Entry: PS51279

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] BCNT_C
Accession [info] PS51279
Entry type [info] MATRIX
Date [info] NOV-2006 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51279
Associated ProRule [info] PRU00610

Name and characterization of the entry

Description [info] Bucentaur C-terminal (BCNT-C) domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=82;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=77;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3715639; R2=0.0098120; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3528.70984; R2=25.10881; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=625; N_SCORE=8.5; H_SCORE=16661; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=421; N_SCORE=6.5; H_SCORE=14100; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-7; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='A'; M=  2,-10,-20,-15,-14,-11,  1,-16, -5,-18,  1, -3, -3,-20,-13,-16, -1,  0, -5,-26,-14,-14;
/M: SY='K'; M= -2, -9,-24,-11, -4,-18,-10,-15,-16, 12, -9, -5, -7,-15, -4,  4, -8, -3,-10,-21,-11, -4;
/M: SY='R'; M=  3, -9,-20,-11, -3,-18,-13,-10,-18,  8,-13, -9, -3,-16,  0, 19,  3, -1,-10,-24,-13, -3;
/M: SY='P'; M= -3, -9,-26,-10, -2,-22,-16,-12,-17,  7,-20, -6, -7, 15, -1,  3,  0,  1,-15,-26,-16, -3;
/M: SY='S'; M=  4,  2,-20,  2, -6,-23, 10,-13,-20,-11,-24,-17,  6, -7, -9,-14, 11, -1,-13,-32,-22, -8;
/M: SY='G'; M=  8,-13,-21,-17,-16,-11, 20,-17,-16,-17,-10, -4, -8,-18,-15,-18,  0, -9,-11,-20,-16,-15;
/M: SY='L'; M=-11,-26,-25,-28,-18,  0,-29,-18, 16,-20, 26, 15,-23,-13,-14,-11,-23,-10,  6,-21, -4,-18;
/M: SY='D'; M=-11, 12,-26, 17,  9,-24,-15, -5,-18, -6,-11,-12,  5, -3,  3, -9, -3, -7,-20,-32,-16,  6;
/M: SY='N'; M= -4, 11,-25,  8,  6,-28,-11,  9,-23,  2,-25,-13, 14, -2, 11, -2,  3, -5,-24,-30,-14,  7;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='L'; M= -2,-20,-19,-23,-12,  4,-24,-19, 14,-19, 17,  8,-19,-20,-15,-18,-14, -7, 11,-18, -3,-14; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='L'; M= -5,-22,-22,-24,-14, -2,-26,-18,  8,-12, 25, 10,-20,-24,-12, -5,-21, -9,  4,-20, -4,-14;
/M: SY='S'; M= 11, -3,-19, -2,  9,-24, -1,-12,-22, -7,-24,-18,  0,  2,  0,-12, 17,  3,-16,-31,-22,  4;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='Q'; M=  6,  2,-18, -4,  2,-22,-12, -7,-16,  7,-17, -8,  5,-10, 10,  1,  6,  6,-13,-23,-12,  6; D=-13;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='I'; M=  0,-18,-19,-23,-17, -1,-23,-17, 15,-19, 12,  6,-14,-18,-13,-18, -7,  1,  9,-17,  2,-17; D=-13;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='G'; M= -3, -9,-18,-10,-10,-13, 17,-10,-13, -6, -7,  0, -5,-13, -8, -7, -6,-10,-11,-13,-12, -9; D=-13;
/I:         I=-13; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='S'; M= 12,  7,-17,  5,  6,-24, -5, -9,-21,  0,-24,-17,  9,-10,  0, -6, 16,  4,-14,-31,-19,  3;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-29, -1,  5,-26,-19,-10,-24, 31,-23,-10,  2, -2,  4, 17, -9, -9,-20,-23,-12,  4;
/M: SY='K'; M=  2, -9,-26,-10,  0,-22,-17,-13,-19, 19,-15, -8, -8, -2,  0, 12, -8, -8,-13,-21,-13, -1;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='Q'; M= -7, -4,-27, -2, 10,-30,-16, -3,-20, 12,-23, -8, -3, 11, 23,  5,  0, -6,-23,-22,-14, 15; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22,  7,-31,-21, 26,-28, 41, 23,-27,-27,-18,-21,-27,-10, 14,-20,  0,-21;
/M: SY='N'; M=  1, 17,-14,  9,  0,-20,  0, -1,-20, -6,-30,-20, 32,-14,  0, -6, 27, 11,-19,-40,-20,  0;
/M: SY='T'; M=  0,-13,-10,-18,-18, -6,-24,-24,  7,-14, -2, -2,-13,-18,-18,-14,  7, 29, 21,-30,-10,-18;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-18,-30,-22,  8,-30,-22, 22,-28, 41, 18,-30,-30,-22,-20,-26, -8, 19,-22, -2,-22;
/M: SY='E'; M=-13, 23,-30, 36, 47,-33,-17,  0,-33,  7,-23,-23,  6, -3, 14, -3,  0,-10,-30,-33,-20, 30;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='S'; M=  8,  0,-10, -2, -2,-18, -4,-12,-18,-10,-26,-18,  8,-10, -2,-10, 36, 26, -8,-38,-18, -2;
/M: SY='R'; M=-15,  1,-30,  3,  7,-27,-19, -5,-31, 37,-26,-12,  2,-14,  9, 43, -9,-10,-21,-22,-11,  6;
/M: SY='L'; M= -5,-21,-21,-24,-14, -3,-23,-13,  7, -9, 22, 19,-20,-23, -8, -4,-19, -9,  3,-20, -4,-12;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='K'; M=  6,  2,-22,  1,  3,-25, -4,-12,-24,  9,-20,-14, -1,-11, -1,  4,  2, -2,-15,-24,-17,  0;
/M: SY='S'; M= -3,  2,-21,  4,  5,-25, -5,-10,-20,  0,-22,-14,  1,-12,  4, -4, 10,  3,-12,-30,-17,  5;
/M: SY='F'; M=-10,-26,-20,-33,-26, 51,-27,-13,  2,-23,  6,  0,-20,-28,-30,-18,-16, -8,  3,  6, 30,-26;
/M: SY='V'; M= -5,-15,-20,-17,-12,-13,-26,-21,  4,  8, -7,  1,-14,-19,-11,  0, -8,  0, 15,-25, -9,-12;
/M: SY='D'; M=-15, 32,-28, 45, 24,-35,-14, -1,-33,  2,-25,-23, 12, -8,  9, -6,  2, -4,-27,-35,-18, 17;
/M: SY='K'; M=-11,  7,-30, 11, 23,-34,-19, -1,-28, 26,-25,-11,  2, -8, 26, 14, -4,-10,-26,-24,-13, 24;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E'; M=-12, 17,-28, 22, 27,-28,-16, -1,-26, 12,-21,-12,  8, -8, 10,  2, -3, -9,-24,-30,-16, 18;
/M: SY='G'; M=  3, -1,-25, -3, -3,-27, 30,-13,-31, -6,-27,-18,  6,-15, -8,-10,  6, -9,-24,-25,-24, -5;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='L'; M= -9,-26,-20,-29,-20,  5,-28,-18, 26,-25, 33, 22,-23,-23,-16,-19,-23, -9, 14,-18,  0,-19; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='E'; M= -3,  8,-26,  5, 15,-28, -7, -4,-26, 15,-25,-14, 11,-11, 11,  6,  0, -8,-24,-26,-17, 13;
/M: SY='E'; M=-14, 26,-30, 39, 44,-34,-16,  0,-34,  6,-24,-24,  8, -4, 12, -4,  0,-10,-30,-34,-20, 28;
/M: SY='D'; M=-14, 25,-30, 38, 38,-34,-16, -1,-34, 10,-25,-23,  8, -5, 11, -1, -1,-10,-29,-33,-19, 24;
/M: SY='L'; M=-11,-27,-21,-27,-18,  7,-29, -7, 14,-28, 42, 18,-26,-29,-17,-18,-28,-11,  6,-21,  2,-18;
/M: SY='E'; M= -4,  9,-25, 13, 16,-27,-15, -7,-19,  3,-20,-14,  3, -9,  9, -4,  4, -4,-16,-30,-16, 12;
/M: SY='T'; M=  5,-11,-19,-17,-10,-13,-19, -5,  0,-14, -2,  0, -7,-15, -3,-14,  2,  6, -1,-25, -7, -8;
/M: SY='H'; M=-11, -2,-28, -2,  4,-16,-19, 68,-25, -8,-17, -3,  4,-18,  7, -3, -8,-16,-25,-23, 17,  1;
/M: SY='N'; M= -1, 15,-23,  5, -2,-25, 11, -2,-24,  1,-27,-16, 27,-17,  2, -2,  5, -7,-26,-29,-20,  0;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='R'; M=-12, -3,-28, -3,  7,-26,-18, -4,-26, 36,-24, -8,  0,-12, 15, 37, -8, -9,-19,-18, -9, 10; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='G'; M=  1, -5,-21, -6,-10,-23, 29,-15,-28, -7,-25,-16,  2,-14,-10,-10, 10, -1,-19,-24,-21,-10; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='K'; M= -6, -1,-25, -1,  5,-26, -7,-10,-27, 32,-27,-11,  1,-10,  5, 18, -3, -7,-18,-20,-12,  5; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
/M: SY='D'; M=-12, 20,-26, 27, 22,-28, -4, -1,-30,  4,-23,-20, 12, -9,  5,  2,  0, -9,-26,-29,-18, 13; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='G'; M=  6, -7,-24, -9,-13,-26, 36,-18,-30,-10,-26,-17,  0,-16,-13,-13,  7, -5,-20,-23,-24,-13;
/M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21, 35,-30, 16,  0,-12,  1,  0,-20,-30,-13,-11,-20,-10, -9, 28, 75,-21;
/M: SY='L'; M= -5,-26,-21,-28,-18,  3,-26,-19, 14,-21, 34, 14,-24,-26,-16,-11,-23, -9,  7,-20, -3,-18;
/M: SY='E'; M=  1, 15,-25, 19, 24,-29, -2, -5,-28,  0,-22,-20,  8, -8,  4, -8,  3, -8,-24,-30,-21, 14;
/M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5,  6,-26,-20, -3,-29, 35,-24, -9,  0,-15, 15, 49, -9,-10,-21,-20,-10,  8;
/M: SY='Q'; M= -9, -7,-26, -9,  4,-26,-21,  0, -8, 10,-10, 12, -7,-14, 29,  6, -7, -9,-11,-21, -8, 17;
/M: SY='D'; M=  1, 20,-23, 25, 22,-29, -9, -4,-27,  0,-23,-21, 12, -8,  4, -8,  7, -4,-22,-33,-20, 13;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21, 18,-30,-20, 18,-30, 45, 18,-29,-30,-22,-20,-29,-10,  9,-17,  3,-21;
/M: SY='N'; M= -5, 19,-25, 16,  6,-30, -2,  0,-26,  5,-26,-16, 21,-14, 11,  0,  3, -7,-26,-30,-18,  9;
/M: SY='R'; M=-16, -1,-29, -2,  9,-23,-18, -1,-29, 28,-23,-12,  6,-16, 10, 47, -7, -9,-22,-23,-12,  6;
/M: SY='A'; M= 21,-18,-11,-23,-17,-10,-14,-23,  7,-16,  1, -1,-17,-19,-17,-19,  2,  1, 19,-26,-14,-17;
/M: SY='D'; M=-12, 23,-27, 34, 22,-31,-13,  0,-27,  1,-21,-14,  8, -9, 10, -6,  2, -7,-23,-34,-17, 16;
/M: SY='H'; M= -5,  7,-23,  3,  1,-10,-13, 11,-14, -5,-14, -5,  9,-17,  0, -7, -1, -5,-17,-19,  6, -1;
/M: SY='R'; M=-18,-11,-28,-11, -2,-19,-21, -3,-25, 28,-18, -8, -2,-20,  7, 59,-10, -9,-14,-21,-10, -2;
/M: SY='R'; M=-13,  5,-29,  6, 24,-28,-18,  2,-27, 18,-22,-13,  7,-11, 21, 26, -3, -9,-26,-25,-14, 21;
/M: SY='Y'; M=-16, -1,-26, -1,  7, 14,-22,  0,-15, -8, -9,-11, -2,-18, -7, -9, -9, -9,-17, -7, 16,  0;
/M: SY='E'; M=-10, 15,-28, 18, 44,-29,-16,  3,-27,  8,-22,-18, 12, -5, 21,  1,  2, -8,-30,-31,-19, 32;
/M: SY='E'; M=-13, -1,-28, -1, 12,-14,-22,  7,-14,  4, -9, -7,  1,-15,  4,  5, -9,-10,-17,-20,  1,  6;
/M: SY='E'; M= -6,  4,-27,  6, 26,-17,-17,  2,-22,  6,-17,-14,  2,-11,  8,  4, -2, -8,-22,-19, -2, 16;
/M: SY='R'; M=-16, -2,-29, -4,  4,-24,-18,  0,-28, 29,-23,-10,  7,-17, 13, 49, -7, -9,-22,-22,-11,  5;
/M: SY='D'; M= -8, 19,-27, 23, 18,-30,-13, -3,-30, 14,-25,-19, 11,-10,  6,  9, -1, -8,-24,-30,-17, 12;
/M: SY='A'; M= 14,-14,-15,-21,-16,  1,-15,-18,  3,-17,  8,  0,-11,-21,-17,-18, -6, -4,  5,-20, -8,-16;
/M: SY='R'; M=-17, -2,-29, -5,  2,-22,-18, -1,-29, 31,-23,-11,  7,-18,  9, 54, -8, -9,-21,-22,-11,  2;
/M: SY='L'; M= -4,-11,-21,-14, -6, -9,-20,-11,  0, -4,  6,  6, -8,-20, -6, -2,-12, -7,  0,-24, -9, -7;
/M: SY='S'; M= 16,  2,-14, -4,  2,-21, -5,-11,-17, -2,-21,-15,  6,-10, -2, -8, 17,  9,-11,-30,-18,  0;
/M: SY='E'; M=  0,  2,-21, -2,  7,-23, -4, -6,-18,  0,-18, -7,  5,-12,  6, -4,  6,  1,-17,-27,-16,  6;
/M: SY='M'; M= -4, -7,-21,-14, -9,-13,-13, -2, -7,  3, -6, 14, -1,-18,  2, 13, -4, -4, -7,-25,-10, -5;
/M: SY='G'; M= -5,  4,-25, -1, -5,-24, 16, -8,-26,  5,-26,-11, 13,-16, -4,  0,  2, -8,-22,-27,-19, -5;
/M: SY='R'; M=-13, -1,-27, -1, -2,-21,-19, -8,-16, 14,-18, -9,  2,-10, -1, 21, -8, -8,-11,-26,-13, -3;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_09 which contains 546'439 sequence entries.


Total number of hits 21 in 21 different sequences
Number of true positive hits 21 in 21 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] BCNT-C
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
21 sequences

CFDP1_BOVIN (Q8HXY9), CFDP1_CAMDR (Q4ADK7), CFDP1_CHICK (Q75QI0), 
CFDP1_HUMAN (Q9UEE9), CFDP1_MOUSE (O88271), CFDP1_MUNRE (Q4ADK4), 
CFDP1_RAT   (Q75UQ2), CFDP1_TRAJA (Q60FC2), SWC5_ASHGO  (Q754T8), 
SWC5_ASPFU  (Q4WRE2), SWC5_CANAL  (Q5A8H7), SWC5_CANGA  (Q6FML0), 
SWC5_DEBHA  (Q6BWZ7), SWC5_EMENI  (Q5BER4), SWC5_GIBZE  (Q4I650), 
SWC5_KLULA  (Q6CKH1), SWC5_NEUCR  (Q7RYI3), SWC5_SCHPO  (O74897), 
SWC5_USTMA  (Q4P6D5), SWC5_YARLI  (Q6C7G8), SWC5_YEAST  (P38326)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission