -1,-11,-26, -7,  6,-25, -7, -4,-20,  7,-19,-19,-16, 47,  5, -2, -4, -2,-23,-25,-16,  2;
/M: SY='I'; M= -4,-17,-18,-25,-22, 16,-20,-17, 27,-16, 20,  6,-12,-29,-18,-17,-12,  0, 22,-17, 12,-21;
/M: SY='H'; M=  3,-12,-13,-15, -7,-13,-17, 14,  1,-11,  0,  7, -7, -9, -4,-13, -3,  2,  0,-37,-13, -7;
/M: SY='R'; M= -5,-11,-21, -8, -2, -9,-20, 12,-10, -3, -1,  6,-11,-11, 12, 15, -9,-10, -9,-20,  3,  2;
/M: SY='E'; M=  7, -1,-15,  3,  9,-14,-13, -7, -7,  3,  0,  6, -5,-10,  3, -5, -3, -4, -6,-28, -9,  7;
/M: SY='L'; M= -6,-14, -8,-19,-17, 16,-18,-13, 29,-18, 32, 17,-14,-31,-20,-21,-17,  0, 18,-22, 18,-17;
/M: SY='I'; M= -2,-13,-11,-19,-15, 11,-13,-14, 20,-15, 20, 10,-12,-28,-17,-18,-11, -1, 14,-20,  7,-16;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='Q'; M=  5,  0,-18,  6, 13,-21,-11,-10,-19, 11,-14, -1, -4, -3, 15, 13,  1, -8,-15,-20,-15, 12; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='Q'; M=  1, -7,-20, -5,  6,-13,-12, -5,-10,  2, -3,  1, -9, -7,  9,  1, -4, -6, -9,-16, -4,  6;
/M: SY='L'; M=  0,-11, -6,-15,-10,  3,-19,-14,  9,-11, 12,  4, -9,-22,-11,-15, -4,  6,  8,-25,  1,-10;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='G'; M=  0,  7,-32,  4, -8,-27, 42,-22,-14, -3,-18,-17,  4, -6,-11,-13,  0,-13,-25, -6,-23,-10; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='A'; M=  4, -4,-16, -5,  0, -8, -2,-11, -4,  1, -5, -2, -2, -8, -1, -3,  0, -3, -4,-16,-10, -1; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='P'; M= -3,-17,-27,-10,  5,-29,-11,  4,-19,  6,-19,-24,-23, 72, -2,-10, -8,  1,-26,-31,-17, -3;
/M: SY='I'; M= -4,-14,-10,-21,-18, 11,-18,-14, 33,-19, 30, 15,-13,-31,-20,-21,-15,  1, 23,-24, 15,-18;
/M: SY='V'; M= 11,-13,-25,-16,-18,  5,-17,-20, 21,-12, 10,  6,-11,-26,-13,-14, -4,  7, 25,-28,  0,-18;
/M: SY='A'; M= 12, -6,-13,-11, -9,-13, -3,-18,  1, -5, -3,  3, -1,-16, -6,-14,  6,  9,  2,-29,-20, -9;
/M: SY='T'; M=  6, -4,-21, -8, -9,-22,-11,-13, -8, -4,-10,-11, -1, 18, -3,-21, 16, 30, -5,-40,-15, -8;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-20, -1,  0,-11, -2,-11,-10,  0,-18,-18,  1, -9, -9,-11, 38, 22, -9,-31,-19, -9;
/M: SY='A'; M= 29, -3,-27, -4, -5,-13,  0,-20,  5, -4, -4,  8, -3,-15,  2,-12,  5,  7, 11,-41,-28, -5;
/M: SY='N'; M= -1, 31,-13,  5, -9,-10, -1, -9,  1,  1,-17,  1, 65,-24, -9,-17, -1,  7,-17,-61,-34,-10;
/M: SY='I'; M= -5,-15,-15,-17,-12,  6,-17,-14, 12, -9, 12,  3,-15,-11,-11, -7,-11, -3,  8,-20,  7,-13;
/M: SY='S'; M=  5, -3,-23, -3, -1,-11, -2, -9,-12,  0,-16,-20, -4,  5, -8,-12, 23, 12,-13,-27,-16, -9;
/M: SY='G'; M=  0,  6,-32,  4, -9,-28, 46,-24,-13, -5,-15,-16,  2, -8,-13,-16,  1,-12,-25, -6,-23,-11;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='E'; M=  0, -2,-14,  3, 20,-22,-16, -1,-21,  9,-12, -3, -5, -2, 19,  8, -2,-10,-20,-19,-11, 19;
/M: SY='P'; M= -4,-10,-25, -5,  5,-28, -5, -4,-17,  5,-18,-22,-16, 48, -2, -9, -5, -3,-22,-23,-16, -1;
/M: SY='T'; M=  3, -8,-21, -8, -4,-12,-10,-11, -1, -3, -7,-11, -8,  5, -5,-12,  6,  8, -3,-26,-10, -7;
/M: SY='P'; M=  0,-13,-16,-15, -7,-10,-13, -9,  4, -5, -1, -3,-12,  6, -9,-11, -6,  2,  0,-26, -8,-10;
/M: SY='T'; M=  2, -8,-21,-13,-13, -6,-15,-14,  5, -6,  3,  1, -2,-11, -5,-13,  3, 13,  6,-28, -3,-11;
/M: SY='D'; M=  1, 10,-16, 16,  0,-19,-13,-14,-16, -1, -8,-10,  5,-10, -3, -8,  5,  4, -9,-30,-11, -2;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='A'; M=  4, -3,-18, -3, -4,-12,-10,-13, -1, -3, -5, -7, -3, -1, -8,-12, -2,  0, -1,-30,-13, -7; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='E'; M=  3,  3,-14,  9, 19,-25,-11,-10,-17,  7, -9, -6, -3,  0,  9, -5,  0, -6,-15,-21,-14, 15;
/M: SY='E'; M=  1,  4,-17, 15, 22,-29,-15,  8,-21,  5, -7, -5, -6, -1,  7, -7, -1,-11,-18,-24,-11, 17;
/M: SY='I'; M=  9,-13,-19,-20,-16,  1,-15,-19, 27,-12, 10,  8, -8,-25,-12,-15, -6,  3, 24,-31, -6,-16;
/M: SY='E'; M= -2, -4,-16, -2,  1, -6,-13,-14, -5, -1,  0, -4, -5,-14, -2, -2, -3, -7, -3,-18, -3, -1;
/M: SY='E'; M=  4,  2,-19,  7, 12,-23,-10, -7,-16,  7,-12, -6, -2,  0,  7,  0,  1, -6,-14,-25,-16,  9;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='E'; M=  1, -1,-16,  6, 14,-22,-13, -5,-16,  5, -7, -5, -6, -3, 12,  1, -3, -8,-15,-18, -9, 12; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='F'; M=-13,-19,-16,-25,-20, 36,-20,-15, 13,-14, 26,  5,-17,-31,-20,-14,-15, -8, 11, -2, 26,-20; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='G'; M= -1, -2,-24, -2, -1,-15,  8,-14,-12,  2,-11, -9, -3,  1, -3, -5, -3, -8,-16,-13,-12, -3; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='D'; M=  3,  8,-23, 10,  3,-24,  8, -8,-15,  2,-14, -9,  6, -2, -3, -9,  3, -4,-17,-25,-19, -1; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='M'; M=  0, -8,-19,-11, -4, -7,-10, -8,  1,  0, -3,  3, -4,-12,  3,  2, -5, -5, -1,-18, -5, -3; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='V'; M=  8,-10,-16,-12,-15,  2,-18,-20, 19,-12,  8,  3, -9,-25,-15,-13, -5,  5, 22,-32, -3,-16;
/M: SY='D'; M=  1, 28,-23, 53,  7,-37,-10,-17,-27,  0, -9,-21,  3, -2, -7, -9, -1, -7,-16,-35,-12,  0;
/M: SY='L'; M= -5,-15,-22,-17,-18, 13, -9,-17, 13,-13, 17,  3,-15,-26,-17,-14,-11, -4, 11, -8, 15,-18;
/M: SY='I'; M= -2,-19,-21,-27,-24, 15,-21,-19, 31,-15, 17,  4,-12,-30,-20,-16,-11,  0, 29,-19, 10,-24;
/M: SY='I'; M= -2,-15,-14,-20,-20, 11,-16,-19, 31,-18, 22,  8,-14,-30,-21,-19,-12,  1, 25,-22, 11,-20;
/M: SY='D'; M= -2, 23,-21, 42,  5,-31,-12,-13,-21, -2, -5,-16,  3, -7, -7,-11, -3, -6,-13,-33, -9, -1;
/M: SY='G'; M= -1,  0,-37,  0, -8,-22, 16,  6,-12, -7,-11, -8, -2, -5, -8,-13, -1, -9,-17,-18,-12, -9;
/M: SY='G'; M= -1, 10,-31,  8, -8,-31, 42,-22,-16, -4,-18,-19,  6, -3,-13,-16, -1,-13,-27, -9,-25,-10;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='P'; M= -3, -3,-16,  4,  6,-17,-12, -5,-15,  3, -7,-11, -9, 13,  6,  1, -4, -5,-13,-14, -4,  5; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='C'; M= -6,-11, 13,-17, -7,-12,-17,-21,  7,-10,  1, -7, -5,-10,-12,-17, -5, -1,  3,-25,-16,-10;
/M:         M= -2, -9,-11, -9, -3,-11, -9,-15, -6, -3, -6, -7, -9, -4, -2, -3, -3, -4, -7,-15, -9, -4;
/M: SY='T'; M= -3, -6,-26, -9,-11, -7, -4, -9,  0, -6, -4, -6,  0,-11, -8, -9, -1,  1, -2,-20, -3,-12;
/M: SY='G'; M=  1, -5,-30, -9,-11,-19, 25,-18,-10, -3,-14,-10, -3, -6, -3,  1, -1,-12,-15, -9,-18,-10;
/M: SY='L'; M=  1, -8, -3, -8,  1,-11,-18,-14,  4, -7,  5,  1, -9,-16,  0, -9, -6, -1,  2,-23, -5,  1;
/M: SY='P'; M=  2,  4,-20, 15, 14,-32, -4, -8,-23,  5,-15,-18, -8, 22,  1, -9,  1, -5,-21,-26,-18,  8;
/M: SY='S'; M=  7, 10,-23, 17, -1,-20, -2,-14,-15, -1,-16,-20,  3, -9, -9,-11, 27, 15,-11,-33,-17, -8;
/M: SY='T'; M=  9,  0,-21, -7,-14,-18,-13,-17, -3, -6, -5, -5,  6, -1, -3,-24, 22, 38,  3,-43,-13, -9;
/M: SY='I'; M=  5,-18,-19,-26,-27,  5,-19,-24, 43,-19, 15,  6,-11,-33,-24,-19,-10,  6, 40,-29,  2,-27;
/M: SY='V'; M=  5,-18,-21,-22,-25,  7,-22,-23, 37,-18, 15,  5,-15,-33,-22,-14,-10,  5, 38,-26,  7,-25;
/M: SY='D'; M=  1, 20,-24, 38,  9,-30,-11,-14,-27,  6,-12,-13,  3, -7,  3,  4,  1, -8,-16,-28,-11,  4;
/M: SY='L'; M= -7,-18, -4,-22,-17, 13,-19,-19, 15,-15, 17,  5,-17,-30,-18,-12,-14, -4, 13, -7, 11,-17;
/M: SY='T'; M=  6, -1,-18, -3, -9,-15,-16,-17,  1, -6, -1, -2,  1,-10, -3,-14,  7, 17,  6,-35, -9, -7;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='D'; M=  4,  7,-21, 10,  2,-23,  4,-12,-14,  0,-13,-12,  3, -4, -3, -9,  6, -1,-14,-26,-19, -1; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='G'; M= -1,  8,-26,  9, -1,-25, 20,-14,-15,  0,-14,-12,  5, -4,-10,-13,  0, -9,-22,-17,-19, -5;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='E'; M=  0, -3,-20, -2,  8,-17, -7, -8,-13,  8,-11, -5, -3,  6,  2, -3,  1, -2,-13,-21,-11,  5; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='P'; M= -9,-18,-21,-15, -6, -5,-11, -9, -3, -4, -2,-10,-22, 14, -9, -9,-10, -5, -6,  3,  5,-10; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='Q'; M=  0, -8,-12, -7,  6,-17,-16, -6,-13,  6, -9,  3, -6, -6, 15, 12, -3, -4,-10,-18, -9,  8; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='I'; M=  0,-19,-17,-28,-26, 11,-20,-21, 39,-18, 19,  7,-11,-31,-23,-20,-11,  3, 33,-26,  5,-26;
/M: SY='L'; M= -4,-13,-13,-16,-15, 12,-19,-14, 24,-15, 26, 13,-14,-29,-18,-17,-15,  0, 18,-21, 16,-16;
/M: SY='R'; M= -9,-17,-20, -9, -9,-10,-19,-10,-28, 11,-20,  0,-16,-10, 27, 73, -9,-27,-11, -3, -2,  0;
/M: SY='Q'; M= -1, -9,-14, -3, 13,-21,-17,  1,-19,  5,-11, -7,-12,  8, 16,  9, -4,-10,-17,-18,-10, 13;
/M: SY='G'; M=  5,  0,-36, -8,-15,-26, 60,-26, -9, -7,-19,-16,  0,-10,-15,-16,  5,-12,-22, -2,-29,-16;
/M: SY='R'; M=  8, -6,-19, -4, -1,-15, -6,-16, -9,  4,-10,  0, -7, -7,  4,  9,  0, -7, -4,-24,-17, -2;
/M: SY='G'; M=  2,-10,-21,-19,-20, -9, 17,-24, 16,-14,  1, -4, -6,-22,-18,-18, -4, -5,  7,-15,-13,-20;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_04 which contains 544'996 sequence entries.


Total number of hits 181 in 181 different sequences
Number of true positive hits 181 in 181 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] YrdC-like
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
181 sequences

HYPF2_CUPNH (O07451), HYPF_AZOCH  (Q43950), HYPF_AZOVI  (P40596), 
HYPF_ECOLI  (P30131), HYPF_METJA  (Q58123), HYPF_RHILV  (P28156), 
HYPF_RHOCA  (Q02987), HYPF_SYNY3  (Q55638), SUA5_BACSU  (P39153), 
SUA5_PYRAB  (Q9UYB2), SUA5_SCHPO  (O94530), SUA5_SULTO  (Q970S6), 
SUA5_YEAST  (P32579), TSAC_ACIAD  (Q6FFH9), TSAC_ACIBC  (B2I111), 
TSAC_ACIBS  (B0VNL3), TSAC_ACIBT  (A3M154), TSAC_ACIBY  (B0VCB7), 
TSAC_ACTP2  (A3N1E4), TSAC_ACTP7  (B3GY27), TSAC_ACTPJ  (B0BQ80), 
TSAC_ACTSZ  (A6VL69), TSAC_AERHH  (A0KEX6), TSAC_AERS4  (A4ST51), 
TSAC_ALCBS  (Q0VTD8), TSAC_ALKEH  (Q0A5B4), TSAC_BAUCH  (Q1LT55), 
TSAC_BLOFL  (Q7VQB9), TSAC_BLOPB  (Q493I0), TSAC_BUCAI  (P57561), 
TSAC_BUCAP  (Q8K977), TSAC_BUCBP  (Q89A89), TSAC_CELJU  (B3PGZ1), 
TSAC_CHRSD  (Q1QTJ8), TSAC_CHRVO  (Q7P0L7), TSAC_CITK8  (A8AQH7), 
TSAC_COLP3  (Q48AU1), TSAC_COXBN  (A9KH21), TSAC_COXBR  (A9N9G8), 
TSAC_COXBU  (Q83AA2), TSAC_CROS8  (A7MPF3), TSAC_DICNV  (A5EW39), 
TSAC_ECO24  (A7ZSH1), TSAC_ECO57  (Q8X8F8), TSAC_ECODH  (B1X6D5), 
TSAC_ECOHS  (A8A587), TSAC_ECOK1  (A1AGH4), TSAC_ECOL5  (Q0TCH9), 
TSAC_ECOL6  (Q8FD17), TSAC_ECOLC  (B1IQ17), TSAC_ECOLI  (P45748), 
TSAC_ECOSM  (B1LGN9), TSAC_ECOUT  (Q1R650), TSAC_ENT38  (A4WF91), 
TSAC_HAEDU  (Q7VNS3), TSAC_HAEI8  (Q4QMR0), TSAC_HAEIE  (A5UE77), 
TSAC_HAEIG  (A5UHE9), TSAC_HAEIN  (P44807), TSAC_HAHCH  (Q2SQW8), 
TSAC_HALHL  (A1WZH9), TSAC_HISS1  (Q0I1B6), TSAC_HISS2  (B0UWV9), 
TSAC_IDILO  (Q5QXJ5), TSAC_KLEP7  (A6TET6), TSAC_LARHH  (C1D9T5), 
TSAC_MANSM  (Q65WC1), TSAC_MARAV  (A1TWN4), TSAC_MARMS  (A6VT87), 
TSAC_METCA  (Q603G8), TSAC_METFK  (Q1H4G9), TSAC_METJA  (Q60369), 
TSAC_MORCR  (D5V9A9), TSAC_MYCLE  (P45831), TSAC_MYCTO  (P9WGC8), 
TSAC_MYCTU  (P9WGC9), TSAC_NEIG1  (Q5F5I5), TSAC_NEIM0  (A9M4K6), 
TSAC_NEIMA  (A1IP83), TSAC_NEIMB  (Q9JXA4), TSAC_NEIMF  (A1KWL6), 
TSAC_NITOC  (Q3J7C4), TSAC_PASMU  (Q9CLG4), TSAC_PHOLL  (Q7MYI5), 
TSAC_PHOPR  (Q6LLJ9), TSAC_PSE14  (Q48QH8), TSAC_PSEA6  (Q15ZX7), 
TSAC_PSEA7  (A6UX84), TSAC_PSEAB  (Q02V59), TSAC_PSEAE  (Q9I7A5), 
TSAC_PSEE4  (Q1I2G9), TSAC_PSEF5  (Q4KKQ6), TSAC_PSEHT  (Q3IDH7), 
TSAC_PSEMY  (A4XNB6), TSAC_PSEP1  (A5VWK1), TSAC_PSEPF  (Q3KKE2), 
TSAC_PSEPG  (B0KF32), TSAC_PSEPK  (Q88RQ9), TSAC_PSEPW  (B1J499), 
TSAC_PSESM  (Q88B46), TSAC_PSEU2  (Q500S6), TSAC_PSEU5  (A4VFI1), 
TSAC_PSYA2  (Q4FPS7), TSAC_PSYCK  (Q1Q7W4), TSAC_PSYIN  (A1SR31), 
TSAC_RIEPU  (D4G8K6), TSAC_SACD2  (Q21PU1), TSAC_SALAR  (A9MN84), 
TSAC_SALCH  (Q57J68), TSAC_SALPA  (Q5PIS8), TSAC_SALPB  (A9N8A7), 
TSAC_SALTI  (Q8Z1W6), TSAC_SALTY  (Q8ZLN0), TSAC_SERP5  (A8GKG1), 
TSAC_SHEAM  (A1S1K5), TSAC_SHEB5  (A3CYL0), TSAC_SHEB8  (A6WHB6), 
TSAC_SHEB9  (A9KUA7), TSAC_SHEDO  (Q12TA0), TSAC_SHEFN  (Q08A23), 
TSAC_SHEHH  (B0TLD6), TSAC_SHELP  (A3QJE8), TSAC_SHEON  (Q8EKQ3), 
TSAC_SHEPA  (A8GYH9), TSAC_SHEPC  (A4Y1D2), TSAC_SHESA  (A0KR66), 
TSAC_SHESH  (A8FP81), TSAC_SHESM  (Q0HPA1), TSAC_SHESR  (Q0I0R7), 
TSAC_SHESW  (A1RDY7), TSAC_SHEWM  (B1KCX0), TSAC_SHIB3  (B2U2Q0), 
TSAC_SHIBS  (Q31VZ4), TSAC_SHIDS  (Q32B67), TSAC_SHIF8  (Q0T019), 
TSAC_SHIFL  (Q83JD1), TSAC_SHISS  (Q3YWX6), TSAC_SODGM  (Q2NQQ7), 
TSAC_STRMK  (B2FIS1), TSAC_THICR  (Q31JQ7), TSAC_THIDA  (Q3SG43), 
TSAC_VIBC3  (A5F4C5), TSAC_VIBCB  (A7N129), TSAC_VIBCH  (Q9KVT5), 
TSAC_VIBF1  (Q5E1R5), TSAC_VIBPA  (Q87KE2), TSAC_VIBVU  (Q8DDD6), 
TSAC_VIBVY  (Q7MGL3), TSAC_WIGBR  (Q8D257), TSAC_XANAC  (Q8PG13), 
TSAC_XANC5  (Q3BNJ9), TSAC_XANC8  (Q4UQ07), TSAC_XANCB  (B0RWR5), 
TSAC_XANCP  (Q8P4F2), TSAC_XANOM  (Q2P833), TSAC_XANOP  (B2SL46), 
TSAC_XANOR  (Q5H5D8), TSAC_XYLF2  (B2I8S9), TSAC_XYLFA  (Q9PEV9), 
TSAC_XYLFM  (B0U4N0), TSAC_XYLFT  (Q87AQ5), TSAC_YERE8  (A1JRY6), 
TSAC_YERP3  (A7FNJ8), TSAC_YERPA  (Q1C2Y3), TSAC_YERPB  (B2K500), 
TSAC_YERPE  (Q74XX5), TSAC_YERPG  (A9R933), TSAC_YERPN  (Q1CCY0), 
TSAC_YERPP  (A4TH27), TSAC_YERPS  (Q664V8), TSAC_YERPY  (B1JJI2), 
Y1198_HAEIN (P45103), Y259_MYCGE  (Q49404), Y362_MYCPN  (P75419), 
YCIO_ECOL6  (P0AFR5), YCIO_ECOLI  (P0AFR4), YCIO_SHIFL  (P0AFR6), 
YRDC_BOVIN  (Q0VC80), YRDC_HUMAN  (Q86U90), YRDC_MOUSE  (Q3U5F4), 
YRDC_RAT    (Q499R4)
» More

PDB
[Detailed view]
6 PDB

1HRU; 1K7J; 1KK9; 2EQA; 3AJE; 4E1B

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission