Entry: PS51230

General information about the entry

Entry name [info] EB1_C
Accession [info] PS51230
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JUL-2006 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAY-2015 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51230
Associated ProRule [info] PRU00576

Name and characterization of the entry

Description [info] EB1-C terminal (EB1-C) domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=73;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=68;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6025920; R2=0.0113639; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2644.93392; R2=23.29956; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=519; N_SCORE=8.5; H_SCORE=12687; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=343; N_SCORE=6.5; H_SCORE=10637; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-7; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='E'; M= -2, -2,-24, -4,  4,-19,-10, -4,-14, -7,-14, -9,  1,  0, -1, -9,  1,  0,-15,-28,-15,  0;
/M: SY='L'; M= -2,-13,-20,-14, -9, -6,-10,-15, -2,-16,  9,  0,-11,-21,-11,-13, -9, -7, -2,-24,-10,-10;
/M: SY='N'; M=  3,  9,-22,  7, 10,-25, -6, -6,-21,  0,-23,-17, 12, -4,  2, -6,  8, -2,-19,-31,-20,  5;
/M: SY='E'; M=  3,  4,-22,  2,  7,-21, -7, -9,-15, -3,-14,-12,  5,-13, -1, -8,  2, -4,-13,-28,-17,  3;
/M: SY='B'; M=  1,  4,-21,  1,  2,-19,-12, -8,-14, -2,-10, -7,  4,-12,  1, -6,  0, -1,-13,-27,-14,  1;
/M: SY='D'; M=-11, 16,-25, 17,  9,-22,-13, -3,-26,  8,-25,-18, 14, -8,  3,  6,  3, -3,-23,-30,-15,  5;
/M: SY='Q'; M=  1,  5,-22,  4,  5,-23,-13,  3,-16, -4,-15, -9,  5,-13,  8, -7,  4, -1,-15,-28,-12,  5;
/M: SY='E'; M= -5,  6,-23,  7, 18,-25,-17, -5,-17,  2,-17,-12,  3, -7, 12, -3,  2, -1,-15,-29,-16, 15;
/M: SY='I'; M= -6,-17,-21,-23,-18, -5,-27,-20, 18,-14,  9,  9,-12,-21,-14,-14,-10, -2, 15,-25, -6,-18;
/M: SY='E'; M= -4,  1,-26,  2, 13,-25,-12, -7,-19,  2,-19,-12,  2, -2,  8, -1,  2, -5,-19,-28,-17,  9;
/M: SY='E'; M=  3,  1,-23,  1, 10,-19,-15, -5,-16,  4,-14,-11, -1,-11,  1, -4,  0, -4,-14,-23, -9,  5;
/M: SY='L'; M= -9,-24,-21,-25,-16,  0,-27,-15, 12,-19, 26, 15,-23,-19,-11,-12,-20, -6,  7,-21, -2,-14;
/M: SY='Q'; M= -5,  2,-21, -3,  2,-20,-17, -7,-10,  2,-15, -4,  5,-13,  8, -2,  5,  6,-10,-28,-12,  4;
/M: SY='E'; M=  2,  6,-20,  5, 12,-25,-11, -2,-23,  3,-22,-15,  6,-10,  8, -1, 11,  4,-17,-30,-15,  9;
/M: SY='E'; M= -8,  1,-26,  3, 20,-26,-18, -2,-19,  8,-17, -9,  2,-10, 20,  5,  1, -5,-20,-27,-14, 20;
/M: SY='M'; M= -6,-21,-17,-26,-18, -2,-25,-14, 14,-16, 17, 20,-20,-18,-13,-15,-18, -8,  9,-21, -2,-17;
/M: SY='S'; M= -1, -1,-20, -3,  3,-18,-16,  0,-13, -3,-14, -8,  1,-12,  4, -6,  7,  6,-10,-27, -8,  3;
/M: SY='D'; M=-11, 22,-26, 28, 25,-31,-14,  0,-28,  5,-24,-19, 13, -9, 12, -2,  4, -3,-25,-33,-18, 19;
/M: SY='L'; M= -9,-20,-22,-22,-12,  9,-24,-13,  4,-19, 14,  6,-19,-23,-13,-15,-14, -6,  0, -6,  7,-12;
/M: SY='E'; M= -6,  5,-25,  6, 13,-26,-15, -5,-21, 12,-20,-12,  5,-11, 11,  7,  1, -5,-19,-27,-14, 11;
/M: SY='I'; M= -1,-12,-21,-15, -6,-10,-22,-17,  7,-16,  5,  1, -9,-17, -8,-16, -3,  0,  4,-26,-10, -8;
/M: SY='T'; M= -3, -8,-22,-11, -1,-12,-20, -6, -7,  0, -5,  0, -7,-15,  0, -4, -3,  1, -6,-21, -3, -2;
/M: SY='I'; M=  0,-14,-21,-21,-16, -8,-22,-18, 12, -9,  0,  5, -8,-19,-11, -9, -6, -4, 10,-24, -8,-15;
/M: SY='E'; M= -9, 12,-27, 19, 31,-29,-17, -2,-28, 10,-22,-16,  3, -6, 16,  1,  1, -6,-25,-28,-16, 24;
/M: SY='G'; M= -3, -1,-25,  1, -3,-22,  6, -8,-20, -8,-17,-12,  0,-15, -7, -8,  1, -6,-15,-27,-16, -6;
/M: SY='L'; M= -6,-27,-21,-30,-22,  6,-29,-18, 23,-24, 30, 19,-25,-26,-18,-20,-22, -8, 16,-17,  4,-21;
/M: SY='E'; M=-10,  0,-28,  5, 30,-22,-22, -5,-15,  5, -7, -5, -6, -8, 11, -2, -7,-10,-17,-26,-13, 20;
/M: SY='K'; M= -7, -1,-17, -1,  6,-19,-18,-11,-23, 18,-22,-12, -2,-13,  1, 10, -2, -4,-13,-25,-12,  4;
/M: SY='E'; M= -6, 10,-27, 18, 49,-29,-18, -3,-28,  7,-19,-19,  0, -2, 15, -3,  2, -6,-26,-30,-19, 32;
/M: SY='R'; M=-17, -8,-29, -8,  1,-21,-19, -2,-29, 29,-22,-11,  1,-18,  9, 61, -7, -8,-19,-21,-11,  1;
/M: SY='D'; M=-16, 41,-27, 50, 19,-33, -9,  2,-32,  1,-27,-23, 25,-11,  2, -7,  1, -8,-29,-38,-19, 10;
/M: SY='F'; M=-19,-25,-21,-34,-21, 65,-29,-17, -3,-25,  6, -1,-17,-27,-29,-17,-17,-10, -4,  5, 24,-21;
/M: SY='Y'; M=-19,-21,-20,-22,-21, 25,-31, 13,  1,-13,  0,  0,-20,-30,-12,-13,-19,-10, -7, 22, 68,-21;
/M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-33,-27, 63,-30, -6,  0,-23,  7,  0,-20,-30,-30,-17,-20,-10, -3, 17, 47,-27;
/M: SY='N'; M=  0, 12,-18,  6, -1,-22,  6, -5,-21, -6,-26,-18, 21,-16, -3, -6, 15,  2,-18,-35,-21, -2;
/M: SY='K'; M=-11, -2,-29, -2,  8,-28,-20, -9,-27, 45,-26, -6, -1,-11,  9, 30,-11,-10,-18,-20, -9,  8;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,  9,-31,-21, 22,-30, 48, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 11,-20,  0,-21;
/M: SY='R'; M=-17, -9,-29, -9,  2,-22,-21, -1,-26, 26,-17, -7, -2,-18, 14, 53,-10,-10,-19,-20, -9,  5;
/M: SY='D'; M= -8, 17,-24, 21, 12,-21,-13, -4,-24, -2,-17,-16,  9,-13,  2, -3,  1, -4,-20,-30,-14,  7;
/M: SY='I'; M= -5,-29,-24,-36,-28,  0,-35,-28, 40,-27, 20, 16,-23,-23,-21,-26,-18, -7, 30,-22, -3,-28;
/M: SY='E'; M=-12, 16,-30, 28, 54,-32,-18,  0,-32,  8,-22,-22,  3, -2, 17, -2,  0,-10,-30,-32,-20, 35;
/M: SY='I'; M=-10,-18,-26,-20,-17, -8,-19,-14, 12,-19, 10,  7,-14,-22,-11,-14,-16,-11,  6,-22, -6,-16;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-32,-22, 11,-31,-21, 24,-29, 40, 21,-27,-28,-20,-21,-27,-10, 14,-19,  1,-22;
/M: SY='C'; M= -5,-23, 34,-29,-26, -6,-27,-23,  2,-23,  4,  5,-23,-31,-23,-22,-12, -5, 13,-32,-12,-25;
/M: SY='Q'; M=-13, 13,-29, 16, 21,-35,-17, 18,-26,  5,-22, -9,  9,-11, 35,  3, -1,-11,-30,-27,-10, 27;
/M: SY='D'; M=-11, 19,-25, 22, 21,-27,-14,  4,-25,  0,-20,-16, 13,-10, 11, -4,  4, -2,-24,-33,-15, 16;
/M: SY='H'; M= -3, -9,-23,-12, -7,-13,-19,  6, -7, -9, -6,  0, -6, -8, -4, -7, -5, -2, -7,-24, -3, -8;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='E'; M= -6, -3,-20, -3, 11,-14,-18, -8, -7, -1, -4, -4, -3,-10,  4, -4, -2,  0, -9,-22,-10,  7; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M: SY='N'; M= -5,  5,-14,  2,  3,-11,-10, -3, -5, -5, -6, -5,  9,-12,  1, -5,  0, -2, -8,-21, -9,  2; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='P'; M= -4,  0,-19,  1, -1,-17,  3, -9,-17, -4,-16,-12,  2,  4, -5, -7,  2, -3,-15,-21,-15, -4; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='N'; M= -7,  3,-21,  0, -2,-18, -8, -6,-13,  1,-12, -4,  5,-12,  1, -3,  0, -3,-13,-27,-13, -1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='E'; M= -5,  7,-16,  9, 13,-23,-15, -8,-17, -5,-19,-15,  6,-10,  5, -8, 10,  5,-15,-34,-17,  8;
/M:         M= -6, -2,-23, -1, -2,-16,-14, -3, -7,-11, -4, -2, -5,-13, -6,-13, -6, -5, -5,-28,-10, -5;
/M: SY='B'; M= -5,  5,-20,  4, -2,-14,-15, -9,-11, -7, -9, -9,  4,-18, -5, -7,  1,  0, -7,-30,-12, -3;
/M: SY='E'; M=-11, -1,-31,  5, 15,-26,-21, -9,-14, -3,-17,-10, -5, 15,  6, -8, -5, -9,-18,-29,-18,  8;
/M: SY='L'; M=-11,-21,-21,-23,-18, 15,-28,-19, 13,-24, 22,  9,-20,-25,-20,-19,-18, -7,  9,-18,  2,-19;
/M: SY='V'; M= -5,-25,  7,-29,-23, -4,-28,-24, 13,-20, 13, 10,-24,-28,-21,-19,-16, -7, 17,-28,-10,-23;
/M: SY='K'; M= -7,  5,-25,  2,  7,-21, -6, -6,-24, 13,-25,-13, 10,-13,  5,  6,  2, -4,-20,-26,-14,  6;
/M: SY='R'; M= -9,  0,-28,  2,  7,-23,-13, -1,-27, 17,-21,-12,  0,-14,  8, 25, -4, -9,-21,-21, -8,  6;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-25,-37,-29,  1,-37,-29, 43,-28, 21, 18,-23,-23,-22,-27,-19, -8, 32,-22, -2,-29;
/M: SY='Q'; M= -9, -6,-26, -6,  5,-21,-21,  2,-14, 10,-12, -1, -5,-15, 17,  6, -6, -7,-15,-20, -2, 10;
/M: SY='E'; M=  3,  6,-23,  8, 15,-27,-12, -7,-23,  6,-20,-14,  1, -9,  9, -1,  4,  0,-18,-27,-16, 12;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-25,-37,-30,  0,-37,-30, 45,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 35,-23, -3,-30;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,  9,-30,-20, 22,-29, 47, 22,-29,-29,-19,-20,-29,-10, 11,-20,  0,-20;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='A'; M= 14,  4,-17,  0,  5,-24, -6, -9,-20,  2,-22,-15,  7,-10,  4, -5, 14,  2,-14,-29,-18,  4;
/M: SY='T'; M=  4, -1,-12, -7, -4,-14,-15,-16,-14, -7,-15,-12,  1,-10, -6, -6, 20, 35, -4,-31,-13, -5;
/M: SY='E'; M=-11,  7,-27,  8, 20,-22,-19, -1,-14,  0,-15, -8,  5, -6, 11, -5, -2, -6,-19,-27,-11, 14;
/M: SY='D'; M= -8, 18,-27, 26, 24,-30, -8, -4,-27,  0,-22,-19,  7, -9,  5, -7,  0, -9,-22,-32,-20, 14;
/M: SY='G'; M= -5,  0,-28,  1, 10,-28, 16, -9,-28, -3,-23,-15,  3,-12,  4, -7,  0,-10,-26,-24,-21,  7;
/M: SY='F'; M=-13, -4,-24, -3,  2,  7,-23, -7,-10,-10, -8, -8, -7,-17, -5,-11, -6, -6,-10,-14,  5, -1;
/M: SY='E'; M= -5, -8,-25, -5,  9,-13,-18,-13, -6, -9, -6, -7, -9, -7, -3,-13, -4, -6, -7,-26,-13,  2;
/M:         M= -2, -9,-22,-10, -6,-17, -8, -6, -8,-12,-10, -6, -5, -9, -7,-13,  0, -3, -5,-28,-13, -7;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2015_07 which contains 548'872 sequence entries.


Total number of hits 25 in 25 different sequences
Number of true positive hits 25 in 25 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] EB1 C-terminal
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
25 sequences

BIM1_YEAST  (P40013), EB1A_ARATH  (Q7XJ60), EB1B_ARATH  (Q9FJJ5), 
EB1C_ARATH  (Q9FGQ6), EB1_DICDI   (Q8WQ86), MAL3_SCHPO  (Q10113), 
MARE1_BOVIN (Q3ZBD9), MARE1_CHICK (Q5ZLC7), MARE1_COTCO (Q6V291), 
MARE1_COTJA (Q66T82), MARE1_HUMAN (Q15691), MARE1_MOUSE (Q61166), 
MARE1_PONAB (Q5R7Z5), MARE1_RAT   (Q66HR2), MARE1_XENTR (Q6P848), 
MARE2_BOVIN (Q3SZP2), MARE2_CHICK (Q5ZKK1), MARE2_HUMAN (Q15555), 
MARE2_MOUSE (Q8R001), MARE2_PONAB (Q5R4I6), MARE2_RAT   (Q3B8Q0), 
MARE2_XENLA (Q7ZXP1), MARE3_HUMAN (Q9UPY8), MARE3_MOUSE (Q6PER3), 
MARE3_RAT   (Q5XIT1)
» More

PDB
[Detailed view]
10 PDB

1TXQ; 1WU9; 1YIB; 1YIG; 2HKQ; 2HL5; 3GJO; 3MTU; 3TQ7; 4E61

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission