Entry: PS51270

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] ZF_CTCHY
Accession [info] PS51270
Entry type [info] MATRIX
Date [info] NOV-2006 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51266
Associated ProRule [info] PRU00965

Name and characterization of the entry

Description [info] Zinc finger CTCHY-type profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=65;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=60;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4404461; R2=0.0072403; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-7658.29566; R2=29.91221; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=962; N_SCORE=9.4; H_SCORE=15314; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=561; N_SCORE=6.5; H_SCORE=9122; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-17; D=-80; I=-80; B1=*; E1=*; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
...
                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-255; BD=-255;
/M: SY='M'; M= 10,-31,-45,-36, 40,-37,-25, -2,-33, 20, 85,-35,-38,-28,-32,-20,-22,  8,-30, -9;
/M: SY='G'; M= 40,-33,-28,-31,-43, 67,-33,-42,-29,-41,-33,-17,-31,-26,-35, 13,-22,-32,-39,-38;
/M: SY='K'; M=-24, 19, -2, 34,-38,-33,-19,-40, 60,-27,-29,  3,-28, 13, 16, -3,-20,-36,-38, -7;
/M: SY='Y'; M=-35,-45,-33,-36, 17,-41, 18,-21,-29,-17,-13,-34,-46,-24,-25,-29,-29,-26,  9,110;
/M: SY='Y'; M=-35,-39,-40,-40, 74,-43,-13,-16,-34,-11,-14,-35,-46,-35,-32,-30, -3,-21,  2, 85;
/M: SY='C'; M=-25,139,-44,-45,-35,-40,-44,-42,-40,-32,-33,-31,-55,-48,-47,-27,-25,-29,-65,-46;
/M: SY='D'; M= -3,-34, 42, -2,-37,  2,-20,-34,  5, -8,-29, 33, -8,-16,-22, 40,-12,-32,-48,-31;
/M: SY='I'; M=-12,-38,-38,-31,-20,-45,-40, 62, 29, -6, -7,-30,-34,-27,-23,-28, -5, 30,-39,-23;
/M: SY='C'; M=-25,139,-44,-45,-35,-40,-44,-42,-40,-32,-33,-31,-55,-48,-47,-27,-25,-29,-65,-46;
/M: SY='K'; M=-27,-39,-14,-10,-39,-29, 39,-15, 70,-38,-26, 42,-29, -7,  4,-18,-19,-34,-42,-26;
/M: SY='F'; M=-33,-33,-49,-42, 60,-49,-32,  0,-42, 59,  2,-45,-48,-39,-39,-40,-28, -7,-22, -2;
/M: SY='W'; M=-38,-43,-51,-44, 79,-43,-29,-19,-37,-13,-19,-44,-47,-41,-36,-38,-35,-26,110, 57;
/M: SY='D'; M=-31,-43, 94,  3,-50,-26,-15,-48,-17,-48,-45, 31,-31,-17,-26,-18,-19,-46,-66,-34;
/M: SY='D'; M=-27,-40, 81, -1,-47,-24,-15,-46, 10,-47,-41, 46,-31,-15,-13,  5,-16,-43,-60,-33;
/I:         I=-24; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77;
/M: SY='D'; M=-30,-44, 90, 33,-50,-29,-16,-49,-16,-47,-45, 15,-29,-14,-24,-19,-21,-45,-62,-34;
/I:         I=-22; MD=-71;
/M: SY='T'; M=-27,-56,-51,-29,-51,-56,-56,-11,-46,-33,-40,-47, 13,-48,-27, -7, 16,  7,-69,-52; D=-22;
/I:         I=-22; MI=-71; MD=-71; IM=-71; DM=-71;
/M: SY='S'; M=-37,-54,-12, -2,-62,-45,-44,-59, -5,-61,-55,  0,-49,-34,-40, 28, 12,-53,-70,-54; D=-22;
/I:         I=-22; DM=-71;
/M: SY='K'; M=-27,-42, 11, -6,-42,-34,-20,-44, 73,-41,-30,-12,-29, -4, 50,-21,-23,-39,-38,-28;
/M: SY='Q'; M=-10,-38, 17, 16,-44,-10,-18,-40, 25,-41,-31, 26, 10, 43, -5, 33, -7,-37,-44,-31;
/M: SY='Q'; M=-23,-41,-32,-18,-27,-40,  7, 48,-20,-10, 19,-25,-34, 68,-21,-13,-22, 19,-39,-21;
/M: SY='Y'; M=-36,-43,-37,-39, 55,-42, -5,-18,-31,-13,-13,-36,-47,-29,-28,-31,-29,-23,  7,101;
/M: SY='H'; M=-33,-44,-17,-17,-31,-34,127,-50,-21,-32,-17, -6,-33,-11,-15,-22,-31,-49,-67,  0;
/M: SY='C'; M=-25,139,-44,-45,-35,-40,-44,-42,-40,-32,-33,-31,-55,-48,-47,-27,-25,-29,-65,-46;
/M: SY='D'; M=-18,-44, 68,  8,-44,-27,  9,-43,-18,-44,-37, 21, 53,  9,-26, -4,-20,-42,-50, -8;
/M: SY='D'; M=-25,-41, 55,  5, 21, 35,-22,-40, 17,-36,-34, -1,-14,-20,-22,-12,-24,-39,-34, 12;
/M: SY='C'; M=-24,137,-44,-44,-35,-22,-44,-42,-40,-33,-33,-30,-54,-47,-47,-27,-25,-30,-64,-45;
/M: SY='G'; M=-16,-38,-18,-31,-45, 74,-25,-49, -5,-49,-37, 49,-33,-24,-30,-12,-25,-46,-42,-39;
/M: SY='I'; M=-28,-38,-49,-45,-10,-52,-42, 69,-41, 32, 25,-41,-40,-37,-43,-37,-22, 22,-37,-19;
/M: SY='C'; M=-25,139,-44,-45,-35,-40,-44,-42,-40,-32,-33,-31,-55,-48,-47,-27,-25,-29,-65,-46;
/M: SY='R'; M=-31,-47,-27,-15,-39,-41,-15,-46, 13,-38,-27,-20,-39, -3, 95,-25,-29,-40,-39,-26;
/M: SY='V'; M=-23,-34,-40,-35,-17,-46,-37, 41,-27, 18, 21,-33,-38,-30, 16,-27, 19, 42,-43,-22;
/M: SY='G'; M=-12,-40,-28,-39,-46, 88,-34,-54,-33,-50,-39,-14,-32,-31,-41,-13,-32,-48,-37,-41;
/M: SY='G'; M= -6,-40,  8, -6,-40, 46,-26,-36, 11, -8,-26,-17, 25, 34, -8,-16, -3,-34,-40,-33;
/M: SY='G'; M=  0,-40,-24,-12,-43, 56,-27,-44, 31,-43,-33, -5, 14,-17, 21, -4,-24,-31,-39,-35;
/I:         I=-22; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
/M: SY='E'; M=-25,-42, 31, 48,-37,-21,-23, 20, 38,-28,-25,-16,-26,  4,-11,-14,-22,-15,-42,-30;
/M: SY='D'; M=-25,-38, 73,  3,-45,-22,-14,-45,  6,-46,-39, 53,-31,-14, -7, 16,-15,-42,-58,-33;
/M: SY='F'; M=-34,-36,-41,-41, 89,-40,-22,-16,-36, -9,-16, -2,-46,-40,-34, -4,-26,-20, -5, 52;
/M: SY='F'; M=-38,-36,-47,-27, 98,-46,-27,-13,-40, -5,-14,-39,-48,-47,-37,-36,-30,-18, -3, 39;
/M: SY='H'; M=-33,-44,-17,-17,-31,-34,127,-50,-21,-32,-17, -6,-33,-11,-15,-22,-31,-49,-67,  0;
/M: SY='C'; M=-25,139,-44,-45,-35,-40,-44,-42,-40,-32,-33,-31,-55,-48,-47,-27,-25,-29,-65,-46;
/M: SY='M'; M=-15,-38, 44, 11,-32,-32,-19,-27, 39,-12, 49, -3,-16, 11,-11,-14, -3,-28,-41, -4;
/M: SY='K'; M=-24,-38,  2,  1,-35,-35,-24,  0, 61,-29,-23,  0,-29,  3, 17,-19, 13,  7,-41,-28;
/M: SY='C'; M=-25,139,-44,-45,-35,-40,-44,-42,-40,-32,-33,-31,-55,-48,-47,-27,-25,-29,-65,-46;
/M: SY='N'; M=-21, 18, 17,-11,-42, 39,-16,-42,-17,-42, -6, 70,-34, 15,-12, -3,-18,-41,-49,-35;
/M: SY='C'; M= 22, 85,-38,-34,-25,-32,-36, 10,-33,  7, 18,-28,-39,-31,-37,  9,  7, 10,-47,-30;
/M: SY='C'; M=-25,139,-44,-45,-35,-40,-44,-42,-40,-32,-33,-31,-55,-48,-47,-27,-25,-29,-65,-46;
/M: SY='Y'; M=-30,-36,-44,-39,  2,-46,-20, 16,-36, 48, 46,-41,-44,-30,-34,-36,-26,  1,-18, 61;
/I:         I=-24; MD=-77;
/M: SY='S'; M=  7,-34,-26,-26,-40, 33,-30,-32,-27,-39,-32,-17, 39,-22,-33, 51,  1, -6,-44,-36; D=-24;
/I:         I=-24; MI=-77; IM=-77; DM=-77;
/M: SY='M'; M=-23,-34,-34,-31,-18,-39,-28, 36,  1,  2, 62, -5,-33,-24, -8,-13, 29, 17,-39,  1;
/I:         I=-22; MD=-71;
/M: SY='Q'; M=-10,-37,  6,  6,-37, -5,-23,-19, 18,-21, -7,  2,-31, 27, 17, 24, 12, -6,-44,-30; D=-22;
/I:         I=-22; MD=-71;
/M: SY='L'; M=-32,-38,-48,-43,-13, -9, 12, 12,-43, 56, 20,-43,-48,-36,-41,-40,-30, -2,-41,-22; D=-22;
/I:         I=-22; MI=-71; IM=-71; DM=-71;
/M: SY='R'; M=-26,-42,-20, 24,-15,-37, 27, -4, 29,-20,-22,-20, 14, 11, 47,-10,-14, -6,-40,-24;
/I:         I=-22; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
/M: SY='D'; M=-29,-45, 50,  9,-48, 23,-25,-45, -2,-31,-39, 31,-37,-21,  5,-11,-26,-31,-55,-39; D=-22;
/I:         I=-22; DM=-71;
/M: SY='N'; M=-20,-36, 16, 25,-42, 12,-18,-42, 30,-42,-33, 45,-28,-10,  9, 20,  8,-37,-46,-33;
/M: SY='H'; M=-33,-44,-17,-17,-31,-34,127,-50,-21,-32,-17, -6,-33,-11,-15,-22,-31,-49,-67,  0;
/M: SY='K'; M=-18, 10,-22,-12,-38,-34, 17,-22, 56,-34,-25, -6, -6, 13, 39, -8,  5, -9,-41,-27;
/M: SY='C'; M=-25,135,-42,-42,-35,-40, 22,-42,-39,-32,-31,-28,-53,-44,-44,-27,-25,-30,-65,-40;
/M: SY='I'; M=-24,-36,-45,-39,-15,-49,-41, 53,-30, 20, -3,-38,-41,-33, 15,-33,-20, 48,-42,-22;
/M: SY='E'; M= -7,-42,  4, 86,-46,-37,-18,-46, -6,-39,-35,-20,-19,  1,-16,-18, -7,-37,-44,-37;
/M: SY='N'; M=-26,-37,  9,-14,-41,  6,-14,-43, 38,-44,-32, 67,-34,-10, 42,-15,-18,-41,-46,-32;
/M: SY='S'; M= 29, 29,-28,-26,-32, -2,-31, -8, -5,-25,  6,-19,-31,-22,-27, 41, 19, 13,-45,-30;
/M: SY='M'; M=  1,-29,-33,-30,-20,-32,-27,  4,-28, 20, 62,-23,-31,-24,-30, 22, 42, -2,-42,-22;
/M: SY='H'; M=-26,-43, 33, 39,-42,-33, 62,-46, 12,-39,-30,-11,-29, 16, 42,  2,-23,-42,-48,-23;
/M: SY='C'; M=-22, 63,  7,-17,-37,  1, 56,-36,-19,-31, 20, 26,-34, 44,-21, 14, -1,-34,-50,-24;
/M: SY='N'; M=-27,-35, 57,-10,-43,-18, 26,-43,-14,-46,-36, 82,-34,-14,-22, -2,-14,-43,-62,-32;
/I:         E1=0; IE=-255; DE=-255;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_09 which contains 546'439 sequence entries.


Total number of hits 3 in 3 different sequences
Number of true positive hits 3 in 3 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] window20
Author [info] N_Hulo
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] ZN_FING
Feature description [info] CTCHY-type
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
3 sequences

YERG_SCHPO  (O14099), ZN363_HUMAN (Q96PM5), ZN363_MOUSE (Q9CR50)

			
		
PDB
[Detailed view]
2 PDB

2DKT; 2K2C

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission