Due to maintenance work, this service will not be available Thursday September 18th between 1pm and 4am CEST.
Entry: PS51250

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] TAUB
Accession [info] PS51250
Entry type [info] MATRIX
Date [info] AUG-2006 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51237

Name and characterization of the entry

Description [info] Taurine import ATP-binding protein tauB.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=67;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=62;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9104320; R2=0.0120544; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2927.78622; R2=27.47968; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=99999; N_SCORE=9999.0; H_SCORE=44175; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=1501; N_SCORE=20.0; H_SCORE=44175; MODE=1; TEXT='?';
/CUT_OFF: LEVEL=-2; SCORE=381; N_SCORE=6.5; H_SCORE=13398; MODE=1; TEXT='??';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='V'; M= -4,-30,-18,-34,-30,  0,-34,-30, 38,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 42,-26, -6,-30;
/M: SY='E'; M=-14, 26,-30, 40, 44,-34,-16,  0,-34,  6,-24,-24,  8, -4, 12, -4,  0,-10,-30,-34,-20, 28;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-18,-30,-22,  8,-30,-22, 22,-28, 42, 18,-30,-30,-22,-20,-26, -8, 18,-22, -2,-22;
/M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25, 48,-30,-20,  9,-30, 28,  9,-25,-30,-31,-20,-25,-10,  5, -4, 16,-25;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,  8,-28,-16, 20,-26, 44, 28,-28,-28,-16,-18,-28,-10, 10,-20,  0,-18;
/M: SY='A'; M= 31,-10,-18,-16,-14,-24, 27,-20,-22,-14,-18,-14, -6,-14,-14,-20,  6, -8,-12,-20,-24,-14;
/M: SY='T'; M= -1,  2,-15, -2,  8,-16,-17,-14,-16, -5,-16,-14,  2, -8, -2, -8, 19, 31, -8,-32,-14,  3;
/M: SY='R'; M=-18,  5,-30, 11, 16,-26,-18,  0,-32, 20,-22,-16,  4,-14, 10, 41, -6,-10,-24,-26,-14, 10;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,  8,-32,-22, 27,-30, 43, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 14,-20,  0,-22;
/M: SY='V'; M= -4,-30,-16,-32,-28,  2,-32,-28, 31,-24, 21, 14,-28,-28,-26,-22,-16, -4, 38,-26, -6,-28;
/M: SY='V'; M= -2,-30,-12,-30,-28,  2,-30,-28, 28,-22, 18, 12,-30,-30,-28,-20,-14, -2, 42,-28, -8,-28;
/M: SY='M'; M=-10,-24,-20,-30,-20,  4,-24, -8, 20,-18, 33, 43,-24,-24, -8,-14,-24,-10, 10,-20,  0,-14;
/M: SY='S'; M= 14,  7,-14,  8,  1,-24, -2,-10,-21, -8,-25,-20,  7,-10, -2,-12, 26, 10,-11,-35,-20,  0;
/M: SY='P'; M= -8,-18,-38,-10, -4,-30, -3,-20,-24,-12,-30,-20,-16, 70,-12,-20, -8,-12,-30,-28,-30,-12;
/M: SY='R'; M=-12, -1,-30, -3, -4,-24,  3, -5,-28,  6,-26,-16, 10,  0, -2, 20, -4,-10,-26,-26,-20, -6;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='G'; M=  9,-10,-26,-12,-18,-28, 57,-20,-34,-18,-26,-18, -2,-18,-18,-20,  2,-16,-24,-20,-28,-18;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-22,-36,-30,  0,-36,-30, 42,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 38,-24, -4,-30;
/M: SY='A'; M=  5,-14,-17,-18,-13, -9,-19,  5, -1,-16,  3,  2,-12,-20,-11,-14, -5,  2,  4,-26, -3,-13;
/M: SY='K'; M=  2,  0,-26,  0, 14,-26,-16,  8,-26, 19,-22,-10, -1,-10,  8,  8, -4, -9,-19,-24, -9, 10;
/M: SY='R'; M=-14, 10,-27, 15, 16,-25,-18, -3,-29, 12,-21,-17,  4,-12,  7, 23, -1,  0,-21,-28,-15, 10;
/M: SY='Y'; M=-14,-26,-26,-28,-22, 16,-32, -7, 19,-22, 24, 12,-24,-28,-16,-18,-24,-10,  7, -1, 31,-22;
/M: SY='P'; M=-12,-13,-36, -5, 10,-28,-20,-12,-24,  2,-26,-18,-12, 50, -1,  4, -8,-10,-28,-28,-24,  0;
/M: SY='L'; M= -4,-23,-16,-23,-17,  1,-23,-20, 13,-24, 25,  9,-21,-26,-17,-18,-11, -1, 13,-26, -6,-17;
/M: SY='D'; M= -9, 21,-26, 26,  7,-29, -8, -5,-27, -5,-30,-23, 17, 11, -2,-10,  9, -1,-26,-38,-22,  1;
/M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-35,-28, 69,-30,-11,  0,-25,  8,  0,-20,-30,-33,-18,-20,-10, -2, 15, 41,-28;
/M: SY='A'; M= 40, -2,-12,-13, -8,-20,  0,-15,-12, -8,-13,-12,  1,-12, -8,-17, 10,  0, -5,-23,-20, -8;
/M: SY='R'; M= -4,  4,-26,  6,  2,-25,-13, -4,-28, 14,-20,-15,  2,-15,  3, 32, -3, -8,-18,-25,-15,  0;
/M: SY='R'; M=-18,  1,-28,  3,  0,-20,-18,  0,-21, 14,-13,  1,  0,-18,  5, 34,-10,-10,-15,-24,-10,  0;
/M: SY='F'; M=-13,-24,-26,-29,-26, 28,-10,-15,  2,-24,  1,  0,-15,-25,-25,-20,-15,-12, -2,  0, 19,-26;
/M: SY='V'; M=  5,-26,-14,-28,-22,  0,-24,-24, 19,-22, 22, 10,-26,-26,-22,-20,-14, -4, 25,-24, -8,-22;
/M: SY='A'; M= 36,  1,-12,-11, -8,-20,  0,-13,-12, -8,-15,-12,  6,-12, -8,-15, 10,  0, -7,-25,-20, -8;
/M: SY='G'; M= 10, -7,-25, -7, -5,-28, 39,-17,-32,-13,-24,-18, -2,-14,-11,-17,  2,-14,-23,-22,-26, -8;
/M: SY='E'; M=  3, 11,-26, 18, 22,-30,  1, -8,-29, -2,-22,-20,  2, -8,  2,-10,  2, -9,-23,-28,-22, 12;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='P'; M= -2,  2,-16, -1, -2,-16, -8, -9,-14, -6,-19,-14,  7, 13, -4, -8, 11, 11,-14,-27,-16, -4; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='A'; M= 19,-16,-12,-20,-14, -9,-12,-20,  2,-16,  3, -1,-14,-18,-14,-18,  3,  2, 10,-26,-14,-14;
/M: SY='R'; M=-13, -8,-26, -8,  0,-20,-16, -2,-28, 21,-22,-12,  2,-18,  8, 52,  1, -3,-18,-24,-12,  0;
/M: SY='E'; M=  7,  3,-19,  6, 25,-25, -9, -7,-23, -1,-22,-18,  2, -5,  7, -7, 17,  3,-17,-32,-20, 16;
/M: SY='I'; M= -5,-30,-21,-35,-30,  0,-35,-30, 41,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 39,-25, -5,-30;
/M: SY='K'; M=-12, -2,-30, -2,  8,-28,-20, -8,-30, 46,-28,-10,  0,-12, 10, 39,-10,-10,-20,-20,-10,  8;
/M: SY='A'; M= 22, -4,-15, -8, -2,-22, -5,-14,-18,  4,-22,-14,  0,-10, -2, -5, 16,  5, -8,-27,-18, -2;
/M: SY='D'; M= -2, 19,-18, 27,  8,-28, -4, -6,-28, -6,-30,-24, 14,-10,  0,-10, 25,  8,-18,-40,-20,  4;
/M: SY='P'; M=-10,-13,-38, -3, 14,-30,-20,-15,-22, -5,-28,-20,-15, 70, -3,-15, -8,-10,-30,-30,-28,  1;
/M: SY='E'; M=  4,  5,-26,  8, 12,-31,  7, -7,-27, -3,-22,-15,  1,-10,  9, -9,  2,-10,-23,-25,-20, 10;
/M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-35,-28, 69,-30,-11,  0,-25,  8,  0,-20,-30,-33,-18,-20,-10, -2, 15, 41,-28;
/M:         M= -4,-13,-25,-16,-12,-17, -6,-19, -1, -6,-12, -3, -5,-15, -9,-10,  0, -5, -1,-25,-12,-12;
/M: SY='R'; M= -2, -4,-26, -5, 12,-26,-16, -2,-24, 14,-18, -9, -2,-12, 19, 27, -2, -8,-20,-22,-14, 14;
/M: SY='M'; M= -8,-17,-18,-25,-18,  0,-22, -8, 13,-14, 19, 37,-17,-20, -6,-12,-13,  4,  8,-22, -2,-12;
/M: SY='R'; M=-20, -8,-30, -8,  0,-20,-20, 22,-30, 21,-20, -8,  2,-20, 10, 54,-10,-12,-22,-22, -3,  0;
/M: SY='E'; M=-12, 17,-30, 27, 44,-34,-18,  2,-30,  8,-22,-19,  4, -4, 23,  0,  0,-10,-30,-30,-18, 33;
/M: SY='E'; M=  1, -6,-26, -5,  7,-18,  2, -3,-21, -4,-16,-11, -6,-14,  6, -9, -2,-10,-20,-12, -1,  5;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-22,-34,-26,  4,-34,-26, 34,-28, 30, 18,-26,-26,-22,-24,-22, -8, 26,-22, -2,-26;
/M: SY='L'; M= -8,-23,-18,-26,-18,  6,-28,-20, 13,-26, 37, 13,-23,-26,-18,-18,-19,  3,  8,-22, -2,-18;
/M: SY='G'; M=  1,  5,-21,  9, -4,-28, 25,-12,-31,-12,-30,-22,  8,-14, -8,-14, 17, -1,-21,-32,-24, -6;
/M: SY='M'; M=-12,-16,-25,-18, -3, -7,-25, -9,  6, -6, 11, 16,-15,-19, -2,  2,-17,-10,  0,-22, -6, -4;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-24,-38,-30, 15,-36,-28, 37,-28, 16, 14,-22,-24,-26,-26,-18, -8, 28,-16,  4,-30;
/M: SY='W'; M=-16,-24,-31,-26,-15, 16,-25, -9, -5,-16,  2, -1,-22,-26, -4,-12,-22,-15,-13, 33, 24, -9;
/M: SY='D'; M=  1, 19,-26, 27, 15,-32,  3, -8,-31, -3,-24,-22,  6,-10, -1,-12,  2, -9,-23,-30,-22,  7;
/M: SY='M'; M=-10, -9,-24,-10,-10,-15,-25,-10, 11,-11,  2, 15,-11,-18,  2,-12,-11, -8,  7,-25, -7, -5;
/M: SY='E'; M=  1, -2,-26,  0, 17,-26,  4, -8,-29,  4,-20,-16, -2,-10,  3,  6,  0,-10,-22,-24,-20,  9;
/M: SY='E'; M=-12,  0,-32,  8, 37,-28,-20, -4,-28,  9,-22,-18, -4, 17, 12,  7, -4,-10,-28,-28,-21, 22;
/M: SY='A'; M= 23, -1,-19, -2, 22,-25, -9,-11,-19, -1,-15,-15, -5, -5,  4,-11,  5, -5,-14,-25,-20, 13;
/M: SY='E'; M=-10,-10,-28,-11,  9, -1,-12,-14, -7,-12, -7, -7, -9,-14, -8,-14, -9,-12,-10,-18, -7,  0;
/M: SY='E'; M= -8, -1,-24,  1, 19,-19,-16, 17,-17, -2,-13,  2, -1,-10, 10, -4,  2, -6,-17,-30, -8, 13;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Post-processing [info]

PROMOTED_BY PS50893

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 46 in 46 different sequences
Number of true positive hits 46 in 46 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] V_Lesaux
Taxonomic range [info] Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
46 sequences

TAUB1_BURXL (Q146E7), TAUB2_BURXL (Q13KX9), TAUB3_BURXL (Q13IS7), 
TAUB_BURCA  (Q1BT84), TAUB_BURCH  (A0KAV6), TAUB_BURMA  (Q62AW4), 
TAUB_BURP1  (Q3JKX3), TAUB_BURPS  (Q63JZ3), TAUB_BURS3  (Q39CJ6), 
TAUB_BURTA  (Q2T751), TAUB_CHRVO  (Q7NU46), TAUB_CUPNH  (Q0K2U3), 
TAUB_CUPPJ  (Q471U2), TAUB_ECO57  (Q8X5I6), TAUB_ECOL5  (Q0TKS1), 
TAUB_ECOL6  (Q8FKF5), TAUB_ECOLI  (Q47538), TAUB_ECOUT  (Q1RFH8), 
TAUB_JANSC  (Q28K97), TAUB_PARPN  (Q6RH47), TAUB_PELUB  (Q4FMG5), 
TAUB_PSE14  (Q48C94), TAUB_PSEAB  (Q02SA6), TAUB_PSEAE  (Q9HX79), 
TAUB_PSEE4  (Q1IGM2), TAUB_PSEF5  (Q4KK16), TAUB_PSEPF  (Q3KJQ7), 
TAUB_PSEPK  (Q88RA1), TAUB_PSEPU  (Q8KZR4), TAUB_PSESM  (Q87UH7), 
TAUB_RHIEC  (Q2K164), TAUB_RHIL3  (Q1M7R4), TAUB_RHILO  (Q98DW6), 
TAUB_RHIME  (Q92UX0), TAUB_RHISN  (Q6W2B1), TAUB_ROSDO  (Q16BJ3), 
TAUB_RUEPO  (Q5LVM5), TAUB_SHIBS  (Q325N3), TAUB_SHIDS  (Q32IZ6), 
TAUB_SHIF8  (Q0T7M2), TAUB_SHIFL  (Q83MA0), TAUB_SHISS  (Q3Z542), 
TAUB_YERPA  (Q1C2S1), TAUB_YERPE  (Q8ZJD0), TAUB_YERPN  (Q1CCR9), 
TAUB_YERPS  (Q664P8)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission