Entry: PS51215

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] AWS
Accession [info] PS51215
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JUN-2006 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51215
Associated ProRule [info] PRU00562

Name and characterization of the entry

Description [info] AWS domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.2861123; R2=0.0114865; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4447.62802; R2=10.45411; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=454; N_SCORE=8.5; H_SCORE=8284; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=280; N_SCORE=6.5; H_SCORE=7375; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-22; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D'; M=-13, 12,-51, 20,  4,-45,-26,-13,-45, -9,-47,-33,  5,-31, -4,-21, -2,-10,-36,-60,-39,  0;
/M: SY='D'; M=-21,  7,-58, 17, 17,-35,-31,-10,-52,-10,-51,-38, -5,-27, -3,-23,-11,-15,-40,-53,-31,  9;
/M:         M= -9,-27,-35,-30,-24,-16,-34,-26,-15,-23,-18,-12,-22,-36,-22,-26, -2,-10,-10,-46,-22,-24;
/M: SY='M'; M=-13,-34,-28,-38,-28,-16,-38,-26,-16,-27,-12,  4,-29,-28,-21,-32,-10,-13,-16,-42,-23,-26;
/M: SY='T'; M=-15,-29,-29,-36,-28,-28,-38,-33, -9, -7,-17,-10,-21,-38,-18,-21,-14,  3, -4,-51,-32,-27;
/M: SY='C'; M= -8,-55,116,-65,-65,-40,-56,-66,-21,-55,-30,-29,-45,-57,-46,-56,-14,-13,-19,-50,-48,-65;
/M: SY='N'; M=-15,  3,-45, -3,  2,-45,-26, -9,-39, -7,-39,-25, 12,-32, -2,-13,  4, -2,-26,-58,-37, -1;
/M: SY='C'; M= -6,-57,109,-65,-64,-41,-56,-66,-23,-55,-31,-30,-48,-44,-47,-56,-18,-20,-21,-51,-50,-64;
/M: SY='K'; M= -7,-12,-47,-16,  1,-47,-23,-19,-41, 18,-38,-25, -7,-19,  8, -5, -1,  2,-29,-56,-40,  2;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='P'; M=-13,-14,-49,-13,  1,-41,-34,-13,-42, 10,-39,-30,-14, 13, -3,  1, -9,-13,-33,-48,-31,  0; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M:         M=-10,-15,-22,-15,-15,-18,-21,-16,-11, -9, -6, -6,-11, -7,-11, -7, -9, -5, -8,-27,-19,-13; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='D'; M= -6,  0,-22,  5, -6,-20,-12,-14,-18,-10,-16, -9, -3,-17, -6,-14, -1, -1,-15,-29,-21, -6; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='S'; M= -3,  4,-23,  5,  2,-26,-15,-10,-21, -6,-24,-16,  4,-16, -2,-12,  6,  3,-12,-34,-23,  0; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='S'; M= -5, -2,-28, -4,-10,-27,  0, -8,-28,-10,-29,-18,  2,-17, -9,-15,  3,  3,-22,-35,-22,-11; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='A'; M=  3,-13,-36,-14,-12,-39, -1,-25,-35,-13,-36,-23,-12,-10,-15,-20,  3, -5,-25,-48,-38,-13; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='C'; M= -4,-28, 18,-34,-30,-32,-38,-33,-13,-25,-24,-17,-23,-35,-23,-31, -2,  4,-10,-46,-32,-31; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='G'; M= -2,-19,-28,-29,-29,-50, 15,-33,-44,-10,-47,-33, -7,-40,-23,-25, -6, -7,-32,-57,-47,-29;
/M: SY='C'; M= -9,-39, 73,-46,-45,-44,-50,-53,-30,-44,-37,-33,-32,-38,-36,-47, -8,-16,-26,-55,-49,-47;
/M: SY='G'; M=-13,  2,-61,  5,-18,-54, 34,-28,-63,-21,-61,-47,  0,-43,-25,-32,-11,-25,-54,-62,-50,-21;
/M: SY='S'; M= -6,  5,-44,  6,  6,-43,-27,-10,-45, -4,-44,-30,  3,-27, -1,-13, 15,  5,-33,-56,-32,  2;
/M: SY='D'; M=-17, 24,-53, 31,  4,-49,-18,-15,-55, -7,-55,-41, 18,-32, -7,-17,  4, -2,-44,-65,-45, -1;
/M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/M: SY='L'; M=-19,-47,-33,-49,-34,-13,-54,-28,  1,-29,  7,  3,-40,-42,-22,-32,-23,-14,  1,-32,-15,-29;
/M: SY='N'; M=-25, 22,-19, -2,-23,-52,-23, -9,-46,-12,-46,-32, 53,-43,-11,-20,  3,  1,-38,-64,-40,-22;
/M: SY='R'; M=-21,-20,-55,-27, -7,-48,-32, -7,-45, 18,-39,-29,-13,-30,  4, 59,-14,-17,-32,-52,-41, -1;
/M: SY='M'; M= -1,-38,-32,-41,-20,-21,-40,-29, -9,-14,  1, 19,-33,-32, -8,-25,-14,-12, -4,-41,-29,-16;
/M: SY='M'; M=-12,-44,-16,-49,-38,-20,-49,-39,  3,-26,  9, 15,-33,-40,-21,-31,-16, -4,  6,-45,-30,-32;
/M:         M=-21,-28,-25,-38,-32,  0,-42, -5,-26,-23,-20, -7,-16,-43,-16,-24, -8,-15,-25,-32,  0,-28;
/M: SY='I'; M=-19,-33,-30,-42,-37,-15,-48,-30,  7,-27, -8, -3,-23,-42,-25,-27,-15, -2,  4,-44,-19,-35;
/M: SY='E'; M=-18,  0,-60,  5, 52,-43,-40, -5,-49,  2,-49,-32,-13,-25, 22,-14, -6,-17,-34,-54,-39, 39;
/M: SY='C'; M= -4,-58,120,-67,-66,-40,-56,-67,-21,-56,-30,-29,-49,-56,-48,-58,-17,-19,-19,-50,-49,-66;
/M: SY='S'; M= -9,  2,-29, -8,-18,-39,-26,-12,-36,-16,-40,-29, 15,-29,-14,-23, 19,  9,-26,-55,-26,-18;
/M: SY='P'; M= -1,-12,-46,-11, -6,-46,-31,-13,-43,  3,-42,-31,-10,  8, -5,-13,  6,-10,-32,-60,-38, -6;
/M: SY='S'; M=-10, -4,-49, -8, -3,-48,-10,-18,-46,  0,-44,-32,  0,-32, -4, -7,  4, -8,-34,-59,-42, -4;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='T'; M=-13, -7,-30,-12, -5,-21,-27, -4,-20, -6,-23,-16, -2,-25, -5,-10, -3,  1,-14,-31,-10, -6; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/M: SY='P'; M=-13,-20,-40,-26,-20,-49,-26,-26,-44, -6,-39,-30,-10,  8,-17,-11, -7,-14,-35,-60,-46,-19;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='C'; M= -3,-47, 30,-53,-46,-29,-45,-45,-15,-34,-11,-13,-38,-42,-33,-33,-14,-16,-10,-40,-35,-43; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='G'; M=  0,-16,-48,-21,-26,-49, 45,-31,-53,-21,-52,-35,-11,-24,-25,-30, -6,-22,-45,-52,-48,-25; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='E'; M= -4, -3,-49, -2, 18,-49,-30,-15,-45, 11,-45,-33, -6,-13,  4, -7,  9, -6,-31,-61,-42, 12;
/M: SY='H'; M=-22,-12,-52,-21,-11,-32,-31,  4,-44,  1,-36,-27,  2,-29,  3, -9,-10,-16,-37,-42,-10, -6;
/M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/M: SY='S'; M= -7, -9,-41,-16, -3,-42,-11,-13,-46, -3,-44,-26, -1,-33,  2,-14,  3, -4,-35,-53,-36, -3;
/M: SY='N'; M=-29, 46,-51, 18, -9,-59,-11,  9,-59,  5,-59,-39, 85,-39,  1, -8,  9, -1,-49,-69,-40, -9;
/M: SY='R'; M=-24,-17,-55,-23,  6,-48,-40,  1,-45, 28,-38,-20, -7,-30, 40, 47,-16,-15,-37,-47,-36, 18;
/M: SY='R'; M=-18,-26,-38,-28,-20,-39,-39,-21,-39, -4,-36,-25,-21, -9,-10, 17,-14,-19,-33,-52,-39,-16;
/M: SY='F'; M=-38,-61,-36,-62,-60, 76,-62,-28,  4,-49,  8,  6,-60,-58,-49,-49,-40,-36, -9,-11, 25,-59;
/M: SY='Q'; M=-16,-18,-47,-22,  2,-42,-34, -4,-40,  3,-33,-18, -9,-33, 27,  6, -9,-10,-29,-40,-30, 11;
/M: SY='K'; M=-17,-10,-56,-18,  4,-48,-34, -7,-47, 44,-38,-23, -2,-26, 19, 36,-10,-12,-38,-55,-39,  9;
/M: SY='R'; M=-21,-17,-55,-24, -6,-37,-32, -1,-46, 11,-37,-28, -9,-24,  3, 22,-12,-19,-38,-50,-30, -3;
/M: SY='Q'; M=-17,-12,-52,-14, 10,-41,-38,  0,-45, 21,-35,-19, -4,-24, 36,  3,-11,-11,-36,-48,-30, 18;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_09 which contains 546'439 sequence entries.


Total number of hits 38 in 38 different sequences
Number of true positive hits 38 in 38 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] AWS
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
38 sequences

ASH1L_HUMAN (Q9NR48), ASH1L_MOUSE (Q99MY8), ASH1_DROME  (Q9VW15), 
ASHH1_ARATH (Q84WW6), ASHH2_ARATH (Q2LAE1), ASHH3_ARATH (Q945S8), 
ASHH4_ARATH (Q9M1X9), ASHR3_ARATH (Q949T8), C1716_DROME (Q9VYD1), 
LIN59_CAEEL (O44757), MES4_DROME  (Q8MT36), NSD1_HUMAN  (Q96L73), 
NSD1_MOUSE  (O88491), NSD2_HUMAN  (O96028), NSD2_MOUSE  (Q8BVE8), 
NSD3_HUMAN  (Q9BZ95), NSD3_MOUSE  (Q6P2L6), SET2_ASHGO  (Q757Y8), 
SET2_ASPFU  (Q4WTT2), SET2_ASPOR  (Q2UTN6), SET2_CANAL  (Q59XV0), 
SET2_CANGA  (Q6FX50), SET2_CHAGB  (Q2H988), SET2_COCIM  (Q1DU03), 
SET2_CRYNB  (P0CO29), SET2_CRYNJ  (P0CO28), SET2_DEBHA  (Q6BM04), 
SET2_EMENI  (Q5ASA5), SET2_GIBZE  (Q4IB50), SET2_KLULA  (Q6CXP5), 
SET2_NEUCR  (Q7RZU4), SET2_SCHPO  (O14026), SET2_USTMA  (Q4PBL3), 
SET2_YARLI  (Q6C5G5), SET2_YEAST  (P46995), SETD2_HUMAN (Q9BYW2), 
SETD2_MOUSE (E9Q5F9), SETVS_PLAF7 (Q8IE95)
» More

PDB
[Detailed view]
4 PDB

3OOI; 3OPE; 4FMU; 4H12

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission